CMA在产前诊断中应用
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“基于母血浆深度测序的胎儿亚显微染色体异常无创伤性检测”点评胡平【期刊名称】《中国产前诊断杂志(电子版)》【年(卷),期】2013(005)002【总页数】2页(P54-55)【作者】胡平【作者单位】南京医科大学附属南京妇幼保健院,江苏南京 210004【正文语种】中文1 原文摘要The purpose of this study was to determine the deep sequencing and analytic conditions needed to detect fetal subchromosome abnormalities across the genome from a maternal blood sample.Cellfree(cf)DNA was isolated from the plasma of 11 pregnant women carrying fetuses with subchromosomal duplications and deletions,translocations,mosaicism,and trisomy 20 diagnosed by metaphase karyotype.Massively parallel sequencing(MPS)was performed with 25-mer tags at approximately 109 tags per sample and mapped to reference human genome assemblyhg19.Tags were counted and normalized to fixed genome bin sizes of 1Mbor 100 kb to detect statistically distinct copy-number changes compared to the reference.All seven cases of microdeletions,duplications,translocations,and the trisomy 20 were detected blindly by MPS,including a microdeletion as small as 300 kb.In two of these cases in which the metaphase karyotype showed additional material of unknown origin,MPS identified both the translocation breakpoint and the chromosomal origin of the additional material.In the four mosaic cases,the subchromosomal abnormality was not demonstrated by MPS.This work shows that in nonmosaic cases,it is possible to obtain a fetalmolecular karyotype by MPS ofmaternal plasma cfDNA that is equivalent to a chromosome microarray and in some cases is better than a metaphase karyotype.This approach combines the advantage of enhanced fetal genomic resolution with the improved safety of a noninvasive maternal blood test.2 论文核心内容及点评该文章于2013年2月发表于《The American Journal of Human Genetics》杂志。
一例新生突变16p13.11微缺失综合征的思考[摘要]目的探讨CMA在胎儿侧脑室增宽中应用价值,为临床遗传咨询提供指导价值。
方法患者孕25+5周,因“超声提示胎儿双肾盂分离(左侧7mm、右侧4mm)、侧脑室宽度(左侧10mm、右侧8.6mm)”于2021年1月12日在宁夏回族自治区银川市妇幼保健院产前诊断中心进行遗传咨询,知情同意后抽取胎儿羊水,采用G显带染色体核型分析技术和染色体微阵列芯片技术(chromosomal microarray,CMA),进行遗传学分析和产前诊断。
