环状RNA在妇科恶性肿瘤中的研究
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环状RNA在妇科恶性肿瘤中的研究作者:张晓黎张颖陈国通宋硕来源:《医学信息》2020年第03期摘要:环状RNA(circRNA)是一类由前体mRNA形成的封闭单链RNA分子,其在物种间具有高稳定性、丰富性和进化保守性。
circRNA作为“分子海绵”吸附于miRNA,调控下游靶基因的表达水平,且少数circRNA还可以翻译成肽或蛋白质。
研究证实,circRNA在病理状态和特定情况下表达异常,可促进或抑制肿瘤的进展,并有望成为恶性肿瘤的新型诊断标记物、分子治疗靶点和预后评估指标。
本文通过对circRNA的分类、主要功能及其与妇科恶性肿瘤的关系作一综述,以期为妇科恶性肿瘤的临床诊治提供参考。
关键词:环状RNA;妇科恶性肿瘤;卵巢癌;宫颈癌;子宫内膜癌中图分类号:R737.3; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;文献标识码:A; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;DOI:10.3969/j.issn.1006-1959.2020.03.012文章编号:1006-1959(2020)03-0038-05Study of Circular RNA in Gynecological MalignanciesZHANG Xiao-li1,ZHANG Ying2,CHEN Guo-tong1,SONG Shuo1(1.Guangdong Medical University,Zhanjiang 524000,Guangdong,China;2.Department of Gynecology,the Affiliated Hospital of Guangdong Medical University,Zhanjiang 524000, Guangdong,China)Abstract:Circular RNA (circRNA) is a type of closed single-stranded RNA molecule formed from precursor mRNA, which has high stability, abundance and evolutionary conservation among species. CircRNA acts as a "molecular sponge" that is adsorbed on miRNAs, and regulates the expression level of downstream target genes. A few circRNAs can also be translated into peptides or proteins. Studies have confirmed that abnormal expression of circRNA in pathological conditions and specific conditions can promote or inhibit tumor progression, and is expected to become a new diagnostic marker, molecular therapeutic target and prognostic indicator for malignant tumors. This article reviews the classification, main functions of circRNA, and their relationship with gynecological malignancies in order to provide a reference for the clinical diagnosis and treatment of gynecological malignancies.Key words:Circular RNA;Gynecological malignancy;Ovarian cancer;Cervicalcancer;Endometrial cancer环状RNA(circular RNA,circRNA)是由下游3'剪接位点和上游5'剪接位点反向剪接形成的一类共价封闭的单链环状RNA分子[1]。
circRNA最早于1976年在仙台病毒中首次被发现[2],1979年,首次在真核细胞的细胞质中被发现[3]。
1980年,Arnberg AC等[4]在酵母的线粒体中也发现了circRNA。
circRNA具有真核中丰富,进化上保守,组织特异性表达,高度稳定,可在神经组织中随衰老而累积等特点,且circRNA可以通过竞争剪接方式与其对应的线性RNA产物进行顺式调节[5]。
研究显示[6],circRNA在不同物种中起到miRNA海绵的作用,称之为竞争性内源RNA(ceRNA),能竞争性结合microRNAs(miRNAs),從而调控靶基因的表达。
这说明circRNA可能通过竞争性结合疾病相关的miRNA在疾病调控中发挥着非常重要的作用。
另研究表明[7],circRNA在肿瘤分化、及发生进展过程中的基因调控中表现出不可或缺的生物学功能。
