耶尔森菌属
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把文献标好,讨论中能知道我们新发现的内生菌的属和种吗,健株与病株内生细菌种类的不同,加以讨论。
投哪里?茄子植株内生细菌群落结构多态性蓝江林1,刘波1*,唐秋榕2,朱育菁1,林抗美1,苏明星1,史怀1(1.福建省农业科学院农业生物资源研究所,福建福州350003;2.福建农林大学植物保护学院,福建福州350002)摘要:分离纯化不同来源地茄子健株和青枯病株内生细菌,利用细菌脂肪酸鉴定技术进行鉴定,研究茄子植株内生细菌的群落结构特性。
共获得内生细菌18属28种,健株共分离到内生细菌15属23种,含量为5.96×105CFU/g。
病株分离到内生细菌14属16种,含量为3190.92×105CFU/g,其中青枯雷尔氏菌含量为3186.86×105CFU/g。
不同种植地来源的茄子健株内生细菌的种类结构有较大差异,来自晋江的健株分离到13属17种,来自东洋的健株分离到7属9种,而来自福清的健株仅分离到3属4种。
来自晋江的植株内生细菌的SIMPSON(D)优势度指数和SHANNON(H1)多样性指数分别为0.9632和3.5725,均高于来自东洋的植株内生细菌的0.9444和2.7255,来自福清植株的0.8333和1.5。
而均匀度则以来自东洋的植株最高为0.9708,来自晋江和福清的植株分别为0.9654和0.9464。
关键词:茄子,内生细菌,群落结构Polymorphism of community structure of endophytic bacteria from eggplant plantLAN Jiang-lin1,LIU Bo1*,TANG Qiu-rong2,ZHU Yu-jing1,LIN Kang-mei1,SU Ming-xing1,SHI Huai1(1. Agricultural Bioresource Research Institute,Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350003;2. College of Plant Protection,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002 )Abstract: In order to study the community structure of endophytic bacteria in eggplant, healthy and infested eggplant plants were collected from different areas in Fujian Province, PR China. The endophytic bacteria inside the plants were isolated and identified by using fatty-acid identification technology. The results showed that 28 species of endophytic bacteria were detected in eggplant totally, belonging to 18 genera. Inside the healthy plant, 23 species of endophytic bacteria belonging