第六章NCBI数据模型前言数据模型什么是数据模型生物学家多数熟悉用动物模型来研究人体疾病。
尽管人体疾病有可能在动物中找不到完全相同的形式，但某种动物疾病和人体疾病有相当多的类似性质使咱们能够从动物疾病中取得的数据来推断人体的疾病进程。
通过将肌肉想象成弹簧和水压活塞的组合，将骨骼想象成杠杆臂，能够取得描述肌肉骨骼运动的数学模型。
如此的模型能够对更多复杂的生物系统进行成心义的预测和查验。
显然，若是模型与描述的实际现象能够加倍接近或精致，那么它对所模拟的自然现象的预测和明白得就更成心义。
八年前，NCBI介绍了一种新的序列相关信息模型。
这种新模型使基于Entrez系统的完整数据库GenBank的成立和相应的软件取得快速的进展。
该模型具有如下优势：它能轻而易举的从已发布的说明的DNA序列映射到编码蛋白，到基因的染色体设计，到三维蛋白质的结构（见第5章）。
该模型的优势对生物学家利用Entrez有专门大的帮忙。
可是很少有生物学家了解该模型的基础。
当基因信息变得愈来愈丰硕，愈来愈复杂的情形下，显现了很多符合 GenBank数据，且模型本身更好明白得的实际数据模型。
这一章不深切讨论细节，只介绍一些有效的索引及NCBI模型所起的作用。
模型的一些例子GenBank数据是以DNA为中心角度的数据报告（见第2章），也确实是以CDS特点为代表的一段编码蛋白质的DNA序列。
限定符/translation="MLLYY"描述了将CDS特点翻译成的氨基酸顺序。
其它的DNA特点（例如mat-肽）有时被GenBank 数据应用来描述未命名蛋白质（部份由/translation描述）的切分产物，但这不是一种令人中意的解决方式。
相反，大多数蛋白质序列数据库以蛋白质为中心角度，如此可能完全失掉其与编码基因之间的联系，或只是间接的用序列号表示其联系（这并非提供准确的对基因突变分析有重要作用的密码子--氨基酸对应关系）。
NCBI数据模型直接构造了包括DNA和蛋白质序列的模型。
[1]. SQL语言具有数据定义、数据查询和数据更新的功能。
V[2]. ERP和MRPI之间的关系是_____________ 。
A.ERP在MRPI的基础上增加了许多新功能B.MRP H所涉及的范围大于ERPC.MRP H是在ERP的基础上发展起来的D.和ERPt目比较，MRRI的功能更强[3]. 在信息系统开发中，对应用单位进行初步调查，研究拟建系统初步方案的工作应在________ 阶段进行。
A.系统规划阶段B.系统分析阶段C.系统设计阶段[4]. 在信息系统开发中，数据库系统设计分为三个阶段，依次为___________ 结构设计、逻辑结构设计和物理结构设计。
概念⑸. 关系数据模型的基本结构是__________ 。
A.模式B.线性表C.模块表D.二维表⑹. 从信息处理的深度看，下列叙述中错误的是_____________________ 。
A.信息处理系统分为管理业务系统、辅助技术系统和办公信息系统B.管理业务系统有面向操作层和面向管理层二类C.CAD、CAM属于辅助技术系统D.信息检索系统属于信息分析系统[7]. 分布式数据库系统是各个节点上局部DBMS勺一种合作，但每个节点上必须增加的软件是_______________ 。
应用软件[8]. SQL语言是为关系数据库配备的过程化的语言。
X[9]. 在信息系统规划阶段，采用________ 方法，可以保证系统结构的整体性和信息需求的一致性。
自顶向下[10]. 下面关于关系数据模型的描述中，错误的是______________ 。
A.关系操作的结果也是关系B.关系模式的主键是该模式的某个属性组C.关系模型的结构是二维表D.关系模型与关系模式是两个相同的概念[11]. 数据流程图的英文缩略词为__________ 。
A.DDB.CASEC.DFDD.CAD[12]. 在学生成绩管理系统中，有学生表S,其模式为S（S#,SNAME,SEX,AGE。
第一章数据库系统概述1.几个概念：数据、数据库、数据库管理系统(DBMS)、DDL（数据库模式定义语言）、DML(数据操纵语言)、数据库系统（DBS）.2. 数据库系统的三级模式结构由外模式、模式、内模式三级构成模式（逻辑模式）：是数据库中全体数据的逻辑结构和特征的描述，是所有用户的公共数据视图。
内模式（存储模式）：对应于物理级，它是数据库中全体数据的内部表示或底层描述，是数据库最低一级的逻辑描述，它描述了数据在存储介质上的存储方式翱物理结构，对应着实际存储在外存储介质上的数据库。
外模式（子模式或用户模式）：是数据库用户（包括应用程序员和最终用户）能够看见和使用的局部数据的逻辑结构和特征的描述.3.数据库的二级映象功能与数据独立性数据库管理系统在三级模式之间提供了两层映象:外模式/模式映象（体验逻辑）、模式/内模式映象（体现物理）这两层映象保证了数据库系统中数据的逻辑独立性和数据的物理独立性.4.构成数据模型的三要素：数据结构、数据操作和数据完整性约束。
5.数据模型的分类：第一类是概念模型，第二类是逻辑模型和物理模型。
概念模型按用户的观点来对数据和信息建模，主要用于数据库设计。
逻辑模型按计算机系统的观点对数据建模，主要用于DBMS的实现。
信息世界涉及的概念主要有：实体、属性、码、域、实体型、实体集、联系。
概念模型的表示方法：实体-联系表示法，即E-R模型（E-R图）。
第二章关系数据库1．几个概念：什么是码、候选码？什么是主码、外码、主属性、全码？码：唯一标识实体的属性集称为码。
候选码：若关系中的某一属性组的值能惟一地标识一个元组，则称该属性组为候选码。
主属性：候选码的诸属性称为主属性。
全码：关系模式的所有属性是这个关系模式的候选码，称为全码。
外部码（外码）：设F是基本关系R的一个或一组属性，但不是关系R的码，Ks是基本关系S的主码。
若F与Ks相对应，则称F是R 的外码。
并称R为参照关系，F为被参照关系。
