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肿瘤基因组学及其对肿瘤诊断和治疗的意义肿瘤是人类面临的一个重大健康挑战，它在近年来已经成为全球主要的死因之一，尤其是在发展中国家。
肿瘤的发生与基因的变异有着密切的关联，肿瘤基因组学的出现为我们提供了一种全新的解决问题的方式。
这篇文章将从肿瘤基因组学的概念、技术、应用和前景四个方面来阐述其对肿瘤诊断和治疗的意义。
一、肿瘤基因组学的概念肿瘤基因组学是研究肿瘤遗传学、基因组学和生物信息学的交叉学科，它主要是研究肿瘤基因组、转录组、表观遗传学和代谢组学等方面的问题。
肿瘤基因组学的研究对象是肿瘤细胞的基因组，主要目的是寻找与肿瘤发生发展有关的基因和分子机制，并通过“定制化治疗”手段对肿瘤进行精准的治疗。
二、肿瘤基因组学的技术肿瘤基因组学的技术手段主要包括基因测序、蛋白质组学、代谢组学、表观遗传学和单细胞技术等。
其中，基因测序是肿瘤基因组学研究的重要技术手段，通过对肿瘤细胞DNA的全基因组测序、外显子测序、全转录组测序等手段，可以全面了解肿瘤基因组的异常变异情况，分析癌基因、抑癌基因、肿瘤突变、拷贝数变异及染色体变异等。
三、肿瘤基因组学的应用肿瘤基因组学的应用在肿瘤的精细化诊断、靶向治疗、分子标志物发现等方面展现出了巨大的潜力和优势。
1、精细化诊断：通过对肿瘤的基因组变异情况的分析，能够对肿瘤的类型、恶性程度、预后等进行精准的评估。
例如通过检测特异性EGFR突变基因，可以更好地判断肺癌患者的预后和治疗方案，为临床医生提供更为准确的诊断依据。
2、靶向治疗：肿瘤基因组学灵活的治疗方式，使得以往的万金油式的广谱化疗法可以被精准的靶向治疗法所代替。
例如，HER-2基因放大的乳腺癌患者的治疗效果可以通过特异性抗体的靶向性药物来得到明显的提高。
3、分子标志物发现：肿瘤基因组学不仅在肿瘤诊断和治疗上发挥着重要作用，在肿瘤预防和筛查上也是一项具有重要意义的研究领域。
通过对不同阶段肿瘤的基因组变异情况的分析，可以发现不同的分子标志物，并且在临床上进行应用，可以提高早期诊断准确率和治疗成功率。
蛋白质药物的研发与应用前景近年来，随着医药研发技术的不断发展，蛋白质药物越来越受到人们的关注。
蛋白质药物是指以蛋白质为活性成分的药品，具有高度特异性和生物活性，可用于治疗肿瘤、自身免疫疾病、心血管疾病等多种疾病。
本文将介绍蛋白质药物的研发和应用前景。
一、蛋白质药物的研发目前，蛋白质药物的研发主要分为三个阶段：基础研究、前期临床研究和临床试验。
其中，基础研究是蛋白质药物研发的基础，主要是通过基因克隆、蛋白表达及纯化等手段获得目标蛋白质，并对其进行结构与功能分析。
前期临床研究主要是对目标蛋白质进行药代动力学、毒理学、药效学等评价，确定其适应症、给药途径、剂量等参数。
临床试验是最后一个阶段，主要是对蛋白质药物进行第一、二、三期临床试验，评价其疗效和安全性。
目前，蛋白质药物的研发主要面临以下几个问题：1.生产成本高：蛋白质药物的生产过程复杂，需要大量的纯化和检测工作，因此生产成本较高。
2.不稳定性：蛋白质药物存在不稳定性，容易受到体内环境的影响。
3.免疫原性：蛋白质药物具有一定的免疫原性，容易引起免疫系统的反应。
为了解决这些问题，研究人员采取了许多创新性的策略。
例如，通过改变蛋白质结构和/或引入化学修饰物质，改善蛋白质药物的稳定性和免疫原性。
另外，也在努力研发新的技术和工艺，以降低蛋白质药物的生产成本。
二、蛋白质药物的应用前景蛋白质药物具有高度特异性和生物活性，可用于治疗多种疾病。
以下是蛋白质药物的主要应用领域：1.肿瘤治疗：目前许多蛋白质药物被广泛应用于肿瘤治疗，例如TNF-α抑制剂、PD-1抑制剂等。
