双酶切连接反应全攻略
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载体双酶切技术是分子生物学领域常用的实验技术之一,它通过利用两种不同的限制性内切酶作用于同一个质粒DNA,从而实现对目标DNA片段的精确剪切和克隆。
本文将从载体双酶切技术的原理、应用和优缺点等方面进行详细介绍。
一、原理载体双酶切技术的原理主要基于两种不同的限制性内切酶对DNA的特异性切割。
首先,选择两种能够在同一质粒上切割出相互兼容的黏性末端的内切酶,并确定其最佳反应条件。
然后,将目标DNA片段与质粒进行双酶切反应,使得目标DNA片段的末端与质粒的末端具有互补的黏性末端。
最后,通过DNA连接酶的作用,将目标DNA片段与质粒连接成重组质粒,实现目标DNA片段的克隆插入。
二、应用载体双酶切技术在分子生物学研究中有着广泛的应用。
首先,它可以用于重组质粒的构建,将外源基因插入到质粒中,用于基因克隆、表达和功能研究。
其次,还可以通过双酶切技术对质粒进行定向修饰,如引入点突变、插入序列或者删除特定片段等,用于研究基因的结构与功能。
此外,载体双酶切技术也被广泛应用于基因工程、蛋白质表达、基因组编辑等领域。
三、优缺点1. 优点(1)精准:通过双酶切技术可实现对DNA片段的精确切割和定向连接,保证了重组质粒的稳定性和可靠性。
(2)灵活:可以根据实验需要选择不同的限制性内切酶组合,实现对DNA的多样化操作。
(3)高效:相比传统的单酶切技术,载体双酶切技术能够提高DNA片段的连接效率和克隆成功率。
2. 缺点(1)操作复杂:双酶切技术需要充分考虑两种内切酶的选择、反应条件的优化及连接方法的调整,操作过程较为复杂。
(2)局限性:某些情况下可能无法找到适合的双酶切位点,导致目标DNA片段无法有效插入到质粒中。
(3)成本较高:需要购买多种限制性内切酶和连接酶,增加了实验成本。
综上所述,载体双酶切技术作为一种重要的分子生物学工具,在基因工程和分子生物学研究中发挥着重要作用。
随着技术的不断进步和完善,相信它将在更多领域展现出其巨大的潜力和价值。
Double Digestion(双酶切反应)时Universal Buffer(通用缓冲液)的使用表之迟辟智美创作
■说明
使用二种酶同时进行DNA切断反应(Double Digestion) 时,为了节省反应时间,通常希望在同一反应体系内进行.TaKaRa采纳Universal Buffer暗示系统,并对每种酶暗示了在各Universal Buffer中的相对活性.尽管如此,在进行Double Digestion时,有时还会难以找到合适的Universal Buffer.本表以在pUC系列载体的多克隆位点处的各限制酶为核心,显示了在Double Digestion可使用的最佳Universal Buffer条件.在本表中,各Universal Buffer之前暗示的[数字×] 是指各Universal Buffer的反应体系中的最终浓度.TaKaRa销售产物中添附的Universal Buffer全为10倍浓度的缓冲液.终浓度为0.5×时反应体系中的缓冲液则稀释至20倍,1×时稀释至10倍,2×时稀释至5倍进行使用.