结果胎儿羊水样本CMA测序结果为:arr[GRCh37]16p13.11(15049829_16258367)x1,提示胎儿16号染色体p13.11处存在约1.21Mb缺失,为致病性拷贝数变;通过父母的CMA溯源,父亲未检测到样本16p13.11存在片段缺失,但检测到7号染色体上意义不明的拷贝数重复,表型正常;母亲检测未见异常,表型正常。
经产前诊断遗传咨询后,本例孕妇及家属选择自愿终止妊娠。
结论对于产前超声提示侧脑室增宽的胎儿应建议CMA检测,进而发现更多染色体异常,指导预后,利于优生。
关键字16p13.11微缺失综合征;侧脑室增宽;CMA;产前诊断染色体微缺失及微重复是指染色体细微片段发生缺失或者重复,使得正常基因发生剂量改变进而导致的临床表现较复杂的一种染色体疾病。
16p13.11微缺失综合征是微缺失、重复综合征中较多见的一类染色体异常,是由于16号染色体短臂上的大片段基因缺失引起的染色体异常疾病,临床上具有广泛表型表现的多效性基因组变异,包括神经发育表型如孤独症、智力低下、癫痫和学习困难,以及非中枢神经系统表型如身体畸形和先天性异常[1]。
染色体微阵列分析(Chromosomal Microarray Analysis, CMA)又称染色体芯片,可在全基因组范围内同时检测染色体微缺失、微重复等基因组失衡现象,且具有分辨率高、检测流程标准化、无需细胞培养,特异性、稳定性好等优点,目前已被作为产前、产后遗传病诊断中的一线诊断技术。
15三体嵌合体:羊水穿刺产前诊断及胎儿组织的遗传检测孙惠霖;刘建兵;许孟军;张庆娥;应菲菲;安宁;李敏【期刊名称】《现代妇产科进展》【年(卷),期】2024(33)3【摘要】目的:对无创胎儿DNA检测结果提示为15号染色体异常的孕妇进行产前诊断并对流产胎儿组织进行遗传检测,为15三体嵌合体的遗传咨询和产前诊断提供依据。
方法:选取1例无创胎儿DNA提示为15号染色体异常的孕妇,应用染色体核型分析、染色体微阵列分析技术(CMA)进行产前诊断并对流产胎儿组织进行荧光原位杂交(FISH)验证。
结果:产前诊断胎儿羊水细胞染色体核型为15三体嵌合体,嵌合比例约为6.67%,CMA结果提示为15三体嵌合体,嵌合比例约为70%。
二者结果相同,但嵌合比例存在较大差异。
经遗传咨询及知情同意,孕妇及家属选择终止妊娠,取流产胎儿羊水及胎盘进行FISH验证,羊水检测结果提示15三体嵌合比例约为48%,胎盘检测结果提示15三体比例约为39%。
结论:该例胎儿为15三体嵌合体,是真性嵌合体。
羊水细胞培养过程中46,XN细胞可能存在优势生长,导致产前诊断染色体核型分析与CMA嵌合比例存在较大差异。
流产胎儿组织的FISH检测对产前诊断结果验证具有良好的应用效果。
【总页数】4页(P213-215)【作者】孙惠霖;刘建兵;许孟军;张庆娥;应菲菲;安宁;李敏【作者单位】扬州大学医学院附属盐城妇幼保健院(盐城市妇幼保健院)医学遗传中心;扬州大学医学院附属盐城妇幼保健院(盐城市妇幼保健院)产前诊断中心【正文语种】中文【中图分类】R714.55【相关文献】1.产前诊断中羊水染色体嵌合体的回顾性分析2.产前诊断两例罕见羊水细胞嵌合体染色体的讨论3.880例不同产前诊断指征孕妇羊水穿刺胎儿染色体核型的对比分析4.染色体三体、嵌合体及单亲二体的产前诊断和遗传咨询V-Seq联合核型分析在羊水穿刺胎儿染色体嵌合体诊断中的应用因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
《中国产前诊断杂志(电子版)》 2023年第15卷第2期·论著· 核型分析联合染色体微阵列分析在胎儿超声异常中的应用刘建珍 林铿 许碧秋 陈鸿桢 (广州市花都区妇幼保健院,广东广州,510800)【摘要】 目的 探讨核型分析联合染色体微阵列分析(chromosomalmicroarrays,CMA)技术在胎儿超声异常的应用价值。
方法 分析2020年1月至2022年6月就诊于广州市花都区妇幼保健院的220例胎儿超声异常病例的核型分析和CMA结果,按超声情况分为单发结构异常、多发结构异常、结构异常合并软指标异常、单项软指标异常、多项软指标异常共五组,分析各组染色体异常情况。
结果 核型分析、CMA在胎儿超声异常病例的染色体异常检出率分别为8.18%(18/220)、11.36%(25/220),两种技术对于胎儿染色体异常的检出率差异无统计学意义(χ2=1.26,犘=0.26)。
核型分析较CMA额外检出2例平衡易位,CMA较核型分析额外检出6例拷贝数变异(CNVs)和3例纯合区域(ROH)。
单发结构异常、多发结构异常、结构异常合并软指标异常、单项软指标异常、多项软指标异常的染色体异常检出率分别为11.11%(4/36)、25.00%(2/8)、16.67(2/12)、10.26%(16/156)、50.00%(4/8)。
多发结构异常的胎儿染色体异常率高于单发结构异常,多项软指标异常胎儿染色体异常率显著高于单项软指标异常,差异有统计学意义(χ2=11.23,犘=0.00)。