to 15genera,and their content were 5.96×105CFU/g. Meanwhile,16 species of endophytic bacteria belonging to 14genera were found in infested plant,their content were 3190.92×105CFU/g,including Ralstonia solanacearum reached 3186.86×105CFU/g. Significant difference of endophytic bacteria was observed among the eggplants collected from different areas. 17 species belonging to 13 genera, 9 species belonging to 7 genera and 4 species belonging to 3 genera were tested in healthy plants from Jinjiang, Dongyang and Fuqing area, respectively. SIMPSON(D) and SHANNON(H1) of the endophytic bacterium community in plant from Jinjiang were 0.9632and 3.5725, respectively, higher than those in plants from Dongyang and Fuqing. The evenness of endophytic bacteria was 0.9708 in plants from Dongyang, which were higher than those of 0.9654 and 0.9464 in plants from Jinjiang and Fuqing, respectively.Key word:eggplant plant;endophytic bacteria;community structure植物内生细菌(Endophyte bacteria)是指能在健康植物组织内栖居而对植物不造成实质性危害而与植物建立了和谐联合(compatible association)关系的微生物(Kado, 1992;Kobayashi, 2000)。
表 2.细菌、放线菌、衣原体、支原体、立克次体、螺旋体分类名录
物质特指菌株或活菌培养物,应按UN2814的要求包装和空运,其他相关样本和B类的病原和相关样本均按UN3373的要求包装和空运;通过其他交通工具运输的可参照以上标准包装。
f因属甲类传染病,流行株按第二类管理,涉及大量活菌培养等工作可在BSL-2实验室进行;非流行株归第三类。
说明:
1.在保证安全的前提下,对临床和现场的未知样本的检测可在生物安全二级或以上防护级别的实验室进行。
涉及病原
菌分离培养的操作,应加强个体防护和环境保护。
但此项工作仅限于对样本中病原菌的初步分离鉴定。
一旦病原菌初步明确,应按病原微生物的危害类别将其转移至相应生物安全级别的实验室开展工作。
2.“大量”的病原菌制备,是指病原菌的体积或浓度,大大超过了常规检测所需要的量。
比如在大规模发酵、抗原和疫苗生产,病原菌进一步鉴定以及科研活动中,病原菌增殖和浓缩所需要处理的剂量。