■注意
◇ 1 μg DNA中添加10 U的限制酶,在50 μl的反应体系中,37℃下反应1小时可以完全降解DNA.◇为防止Star 活性的发生,请将反应体系中的甘油含量,尽量控制在10%以下.◇根据DNA的种类,各DNA的立体结构的分歧,或当限制酶识别位点邻接时,有时会发生Double Digestion不能顺利进行的可能.。
酶切操作技巧实验材料实验耗材:枪头(10μl、200μl)、EP管(200μl)试剂:限制性内切酶及buffer、ddH2O准备工作:冰,37˚C水浴、质粒或PCR产物实验操作步骤:酶切反应体系成分体积(µL)质粒或PCR产物<1µgBuffer2限制性内切酶1 1限制性内切酶2 1ddH2O Up to 2037˚C水浴2h。
注意事项:1. 尽量选择粘端酶切和那些酶切效率高的限制酶,提前看好各公司的双切酶所用公用的buffer,以及各酶在公用buffer里的效率。
2. 双酶切时间及其体系:一般酶切2个小时,酶切效率低的可适当延长时间,酶切体系不宜过大,会影响质粒和酶的碰撞机会,效果降低;质粒量不应该超过酶切要求的最大量,否则酶切不完全,酶的用量控制在1U酶在15-20ul 体系中酶解1ug DNA。
3. 两种酶切的条件不同时,分别进行两次酶切,切完一个纯化后再切:温度要求不同,先酶切低温要求的,再酶切高温要求的;若盐浓度要求不同,先酶切低盐浓度要求的,再酶切高盐浓度要求的。
4. 双酶切时如果两种酶反应温度一致而buffer不同时,可查阅内切酶供应商在目录后的附录中提供的各种酶在不同buffer中的活力表,如果有一种buffer 能同时使2种酶的活力都超过70%的话,就可以用这种buffer作为反应buffer;如果两种酶厂家不同无法查时可比较其buffer成份,相似的话可以考虑各取一半中和;任何时候2种酶的总量不能超过反应体系的1/10体积,而且最大反应体系最好不要小于20 ul。
如果2种酶的buffer成份相差较大或2种酶的反应温度不同则必须分别做酶切。
第1种酶切后要考虑用酚抽、电泳后胶回收或加热等方法使酶失活后再进行下一次酶切反应。
厂家目录一般都会有相应的附录以供查阅各种酶的反应温度。
有的酶可以用加热使之失活,如CIAP;有的则不行。
5. 酶量的问题:不同公司的酶活力单位不同,按说明书的酶切体系添加酶量,按反应条件进行酶切反应。
酶切酶连步骤
嘿,朋友们!今天咱就来好好唠唠酶切酶连这个神奇的步骤。
你想想看啊,这酶切酶连就像是一场精细的手术,得小心翼翼地操作呢!咱先来说说酶切。
这就好比是一把精准的剪刀,要把 DNA 这个大分子剪成我们想要的片段。
可别小看这一剪子,要是没剪好,那可就全乱套啦!就像你要裁衣服,要是裁歪了,那做出来的衣服能好看吗?所以啊,选择合适的酶那是相当重要,就跟选一把锋利好用的剪刀一样。
然后呢,就是酶连啦!这一步就像是把剪开的片段重新缝合起来,让它们变成一个新的整体。
这可不是随随便便就能连好的呀!得找对接口,就跟拼图似的,得严丝合缝才行。
要是没连对,那可就成了四不像啦!这时候就得考验咱的耐心和技术咯。
你说这酶切酶连是不是特别有意思?就像搭积木一样,一块一块地拼凑出我们想要的东西。
而且这过程中可不能马虎,一个小细节没注意到,可能就会前功尽弃呢!这多像我们过日子啊,每天都得认真对待,不然一不小心就会出岔子。
在做酶切酶连的时候,可得注意各种条件哦!温度啦、缓冲液啦,都得把握好。
这就好比做饭,火候、调料都得恰到好处,不然做出来的菜能好吃吗?还有啊,操作的时候一定要仔细,千万别手抖啊!不然一哆嗦,可能就把好不容易弄好的给毁了。
咱再想想,要是没有酶切酶连这技术,那好多实验都没法做啦!好多伟大的发现可能就被耽误了呢!所以说啊,这小小的步骤可有着大大的作用。
总之呢,酶切酶连虽然看似简单,实则暗藏玄机。
只有我们认真对待,仔细钻研,才能把它做好。