这些蛋白质药物可阻止肿瘤生长、促进免疫系统对癌细胞的攻击，从而有效地治疗肿瘤。
2.自身免疫疾病治疗：许多自身免疫疾病是由免疫系统攻击自身组织导致的，蛋白质药物可以通过调节免疫系统的功能，抑制自身免疫反应，缓解症状。
例如，TNF-α抑制剂可用于治疗类风湿性关节炎、肠炎等疾病。
3.心血管疾病治疗：目前许多蛋白质药物也被广泛应用于心血管疾病治疗，例如ACE抑制剂和β受体阻滞剂等。
BioID技术在肿瘤蛋白质组学中的发展与应用【摘要】BioID技术是一种新兴的蛋白质组学技术，已在肿瘤研究中得到广泛应用。
本文主要介绍了BioID技术的原理及其在肿瘤蛋白质组学中的应用。
通过该技术，研究人员可以快速而准确地识别蛋白质相互作用网络，揭示了肿瘤发生和发展的机制。
BioID技术还在转录组学、蛋白质鉴定和靶向治疗等方面展现出潜力。
未来，随着技术的不断改进和完善，BioID技术将在肿瘤蛋白质组学研究中发挥越来越重要的作用，为肿瘤治疗提供更多的可能性。
【关键词】BioID技术、肿瘤、蛋白质组学、蛋白质互作网络、转录组学、蛋白质鉴定、靶向治疗、未来发展、治疗、肿瘤治疗、总结。
1. 引言1.1 BioID技术简介BioID技术是一种基于生物体内生物素连接酶（BirA）介导的蛋白质互作的新型生物化学工具。
该技术利用生物素和生物素连接酶相互作用的特异性，将生物素标记的蛋白与靶蛋白特异性地连接在一起。
通过生物素连接酶催化生成活性化的生物素，从而实现标记蛋白质与靶蛋白质的接近，进而识别和鉴定蛋白质相互作用。
这种技术在蛋白质组学中具有高度的特异性和灵敏性，可以帮助研究人员快速准确地识别蛋白质间的相互作用关系。
BioID技术的出现为肿瘤蛋白质组学研究提供了新方法和思路。
通过将生物素标记的蛋白质引入肿瘤细胞中，并结合质谱技术对标记的蛋白进行鉴定和定位，可以揭示肿瘤细胞中复杂的蛋白互作网络。
这种技术不仅可以帮助研究人员了解肿瘤发生发展的分子机制，还可以为肿瘤的治疗和预防提供新的靶点和思路。
BioID技术的引入，将为肿瘤蛋白质组学研究带来更深入的挖掘和更广阔的应用前景。
1.2 肿瘤蛋白质组学概述肿瘤蛋白质组学是一门研究肿瘤组织中蛋白质表达和功能的学科领域。
随着科技的不断进步和发展，肿瘤蛋白质组学已经成为肿瘤研究中至关重要的一部分。
在肿瘤蛋白质组学领域，研究人员通过对肿瘤细胞中蛋白质的定量和定性分析，揭示了肿瘤细胞的分子特征和生物功能，为肿瘤的预防、诊断和治疗提供了重要的科学依据。
蛋白质工程技术在生物医学领域中的应用蛋白质工程技术是一个综合性学科，其中涉及了生物学、化学、生物化学、微生物学、分子生物学、遗传学等多个学科。
在现代医学领域，蛋白质工程技术得到了广泛的应用。
本文将介绍蛋白质工程技术在生物医学领域中的应用及其意义。
一、蛋白质工程技术是什么？蛋白质工程技术是指利用分子生物学、生物化学和化学等多学科手段对蛋白质进行改造，以实现特定功能和性质的调节。
主要包括四个方面：蛋白质纯化技术、高效表达技术、野生型蛋白质突变优化技术、蛋白质异构化分析技术。
通过蛋白质工程技术，科学家们可以对蛋白质的构造和功能进行改造，不仅有助于揭示蛋白质的基本工作原理，而且能够使其具备针对性的生物活性和生物学功能。
因此，蛋白质工程技术被广泛应用于医学、化学、农业、环境等多个领域。
二、蛋白质工程技术在生物医学领域中的应用1. 制药行业在制药行业中，蛋白质工程技术被广泛应用于新药的研发。
蛋白质药物是制药业的一个新兴领域，其主要作用是通过特异性的蛋白质-蛋白质和蛋白质-小分子相互作用，精准地治疗疾病。
目前，蛋白质药物已经成为临床上很多疾病的重要药物，并被证明具有高效、低毒性和良好的安全性。
蛋白质工程技术可以使得蛋白质药物具有更优的药物特性，如生物合成、结构稳定性、收缩时间等。
