生化复习整理 3
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八、蛋白质的分类后从毛细血管中扩散到组织中并被肌红蛋白结合,供组NN NHN NH 2NH NN HN O NH 2Adenine(A)Guanine(G)N NNH 2O胞嘧啶碱基13氨基式NH N NHO亚氨基式4R RNHN OO胸腺嘧啶碱基1342NNOHON N O OH烯醇式烯醇式酮式RR R--- 酶联免疫吸附分析--- 快速筛查和定量一个抗原(蛋白)在样品 中的存在--- 原理:待测抗原(或抗体)和酶标抗体(或抗原)间的特异结合第三章 核酸的化学 一、核酸与生命遗传● 核酸是生命遗传信息的携带者和传递者。
--- 生命的延续,遗传特性的保持,生长发 育,细胞分化等--- 生物变异,如肿瘤、遗传病、代谢病等● 中心法则 二、核酸的分类和组成 1. 核酸的分类脱氧核糖核酸 DNA -------细胞核内;核糖核酸 RNA ------细胞质中 1.1 脱氧核糖核酸(DNA )● 含有生物物种的所有遗传信息,分子量一般都很大。
● 多为双链分子,其中大多数是链状结构,也有少部分呈环状结构。
1.2 核糖核酸(RNA )● 主要负责DNA 遗传信息的翻译和表达,分子量要比DNA 小得多。
● 为单链分子。
● 按功能分为:mRNA --- 信使RNA (messenger RNA ) tRNA --- 转移RNA (transfer RNA ) rRNA --- 核糖体RNA (ribosomal RNA )snRNA --- 小核RNA (small nuclear RNA ) 具有酶的功能。
多参与RNA 合成后的修饰与加工过程。
2. 核酸的组成● 核酸:线性多聚核苷酸● 基本结构单元:核苷酸 (nucleotide) ● 基本组成成分:磷酸,戊糖, 碱基● DNA 与RNA 结构相似,但在组成成份上略有不同。
(1) 碱基碱基的结构特征1. 都具有呈平面或接近于平面的芳香环结构。
2. 芳香环与环外基团可以发生酮式—烯醇式或氨基式—亚氨基式互变异构。
它主要与pH 和温度有关。
3. 不同的互变异构体形成氢键的能力和方向差异明显,故对核酸的结构和性质有直接的影响(教材p145)。
4. 在大多数细胞的内部,氨基式和酮式占优势,是最稳定的。
碱基的互变异构碱基中形成氢键的位置(见教材p145)5. 嘌呤碱和嘧啶碱分子中都含有共轭双键体系,在紫外区有吸收(260 nm 左右)。
(2)戊糖组成核酸的戊糖有两种。
DNA 所含的糖为β-D-2-脱氧核糖;RNA 所含的糖则为β-D-核糖。
(3)核苷 nucleoside糖与碱基之间通过C-N 糖苷键连接形成糖苷。
(4)核苷酸 nucleotideAPP PCP P OHG T T5'3'3'3'3'3'5'5'5'5'●是核苷的磷酸酯,是核酸的结构单元,如:AMP和dAMP●主要功能--- 作为细胞之间传递信息的信使。
●多聚核苷酸链具有方向性,方向为:(左)5’-pApCpGpTpT-3’-ACGTT-3’系,称为碱基互补。
A和T之间形成两个氢键(A=T),G与CHelical forms of DNAMajor Groove(大沟)and Minor Groove(小沟)DNA三螺旋结构的概念。
区、二氢尿嘧啶区、T CG区和可变区。
除了氨基酸接受区外,其余每个区均含有一个突环和一个臂。
tRNA中的特殊碱基(1) 氨基酸接受区(图中上方方框部分)包含有tRNA的3’-末端和5’-末端。
氨基酸可与3’-末端的A成酯,该区在蛋白质合成中起携带氨基酸的作用。
(2) 反密码区(图中下方方框部分)与氨基酸接受区相对的一般含有7个核苷酸残基的区域,其中正中的3个核苷酸残基称为反密码子。
四、核酸的性质1. 核酸的两性性质及等电点●核酸分子两性性质.既含有酸性基团(磷酸基)也含有碱性基团(氨基)●核酸的等电点比较低。
如DNA的等电点为4~4.5,RNA的等电点为2~2.5。
●RNA的等电点比DNA低的原因:RNA分子中核糖基2’-OH通过氢键促进了磷酸基上质子的解离。
2. 核酸的水解2.1 酸或碱水解●磷酸二酯键可在酸或碱性条件下水解切断。
●两种核酸对酸或碱的耐受程度有很大差别:如,在0.1 mol/L NaOH溶液中,--- RNA几乎可以完全水解--- DNA在同样条件下则不受影响主要原因:2’-OH的邻基参与作用核糖核酸的碱水解反应2.2 酶水解●核酸水解酶(nuclease): 催化水解多聚核苷酸链中的磷酸二酯键。
●根据作用底物分为:DNA水解酶(DNases):以DNA为底物RNA水解酶(RNases):以RNA为底物●根据作用方式分为:核酸外切酶(exonuclease):从多聚核苷酸链的一端(3‘-端或5’-端)开始,逐个水解切除核苷酸核酸内切酶(endonuclease):从多聚核苷酸链中间开始,在某个位点切断磷酸二酯键RNA内切酶●牛胰核糖核酸酶(RNase I, EC2.7.7.16)作用位点:嘧啶核苷-3’-磷酸与其他核苷酸间的连键(如:5‘-Ap-Up-Gp-Cp-A-3’)。
●核糖核酸酶T1 (RNase T1, EC3.1.4.8)作用位点:3’-鸟苷酸与其他核苷酸间的连键(如:5‘-Ap-Up-Gp-Cp-A-3’)。
