实验1：数据库操作实验

实验三利用BLAST的数据库比对分析2012454116郑俊昌一、实验目的1、学习BLAST序列相似性网络核酸蛋白数据库比对方法2、进行网络核酸蛋白数据库基因相似性分析二、实验内容1、BLAST工具介绍BLAST® (Basic Local Alignment Search Tool)工具是用查询的DNA或蛋白质序列与所以可能的序列数据库进行相似性搜索的多个程序。

BLAST程序运行速度快，打分合理，容易辨认出真正的匹配与随机背景的不同。

BLAST不仅可以进行局部亦可以进行全局搜索，易于发现一些分隔的相似区段。

BLAST的功能：BLAST对一条或多条序列(可以是任何形式的序列)在一个或多个核酸或蛋白序列库中进行比对。

BLAST还能发现具有缺口的比对上的序列。

BLAST可处理任何数量的序列, 包括蛋白序列和核算序列; 也可选择多个数据库但数据库必须是同一类型的, 即要么都是蛋白数据库要么都是核酸数据库。

下面介绍5个BLAST分析的程序：（1） BLASTP是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。

库中存在的每条已知序列将逐一地同每条所查序列作一对一的序列比对。

（2） BLASTX是核酸序列到蛋白库中的一种查询。

先将核酸序列翻译成蛋白序列（一条核酸序列会被翻译成可能的六条蛋白即六框翻译），再对每一条作一对一的蛋白序列比对。

（3） BLASTN是核酸序列到核酸库中的一种查询。

库中存在的每条已知序列都将同所查序列作一对一地核酸序列比对。

（4） TBLASTN是蛋白序列到核酸库中的一种查询。

与BLASTX相反，它是将库中的核酸序列翻译成蛋白序列，再同所查序列作蛋白与蛋白的比对。

（5） TBLASTX是核酸序列到核酸库中的一种查询。

此种查询将库中的核酸序列和所查的核酸序列都翻译成蛋白质（六框翻译），这样每次比对会产生36种比对阵列。

2、连接NCBI进行BLAST相似性分析BLAST可以通过登录NCBI的BLAST服务器进行，也可以下载BLAST程序及相关数据库后进行本地BLAST分析。

实验一 SQL SERVER 2005的安装与组成一、实验目的及要求本实验主要是要求学生了解Microsoft SQL server 2005安装过程、熟悉SQL Server Management Studio工作界面以及数据库建立。

主要要求有：●了解安装Microsoft SQL server 2005条件及其过程●了解Microsoft SQL server 2005 的结构体系及实例的含义●熟悉SQL Server Management Studio工作环境●熟悉系统数据库的功能●了解数据库文件组成二、实验原理及背景知识（一）SQL server 2005安装环境安装数据库SQL Server 2005有很多软件要求，在安装数据库软件之前，必须准备好这些必要条件，依次按照以下顺序安装相应的内容：1、浏览器软件。

安装Microsoft SQL server 2005之前，需要安装Microsoft Internet 6.0SP1或更高版本。

2、IIS组件的添加：如果Windows服务器没有安装IIS，必须要安装该组件之后，SQL server 2005才能完整安装。

（1）对于Windows 7操作系统，开始”->“控制面板”->程序和功能->打开或关闭Windows功能界面中，添加上Internet信息服务，实现IIS组件的安装，如图2-1-1。

图2-1-1 Windows 7操作系统下加载Internet信息服务界面（2）对于Windows XP操作系统，请从“开始”|“控制面板”|“添加删除程序”|“添加删除Windows组件”进行安装。

如果系统是ghost版本，要下载i386文件或者使用非ghost版本中i386文件。

3、.NET Framework 2.0在安装Microsoft SQL server 2005开始之前，在电脑屏幕给出安装之前必须准备的必要条件信息之前，必须同意终端用户许可协议。

