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分子生物学名词释义

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名词释义：●Hoogsteen氢键：在酸性的溶液中，胞嘧啶的N-3原子被质子化，可与鸟嘌呤的N-7原子形成氢键，同时，胞嘧啶的N-4的氢原子也可与鸟嘌呤的O-6形成氢键●碱基堆积力：DNA分子的两条多聚核苷酸链在旋进过程中，相邻的两个碱基对平面会彼此重叠●Chargaff 规则：(1)不同生物个体的DNA，其碱基组成不同；(2)同一个体不同器官或不同组织的DNA具有相同的碱基组成；(3)对于一特定组织的DNA，其碱基组分不随其年龄、营养状态和环境而变化；(4)对于一特定的生物体而言，A与T、C与G的摩尔数相等●DNA超螺旋（正超螺旋和负超螺旋）：在DNA双螺旋结构基础上进一步盘绕所形成的螺旋结构，当盘绕方向与DNA双螺旋方向相同时为正超螺旋，反之为负超螺旋●外显子：基因组DNA中出现在成熟mRNA分子的核苷酸序列，最终被翻译成蛋白质●内含子：位于外显子之间、可以被转录在前体RNA中，但经过剪接被去除，最终不存在于成熟mRNA分子中的核苷酸序列●密码子：在mRNA的开放阅读框架区，每3个相邻的核苷酸代表一种氨基酸或肽链合成的起始/终止信息，称为三联体密码子●开放阅读框：从mRNA的5’-端起始密码子AUG开始至3’-端终止密码子前的一段能编码并翻译出氨基酸序列的核苷酸序列，通常代表某个基因的编码序列●核酶：具有催化活性的核酸●干扰RNA/RNA干扰：与靶基因同源的双链RNA诱导的特异转录后基因沉默现象●DNA变性/复性：在某些理化因素作用下，DNA双链的互补碱基对之间的氢键断裂，使双螺旋结构松散，形成单链的故乡，不涉及一级结构的改变●DNA增色效应/减色效应：变性后DNA溶液的紫外吸收作用增强的效应●顺式作用元件：DNA分子中的一些调控序列，包括启动子、上游调控序列、增强子、加尾信号和一些细胞信号反应元件等●反式作用因子：通过直接结合或间接作用于DNA、RNA等核酸分子，对基因表达发挥不同调节作用（激活或抑制）的蛋白质分子●操纵子：每一转录区段可视为一个转录单位，称为操纵子，包括了若干个基因的编码区及其调控序列●增强子：是可以增强真核基因启动子工作效率的顺式作用元件，是真核基因中最重要的调控序列，决定着每一个基因在细胞内的表达水平●沉默子：是可抑制基因转录的特定核苷酸序列，当其结合一些反式作用因子时对基因的转录起阻遏作用，使基因沉默●断裂基因：由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成，去除非编码区再连接后，可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质的基因被称为断裂基因●高度重复序列：是真核基因组中存在的、重复频率可达106 次以上的短核苷酸重复序列，不编码蛋白质或RNA●中度重复序列：指在真核基因组中重复数十至数千次核苷酸序列●单拷贝序列：在单倍体基因组中只出现一次或数次的核苷酸序列●基因家族：指由某一祖先基因经过重复和变异所产生的一组在结构上相似、功能相关的基因●假基因：是基因组中存在的一段与正常基因非常相似但不能表达的DNA序列●复制子：从一个DNA复制起点起始的DNA复制区域称为复制子●冈崎片段：DNA复制过程中，在后随链上不连续合成的片段●半保留复制：DNA复制时，亲代DNA双螺旋解开成为两条单链各自作为模板，按照碱基配对规律合成一条与模板相互补的新联，形成两个子代DNA分子，每一个子代DNA 分子中都保留有一条来自亲代的链●前导链：在DNA复制过程中，沿着解链方向生成的子链DNA的合成是连续进行的，这股链称为前导链●后随链：模板被打开一段，起始合成一段子链，再打开一段，再起始合成另一段子链，这一不连续复制的链称为后随链●复制叉：复制中的模板DNA形成2个延伸方向相反的开链区●端粒：由特殊DNA及短的GC丰富区重复序列及蛋白质组成，覆盖在染色体两个末端的特殊结构称端粒，对保护染色体及维持染色体线性长度有重要意义●端粒酶：是由特殊RNA及蛋白质组成的复合体，能以自身的RNA为模板，催化端粒的延伸●自主复制序列：酵母DNA复制起始点含11bp富含AT的核心序列：A(T)TTTATA(G)TTTA(T)●逆转录：指以RNA为模板，按照碱基配对原则，在逆转录酶的作用下，催化合成DNA的过程●Klenow片段：是原核生物DNA pol I经特异的蛋白酶水解后产生的大片段，具有5’—3’核酸外切酶活性和聚合活性●DNA拓扑异构酶：指能够改变DNA分子的拓扑构象，理顺DNA链结构来配合复制进程的酶，广泛存在于原核及真核生物●DNA损伤：由辐射或药物引起的DNA结构的改变，包括DNA结构的扭曲和点突变。