●核糖核酸酶T2 (RNase T2)作用位点:3’-腺苷酸与其他核苷酸间的连键(如:5‘-Ap-Up-Gp-Cp-A-3’)。
DNA限制性内切酶●可特异性的水解DNA中某些特定碱基顺序部位,有严格的碱基专一性●一般能识别4~6个特异性脱氧核苷酸顺序。
●当作用于双链DNA时,此酶可以交错地切断两条链(此时产生两条互补的单链,称为粘性末端,Sticky ends),也可以不交错切割(切开的两个末端称为平端, Blunt ends)3. 核酸的紫外吸收●在核酸分子中,由于嘌呤碱和嘧啶碱具有共轭双键体系,因而具有独特的紫外线吸收光谱,一般在260nm左右有最大吸收峰,可以作为核酸及其组份定性和定量测定的依据。
4. 核酸的变性、复性与杂交4.1 核酸的变性(denaturation)●是指核酸双螺旋区的多聚核苷酸链间的氢键断裂,变成单链结构的过程。
●变性核酸将失去其部分或全部的生物活性。
●核酸的变性并不涉及磷酸二酯键的断裂,所以它的一级结构(碱基顺序)保持不变。
●能够引起核酸变性的因素很多。
温度升高、酸碱度改变、甲醛和尿素等的存在均可引起核酸的变性。
●RNA变性所引起的性质变化没有DNA那样明显。
核酸变性的特征a. 增色效应(hyperchromic effect):●天然DNA完全变性后,紫外吸光度(l max = 260 nm)增加25-40%.●RNA变性后,紫外吸收强度约增加1.1%。
●这种因变性所引起的紫外吸收强度增加的现象称为增色效应。
b. 熔点(melting temperature,T m)DNA的变性过程是突变性的,它在很窄的温度区间内完成。
因此,通常将引起DNA变性的温度称为DNA的熔点。
●DNA的T m值与分子中G和C的含量有关。
--- G和C的含量高,T m值高。
--- 测定T m值,可反映DNA分子中G, C含量--- 经验公式: (G+C)%=(T m - 69.3) X 2.444.2 核酸的复性(renaturation)●变性DNA在适当的条件下,两条彼此分开的单链可以重新缔合成为双螺旋结构,这一过程称为复性。
●DNA复性后,一系列性质将得到恢复,但是生物活性一般只能得到部分的恢复。
●热变性的DNA骤然冷却至低温时,DNA不可能复性。
缓慢冷却时,可以复性。
●分子量越大,复性越难。
●浓度越大,复性越易。
●DNA的复性还与它本身的组成和结构有关4.3 核酸的杂交(hybridization)●热变性的DNA单链,在复性时也可以与在某些区域有互补序列的异源DNA单链形成双螺旋结构。
●这样形成的新分子称为杂交DNA分子。
DNA单链与互补的RNA链之间也可以发生杂交5. 核酸的催化性质⏹1982年,美国两位生物化学家T. Cech和S. A. Altman发现了某些核糖核酸(RNA)的催化作用,并提出了“核酶”(ribozyme)的概念。
⏹核酶的发现,证明了核酸既是信息分子,又是功能分子,对于研究生命的起源,了解核酸新功能, 以及重新认识酶的概念等都具有重要意义。
脱氧核酶⏹单链DNA分子同样具有酶活性,这些具有催化功能的DNA分子称为脱氧核酶(DNAzyme),又称酶性DNA,在一定条件下可切割RNA分子特定位点内部的磷酸二酯键。
⏹脱氧核酶的发现进一步延伸了酶的概念核酶的应用⏹人工合成核酶已获成功;⏹核酶的其他作用底物也已被发现,如多糖,DNA以及氨基酸酯等。
⏹核酶在核酸的翻译、表达和核糖体功能中有可能起着重要作用。
⏹理论应用:支持在蛋白质产生以前核酶可能参与催化最初的新陈代谢的设想。
⏹医学应用:作为基因工程药物的两个显著优点:1) 化学本质是核酸,其引起免疫应答的可能性比外源蛋白小得多;2) 一般核酶的分子比较小,易于操作。
五、核酸碱基顺序测定●DNA碱基顺序测定方法DNA单链DNA片断DNA顺序1. Maxam-Gilbert法2. Sanger双脱氧法●RNA碱基顺序测定方法RNA DNA DNA顺序RNA顺序第四章酶一、酶的概念1. 酶的催化特点酶和一般催化剂的共性⏹酶和一般的化学催化剂一样,它能够改变化学反应的速度,但是不能改变化学反应平衡。
⏹酶能够稳定底物形成的过渡状态,降低反应的活化能,从而加速反应的进行。
⏹所以一般的化学催化理论和规律,同样适用于生物催化体系。
①Higher reaction rate②Milder reaction conditions--- Temperatures below 100℃--- Atmospheric press--- Nearly neutral pH③Greater reaction specificity--- enzymatic reactions rarely have side products④Capacity for regulation2. 酶的化学本质及组成(1) 酶的化学本质⏹除少数核酶外,绝大多数酶都是蛋白质⏹具有催化作用的蛋白质就是蛋白质酶--- 酶⏹蛋白质酶具有蛋白质的所有性质⏹空间结构对其催化活性是必需的⏹有比普通蛋白质更为复杂的空间结构,易发生变性(2) 酶的化学组成◆Simple enzyme (单纯蛋白酶)除了蛋白质外,不含其他物质的酶。
◆Conjugated enzyme (结合蛋白酶)由蛋白质和非蛋白部分共同组成的酶。