例如，利用蛋白质工程技术，可以改变蛋白质的结构、合成结构稳定性和药物的半衰期，从而使药物在体内的表现更好、更长，并且可以降低药物的不良反应。
此外，蛋白质工程技术还可以通过修饰蛋白质表面Leu，Phe、Tyr、Met、Ser、Thr等位点，提高药物的识别特异性、抗原性和亲和性，从而提高药效和治疗效果。
2. 诊断工具在医疗领域，蛋白质工程技术也能为临床诊断提供强有力的支持。
比如，将注射用标记物与特定的蛋白质分子结合，可以在生物体内实现对癌症和病原体的诊断，同时使得药物进入组织成像更加的准确和高效。
目前，有一种叫做ELISA（酶联免疫吸附测定法）的诊断方法，利用蛋白质工程技术将恶性肿瘤标志物和其他蛋白质纳米粒子结合，可以快速和准确地检测特定的血液总蛋白质通过标识癌症的存在。
百泰派克生物科技
分泌蛋白质组学
分泌蛋白组学定义
分泌蛋白是一类在细胞内合成后通过内质网、高尔基体加工并运输到细胞外起作用的蛋白质。
分泌蛋白组学，顾名思义，就是专门研究分泌蛋白的科学，是蛋白组学的一个分支。
很多重要的调节生命活动的蛋白质都是分泌蛋白，如消化酶（唾液淀粉酶、胃蛋白酶、胰蛋白酶）、生长因子、抗体、毒素以及蛋白质多肽激素（胰岛素、胰高血糖素、甲状腺激素、促甲状腺激素）等。
分泌蛋白组学的应用
分泌蛋白组学在疾病的发生和发展机制特别是肿瘤的临床诊断和治疗方面得到了广泛的应用。
肿瘤细胞的分泌蛋白可以直接进入机体的血液，在血液中的浓度与肿瘤体积呈正比，在肿瘤发展的不同阶段其分泌的蛋白种类和含量都可能发生变化，临床上可将此分泌蛋白当做肿瘤标志物，利用分泌蛋白组学手段对肿瘤进行早期诊断和病情监测。
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基因组学和蛋白质组学的结合在疾病诊断中的应用基因组学和蛋白质组学是现代医学领域的两个重要分支。
随着研究的深入和技术的进步，两者的结合已经成为疾病诊断和治疗领域的重要趋势。
本文将探讨基因组学和蛋白质组学的结合在疾病诊断中的应用。
一、基因组学在疾病诊断中的应用基因组学是研究基因组DNA序列及其功能的学科。
人类基因组的测序已经完成，这为研究基因与疾病之间的关系提供了基础。
基因突变会导致蛋白质的异常表达，从而引起疾病的发生。
随着高通量测序技术的发展，人们可以对数千个基因进行快速测序，大大提高了疾病的诊断效率。
例如，在肿瘤学中，基因组学已经成为一种诊断方法。
通过对肿瘤细胞和正常细胞的基因组测序和比较，可以发现肿瘤中存在的突变和变异。
这些数据可以帮助医生辨认出不同类型的肿瘤，并且可以针对不同的肿瘤类型进行个性化治疗。
此外，基因组学还应用于遗传疾病的诊断。
许多遗传疾病是由基因突变引起的。
通过基因组测序，可以确定这些突变，并且为治疗和预防提供一定的指导。
二、蛋白质组学在疾病诊断中的应用蛋白质组学是研究蛋白质组成和功能的学科。
蛋白质是细胞内最重要的组成部分，其功能包括催化代谢过程、维持细胞结构和参与信号传递等。
蛋白质组学的发展为研究疾病提供了全新的视角。
在医学领域，蛋白质组学主要应用于疾病诊断、治疗和预防。
例如，蛋白质组学已经被应用于肿瘤学中。
通过分析癌细胞与正常细胞的蛋白质组成差异，可以发现癌细胞的特异性标志物。
这些标志物可以被用作肿瘤的早期诊断和治疗的监测。
同样地，蛋白质组学还应用于心血管疾病和神经系统疾病的诊断。
通过分析血液和脑脊液中特定蛋白质的含量，可以发现特定疾病的标志物，并且可以为疾病的诊断和预测提供一定的帮助。
三、基因组学和蛋白质组学的结合在疾病诊断中的应用尽管基因组学和蛋白质组学都可以为疾病诊断提供重要的信息，但是两者之间的联系常常被忽视。
事实上，基因突变通常会导致蛋白质的失调。