前者干扰复制、转录，后者则扰乱正常的碱基配对，从而改变子代细胞的DNA序列●光修复：指嘧啶二聚体的直接修复●切除修复：细胞内最重要的修复机制，主要由DNA聚合酶I及连接酶执行●重组修复：指依靠重组酶系，将另一段未受损伤的DNA移到损伤部位，提供正确的模板，进行修复的过程●转换：遗传信息突变的一种形式，在这种突变中，发生的是嘧啶与嘧啶的替代或嘌呤与嘌呤的替代●颠换：一种由嘧啶替代嘌呤或由嘌呤替代嘧啶的遗传信息的突变●错义突变：碱基置换可以造成改变氨基酸编码的错义突变●无义突变：变为终止密码子●同义突变：不改变氨基酸编码●同源重组修复：指的是参加重组的两段双链DNA在相当长的范围内序列相同，这样就能保证重组后生成的新区序列正确●非同源末端连接的重组修复：两个DNA分子的末端不需要同源性就能连接起来●模板链：作为一个基因载体的一段DNA双链片段，转录时作为RNA合成模板的一股单链称为模板链●编码链：与模板链相对应的另一股单链●转录起点●Pribnow box：-35的最大一致性序列是TTGACA，-10区的一致性序列TATAAT●Sextama box：原核生物启动子保守序列●闭合转录复合体：由RNA pol识别并结合启动子，形成闭合转录复合体●开放转录复合体：DNA双链打开，闭合转录复合体成为开放转录复合体●转录泡：具有RNA聚合酶活性的转录复合体发挥功能作用中，结合并解开DNA双链、合成RNA链而形成的开放性体系，其外观类似泡状●转录因子：直接结合或间接作用于基因启动子、形成具有RNA聚合酶活性的动态转录复合体的蛋白质分子●mRNA剪接：去除初级转录物上的内含子，把外显子连接为成熟RNA的过程●RNA编辑：有些基因的蛋白质产物的氨基酸序列与基因的初级转录物序列并不完全对应，mRNA上的一些序列在转录后发生了改变，称为RNA编辑●密码子简并性：有的氨基酸可由多个密码子编码，这种现象被称为简并性●核糖体循环：指从翻译起始复合物的形成至核糖体解聚的翻译全过程。

肽链合成开始时，核糖体的大小亚基解聚，小亚基与mRNA、起始氨基酰tRNA结合后，大亚基与之结合而形成翻译起始复合物，再按照mRNA的密码子顺序经进位、成肽和转位合成肽链，之后核糖体大小亚基解聚●分子伴侣：参与肽链的折叠、蛋白质穿膜进入细胞器、应激后蛋白质复性或降解、蛋白质与蛋白质的相互作用调控及信号转导等过程的一类保守的多肽结合性蛋白质●信号肽：真核细胞分泌性蛋白和跨膜蛋白的前N-端都有一13-36个氨基酸残基的肽段●信号肽酶●核定位序列：所有被靶向输送的细胞核蛋白质其肽链内都含有特异的核定位序列●差异基因表达：同一个体内的不同器官、组织、细胞的差异性的基础称为差异基因表达●基因表达谱：指基因表达的种类和强度，决定了细胞的分化状态和功能●转录衰减：色氨酸操纵子的有效关闭还有一种属于促进已经开始转录的mRNA合成终止的方式来进一步加强，称为转录衰减●表观遗传：是指与DNA排列顺序本身无关的，但可以传递给子代细胞的遗传信息●DNA甲基化：真核基因组中胞嘧啶的第5位碳原子可以在DNA甲基转移酶的作用下被甲基化修饰为5-甲基胞嘧啶，并且以序列CG的中的胞嘧啶甲基化更为常见●诱导多能干细胞：指将关键转录因子的编码基因引入成体细胞，诱导细胞重新编程，形成的具有胚胎干细胞特征的细胞●核苷酸的从头合成：利用磷酸核糖、氨基酸、一碳单位及CO2 等简单物质为原料，经过一系列酶促反应，合成嘌呤核苷酸●核苷酸的补救合成：利用体内游离的嘌呤或嘌呤核苷，经过简单的反应过程，合成嘌呤核苷酸●核苷酸的抗代谢物●PRPP：磷酸核糖焦磷酸●HGPRT：次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶●痛风病：指患者血中尿酸含量升高，当超过8mg/100ml时，尿酸盐晶体即可沉积于关节、软组织、软骨及肾等处，而导致关节炎、尿路结石以及肾疾病●Southern Blot：DNA样品经限制性内切酶消化后行琼脂糖凝胶电泳，将含有DNA区带的凝胶在变性溶液中处理后，再将胶中的DNA分子转移到NC膜上。

