荧光定量PCR实验设计及优化_lxm概要

实时定量PCR应用中的问题及优化方案聚合酶链式反应（polymerase chain reaction , PCR）自诞生之日起就决定了它不仅是一种高敏感、高特异的检测核酸分子的定性方法，而且也是一个能对核酸分子进行精确定量的有力工具[1]。

随着分子生物学技术研究的不断进展，定量PCR技术取得了突飞猛进的发展，不仅建立了一系列的方法，而且也诞生了许多与这些方法相匹配的新型热循环仪和实验材料。

实时定量PCR(real-time quantitative PCR)技术便是一种具有革命性意义的定量PCR技术，所谓实时定量PCR是指在PCR指数扩增期间通过连续监测荧光信号强弱的变化来即时测定特异性产物的量，并据此推断目的基因的初始量[2]。

目前它作为一个极有效的实验方法，已被广泛地应用于分子生物学研究的各个领域，仅2000-2001年，收录在Medline上的以real-time PCR为关键词的文章就达一千多篇。

实时PCR技术较之与以前的以终点法进行定量的PCR技术具有无与伦比的优势。

首先，它不仅操作简便、快速高效，而且具有很高的敏感性和特异性。

其次，由于是在封闭的体系中完成扩增并进行实时测定，大大降低了污染的可能性并且无须在扩增后进行操作。

另外，它还可以通过不同的引物设计在同一反应体系中同时对多个靶基因分子进行扩增，即多重扩增[3,4,5]。

本文将对实时定量PCR目前的应用状况、仪器应用、新材料进展以及实验条件的优化作一综述。

实时定量PCR的应用现状实时定量PCR技术自1996年诞生以来，由于它显著的优越性，不仅广泛的应用于分子生物学的各个研究领域，而且也开始作为一种诊断手段应用于临床。

其应用涉及到的范围包括DNA、mRNA和病毒荷载量的定量，核酸多态性分析，基因突变分析等多个领域[3]。

Giulietti 等人[6]对用实时定量PCR测定细胞因子基因的表达作了详细的描述。

细胞因子是一种调节蛋白，它对免疫反应、炎症反应具有重要的调节作用，其量的改变常常与一些疾病，如炎症反应、自身免疫性疾病、移植排斥有密切的关系。

荧光定量PCR实验报告一、实验目的1、掌握荧光定量PCR技术2、学习如何制备PCR反应体系3、了解实时荧光PCR数据分析4、检测DNA含量二、实验原理荧光定量PCR技术是一种基于PCR扩增原理的DNA分析方法，可定量检测DNA的含量，广泛应用于生物学、医学等领域。

该技术主要依靠荧光标记物，结合荧光信号强度进行定量分析。

PCR反应过程中，引物与模板DNA结合后在酶的催化下形成新的DNA链，每个PCR循环会翻倍模板量。

PCR扩增的温度曲线显示，PCR反应初期呈指数上升阶段，后期呈平台期，最后呈线性上升期。

荧光定量PCR技术基于PCR反应的初期、指数上升阶段的振幅与CT值（Crossing Threshold，荧光信号的阈值值点）之间的关系，对样品中靶序列的含量进行定量分析。

三、实验步骤以10μL体积计算，将荧光定量PCR反应体系制备如下表：试剂名称一次浓度最终浓度10μL体积SYBR Green 1x 1x 1μLdNTPs 10mM 0.2mM 0.2μLMgCl2 25mM 3mM 0.3μLTaq DNA Polymerase 5u/μL 0.04u/μL 0.04μLForward Primer - 0.2μM 0.2μLReverse Primer - 0.2μM 0.2μLTemplate DNA - 1ng-100ng 1μLddH2O - - 7.24μL2、装载PCR板将PCR反应体系均匀装到PCR板中，按照如下步骤进行：① 每组实验会使用96孔PCR板；② 取出PCR板后，先用蒸馏水清洗；③ 按照实验设计，合理地将合适的试剂组合均匀装出到每个孔中；④ 采用专用移液器，能够准确的移液。

