第13章虹彩病毒科(Iridoviridae)介绍
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真鲷虹彩病毒LAMP检测方法的建立袁向芬;石素婷;吕继洲;吴绍强【摘要】为建立一种检测真鲷虹彩病毒的环介导等温扩增(LAMP)方法,满足口岸、养殖场对该病的快速监测的需求,本研究比对分析了GenBank中公布的真鲷虹彩病毒基因组序列,筛选其主要衣壳蛋白MCP基因保守区序列,进行LAMP引物设计,建立了真鲷虹彩病毒LAMP检测方法.对扩增条件进行优化,确定最佳反应条件为62℃,45 min.灵敏度试验结果显示,该方法最低检测限为100拷贝/μL目的基因.特异性试验结果显示,该方法不与流行性造血器官坏死病毒(EHNV)、蛙病毒3型(FV3)、甲鱼虹彩病毒(STIV)发生交叉反应.结果表明,本研究建立的LAMP方法具有良好的敏感性和特异性.对5份疑似真鲷虹彩病毒感染的临床样品进行检测,发现检测结果与世界动物卫生组织(OIE)推荐的PCR方法检测结果符合率为100%.研究表明,本方法具有灵敏度高、特异性强,以及仪器设备简单、操作便捷、结果直观等优点,非常适合作为初筛手段,应用于养殖场、口岸等一线的疫病监测.【期刊名称】《中国动物检疫》【年(卷),期】2018(035)001【总页数】5页(P95-99)【关键词】水生动物疫病;真鲷虹彩病毒;环介导等温扩增;快速检测【作者】袁向芬;石素婷;吕继洲;吴绍强【作者单位】中国检验检疫科学研究院动物检疫研究所,北京 100176;中国检验检疫科学研究院动物检疫研究所,北京 100176;中国检验检疫科学研究院动物检疫研究所,北京 100176;中国检验检疫科学研究院动物检疫研究所,北京 100176【正文语种】中文【中图分类】S852.65真鲷虹彩病毒(Red sea bream iridovirus,RSIV)属于虹彩病毒科(Iridoviridae)、细胞肿大病毒属(Megalocytivirus)[1-2]。
该病毒于1990年首次在日本四国岛的人工养殖患病真鲷中被发现[3],主要感染真鲷、花鲈、条石鲷等30余种海水鱼类[4-5]。
第十三章虹彩病毒科(Iridoviridae)一、概述二、虹彩病毒属三、绿虹彩病毒属四、蛙病毒属五、淋巴囊肿病毒属六、“类金鱼1型病毒属”主要参考文献一、概述同义名:二十面体胞浆型脱氧核糖核酸病毒群(Icosahedral cytoplasmic deoxyriboviruses)。
虹彩病毒科包括许多从昆虫和其它一些动物分离的胞浆型 DNA 病毒。
最早发现的虹彩病毒是1954年Xeros在英国剑桥从沼泽大蚊体内分离到的,以后又分别从金龟甲、带喙伊蚊及蛙和鱼中分离出多种虹彩病毒,由于虹彩病毒在感染的昆虫幼虫体内或在纯化浓缩的病毒沉淀物中,病毒粒子呈周期性间隔的异常整齐排列,形成晶格平面并互相重叠,当有斜射光线照射时呈现蓝色或紫色虹彩,故名虹彩病毒(Iridos希腊字,意指希腊神话中为诸神报信的虹彩女神)。
虹彩病毒比较复杂,最初多从昆虫体中分离获得,但是以后陆续地从许多其它动物如爬行动物、鱼类、软体动物、原虫、乃至藻类和植物体内分离到了虹彩病毒。
其中多数虹彩病毒是非致病性的,但有些虹彩病毒可引起鱼类、蛙等动物的疾病,危害比较大,也有些虹彩病毒被人类用来在农业生产上防治病虫害。
如二化螟虹彩病毒(CIV)可以感染黑尾叶蝉(Nephtotottix cincticeps),并可使深山叶蝉(Colladonus montanus) 发生致死感染,而后者正是传播核果支原体病的传染媒介,从而可防治本病。
近几年来对虹彩病毒的研究逐渐增多,不仅从各类动物、植物中分离出了多种属于虹彩病毒科的病毒,而且对虹彩病毒的形态结构特点,特别是虹彩病毒的分子生物学特性进行了细致的研究,同时在虹彩病毒的分类学方面也取得了很大的进展。
根据国际病毒分类委员会(ICTV)的第六次报告,虹彩病毒科(Iridoviridae)下设五个属:即虹彩病毒属(Iridovirus),绿虹彩病毒属(Chloriridovirus),蛙病毒属(Ranavirus),淋巴囊肿病毒属(Lymphocystivirus)和“类金鱼1型病毒属”(“Goldfish virus 1 like viruses”)。
收稿日期:2003206211;修订日期:2003207217基金项目:国家自然科学基金(30170726);“863”项目(2001AA626030);中国科学院方向性创新项目(220313)资助作者简介:萧 枫(1977—),女,硕士,现主要从事水生动物病毒学的研究通讯作者:张奇亚,zhangqy @综 述水生动物虹彩病毒的分子生物学萧 枫 张奇亚(中国科学院水生生物研究所;淡水生态与生物技术国家重点实验室,武汉 430072)MOLECU LAR BIOLOG Y OF IRI DOVIRUSES FR OM AQUATIC ANIMA LSXIAO Feng and ZH ANG Qi 2Y a(Institute o f Hydrobiology ,The Chinese Academy o f Sciences ,State K ey Laboratory o f Freshwater E cology and Biotechnology Wuhan 430072)关键词:水生动物;虹彩病毒;分子生物学K ey w ords :Aquatic animals ;Iridovirus ;M olecular biology中图分类号:S941141 文献标识码:A 文章编号:100023207(2004)022202205 近年来在世界范围出现的由虹彩病毒感染引起的水生动物高发病率和高死亡率现象给水产业造成了重大经济损失,引起了病毒学家们的热切关注[1,2]。
