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Parp-1基因Lys940Arg、Phe54Leu多态性及HP感染与胃癌发病风险的关联研究

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Parp-1基因Lys940Arg、Phe54Leu多态性及HP感染与胃癌发病风险的关联研究 单勇1 李玉民2 李汛3 周文策3 石斌3 何明彦3 朱克祥3 何建宏3

【摘要】目的 探讨PARP-1基因Lys940Arg、Phe54Leu多态性与胃癌高发区甘肃河西地区汉族人群胃癌发病风险的关系, 并探讨基因多态性与HP感染等环境因素的相互关系。 方法 选择140名胃癌患者与125名健康人群，采用TaqMan实时荧光定量PCR方法分析PARP-1 Lys940Arg、Phe54Leu基因多态性，采用Warthin-Starry法(W-S法) 检测Hp感染。 结果 Lys940Arg AA、GA和GG基因型频率在病例组和对照组中分别为80.0%、16.4%、3.6%和90.4%、8.8%、0.8%；G等位基因频率分别为12.1%和5.6%。Phe54Leu CC、GC和GG基因型频率在病例组和对照组中分别为90.0%、8.6%、1.4%和92.8%、6.4%、0.8%；G等位基因频率分别为5.7%和4.0%。PARP-1 Lys940Arg G基因型携带者患胃癌的风险

是AA基因型携带者的2.4倍(OR=2.354, 95%CI 1.140-4.861, P=0.018)，并使Hp感染后胃癌发生的危险性增加6.6倍(OR=6.600, 95%CI 1.883-23.135, P<0.05)，使有胃癌家族史者胃癌发病风险增加6.7倍(OR= 6.700, 95%CI 1.257-35.722, P<0.05)。Phe54Leu与Lys940Arg各基因型分布频率相似，其基因多

态与胃癌易感性无关，但G基因型与Hp感染有协同作用，使胃癌发病风险增加5.3倍(OR=5.346, 95%CI 1.177-24.292, P<0.05)。结论 PARP-1基因Lys940Arg多态可能与甘肃河西地区汉族人

群胃癌易感性有关，Phe54Leu多态与胃癌发病风险无相关，但其与Lys940Arg位点可能存在一定的连锁不平衡关系，并可放大940 G基因型的致病风险。 【关键词】胃癌；PARP-1；多态性；易感性

The relationship between PARP-1 gene Lys940Arg and Phe54Leu polymorphisms and susceptibility to gastric cancer associated with HP infection in Han Chinese population Shan Yong, Li Yumin,Li Xun, Zhou Wence, Shi Bin, He Mingyan, Zhu Kexiang, He Jianhong Department of General Sugery，First Hospital of Lanzhou University，Lanzhou 730000，China 【Abstract】 Objective To investigate the relationship of PARP-1 Lys940Arg and Phe54Leu polymorphisms and susceptibility to gastric cancer associated with HP infection in hexi area，Gansu province．Methods The polymorphisms of PARP-1gene were detected by realtime-PCR in 140 patients with gastric cancer (GC) and 125 healthy controls; HP infection was detected by Warthin-Starry¡method．Results The AA, GA and GG genotype frequencies of Lys940Arg were 80.0%, 16.4%,3.6% in GC cases and 90.4%, 8.8%, 0.8% in controls, respectively.The G allele frequency of Lys940Arg among GC cases (12.1%) was higher than that (5.6%) among controls. The G genotype had a more than 2.4-fold increased risk of gastric cancer(OR=2.354, 95%CI 1.140-4.861, P=0.018)．A significantly higher risk of gastric cancer was also seen in cases with Lys940Arg G genotype and H.pylori infector and positive family history than in controls(OR: 6.600 and 6.700, respectively, P<0.05)．The genotype frequencies of Phe54Leu were similar with Lys940Arg, but it didn¡t increased risk of gastric cancer. Conclusion The findings suggest that there be a strong correlation between PARP-1 gene Lys940Arg polymophism and susceptibility to gastric cancer in hexi area of Gansu province , while no any significant associations between Phe54Leu polymorphism and the risk of gastric cancer; simultaneously,

1单勇, 男, 1975-, 兰州大学在读硕士, 研究方向: 消化道肿瘤.