3.本表未列之病原微生物和实验活动,由单位生物安全委员会负责危害程度评估,确定相应的生物安全防护级别。
如
4.。
肠杆菌1.肠杆菌属产气肠杆菌、阴沟肠杆菌、聚团肠杆菌、阿斯布肠杆菌、河生肠杆菌生物1群、河生肠杆菌生物2群、中间肠杆菌、格高非肠杆菌、阪崎肠杆菌、泰洛肠杆菌2.埃希菌属大肠埃希菌、福格森氏埃希菌、不活跃大肠埃希菌、伤口大肠埃希菌、赫尔曼氏埃希菌3.沙雷菌属粘质沙雷菌、深红沙雷菌、无花果沙雷菌、泉居沙雷菌、芳香沙雷菌1群、芳香沙雷菌2群、晋城沙雷菌、液化沙雷菌4.克雷伯菌属肺炎克雷伯菌、臭鼻克雷伯菌、鼻硬节克雷伯菌、产酸克雷伯菌、解鸟氨酸克雷伯菌5.变形杆菌属奇异变形杆菌属、普通变形杆菌、潘尼变形杆菌6.普罗威登斯菌属产碱普罗威登菌、斯图普罗威登菌、雷极普罗威登菌、拉氏普罗威登菌7.沙门菌属猪霍乱沙门菌、甲型副伤寒沙门菌、伤寒沙门菌、雏白利沙门菌8.枸橼酸杆菌弗旁地枸橼酸杆菌、异型枸橼酸杆菌、丙二酸盐阴性枸橼酸杆菌9.爱文菌属美洲爱文菌10.布特维西菌属水生布特维西菌11.爱德华菌属迟缓爱德华菌、保科爱德华菌12.巴提奥杆菌属乡间巴提奥杆菌13.哈夫尼亚菌属蜂房哈夫菌属14.西地西菌属戴氏西地西菌、拉氏西地西菌、奈氏西地西菌15.摩根菌属摩根摩根菌16志贺菌属志贺菌A,B,C 群、宋内志贺菌17.克吕沃菌属抗坏血酸克吕沃菌、栖冷克吕沃菌18.莱克勒菌属不脱羧莱克勒菌19 .默勒菌属威斯康星默勒菌20 拉恩菌属水生拉恩菌21.塔特姆菌属、痰塔特姆菌22.耶尔森菌属假结核耶尔森菌、小结肠炎耶尔森菌、中间耶尔森菌、克氏耶尔森菌、费氏耶尔森菌23.不动杆菌属洛菲不动杆菌、溶血不动杆菌、鲍曼不动杆菌、醋酸钙不动杆菌24. 寡养单胞菌属嗜麦芽窄单胞菌非发酵菌1.假单胞菌属铜绿假单胞菌、荧光假单胞菌、恶臭假单胞菌、施氏假单胞菌、门多萨假单胞菌、产碱假单胞菌、假产碱假单胞菌2.伯克霍尔德氏菌属鼻疽伯克霍尔德氏菌、假鼻疽伯克霍尔德氏菌、洋葱伯克霍尔德氏菌、唐菖蒲伯克霍尔德氏菌3.丛毛单胞菌属食酸丛毛单胞菌、睾丸酮丛毛单胞菌4.短波单胞菌属缺陷短波单胞菌、波囊短波单胞菌5.窄食单胞菌属嗜麦芽窄单胞菌6.产碱杆菌属木糖氧化产碱杆菌反硝化亚种、木糖氧化产碱杆菌木糖氧化亚种、粪产碱杆菌7. 不动杆菌属洛菲不动杆菌、醋酸钙不动杆菌、溶血不动杆菌、鲍曼不动杆菌8.黄杆菌属脑膜败血性黄杆菌、芳香黄杆菌、Ⅱb群黄杆菌、产吲哆黄杆菌9.威克斯菌属有毒威克斯菌、动物溃疡威克斯菌10.金色单胞菌属浅黄假单胞菌11.黄色单胞菌属栖稻假单胞菌12.弧菌属霍乱弧菌、副溶血弧菌、溶藻弧菌、河流弧菌、创伤弧菌13气单胞菌属嗜水气单胞菌、温和气单胞菌、杀鲑气单胞菌、舒伯特气单胞菌、豚鼠气单胞菌14邻单胞菌属类志贺邻单胞菌15巴斯德菌属多杀巴斯德菌、溶血巴斯德菌16莫拉氏菌属莫拉氏菌17谢瓦纳拉菌属腐败谢瓦纳拉菌.葡萄球菌/微球菌1.葡萄球菌属金黄色葡萄球菌,金黄色葡萄球菌厌氧亚种,表皮葡萄球菌,头葡萄球菌,解糖葡萄球菌,华纳葡萄球菌,溶血葡萄球菌,人葡萄球菌、路邓葡萄球菌、斯莱福葡萄球菌、耳葡萄球菌、腐生葡萄球菌、孔氏葡萄球菌、木糖葡萄球菌、阿莱特葡萄球菌、模仿葡萄球菌、中间葡萄球菌、猪葡萄球菌、缓慢葡萄球菌2. 微球菌属微球菌,易变微球菌,玫瑰微球菌,克里斯汀微球菌链球菌/肠球菌1肠球菌属酪黄肠球菌,粪肠球菌,屎肠球菌,鸟肠球菌,母鸡肠球菌,坚韧肠球菌2.草绿色链球菌属牛链球菌,唾液链球菌,血液链球菌,中间链球菌,缓症链球菌,变异链球菌群3.β溶血链球菌群化脓性链球菌,无乳链球菌,马链球菌,兽瘟链球菌,似马链球菌,停乳链球菌,β溶血链球菌4.