生物化学复习资料

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Sanger反应在弱碱溶液中Aa与2,4-二硝基氟苯(FDNB)反应,生成黄色的二硝基苯氨基酸(DNP-Aa),Sanger首先用此反应鉴定多肽链或蛋白质的NH2末端氨基酸。

Edman反应;在弱碱条件下Aa与异硫氰酸苯酯(PITC)反应生成苯乙内酰硫脲衍生物,生成的衍生物可通过层析法分离鉴定,Edman首先用此反应鉴定多肽的N-端AA。 异硫氰酸苯酯

苯氨基硫甲酰衍生物 苯乙内酰硫脲衍生物 (PTC-氨基酸) (PTH-氨基酸)

还原型谷胱甘肽(GSH) 氧化型谷胱甘肽(GSSG) 核磁共振(NMR, Nuclear magnetic resonance

在蛋白链中,羰基和氨基具有形成氢键的潜能,蛋白质链内和链间氢键促使蛋白质形成一些规则的折叠单元,即所谓的二级结构. 超二级结构和结构域 若干相邻的二级结构元件(主要是α-螺旋和β-折叠)以及它们之间的联接片段组合在一起,彼此相互作用,形成种类不多的、有规则的二级结构组合或二级结构串,在多种蛋白质中充当三级结构的构件,称为超二级结构。 三种基本的组合方式:αα,βαβ,ββ 。多肽链在二级结构或超二级结构的基础上形成三级结构的局部折叠区,它是相对独立的紧密球状实体,称为结构域(structure domain, domain). 含序列上连续的100-200个氨基酸残基,少至40个左右,多至400个以上。 对较小的球状蛋白质分子或亚基来说,结构域与三级结构是一个意思。 对于较大的蛋白质或亚基,其三级结构往往由两个或多个结构域缔合而成。

能引起免疫反应的任何分子或病原体称为抗原(antigen). 一个单独的抗体或T细胞受体只能结合抗原内的一个特定分子结构,称为它的抗原决定簇(antigenic determinant)或表位(epitope).

相对分子质量小于5000的分子一般没有抗原性。这种本身无抗原性,与载体蛋白结合后有了抗原性的物质

COOHO2NNO2FHF+H2NRCHNO2

O2NHNCHRCOOH+

DNP-Aa

RROCCCHNSNH(CH3NO2)HOHHO

CCCHNSN

H+称为半抗原(hapten). ELISA(enzyme-linked immunosorbent assay,酶连免疫吸附测定) 加入高浓度的中性盐(如[H4N]2SO4、Na2SO3 、NaCl等),可有效破坏蛋白质颗粒的水化层,同时又中和了蛋白质的电荷,使蛋白质产生沉淀。这种加盐使蛋白质沉淀析出的现象称为盐析(salting out)。 盐溶(salting in):低浓度的中性盐可增加蛋白质的溶解度。由于蛋白质分子吸附某些盐类离子后,带电表层使蛋白质分子相互排斥,而蛋白质分子与水分子的相互作用加强,因此溶解度提高。 转速,rpm(rotation per minute) 聚丙烯酰胺电泳(PAGE) SDS电泳

凝胶层析(凝胶过滤,分子排阻层析) 大分子快,小分子慢 含量测定 1 凯氏(Kjeldahl)定氮法: 浓硫酸加热降解蛋白质后测定NH3 2 双缩脲(biuret)法: CuSO4与肽链的氨基结合 3 Folin-Phenol法: 芳香族氨基酸侧链发色 4 Bradford法: 考马斯亮兰 ( Coomassie brilliant blue G250)与肽链结合后吸收谱变化 5 紫外法: 280纳米处的紫外吸收 (1 OD280 = 1 mg/ml) 分子量的测定 SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳 凝胶过滤 质谱 蛋白组(proteome),某一组合细胞表达的全部蛋白。 蛋白组学的研究方法。 双向电泳 质谱 蛋白质芯片 酵母双杂交

酶(enzyme): 是由活细胞产生的蛋以蛋白质为主要成分的生物催化剂 酶能显著地降低活化能,故能表现为高度的催化效率。 高效性 专一性 易失活 活性受调节控制 有些酶的活性与辅因子参与相关

单成分酶(单纯酶,simple enzyme): 是基本组成单位仅为氨基酸的一类酶不含其他成分,它的催化活性仅仅决定于它的蛋白质结构。 双成分酶(结合酶,conjugated enzyme ): 这类酶分子中除了蛋白质部分(酶蛋白,apoenzyme )外还有非蛋白质成分(辅因子,cofactors ),两者结合成的复合物称作全酶(holoenzyme) 。 全酶 = 酶蛋白 + 辅因子(辅酶、辅基、金属离子)

单体酶(monomeric enzyme ) 单体酶只有一条多肽链,这一类酶很少,一般为水解酶类,相对分子质量为13000~35000。寡聚酶(oligomeric enzyme) 寡聚酶由几个甚至几十个亚基组成,亚基相同或不同,亚基间以非共价键结合,用4 mol/L尿素溶液或其它方法可以把它们彼此分开。 寡聚酶的相对分子质量从35 000到几百万。 多酶体系(multienzyme system) 多酶复合体是由几个酶聚合(嵌合)而成的复合体。一般由在系列反应中2~6个功能相关的酶组成,它有利于一系列反应的连续进行,以提高酶的催化效率,同时便于机体对酶的调控。