根据ICT V 第七次报告,虹彩病毒科(Iridoviridae )分为4个属,包括感染脊椎动物的蛙病毒属(Ranavirus )和淋巴囊肿病毒属(Lym phocystivirus ),以及感染无脊椎动物的虹彩病毒属(Iridovirus )和绿虹彩病毒属(Chlo 2riridovirus )[3]。
已见报道的水生动物虹彩病毒中,有来源于鱼类的传染性造血器官坏死病毒(E piz ootic hematopoietic necrosis virus ,EH NV )、真鲷虹彩病毒(Red sea bream irid ovirus ,RSI V )、非洲鱼虹彩病毒(A frican lam peye irid ovirus ,A LI V )、虹鳟鱼病毒(Rainb ow trout virus ,RT V )、欧鲇病毒(European sheatfish virus ,ES V )、欧洲鲶鱼病毒(European catfish virus ,EC V )、大口鲈鱼病毒(Largem outh bass virus ,LM BV )、黄鲶虹彩病毒(G rouper irid ovirus ,G I V );也有来源于两栖类的饰纹汀蛙虹彩病毒(Bohle iridovirus ,BI V )、蛙虹彩病毒(Rana grylio virus ,RG V )、虎纹蛙病毒(T iger frog virus ,TFV );以及来源于爬行类的T V3(Box turtle 3)和T V5(T ortoise virus 5)等。
病毒分类学目录第二编脊椎动物病毒第3章脊椎动物DNA病毒一、痘病毒科(Poxviridae)脊椎动物痘病毒亚科(Chordopoxvirinae)二、非洲猪瘟病毒科(Asfarviridae)三、虹彩病毒科(iridoviridae)脊椎动物病毒成员四、疱疹病毒科(Herpesviridae)五、腺病毒科(Adenoviridae)六、乳头瘤状病毒科(Papovaviridae)七、多瘤病毒科(Polyomaviridae)八、细小病毒科(Parvoviridae)细小病毒亚科九、圆环病毒科(Circovirudae)十、指环病毒属(Anellovirus)第4章脊椎动物反转录病毒一、嗜肝DNA病毒科(Hepadnaviridae)二、反转录病毒科(Retroviridae)第5章脊椎动物双链RNA病毒一、呼肠孤病毒科(Reoviridae)二、双节段RNA病毒科(Birmaviridae)脊椎动物病毒成员第6章脊椎动物负链RNA病毒一、单分子负链RNA病毒目副黏病毒科(Paramyxoviridae)二、单分子负链RNA病毒目丝状病毒科(Filoviridae)三、单分子负链RNA病毒目弹状病毒科(Rhabdoviridae)四、单分子负链RNA病毒目博尔纳病毒科(Bornaviridae)五、正黏病毒科(Orthomyxoviridae)六、布尼亚病毒科(Bunyaviridae)七、沙粒病毒科(Arenaviridae)八、丁型肝炎病毒属(Deltavirus)第7章脊椎动物正链RNA病毒一、披膜病毒科(Togaviridae)二、黄病毒科(Flaviviridae)三、成套病毒目冠状病毒科(Coronaviridae)四、成套病毒目动脉炎病毒科(Arteriviridae)五、杯状病毒科(Caliciviridae)六、微RNA病毒科(Picomaviridae)七、星状病毒科(Astroviridae)八、野田村病毒科(Nodaviridae)乙型野田村病毒属(Betanodavirus)九、戍型肝炎病毒属(Hepatitis E virus)第三编昆虫和其他无脊椎动物病毒第8章昆虫DNA病毒一、杆状病毒科(Baculovilidae)二、多分体DNA病毒科(Polydnaviridae)三、痘病毒科昆虫痘病毒亚科(Entomopoxvirinae)四、泡囊病毒科(Ascoviridae)五、虹彩病毒科(Iridoviridae)昆虫虹彩病毒六、细小病毒科(Parvovirdea)浓核症病毒亚科(Densovirinae)第9章昆虫DNA和RNA反转录病毒一、变位病毒科(Metaviridae)昆虫病毒成员二、前病毒科半病毒属(Hemivirus)第10章昆虫RNA病毒一、呼肠孤病毒科(Reoviridae)昆虫病毒成员二、双节段RNA病毒科(Birnaviridae)昆虫病毒成员三、双顺反子病毒科(Dicistroviridae)四、野田村病毒科(Nodavridae)甲型野田村病毒属五、四体病毒科(Tetraviridae)六、传染性软腐病病毒属(Iflavirus)第11章甲壳动物和其他无脊椎动物病毒一、线头病毒科(Nimaviridae)二、杆状套病毒科(Roniviridae)三、其他甲壳动物病毒(Other