生物信息学实验教案
- 格式：doc
- 大小：161.00 KB
- 文档页数：12
教案[Syllabus(teaching period plan)] 也称课时计划。教师经过备课，以课时为单位设计的具体教学方案。教案 是上课的重要依据。通常包括：班级、学科、课题、上课时间、课的类型、教 学方法、教学目的、教学内容、课的进程和时间分配等。有的教案还列有教具 和现代教学手段（如电影、投影、录像、录音等）的使用、作业题、板书设计 和课后自我分析等项目。由于学科教材的性质、教学目的和课的类型不同，教 案不必有固定的形式。 编写教案要依据教学大纲和教学书。从学生实际情况出发，精心设计。一 般要符合以下要求：①明确地制定教学目的，具体规定传授基础知识、培养基 本技能、发展能力以及思想政治教育的任务。②合理地组织教材，突出重点， 解决难点，便于学生理解并掌握系统的知识。③恰当地选择和运用教学方法， 调动学生学习的积极性。要面向大多数学生，同时注意培养优秀生和提高后进 生，使全体学生都得到发展。 编写教案的繁简，一般有经验的教师写得简略些，而新教师写得详细些。 平行班用的同一课题的教案设计，根据上课班级学生的实际差异有所区别。原 定教案，在上课进程中根据具体情况做适当必要的调整，课后随时记录教学效 果，进行简要的自我分析，有助于积累教学经验，不断提高教学质量。 （摘自《中国大百科全书》〈教育〉分册143～144页、1985年10月版） 说 明 本教案以讲授一个单元（2～4学时）或一次实验（实习）为单位填写。填 写时要要用钢笔填写，字迹要清晰、工整，按表中项目逐一填写。教师要在授 课前将本教案交教研室主任审阅，通过后方可授课。在学期结课后将教案交教 研室存档。
内 蒙 古 民 族 大 学 教 案
专业年级： 09 生物技术 学 科： 生物技术 课程名程： 生物信息学（实验） 授课时间： 2011年 月 日 授课教师： 教 研 室： 生物
内蒙古民族大学教务处制 本次授课题目（章、节）： 实验一 常用分子数据库的使用和数据格式 教学目的： 1、掌握常用的生物信息学数据库的类型 2、掌握常用的分子数据库的使用方法 3、掌握常用的分子数据的格式 教学重点及难点： 重点：常用的生物信息学数据库的类型 难点：1.分子数据库的使用方法 2.数据库的数据格式 授课内容提要及时间分配： 一、常用数据库的使用 1.访问国际上权威的核酸序列数据库（EMBL、GenBank、DDBJ） 20min 2.访问基因组数据库（GDB、AceDB等） 20min 3.访问蛋白质序列数据库（SWISS-PROT、TrEMBL、UniProt） 20min 4.访问蛋白质结构数据库（PDB、PDBsum、MMDB） 20min 二、数据库的格式查询 （1）在Genbank中检索NM_000230，并掌握Genbank格式和FASTA格式。 20min （2）在EMBL（http://www.ebi.ac.uk/cgi-bin/dbfetch）检索U18915，比较这个数据库格式和Genbank格式有何异同。 20min （3）将获得的SWISS-PROT id号在SWISS-PROT数据库中检索，获得Entry information相关信息。 10min （4）将获得的PDB id号在PDB数据库中检索，获得Title，Authors，Primary Citation等相关信息。查看该PDB文件，并下载用RasMol打开，观察不同的模式下的分子结构。 30min （5）将获得PDB id号在MMDB数据库检索，获得Reference，Description，MMDB id号等相关信息。下载该文件，用Cn3D打开，观察不同的模式下的分子结构。 30min 三、写实验报告，答疑 10min 教学方法： 计算机上网操作
教具（挂图、幻灯、录像、标本……等）： 计算机、RasMol、Cn3D软件
作业或思考题： 1.详细分析NM_000230（或U18915）记录号Genbank格式和FASTA格式的各项内容。 2.比较分析一下，Genbank和EMBL格式有何异同。 3.记录在GDB、SWISS-PROT和MMDB数据库中获得的信息。
本单元教学总结（教学的主要经验效果、存在问题、措施、反馈信息等）：
教研室主任意见： 签 字 年 月 日 院校教学管理部门抽查意见：