让我们一起加油,把这神奇的步骤玩得团团转,为科学研究贡献自己的力量吧!相信大家都能在这个过程中收获满满的成就感和乐趣呢!。
•DNA的酶切实验采用粘末端连接必须对目的DNA分子和载体分子进行酶切以获得相应的粘末端进行连接。
酶切可以是单酶切也可以是双酶切。
单酶切操作比较简单,但双酶切如果两种酶所用缓冲液成分不同(主要是盐离子浓度不同)或反应温度不同,这时可以采用如下措施解决:1)先用一种酶切,然后乙醇沉淀回收DNA分子后再用另外一种酶切;2)先进行低盐要求的酶酶切,然后添加盐离子浓度到高盐的酶反应要求,加入第二种酶进行酶切;3)使用通用缓冲液进行双酶切。
具体要根据酶的反应要求进行,尽量避免星号活力。
一材料、试剂和仪器:1 材料:质粒DNA2 试剂:限制性内切酶、ddH2O3 仪器:微量移液枪,离心机,水浴锅,电泳仪,紫外透射观测仪实验程序:I. .单酶切:II. 双酶切:注:酶切的选择原则一般是尽量扩大酶切体系,这样抑制因素得以稀释;基因组DNA或质粒DNA酶的用量较一般DNA大,一般为1μg/10U;所加酶的体积不能超过酶切总体积的1/10,否则甘油浓度会超过5%,会产生星号活力;对难切的质粒或基因组DNA应延长反应时间4—5hr, 甚至过夜。
灭火限制性内切酶活性可以采用加热灭活,乙醇沉淀,酚/氯仿抽提,添加EDTA或SDS等方法,具体每一种酶可能有些方法不能完全灭活,这一点需要注意。
二. 结果与分析:假若一种酶在环状质粒DNA中只有一个酶切位点, 且酶切彻底,紫外灯下检测电泳结果, 则单酶切应为一条带, 而双酶切则为两条带。
如果条带数目多于理论值,那么有可能是酶切不完全。
如果酶切结果与酶切前的质粒条带一样(超螺旋、线性和开环三条带),则说明质粒完全没有被切开。
图4 重组质粒HindIII XbaI双酶切琼脂糖凝胶电泳分析M1 :λ DNA/ HindIII M2:DL2000 1 - 6: 重组质粒HindIII XbaI重组质粒用HindIII XbaI双酶切后释放出插入片断,因此空载体处于同一水平位置,而插入片断长度分别为0.8 ,2.1 ,1.6 ,1.2 ,0.7和0.3kb。
Double Digestion(双酶切反应)时Universal Buffer(通用缓冲液)的使用表
■说明
使用二种酶同时进行DNA切断反应(Double Digestion)时,为了节省反应时间,通常希望在同一反应体系内进行。
TaKaRa采用Universal Buffer表示系统, 并对每种酶表示了在各Universal Buffer中的相对活性。
尽管如此,在进行Double Digestion 时,有时还会难以找到合适的Universal Buffer。
本表以在pUC系列载体的多克隆位点处的各限制酶为核心,显示了在Double Digestion可使用的最佳Universal Buffer条件。
在本表中,各Universal Buffer 之前表示的[数字刃是指各Universal Buffer的反应体系中的最终浓度。
TaKaRa销售产品中添附的Universal Buffer全为10倍浓度的缓冲液。
终浓度为0.5 x
时反应体系中的缓冲液则稀释至20倍,1X时稀释至10倍,2X时稀释至5倍进行使用。
■注意
◊1 (i g DNA中添加10 U的限制酶,在50 口的反应体系中,37 C下反应1小时可以完全降解DNA。
◊为防止Star活性的产生,请将反应体系中的甘油含量,尽量控制在10%以下。
◊根据DNA的种类,各DNA的立体结构的差别,或当限制酶识别位点邻接时,有时会发生
Double Digestion不能顺利进行的可。
双酶切步骤
嘿,朋友们!今天咱就来讲讲双酶切步骤。
你可别小瞧这双酶切,
它就像是一场精细的手术,每一步都得小心翼翼,不然可就出岔子啦!