Crustacea viruses)四、其他无脊椎动物病毒(Other Inwertebrate viruses)第四编植物病毒第12章植物DNA病毒和反转录病毒一、双生病毒科(Geminiviridae)二、矮缩病毒科(Nanoviridae)三、花椰菜花叶病毒科(Caulimoviridae)四、前病毒科(Psedoviridae)植物病毒成员五、变位病毒科(Metaviridae)植物病毒成员第13章植物双链RNA病毒一、呼肠孤病毒科(Reoviridae)植物病毒成员二、双组分RNA病毒科(Partitiviridae)植物病毒成员三、内源RNA病毒属(Endomavirus)第14章植物负链RNA病毒一、弹状病毒科(Rhabdoviridae)植物病毒成员二、布尼亚病毒科(Bunyaviridae)植物病毒成员三、蛇形病毒属(Ophiovirus)四、纤细病毒属(Tenuivirus)五、巨脉病毒属(Varicosavirus)第15章植物正链RNA病毒一、伴生病毒科(Sequiviridae)二、豇豆花叶病毒科(Comoviridae)三、马铃薯Y病毒科(Potyviridae)四、番茄丛矮病毒科(Tombusviridae)五、黄症病毒科(Luteoviridae)六、雀麦花叶病毒科(Bromoviridae)七、长线形病毒科(Closteroviridae)八、芜菁黄花叶病毒科(Tymowviridae)九、线形病毒科(Flexiviridae)十、烟草花叶病毒属(Tobamovirus)十一、烟草脆裂病毒属(Tobravirus)十二、大麦病毒属(H0rdeivirus)十三、真菌传杆状病毒属(Furovirus)十四、马铃薯帚顶病毒属(Pomovirus)十五、花生丛簇病毒属(Pecluvirus)十六、甜菜坏死黄脉病毒属(Benyvirus)十七、南方菜豆花叶病毒属(Sobemovirus)十八、欧尔密病毒属(Ourmlavirus)十九、悬钩子病毒属(Idaeovirus)二十、伞形病毒属(Umbravirus)二十一、温州蜜柑矮缩病毒属(Sadwavirus)二十二、樱桃锉叶病毒属(Cheravirus)第五编原核生掬、寅菌、原生动物和藻类病毒第16章单链DNA噬菌体一、丝杆状噬菌体科(Inoviridae)二、微小噬茵体科(Microviridae)第17章双链DNA噬菌体一、有尾噬菌体目(Caudovirales)肌尾噬菌体科(Myoviridae)二、有尾噬菌体目(Caudovirales)长尾噬菌体科(Siphoviridae)三、有尾噬菌体目(Caudovirales)短尾噬菌体科(Podoviridae)四、复层噬菌体科(Tectiviridae)五、覆盖噬菌体科(Cotticoviridae)六、芽生噬菌体科(Plasmayfridae)七、脂毛噬菌体科(Lipothrixviridae)八、小纺锤形噬菌体科(Fuselloviridae)九、小杆状噬菌体科(Rudiviridae)十、微滴形噬菌体科(Guttaviridae)十一、盐末端蛋白噬菌体属(Salterprovirus)第18章RNA噬菌体一、囊状噬菌体科(Cystovitidae)二、光滑噬菌体科(Leviviridae)第19章真菌和原生动物病毒一、单组分RNA病毒科(Totiviridae)二、双组分RNA病毒科(Partiviridae)三、产黄青霉病毒科(Chrysoviridae)四、低毒病毒科(fypoviridae)真菌病毒成员五、杆状RNA病毒科(Bamaviridae)六、裸露RNA病毒科(Namaviridae)七、根前毛菌病毒属(Rhizidiovirus)八、变位病毒科(Metaviridae)变位病毒属(Metavirus)九、前病毒科(Pseudoviridae)真菌病毒十、呼肠孤病毒科(Reoviridae)真菌病毒成员十一、拟态病毒属(Mimivirus)第20章藻类病毒一、藻类DNA病毒科(Phycodnaviridae)二、海洋RNA病毒科(Mamaviridae)三、前病毒科(Pseudoviridae)藻类病毒成员第六编类病毒、卫星体和朊病毒第21章类病毒一、马铃薯纺锤形块茎类病毒科(Pospiviroidae)二、鳄梨日斑类病毒科(Avsunviroidae)第22章卫星体和朊病毒一、卫星体(satellites)二、朊病毒(prion)。
桂花鱼(鳜鱼)病毒流行特性及防治和治疗汇报人:日期:•桂花鱼(鳜鱼)病毒流行特性•桂花鱼(鳜鱼)病毒防治方法•桂花鱼(鳜鱼)病毒治疗现状及研目录究进展•桂花鱼(鳜鱼)病毒对渔业的影响及应对策略•结论与展望01桂花鱼(鳜鱼)病毒流行特性鳜鱼病毒1型(Sheephead Minnow Virus,简称SMV)是鳜鱼养殖中的主要病毒之一,分布于全球多个水域。
SMV属于虹彩病毒科(Iridoviridae),在鳜鱼的不同生长阶段均可感染,并可跨物种传播给其他鱼类。
病毒种类与分布鳜鱼养殖环境中的病毒数量和种类增加,通过水体传播给健康鱼。
水质污染直接接触虫媒传播健康鱼与病鱼或带毒鱼接触后,病毒通过皮肤、鳃等部位传播。
一些水生昆虫如水蚤等可能携带病毒,通过叮咬健康鱼进行传播。