3、进行PCR扩增反应在PCR扩增反应期间，我们将执行以下操作：② 进行荧光定量PCR反应；③ 在PCR反应过程中，分别记录下样品的CT值和所测基因的拷贝数；4、数据分析① 利用荧光定量PCR仪进行CT值分析，记录下每个样品的CT值；② 利用以下公式，将CT值成功转化成所测基因的拷贝数：DNA含量（ng）=拷贝数 X DNA分子量/ 6.02 X 10^23;③ 分别计算出每个样品的DNA含量；④ 利用所得数据，绘制出荧光定量PCR的结果图，并进行结果的解释。

荧光定量PCR实验原理与应用一、引言荧光定量PCR（real-time quantitative PCR，qPCR），是一种高灵敏、高特异性的基因定量技术。

它通过检测PCR反应过程中产生的荧光信号，可以快速、准确地测量目标DNA的数量。

荧光定量PCR不仅可以用于基因表达分析、突变检测等生物学研究，还在医学诊断、农业育种等领域得到了广泛应用。

二、原理荧光定量PCR基于传统PCR技术，结合了荧光探针技术，能够实时监测PCR反应过程中荧光信号的累积。

在PCR反应中，DNA模板经过多轮的变性、退火和延伸，产生指数级增加的目标DNA片段。

而将荧光探针引入PCR反应体系中，该探针由一个互补于模板DNA的序列和一个荧光物质构成。

在延伸过程中，荧光探针被3’-5’外切酶降解，导致荧光信号的释放。

通过荧光信号的监测，即可获得PCR反应过程中目标DNA的相对数量。

三、实验步骤荧光定量PCR实验通常包括以下几个步骤：1. DNA提取首先需要从样本中提取目标DNA。

DNA提取方法根据样本的来源，可以采用不同的方法，如酚-氯仿法、盐析法、商用DNA提取试剂盒等。

2. PCR反应体系准备根据实验设计确定PCR反应所需的试剂和体积。

PCR反应体系通常包括模板DNA、引物、荧光探针、核酸酶、聚合酶等。

其中，引物用于定义PCR扩增区域，荧光探针用于监测PCR反应过程中产生的荧光信号。

3. qPCR仪设置将PCR反应体系加载到qPCR仪中，设置PCR反应的温度和周期参数。

qPCR仪通过控制温度，实现PCR反应的变性、退火和延伸过程，并监测PCR反应过程中的荧光信号。

4. PCR反应进行将PCR反应体系置于qPCR仪中，开始PCR反应。

qPCR仪会根据设定的温度和周期参数依次进行PCR反应。

在反应过程中，qPCR仪会实时监测PCR反应体系中的荧光信号，并将信号数据输出。

5. 数据分析通过数据分析软件对荧光信号进行处理，得到PCR曲线和相应的荧光阈值。

实时荧光定量PCR实验体系的设计与优化荧光定量PCR以其精确、快速、方便，越来越多的应用在科研、临床及检验检疫的各个领域。

但是定量PCR是对精确性要求很高的实验，不仅要求在实验前有比较完整的实验设计方案，而且实验的条件对实验结果的影响也非常大。

这些都是很多老师与学生非常关心的问题，下面分别从这两个方面来对定量PCR实验做一些阐述。

定量PCR实验步骤（以mRNA为例）：1.设计实验方案：例如对样品、实验组和对照组的一个实验流程设计2.引物和探针的设计和合成3.抽提RNA，测定提取的RNA的浓度4.反转录PCR5.定量PCR6.数据分析在进行定量PCR实验的过程中，PCR的扩增效率是一个非常重要的影响因素，因为定量PCR原理的理论方程是基于扩增效率最大值1，因此高的扩增效率能保证定量PCR实验的精确性及重复性，影响PCR扩增效率主要有以下几个方面：1，扩增子的长度；2，扩增子的GC含量；3，扩增子、引物和探针的二级结构；4，PCR反应各组分的浓度；5，RNA 或者cDNA的纯度。