结论 胎儿超声异常与染色体异常的关系密切,多项超声异常的胎儿染色体异常风险增加。
核型分析能有效检出染色体平衡易位,CMA对CNVs和ROH检测效能高,两者联合能提高胎儿超声异常的染色体异常检出率,明确致病片段来源及性质,并使异常结果得到验证。
【关键词】 胎儿超声异常;核型分析;染色体微阵列分析【中图分类号】 R714.55 【文献标识码】 A犇犗犐:10.13470/j.cnki.cjpd.2023.02.005 通信作者:陈鸿桢,Email:527538053@qq.com犃狆狆犾犻犮犪狋犻狅狀狅犳犽犪狉狔狅狋狔狆犻犮犮狅犿犫犻狀犲犱犮犺狉狅犿狅狊狅犿犪犾犿犻犮狉狅犪狉狉犪狔狊犻狀犳犲狋犪犾狌犾狋狉犪狊狅狌狀犱犪犫狀狅狉犿犪犾犻狋犻犲狊犔犻狌犑犻犪狀狕犺犲狀,犔犻狀犓犲狀犵,犡狌犅犻狇犻狌,犆犺犲狀犎狅狀犵狕犺犲狀 (犎狌犪犱狌犕犪狋犲狉狀犻狋狔犪狀犱犆犺犻犾犱犎犲犪犾狋犺犮犪狉犲犎狅狊狆犻狋犪犾,犌狌犪狀犵狕犺狅狌犌狌犪狀犵犱狅狀犵,510800,犆犺犻狀犪)【犃犫狊狋狉犪犮狋】 犗犫犼犲犮狋犻狏犲 Toexploretheapplicationofkaryotypiccombinedchromosomalmicroarrays(CMA)infetalultrasoundabnormalities.犕犲狋犺狅犱狊 AnalyzedthekaryotypingandCMAresultsof220fetalultrasoundabnormalitiesvisitedinourhospitalfromJanuary2020toJune2022,andtheultrasoundconditionsweredividedintofivegroups:singlestructuralabnormalities,multiplestructuralabnormalities,structuralabnormalitiescombinedwithsoftindexabnormalities,singlesoftindexabnormalities,andmultiplesoftindexabnormalities,andthedetectionofchromosomalabnormalitiesineachgroupwasanalyzed.犚犲狊狌犾狋狊 ThedetectionratesofchromosomalabnormalitiesinultrasoundfetalabnormalitiesbykaryotypeanalysisandCMAwere8.18%(18/220)and11.36%(25/220),respectively,andtherewasnosignificantdifferenceinthedetectionrateofchromosomalabnormalitiesbetweenthetwotechniques(χ2=1.26,犘=0.26).Karyotypeanalysisdetected2additionalcasesofequilibriumtranslocation,6additionalcasesofcopynumbervariation(CNVs)and3additionalcasesofhomozygousregion(ROH)comparedwithCMAanalysis.Thedetectionratesofchromosomalabnormalitiesofsinglestructural32Copyright ©博看网. All Rights Reserved.·论著·《中国产前诊断杂志(电子版)》 2023年第15卷第2期abnormalities,multiplestructuralabnormalities,structuralabnormalitiescombinedwithsoftindexabnormalities,singlesoftindexabnormalities,andmultiplesoftindexabnormalitieswere11.11%(4/36),25.00%(2/8),16.67(2/12),10.26%(16/156)and50.00%(4/8),respectively.Thefetalchromosomalabnormalityrateofmultiplestructuralabnormalitieswashigherthanthatofsinglestructuralabnormalities,andthefetalchromosomalabnormalitiesofmultiplesoftindexabnormalitiesweresignificantlyhigherthanthatofsinglesoftindexabnormalities,andthedifferencewasstatisticallysignificant(χ2=11.23,犘=0.00).