03病毒传播途径0201鳜鱼免疫力下降长期处于不良环境条件下,如水质恶化、营养不良等,导致鳜鱼免疫力下降,容易感染SMV。
病毒毒力增强SMV的毒力随着环境条件的改变而增强,如高温、低氧等环境因素有利于病毒的复制和传播。
病毒致病因02桂花鱼(鳜鱼)病毒防治方法对苗种和成鱼进行严格的健康检查和隔离,防止病毒的传播。
严格检疫和隔离对养殖设施、工具、水源等进行消毒,切断病毒传播途径。
消毒措施选用健康的亲本进行繁殖,培育无病毒的苗种。
培育健康苗种降低养殖密度,提高水质,减少病毒的传播机会。
合理养殖密度预防措施治疗方法使用抗病毒药物、抗菌药物等进行治疗,防止继发感染。
药物治疗免疫增强剂中草药治疗综合治疗使用免疫增强剂提高桂花鱼的免疫力,增强其抵抗力。
使用具有抗病毒和抗菌作用的中草药进行治疗,如板蓝根、大青叶等。
结合药物治疗、免疫增强剂、中草药治疗等多种方法,提高治疗效果。
防疫政策与建议建立完善的疫情监测体系,及时发现和控制病毒传播。
加强疫情监测制定和执行规范的养殖管理制度,确保养殖环节的安全生产。
规范养殖管理加强科研机构和高校的合作,开展病毒研究、防治技术研究等,提高防治效果。
病毒分类表国际微生物学会联合会(International Union of Microbiological Societies,IUMS)病毒学组设立的国际病毒分类委员会(The International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)制定了《国际病毒分类与命名原则》(The International Code of Virus Classification and Nomenclature)。
病毒及类病毒的分类阶元(taxon)的规则简述如下:目:病毒的目以“-病毒目”(-virales)为词尾;科:病毒的科以“-病毒科”(-viridae)为词尾,类病毒的科以“-类病毒科”(-viroidae)为词尾;亚科:病毒的亚科以“-病毒亚科”(-virinae)为词尾;属:病毒的属以“-病毒属”(-virus)为词尾,类病毒的属以“-类病毒属”(-viroid)为词尾;种:病毒的种病毒分类不使用界、门、纲这几个阶层。
根据病毒的基因组组成及复制方式,病毒分为如下几类:•病毒(Viruses)o DNA病毒(DNA Viruses)▪第一组:双链DNA病毒(Group I:dsDNA Viruses)▪第二组:单链DNA病毒(Group II:ssDNA Viruses)o RNA病毒(RNA virus)▪第三组:双链RNA病毒(Group III:dsRNA Viruses)▪第四组:正链RNA病毒(Group IV:(+)ssRNA Viruses)▪第五组:负链RNA病毒(Group V:(-)ssRNA Viruses)o DNA与RNA逆转录病毒(DNA and RNA Reverse Transcribing Viruses)▪第六组:RNA逆转录病毒(GroupVI: RNA Reverse TranscribingViruses)▪第七组:DNA逆转录病毒(GroupVII: DNA Reverse TranscribingViruses)•亚病毒因子(Subviral Agents)o卫星(Satellites)o类病毒(Viroids)o朊毒体(Prions)也可以根据病毒的细胞生物宿主,分为“细菌病毒”、“真菌病毒”、“植物病毒”、“无脊椎动物病毒”、及“脊椎动物病毒”。
蛙病毒三重荧光PCR检测方法的建立李江宇;王树云;王姝;任彤;高志强;谷强;张伟;刘艳华;王娜【摘要】根据GenBank中收录的蛙病毒属虹彩病毒主要衣壳蛋白(MCP)基因序列设计了一对通用引物和3条Taqman探针,通过PCR反应体系的优化以及反应的特异性、灵敏性和干扰性试验,建立了一种可检测蛙病毒属大部分成员并能进行初步分类的三重荧光PCR方法.通过鉴定分析将蛙病毒属成员分为三类,其中第一类包括蛙病毒3型(FV3)、饰纹汀蛙虹彩病毒(BIV)、流行性造血器官坏死病毒(EHNV)、欧洲鮰鱼病毒(ECV)、欧鲶病毒(ESV)、中华鳖虹彩病毒(STIV)、大鲵虹彩病毒(ADIV)、沼泽绿牛蛙虹彩病毒(RGV)和虎纹蛙病毒(TFV),第二类是Santee-Cooper 蛙病毒(SCRV),由大口黑鲈虹彩病毒(LMBV)、裂唇鱼病毒(DFV)和孔雀鱼病毒(GV6)组成,而新加坡石斑鱼虹彩病毒(SGIV)则单独作为第三类.进一步分析发现各病毒的最低检测量均达到102拷贝,表明该方法除了具有良好的特异性和稳定性之外还具有高度灵敏性.建立的该蛙病毒三重荧光PCR方法可为蛙病毒的快速诊断和分子流行病学调查提供一种有效的技术手段.【期刊名称】《高技术通讯》【年(卷),期】2015(025)007【总页数】7页(P746-752)【关键词】蛙病毒;虹彩病毒;主要衣壳蛋白(MCP)基因;三重荧光PCR;Taqman探针【作者】李江宇;王树云;王姝;任彤;高志强;谷强;张伟;刘艳华;王娜【作者单位】北京出入境检验检疫局检验检疫技术中心北京 10113;北京出入境检验检疫局检验检疫技术中心北京 10113;北京市水产技术推广站北京 100021;北京出入境检验检疫局检验检疫技术中心北京 10113;北京出入境检验检疫局检验检疫技术中心北京 10113;北京出入境检验检疫局检验检疫技术中心北京 10113;北京出入境检验检疫局检验检疫技术中心北京 10113;北京出入境检验检疫局检验检疫技术中心北京 10113;中国检验检疫科学研究院北京 100176【正文语种】中文①国家科技支撑计划(2013BAD12B02)资助项目。