进行定量PCR实验时，必须设计好引物和探针，除了能获得高的扩增效率外，对PCR扩增的特异性、消除DNA的扩增及提高扩增的灵敏度都有很大的影响。

下图就是使用不同的引物和探针对18SRNA进行定量PCR的荧光曲线图（反应条件和模板都相同）。

引物设计原则：1.上下游引物要保守为了能够扩增出所需要的保守片段，必须对保守的100-200片段进行PCR扩增。

所以引物的选取也要非常的保守。

2.上下游引物的长度一般为18-30bp之间，且Tm值在58-62℃之间，上下游引物的Tm值相差最好不超过2℃。

3.确保引物中GC含量在30-80%。

应避免引物中多个重复的碱基出现，尤其是要避免4个或超过4个的G碱基出现。

引物的3’端最好不为G或/和C。

引物3’端的5个碱基不应出现2个G或/和C。

4.避免引物内出现反向重复序列形成发夹二级结构，同时也应避免引物间配对形成引物二聚体。

实时定量PCR应用中的问题及优化方案聚合酶链式反应（polymerase chain reaction,PCR）自诞生之日起就决定了它不仅是一种高敏感、高特异的检测核酸分子的定性方法，而且也是一个能对核酸分子进行精确定量的有力工具[1]。

随着分子生物学技术研究的不断进展，定量PCR技术取得了突飞猛进的发展，不仅建立了一系列的方法，而且也诞生了许多与这些方法相匹配的新型热循环仪和实验材料。

实时定量PCR(real-time quantitative PCR)技术便是一种具有革命性意义的定量PCR技术，所谓实时定量PCR是指在PCR指数扩增期间通过连续监测荧光信号强弱的变化来即时测定特异性产物的量，并据此推断目的基因的初始量[2]。

目前它作为一个极有效的实验方法，已被广泛地应用于分子生物学研究的各个领域，仅2000-2001年，收录在Medline上的以real-time PCR为关键词的文章就达一千多篇。

实时PCR技术较之与以前的以终点法进行定量的PCR技术具有无与伦比的优势。

首先，它不仅操作简便、快速高效，而且具有很高的敏感性和特异性。

其次，由于是在封闭的体系中完成扩增并进行实时测定，大大降低了污染的可能性并且无须在扩增后进行操作。

另外，它还可以通过不同的引物设计在同一反应体系中同时对多个靶基因分子进行扩增，即多重扩增[3,4,5]。

本文将对实时定量PCR目前的应用状况、仪器应用、新材料进展以及实验条件的优化作一综述。

实时定量PCR的应用现状实时定量PCR技术自1996年诞生以来，由于它显著的优越性，不仅广泛的应用于分子生物学的各个研究领域，而且也开始作为一种诊断手段应用于临床。

其应用涉及到的范围包括DNA、mRNA和病毒荷载量的定量，核酸多态性分析，基因突变分析等多个领域[3]。

Giulietti等人[6]对用实时定量PCR测定细胞因子基因的表达作了详细的描述。

细胞因子是一种调节蛋白，它对免疫反应、炎症反应具有重要的调节作用，其量的改变常常与一些疾病，如炎症反应、自身免疫性疾病、移植排斥有密切的关系。

荧光定量PCR实验设计及结果分析荧光定量PCR（qPCR）是一种基于Polymerase Chain Reaction（PCR）技术的高灵敏度、高特异性的核酸定量方法。