2通讯作者:李玉民,男,教授,博士生导师.730000,兰州大学第一医院普外2科.lym19621225@hotmail.com

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兰州大学第一医院，兰州（730000） http://www.paper.edu.cn we found Phe54Leu polymorphism could enlarge the role of Lys940Arg¡ G genotype. Further studies are warranted to verify these findings. 【Key words】gastric cancer; p53; SNP; susceptibility

近年来的研究表明，DNA修复基因的多态性与个体对胃癌的易感性有关[1,2]。人类细胞DNA的损伤是致癌的重要步骤。机体DNA修复基因在维持基因组功能整体性、修复致癌因素所致的损伤及抗癌过程中有着重要作用[3]。DNA损伤修复能力是影响肿瘤遗传易感性的决定因素，DNA损伤修复基因突变可能影响酶的功能及酶与参与DNA损伤修复的其他蛋白的相互作用而导致癌症易感性增加[4]。聚腺苷二磷酸核糖聚合酶[ poly (ADP ribose) polymerase, PARP]是一个能选择性识别并结合DNA缺口的DNA结合蛋白酶，主要通过修复DNA单链及双链断裂在维持基因组的完整性方面发挥作用[5,6]。PARP家族共有7个成员，PARP-1是第一个被发现，也是迄今为止研究的最清楚的一个成员。PARP-1是一个含量丰富的核内蛋白，它由三个结构域组成，即DNA结合区，自身调节区和NAD结合区。通过前后排列的两个N末端的锌指结构，识别并结合DNA缺口，并召集其他的DNA修复基因共同完成DNA的损伤修复[7,8]。 胃癌是最常见的消化道恶性肿瘤之一。我国胃癌的发病率和死亡率高出世界水平两倍多，甘肃省又属我国胃癌高发区，尤其是河西地区，胃癌检出率为7.79%,死亡率居全国之首[9]。目前，普遍认为胃癌的发生是一个多基因、多步骤的复杂发展过程，是多种环境危险因素与基因共同作用的结果。大量研究已证实幽门螺杆菌(Helicobacter pylori．Hp)感染与胃癌高度相关，1994年国际癌症研究中心(LARC)将Hp列为I类致癌因子。关于PARP-1Lys940Arg和/或Phe54Leu多态性与胃癌易感性的研究国内外尚未见报道。本研究采用TaqMan实时荧光定量PCR方法，探讨甘肃省胃癌高发区人群PARP-1基因Lys940Arg、Phe54Leu多态性、Hp感染在胃癌发生中的作用。 1、对象与方法 1.1 研究对象 胃癌组140例，来自2007年甘肃河西地区（武威、金昌、张掖、酒泉）县、市级以上医院胃镜和/或手术病理切片确诊病例，其中男性104例,女性36例；选择同期同医院排除肿瘤和消化系统疾病的健康体检者125名,男性87例,女性38例，按年龄和城乡情况与病例频数匹配。具体见表1。所有研究对象均为在河西地区居住满20年以上的当地居民。应用统一调查表形式进行调查，包括一般特征、饮食、饮水史、吸烟饮酒史、消化系统疾病史及药物使用情况、胃癌家族史等。 1．2 方法 1.2.1 外周血基因组DNA的提取 以标准静脉穿刺法获取外周静脉血2.5ml，保存于含有EDTA的抗凝管中。使用柱式血液基因组提取试剂盒(BBI，Canada)从外周血白细胞中提取基因组DNA，操作按说明进行，测定所提取DNA的OD260、OD280，-20℃冰箱保存。 1.2.2 PARP-1 Lys940Arg、Phe54Leu多态性的检测 以Primer Premier 5.0 软件设计合成探针及引物，并由上海基康生物技术公司合成（详见表2）。PCR反应总体积为10ul，内含2¡TaqMan Master Mix 5.0µl，p53 Forward primer(浓度10pmol/ul)与Reverse primer(浓度10pmol/ul)各0.45ul，TaqMan Fam probe(10pmol/ul)、TaqMan Hex probe(10 pmol/ul)各0.25ul，模板DNA 2.0ul (100ng DNA)及去离子水1.6ul。反应条件：50℃预变性2min，然后95℃10min，95℃5s，60℃30s，共40个循环，最后72℃延伸6min。应用TaqMan实时定量荧光PCR方法检测（ROTOR GENE 3000实时定量荧光PCR仪），Rotor-Gene

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MDR1基因多态性与胃癌顺铂化疗疗效的相关性

MDR1基因多态性与胃癌顺铂化疗疗效的相关性

MDR1基因多态性与胃癌顺铂化疗疗效的相关性韩忠诚;苏莹;陆佳伟;冯燕艳;柳江【摘要】目的研究多药耐药基因MDR1 C3435 T基因多态性与胃癌患者对顺铂化疗疗效的关系.方法选取102例经病理学确诊的胃癌患者进行顺铂方案的化疗,通过采集患者外周静脉血提取基因组DNA并测序分析,检测MDR1 C3435T基因多态性并分析基因多态性与患者化疗疗效及生存预后的关系.结果 102例胃癌患者中,MDR1 C3435T C/C基因型患者40例(39.2％),C/T基因型患者29例(28.4％),T/T基因型患者33例(32.4％),其中,C/C基因型患者的完全缓解率CR为3.9％,部分缓解率PR为23.6％,有效治疗率CR+PR为27.6％,明显高于C/T(CR=1％,PR=2％,CR+PR=3％)和T/T(CR=0,PR=9.8％,CR+PR=9.8％)基因型患者.与MDR1 C3435T C/T和T/T基因型患者相比,C/C基因型患者的无进展生存时间(PFS)和总生存时间(OS)更长(PFS:P=0.046;OS:P=0.011).Log-rank和COX多因素回归模型证实MDR1 C3435T基因多态性是影响顺铂化疗的胃癌患者生存的独立预后因素(PFS:HR=3.488,P=0.005;OS:HR=2.418,P=0.035).结论MDR1基因C3435T位点多态性与胃癌患者对顺铂化疗疗效和生存预后相关.【期刊名称】《医学研究杂志》【年(卷),期】2019(048)003【总页数】5页(P29-33)【关键词】MDR1;胃癌;基因多态性;顺铂【作者】韩忠诚;苏莹;陆佳伟;冯燕艳;柳江【作者单位】830000 乌鲁木齐,新疆维吾尔自治区人民医院肿瘤科;830000 乌鲁木齐,新疆维吾尔自治区人民医院肿瘤科;215006 苏州大学附属第二医院肿瘤放射治疗科;830000 乌鲁木齐,新疆维吾尔自治区人民医院皮肤科;830000 乌鲁木齐,新疆维吾尔自治区人民医院肿瘤科【正文语种】中文【中图分类】R735.2胃癌是导致全球癌症患者死亡的第2大常见癌症，具有高发生率和高病死率的特征[1]。

LMP基因多态性与疾病相关性的研究现状

LMP基因多态性与疾病相关性的研究现状

【综 述】L MP基因多态性与疾病相关性的研究现状王丹妹,莫燕娜,吉丽敏,何佟【摘　要】　低分子量多肽(LMP)基因定位于MHC2Ⅱ类基因区域内的一个基因组,是内源性抗原加工与呈递颇为重要的一种基因。

LMP基因编码的蛋白L M P2与LMP7组成的二聚体,对于抗原肽的降解有着重要的作用,其酶解产物有着严格的空间模式。

由于L M P基因具有多态性,因此酶解产生的抗原肽具有数量或者空间构相的不同,并具有对抗原肽选择性转运的现象。

体内外多种因素可以调节LMP基因的表达和生物活性,从而影响者病毒的感染过程以及肿瘤的发生。

目前LMPP基因与疾病的相关性,以及其多态性与疾病的遗传易感关联日益受到广泛的关注。

本文就这一领域的研究成果做一综述。

【关键词】　L M P;多态性;相关性【中图分类号】　R349.6　【文献标识码】　A　【文章编号】　167424152(2010)0821033203Advance m en t of Correl a ti on between L ow M olecul ar W e i ght Polypepti de Gene Poly m orph is m and D isea ses　WAN GD an2m ei,MO Yan2na,J I L i2m in,et al.Hum an B ody Functional L aboratory,Hainan M edical College,Haikou571101,Hainan,Chi2na【Abstract】　Low molecular weight polypep tide(LMP)gene l ocated in the MHC2Ⅱgenes in the regi on of a gene gr oup is en2 dogenous antigen p r ocessing and p resentati on of a very i m portant gene.L M P gene encodes a p r otein di m er composed of LMP2andLMP7,the pep tide has an i m portant r ole in the degradati on of its hydr olyzate has a strict s patial patterns.A s the LMP gene haspoly mor phis m,the pep tide p r oduced by enzy matic or s pace has a number of different confor mati on and on pep tides with selective transfer phenomenon.M any fact ors can regulate in vivo exp ressi on of LMP genes and bi ol ogical activity,thus affecting the p r ocessof those infected with the virus and tu mor occurrence.Currently LMPP genes ass ociated with diseases and their genetic poly mor2phis m and suscep tibility t o diseases are paid increasingly wides p read attenti on.I n this paper,results of research in this field are reviewed.【Key words】　Low molecular weight polypep tide;Poly mor phis m;Correlati on 内源性抗原的处理与提呈在免疫性疾病的发病过程中起着很重要的作用,而与MHC2Ⅰ类分子相关性抗原的处理、提呈途径十分复杂。