首先呢,你得准备好你的“手术工具”,也就是各种试剂和酶啦。
这
就好比厨师要准备好食材和调料才能做出美味佳肴一样。
然后,就是要把你的 DNA 片段给找出来。
这 DNA 片段就像是一个宝贝,得好好对待它,不能让它有一点点损伤哦。
接下来,把酶和 DNA 放在一起,让它们开始“亲密接触”。
这时候
你就得像个守护天使一样,在旁边好好看着,确保一切都按计划进行。
在这个过程中,温度可很重要哦!就像人洗澡水不能太烫也不能太
冷一样,得恰到好处。
不然酶宝宝可不高兴,就不好好工作啦。
时间也是关键啊!不能太短,太短了酶切不完全;也不能太长,太
长了可能会有其他问题出现。
这就好像烤蛋糕,时间掌握不好,蛋糕
不是没熟就是烤焦了。
等酶切结束后,可不能就不管啦。
得检查检查,看看切得怎么样。
这就像是考试结束后要检查一遍试卷一样,可不能马虎。
要是切得好,那当然开心啦,就像考了个好成绩一样。
要是切得不好,也别灰心,找找原因,下次再来。
总之,双酶切步骤虽然听起来有点复杂,但只要你认真对待,就一
定能做好。
就像学骑自行车一样,一开始可能会摔倒,但多练习几次
就会啦。
所以啊,大家别怕困难,大胆去尝试吧!相信自己,一定能掌握好
双酶切步骤,在生物学的世界里畅游无阻!这双酶切啊,真的是很神
奇的一个过程,能让我们看到生命的奥秘一点点被揭开。
大家加油哦!。
双酶切载体构建法双酶切载体构建法是一种常用的分子生物学技术,用于构建重组DNA。
在这种方法中,通过利用两个特定的限制性内切酶,将目标DNA分子切割,并将其插入到载体DNA中,从而构建重组DNA。
本文将详细介绍双酶切载体构建法的原理、步骤和应用。
一、双酶切载体构建法的原理双酶切载体构建法的原理基于限制性内切酶的作用。
限制性内切酶是一类能够识别并切割特定DNA序列的酶。
在双酶切载体构建法中,我们选择两个限制性内切酶,一个用于切割目标DNA,另一个用于切割载体DNA。
这两个酶的切割位点必须位于不同的位置,以确保目标DNA能够正确地插入到载体DNA中。
二、双酶切载体构建法的步骤1. 选择限制性内切酶:首先,根据目标DNA的序列,选择能够识别并切割目标DNA的限制性内切酶。
同时,选择一个在载体DNA 中有适当切割位点的限制性内切酶。
2. 切割目标DNA和载体DNA:将目标DNA和载体DNA分别与两个限制性内切酶一起反应。
这样,目标DNA和载体DNA就会在限制性内切酶的作用下被切割成多个片段。
3. 准备载体DNA:将载体DNA经过限制性内切酶切割后,使用凝胶电泳等方法,将切割后的载体DNA片段分离出来。
4. 连接目标DNA和载体DNA:将切割后的目标DNA与载体DNA片段在适当的条件下进行连接。
这可以使用DNA连接酶来完成,它能够将两个DNA片段连接在一起。
5. 转化宿主细胞:将连接好的重组DNA导入宿主细胞中。
这可以通过转染、电穿孔等方法完成。
6. 筛选和鉴定重组DNA:在转化宿主细胞后,使用选择性培养基或荧光筛选等方法,筛选出携带重组DNA的细胞。
然后,通过PCR、限制性酶切、测序等方法,对重组DNA进行鉴定和验证。
三、双酶切载体构建法的应用双酶切载体构建法在分子生物学研究中有广泛的应用。
以下是它的几个主要应用领域:1. 基因克隆:双酶切载体构建法可以用于将外源基因插入到载体DNA中,从而构建重组DNA,进而实现外源基因的克隆。
酶切连接法
酶切连接法是一种分子生物学技术,用于将不同的 DNA 片段连接在一起。
该方法通常包括以下步骤:
1. 酶切:使用特定的限制酶将待连接的 DNA 片段进行切割,产生特定的粘性末端。
2. 纯化:通过凝胶电泳或其他方法,将切割后的 DNA 片段进行纯化,去除杂质和未切割的 DNA。
3. 连接:将纯化后的 DNA 片段与载体 DNA(如质粒或病毒载体)在连接酶的作用下进行连接。
连接酶能够将粘性末端连接在一起,形成新的 DNA 分子。
4. 转化:将连接后的 DNA 分子导入宿主细胞中,如大肠杆菌或酵母细胞。
转化可以通过热激法、电穿孔法或化学转化法等方法进行。
5. 筛选:通过选择性培养基或其他方法,筛选出含有连接后的 DNA 分子的宿主细胞。
6. 鉴定:对筛选出的宿主细胞进行鉴定,确认其中含有连接后的 DNA 分子。
酶切连接法是一种常用的 DNA 克隆技术,可以用于构建基因文库、表达载体、基因敲除等实验。