因此，将基因组学和蛋白质组学相结合可以更好地了解疾病的发生机制，从而提高疾病的诊断和治疗效果。
SPARC蛋白在肿瘤生物学中的作用研究肿瘤是一种严重的疾病，给全世界带来了极大的负担。
如何治疗肿瘤，防止其转移，是当前医学界研究的重点。
近些年，科学家们发现了一种重要的蛋白质——SPARC蛋白，它在肿瘤生物学中起着重要作用。
本文将从几个方面介绍SPARC蛋白在肿瘤生物学中的作用研究。
1.SPARC蛋白概述SPARC (Secreted Protein Acidic and Rich in Cysteine)蛋白，又叫耐酸耐嗜铜富含半胱氨酸的分泌蛋白(osteonectin)，是一种非胶原蛋白家族成员，广泛分布于多个器官、多种细胞类型和不同种类的组织中。
SPARC蛋白以47 kDa的分子量分泌到细胞外基质中，并发挥不同的功能。
SPARC结构上分为外分泌区、含有19个半胱氨酸的富含碳水化合物区和内部的鸟嘌呤干扰酶链接区等三个部分。
2.SPARC蛋白在肿瘤细胞增殖中的作用SPARC蛋白通过诱导细胞凋亡、抑制肿瘤细胞生长和增殖，发挥着重要作用。
文献报道指出SPARC蛋白在肺、肝、结直肠、胃等多种肿瘤中表达水平往往较低。
SPARC蛋白可以抑制血管生成，在肿瘤细胞周围形成微环境，使肿瘤细胞难以生长，抑制肿瘤的侵袭和转移。
此外，SPARC蛋白还可以诱导人类肿瘤细胞涉及细胞凋亡、细胞周期的控制以及细胞分化等病理生理过程。
因此，SPARC蛋白可以作为治疗肿瘤的靶点之一。
3.SPARC蛋白在肿瘤细胞迁移和转移中的作用SPARC蛋白参与调控细胞外基质的成分，影响肿瘤细胞的侵袭和转移过程。
SPARC蛋白与胶原、纤维网蛋白、骨素蛋白等基质成分相互作用，导致细胞外基质的结构和组成发生变化从而影响肿瘤细胞的活动能力。
此外，SPARC蛋白也可以直接作用于肿瘤细胞，促进其迁移和侵袭。
在血管新生过程中，SPARC蛋白可以影响血管形态的变化，限制血管内皮细胞的的生长和迁移，从而影响肿瘤的血供。
4.SPARC蛋白和肿瘤临床治疗的研究进展SPARC蛋白参与肿瘤的发生发展和预后，对于肿瘤的诊断、分级、预后判断具有一定的价值。
定量蛋白质组学五种常用蛋白质组学定量分析方法对比。
百泰派克生物科技汇总介绍了五种常见定量蛋白质组学分析方法的优势和特点。
SWATH-MS数据可重复性研究。
SWATH在不同实验室间可重复性的研究。
这个研究统计了全世界11个不同的实验室中使用SWATH鉴定的数据重复度情况。
iTRAQ/TMT标签结构以及相对定量原理详解。
通过标记多组不同样品，iTRAQ和TMT能够同时比对正常组织样品和肿瘤组织样品的蛋白水平差异，以及精准检测肿瘤在发展的不同阶段的蛋白水平变化。
蛋白质定量技术及其在临床研究中的应用。
百泰派克采用高通量质谱平台提供蛋白质定量服务，包括定量蛋白质组学，蛋白质定量技术及其他蛋白质组学相关的服务。
百泰派克生物科技独立仪器分析平台，拥有多年蛋白质定量经验，竭诚为您服务。
蛋白组分析中dda和prm。
DDA和PRM是质谱不同的数据采集模式。
DDA主要用于非靶向蛋白质组学的研究，PRM则用于靶向蛋白质组学的研究。
百泰派克生物科技提供基于质谱的DDA、MRM/PRM和DIA蛋白质组学分析服务。
iTRAQ定量蛋白质组学。
iTRAQ蛋白质组学即iTRAQ定量蛋白质组学，是一种标记定量蛋白质组学，指利用iTRAQ标记技术和质谱技术对蛋白质组进行定量。
百泰派克生物科技提供基于质谱的iTRAQ定量蛋白质组学分析服务。
蛋白互作定量检测。
蛋白互作定量检测指对相互作用的蛋白质进行定量。
百泰派克生物科技提供基于质谱的SILAC与免疫共沉淀质谱联用的蛋白互作定量分析服务，可同时实现互作蛋白质组的定性和定量。