转移完成后，在80°真空条件下加热或在紫外交联仪内处理，使DNA固定于NC膜上，即可用于杂交反应●Northern Blot：利用与DNA印迹相类似的技术来分析RNA就称为RNA印迹●Western Blot：蛋白质在电泳之后从胶中转移并固定到模型材料上，再与溶液中相应的蛋白分子相互结合，常用抗体来检测●逆转录PCR：以RNA为模板，在逆转录酶的作用下合成cDNA，再以cDNA为模板通过PCR反应来扩增目的基因●实时PCR/定量PCR：利用荧光标记引物动态监测PCR反应过程中的产物量，消除了产物堆积对定量分析的干扰●基因芯片：是指将许多特定的DNA片段有规律地紧密排列固定于单位面积的支持物上，然后与待测的荧光标记样品进行杂交，杂交后用荧光检测系统等对芯片进行扫描，通过计算机系统对每一位点的荧光信号做出检测、比较和分析，从而迅速得出定性和定量的结果●蛋白质芯片：是将高度密集排列的蛋白质分子作为探针点阵固定在固相支持物上，当与待测蛋白样品反应时，可捕获样品中的靶蛋白，再经检测系统对靶蛋白进行定性和定量分析的一种技术●基因文库：指的是一个包含了某一生物体全部DNA序列的克隆群体●cDNA文库：是包含某一组织细胞在一定条件下所表达的全部mRNA经逆转录而合成的cDNA序列的克隆群体，它以cDNA片段的形式贮存着该组织细胞的基因表达信息●同源重组：是指发生在同源序列间的DNA重组●转化：通过自动获取或人为地供给外源DNA，使受体细胞获得新的遗传表型●转染：将外源DNA直接导入真核细胞（酵母除外）的过程称为转染●转导：当病毒从被感染的细胞（供体）释放出来、再次感染另一细胞（受体）时，发生在供体与受体细胞之间的DNA转移及基因重组即为转导作用●转基因技术：指将外源基因导入受精卵或胚胎干细胞，通过随机重组使外源基因插入细胞染色体DNA，随后将受精卵或胚胎干细胞植入假孕受体动物的子宫，使得外源基因能够随细胞分裂遗传给后代●基因敲入：是通过同源重组的方法，用某一基因替换另一基因，或将一个设计好的基因片段插入到基因组的特定微店，使之表达并发挥作用●基因敲除：建立在同源重组基础上的有目的地去除细胞或动物体内某种基因的技术●基因诊断：直接检测体内基因或外源感染基因的结构及其表达水平是否正常，从而对疾病作出诊断的方法●基因治疗：将某种遗传物质转移到患者细胞体内，使其在体内发挥作用，以治疗疾病的方法●基因组学：是阐明整个基因组结构、结构与功能的关系以及基因之间相互作用的科学●表达标签序列●限制性片段长度多态性：利用特定的限制性内切酶识别并切割基因组DNA，得到大小不等的DNA片段，所产生的DNA数目和各个片段的长度反映了DNA分子上不同酶切位点的分布情况●单核苷酸多态性：指在基因组水平上由单个核苷酸变异所造成的DNA序列多态性●深度测序：基于毛细管阵列电泳仪的测序系统，测序方法为毛细管电泳，序列分析实现了“分析过程”和“读片过程”的自动化，单次测定通量为几万bp，可对一种生物、组织或细胞器进行基因组的全面分析●DNA双螺旋结构模型的主要特征1、DNA由两条多聚脱氧核苷酸链组成2、核糖与磷酸位于外侧3、DNA双链之间形成了互补碱基对4、碱基对的疏水作用力和氢键共同维持着DNA双螺旋结构的稳定●现代分子生物学的中心法则●三种DNA二级结构的基本特征A型DNA、B型DNA右手螺旋，Z型DNA左手螺旋●维系DNA双螺旋结构的主要作用力碱基堆积力和互补链之间碱基对的氢键共同维系着DNA双螺旋结构的稳定●●真核生物的DNA是如何组装成为染色体的第一层次折叠：两分子的H2A、H2B、H3、H4形成一个八聚体的组蛋白核心，长度约150bp的DNA双链在核心组蛋白八聚体上盘绕1.75圈形成核小体的核心颗粒。