犆狅狀犮犾狌狊犻狅狀 Fetalultrasoundabnormalitiesarecloselyrelatedtochromosomalabnormalities,andtheriskoffetalchromosomalabnormalitiesincreaseswithmultipleultrasoundabnormalities.Karyotypeanalysiscaneffectivelydetectthebalancedtranslocationofchromosomes,andCMAhashighefficiencyinthedetectionofCNVsandROH.Thecombinationofthetwocanimprovethedetectionrateofchromosomalabnormalitiesinfetalultrasoundabnormalities,identifythesourceandnatureofpathogenicfragments,andvalidatetheabnormalresults.【犓犲狔狑狅狉犱狊】 Fetalultrasoundabnormalities;Karyotypeanalysis;Chromosomemicroarrayanalysis 超声异常包括结构异常和软指标异常,胎儿超声异常与染色体异常密切相关[1]。
染色体CMA检测意义现代医学科学取得了巨大进步,不仅能够满足人们对检测和诊断婴儿早期可能患有遗传病的需求,而且能够以最佳效果帮助婴儿出生前检查计划。
染色体CMA(染色体细胞检测分析)是最新出现的、广泛应用于婴儿早期检测的技术,其可以大大提高对早期可能患有遗传病的婴儿的检测准确性和灵敏度。
一、染色体CMA检测的概念染色体CMA检测是最新出现的准确高效的婴儿健康检测技术,其基于染色体细胞学分析原理。
染色体CMA技术来源于染色体细胞学分析,它是一种动态的、从核细胞中检测遗传性变异的技术。
它可以被用于检测婴儿可能患上的几百种遗传病。
染色体CMA检测通过检查染色体变异,可以更快、更准确地诊断出婴儿患有遗传病的可能性,从而更好地帮助婴儿生长发育。
二、染色体CMA检测的技术原理染色体CMA检测是一种技术,可以检测出染色体变化。
在此技术中,检测出来的染色体变化能够指示出婴儿是否患有或有可能患有某种遗传性疾病。
因此,要想知道婴儿是否患有遗传性疾病,首先需要进行染色体CMA检测。
染色体CMA检测的步骤包括从胎儿液滴中取样、制备培养基、设立着色技术、读取染色体变异的截面、确定变异的本性、确定变异的位置等多个步骤。
在染色体CMA检测过程中,可以检测出与几百种遗传性疾病相关的众多突变,从而发现婴儿可能患有的遗传病。
三、染色体CMA检测的重要意义染色体CMA检测是当今最先进的婴儿健康检测技术,一旦检测出集中染色体变化,即可诊断出婴儿患有或有可能患有某种遗传病。
因此,它大大提高了对婴儿健康的检测准确性和灵敏度。
同时,染色体CMA检测的准确度高于其他检测方法,检测出来的结果容易准确鉴别,因而是检测早期可能患有遗传病的最佳选择。
此外,染色体CMA检测还可以提供早期治疗,为婴儿健康保驾护航。
总之,染色体CMA检测是一种有效的技术,早期可以检测出婴儿可能患有遗传病的风险,从而可以给婴儿带来更多的健康状态。
它是一种安全、有效、准确的婴儿健康检查技术,必将提高婴儿的健康水平,促进婴儿的健康成长。
临床分子诊断的标准化摘要:临床实验室分子诊断涉及病原体核酸、人类基因和各种蛋白等大分子的测定, 在许多临床疾病的诊断方面, 有极为关键的作用。
在日常检验工作中应用标准物质, 分子诊断为遗传病诊断的重要手段,因其具有直接诊断性、高特异性、灵敏性、早期诊断性的特点,弥补了表型诊断的不足而被广泛应用。
遗传病的分子诊断是利用分子遗传学技术在DNA或RNA水平上对某一基因进行突变分析,从而对特定疾病进行诊断。
关键词:分子诊断;标准化;临床应用在临床应用中, 目前仍存在同一实验室不同检测批次间或不同实验室对同一标本检测间结果的差异, 这已成为时常困扰临床医师、患者以及实验室技术人员的普遍性问题。
此外, 这也是当前不同实验室间结果有条件互认的一个巨大障碍。
而造成不同临床实验室间检验结果差异的原因, 通常包括临床标本的采集、试剂方法、测定操作、仪器设备的维护校准、数据处理及结果报告、标准物质及质控物的应用等方面的不规范等因素。
然而, 仪器设备、试剂生产厂家和临床实验室本身在临床实验室分子诊断标准化中起着非常关键的作用。
一、临床实验室分子诊断标准化1、临床标本采集、运送和保存的标准化。
