基因工程思考题答案--删减后.doc

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第二章 1. 名词解释

(I) 顺反了(cistron):基因所对应的一段核廿酸序列被称为顺反了(cistron), —个顺反了 编码一种

完整的多肽链。它是遗传的功能单位。 (3) 转位因了(transposable elements):是指可以从染色体基因纟fl上的位置转移到另一个 位置,

甚至在不同的染色体Z间跃迁的基因成分。 (4) 基因组(genome):细胞屮,一套完整单倍体的遗传物质的总合。

(5) 启动了 (promoter):是DNA链上一段能与RNA聚合酶结合并能起始转录的序列,其 大小

不等,具有转录目标基因的mRNA的功能。启动了是基因表达不可缺少的重要元件。 (6) 基因(gene),基因是DNA分了中含有特定遗传信息的一段核甘酸序列,是遗传物质 的最小功

能单位。 (7) 顺反了(cistron):基因所对应的一段核昔酸序列被称为顺反子(cistron),—个顺反子 编码一种完

整的多肽链。它是遗传的功能单位。 (8) 终止了 (terminator),在基因3’端下游外侧与终止密码了相邻的一段非编码的核廿酸 短序列,具

有终止转录的功能,叫做终止子(terminator)o (9) 断裂基因(splitgene),宾核生物的结构基因是不连续的,编码氨基酸的序列被非编码 序列所打

断,因而被称为断裂基因(split gene)o在编码序列2间的序列称为内含子(intron), 被分隔开的编码序列称为外显了(exon)。 (10) 顺式作川元件(cis-acting elements),指那些与结构基因表达调控相关、能够被基因 调控蛋H特异性识别和结合的DNA序列。包括启动了、上游启动了元件、增强了、加尾信 号和一些反应元件等。 (II) 反式作用因子(trans-acting elements),可结合顺式作用元件而调节基因转录活性的蛋 白质因子

称为反式作用因子(trans-actingelements)0 (13) 反应元件(response elements),是一类能介导基因对细胞外的某种信号产生反应的 DNA序列,

被称为反应元件(response elements)。 (14) 增强子(enhancer),是一段DNA序列,其屮含有多个能被反式作用因了识别与结合 的顺式作

用元件,反应作用因子与这些元件结合后能够调控(通常为增强)邻近基因的转录。 (15) 转位因了 (transposable elements):是指可以从染色体基因组上的位置转移到另一 个位置,

甚至在不同的染色体Z间跃迁的基因成分。 (16) 转座了 (transposon, Tn),是一类较大的可移动成分,它是由儿个基因组成的特定的 DNA片

段,除有关转座的基因外,至少带有一个与转座作用无关并决定宿主性状的基因(如 抗药性基因)。 (17) 假基因(pseudogene),假基因是多基因家族屮的成员,因其碱基顺序发生某些突变 而失去功

能,不能表达或表达异常,生成无生物活性的多肽。 (18) 重叠基因(overlapping genes),或嵌套基因(nested genes),是指基因的核甘酸序列 (或阅读框)

是彼此重叠的基因,称为重叠基因或嵌套基因。 (19) 基因家族(gene family),就是指核廿酸序列或编码产物的结构具有一定程度同源性 的一组基

因。 (20) 反向重复序列,是指两个顺序相同的拷贝在DNA链上呈反向排列。有两种形式,一 种形式

是两个反向排列的拷贝Z间隔着一段间隔序列;另一种形式是两个拷贝反向串联在一 起,屮间没有间隔序列,这种结构亦称回文结构(palindrome)o (21) 看家基因(housekeeping gene),在几乎所有细胞中或发育过程中持续表达的基因, 被称为看家

基因。 (22) 锌指(zinc fingers)结构,由约30个氨基酸残基纟H•成的一段多肽序列,其屮4个氨 基酸残 基(两个是半脱氨酸两个是组氨酸,或4个都是半脱氨酸)以配位键与相互结 合,形成指状结构,常存在于真核转录因子的DNA结合结构域中。 (23) 亮氮酸拉链(leucine zippers),是指在一段肽链中每隔7个氮基酸残基就有一个亮氨 酸

残基,这段肽链所形成的a ■螺旋就会出现一个由亮氨酸残基组成的疏水面,而另一面则 是由亲水性氨基酸残基所构成的亲水面。由亮氨酸残基纟H•成的疏水1们即为亮氨酸拉链条,两 个具有亮氨酸拉链条的反式作用因子,能借疏水作用形成二聚体。 (24) 基I大1重扌IF (gene rearangement),是指某些基因片段改变原来存在顺序,通过调整

有关 基因片段的衔接顺序,重新组成为一个完整的转录单位。 (25) RNA编辑(RNAediting),是一种较为独特的遗传信息加工的方式,即转录示的mRNA 在编码区发生核昔酸改变的现象,是在RNA分了上岀现的一种修饰现象。 (26) 分了伴侣(molecular chaperone),是指能帮助新生肽链折叠,使Z成为成熟蛋白质,

但本身并不参与共价反应的物质,大部分为蛋白质。 DNase T超敏位点(hypersensitive site):染色体DNA中转录较为活跃的区域,组蛋白相对 缺

乏,并对核酸酶(DNase T )高度敏感,故名。 2. 简述乳糖操纵了屮CAP的正性调节作用机制。

降解物基因活化蛋白(catabolite gene activation protein, CAP)是一种同二聚体,其分 子内有DNA结合区和cAMP结合位点。CAP与cAMP结合形成复合物才能刺激操纵子结 构基因的转录。