签 字 年 月 日 教案[Syllabus(teaching period plan)] 也称课时计划。教师经过备课，以课时为单位设计的具体教学方案。教案 是上课的重要依据。通常包括：班级、学科、课题、上课时间、课的类型、教 学方法、教学目的、教学内容、课的进程和时间分配等。有的教案还列有教具 和现代教学手段（如电影、投影、录像、录音等）的使用、作业题、板书设计 和课后自我分析等项目。由于学科教材的性质、教学目的和课的类型不同，教 案不必有固定的形式。 编写教案要依据教学大纲和教学书。从学生实际情况出发，精心设计。一 般要符合以下要求：①明确地制定教学目的，具体规定传授基础知识、培养基 本技能、发展能力以及思想政治教育的任务。②合理地组织教材，突出重点， 解决难点，便于学生理解并掌握系统的知识。③恰当地选择和运用教学方法， 调动学生学习的积极性。要面向大多数学生，同时注意培养优秀生和提高后进 生，使全体学生都得到发展。 编写教案的繁简，一般有经验的教师写得简略些，而新教师写得详细些。 平行班用的同一课题的教案设计，根据上课班级学生的实际差异有所区别。原 定教案，在上课进程中根据具体情况做适当必要的调整，课后随时记录教学效 果，进行简要的自我分析，有助于积累教学经验，不断提高教学质量。 （摘自《中国大百科全书》〈教育〉分册143～144页、1985年10月版） 说 明 本教案以讲授一个单元（2～4学时）或一次实验（实习）为单位填写。填 写时要要用钢笔填写，字迹要清晰、工整，按表中项目逐一填写。教师要在授 课前将本教案交教研室主任审阅，通过后方可授课。在学期结课后将教案交教 研室存档。
内 蒙 古 民 族 大 学 教 案
专业年级： 09 生物技术 学 科： 生物技术 课程名程： 生物信息学（实验） 授课时间： 2011年 月 日 授课教师： 教 研 室： 生物
内蒙古民族大学教务处制 本次授课题目（章、节）： 实验二 数据库查询与下载 教学目的： 1.掌握Entrez和SRS检索分析工具的使用 2.数据库搜索 教学重点及难点： 1.Entrez和SRS检索分析工具的使用 2.数据库搜索 授课内容提要及时间分配： 1.SRS检索 40min （1）快速查询 （2）标准查询 （3）扩展查询 2.Entrez检索 90min 以calpain蛋白为例，利用Entrez检索系统，检索nr数据库、gene数据库、Map数据库、Conserved Domain 数据库、OMIM数据库、protein数据库、SNPs数据库、SNPs Genotype数据库、SNPs Geneview数据库、Taxonomy数据库、UniSTS数据库、 UniGene数据库中的相关信息。 3.BLAST检索 40min 以NM_005186为模版序列在nr/nt数据库中分别用megablast， discontiguous megablast，blastn程序进行检索。 4.写实验报告，答疑 10min 教学方法： 计算机上网操作
教具（挂图、幻灯、录像、标本……等）： 计算机
作业或思考题： 1. 简要记录SRS检索得到的结果。 2. 简要记录Entrze检索得到各个数据库的结果。 3. 简要记录BLAST检索得到的结果。
本单元教学总结（教学的主要经验效果、存在问题、措施、反馈信息等）：
教研室主任意见： 签 字 年 月 日 院校教学管理部门抽查意见：
签 字 年 月 日 教案[Syllabus(teaching period plan)] 也称课时计划。教师经过备课，以课时为单位设计的具体教学方案。教案 是上课的重要依据。通常包括：班级、学科、课题、上课时间、课的类型、教 学方法、教学目的、教学内容、课的进程和时间分配等。有的教案还列有教具 和现代教学手段（如电影、投影、录像、录音等）的使用、作业题、板书设计 和课后自我分析等项目。由于学科教材的性质、教学目的和课的类型不同，教 案不必有固定的形式。 编写教案要依据教学大纲和教学书。从学生实际情况出发，精心设计。一 般要符合以下要求：①明确地制定教学目的，具体规定传授基础知识、培养基 本技能、发展能力以及思想政治教育的任务。②合理地组织教材，突出重点， 解决难点，便于学生理解并掌握系统的知识。③恰当地选择和运用教学方法， 调动学生学习的积极性。要面向大多数学生，同时注意培养优秀生和提高后进 生，使全体学生都得到发展。 编写教案的繁简，一般有经验的教师写得简略些，而新教师写得详细些。 平行班用的同一课题的教案设计，根据上课班级学生的实际差异有所区别。原 定教案，在上课进程中根据具体情况做适当必要的调整，课后随时记录教学效 果，进行简要的自我分析，有助于积累教学经验，不断提高教学质量。 （摘自《中国大百科全书》〈教育〉分册143～144页、1985年10月版） 说 明 本教案以讲授一个单元（2～4学时）或一次实验（实习）为单位填写。填 写时要要用钢笔填写，字迹要清晰、工整，按表中项目逐一填写。教师要在授 课前将本教案交教研室主任审阅，通过后方可授课。在学期结课后将教案交教 研室存档。
内 蒙 古 民 族 大 学 教 案
专业年级： 09生物技术 学 科： 生物技术 课程名程： 生物信息学（实验） 授课时间： 2011年 月 日 授课教师： 教 研 室： 生物
内蒙古民族大学教务处制