6446例胃癌内镜下病灶部位特点回顾性分析

6446例胃癌内镜下病灶部位特点回顾性分析

７０２　现代消化及介入诊疗　２０２２年第２７卷第６期ＭｏｄｅｒｎＤｉｇｅｓｔｉｏｎ＆Ｉｎｔｅｒｖｅｎｔｉｏｎ２０２２牞Ｖｏｌ．２７牞Ｎｏ．６

·论著·６４４６例胃癌内镜下病灶部位特点回顾性分析

马婷１，隋癑２，卢俊会２，陈星３ 【摘要】目的　分析山西省胃癌的内镜下病灶部位特点，为该省胃癌的早期检出提供参考依据。方法　收集２０１１年至２０２１年山西省肿瘤医院６４４６例胃癌患者的临床资料，包括性别、年龄、内镜下病灶部位、慢性萎缩性胃炎及幽门螺旋杆菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）患病情况。按照病灶部位分为胃上部（贲门胃底部）组、胃中部（胃体部）组、胃下部（胃窦部）组，其中贲门癌的病灶部位分为贲门小弯、贲门前壁、贲门大弯、贲门后壁。统计胃癌患者的内镜下各病灶部位分布占比情况。评估三组胃癌患者性别、年龄、慢性萎缩性胃炎患病情况、Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ感染率差异。结果　胃上部癌在三组中最多见（３２５８／６４４６，５０５％），其中以贲门后壁占比最多（９５９／３２５８，２９４％）。早期胃癌中同样以胃上部癌占比最多（３８５／６８６，５６１％），其中６７５％病灶集中于贲门后壁（２６０／３８５，６７５％）。胃上部癌中男性占比、老年人占比均较其他部位明显更高（Ｐ＜０００１）。胃下部癌慢性萎缩性胃炎和Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ阳性率均相比其他部位明显更高（Ｐ＜０００１）。结论　山西省内镜医师对高龄男性人群应高度警惕胃上部癌的存在，行胃镜检查时尤其注意重点关注贲门后壁及小弯侧，对于黏膜萎缩及Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ阳性患者应当警惕胃下部癌的存在。【关键词】　胃癌；胃镜检查；好发部位；年龄；幽门螺旋杆菌中图分类号：Ｒ７３５．２；Ｒ５７３　文献标志码：Ａ　ＤＯＩ：１０．３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１６７２－２１５９．２０２２．０６．００９

作者单位：１０３００１３山西医科大学第二医院消化内科；２山西医科大学第一医院消化内科；３山西医科大学第一医院胃肠外科通信作者：陈星，Ｅｍａｉｌ：ｃｈｅｎ０４１９ｘｉｎｇ＠１６３．ｃｏｍ基金项目：山西省重点研发项目（２０１９０３Ｄ３２１１４０）

口腔菌群与胃癌相关性的研究进展

口腔菌群与胃癌相关性的研究进展

doi:10.3971/j.issn.1000-8578.2024.23.0850口腔菌群与胃癌相关性的研究进展张聚1,2，董强1，时永全1Research Progress on Association Between Oral Bacteria and Gastric CancerZHANG Ju1,2, DONG Qiang1, SHI Yongquan1 1. State Key Laboratory of Holistic Integrative Management of Gastrointestinal Cancersand National Clinical Research Center for Digestive Diseases, Xijing Hospital of Digestive Diseases, Fourth Military Medical University, Xi’an 710032, China; 2. Department of Gastroenterology, Pingdingshan Medical District, 989 Hospital of PLA Joint LogisticsSupport Force, Pingdingshan 467099, ChinaCorrespondingAuthor:SHIYongquan,E-mail:*****************.cnAbstract: Gastric cancer is one of the major types of cancer threatening human health worldwide. Its pathogenesis has not been fully elucidated, and patients are often diagnosed at an advanced stage. The oral cavity is the second largest microbial pool after the intestine in the human body, and thus the relationship between oral bacteria and human health is attracting increasing interest. Oral bacteria are closely related to gastric cancer and potentially serve as noninvasive diagnostic screening biomarkers for the disease. Imbalance in and displacement of these bacteria can promote the occurrence and development of gastric cancer. Hence, this article reviews the association between oral bacteria and gastric cancer, aiming to provide a basis for further elucidating the pathogenesis of gastric cancer and screening it early through noninvasive methods and serve as a reference for subsequent related research.Key words: Gastric cancer; Oral bacterium; Diagnosis; BiomarkerFunding: Key R&D Plan of Shaanxi Province (No. 2023-ZDLSF-35)Competing interests: The authors declare that they have no competing interests.摘 要：胃癌是世界范围内严重威胁人类健康的一种癌症，其发生机制尚未完全明确，且大部分患者确诊时已是晚期。