DIA蛋白质组学样品处理步骤。
DIA蛋白质组学指利用DIA技术（如SWATH）对样品中的蛋白质组进行检测分析。
百泰派克生物科技提供基于质谱的DIA蛋白质组学分析服务和蛋白质样品制备服务。
功能蛋白质组学。
功能蛋白质组学是蛋白质组学的一部分，其主要目的是研究蛋白质的功能和生命活动的分子机制。
百泰派克生物科技提供基于质谱的功能蛋白质组学分析服务。
超声提蛋白,蛋白组学-概述说明以及解释1.引言1.1 概述概述:随着生物技术的快速发展，蛋白质分析在生物学研究中扮演着重要的角色。
超声提蛋白作为一种新型的蛋白质提取方法，具有快速、高效、环保等特点，被广泛应用于蛋白质组学研究中。
蛋白组学作为一种全面研究蛋白质在生物体内表达、定位、功能等信息的技术手段，可以帮助我们更深入地了解生物体内蛋白质的作用机制。
本文将从超声提蛋白的原理、蛋白组学的应用以及二者结合的意义等方面进行详细探讨，旨在展现这两种技术在生物学研究中的重要性和潜力。
1.2 文章结构:本文分为三个主要部分，分别是引言、正文和结论。
- 引言部分将介绍超声提蛋白和蛋白组学的基本概念，以及本文的研究目的。
- 正文部分将分为三个小节：第一节将详细讲解超声提蛋白的原理，包括其工作原理和应用领域；第二节将探讨蛋白组学在生物学研究中的应用和意义；第三节将探讨超声提蛋白与蛋白组学的结合，分析其优势和潜在的应用前景。
- 结论部分将对本文的研究内容进行总结和归纳，并展望未来超声提蛋白与蛋白组学在生物医学领域的发展潜力和意义。
1.3 目的本文旨在探讨超声提蛋白和蛋白组学在生物科学领域的重要性和应用，以及它们结合的可能性。
通过对超声提蛋白技术和蛋白组学理论的深入解析，我们希望能够揭示这两种方法在蛋白质研究中的优势和局限性，为未来研究提供启示。
此外，我们还将就结合超声提蛋白和蛋白组学在生物医学领域中的潜在应用进行展望，探讨其在疾病诊断、药物研发等方面的重要性。
最终，我们希望通过这篇文章的探讨，为相关领域的研究人员提供有益的参考和启示，促进学术交流和科学进步。
2.正文2.1 超声提蛋白的原理超声提取蛋白是一种常用的蛋白质提取方法，其原理是利用超声波作用于样品中的蛋白质分子，通过超声波的共振效应和剪切力，破坏细胞结构，释放蛋白质。
超声波的高频振动可以导致水分子在共振频率下吸收超声波能量，产生微小水泡，这些微小水泡的爆破作用可以有效地破坏细胞壁，释放蛋白质。
蛋白质组学在中药药理研究中的应用中药是指中国传统医学用以治疗疾病或维持身体健康的药物，也是一种民族文化。
中药由多种天然药物组成，其特殊的组合使其具有良好的治疗效果。
近年来，许多医学学者已经开始使用现代技术，通过揭示中药临床应用过程中的精细调控机制，从而深入研究中药的药理活性及其诱导的作用机制，为中药药理研究及药物开发提供新的思路与方法。
其中，蛋白质组学技术是一项最受欢迎的高科技工具，这种技术既可以识别并鉴定有效的抗病毒或抗肿瘤蛋白或脂质，也可以深入研究药物作用机理。
蛋白质组学技术可以有效探测处理前后的蛋白质表达及组成，从而揭示药物活性和机制。
蛋白质组学结合了多种方法，包括蛋白质质谱、组蛋白质二级结构、蛋白质结合分析等，可以涵盖不同层面的蛋白质信息，及时发现最关键的蛋白质表达、组成调控，可以揭示更多可能与药物作用机制有关的细胞调控机制。
例如，蛋白质鉴定技术可以用来识别有效的抗肿瘤或抗感染的蛋白，从而深入了解中药药理作用机制；蛋白质二级结构分析技术可以揭示药物与特定蛋白受体的作用机制，进而有效控制药物的药效。
蛋白质组学在中药药理研究中的应用，既有助于更好地解释治疗效果，又能为临床实践提供客观依据，也可促进药物开发。