咽峡炎链球菌群星座链球菌,咽峡炎链球菌5.孪生球菌属溶血孪生球菌,麻疹孪生球菌6.肺炎链球菌属肺炎链球菌7.气球菌属绿色气球菌真菌1.隐球菌属新型隐球菌,白色隐球菌,罗伦隐球菌,地生隐球菌,指甲隐球菌2.假丝酵母菌属白假丝酵母菌,白色假丝酵母菌生物变种,季也蒙假丝酵母菌,乳酒假丝酵母菌,克柔假丝酵母菌,溶脂假丝酵母菌,葡萄牙假丝酵母菌,近平滑假丝酵母菌、伪热带蒙假丝酵母菌、皱褶假丝酵母菌、热带假丝酵母菌、光滑假丝酵母菌、涏沫假丝酵母菌3.酵母属酿酒酵母菌4.丝孢酵母属白吉利丝孢酵母菌5.地霉属白地霉菌6.红酵母属粘红酵母菌,深红酵母菌7.毛孢子菌属白杰尔毛孢子菌8.地丝菌属念珠地丝菌。
临床常见细菌及其特点临床常见细菌及其特点一般分为革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌一、革兰氏阳性球菌主要包括葡萄球菌属、链球菌属、肠球菌属等凝固酶阳性常见金黄色葡萄球菌(一)葡萄球菌属表皮葡萄球菌人型葡萄球菌凝固酶阴性溶血葡萄球菌腐生葡萄球菌A:凝固酶阳性金黄色葡萄球菌(1)生物学特点:凝固酶阳性,β溶血,耐盐。
(2)传染源与传播途径:;金黄色葡萄球菌可存在于人类鼻咽部粘膜和皮肤表面,可经手,打喷嚏,皮肤伤口传播。
(3)疾病:①金黄色葡萄球菌引起的食物中毒,②化脓性感染中最常见的病原菌。
皮肤和皮下组织感染如:疖痈、脓肿等③严重的肺炎④脑膜炎、心内膜炎等甚至败血症、脓毒血症等全身性感染、同时也可引起中毒性休克综合症⑤接受血液透析治疗的晚期肾脏疾病患者特别容易感染金葡菌。
⑥金葡菌尤其耐药金葡菌感染是引起住院患者感染和死亡的主要原因之一(4)耐药性:耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌(MRSA),对各类青霉素,头孢菌素和其他β-内酰胺类均交叉耐药。
mecA基因是MRS特有的耐药基因。
B:凝固酶阴性(二)链球菌疱病炎。
坏死性筋膜炎新生儿:败血症、脑膜炎其它:继发急性肾膜炎。
对于妊娠妇女小球肾炎、风湿热<37周的早产或羊膜等破裂>18小时者应给予青霉素治疗可减少(三)肠球菌属原属链球菌常见为粪肠球菌和屎肠球菌1、生物学特性:溶血或不溶血,触酶阴性2、传染源和途径:胃肠正常菌群,伤口感染,机会感染的致病菌3、致病:已作为医院感染重要的致病菌,国外上升为第3位的院感菌,泌尿道感染比较常见4、耐药性:(1)对头孢菌素,苯唑西林,单环类天然耐药,对青霉素敏感性较链球菌低,耐药由β-内酰胺类亲和力降低的低分子量的PBPs引起(2)耐药性最严重的为耐万古霉素的VRE表型共有VanA、VanB、VanC、VanD、VanE、VanG六型,最常见为VanA、VanB(3).屎肠球菌的耐药性较粪肠球菌高。
二、革兰氏阴性杆菌埃希菌属大肠埃希菌克雷伯菌属肺炎克雷伯菌沙门菌属伤寒、肠炎沙门菌志贺菌属痢疾、福氏、鲍氏、宋内志贺菌变形杆菌属奇异、普通变形杆菌肠杆菌科耶尔森菌属鼠疫、小肠结肠耶尔森菌肠杆菌属阴沟、产气肠杆菌枸橼酸杆菌属枸橼酸杆菌普罗威登斯菌属斯氏、雷氏普罗威登斯菌常见阴性杆菌包括沙雷菌属粘质沙雷菌假单胞菌属铜绿假单胞菌、嗜麦芽窄食非发酵菌不动杆菌属鲍曼不动杆菌(一)肠杆菌科以下为常见肠杆菌科细菌的特点内酰类抗生素均产生耐,仅多数产吲哚自身粪便菌群常见菌;腹泻;对头霉素类,碳青霉素及酶抑制剂敏感动力阳性当机体抵抗力下降或Eco侵入肠外组织或器官,可新生儿败血症和脑膜炎;伤口感染;胆囊炎等(二)非发酵菌1、假单胞菌属:A、铜绿假单胞菌(Pae.)(1)生物学特性:革兰氏阴性,H2O2(+),动力(+),广泛存在于自然界(水和土壤),是重要的机会致病菌(2)传染源:常发生医院内感染,细菌可存在于空调机的水管、引流管、呼吸机、蔬菜和鲜花。