它通过测量PCR反应体系中特定荧光染料的荧光信号，来实现对目标DNA或RNA的定量分析。

在荧光定量PCR实验设计中，需要考虑样品的选择、引物和探针的设计、实验条件的优化等方面的因素，并根据实验结果进行分析。

实验设计：1.样品选择：根据研究目的选择合适的样品，可以是细胞、组织或者提取的DNA/RNA样品等。

2.引物和探针的设计：根据目标序列的特点设计适当的引物和探针，确保其在PCR反应中的特异性和有效性。

3.实验条件的优化：优化PCR反应条件，包括温度、循环次数、荧光染料浓度等，以提高反应的特异性和灵敏度。

4.标准曲线的制备：通过稀释不同浓度的目标DNA或RNA来制备标准曲线，用于定量目标序列在待测样品中的存在量。

实验步骤：1.样品提取：根据实验需要选择合适的样品提取方法，提取目标DNA或RNA。

2.引物和探针设计：根据目标序列的特点，设计合适的引物和探针。

3.PCR反应：将提取的DNA或RNA与引物和探针一起加入PCR反应体系中，进行PCR扩增反应。

4.荧光信号检测：在每个PCR循环结束后，使用荧光探测仪读取PCR 反应管中的荧光信号。

5.数据分析：根据标准曲线，计算待测样品中目标序列的存在量。

结果分析：1.标准曲线的分析：利用标准曲线中各个浓度点的荧光信号与目标序列存在量的关系，计算出待测样品中目标序列的存在量。

可以通过软件进行自动计算，得到定量结果。

2.目标序列的存在量：根据定量结果，可以比较不同样品中目标序列的存在量，分析不同样品之间的差异或相似性。

3.PCR效率的评估：通过标准曲线的斜率来评估PCR反应的效率，斜率越接近-3.3，反应效率越高。

4.优化实验条件：根据结果分析，可以对实验条件进行优化，提高荧光定量PCR的灵敏度和特异性。

荧光定量PCR技术的优化与应用PCR技术是一种基于DNA聚合酶的反应，可以在短时间内制备出大量的DNA复制物。

PCR技术在现代生物学研究和医学诊断中广泛应用，荧光定量PCR是一种利用荧光信号进行定量分析的PCR技术。

在该技术中，荧光探针与PCR反应体系中的DNA结合，通过探针荧光强度变化，可以对PCR扩增产物进行定量分析。

本文将探讨荧光定量PCR技术的优化与应用。

一、荧光探针的选择与设计荧光探针是荧光定量PCR技术的核心。

荧光探针分为两种，分别是互补探针和融合探针。

互补探针是包含荧光染料和靶序列互补的短链寡核苷酸探针，当这种探针与靶序列结合时，荧光被激发发出信号。

融合探针是由两个长链寡核苷酸通过接头连接而成的探针，其中一个链上带有荧光染料，另一个链上带有荧光淬灭剂。

当探针与靶序列结合时，荧光染料与淬灭剂分离，荧光被激发发出信号。

在选择荧光探针时需要考虑以下两个因素。

首先，荧光探针的选择要根据实验设计的要求来进行。

例如，如果实验需要同时检测多个信号，那么就需要选择多种荧光探针分别标记各个靶序列。

其次，探针设计需要考虑到检测靶序列的特异性与灵敏度。

对于特异性，探针的序列长度应该足够长，以确保只与目标序列结合，避免误差。

对于灵敏度，需要控制探针的荧光强度，以避免信号过强或过弱，影响扩增结果。

二、PCR反应条件的优化PCR反应条件的优化对荧光定量PCR技术的灵敏度和特异性有着重要的影响。

下面将分别讨论PCR反应体系、探针浓度和热循环条件的优化。

PCR反应体系的优化：PCR反应体系通常包括模板DNA、引物、聚合酶、荧光探针和一些辅助物质。

在荧光定量PCR中，需要控制荧光信号的强度和稳定性，常用的办法是控制反应体系中的荧光染料的浓度。

然而，荧光染料浓度过高容易导致信号饱和，推荐的荧光染料浓度一般为5-40nM。

探针浓度的优化：荧光定量PCR的灵敏度是探针浓度关键因素，探针浓度过低容易导致荧光强度不足，探针浓度过高则容易导致荧光饱和。

荧光定量PCR手册荧光定量PCR（real-time PCR）技术是一种高灵敏度、精确度和可靠性的DNA定量检测方法。

它结合了PCR技术和荧光探针技术，通过实时检测PCR反应过程中产生的荧光信号，实现对样品中目标DNA序列的定量分析。