临床标本的采集、运送和保存对检验结果往往有决定性的影响, 而这些问题常涉及临床实验室与其他相关科室的工作分工与协作, 此点以前不太被关注或认为是难以控制的问题。
但为保证得到正确的检验结果,必须制定一个规范的临床标本采集、运送和保存的程序。
常用的临床标本通常有血清(浆)、全血、分泌物、组织、尿液、脑脊液及其他体液等。
对这些标本的采集、运送和保存的标准化主要是对标本采集的具体方法、所用容器、采集量、采集时所用材料和用具、运送方式和不同时间中标本保存条件等做出明确而又详尽的规定, 写成标准操作程序SOP;并对参与该程序运行的相关人员进行必要的培训, 及时与临床科室进行全面而有效的“对话”包括工作沟通、定期质量评价、纠错措施, 是保证所制定的程序得到确实执行的必不可少的环节。
·论著·《中国产前诊断杂志(电子版)》 2016年第8卷第2期生长受限胎儿染色体微阵列结果分析朱辉 林少宾 黄林环 何志明 黄轩 周 方群 罗艳敏(广州市中山大学附属第一医院妇产科胎儿医学中心,广东广州 510080)【摘要】 目的 探讨染色体微阵列分析(CMA)技术在胎儿生长受限(FGR)中的应用价值。
方法 选取2013年3月至2015年5月在中山大学附属第一医院胎儿医学中心以FGR为指征行产前诊断的95份病例进行回顾性分析,所有病例行传统染色体核型分析,68例行CMA检测。
结果 核型分析检测出8.42%(8/95)的异常,而CMA发现14.71%(10/68)的异常。
在核型正常的FGR中,CMA额外检出8.33%的异常。
CMA检测的异常包括2号染色体单亲二体和5q12.1、19p13.3p13.2和11p14.3等染色体微缺失/微重复。
相关基因包括PMP22、ERCC8和C3。
结论 CMA技术可以显著提高FGR遗传学病因的检出率。
【关键词】 胎儿生长受限;染色体微阵列分析技术;染色体核型分析【中图分类号】 R714.53 【文献标识码】 A犇犗犐:10.13470/j.cnki.cjpd.2016.02.004基金项目:中山大学青年教师培育项目(13ykpy18) 通讯作者:罗艳敏邮箱:luoyanm@mail.sysu.edu.cn【犃犫狊狋狉犪犮狋】 犗犫犼犲犮狋犻狏犲 Toevaluatethecontributionofchromosomalmicroarrayanalysis(CMA)intheprenataldiagnosisoffetalgrowthrestriction(FGR).犕犲狋犺狅犱 Ninety fiveFGRcasesbetweenMarch2013toMay2015wereretrospectivelyanalyzed.Allofcaseswereevaluatedbytraditionalkaryotypewhile68caseswereevaluatedbyCMA.犚犲狊狌犾狋狊 Chromosomalaberrationsweredetectedin8.42%ofthecases(8/95)bykaryotypeanalysis,whilein14.71%ofthecases(10/68)byCMA.Incaseswithnormalkar yotype,CMAidentifiedsignificantabnormalitiesin8.33%ofFGRcases.TheaberrationsdetectedbyCMAincludeuniparentaldisomy2,microdeletionsormicroduplicationsof5q12.1,19p13.3p13.2and11p14.3,containingPMP22,ERCC8andC3gene.犆狅狀犮犾狌狊犻狅狀狊 CMAisaneffectivemethodforthege neticdiagnosisofFGR.【犓犲狔狑狅狉犱狊】 fetalgrowthrestriction;chromosomalmicroarrayanalysis;karyotype. 胎儿生长受限(fetalgrowthrestriction,FGR)指胎儿受各种不利因素影响,未能达到其潜在所应有的生长速率。