第十三章虹彩病毒科(Iridoviridae)一、概述二、虹彩病毒属三、绿虹彩病毒属四、蛙病毒属五、淋巴囊肿病毒属六、“类金鱼1型病毒属”主要参考文献一、概述同义名:二十面体胞浆型脱氧核糖核酸病毒群(Icosahedral cytoplasmic deoxyriboviruses)。
虹彩病毒科包括许多从昆虫和其它一些动物分离的胞浆型 DNA 病毒。
最早发现的虹彩病毒是1954年Xeros在英国剑桥从沼泽大蚊体内分离到的,以后又分别从金龟甲、带喙伊蚊及蛙和鱼中分离出多种虹彩病毒,由于虹彩病毒在感染的昆虫幼虫体内或在纯化浓缩的病毒沉淀物中,病毒粒子呈周期性间隔的异常整齐排列,形成晶格平面并互相重叠,当有斜射光线照射时呈现蓝色或紫色虹彩,故名虹彩病毒(Iridos希腊字,意指希腊神话中为诸神报信的虹彩女神)。
虹彩病毒比较复杂,最初多从昆虫体中分离获得,但是以后陆续地从许多其它动物如爬行动物、鱼类、软体动物、原虫、乃至藻类和植物体内分离到了虹彩病毒。
其中多数虹彩病毒是非致病性的,但有些虹彩病毒可引起鱼类、蛙等动物的疾病,危害比较大,也有些虹彩病毒被人类用来在农业生产上防治病虫害。
如二化螟虹彩病毒(CIV)可以感染黑尾叶蝉(Nephtotottix cincticeps),并可使深山叶蝉(Colladonus montanus) 发生致死感染,而后者正是传播核果支原体病的传染媒介,从而可防治本病。
近几年来对虹彩病毒的研究逐渐增多,不仅从各类动物、植物中分离出了多种属于虹彩病毒科的病毒,而且对虹彩病毒的形态结构特点,特别是虹彩病毒的分子生物学特性进行了细致的研究,同时在虹彩病毒的分类学方面也取得了很大的进展。
根据国际病毒分类委员会(ICTV)的第六次报告,虹彩病毒科(Iridoviridae)下设五个属:即虹彩病毒属(Iridovirus),绿虹彩病毒属(Chloriridovirus),蛙病毒属(Ranavirus),淋巴囊肿病毒属(Lymphocystivirus)和“类金鱼1型病毒属”(“Goldfish virus 1 like viruses”)。
养殖银鲳虹彩病毒感染的组织病理学分析及分子检测许跃,钱冬,周素明*,王亚军,尹飞,金珊,詹萍萍(宁波大学海洋学院,生物技术教育部重点实验室,浙江宁波 315211)摘要:2018年7月,宁波象山某养殖场内银鲳出现集中死亡现象,累积死亡率高达80%以上,为探究此次疾病暴发的原因,本研究通过对患病银鲳进行组织病理学分析、透射电镜观察、病原的分子生物学检测及分析来对其病原进行鉴定,以便制定合理的防控措施。
患病银鲳临床表现为厌食、身体失衡、脾脏肿大、肝脏颜色异常等病征。
组织病理学观察发现,患病银鲳肝脏、脾脏和肾脏均出现直径10~15 μm、细胞质嗜碱性的肿大细胞。
进一步的透射电镜观察则在脾脏、肾脏等组织细胞内发现了病毒包涵体结构以及大量的病毒粒子,直径为140~160 nm。
通过虹彩病毒特异性PCR检测发现,患病组织样品为虹彩病毒阳性。
此外,通过病毒主要衣壳蛋白基因(MCP)序列分析,发现银鲳源病毒与大黄鱼虹彩病毒(GenBank 登录号:AY779031.1)MCP同源性最高为99.76%,认为此分离病毒属于虹彩病毒科、肿大细胞病毒属、真鲷虹彩病毒(Red sea bream iridovirus, RSIV)类群。
本实验首次报道了全人工养殖环境下银鲳感染虹彩病毒的病例,该研究将为养殖银鲳虹彩病毒病的诊断和防治提供重要的参考依据。
关键词: 银鲳;养殖;肿大细胞病毒;虹彩病毒;分子诊断中图分类号: S 941.41文献标志码: A银鲳(Pampus argenteus)属鲈形目(Perciformes)、鲳科(Stromateidae)、鲳属(Pampus),在我国主要分布于东海、南海和黄、渤海等地区[1]。
由于银鲳肉质细腻、营养丰富、味道鲜美而深受消费者喜爱,其市场需求量逐年增大,但由于市场供给全部依赖捕捞,导致银鲳的市场价格逐年攀升。
最近几年,国内银鲳的全人工养殖在宁波地区取得成功[2]。
目前,有关养殖银鲳的研究主要集中在生殖生理、饲料研发及对环境的适应性等方面[3-7],在疾病方面的研究极少。
昆虫病毒及其应用全世界从1100多种昆虫中发现了1670多种昆虫病毒。
我国已从7个目35科196种昆虫中分离到243株昆虫病原病毒。
目前进入大田推广或示范阶段的病毒杀虫子剂约20种,棉铃虫核型多角体病毒杀虫剂是我国第一个商品化且登记注册的病毒杀虫剂。
斜纹夜蛾NPV、黄地老虎GV杀虫剂及菜青虫GV杀虫剂等昆虫病毒杀虫剂均已注册,并有一定应用面积。
昆虫病毒的研究历史:昆虫病毒病的研究由来已久,最初是对家蚕和蜜蜂疾病的研究开始的,家蚕的高节病、脚肿病,目的是如何控制昆虫的病毒病。
我国70年代开始,(中国农科院武汉病毒研究所)开始研究用昆虫病毒来防治农、林害虫。
病毒防治害虫成功例子:欧洲云杉叶蜂在加拿大东部和美国东北部,曾猖獗一时,导致云杉林木的巨大损失。
