实时荧光定量PCR详细操作步骤
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实时荧光定量PCR
组织RNA提取:
一般认为100mg肝组织提取RNA 500ng,100mg肺提取RNA 200ng,脑内的RNA丰度适中,100mg脑组织,提取RNA 5-200ng。所以一个10mg的海马可匀出RNA约为20ng。
反转录反应
反转录反应参照TaKaRa RT-PCR说明书。
反转录反应条件如下。
37°C 15 min(反转录反应)
85°C 5 sec(反转录酶的失活反应)
Real Time PCR反应
选用脑源神经营养因子(BDNF)为目标基因,核糖体18S rRNA(18S rRNA)做为内参。
基因 引物序列 扩增片段长度
NR2B NR2B(+) CCGCAGCACTATTGAGAACA 213 bp
NR2B(–) ATCCATGTGTAGCCGTAGCC
18s rRNA 18s rRNA(+) TTTGTTGGTTTTCGGAACTGA
198 bp
18s rRNA(–) CGTTTATGGTCGGAACTACGA
1) 按下列组份配制PCR反应液(反应液配制请在冰上进行)。
试剂 使用量 终浓度
SYBR® Premix Ex TaqTM(2×) 12.5 μl 1× PCR Forward Primer(10 μM) 1 μl 0.4 μM
PCR Reverse Primer(10 μM) 1 μl 0.4 μM
模板(cDNA溶液) 0.5 μl
dH2O 10
μl
Total 25 μl
全班40人,分为5组,每组做8管。4管做BDNF,4管做18S rRNA。4管BDNF或者18S rRNA,采用相应的正反PCR引物。每种基因做两个模板,一个模板采用原液浓度,一个模板采用稀释一倍浓度,体积均为0.5 μl。
2)三步法PCR
首先95°C 作用3 min。
PCR进行35个循环。
步骤 温度 时间
变性 95°C 30 秒
退火 58°C 30 秒
延伸 72°C 30 秒
融解曲线
温度 时间 变温速度
95°C 0秒 20°C/秒 55°C 15秒 20°C/秒
95°C 0秒 0.1°C/秒