荧光定量PCR手册是进行该技术实验的重要辅助工具，它包含了实验设计、荧光探针与引物设计、反应体系配制、PCR条件设置与优化等重要内容。

本文将从以下几个方面，介绍荧光定量PCR手册的编写方法和要点。

一、实验设计实验设计是荧光定量PCR手册编写的第一步，其目的是明确实验目的和研究对象，合理确定实验采样方案和数据分析方法。

针对不同的实验需求，实验设计的内容也会有所差异。

通常情况下，实验设计需要做到如下三个方面的考虑：1. 确定实验目的和研究对象。

例如，是要检测某种标记基因的表达水平、某种外源基因的插入情况，还是要检测样品中某些病毒或细菌的存在情况等。

2. 合理确定实验采样方案。

采样量、采样时间和方法等都非常重要，需要根据实验目的来选取。

此外，还需要确定合适的对照组、重复次数和样品数等，以确保实验结果的可靠性和严谨性。

3. 确定数据分析方法。

荧光定量PCR实验得到的数据通常是荧光信号的数量，需要使用特定的软件进行数据分析和处理。

选择合适的数据分析方法可以有效提高实验结果的可靠性和准确性。

二、荧光探针与引物设计荧光定量PCR实验中的荧光探针和引物设计是非常重要的一步，直接关系到实验的灵敏度和特异性。

荧光探针和引物的设计需要根据目标DNA序列的特点来确定。

一般情况下，荧光探针和引物需要考虑以下几个方面的因素：1. 序列特性。

荧光探针和引物的序列需要尽可能与目标DNA序列匹配，从而提高PCR扩增效率和特异性。

2. 位置特性。

荧光探针和引物需要特定的位置，以确保它们在PCR扩增过程中能够与模板DNA序列结合并产生荧光信号。

3. 碱基配对。

荧光探针和引物的碱基配对需要尽可能避免形成二聚体和非特异性反应，以保证实验结果的准确性。

定量PCR反应体系优化及实验实例定量PCR（Quantitative PCR，qPCR）是一种用于精确测量靶标DNA 或RNA分子在样本中的相对和绝对数量的技术。

在进行定量PCR反应时，有几个关键因素需要优化，包括引物和探针的选择和设计、PCR反应体系的优化以及PCR程序的设置。

下面将介绍如何优化定量PCR反应体系，并给出一个实验实例。

1.反应体系组分的优化：-模板DNA或RNA的浓度：根据样本中目标分子的预期含量来确定合适的模板浓度。

通常情况下，应在反应开始时进行浓度递减实验，并在样本的线性范围内选择最佳浓度。

-引物和探针的浓度：引物和探针的浓度也需要优化，以确保在合适的浓度范围内扩增特定的靶标。

通常情况下，可以选择不同的引物和探针浓度进行实验，并选择产生最佳信号的浓度。

- 酶的浓度：比如Taq DNA聚合酶的浓度也需要进行优化，确保反应酶活性处于最佳状态。

通过实验，可以确定在不同酶浓度下扩增产物的线性范围。

2.反应条件的优化：-引物和探针的退火温度：引物和探针的退火温度是非常重要的，它们直接影响特异性和效率。

合适的退火温度可以提高PCR产物的特异性，避免非特异性扩增。

-延伸时间：合适的延伸时间可以确保反应中的扩增产物达到最大的量，但时间过长可能会导致非特异性扩增或降低效率。

通过递增延伸时间进行优化可以找到最佳时间。

- Annealing时间：引物的退火时间也需要进行优化。

合适的退火时间可以确保引物结合到模板的特定位点，并在此过程中提高特异性。

下面是一个实例，用于定量PCR分析一个基因在不同组织中的表达水平：1.实验目的：测量特定基因在肝脏和肺组织中的表达水平。

2.实验步骤：-收集肝脏和肺组织样本，提取总RNA。

-利用逆转录酶将RNA转录成cDNA。

-设计引物和探针：根据目标基因序列，设计特异性的引物和探针。

-优化PCR反应体系：-测试不同模板浓度，并选择产生最佳信号的浓度。

-优化引物和探针的浓度。

荧光定量pcr仪实验报告近年来，在不断的学习和实践中，我们有了自己的实验经验。

荧光定量 pcr仪是根据 PTI (Principle Time Agent Imaging)理论设计开发的一种测量方法，它利用荧光探针在光化学发光条件下产生具有荧光特性的光束，然后通过软件自动调整光强以计算出浓度。

