DNA重组技术实验报告

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一、实验名称:

重组DNA技术

二、实验目的:

1.了解掌握DNA重组技术理论基础;

2.掌握质粒载体、外源DNA的准备、酶切、连接技术方法;

3.掌握连接产物的转化方法及操作;

4.掌握阳性重组体的的鉴定和筛选方法;

三、实验原理:

1.重组DNA技术

重组DNA技术是指在体外通过人工“剪切”和“拼接”等方法,对各种生物的核酸(基因)进行改造和重新组合,然后导入微生物或真核细胞内,使重组基因在细胞内表达,产生出人类需要的基因产物,或者改造、创造新特性的生物类型的技术。它主要包括以下几个步骤:

①目的基因的获取:主要有化学合成、PCR、基因组文库、cDNA文库构建等。cDNA文库是以mRNA为模板,利用反转录酶合成与mRNA互补的DNA,再复制成双链cDNA片段,与适当载体连接后转入受体菌,这些受体菌包含了所有cDNA信息,总称cDNA文库。常用于筛选编码蛋白质的结构基因。基因组DNA文库是利用限制性核酸内切酶将组织或细胞染色体DNA切割后,与适当载体连接后转入受体菌,这些受体菌包含了所有基因组DNA信息,因此称为基因组DNA文库。

②基因载体的选择与构建:常用载体有质粒、噬菌体、病毒DNA等。分为克隆载体和表达载体。克隆载体:用于目的基因的克隆、扩增、序列分析和体外

定点突变等。表达载体:用于在宿主细胞中表达外源目的基因,获得大量表达产物。选择好的载体与目的基因利用限制性内切酶切割成合适片段。

③目的基因与载体的拼接:通过粘性末端连接法(同源互补粘性末端连接、非同源互补粘性末端连接)、平端连接、人工接头连接、同聚物接尾、经部分补平的不匹配末端的连接等将目的基因与载体进行连接。

④重组DNA分子导入受体细胞:将连接有目的DNA的载体导入宿主细胞,主要有以下几种方法:a、转化:将质粒或其它外源DNA导入宿主细胞(常用大肠杆菌),并使其获得新的表型的过程。b、转染:将外源DNA导入真核细胞的过程。c、感染:以λ噬菌体、柯斯质粒和病毒为载体的重组DNA分子,在体外经过包装成具有感染能力的病毒或噬菌体颗粒,才能感染适当的细胞,并在细胞内扩增。

⑤重组体的筛选:可通过遗传标记如抗药性标志选择、营养缺陷型的互补筛选法及分子标记(PCR、分子杂交)等直接筛选或是根据免疫化学法、酶联免疫检测法等进行间接筛选。

⑥无性繁殖转化子(含重组分子的受体细胞)

⑦目的基因的表达

2、质粒酶切及鉴定原理

限制性内切酶是一种工具酶,其特点是具有能够识别双链DNA分子上的特异核苷酸序列的能力,能在这个特异性核苷酸序列内,切断DNA双链,形成一定长度的DNA序列。根据限制性内切酶的识别切割特性、催化条件及是否具有修饰酶活性可分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三类,II型限制性内切酶只需要二价镁离子的激活,酶在其识别序列内切割双链DNA,产生的各种DNA片段具有相同的末端结构,而且大多数的II型酶可提供粘性未端,有利于片段再连接,限制性内切酶对环状质粒DNA产生的酶切片段数与切口数一致。因此,鉴定酶切后的片段在电泳凝胶的区带数,就可以推断切口的数目;从片段迁移率可判断酶切片段大小。用已知分子量的线状DNA为对照,通过电泳迁移率的比较,可以粗略地测出分子形状相同的未知DNA的相对分子大小。本实验采用的限制性内切酶是Bam HI 和Hind III。

对于DNA回收,回收的目的是为了纯化提取的质粒,以用于以后的分子

杂交、重组质粒的构建、序列分析等。目前常用的回收技术有:柱纯化回收法、电洗脱法、低熔点琼脂糖凝胶法、DEAE滤膜插片法等,其中柱纯化回收法、电洗脱法,经济节省,操作方便,对DNA回收效果好。本实验采用试剂盒回收(柱纯化回收法),其原理是采用凝胶裂解液融化凝胶,采用特殊的收集管收集DNA 后,漂洗液洗脱杂质,最后用洗脱液洗出DNA。