一种该虫的核型多角体病毒随着昆虫天敌从欧洲引入加拿大,迅速传播,形成流行,有效地控制了这种叶蜂的危害。
昆虫病毒施于田间后,在一定的自然条件下,能起到长期控制害虫的作用,逐渐受到重视。
一、昆虫病毒的类群1.昆虫病毒的一般构造在了解植物病毒的基础上:蛋白质和核酸(多数是RNA)。
病毒是一类没有细胞构造的生物体,其主要组成是核酸和蛋白质。
病毒个体称为病毒粒子,由两部分构成:中央是核心,成分为核酸;外层是被壳,成分是蛋白质。
病毒粒子的形状有的为杆状,有的为近球形。
昆虫病毒与植物病毒的不同:多数昆虫病毒有包涵体。
病毒粒子被包封在由蛋白质组成的包涵体内,称为包涵体病毒(watermelon)。
包涵体的形状有:多角体、颗粒状,在寄主脂肪、肠壁、真皮、肌肉以及其它组织细胞的核或细胞质里增殖。
包涵体的大小以微米计算,在光学显微镜下可见,但颗粒体病毒刚刚能被观察到。
病毒粒子只有在电子显微镜下才能看到。
没有包涵体的称为无包涵体病毒。
核酸:一种病毒只含有一种核酸,RNA或DNA,核酸有单股和双股之分。
动物病毒中RNA病毒以单股多,DNA病毒以双股多。
(大多数植物病毒为单股的RNA病毒)。
附录 3 关于病毒的分类(注:每科下的模式图见《微生物学:原理与探索》中译本)病毒的分类与细菌分类法一样,经历了很大的变化。
由于缺乏病毒繁殖及其分子生物学方面的数据,大多数病毒没有被分类。
全世界实验室和保藏中心估计有超过30000种病毒。
本附录是根据《Microbiology: Principles and Explorations, 6th Edition 》(ISBN: 0-471-42084-0,©2005)给出的信息。
这里列出的21科病毒主要是感染脊椎动物的病毒。
仅占国际病毒分类学委员会第六次报告《病毒分类法》(Virus Taxonomy——Sixth Report of the international Committee on Taxonomy of Viruses(F.A. Murphy, et .al. [eds.],1995,New Y ork: Springer-V erlag Wien)中提到的71科,3000多种病毒的一小部分。
1.科:小核糖核酸病毒科(Picornaviridae)属:肠道病毒属(Enterovirus)(胃肠病毒,脊髓灰质炎病毒,柯萨基病毒A组和B组,埃可病毒)肝病毒属(Hepatovirus)(甲型肝炎病毒)心病毒属(Cardiovirus)(老鼠和其它啮齿动物类的脑心肌炎病毒)鼻病毒属(Rhinovirus)(上呼吸道感染病毒,普通感冒病毒)口蹄疫病毒属(Aphthovirus)(口蹄疫病毒)无被膜,多面体,正链的ssRNA。
其合成及成熟在宿主细胞的细胞质中进行。
通过细胞裂解释放病毒。
2.科:嵌环样(杯状)病毒科(Caliciviridae)属:杯状病毒属(Calicivirus)(诺瓦克病毒及引起肠胃炎的类似病毒,戊型肝炎)无被膜,多面体,正链的ssRNA。
其合成及成熟在宿主细胞的细胞质中进行。
通过细胞裂解释放病毒。
3.科:披膜病毒科(T ogaviridae)属:甲病毒属(Alphavirus)(东部、西部、和委内瑞拉马脑炎病毒,塞姆利基森林病毒)风疹病毒属(Rubivirus)(风疹病毒)动脉炎病毒属(Arterivirus)(马传染性动脉炎病毒,猴出血热病毒)有被膜,多面体,正链ssRNA。
石斑鱼虹彩病毒SGIV感染致病的细胞分子基础及免疫防控对策秦启伟;黄晓红【摘要】虹彩病毒(Iridovirus)是目前海水和淡水养殖鱼类最严重的病毒性病原之一,已从100多种鱼类中分离鉴定出该病毒.石斑鱼虹彩病毒(Singapore grouper iridovirus,SGIV)是从新加坡养殖的患病石斑鱼中分离鉴定的高致病性虹彩病毒,是虹彩病毒科Iridoviridae蛙病毒属Iridovirus 1种新的病毒.本文从以下几个方面对SGIV的研究进行综述:SGIV的形态、超微结构及其在石斑鱼细胞中的复制和装配过程;SGIV病毒基因组、转录组、囊膜蛋白质组及miRNAs的解析;SGIV感染宿主靶标组织的鉴定;病毒侵染的入侵方式、运动轨迹和胞内运输的实时追踪;SGIV 感染宿主引起类凋亡的死亡机制及介导的信号通路的揭示;多种宿主免疫抗病基因对病毒感染的调节作用;多种SGIV的检测技术,包括基于抗体的流式细胞技术、微流控芯片检测技术、环介导等温扩增技术及核酸适配体检测方法等;SGIV的灭活疫苗、亚单位疫苗和DNA疫苗的研制等.以期为深入阐明SGIV感染致病机理奠定坚实的理论基础,为发展抗病毒对策提供技术支撑.【期刊名称】《华南农业大学学报》【年(卷),期】2019(040)005【总页数】13页(P78-90)【关键词】石斑鱼虹彩病毒;病原分子特征;病原-宿主互作;检测技术;免疫防控【作者】秦启伟;黄晓红【作者单位】华南农业大学海洋学院/教育部海洋生物资源保护与利用粤港澳联合实验室 (培育)/广东省水产免疫与健康养殖工程技术研究中心,广东广州 510642;华南农业大学海洋学院/教育部海洋生物资源保护与利用粤港澳联合实验室 (培育)/广东省水产免疫与健康养殖工程技术研究中心,广东广州 510642【正文语种】中文【中图分类】Q939.4;S965.334随着水产养殖品种的增多和养殖规模的扩大,各种传染性疾病不断暴发和流行,已成为制约水产养殖业健康可持续发展的主要瓶颈。