荧光定量 pcr仪有很大的应用潜力，目前在许多研究领域都有广泛需求。

例如：农业科学、材料科学、环境生态、食品工业、化学、物理和化学工程等领域都有着广泛的应用空间。

本文将介绍荧光定量 pcr仪的工作原理和光化学发光法测水平之间的关系，分析使用荧光定量 pcr仪进行分析方法的适用性和局限性。

同时利用这一特性可以确定不同检测对象中不同浓度水平上相应分子量所对应关系，为研究不同分子及各分域之间分子量关系提供了重要工具。

一、荧光定量 pcr仪的工作原理荧光定量 pcr仪工作原理是将荧光探针在特定波长和光谱范围内(1-100 nm)发光，利用紫外光泵浦发光二极管产生一定波长的光，然后通过软件自动调节光强来计算出荧光值。

通过比较不同波长下的荧光强度，可得到样品中特定物质浓度的变化趋势，从而得出样品中特定物质的浓度。

它能有效地分析样品中各种物质的含量，但因波长不同，测得的数据精度也不相同。

这种方法在分子分析方面特别适用于生物样品，可以用来测定微生物以及其代谢产物或毒性物质的生物浓度；也可以用来测定某些物质中特定分子或生物受体、基因表达、蛋白质组成以及分子量的变化。

荧光定量 pcr仪可以通过监测荧光激发物发出的光来反映未知物质存在或不存在以及各种化合物在某一特定波长范围内在该特定波长范围内具有的发光强度，然后计算出各浓度水平上这些化合物各自不同的量值。

它采用一种较简单和容易操作的方法而被广泛用于检测样品中各个常见化合物到其浓度变化曲线之间关系，它不仅能精确测量样品中特定物质浓度，而且可以通过计算机软件自动计算出各组分分子量。

荧光定量PCR实验指南荧光定量PCR（qPCR）是一种能够对DNA或RNA的特定序列进行定量分析的技术。

它结合了PCR技术和荧光检测技术，能够检测出非常低浓度的靶分子。

本文将为您提供一份荧光定量PCR实验的指南，以帮助您完成这一实验。

实验前的准备工作：1.设计引物和探针：引物和探针是荧光定量PCR实验的核心组成部分，因此需要确保它们与目标序列特异性结合。

同时，还需选择合适的荧光染料和探针的浓度。

2.准备实验材料：包括引物、探针、荧光染料、模板DNA或RNA、逆转录酶酶、dNTP、聚合酶、缓冲液、MgCl2等。

3.准备质量控制样品：根据需要制备相应的阳性对照样品，并准备阴性对照样品。

实验步骤：1.反应体系的准备：根据PCR试剂盒使用说明或自行优化，将引物、探针、荧光染料、逆转录酶酶、dNTP、聚合酶、缓冲液、MgCl2等加入PCR管（注意按顺序添加，避免污染）。

2.加入模板：将模板DNA或RNA加入PCR管中，注意保持反应体系的稳定。

3.PCR条件设定：根据目标序列的特性和PCR试剂盒的要求设定PCR反应的温度、时间和周期数。

4.PCR反应：将PCR管密封，然后置于热循环仪中进行PCR反应。

5.数据分析：使用荧光定量PCR软件分析PCR反应产生的荧光信号，得到目标序列的定量结果。

注意事项：1.严格控制实验室的污染，使用无核酸污染的试剂和器材，避免引物和探针的降解。

2.对于荧光定量PCR的标准曲线方法，可以使用标准品系列的不同浓度来制作标准曲线，并根据荧光信号的强度进行定量。

3.在实验过程中，建议进行阳性和阴性对照样品的实验，以确保实验结果的准确性。

4.合理选择PCR管的容量，适量调整反应体系的配比，以保证实验的稳定性和可重复性。

总结：荧光定量PCR是一种非常强大的技术，能够在基因表达调控、感染病原体检测、突变检测等多个领域发挥重要作用。

在进行荧光定量PCR实验时，我们需要设计特异性的引物和探针，并合理选择荧光染料和探针的浓度。

荧光定量PCR实验指南〔一〕一、根本步骤：1、目的基因〔DNA和mRNA〕的查找和比对；2、引物、探针的设计；3、引物探针的合成；4、反响体系的配制；5、反响条件的设定；6、反响体系和条件的优化；7、荧光曲线和数据分析；8、标准品的制备；二、技术关键：1、目的基因〔DNA和mRNA〕的查找和比对；从/网点的genbank中下载所需要的序列。