通过蛋白质组学，除了揭示活性化合物的作用机制及临床副作用，还可以直接提炼细胞调控性抗病毒或抗肿瘤的机制，从而构建抗病的药物，从而改善中药药理作用及其临床使用。
此外，蛋白质组学还可以帮助我们发现更多可以用于治疗疾病的对象或系统，从而提高中药药理学研究的准确性及效率，从而使中药药理研究获得更大的进展。
总之，通过蛋白质组学，可以更好地探索中药药理活性及其诱导的作用机制，可以提高中药研发的条件，并为中药药理研究及药物开发提供新的思路与方法。
因此，蛋白质组学在中药药理研究中的应用是非常重要的，也是未来发展的方向。
1蛋白质组学在肿瘤研究和临床应用中的意义 李春海 中国抗癌协会、军事医学科学院
在人类基因组计划的实施和完成后，研究重点已转移到基因的功能上，从而进入基因组时代。而生物功能主要执行者是蛋白质，1994年澳大利亚Macquarie大学的wilkius 和williams首先提出蛋白质组学（Proteome）的概念，Proteome一词是蛋白质（protein）与基因组学（genome）两个词的组合，指的是一种基因组所表达的全部蛋白质，既包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质，而蛋白质组的研究是功能基因组学研究的核心，称为蛋白质组学。其主要内容包括结构蛋白质组和功能蛋白组学，它是从细胞整体水平进行蛋白质特性的研究，如表达水平、翻译后修饰及相互作用等，并由此获得对疾病过程、细胞生理、生化特征和调控网络的广泛完整的认识。所以，蛋白质组学及其技术正在逐步成为生物学、医学及药物学等的理论依据和研究手段。
一、 肿瘤标志筛查策略 1、肿瘤检查传统方法 大多数肿瘤早期无明显症状，因此对肿瘤高危人群进行筛查（Screening）尤为主要，肿瘤筛查是对一般健康的无症状的人群，用适当的指标对其进行检查，从而发现一些指标阳性的人群，并对这些人群或高危人群进一步进行临床检查和随访观察，从而达到早期发现、早期诊断、早期治疗的目的。以往，早期的肿瘤筛查多采用临床上常用检查方法：图像诊断（CT、MRT、PET）化学诊断，（血液学和免疫学）及病理学（细胞学、组织学）如细胞病理学检查；X线检查及各种内窥镜检查；和实验室生化检查，如甲胎蛋白用于肝癌的筛查，前列腺特异抗原用于前列腺癌的筛查，癌胚抗原用于大肠癌的筛查等。其中许多检查目前仍在应用，并取得了良好的效果。此外还有一些经典检查方法如瑞典的一项调查结果表明应用X线以及乳腺自查方法对乳腺癌进行筛查使乳腺癌病死率下降44%[2]。应用巴氏涂片对人群进行宫颈癌筛查使美国宫颈癌死亡率下降70%。
但上述方法应用于人群筛查仍存在很多缺点，主要是有一些属于损伤性检查。筛查方法操作过于复杂、对人体的侵害性较大，人群依从性差及成本高，而有一些肿瘤标志虽然可应用于人群的肿瘤筛查。如PSA用于前列腺癌筛查虽然特异性好，但敏感性差，导致部分患者被漏查；甲胎蛋白用于肝癌筛查由于特异性较差，阳性预测值较低，出现假阳性。因此，肿瘤筛查要选择适当的方法，提高其可操作性及人群依从性，选择高度特异性的标志物，或多种标志物联合检测来提高敏感性和特异性。 2、肿瘤发生发展过程与肿瘤标志的筛选 肿瘤发生过程是一种多基因多阶段多因子的部复杂过程,是癌基因激活和抑癌基因失活的结果.而从组织增生产生原位癌变的过程中，肿瘤发生、启动、增生、癌前病变到成癌过程中除了基因水平的变化外，而在分子水平还有不同的功能性蛋白的参与,这就为寻找与癌变过程有关的相对特异肿瘤标志物提供了线索。 肿瘤进展阶段是处于癌变与成癌之间的一个过渡阶段,早期发生突变并表达的基因在此阶段表达量进一步增强,为侵袭转移提供潜在的动力。转移也是多步骤复杂连续的过程，与转移有关的特殊基因受到激活，并有多种蛋白水解酶的参与。总之，肿瘤在发生发展和转移的过程中,每演进一步在分子水平就有不同的功能性蛋白参与,并且很可能在各个环节相互协调共同表达。因此从肿瘤发生、发展、演进过程的筛选与肿瘤相关的起关键性调控作用的标志,无论从理论上还是从实际的研究来说都是可能的。 最初在寻找分子标志的时候,仅仅局限与某些特定的突变型蛋白(如C-erB-2、p180、雌激素受体等)与表达增强的突变型的蛋白（P53, CycliD 1[3]等）,它们不但可以作为早期发现肿瘤的标志,而且可以作为肿瘤进展程