《数据库系统原理》实验指导书索剑2007-11实验1：数据库模式设计及建立（2学时）实验目的：1．掌握数据库模式设计及建立的方法，建立数据库及关系2．比较SQL命令方式和可视化环境管理器方式设计的异同点3．熟悉 SQL SERVER 的企业管理器和查询分析器实验类型：验证实验内容：1．在SQL Server环境中建立“学生-课程”数据库2．使用SQL语言及可视化环境建立“学生-课程”数据库中的表3．观察“学生-课程”数据库的E-R图、逻辑模式以及文件存储之间的联系操作步骤：1．描述教材P59中所叙述的“学生-课程”数据库概念模式2．仔细分析“学生-课程”数据库关系逻辑模式（尤其是实体完整性、参照完整性规则）Student（学生表）:Sno Sname Ssex Sage Sdept95001 李勇男20 CS95002 刘晨女19 IS95003 王敏女18 MA95004 张立男18 IS95005 王强男17 IS95015 张三男20 CS95019 李四男20 CS95020 陈冬男18 ISCourse（课程表）:Cno Cname Cpno Ccredit1 数据库 5 42 数学 23 信息系统 1 44 操作系统 6 35 数据结构7 46 数据处理 27 Pascal语言6 4SC（选修表）：Sno Cno Grade95001 1 6595001 2 8895001 3 5795001 4 7995001 5 4595001 6 9095001 7 8195002 2 9095002 3 8095002 4 5595003 2 095019 2 6695020 13．熟悉SQL SERVER的企业管理器和查询分析器4．在企业管理器可视化环境下创建“学生-课程”数据库，仔细观察物理模式的形成过程5．在可视化环境下建立如上所述关系模式，建立相应的实体、参照完整性，添加关系数据，仔细观察逻辑模式的形成过程6．启动“查询分析器”，编制SQL语言再次实现上述过程。

《数据库原理》实验报告一、实验目的：1、使用Powderdesigner建模工具完成本实验。

2、完成下列表中所描述数据库的概念数据模型设计，对关键字、空值、域完整性等做出必要的描述，根据实际情况确定联系的类型。

3、依据所涉及的概念数据模型（CDM）生成相应的物理数据模型(PDM)，可以对生成的物理数据模型作必要的修改。

4、生成建立数据库的目标代码。

二、实验使用环境：SQL server 2012、Powerdesigne:16.5三、实验内容与完成情况：1.创建概念模型客户与订购单是一对多的关系：一个客户可以有多个订购单，但是一个订购单只能属于一个客户订购单与产品是多对多的关系：一个产品可以有多个订购单，一个订购单也可以包括多个产品内容2.属性数据类型客户表：产品表：订购单表：3.概念模型转换为物理模型由于客户与订购单是一对多的关系，所以客户的主键（客户号）存在于订购单中做外键，加入订单日期由于订购单与产品是多对多的关系，所以订购单的主键（订单号）和产品的主键（产品号）存在于两者的关系订单明细中作为主键和外键，另外加入序号和数量作为4.约束条件客户号：前两个字符为字母客户名称：不允许为空值：邮政编码：6位数字字符电话：数字字符电子邮箱：包含@字符产品号：前两个字符为字母产品名称：值唯一单价：>0客户号：不允许空值订购日期：默认是系统时间序号：自增1，初值15.生成数据库脚本得到商店.sql 脚本，见附件新建数据库测试结果：连接数据源导入数据库：数据库中可看到：数据库关系图：逆向工程数据库导入：先按照上述操作连接SQL SERVER与PowerDensigner，并建立物理模型：教学管理开始导入：成功导入：且数据类型等保持一致：BBS.sql导入：新建物理模型：教学管理选择通过脚本导入导入结果：讲BBS.sql在SQL里运行，产生关系图：两表相同，表示导入成功。

产生报表：报表的作用：在工程较大时，PD中看到的较复杂，但是报表能把复杂的展示简单化，条理清晰地进行表、图、约束等信息的检索查看，让数据更清晰的呈现。