但其在妇科恶性肿瘤(包括卵巢癌、子宫内膜癌、宫颈癌)中的研究尚处于起步阶段,本文通过对circRNA的分类、主要功能及其与妇科恶性肿瘤的关系作一综述。
1 circRNA的分类根据circRNA的成环方式,目前主要有四种类型[8-11]:外显子circRNA(ecircRNAs)、环状内含子RNA(CiRNAs)、外显子内含子circRNAs(EIciRNAs)、基因间circRNA或融合circRNAs(f-circRNAs),表明circRNA可源于外显子,也可从编码外显子的过程中派生出来。
2 circRNA的主要功能随着高通量RNA测序技术的快速发展及生物信息学的大量数据分析,大量研究证实circRNAs具有miRNA海绵功能[12,13]、基因转录调控[14]、与RNA结合蛋白结合[15]以及翻译功能[16,17],且circRNAs在肿瘤细胞中起着重要作用,可能成为癌症治疗的新生物标志物和治疗靶标[18,19]。
2.1在细胞核内2.1.1 circRNA调节其亲本基因的转录; 一方面,存在于人类细胞核内的ciRNAs及EIciRNAs可以促进亲本基因的转录。
Li Z等[10]研究证明了EIciRNAs可通过与POLⅡ、U1 snRNP和亲本基因启动子相互作用而促进亲本基因的转录,并通过U1 snRNP和EIciRNAs间的特定RNA-RNA相互作用实现转录控制的调节策略。
另一方面,circRNAs还可能抑制亲本基因的转录。
Smid M等[20]研究表明,circRNA(circCNOT2)沉默后影响乳腺癌细胞MCF-7和BT-474的增殖活力,且circCNOT2高表达组患者芳香酶抑制剂(AI)治疗的无进展生存期明显低于低表达组,进一步证明包含起始密码子的circRNA(circCNOT2)可能会影响线性基因的表达,而用来剪接circRNA的线性转录本被迫使用另一个起始密码子进行翻译,导致一些circRNA与其亲本mRNAs的转录呈负相关[20]。
提示circRNAs可能会抑制其亲本基因的表达,并在肿瘤的发生发展及治疗中发挥重要作用。
2.1.2 circRNAs调节其线性同源转录本的剪接; circRNA的生物发生和同一宿主基因的线性剪接可通过竞争剪接位点相互调节。
Ashwal-Fluss R等[21]在果蝇中发现了第一个参与外显子环化过程的蛋白-剪接因子muscleblind(MBL),在脊椎动物中发现了其同源物muscleblind-like蛋白1(MBNL1),而MBL的第二外显子可以环化形成circRNA(CircMbl),CircMbl 及其侧翼内含子可与MBL特异性结合,从而与线性剪接竞争MBL结合位点,影响muscleblind的线性剪接。
Conn VM等[22]研究证明,SEPALLATA3(SEP3)基因的第6个外显子形成的circRNA(CircSEP3)序列与亲本DNA序列有重复,可与其亲本基因结合形成一个RNA∶DNA杂合体(R-loop),R-loop的形成可以直接阻断线性同源转录本的转录,同时招募剪切因子引发对SEP3的可变剪切,导致植物开花表型变化。
2.2在细胞质中2.2.1 circRNA充当miRNA海绵; miRNAs是基因表达的重要转录后调控因子,通过直接碱基配对作用于信使RNA(mRNA)非翻译区内的靶位点。
Salmena L等[12]认为不同类型的circRNA分子会争相与miRNA结合,从而减少miRNA对其mRNA目标的抑制作用,这就是circRNA通过ceRNA机制调控亲本基因。
ceRNA可以通过应答元件(microRNA response elements,MREs)作为miRNA“分子海绵”与miRNA结合,从而影响miRNA的活性[23],且该作用在各种肿瘤中均得到了证实[24,25]。
2.2.2 circRNAs结合蛋白发挥作用; circRNAs可以与不同的RNA结合蛋白(RNA binding protein,RBPs)相互作用形成特定的circRNPs,改变RBPs的构象从而发挥调控作用[15],如CircMbl能与MBL结合,与同源线性剪接竞争MBL结合位点,从而在基因调控中发挥作用[21]。
转录因子家族成员FOXO3环化而成的circRNA(circFOXO3)在老年的人体和小鼠心臟组织中均呈高表达,circFOXO3可与抗衰老蛋白ID-1、转录因子E2F1以及抗应激蛋白FAK和HIF1α相互作用[26]。
Holdt LM等[27]研究发现,Ink4a/Arf位点(编码细胞周期抑制剂-p16Ink4a以及p53间接激活剂-p19Arf)中的环状反义非编码RNA(circANRIL)可与pescadillo同源物1(pescadillo homologue 1,PES1)结合,通过控制核糖体RNA(rRNA)的成熟和调控动脉粥样硬化形成途径,使其具有动脉粥样硬化保护作用。
总之,circRNAs可与RBPs相互结合在疾病的发生发展中发挥作用。
2.2.3 circRNA翻译多肽; Chen CY等[28]研究表明,脑心肌炎病毒(encephalomyocarditis virus,EMCV)中内部核糖体进入位点(internal ribosome entry sites,IRES)元件可直接与起始因子或核糖体结合,从而以不依赖帽的方式在体外驱动人工circRNA的翻译。