当的萄糖浓度低时,会使cAMP浓度升高,形成cAMP-CAP复合物,并与 启动了上游的CAP位点结合,刺激RNA聚合酶的转录作用,使转录效率提高50倍,然而 这种作用的前提条件是无阻遏效应存在。当葡萄糖浓度较高时,cAMP浓度降低,cAMP与 CAP结合受阻,转录效率下降,由此可见,乳糖操纵了结构基因的高表达既需要有诱导剂 的存在(消除阻遏效应),又要求无匍萄糖或低浓度匍萄糖的条件(促进cAMP-CAP复合物 的形成,刺激转录)。 3.比较原核基因组与真核基因组的结构与功能特点

1原核生物基因组仅由一条环状双链DNA分 子

组成,含有1个复制起点,无染色体结构, 基因的转录和翻译在同一区域进行。 1.多条染色体,两份同源的基因组,而原核 生物

的基因组则是单拷贝的。基因组庞大、 复杂,具有许多复制起点,每个复制子大小 不一。 2.具冇操纵了结构

这是原核基因纟R的一个突出的结构特点。 2

.无明显操纵了结构,存在大最反式作川因 子

与顺式作用元件的相互作用调节 3・编码序列在基因组屮约占50%

编码顺序不重叠,其转录产物多为多顺反子 结构。

3.非编码的顺序占绝大部分,约占90%以上。

基因组中非编码的顺序所占比例是真核生物 与细菌、病毒的重要区别。 4.多顺反了结构,无内含了,是连续的,因 此转

录后不需要剪切。 4.单顺反了结构,即一分了 mRNA

只能翻 译成

一种蛋白质。存在断裂基因。 5.基因组屮重复序列很少 5.

含有大量重复顺序,这是真核生物基因组 的重

要特点。 6.存在移动基因,包括插入序列和转座了 6

有基因家族,功能相关的基因构成各种基因 家

族,它们可串联在一起,亦可相距很远。 4.简述真核表达调控的主要环节和调控方式。

(-)DNA水平的调控:(1)染色质结构对基因表达的调控作用,(2)基因修饰,(3) 基因重排,(4)基因扩增。 (二)转录水平的调控(转录起始的调控) (1)反式作用因了的活性调节;(2)反式作用因了与顺式元件的结合;(3)反式作用 因

了的组合式调控作用 (三) 转录后水平调控 (1) “加帽”和“加尾”的调控;(2) mRNA选择性剪接对表达的调控;(3) RNA 编辑的调控;(4) mRNA转运调节 (四) 翻译水平的调控 (1)翻译起始调控;(2) mRNA稳定性对翻译的影响

(五) 翻译后水平的调控 (1)信号肽的切除;(2)新生肽链的修饰;(3)肽链的剪接与正确折叠

第三章 1. 核酸分离纯化应注意哪些事项? 一般的分离纯化分为哪些步骤?各步的要点是什么?

分离纯化核酸应注意:①应保证核酸一级结构的完整性,防止降解;②排除其它分子的 污染。为了保证核酸结构与功能的研究,完整的一级结构是最基木的要求,因为遗传信息全 部贮存在一级结构Z内。保持核酸的完整性,即保持其天然状态。细胞内的核酸酶活力很高, 在制取过程屮必须防止核酸

酶对核酸的降解。③防止化学因素(酸碱等)和物理因素(高温或机 械剪切等)引起核酸变性或破坏。制备RNA要特别注意防上核酸酶的作用,因为RNase分 布很广,活力很高;而对DNA更重要的是防止张力剪切作用,因为DNA分子特别长,容 易断裂。 核酸的纯化:①首先是去除蛋白质。要点:从细胞裂解液等复杂的分了混合物屮纯化核 酸,要先用某些蛋白水解酶消化大部分蛋白质丿rs,再用有机溶剂抽提。从核酸溶液屮去除蛋 白质常用酚/氯仿抽提法,在氯仿屮加入少许异戊醉的目的在于减少蛋白质变性操作过稈屮 产生的气泡。②用氯仿抽提处理,去除核酸溶液中的痕量酚。要点:如果下一步骤中酶反应 的条件要求严格,最可靠的方法是再用水饱和的乙瞇抽提一次,以彻底去除核酸样品屮的痕 量酚与氯仿,然后在68°C水浴屮放置10分钟使痕量乙瞇蒸发掉。

6. PCR反应的基本原理是什么?每个循环包括哪些步骤?有何应用价值?

PCR反应的基木原理:首先是双链DNA分子在临近沸点的温度下加热时便会分离成两 条单链

的DNA分了,然后DNA聚合酶以单链DNA为模板并利用反应混合物屮的四种脱氧 核昔三磷酸(dNTPs)合成新生的DNA互补链。此外,DNA聚合酶同样需要有一小段单链 DNA来启动(“引

导”)新链的合成。 每一个温度循环周期均是由高温变性、低温退火及适温延伸等三个步骤组成。 应用价值:PCR技术不仅可以用来扩增与分离bl的基因,而且在临床医疗诊断、胎儿 性别鉴定、癌症治疗的监控、基因突变与检测、分了进化研究,以及法医学等诸多领域都有 着重要的应用。

9. PCR的引物设计应遵守哪些原则?如何对体系反应条件按优化?

原则:®PCR引物合成的DNA片段通常长15〜25碱基,其中G+C约占50%。 %1 在设计时必须特别注意引物Z间不能互配形成双链结构,引物内部也不能形成发夹结 构。③引物的丁末端必须与目的片段完全相配。④引物的5,末端可以不与目的片段互补, 可以包含内切酶位点或启动了序列,但在下一轮反应屮,这些序列会被同样合成。有时在扩 增仅知其表达产物的目的片段时,可以在引物屮设计成简并密码了。 体系反应条件按优化:①首先是使模板DNA解离成为单链,这个过程可以通过加热完 成,在90〜95°C条件下,根据模板DNA复杂程度,调整变性温度和时间。一般情况下选择 94°C, 30秒可