染色体微阵列分析在胎儿唇腭裂畸形中的临床应用孟卓;熊礼宽;林小影;王辉林【摘要】Objective To discuss the clinical value of chromosomal microarray analysis(CMA)in the diagno-sis of fetal cleft lip and palate(CLP).Methods A total 21 CLP cases in Shenzhen Bao'an Maternal and Child Health-care Hospital from July 2014 to December 2016 were enrolled,in which 19 were diagnosed by prenatal ultrasound and 2 were missed by prenatal ultrasound.There were 12 non-syndromic cases and 9 syndromic cases.Among the patients,13 amniotic fluid samples,1 cord blood sample,2 fetal organic tissue samples and 5 venous blood samples were collected. Chromosome karyotype and CMA technology were used to detect and analyze the samples.Genome copy-number varia-tions(CNVs)were obtained,and the sensitivity of the two methods for detecting cleft lip and palate was compared.The differences in abnormal CNVs in different types of CLP patients were evaluated.Results CMA results showed 33.3% (7/21)of CNVs,and karyotype results showed 9.5%(2/21)of chromosomal abnormalities,with no statistically signifi-cant difference (P>0.05). Of the CMA results, the detection rate of CNVs in non-syndromic CLP was 25.0% (3/12), and the rate of CNVs in syndromic CLP was 44.4%(4/9),but the difference was not statistically significant(P>0.05). Conclusion Compared with the traditional karyotype analysis,CMA technique has slightly higher sensitivity for detec-tion of CLP,but Further studies are needed to confirm the value of CMA.%目的探讨染色体微阵列分析技术(CMA)在产前诊断胎儿唇腭裂畸形(CLP)中的临床应用价值.方法研究对象为2014年7月至2016年12月期间在深圳市宝安区妇幼保健院产前超声诊断的19例CLP胎儿和2例产前超声漏诊的单一腭裂患儿,其中12例单纯性CLP,9例综合征性CLP.21例样本中羊水13例,脐带血1例,引产胎儿组织2例,新生儿外周血5例.采用染色体核型技术和CMA 技术对样本进行检测,获得基因组拷贝数变异(CNVs),对比CMA技术和传统染色体核型技术对唇腭裂患者检出异常结果的敏感性,评估不同类型唇腭裂患者携带CNVs的差异.结果 CMA结果中33.3%(7/21)为CNVs,染色体核型结果中9.5%(2/21)为染色体异常,差异无统计学意义(P>0.05).CMA结果中单纯性CLP检出CNVs率为25.0%(3/12),综合征性CLP检出CNVs率为44.4% (4/9),差异无统计学意义(P>0.05).结论不管是综合征性的唇腭裂,还是单纯性的唇腭裂,使用CMA 技术进行分析均较传统染色体核型技术能提高异常检出率,但尚需进一步证实CMA 在产前超声诊断唇腭裂胎儿时的临床应用价值.【期刊名称】《海南医学》【年(卷),期】2018(029)003【总页数】3页(P336-338)【关键词】产前诊断;超声;胎儿;唇腭裂;染色体微阵列分析技术;基因组拷贝数变异【作者】孟卓;熊礼宽;林小影;王辉林【作者单位】深圳市宝安区妇幼保健院超声科,广东深圳518000;深圳市出生缺陷研究重点实验室,广东深圳518040;深圳市宝安区妇幼保健院中心实验室,广东深圳518000;深圳市宝安区妇幼保健院超声科,广东深圳518000;深圳市出生缺陷研究重点实验室,广东深圳518040;深圳市出生缺陷研究重点实验室,广东深圳518040;深圳市宝安区妇幼保健院中心实验室,广东深圳518000【正文语种】中文【中图分类】R714.53我国卫生部2012年发布的《中国出生缺陷防治报告》显示唇腭裂在先天性畸形中排位第三[1],我国为唇腭裂高发的国家。