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分子生物学名词解释

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1, 错义突变:DNA分子中碱基对的取代,使得mRNA的某一密码子发生变化,由它所编码的氨基酸就变成另一种的氨基酸,使得多肽链中的氨基酸顺序也相应的发生改变的突变.2 无义突变:由于碱基对的取代,使原来可以翻译某种氨基酸的密码子变成了终止密码子的突变.3 同义突变:碱基对的取代并不都是引起错义突变和翻译终止,有时虽然有碱基被取代,但在蛋白质水平上没有引起变化,氨基酸没有被取代,这是因为突变后的密码子和原来的密码子代表同一个氨基酸的突变.4移码突变:在编码序列中,单个碱基,数个碱基的缺失或插入以及片段的缺失或插入等均可以使突变位点之后的三联体密码阅读框发生改变,不能编码原来的蛋白质的突变.1转化:指质粒DNA或以它为载体构建的重组DNA导入细菌的过程.2 感染:以噬菌体,粘性质粒和真核细胞病毒为载体的重组DNA分子,在体外经过包装成具有感染能力的病毒或噬菌体颗粒,才能感染适当的细胞,并在细胞内扩增.3转导:指以噬菌体为载体,在细菌之间转移DNA的过程,有时也指在真核细胞之间通过逆转录病毒转移和获得细胞DNA的过程.4转染:指病毒或以它为载体构建的重组子导入真核细胞的过程.5.癌基因:是细胞内控制细胞生长的基因,具有潜在的诱导细胞恶性转化的特性.当癌基因结构或表达发生异常时,其产物可使细胞无限制增殖,导致肿瘤的发生.包括病毒癌基因和细胞癌基因.6., 细胞癌基因:存在于正常的细胞基因组中,与病毒癌基因有同源序列,具有促进正常细胞生长,增殖,分化和发育等生理功能.在正常细胞内未激活的细胞癌基因叫原癌基因,当其受到某些条件激活时,结构和表达发生异常,能使细胞发生恶性转化.7. 病毒癌基因:存在于病毒(大多是逆转录病毒)基因组中能使靶细胞发生恶性转化的基因. 它不编码病毒结构成分,对病毒无复制作用,但是当受到外界的条件激活时可产生诱导肿瘤发生的作用.8. 基因诊断:以DNA或RNA为诊断材料,通过检查基因的存在,结构缺陷或表达异常,对人体的状态和疾病作出诊断的方法和过程.9 RFLP:即限制性片段长度多态性,个体之间DNA的核苷酸序列存在差异,称为DNA多态性.若因此而改变了限制性内切酶的酶切位点则可导致相应的限制性片段的长度和数量发生变化,称为RFLP.10 基因治疗:一般是指将限定的遗传物质转入患者特定的靶细胞,以最终达到预防或改变特殊疾病状态为目的治疗方法.11, 反义RNA:碱基序列正好与有意义的mRNA互补的RNA称为反义RNA.可以作为一种调控特定基因表达的手段.12, 核酶:是一种可以催化RNA切割和RNA剪接反应的由RNA组成的酶,可以作为基因表达和病毒复制的抑制剂.SSCP:单链构象多态性检测是一种基于DNA构象差别来检测点突变的方法.相同长度的单链DNA,如果碱基序列不同,形成的构象就不同,这样就形成了单链构象多态性.13, 管家基因:在生物体生命的全过程都是必须的,且在一个生物个体的几乎所有细胞中持续表达的基因.14, 细胞全能性:指同一种生物的所有细胞都含有相同的DNA,即基因的数目和种类是一样的,但在不同阶段,同一个体的不同组织和器官中基因表达的种类和数目是不同的.15, SD序列:转录出的mRNA要进入核糖体上进行翻译,需要一段富含嘌呤的核苷酸序列与大肠杆菌16S rRNA3,末端富含嘧啶的序列互补,是核糖体的识别位点.16, 反义核酸技术:是通过合成一种短链且与DNA或RNA互补的,以DNA或RNA为目标抑制翻译的反义分子,干扰目的基因的转录,剪接,转运,翻译等过程的技术.17, 核酸探针:探针是指能与某种大分子发生特异性相互作用,并在相互作用之后可以检测出来的生物大分子.核酸探针是指能识别特异碱基顺序的带有标记的一段DNA或RNA分子. 18, 周期蛋白:是一类呈细胞周期特异性或时相性表达,累积与分解的蛋白质,它与周期素依赖性激酶共同影响细胞周期的运行.19, CAP:是大肠杆菌分解代谢物基因活化蛋白,这种蛋白可将葡萄糖饥饿信号传递个许多操纵子,使细菌在缺乏葡萄糖时可以利用其他碳源.20, 端粒:以线性染色体形式存在的真核基因组DNA末端都有一种特殊的结构叫端粒.该结构是一段DNA序列和蛋白质形成的一种复合体,仅在真核细胞染色体末端存在.21 操纵子:是指数个功能上相关的结构基因串联在一起,构成信息区,连同其上游的调控区(包括启动子和操纵基因)以及下游的转录终止信号所构成的基因表达单位,所转录的RNA为多顺反子.22 顺式作用元件:是指那些与结构基因表达调控相关,能够被基因调控蛋白特异性识别和结合的特异DNA序列.包括启动子,上游启动子元件,增强子,加尾信号和一些反应元件等.23 反式作用因子:是指真核细胞内含有的大量可以通过直接或间接结合顺式作用元件而调节基因转录活性的蛋白质因子.24启动子:是RNA聚合酶特异性识别和结合的DNA序列.25 增强子:位于真核基因中远离转录起始点,能明显增强启动子转录效率的特殊DNA序列.它可位于被增强的转录基因的上游或下游,也可相距靶基因较远.26基因表达:是指生物基因组中结构基因所携带的遗传信息经过转录,翻译等一系列过程,合成特定的蛋白质,进而发挥其特定的生物学功能和生物学效应的全过程.27 信息分子:调节细胞生命活动的化学物质.