下载的方式有两种：一为打开某个序列后，直接点击“save〞，保存格式为“.txt〞文件。

保存的名称中要包括序列的物种、序列的亚型、序列的注册号。

然后，再打开DNAstar软件中的Editseq软件，点击“file〞菜单中的“import〞，打开后点击“save〞，保存为“.seq〞文件。

另一种直接用DNAstar软件中的Editseq软件，点击“file〞菜单中的“open entrez sequence〞，导入后保存为“.seq〞文件，保存的名称中要包括序列的物种、序列的亚型、序列的注册号。

然后要对所有的序列进展排序。

用DNAstar软件中的Seqman软件，点击“sequence〞菜单中的“add〞，选择要比拟的“.seq〞的所有文件，点击“add〞或“add all〞，然后点击“Done〞导入要比拟的序列，再点击“assemble〞进展比拟。

横线的上列为一致性序列，所有红色的碱基是不同的序列，一致的序列用黑色碱基表示。

有时要设定比拟序列的开始与结尾。

有时因为参数设置的原因，可能分为几组(contig)，假如想全部放在一组中进展比拟，就调整“project〞菜单下的“parameter〞，在“assembling〞的“minimum math percentage〞默认设置为80，可调低即可。

再选择几个组，点击“contig〞菜单下的“reassemble contig〞即可。

选择上下的原如此是在保证所分析的序列在一个“contig〞的前提下，尽量提高“minimum math percentage〞的值。

荧光定量PCR实验报告摘要：荧光定量PCR（quantitative polymerase chain reaction，qPCR）是一种通过扩增和定量DNA的方法。

本实验的目的是利用荧光定量PCR技术，对给定的DNA样品进行定量检测，并比较不同浓度的模板DNA的扩增情况。

实验结果表明，荧光定量PCR是一种快速、准确、高灵敏度的定量PCR方法。

引言：荧光定量PCR技术是PCR技术的一种发展，并且在分子生物学中得到广泛应用。

它可以实时监测PCR扩增反应中DNA的扩增情况，因此被广泛用于基因表达检测、基因拷贝数检测、病原体检测等领域。

在这个实验中，我们将利用荧光定量PCR技术检测给定DNA样品的浓度并比较不同浓度的模板DNA的扩增情况。

材料与方法：1.实验材料：（1）实验电脑：配备实时荧光定量PCR软件的计算机。

（2）实验试剂：-PCR反应混合液：包含DNA模板、引物、荧光染料、酶等。

- 模板DNA：浓度为10 ng/μL的DNA样品。

-引物：用于扩增目标DNA的引物。

-荧光染料：用于实时检测PCR扩增过程中的DNA量。

（3）实验仪器：实时荧光定量PCR仪。

2.实验步骤：（1）制备PCR反应混合液，包括DNA模板、引物、荧光染料和酶。

（2）将PCR反应混合液分装到PCR试管中。

（3）将不同浓度的模板DNA分别加入PCR试管中。

（4）使用实时荧光定量PCR仪将PCR试管放入仪器中，进行PCR扩增反应。

（5）实时监测PCR扩增过程中的荧光信号，并记录荧光信号的变化。

结果与讨论：本实验中，我们选取了不同浓度的模板DNA样品并进行PCR扩增反应。

实时荧光定量PCR仪可以实时监测PCR反应中的荧光信号，并根据荧光信号的强度来定量PCR扩增产物的量。

实验结果显示，荧光信号随着PCR反应的进行逐渐增强，并且荧光信号的强度与模板DNA的浓度呈正相关关系。

通过测量荧光信号的强度，我们可以计算出不同浓度的模板DNA的扩增产物的量，进一步定量DNA样本的浓度。