孕妇31岁,丈夫39岁,孕2产1,平素月经规律,(5~6)/28 d,末次月经2017年8月30日。
2017年12月7日因外院“孕12+3周B 超提示胎儿颈后透明带厚度0.3 cm”转诊至解放军总医院第一医学中心,孕14+1周复查B 超提示胎儿颈部皱褶(nuchal fold,NF )厚度 0.48 cm,余未见明显异常;孕17+4周超声提示胎儿NF 厚度 0.76 cm,下颌骨短小,胎儿透明隔腔显示不清。
孕20周超声提示胎儿左侧侧脑室1.15 cm,NF 厚度 0.61 cm,透明隔及胼胝体可见;羊膜腔穿刺取羊水20 ml 进行细胞培养,经过胰蛋白酶消化、Giemsa 染色显带,行染色体核型分析未见异常;另取羊水10 ml,提取胎儿基因组DNA 行单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP array )检测亦未见染色体拷贝数异常。
孕22+6周超声提示胎儿左侧侧脑室增宽,宽约1.15 cm,胎儿NF 厚度 0.64 cm,孕妇和家属选择继续妊娠。
孕28周外院超声提示羊水指数33.5 cm,再次转至我院,孕31+4周超声提示胎儿双顶径9.37 cm,头围34.93 cm,左侧侧脑室1.02 cm,腹围30.07 cm,股骨长6.01 cm,羊水指数42.8 cm,脐动脉收缩压/舒张压(S/D )2.9~4.2,收入院。
考虑不除外单基因遗传病,建议取羊水行全外显子组测序,告知为科研性质,结果回报需时较长,可能无助于处理。
夫妻双方同意行核心家系全外显子组测序及可疑致病位点Sanger 测序验证:提取羊水及夫妻双方外周血基因组DNA,质检合格后进行文库制备。
采用IDT The xGen Exome Research Panel v1.0全外显子捕获芯片实现目标序列的靶向富集,进行文应用全外显子组测序产前诊断1例罕见的条纹状骨病伴颅骨硬化症 许伊云 张鑫悦 汪淑娟 谢潇潇 周红辉 游艳琴 卢彦平(解放军总医院第一医学中心 妇产科,北京 100853)·病例报告·DOI :10.3969/j.issn.2095-5340.2020.02.019基金项目:军队计生专项研究基金军队出生缺陷干预救助体系的研究(16JS010)通信作者:卢彦平(Email :***************)库构建,经Illumina NovaSeq 6000系列测序仪高通量测序,目标序列测序覆盖度≥99%。
染色体微阵列分析在胎儿右位主动脉弓中的临床应用郭珍;章春泉;阳彦;周欣;戴琳;肖晓娟;李欢【摘要】目的探讨染色体微阵列分析技术(CMA)在产前超声诊断胎儿右位主动脉弓(RAA)中的临床应用价值.方法研究近两年在江西省妇幼保健院产前超声诊断为RAA并分娩后确认者胎儿30例,30例样本中羊水23例,脐带血5例,引产胎儿组织2例.对样本分别进行传统染色体核型分析和CMA,并比较两种检测方法的检出率,评估不同类型RAA患者携带基因组拷贝数变异(CNVs)的差异.结果 30例胎儿RAA中(1)传统染色体核型分析共检出3例染色体核型异常标本(47,XX+21;45,X;47,XY+18),检出率为10%(3/30);(2)CMA共检出7例异常,检出率为23.3%(7/30),2例胎儿检测出22q.11.2微缺失(6.7%),2胎例儿检出其他具有临床意义的拷贝数变异(6p21.3微缺失9q31.2微缺失).CMA检测技术对RAA胎儿染色体异常的检出率比传统染色体核型分析检出率提高了13.3%,差异无统计学意义(χ2=1.92,P=0.166);(3)24例孤立性RAA检出拷贝数变异3例(12.5%);6例非孤立性RAA胎儿检出拷贝数异常4例(66.7%).非孤立性RAA的致病性CNVs 率高于孤立性RAA,差异有统计学意义(P=0.016).结论 CMA可以检测传统染色体核型分析无法检测的染色体异常,当产前超声提示胎儿RAA时,强烈建议进行胎儿核型分析和基因检测,该技术的临床应用对产前咨询以及产后风险评估有重要意义.【期刊名称】《实用医学杂志》【年(卷),期】2019(035)008【总页数】4页(P1278-1281)【关键词】产前诊断;胎儿;右位主动脉弓;染色体微阵列分析技术;拷贝数变异【作者】郭珍;章春泉;阳彦;周欣;戴琳;肖晓娟;李欢【作者单位】江西省妇幼保健院南昌330006;南昌大学第二附属医院南昌330000;江西省妇幼保健院南昌330006;江西省妇幼保健院南昌330006;江西省妇幼保健院南昌330006;江西省妇幼保健院南昌330006;江西省妇幼保健院南昌330006【正文语种】中文右位主动脉弓(right aortic arch,RAA)是胎儿主动脉弓异常中最常见的一种类型,指主动脉弓位于气管、食管的右侧,是胚胎时期配对主动脉弓异常退化形成的,占总妊娠的0.1%[1],占先天性心脏病的约1%~3%[2]。