其中由细胞分泌的调节靶细胞生命活动的化学物质称为细胞间信息分子;而在细胞内传递信息调控信号的化学物质称为细胞内信息分子. 28 受体:是存在于靶细胞膜上或细胞内能特异识别生物活性分子并与之结合,进而发生生物学效应的的特殊蛋白质.29 分子克隆:在体外对DNA分子按照即定目的和方案进行人工重组,将重组分子导入合适宿主,使其在宿主中扩增和繁殖,以获得该DNA分子的大量拷贝.二, 问答题(一),病毒,原核,真核基因组的特点答:1,病毒基因组的特点:① 种类单一;②单倍体基因组:每个基因组在病毒中只出现一次;③形式多样;④大小不一;⑤基因重叠;⑥动物/细菌病毒与真核/原核基因相似:内含子;⑦具有不规则的结构基因;⑧基因编码区无间隔:通过宿主及病毒本身酶切;⑨无帽状结构;⑩结构基因没有翻译起始序列. 2,原核基因组的特点:①为一条环状双链DNA;②只有一个复制起点;③具有操纵子结构;④绝大部分为单拷贝;⑤可表达基因约50%,大于真核生物小于病毒;⑥基因一般是连续的,无内含子;⑦重复序列很少.3,真核基因组的特点:①真核生物基因组远大于原核生物基因组,结构复杂,基因数庞大,具有多个复制起点;②基因组DNA与蛋白质结合成染色体,储存于细胞核内;③真核基因为单顺反子,而细菌和病毒的结构基因多为多顺反子;④基因组中非编码区多于编码区;⑤真核基因多为不连续的断裂基因,由外显子和内含子镶嵌而成;⑥存在大量的重复序列;⑦功能相关的基因构成各种基因家族;⑧存在可移动的遗传因素;⑨体细胞为双倍体,而精子和卵子为单倍体.(二),乳糖操纵子的作用机制答:1,乳糖操纵子的组成:大肠杆菌乳糖操纵子含Z,Y,A三个结构基因,分别编码半乳糖苷酶,透酶和半乳糖苷乙酰转移酶,此外还有一个操纵序列O,一个启动子P和一个调节基因I.2,阻遏蛋白的负性调节:没有乳糖存在时,I基因编码的阻遏蛋白结合于操纵序列O处,乳糖操纵子处于阻遏状态,不能合成分解乳糖的三种酶;有乳糖存在时,乳糖作为诱导物诱导阻遏蛋白变构,不能结合于操纵序列,乳糖操纵子被诱导开放合成分解乳糖的三种酶.所以,乳糖操纵子的这种调控机制为可诱导的负调控.3,CAP的正性调节:在启动子上游有CAP结合位点,当大肠杆菌从以葡萄糖为碳源的环境转变为以乳糖为碳源的环境时,cAMP浓度升高,与CAP结合,使CAP发生变构,CAP结合于乳糖操纵子启动序列附近的CAP结合位点,激活RNA聚合酶活性,促进结构基因转录,调节蛋白结合于操纵子后促进结构基因的转录,对乳糖操纵子实行正调控,加速合成分解乳糖的三种酶.4,协调调节:乳糖操纵子中的I基因编码的阻遏蛋白的负调控与CAP的正调控两种机制,互相协调,互相制约.(三),真核生物转录水平的调控机制答:真核生物在转录水平的调控主要是通过反式作用因子,顺式作用元件和RNA聚合酶的相互作用来完成的,主要是反式作用因子结合顺式作用元件后影响转录起始复合物的形成过程. 1, 转录起始复合物的形成:真核生物RNA聚合酶识别的是由通用转录因子与DNA形成的蛋白质-DNA复合物,只有当一个或多个转录因子结合到DNA上,形成有功能的启动子,才能被RNA聚合酶所识别并结合.转录起始复合物的形成过程为:TFⅡD结合TATA盒;RNA聚合酶识别并结合TFⅡD-DNA复合物形成一个闭合的复合物;其他转录因子与RNA聚合酶结合形成一个开放复合物.在这个过程中,反式作用因子的作用是:促进或抑制TFⅡD与TATA盒结合;促进或抑制RNA聚合酶与TFⅡD-DNA复合物的结合;促进或抑制转录起始复合物的形成.2, 反式作用因子:一般具有三个功能域(DNA识别结合域,转录活性域和结合其他蛋白结合域);能识别并结合上游调控区中的顺式作用元件;对基因的表达有正性或负性调控作用.3, 转录起始的调控:⑴反式作用因子的活性调节:①表达式调节——反式作用因子合成出来就具有活性;②共价修饰——磷酸化和去磷酸化,糖基化;③配体结合——许多激素受体是反式作用因子;④蛋白质与蛋白质相互作用——蛋白质与蛋白质复合物的解离与形成.⑵反式作用因子与顺式作用元件的结合:反式作用因子被激活后,即可识别并结合上游启动子元件和增强子中的保守性序列,对基因转录起调节作用.⑶反式作用因子的作用方式——成环,扭曲,滑动.⑷反式作用因子的组合式调控作用:每一种反式作用因子结合顺式作用元件后虽然可以发挥促进或抑制作用,但反式作用因子对基因调控不是由单一因子完成的而是几种因子组合发挥特定的作用.(四),真核生物转录后水平的调控机制答1),5,端加帽和3,端多聚腺苷酸化的调控意义:5,端加帽和3,端多聚腺苷酸化是保持mRNA 稳定的一个重要因素,它至少保证mRNA在转录过程中不被降解.(2),mRNA选择性剪接对基因表达调控的作用(3),mRNA运输的控制(五),受体的特点答:1,高度专一性;2,高度亲和性;3,可逆性;4,可饱和性;5,特定的作用模式(六),表皮生长因子介导的信号传导途径答:表皮生长因子受体是一个典型的蛋白酪氨酸激酶受体,这个信号转导途径的主要步骤是: 1, 受体二聚化的形成及其磷酸化:表皮生长因子与受体的结合使受体发生二聚化,从而改变受体构象,使蛋白酪氨酸激酶活性增强,受体自身的几个蛋白酪氨酸残基在激酶的作用下发生磷酸化.2, 募集接头蛋白Grb2:表皮生长因子受体自身被磷酸化后,不仅其激酶活性增强,而且其构象发生变化,从而适合与含SH2结构域的蛋白分子相结合.Grb2是作为接头蛋白结合到受体上. 3, 调控分子SOS的活化:SOS含有可与SH3结构域相结合的富含脯氨酸基序,当Grb2结合到磷酸化的表皮生长因子受体后,它的两个SH3结构域即可结合SOS,使之活化.4, 低分子量G蛋白Ras的活化:SOS可促进Ras释放GDP,结合GTP的反应,使Ras激活.