酶分子很大,其催化作用往往并不需要整个分子催化活性仅与酶的一小部分区域有关,这一区域就是酶的活性中心。 酶的活性中心也称活性部位(active site),是指酶分子中与底物结合并起催化反应的空间部位。 结合部位,由一些参与底物结合的有一定特性的基团组成 催化部位,由一些参与催化反应的基团组成,底物的键在此处被打断或形成新的键,从而发生一定的化学变化。

脂肪酸的物理和化学性质 非极性烃链是造成脂肪酸在水中溶解度低的原因,烃链越长,溶解度越低。 脂肪酸和脂肪酸化合物的熔点也受烃链长度和不饱和程度的影响。不饱和脂肪酸比相同链长的饱和脂肪酸熔点低,对相同链长的不饱和脂肪酸,双键越多熔点越低。顺式异构体的熔点又比反式异构体低。 ☺ 淀粉酶促水解 淀粉酶促水解 淀粉酶、-淀粉酶、脱支酶和麦芽糖酶参与了植物体内的淀粉水解。 -淀粉酶耐热(70℃,15min)不耐酸(pH3.3),在淀粉分子内部随机水解-1,4糖苷键,将直链淀粉水解的产物为葡萄糖、麦芽糖;将支链淀粉作用产物为葡萄糖、麦芽糖和糊精。 -淀粉酶耐酸不耐热,从多糖的非还原端的-1,4糖苷键,将直链淀粉水解成麦芽糖;将支链淀粉(或糖原)水解为麦芽糖和极限糊精。 脱支酶(R酶)可专一水解-1,6糖苷键。支链淀粉经淀粉酶水解产生的极限糊精,由脱支酶水解去除-1,6键连接的葡萄糖,再在-淀粉酶和-淀粉酶作用下彻底水解。 麦芽糖酶水解麦芽糖和糊精中的-1,4糖苷键,生成葡萄糖。 ☺ ☺ 糖酵解是指葡萄糖在酶的作用下,在细胞质中经一系列脱氢氧化分解成丙酮酸的过程。 EMP的生化历程 糖酵解分为己糖的磷酸化、磷酸己糖的裂解和丙酮酸的生成三个阶段,共10个反应组成。 ☺ 在底物氧化过程中,将底物分子中的高能磷酸基团直接转移给ADP,偶联生成ATP的反应称为底物水平磷酸化(substrate level phosphorylation)。 ☺ ☺ ☺ ☺ ☺

☺ 磷酸戊糖途径是有O2条件下,在细胞质中将葡萄糖直接氧化分解为CO2的过程。 PPP可分为葡萄糖的直接氧化阶段和非氧化的分子重组合阶段。 ☺ 磷酸戊糖途径是通过6-磷酸葡萄糖直接脱氢脱羧将糖氧化分解的,脱氢酶的辅酶为NADP,无ATP的产生与消耗。 ☺ ☺ ☺ ☺ ☺ ☺ ☺ ☺ ☺

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1.TCA的生理意义 ① TCA是机体获取能量的主要方式。 ② TCA是糖,脂和蛋白质等物质代谢和转化的枢纽。Tca循环一方面是糖,脂和氨基酸彻底氧化分解得共同途径,另一方面循环中间物如草酰乙酸,α-酮戊二酸,柠檬酸,琥珀酰coA和延胡索酸等又是合成糖,脂肪酸,氨基酸和卟啉环等的原料和碳骨架,成为各种物质代谢的枢扭。 ③ TCA的一些中间产物也是某些植物的贮藏物质。如苹果酸,柠檬酸既是生物氧化基质,也是一定生长发育时期一定器官中的积累物质。 2.简述蛋白质结构和功能的关系。 答:机构决定功能,功能反映结构。蛋白质具有一级二级三级甚至四级结构,不同层次的结构决定不同的功能。例如:一级结构和种属差异,分子进化,一些分子病(如镰刀状细胞贫血病)有关。再如,肌红蛋白(mb)和血红蛋白Hb的空间结构决定了它们特殊的储氧和运氧功能。 3.简述代谢合成过程中酶调节的主要方式。 答:1。酶含量的调节。改变酶的含量通过调节其合成速度和降解速度来实现的。 2.酶含量不变。通过改变酶的构像和结构而改变酶的活性。 酶活性通过酶原激活,共价修饰,级联放大,别构效应及辅因子的调节。 4.简述大肠杆菌DNA复制酶类和有关因子。 DNA聚合酶,引物酶,DNA连接酶,单链DNA结合蛋白,DNA拓扑异构酶和DNA解螺旋酶。 5.DNA双螺旋结构模型和特点 1.脱氧核糖和磷酸基通过酯键交替连接成反向平行的两条主链,它们绕一共同轴心向右盘旋形成双螺旋构型。形成大沟和小沟。 2.螺旋直径2nm;螺旋周期包含10bp;螺距3.4nm;相邻碱基对平面的间距0.34nm。 3.碱基位于螺旋的内则,它们以垂直于螺旋轴的取向。磷酸和戊糖位于外侧,彼此间通过磷酸二酯键连接,形成能够DNA的骨架,糖环平面与中轴平行。 4.同一平面的碱基在二条主链间形成碱基对。 A-T、G-C。间以氢键配对。A-T间形成两个氢键,G-C间形成三个氢键。 6.sanger双脱氧测序关键试剂是什么?简述双脱氧测序的原理,基因组测序的策略。

7.简述Emp途径的基本历程。 8.每一步的酶的类别,主要的调控部位。

8.脂类的β氧化和从头合成的差异。 9.简述化学渗透学说