微生物检验技术专业实践能力模拟题14一、最佳选择题1. 空斑试验用于测定病毒的A.核酸种类B.感染力C.数目D.类型E.黏附力答案:B空斑试验常用来检测病毒感染力。
将适当浓度的病毒悬液接种到生长单层细胞的玻璃平皿或扁瓶中,当病毒吸附于细胞上后,再在其上覆盖一层溶化的半固体营养琼脂层,待凝固后,孵育培养。
当病毒在细胞内复制增殖后,每一个感染性病毒颗粒在单层细胞中产生一个局限性的感染细胞病灶,病灶逐渐扩大,若用中性红等活性染料着色,在红色的背景中显出没有着色的“空斑”,清楚可见。
2. 2003年在我国内陆的SARS疫情中,山西省属于A.输出病例区B.未发生病例区C.输入病例区,并引起当地传播D.输入病例区,未引起当地传播E.流行区,并输出病例引起其他地区感染答案:C2003年我国内陆的SARS疫情中,山西省的SARS病例是由外地传入,属于输入病例区,并在当地引起传播。
3. 对疑似霍乱弧菌感染患者的粪便标本,采用压滴法,用普通光学显微镜观察A.细菌壁B.线粒体C.芽胞D.动力E.荚膜答案:D压滴法观察霍乱弧菌的动力,可发现霍乱弧菌呈流星样或穿梭样运动,具有鉴定价值。
4. 诊断流感病毒常用的血清学方法是A.沉淀试验B.补体结合试验C.血凝与血凝抑制试验D.试管凝集试验E.玻片凝集试验答案:C用血清学方法诊断流感病毒,取发病3d内和2~4周后双份血清做血凝抑制试验或补体结合试验,测定急性期和恢复期血清抗体,升高4倍以上有诊断意义。
最常用和最简单的方法是血凝抑制试验,必要时采用补体结合试验。
5. 荚膜肿胀试验可快速诊断A.肺炎链球菌感染B.乙型溶血性链球菌感染C.甲型溶血性链球菌感染D.军团菌感染E.布鲁菌感染荚膜肿胀试验可作为肺炎链球菌的快速诊断,用于痰液、脓汁或脑脊液中肺炎链球菌的鉴定。
6. 食品大肠菌群乳糖初发酵试验,待检样品接种量在1ml以上者,用A.双料乳糖胆盐发酵管B.单料乳糖胆盐发酵管C.单料乳糖蛋白胨发酵管D.双料乳糖蛋白胨发酵管E.乳糖蛋白胨发酵管答案:A食品大肠菌群乳糖初发酵试验,将待检样品接种于乳糖胆盐发酵管内,接种量在1ml以上者,用双料乳糖胆盐发酵管;接种量在1ml及1ml以下者,用单料乳糖胆盐发酵管。
菌组代码及名称
菌组代码及名称
代码菌组名称
GM+ 所有G+菌
GM- 所有G-菌
EBC 肠杆菌科细菌
NFR 非发酵G-杆菌
ANA 厌氧菌
MYC 分枝杆菌
FUN 真菌
PAR 寄生虫
AC- 不动杆菌属
AEC 气球菌属
AER 气单胞菌属
BCS 芽胞杆菌属
BAC 拟杆菌属
BUK 伯克霍尔德菌属
CAM 弯曲菌属
CAN 念珠菌属
CI- 柠檬酸杆菌属
COR 棒杆菌属
EN- 肠杆菌属
ENT 肠球菌属
ESC 埃希菌属
FLA 黄杆菌属
FRA 弗郎西斯菌属
HA- 嗜血杆菌属
KL- 克雷伯菌属
LIS 李斯特菌属MO- 莫拉菌属MOR 摩根菌属MYC 分枝杆菌属
NE- 奈瑟菌属
PR- 变形杆菌属PRV 普罗威登斯菌属PS- 假单胞菌属SAL 沙门菌属
SE- 沙雷菌属
SHI 志贺菌属
STA 葡萄球菌属SCN 凝固酶阴性葡萄球菌STE 窄食单胞菌属STR 链球菌属
SVI 链球菌
BS- β-溶血链球菌
VI- 弧菌属
YER 耶尔森菌属。