活化的Ras作用其下游分子Raf,使之活化.Raf是MAPK级联反应的第一个分子,由此启动了MAPK的三级激活过程.5, MAPK的级联激活:Raf是一种MAPKKK,它作用于MEK,使之磷酸化而激活,活化的MEK在作用于MAPK家族的ERK1,使之磷酸化激活由此完成了三级激活.6, 转录因子的磷酸化及转录调控作用:活化的ERK可以转至细胞核内,使某些转录调控因子发生磷酸化,从而影响基因的转录.(七),cAMP信号转导途径答:1,组成:胞外信息分子(主要是胰高血糖素,肾上腺素和促肾上腺皮质激素),受体,G蛋白, AC,cAMP , PKA.2,途径:信号分子与受体结合,引起受体构象变化受体活化G蛋白活化后的G蛋白激活腺苷酸环化酶(AC)，AC 催化ATP生成cAMP，cAMP 活化PKA,PKA使目标蛋白磷酸化,调节代谢酶的活性或调节基因的表达(八),IP3-Ca2+信号途径:信号分子与受体结合,引起受体构象变化受体活化G蛋白，活化后的G蛋白激活PLC，PLC 水解PIP2生成IP3 和DG，IP3 使钙通道打开,细胞内Ca2+升高，Ca2+ 与CaM结合,激活Ca2+-CaM依赖的蛋白激酶，Ca2+ -CaM依赖的蛋白激酶使目标蛋白磷酸化.(九),分子克隆中常用的工具酶及良好载体的条件答:(1),常用的工具酶1, 限制性核酸内切酶:是细菌产生的一类能识别和切割双链DNA分子内特定的碱基顺序的核酸水解酶.2, DNA连接酶:将两段DNA分子拼接起来的酶.3, DNA聚合酶:催化单核苷酸链延伸.4, 逆转录酶:依赖于RNA的DNA聚合酶,这是一种有效的转录RNA成为DNA的酶,产物DNA又称互补DNA.5, 末端脱氧核糖核酸转移酶:将脱氧核糖核酸加到DNA的3末端.6, 碱性磷酸酶:催化去除DNA,RNA等的5磷酸基团.7, 依赖DNA的RNA聚合酶:识别特异性启动子,RNA转录.(2),良好载体的条件1,必须有自身的复制子;2,载体分子上必须有限制性核酸内切酶的酶切位点,即多克隆位点,以供外源DNA插入;3,载体应具有可供选择的遗传标志,以区别阳性重组子和阴性重组子;4,载体分子必须有足够的容量;5,可通过特定的方法导入细胞;6,对于表达载体还应具备与宿主细胞相适应的启动子,前导顺序,增强子,加尾信号等DNA调控元件.(十),蓝-白筛选的原理答:某些质粒带有大肠杆菌的半乳糖苷酶基因片段,在半乳糖苷酶基因的基因区外又另外引入了一段含多种单一限制酶位点的DNA序列.这些位点上如果没有克隆外源性DN**段,在质粒被导入lac-的大肠杆菌后,质粒携带的半乳糖苷酶基因将正常表达,与大肠杆菌的半乳糖苷酶基因互补,产生有活性的半乳糖苷酶,加入人工底物X-gal和诱导剂IPTG后,出现蓝色的菌落.如果在多克隆位点上插入外源DN**段,将使lac Z基因灭活,不能生成半乳糖苷酶,结果菌落出现白色.由于这种颜色标志,重组克隆和非重组克隆的区分一目了然.(十一)SANGER双脱氧链终止法的原理答:DNA链中核苷酸以3',5'-磷酸二酯键连接,合成DNA所用的底物是2'-脱氧核苷三磷酸.2',3'ddNTP与普通dNTP不同,它们在脱氧核糖的3'位置缺少一个羟基.在DNA聚合酶作用下通过三磷酸基团掺入到延伸的DNA链中,但由于没有3'羟基,不能同后续的dNTP形成磷酸二酯键,因此,正在延伸的DNA链不能继续延伸.在DNA合成反应混合物的4种普通dNTP中加入少量的一种ddNTP,链延伸将与偶然发生但却十分特异的链终止竞争,产物是一系列的核苷酸链,其长度取决于引物末端到出现过早链终止位置间的距离.在4组独立酶反应中分别采用4种不同的ddNTP,结果将产生4组寡核苷酸,它们将分别终止于模板链的A,C,G或T位置.(十二),核酸分子杂交的原理答:具有互补序列的两条单链核酸分子在一定的条件下(适宜的温度及离子强度等)碱基互补配对结合,重新形成双链;在这一过程中,核酸分子经历了变性和复性的变化,以及在复性过程中个分子间键的形成和断裂.杂交的双方是待测核酸和已知序列.(十三),影响杂交的因素答:1,核酸分子的浓度和长度:核酸浓度越大,复性速度越快.探针长度应控制在50-300个碱基对为好.2,温度:温度过高不利于复性,而温度过低,少数碱基配对形成的局部双链不易解离,适宜的温度是较TM值低25度.3,离子强度:在低离子强度下,核酸杂交非常缓慢,随着离子强度的增加,杂交反应率增加.高浓度的盐使碱基错配的杂交体更稳定,所以进行序列不完全同源的核酸分子杂交时必须维持杂交反应液中的盐浓度和洗膜液中的盐浓度.4,杂交液中的甲酰胺:甲酰胺能降低核酸杂交的TM值.它有以下优点:在低温下探针更稳定;能更好地保留非共价结合的核酸.5,核酸分子的复杂性:是指存在于反应体系中的不同顺序的总长度.两个不同基因组DNA变性后的相对杂交速率取决于样品浓度绝对一致时的相对复杂性(即DNA中的碱基数).6,非特异性杂交反应:在杂交前应对非特异性杂交反应位点进行封闭,以减少其对探针的非特异性吸附作用.(十四),探针的种类和优缺点答:1,cDNA探针:通过逆转录获得cDNA后,将其克隆于适当的克隆载体,通过扩增重组质粒而使cDNA得到大量的扩增.提取质粒后分离纯化作为探针使用.