四、主要实验仪器:不同规格移液器、EP管、常规电泳仪、紫外灯、恒温水浴箱、常规台式离心机、恒温孵箱、CP3吸附柱、收集管、培养皿、酒精灯、玻璃涂布棒等。

五、主要实验试剂:

1. 酶切相关试剂:pUC18DNA、λDNA(TIANGEN, MD202)、Hind III(Thermo, ER0501)、Buffer R (10X) (Thermo, BR5)、BamHI(Thermo, ER0051)、BamHI-Lsp1109I Buffer (10X)(Thermo, B57)、pUC18-mir203 质粒DNA (老师提供)。

2.电泳相关试剂:琼脂糖、GoldView、1kb DNA Ladder(TIANGEN,MD111)、DNA电泳loading buffer(6X)(TIANGEN, RT201-01),电泳缓冲液。

3、凝胶DNA回收:小量琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒(庄盟国际生物,ZP202)。

4. 重组体构建相关试剂:T4 DNA连接酶(Thermo, EL0014)、10X T4 DNA 连接buffer( Fermentas, 00044933)。

5. 转化相关试剂:感受态细胞(本实验用感受态细胞DH5α从公司购买)、LB培养基(老师提供)、含Amp琼脂糖平皿(老师提供)、质粒小量提取试剂盒(庄盟国际生物,ZP101)、ddH2O等。

六、实验步骤:

1. 载体pUC18和目的DNA酶切

(1)质粒DNA酶切反应体系:

反应条件:37℃恒温水浴,2hr;室温下放置等待连接。

(2)目的DNA酶切反应体系:

反应条件:37℃恒温水浴,2hr;

(3)质粒载体双酶切反应体系:

反应条件:37℃恒温水浴,2hr;

根据以上反应体系配制好后,瞬时离心后置于37℃恒温水浴锅中反应。

2.目的DNA酶切片段电泳鉴定

(1)配制1%琼脂糖凝胶:称取0.5克琼脂糖,置于锥形瓶内,加入50ml 1×TAE,瓶口用保鲜膜封盖,在微波炉中加热直至琼脂糖全部溶解,得到1 %琼脂糖凝胶液,待其冷却至65℃左右,加入2.5 μL GoldView。小心混匀并倒在制胶槽中,控制灌胶速度,使胶液缓慢展开,避免产生气泡,待胶凝固完全后,轻轻拔出梳子。将凝胶放入电泳槽中,加入恰好没过胶面1mm深的足够电泳缓冲液,准备电泳。

(2)电泳:取20uL酶切后产物,加入4uL DNA电泳loading buffer混匀,上样20uL。恒压90V电泳40-60min。

(3)紫外灯下观察结果并切胶用于后续试验。

3.目的DNA凝胶条带切割及目的DNA回收

根据试剂盒说明书操作

(1)将单一的目的DNA 条带从琼脂糖凝胶中切下(尽量切除多余部分)放入干净的离心管中,称取重量,约0.3g。

(2)向胶块中加入3倍体积溶胶液(900 µl),55℃,水浴10分钟左右,其间不断温和地上下翻转离心管,以确保胶块充分溶解。

(3)将上一步所得溶液加入一个吸附柱中(吸附柱放入收集管中),12,000 rpm (~13,400×g )离心1 分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放入收集管中。(4)向吸附柱中加入600 μl 漂洗液W2 (使用前加入无水乙醇),12,000 rpm (~13,400×g )离心1 分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放入收集管中。(5)向吸附柱中加入500 μl 漂洗液W2,12,000 rpm (~13,400×g )离心 1 分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放入收集管中。

(6)将吸附柱放入收集管中,12,000 rpm (~13,400×g )离心 2 分钟,尽量除去漂洗液。将吸附柱置于室温放置数分钟,彻底晾干。

(7)将吸附柱放入一个干净离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加50μl 的洗脱缓冲液TE,12,000 rpm (~13,400×g )离心 1 分钟,收集DNA 溶液。4. 连接目的DNA和酶切后的质粒DNA

反应体系: