生化工程实验室分子生物学操作规范

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生化工程实验室分子生物学操作规范
1. 手套使用
原则上不论什么实验都应带手套操作,特别是:
1)无菌操作;
2)与RNA有关的所有操作;
3)重要克隆菌的挑单克隆、扩增、保存等;
4)与有毒试剂有关的所有操作,比如用EB染胶,用有机溶剂提取(在通风橱内操作)。
2. 移液枪及枪头使用
1)在合适量程范围内使用;
2)移液枪定期校对;
3)枪头必须插紧,防止脱落以及吸样体积不够;
4)不要水平放置带有枪头的枪;
5)使用后挂在枪架上,不可以乱放;
6)装枪头时必须戴手套,灭菌后50-70℃烘干后使用;
7)加样体积应为枪头最大体积的20-100%,低于该范围的用小一号的枪头。
3. 加样
1)加用任何试剂前要将试剂混合(除饱和酚或一些特别的有机试剂);
2)加样的枪头应在试剂的中间表层吸收,防止枪头外壁带用过多试剂,改变加样试剂体积
(除饱和酚外,一定要伸到饱和酚液的下部吸取);
3)加酶时酶要放置在冰上,应注意体积准确,外壁不带,内壁吹打干净。注意用枪头从反
应体系的管底吸上,反复吹打。
4. 混匀
1)除上述特殊试剂外,所有试剂在使用前后都要充分混匀;多数分子操作在加样后、反应
前都要充分混匀;
2)0.2ml和0.5ml管30%体积以下可进行枪混匀和擦边混匀;
3)0.5-1.5ml管15-40%体积时,试管30%体积以下时可使用漩涡混匀器混匀;
4)0.5-1.5ml管30-70%体积,试管30-70%时可进行颠倒混匀。
5. 水浴锅
1)需提前10-30分钟调好温度,稳定后才能使用;
2)水位不可以低于水浴锅高度的50%,及时添水或换水;
3)使用合适的浮子;
4)使用完毕及时关闭电源。
6. 离心
1)离心如果需要预冷,应至少预冷15min;
2)要质量对称放置;
3)不合适的离心管应外套其他型号的离心管;
4)离心后如果要移动,应放在离心管架上移动,防止破坏液面;
5)短暂离心要在3000-8000rpm范围内,时间应短于30秒;
6)离心完毕应及时清理离心机。
7. 琼脂糖凝胶电泳
1)凝胶制作
配制凝胶的浓度据实验需要而变 ,一般在0.8% ~2.0%之间,如果一次配制凝胶
100 ml,没用完的凝胶可以再次融化,但随着融化次数的增加,水分丢失也越多,凝胶浓度
则会越来越高,导致实验结果不稳定,补水办法:一是在容器上标记煮胶前的刻度,煮胶后
补充相应的水分至原刻度;二是在煮胶前称重,煮胶后补充水至原重量。粗略一点的方法是
通过多次较恒定的煮胶条件得出一个经验补水值。
2)梳板的选用
一般每个制胶模具均配有多个齿型不同的梳板,梳齿宽厚,形成的点样孔容积较大,用
于DNA 片段回收实验等;相反,梳齿窄而薄,形成的点样孔容积就较小,用于PCR产物、
酶切产物鉴定等。梳板的选择主要是看上样量的多少而定,一般来说,上样量小时尽量选择
薄的梳板制胶,此时电泳条带致密清晰,便于结果分析。另外,每次制胶时都要注意梳齿与
底板的距离至少要1 mm,否则,拔梳板时易损坏凝胶孔底层,导致点样后样品渗漏。当然,
点样孔的破坏还与拔梳板的时间和方法有关,一般凝胶需冷却30 min以上方可拔梳板,应
急的情况下可以将成型的凝胶块放4℃ 冰箱中冷却15 min 左右,拔梳板的方法是将制胶槽
放置在电泳槽中的电泳缓冲液中,然后垂直向上慢慢用力,因为有液体的润滑作用,梳板易
拔出且不易损坏点样孔。
3)点样
点样需加上样缓冲液,因为上样缓冲液中加了甘油或蔗糖增加密度,使样品沉入孔底;
指示样品的迁移过程,上样缓冲液中一般加了两种指示剂,溴酚兰和二甲苯青(值得注意的
是指示剂并非染色剂,DNA染色剂是溴化乙锭,而且要在紫外光的激发下才能看见桔红色
荧光)。上样缓冲液储存液一般为6× (10×),表示其浓度为工作浓度的六倍。使用时上样缓
冲液应稀释到一倍浓度。点样方法是将移液器基本垂直点样孔,用另一只手帮助固定移液器
下端,移液器枪头尖端进入点样孔即可将样品注入孔内,千万不可将尖插至孔底,并点上适
合的DNA分子量标准,所谓适合是指样品DNA分子量大小应基本在DNA分子量标准范围
之内。
4)电泳
将电泳仪的正极与电泳槽的正极相连,负极与负极相连,核酸带负电荷,从负极向正极
移动。电泳槽中电泳缓冲液与制胶用电泳缓冲液应相同,电泳缓冲液刚好没过凝胶1 mm 为
好,电泳缓冲液太多则电流加大,凝胶发热。电泳时凝胶上所加电压一般不超过5 v/cm(指
的是正负电极之间的距离,而不是凝胶的长度),电泳时间一般为30-60 min,根据实验需要
也可作适当调整,电压增高,电泳时间缩短,核酸条带相对来说不够整齐,不够清晰;相反,
电压降低,电泳时间较长,核酸条带整齐清晰。另外,如果电泳后样品泳动很慢或者没泳动,
请检查胶模两端的封口胶条是否已去掉。
5)结果分析
较成功的电泳结果是分子量标准条带整齐清晰,样品条带也整齐清晰,如果条带模糊暗
淡,单从琼脂糖凝胶电泳角度来说,可能的原因:EB见光易分解,母液配制时间过长或保
存不当(一般4℃ 避光保存一年内有效),或者终浓度没达到0.5 ug/ml;电泳槽中缓冲液使用
次数过多,缓冲能力下降。特别是TAE缓冲液,一般用2-3次就要更换,TBE缓冲液则可
使用10次左右。另外,溴化乙锭(EB)是一种中等强度诱变剂,操作过程中要戴手套,并将
加有EB的染色液作好标记、妥善保存。实验室要严格区分污染区和非污染区,不要把污染
区的物品拿到非污染区,碰过EB的手套要及时丢弃。