它是目前应用最为广泛的一种探针.2,基因组探针:从基因组文库里筛选得到一个特定的基因或基因片段的克隆后,大量扩增,纯化, 切取插入片段,分离纯化为探针.3,寡核苷酸探针:根据已知的核酸顺序,采用DNA合成仪合成一定长度的寡核苷酸片段作为探针.4,RNA探针:采用基因克隆和体外转录的方法可以得到RNA或反义RNA作为探针.(十五),探针的标记法答:1,缺口平移法:此法是利用适当浓度的DNase Ⅰ在DNA双链上随机切割单链,造成单链切口.切口处产生一个5末端和3末端,3末端就可以作为引物,在大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ的催化下,以互补的DNA单链为摸板,依次将dNTP连接到切口的3末端的羟基上,合成新的DNA单链;同时DNA聚合酶Ⅰ的5→3的核酸外切酶活性在切口处将旧链从5末端逐步切除,新合成链不断延伸,从而使原DNA分子上的部分核苷酸残基被标记的核苷酸所取代.2,随机引物法:随机引物是人工合成的长度为6个寡核苷酸残基的寡聚核苷酸片段的混合物.对于任何一个用作探针的DN**段,随机引物混合物中都会有一些六核苷酸片段可以与之结合,起到DNA合成引物的作用.将这些引物与变性的DNA单链结合后,以4种dNTP(其中一种是标记物标记的dNTP)为底物,合成与探针DNA互补的切带有标记物的DNA探针.3,PCR标记法:在PCR反应底物中,将一种dNTP换成标记物标记的dNTP, 这样标记的dNTP就在PCR反应的同时掺入到新合成的DNA链上.4,末端标记法:只是将DN**段的一端进行标记.(十六),PCR的基本原理答PCR是在试管中进行的DNA复制反应,基本原理是依据细胞内DNA半保留复制的机理,以及体外DNA分子于不同温度下双链和单链可以互相转变的性质,人为地控制体外合成系统的温度,以促使双链DNA变成单链,单链DNA与人工合成的引物退火,然后耐热DNA聚合酶以dNTP为原料使引物沿着单链模板延伸为双链DNA.PCR全过程每一步的转换是通过温度的改变来控制的.需要重复进行DNA模板解链,引物与模板DNA结合,DNA聚合酶催化新生DNA的合成,即高温变性,低温退火,中温延伸3个步骤构成PCR反应的一个循环,此循环的反复进行,就可使目的DNA得以迅速扩增.DNA模板变性:模板双链DNA 单链DNA,94℃.退火:引物+单链DNA 杂交链,引物的Tm值.引物的延伸:温度至70 ℃左右, Taq DNA聚合酶以4种dNTP为原料,以目的DNA为模板,催化以引物3'末端为起点的5'→3'DNA链延伸反应,形成新生DNA链.新合成的引物延伸链经过变性后又可作为下一轮循环反应的模板PCR,就是如此反复循环,使目的DNA得到高效快速扩增.(十七),PCR引物设计的基本要求答:1,引物长度一般为15～30个核苷酸.过短影响PCR的特异性,过长会提高相应退火温度,使延伸温度超过TaqDNA聚合酶最适温度74℃,影响产物的生成.2,引物的碱基尽可能随机,避免出现嘌呤,嘧啶碱基堆积现象.3'端不应有连续3个G和C.否则会使引物和模板错误配对.G+C含量一般占45% -55%.3'端和5'端引物具有相似的Tm值,Tm 值计算公式:Tm=4(G+C)+ 2(A+T)3,引物自身不应存在互补序列以避免折叠成发夹结构.引物的连续互补序列,一般不超过3bp. 4,两个引物之间不应存在互补序列,尤其应避免3'端的互补重叠.5,引物与非特异扩增区的序列的同源性不超过70%,引物3'末端连续8个碱基在待扩增区以外不能有完全互补序列,否则易导致非特异性扩增.6,引物3'端碱基是引发延伸的起点,因此一定要与模板DNA配对.引物3'端最佳碱基选择是G 和C,形成的碱基配对比较稳定.7,引物与模板结合时,引物的5'端最多可以游离十几个碱基而不影响PCR反应的进行.8,引物的5'端可以修饰,如附加限制酶位点,引入突变位点,用生物素,荧光物质,地高辛标记,加入其它短序列包括起始密码子,终止密码子等.(十九),影响大肠杆菌系统外源基因表达的因素答:1,启动子的强弱;2,基因的剂量;3,影响RNA转录和翻译效率的因素:SD序列,mRNA;4,外源基因密码子的选择;5,表达产物的大小;6,表达产物的稳定性.(二十),大肠杆菌系统表达外源基因必须具备的条件答:1,要求外源基因的编码区不能含有内含子;2,表达的外源片段要位于大肠杆菌启动子的下游,并形成正确的阅读框架;3,转录出的mRNA必须有与大肠杆菌16S rRNA3,末端相匹配的SD序列,才能被有效的翻译成蛋白质.4,蛋白产物必须稳定,不易被细胞内蛋白酶快速降解,且对宿主无害.(二十三),基因敲除的基本程序答:通过DNA同源重组,使得胚胎干细胞特定的内源基因被破坏而造成功能丧失,然后通过胚胎干细胞介导得到该基因丧失的小鼠模型的过程称为基因敲除.1, 打靶载体的构建:同源序列要足够长,要含有筛选用的标志基因.2, 胚胎干细胞的体外培养3, 打靶载体导入胚胎干细胞4, 同源重组胚胎干细胞的筛选5, 基因敲除胚胎干细胞注射入胚泡6, 胚泡植入假孕小鼠的子宫中7, 杂交育种获得纯合的基因敲除动物(二十四),DNA芯片的原理答:DNA芯片技术就是一种大规模的集成的固相核酸分子杂交,以大量已知碱基序列的寡核苷酸片段为探针,检测样品中哪些核酸序列与其互补,然后通过定性定量分析得出待测样品的基因序列及表达的信息.其方法包括芯片的制备,样品的准备,分子杂交和检测分子.(二十五),诱变剂的作用机制答:1,碱基的类似物诱发突变2,改变DNA的化学结构3,结合到DNA分子上诱发移码突变4,紫外线及其他射线引起的DNA分子的变化(二十六),突变类型及其遗传效应。