度的标志.但是随肿瘤恶化程度的增加，多种基因发生突变,已很难从单个蛋白的变化对肿瘤进行诊断分型以及预后判断。因为单个蛋白仅仅是肿瘤恶性发展过程中单一因子的变化，并不能真正反映出癌变过程多种因子的复杂变化.蛋白质组学技术能对不同肿瘤的蛋白表达谱进行全面的分析，这样可筛选出多种肿瘤标志为肿瘤标志物的联合检测提供更多依据。 3、蛋白组学在肿瘤标志筛选中作用 2
目前仅靠原有传统免疫检测技术：如免疫荧光、免疫酶标、免疫印迹以及分子原位杂交等技术,检测癌组织和细胞中的微量表达的组织特异性抗原\细胞系抗原或糖链异常合成的糖蛋白以及肿瘤相关的癌基因、抑癌基因等，但是这不能满足目前临床需要。为了寻找和筛选新的肿瘤相关标志物，需应用先进分子生物学技术,尤其是近年来迅速发展的基因组学,蛋白质学技术及生物信息学。以PCR技术为基础的微卫星技术和单核苷酸多态性(SNP)的测定，使人们可以通过特定引物从患者的体液或肿瘤样品中直接扩增出微量表达的基因,它比传统的PCR技术测定数效率高、目的性强、定位精度高和易于进行自动化分析等优点.而基因芯片与微卫星技术和SNP结合,为高通量、自动化寻找肿瘤相关基因标志提供新的技术途径。 而PCR技术和基因芯片都是通过基因型寻找新的肿瘤基因标志,但不是从具有生物功能的蛋白质进行分析。虽然从mRNA水平能够快速研究相应转录子的表达谱，但在翻译的过程中要进行磷酸化、基化、乙酰化、糖基化等修饰，并不能了解肿瘤发生发展过程中蛋白表达质与量的变化,体内mRNA与相应蛋白的表达水平并没有直接的关系。而细胞信号转导途径中各信号蛋白之间的交流与细胞是否处于休眠静息、分裂增殖、分化，凋亡还是转移等生命活动状态密切有关,而肿瘤的生长依赖多种蛋白质分子，如各种生长因子和酶，而这些蛋白质分子与肿瘤的发生发展有密切关系，因而都可能成为潜在的肿瘤标志。 但是传统的检测方法往往一次只能检测一种肿瘤标志物，而利用单个肿瘤标志物诊断肿瘤，其特异性和敏感性都不够理想。蛋白质组学技术可以高通量快速的筛选肿瘤不同发生阶段基因表达的各种蛋白质，尤其是组织与体液中所含有的与肿瘤相关的低丰度蛋白，从而发现大量有诊断价值的蛋白标志分子，而这些蛋白能够为肿瘤治疗提供新的靶点,为早期诊断提供有效肿瘤标志。联合多种标志物进行肿瘤的筛查将有望提高筛查的特异性与敏感性。
二、 蛋白质组学研究方法 从蛋白质组学分析表明肿瘤是一种蛋白质缺陷病，在其发生过程中有许多蛋白质发生异常变化，而这种变化不仅有蛋白量表达的变化，还有蛋白翻译后加工上的改变，从而导致肿瘤组织表达的蛋白图谱（Protein profile）的变化，所以应用蛋白组学技术检测蛋白图谱的变化可以预测肿瘤发生的变化。目前应用于蛋白组学研究的主要技术有：双向凝胶电泳（Two-Dimensional gel Electrophoresis， 2-DE），质谱技术（Mass Spectrometry ，MS）。微阵列技术（Microarry）和生物信息技术（Bio-Informcnation，BI）。 1、 双向凝胶电泳 1） 原理 双向凝胶电泳技术主要用于分离肿瘤组织样品或体液中的蛋白质，其基本原理首先根据蛋白质等电点和分子量的差异中进行第二向分离。自Ｏ′Ｆａｒｅｌｌ等提出双向凝胶电泳以来，虽有二十多年的历史，直至目前在蛋白质组研究中仍具有不可替代的地位，因为其具有高分辨率和同时具备微量分析和制备样品的性能，仍应用于膀胱癌、肾癌、甲状腺癌症相关肿瘤标志的筛选和研究中。 2） 应用 Ｃｅｌｉｓ［５］等采用双向电泳在膀胱癌病人的尿液中发现了４种蛋白质、银屑素、银屑病相关脂肪酸结合蛋白
