最新核酸化学

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1.4.3 第三章核酸化学

第三章核酸化学

学习目标

知识目标

(1)阐述核酸的元素组成、组成成分及组成单位。

(2)描述DNA、mRNA、tRNA和rRNA的结构特点。

(3)阐述核酸的变性、复性、杂交等基本概念,并列举其应用。

(4)了解核酸的性质、体内重要的游离核苷酸及其衍生物的功能。

(5)概括核酸提取的有关原理和注意事项。

能力目标

(1)至少会用一种方法完成核酸的含量测定。

(2)具备核酸类药物在使用、储存和运输中的基本技能。

核酸是生物体的基本组成物质,是重要的生物大分子,从高等的动物、植物到简单的病毒都含有核酸。核酸是遗传信息的载体。

1869年,年轻的瑞士科学家Miescher从脓细胞核中分离出一种含有C、H、O、N和P的物质,当时称为核素。因发现核素显酸性,后又改称为核酸,意即来自细胞核的酸性物质。随后,Hoppe-Seyler从酵母中分离出一种类似的物质,即现在的RNA。自那之后,核酸研究并非非常顺利。直到1909年,美国生物化学家Owen发现核酸中的糖分子是由5个碳原子组成的核糖。1930年,他又发现Miescher在绷带上发现的核酸中的糖分子比

Hoppe-Seyler发现的“酵母核酸”中的糖分子少了1个氧原子,因此将这种糖分子称为脱氧核糖,含两种不同糖分子的核酸分别称为脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)。1934年,Owen将核酸水解,证明核酸的基本组成单位是核苷酸。同时,在这一时期还证明了核苷酸是由碱基、戊糖和磷酸组成。20世纪50年代初,Chargaff发现DNA的嘌呤和嘧啶组成有其特殊规律。1953年,Watson和Crick提出了DNA的双螺旋结构模型。从此,核酸的研究经历了基因克隆、人类3×109个碱基对(base pair,bp)的基因测序,开始进入基因组学研究阶段。

1.4.3.1 第一节核酸的化学组成

第一节核酸的化学组成

一、核酸的元素组成

组成核酸的元素有C、H、O、N、P 5种,其中磷的含量在各种核酸中变化范围不大,平均含磷量为9%~10%。因而,可通过测定生物样品中磷的含量来计算样品中核酸含量。

二、核酸的基本组成单位——核苷酸

核酸在核酸酶的作用下水解为核苷酸,因此核酸的基本组成单位是核苷酸。为区别多、寡核苷酸,故将核苷酸也称为单核苷酸。核苷酸完全水解可释放出等摩尔量的碱基、戊糖和磷酸。

知识链接

核苷酸的利用

调味料:鸟苷酸(GMP)、肌苷酸(IMP)等核苷酸属于呈味性核苷酸,除了本身具有鲜味之外,在和左旋谷氨酸(味精)组合时,还有提高鲜味的作用,可作为调料、汤料的原料使用。

食品添加剂:母乳中含有尿苷酸(UMP)、胞苷酸(CMP)、腺苷酸(AMP)、鸟苷酸(GMP)、肌苷酸(IMP)等多种核苷酸,对提高婴儿的免疫调节功能和记忆力发挥着作用。在欧美等国家生产的婴儿奶粉均按照母乳中的含量添加微量核苷酸,也有添加RNA的例子。

药物:核苷酸作为药物,可抑制尿道发炎,在美国也有作为免疫调节剂给手术后的患者使用的例子。

(一)核苷酸的组成成分

1.碱基

核酸中的碱基主要有嘧啶碱(pyrimidine base)和嘌呤碱(purine base)两种。

(1)嘧啶碱:嘧啶碱是含有两个相间氮原子的六元杂环化合物。核酸中主要的嘧啶碱衍生物有三种:胞嘧啶(cytosine,C)、胸腺嘧啶(thymine,T)和尿嘧啶(uracil,U)。

(2)嘌呤碱:嘌呤碱由嘧啶环与咪唑环合并而成。核酸中的嘌呤碱主要有两种,即腺嘌呤(adenine,A)和鸟嘌呤(guanine,G)。

(3)稀有碱基:核酸中还有一些含量甚少的碱基,称为稀有碱基(或修饰碱基)。常见的稀有嘧啶碱基有5-甲基胞嘧啶、5,6-二氢尿嘧啶等;常见的稀有嘌呤碱基有7-甲基鸟嘌呤、N6-甲基腺嘌呤等。

知识链接

20世纪90年代,人类基因工程启动,科学家每天人工测序5000对碱基。21世纪初期,自动测序仪每天可以测序10万对碱基,而现在,每天可以测序250亿对碱基。但是,目前要分析人类所有的基因仍然需要至少几周的时间。

韩国KAIST的研究人员让一个DNA通过纳米通道,每个碱基就会附着在石墨纳米带状体上几微秒。通过改变石墨导电性能的方式分离四种碱基——腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶和鸟嘌呤。这样基因测序可以通过观察导电性变化,更快更准确地进行。预计可以在1h 内分析30亿对碱基,这对于基因组测序研究而言具有重要的意义。

这项研究对于基因和生物工程领域研究意义重大,而且还能够为疑难杂症的治疗提供解决方案。这种方法还将推进基于基因信息的医疗、基因突变、遗传性疾病、个体和适应性疾病的发展,甚至推进人类进化研究的进程。

2.戊糖

核酸中所含的糖是核糖(D-ribose)和脱氧核糖(deoxy-D-ribose),均属于戊糖。戊糖都是以β-D-呋喃糖的环状形式存在。由于环状糖中的第1位碳原子(C1′)是

不对称碳原子,所以有α-及β-两种构型。核酸中所含的戊糖均为β-型。核糖中的

C2′—OH脱氧后形成脱氧核糖(2′-deoxy-D-ribose)。核糖上的碳原子序号上加“′”,是为了区别于碱基上的碳原子序号。

(二)核苷酸的分子结构

1.核苷

由一个戊糖(核糖或脱氧核糖)和一个碱基(嘌呤碱或嘧啶碱)缩合而成。

戊糖第1位碳原子(C1′)上的羟基与嘌呤碱第9位氮原子(N9)或嘧啶碱第1位氮原子(N1)上的氢缩合脱水形成糖苷键。核糖与碱基通过糖苷键连成核糖核苷,脱氧核糖与碱基通过糖苷键连成脱氧核糖核苷。

2.核苷酸

核苷酸由磷酸与一分子核苷通过磷酸酯键连成。

核苷中戊糖的羟基与磷酸作用形成磷酸酯键,核苷与磷酸通过磷酸酯键连接成的化合物即为核苷酸。核苷酸分为核糖核苷酸(nucleoside monophosphate,NMP)和脱氧核糖核