名词解释-分子生物学

名词解释-分子生物学

1、转录（Transcription）：以某一DNA链为模板，按照碱基互补原则形成一条新的RNA链的过程，是基因表达的第一步。

2、编码链：与mRNA 有相同序列的DNA 链3、下游：沿着表达方向的序列。

例如，编码区是在起始区的下游。

4、上游：转录起点之前的序列，例如，细菌启动子在转录单位的上游，起始密码在编码区上游。

5、启动子：结合RNA 聚合酶并起始转录的DNA 区域。

6、RNA聚合酶：使用DNA作为模板合成RNA的酶(正式应为DNA-依赖性RNA 聚合酶)7、终止子：是给予RNA聚合酶转录终止信号的DNA序列。

DNA分子中终止转录的核苷酸序列。

8、转录单位：指RNA聚合酶起始位点和终止位点间的距离，可能包括不止一个基因。

9、初级转录本：与一个转录单位相对应的未修饰的RNA 产物。

10、组成型表达constitutive expression：个体发育的任一阶段，在所有细胞中都持续进行的表达。

一般是生命过程必需的基因。

11、负调控：在没有任何调节蛋白或其失活的情况下，基因表达；存在repressor的时候基因表达受阻。

12、正调控：在没有任何调节蛋白或其失活的情况下，基因关闭；存在activator的时候基因表达开启。

一般原核生物偏向负调控，原核生物的DNA裸露无保护，很容易启动转录，并翻译。

因此其细胞内的基因可以说是基本全部默认开启，因此在正常情况下原核细胞内存在大量不同的reressor阻遏着大量基因的转录。

细胞必须根据不同的条件，对一些被阻遏的基因进行去阻遏的调控，或对一些基因的表达进行阻止。

13、顺式作用元件cis-acting element DNA分子上的一些与基因转录调控相关的特定序列。

14、反式作用因子trans-acting factor一些与基因表达调控有关的蛋白因子。

15、顺式调控cis-acting regulation 一段非编码DNA序列对基因转录的调控作用，顺式正调控（启动子、增强子）；顺式负调控（沉默子）16、反式调控trans-acting regulation 转录因子作用于顺式作用元件对基因转录的调控。

分子生物学-名词解释中文

分子生物学-名词解释中文

第十章DNA的生物合成一、遗传学的中心法则和反中心法则：DNA通过复制将遗传信息由亲代传递给子代；通过转录和翻译，将遗传信息传递给蛋白质分子，从而决定生物的表现型。

DNA的复制、转录和翻译过程就构成了遗传学的中心法则。

但在少数RNA病毒中，其遗传信息贮存在RNA中。

因此，在这些生物体中，遗传信息的流向是RNA通过复制，将遗传信息由亲代传递给子代；通过反转录将遗传信息传递给DNA，再由DNA通过转录和翻译传递给蛋白质，这种遗传信息的流向就称为反中心法则。

二、DNA复制的特点：1．半保留复制：DNA在复制时，以亲代DNA的每一股作模板，合成完全相同的两个双链子代DNA，每个子代DNA中都含有一股亲代DNA链，这种现象称为DNA的半保留复制(semiconservative replication)。

DNA以半保留方式进行复制，是在1958年由M. Meselson 和F. Stahl 所完成的实验所证明。

2．有一定的复制起始点：DNA在复制时，需在特定的位点起始，这是一些具有特定核苷酸排列顺序的片段，即复制起始点（复制子）。

在原核生物中，复制起始点通常为一个，而在真核生物中则为多个。

3．需要引物(primer)：DNA聚合酶必须以一段具有3'端自由羟基（3'-OH）的RNA作为引物，才能开始聚合子代DNA链。

RNA引物的大小，在原核生物中通常为50～100个核苷酸，而在真核生物中约为10个核苷酸。

4．双向复制：DNA复制时，以复制起始点为中心，向两个方向进行复制。

但在低等生物中，也可进行单向复制。

5．半不连续复制：由于DNA聚合酶只能以5'→3'方向聚合子代DNA链，因此两条亲代DNA链作为模板聚合子代DNA链时的方式是不同的。

以3'→5'方向的亲代DNA链作模板的子代链在聚合时基本上是连续进行的，这一条链被称为领头链(leading strand)。

分子生物学名词解释

分子生物学名词解释

2. 基因(gene)是一段携带功能产物(多肽，蛋白质，tRNA和rRNA和某些小分子RNA信息的DNA片段，是控制某种性状的的遗传单位。

3. 密码子偏爱 ( codon bias ):指在不同物种的基因中经常为某种氨基酸编码的只是其中的一个密码子。

4. 基因的剪接位点 ( splice sites ): 一般有特定的序列特征，计算机程序利用这种序列特征可预测将近50%的外显子及20%的完整基因。

值佯谬( C value paradox )：生物体的进化程度与基因组大小之间不完全成比例的现象。

N 值佯谬( N value paradox )：基因组中基因数目与生物进化程度或复杂程度的不对称性6. 基因组(genome :是指一个细胞或生物体的一套完整的单倍体遗传物质.()7. 基因家族(genefamily): 指核苷酸序列或编码产物的结构具有一定同源性的一些基因。

(04)8. 基因超家族( gene superfamily ):结构上具有一定的相似性，但功能不一定相似，且进化上的亲缘关系较远。

如免疫球蛋白基因超家族、丝氨酸蛋白酶基因超家族等( 05)9. 基因组学(genomics):发展和应用基因作图、DNA测序、基因定位等新技术以及计算机程序，分析生命体(包括人类)全部基因组结构及功能10. 微卫星DNA(microsatellite DNA:或称简短串连重复，由2~6个核苷酸的重复顺序组成，如(CA)n、(GA)n、(TA)n，n 为15~30具有多态性，卫星长度常小于1OObp,大量分布每条染色体11. 小卫星DNA(minisatellite DNA): 由6~12个核酸的重复顺序组成，位于染色体端粒及其附近，长度数十~数千bp12. 大卫星DNA(macrosatellite DNA )：即经典的卫星DNA由数十个核苷酸的重复单位构成，主要存在于异染色区和着丝粒。

13. 蛋白质组(proteome) 是指细胞或组织表达的全部蛋白质14. 蛋白质组学(proteomics): 是从整体上采取高通量/ 大规模手段研究所有蛋白组成及其活动规律.15. 单核苷酸多态性( single nucleotide polymorphism, SNP ) : 指发生在基因组序列中单个碱基的改变引起的DNA序列的变化16. 限制性片段长度多态性( restriction fragment length polymorphism ，RFLP：DNA位点的多态性导致限制性内切酶切割位点的差异，即RFLP是第一代DNA遗传学标记()17. 顺式作用元件(cis-acting element) ：真核生物中能够被基因调控蛋白特异性识别和结合，并对自身基因转录起始有调节作用的DNA序列18. 核心启动子(Core promoter):常由TATA盒、位于TATA盒上游的的上游启动子元件、以转录点为中心的起始子和下游启动子元件， 4 个元件组合而成。