第十三章虹彩病毒科(Iridoviridae)一、概述二、虹彩病毒属三、绿虹彩病毒属四、蛙病毒属五、淋巴囊肿病毒属六、“类金鱼1型病毒属”主要参考文献一、概述同义名:二十面体胞浆型脱氧核糖核酸病毒群(Icosahedral cytoplasmic deoxyriboviruses)。
虹彩病毒科包括许多从昆虫和其它一些动物分离的胞浆型 DNA 病毒。
最早发现的虹彩病毒是1954年Xeros在英国剑桥从沼泽大蚊体内分离到的,以后又分别从金龟甲、带喙伊蚊及蛙和鱼中分离出多种虹彩病毒,由于虹彩病毒在感染的昆虫幼虫体内或在纯化浓缩的病毒沉淀物中,病毒粒子呈周期性间隔的异常整齐排列,形成晶格平面并互相重叠,当有斜射光线照射时呈现蓝色或紫色虹彩,故名虹彩病毒(Iridos希腊字,意指希腊神话中为诸神报信的虹彩女神)。
虹彩病毒比较复杂,最初多从昆虫体中分离获得,但是以后陆续地从许多其它动物如爬行动物、鱼类、软体动物、原虫、乃至藻类和植物体内分离到了虹彩病毒。
其中多数虹彩病毒是非致病性的,但有些虹彩病毒可引起鱼类、蛙等动物的疾病,危害比较大,也有些虹彩病毒被人类用来在农业生产上防治病虫害。
如二化螟虹彩病毒(CIV)可以感染黑尾叶蝉(Nephtotottix cincticeps),并可使深山叶蝉(Colladonus montanus) 发生致死感染,而后者正是传播核果支原体病的传染媒介,从而可防治本病。
近几年来对虹彩病毒的研究逐渐增多,不仅从各类动物、植物中分离出了多种属于虹彩病毒科的病毒,而且对虹彩病毒的形态结构特点,特别是虹彩病毒的分子生物学特性进行了细致的研究,同时在虹彩病毒的分类学方面也取得了很大的进展。
根据国际病毒分类委员会(ICTV)的第六次报告,虹彩病毒科(Iridoviridae)下设五个属:即虹彩病毒属(Iridovirus),绿虹彩病毒属(Chloriridovirus),蛙病毒属(Ranavirus),淋巴囊肿病毒属(Lymphocystivirus)和“类金鱼1型病毒属”(“Goldfish virus 1 like viruses”)。
非洲猪瘟病毒原来也属于虹彩病毒科,后因发现其DNA结构和复制方式明显不同于其他虹彩病毒,故已由虹彩病毒科中分离出去,列为未分类的病毒。
虹彩病毒的病毒粒子较大,病毒粒子直径为125~300nm。
结构比较复杂,它具有致密的不规则的中央核心体,即含有双链DNA的病毒核心体。
昆虫虹彩病毒没有囊膜,脊椎动物的虹彩病毒有囊膜,但同一样品的病毒粒子可具有一或两层环绕的膜。
病毒的球状核蛋白核心被富含脂质的结构蛋白亚单位组成的膜所包围,某些病毒的病毒粒子成熟后再获得一个来自胞浆膜的囊膜。
该囊膜可以增强病毒的感染性,但它对病毒增殖并不是必需的。
囊膜内为一个二十面立体对称的衣壳,衣壳由多达1 892或2 172个壳粒组成。
虹彩病毒粒子的分子量为500~2 000×10 6 Da,S20W=1 300~4 450,CsCl2中的浮密度为135g~160g/cm3。
虹彩病毒属和绿虹彩病毒属的成员因没有含脂质的囊膜而对乙醚有抵抗力,而其它属病毒有囊膜对乙醚和非离子去污剂敏感。
本科病毒在pH3~10条件下稳定,在4℃条件下可存活数年。
对热敏感,55℃15~30分钟即可使其灭活。
图13-1 虹彩病毒的核衣壳虹彩病毒的核衣壳内含有单分子的线状双股DNA,长为170~200 kb,其分子量为100~250×10 6 Da,带喙伊蚊虹彩病毒的基因组有440 kb。
有些病毒可能在衣壳内具有双分子核酸。
核酸占整个病毒粒子总重量的12%~30%,G+C含量为29%~32%,但蛙病毒属高达58%。
虹彩病毒的核酸有其独特的结构:在双股DNA分子末端都具有单链结构;在蛙病毒属、淋巴囊肿病毒属及虹彩病毒属(至少一种病毒)的基因组双链DNA分子链两端都带有同一基因序列,,称之谓“末端过剩”(terminanl redundancy),而且在不同分子的两端又呈现不同的末端环状排列,称之谓“环状变换”(circular permutation),这是虹彩病毒基因组的一个基本共同特点。
但是在虹彩病毒属和蛙病毒属的代表株之间以及蛙病毒属和淋巴囊肿病毒属的代表株之间没有发现基因组DNA的同源序列。
虹彩病毒的基因组DNA另一个特点是胞密啶5′端的高度甲基化,特别是蛙病毒和淋巴囊肿病毒(因为二者的基因所编码DNA甲基转移酶的缘故)。
甲基化可能与保护DNA免受酶切和与DNA复制、重组、修复及其基因表达有关。
虹彩病毒具有20种以上的结构蛋白和若干病毒粒子结合性酶。
以单向和双向PAGE技术研究病毒结构蛋白发现有13~35种结构多肽,分子量在10~250×10 Da范围内,并发现大多数结构蛋白在病毒粒子中具有酶活性,特别是蛋白激酶活性。
目前已研究证明二化螟虹彩病毒有RNA聚合酶、蛋白激酶、核苷三磷酸水解酶以及碱性蛋白酶等活性,后者可能是一种丝氨酸蛋白酶,在蛙病毒3型病毒粒子中至少有6种酶活性,除蛋白激酶外,在核衣壳内还有核苷三磷酸水解酶、胸腺嘧啶激酶和DNA甲基转移酶等。
无囊膜的虹彩病毒(如昆虫虹彩病毒)的病毒粒子中含有5%~9%的类脂质(主要是磷脂),它是构成正二十面体衣壳整体不可缺少的成分。
