中山大学三期集群平台

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中山大学三期集群平台用户手册 - 1 - 中山大学三期集群平台 使用手册

中山大学网络与信息技术中心 2012 年12 月27 日 中山大学三期集群平台用户手册

- 2 - 目 录

第一部分:中山大学高性能与网格计算平台用户守则.................................................................................... - 3 - 第二部分:三期集群环境及使用简介................................................................................................................ - 4 - 一、集群系统简介与登陆 ................................................................................................................................... - 4 - 二、编译系统 ....................................................................................................................................................... - 4 - 1、GNU编译器:4.4.6.................................................................................................................................. - 4 - 2、PGI编译器:10.0-0.................................................................................................................................. - 4 - 3、Intel编译器:12.1.0............................................................................................................................... - 4 - 三、并行环境 ....................................................................................................................................................... - 4 - 1、mpich2................................................... ............. ................................................................................... - 4 - 2、openmpi.............................................................................................................................. .................... -5 - 3、mvapich............................................................................... .................................................................... -5- 四、作业调度系统 ............................................................................................................................................... - 5 - 五、数学库 ........................................................................................................................................................... - 5 - 六、科学计算软件 ............................................................................................................................................... - 6 - 七、作业调度系统使用简介 ............................................................................................................................... - 7 - 1、后台提交作业qsub .............................................................................. ................................................ - 7 - 2、查看状态qstat ............................................................................ ........................................................ - 10 - 3、查询作业qselect ................................................................................................................................... - 11- 4、挂起作业qhold .................................................................................................................................... - 11 - 5、释放作业qrls ...................................................................................................... ................................ - 12 - 6、重新运行作业qrerun .......................................................................................................................... - 12 - 7、更改作业属性qalter ............................................................................................................................ - 13 - 8、删除作业qdel ...................................................................................................................................... - 13 - 9、给作业发送消息qmsg ........................................................................................................................ - 13 - 10、在结点池之间移动作业qmove ........................................................................................................ - 14 - 11、给作业发送信号qsig ........................................................................................................................ - 14 - 12、查看和管理结点ljrsnodes ................................................................................................................. - 14 - 13、查看所有计算结点的状态shownodes ............................................................................................. - 14 -八.资源分配策略及PBS 脚本相应参数设置指南.......................................................................................... - 15 - 附件:PBS 作业模板............................................................................................... .......................................... - 15 –