５、凝胶溶素片段和前列腺素Ｄ２合成酶．银屑素是一种高钙结合蛋白质，主要由鳞状上皮细胞表达，在银屑病角质细胞中表达增高，仅发现于膀胱鳞状细胞癌病人（squamous cell carcinomas，SCC）的组织及尿液中，而在纯移形细胞癌（transitional cell carcinomas，TCC）中难以检测其表达，因此可将银屑素作为膀胱鳞状细胞癌病人的预后标志。而在肾细胞癌的研究中发现血浆谷胱苷肽过氧化物酶、锰弱氧化物歧化酶两种单体出现在正常的组织中，而锰弱氧化物歧化酶只出现在肿瘤组织中，所以可将两种蛋白作为肾细胞癌的肿瘤标志物[6]。
LIN[7]等双电泳分析了SW579、CGTH W-1、CGTH W-3、RO82 W-1四株甲状腺癌细胞系，发现CGTH W-1、CGTH W-3、RO82 W-1细胞系中有特异的蛋白质，而这些点可以作为甲状腺的肿瘤标志物。 3） 局限性 应用在2-DE技术对病变组织所得分析时，必须慎重，因为一般并不清楚肿瘤进展过程中蛋白质表达的变化是偶然发生的，还是由于来自不同患者的样品之间差异造成的。此外，由于双向凝胶技术本身的问题：如手工操作、难以掌握：很难分离到高级性的蛋白质；由于第二向SDS PAGE的限制，对于低分子量和高分子量的蛋白及样品 3
内低拷贝数的蛋白很难分离；膜蛋白等疏水性的蛋白在制样的过程中丢失太多等等。若不尽快发展蛋白质分离技术，2-DE将不能满足标志物研究的要求。除此之外染色技术也是制约双向凝胶电泳发展的一个重要因素，现在的染色技术已从传统的考马斯亮蓝染色，发展为胶体考马斯亮蓝染色、胶体银染、锌染和荧光染色技术等。 2、激光捕获显微切割技术（laser capture microdissection，LCM） 1） LCM的原理与特点 利用双向凝胶电泳分析肿瘤组织的时候，往往采用的是复合组织，尤其肿瘤组织的异质性在肿瘤组织中既有分化程度不同肿瘤细胞恶性程度不同而且含有正常细胞。所以，由于它混合有不同的细胞类型，所得电泳结果不能作为正常、癌前病变、低侵袭性和高侵袭性癌细胞的蛋白表达特征。要分析复合组织中疾病发展过程中的关键蛋白的表达模式、功能及变化，必须获取肿瘤癌前病变或癌旁组织中相对纯化细胞甚至单个细胞。最近发展起来的激光捕获显微切割技术[8、9]其突出特点是能高效地从复合组织中，特异性挑选出某一特定的同类细胞，乃
至单个细胞，因而特别适用于肿瘤学方面的研究。操作者只要在显微镜下观察选择所需组织或细胞，然后激活显微镜上的一束激光，激光束立即被靶细胞上方转运膜的一个精确点吸收，细胞或组织载体热塑性膜局部温度迅速升高90度左右，后融化并流到靶组织间隙，在激光脉冲结束200m/s内立即冷却，并与靶细胞结合，其结合力比靶细胞与载玻片间结合力更强；此时通过移动与显微镜相连的转运，将靶细胞从组织切片中分离出来。 2) LCM的应用 LCM能避免肿瘤组织的异质性对蛋白分析的影响，可直接将正常组织、癌前病变、低浸润性和高转移的组织细胞分离，再应用双向凝胶电泳与蛋白质芯片技术分析相关蛋白的表达图谱。Emmert Buck[10]等应用LCM技术分析了
前列腺癌与乳腺癌及其正常组织，通过改变激光束直径与脉宽，可获得直径在0.3mm~1.0mm的乳腺癌与前列腺癌癌前病变组织，而没有受邻近肿瘤细胞的干扰。 Jones MB[11]等采用LCM等筛选出三个具有侵润特征和两个具有低恶性（low malignant potential，LMP）