有囊膜病毒(如从蛙、鱼分离的虹彩病毒)在其来自宿主胞浆膜的囊膜中也含有类脂质,约3%~14%,其它成员类脂质的含量取决于囊膜的形成方式。
在虹彩病毒的粒子中未检出有糖类存在。
在病毒的抗原方面,不同昆虫的虹彩病毒之间在血清学反应上具有广泛的交叉反应,但是昆虫虹彩病毒与脊椎动物虹彩病毒之间无交叉反应,各种脊椎动物的虹彩病毒之间也无交叉反应。
实验证明,针对虹彩病毒的抗体一般对病毒粒子无中和作用。
目前尚未对虹彩病毒进行系统的血清学调查,但已有的研究表明脊椎动物虹彩病毒和非脊椎动物虹彩病毒之间在血清学和核酸序列上均无关。
虹彩病毒通过胞饮作用进入宿主细胞,并在吞饮液内脱衣壳。
病毒感染早期即迅速抑制宿主的大分子合成,病毒的转录至少分为三期,即立即早期、早期和晚期,晚期转录并不依赖DNA的复制。
但脊椎动物虹彩病毒缺乏合成mRNA必需的酶,故需依赖宿主细胞的RNA聚合酶Ⅱ。
病毒DNA的复制可分为两个阶段:第一阶段在感染早期,在宿主细胞核内合成较小的复制型DNA 分子,其长度等于或比基因组小二倍;第二阶段是在感染的晚期(在晚期基因表达后),在胞浆内复制成极大的复制复合体,即DNA连结体,并在胞浆内加工切割成成熟的DNA,包装入成熟的病毒颗粒。
这种加工结果可能导致“末端过剩”和“环状变换”的形成。
成熟病毒粒子的装配发生在胞浆中,成熟病毒的释放是通过胞浆膜上出芽或细胞溶解,出芽释放的病毒获得一个来自原生质膜或内质网膜的囊膜。
虹彩病毒可以在较广泛的培养细胞上生长,并对感染细胞具有抑制其大分子生物合成的作用。
虹彩病毒在细胞浆中的增殖与痘病毒相似,但虹彩病毒的核酸合成既依赖于宿主细胞浆,又依赖于宿主的细胞核。
病毒装配是在细胞浆中进行的,在电子显微镜下观察,可见到胞浆中有大量堆集的二十面体立体对称的虹彩病毒。
昆虫虹彩病毒的感染范围限于无脊椎动物。
易在来自其自然宿主的培养细胞上增殖,虹彩病毒32型病毒既可感染陆生等足目动物,又可感染线虫。
虹彩病毒仅能从其生活史中有水生阶段的变温动物体内分离出,大多数昆虫虹彩病毒能使感染幼虫变蓝或青绿色,但脊椎动物虹彩病毒不能引起颜色变化。
带喙伊蚊虹彩病毒能通过孵巢垂直传播,而一些虹彩病毒可水平传播。
二、虹彩病毒属(Iridovirus)亦称为小虹彩昆虫病毒属(Small iridovirus insect virus group)。
1986年ICTV将二化螟(Chilo suppressalis)虹彩病毒即昆虫虹彩病毒6型定为本属的代表株。
病毒粒子的直径约为120nm,没有囊膜,具有比较复杂的衣壳结构,含有类脂质,但因这些脂质受到蛋白衣壳的保护,乙醚不能破坏病毒的感染性,病毒感染的昆虫幼虫和经纯化而得到的病毒粒子沉淀物在斜射光线照射下产生蓝紫色的虹色光彩。
二化螟虹彩病毒(CIV)的基因组为双股DNA分子,全长209 Kb,目前已知道它的多种限制性核酸内切酶的酶切图谱(图13-2)。
基因组DNA分子在双股DNA的两末端具有单链结构,并且具有末端过剩和环状转换的结构特点。
本属原来的代表株昆虫虹彩病毒1型即沼泽大蚊(Tipula paludosa)虹彩病毒(TIV)的基因组DNA分子包括两个部分,分别为L1 (176 Kb)和S1 (108 Kb),编码25~30个蛋白质。
本属病毒DNA分子量约为158×10 6 Da,所形成DNA双环结构的分子量为140×10 6 Da。
这说明其末端过剩的DNA占全部基因组DNA分子的12%左右。
这一特点是虹彩病毒科成员基因组DNA分子所共同具有的特点。
昆虫虹彩病毒9型的基因组DNA的酶切图谱现也已清楚。
在二化螟虹彩病毒与蛙病毒3型的基因组DNA分子之间,迄今未发现有任何同源序列。
0(Kb) 20 80 120 160 200 210Pvu Ⅱ:A G H M F ASph Ⅰ:I J F D EAsp718:K A L B EAPa Ⅰ:A图13-2 CIV DNA的酶切图谱(DNA 全长 209 Kbp,MW=158 MDa.)从各种昆虫体内分离获得的大量昆虫虹彩病毒,通过血清学分析鉴定,结果表明至少可以区分为32个血清型别。
其中属于本属的成员包括有昆虫虹彩病毒的1、2、6、9、10、16~32型,如白粉金龟甲虹彩病毒(SIV),即2型;蝙蝠蛾虹彩病毒(WIV),即9型;堆砂苔螟虹彩病毒(WtIV),即10型;草地金龟甲虹彩病毒(CZIV),即16型;步行虫虹彩病毒(PIV),即17型;阿鳃金龟虹彩病毒(OPIV),即18型;草金龟虹彩病毒(OdIV),即19型;蚋虹彩病毒(SiIV),即22型。
章鱼(真蛸)病病毒(Octopus vulgoris disease virus,OvIV)也可能是虹彩病毒属的成员。
昆虫虹彩病毒的自然感染发病率较低,但人工实验接种,尤其是采取腹腔注射接种的方式,有较广的宿主范围。
例如沼泽大蚊虹彩病毒至少能使双翅目7个种,鳞翅目13个种和鞘翅目3个种的昆虫幼虫感染发病;白粉金龟甲虹彩病毒能感染许多双翅目、鳞翅目与鞘翅目昆虫;昆虫虹彩病毒32型能感染陆生等足目动物和线虫;而二化螟虹彩病毒(CIV)可感染100多种昆虫。
一般来说,昆虫虹彩病毒的宿主范围限于无脊椎动物,但是腹腔注射大量的CIV野毒株或经紫外线照射的毒株,常可使蛙和小鼠致死,而注射加热灭活或抗血清灭活的CIV病毒不引起毒性反应,其原因不明,有人认为这是病毒蛋白本身的非特异性毒性所致。