该方法具有高效、简便、快速等优点,是分子生物学研究中不可或缺的技术之一。
双酶切体系(总2页)
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Double Digestion(双酶切反应)时Universal Buffer(通用缓冲液)的使用表
■ 说明
使用二种酶同时进行DNA切断反应 (Double Digestion) 时,为了节省反应时间,通常希望在同一反应体系内进行。
TaKaRa采用Universal Buffer表示系统,并对每种酶表示了在各Universal Buffer中的相对活性。
尽管如此,在进行Double Digestion时,有时还会难以找到合适的Universal Buffer。
本表以在pUC系列载体的多克隆位点处的各限制酶为核心,显示了在Double Digestion可使用的最佳Universal Buffer条件。
在本表中,各Universal Buffer之前表示的 [数字×] 是指各Universal Buffer的反应体系中的最终浓度。
TaKaRa销售产品中添附的Universal Buffer全为10倍浓度的缓冲液。
终浓度为×时反应体系中的缓冲液则稀释至20倍,1×时稀释至10倍,2×时稀释至5倍进行使用。
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■ 注意
◇ 1 μg DNA中添加10 U的限制酶,在50 μl的反应体系中,37℃下反应1小时可以完全降解DNA。
◇ 为防止Star活性的产生,请将反应体系中的甘油含量,尽量控制在10%以下。
◇ 根据DNA的种类,各DNA的立体结构的差别,或当限制酶识别位点邻接时,有时会发生Double Digestion不能顺利进行的可能。
一、建立一个标准的酶切反应目前大多数研究者遵循一条规则,即10个单位的内切酶可以切割1μg不同来源和纯度的DNA.通常,一个50μl的反应体系中,1μl的酶在1X NEBuffer终浓度及相应温度条件下反应1小时即可降解1μg已纯化好的DNA。
如果加入更多的酶,则可相应缩短反应时间;如果减少酶的用量,对许多酶来说,相应延长反应时间(不超过16小时)也可完全反应。
二、选择正确的酶不言而喻,选择的酶在底物DNA上必须至少有一个相应的识别位点.识别碱基数目少的酶比碱基数目多的酶更频繁地切割底物。
假设一个GC含量50%的DNA链,一个识别4个碱基的酶将平均在每44(256)个碱基中切割一次;而一个识别6个碱基的酶将平均在每46(4096)碱基切割一次.内切酶的产物可以是粘端的(3’或5’突出端),也可以是平端的片段.粘端产物可以与相容的其它内切酶产物连接,而所有的平端产物都可以互相连接。
相关信息参见目录的Compatible Cohesive Ends And Recleavable Blunt Ends一文。
三、酶内切酶一旦拿出冰箱后应当立即置于冰上。
酶应当是最后一个被加入到反应体系中(在加入酶之前所有的其它反应物都应当已经加好并已预混合)。
酶的用量视在底物上的切割频率而定。
例如,超螺旋和包埋法切割的DNA通常需要超过1U/μg的酶才能被完全切割。
参见目录第244和264之"切割质粒DNA"和"包埋法切割DNA”。
四、 DNA待切割的DNA应当已去除酚、氯仿、乙醇、EDTA、去污剂或过多盐离子的污染,以免干扰酶的活性。
DNA的甲基化也应该是酶切要考虑到的因素。
关于甲基化的内容,参见第252页至253页之甲基化相关内容.五、缓冲液对于每一种酶NEB都提供相应的最佳缓冲液,可保证几乎100%的酶活性。
使用时的缓冲液浓度应为1X.有的酶要求100μg/ml的BSA以实现最佳活性。
Double Digestion(双酶切反应)时Universal Buffer(通用缓冲液)的使用表
■ 说明
使用二种酶同时进行DNA切断反应(Double Digestion) 时,为了节省反应时间,通常希望在同一反应体系内进行。
TaKaRa采用Universal Buffer表示系统,并对每种酶表示了在各Universal Buffer中的相对活性。
尽管如此,在进行Double Digestion时,有时还会难以找到合适的Universal Buffer。
本表以在pUC系列载体的多克隆位点处的各限制酶为核心,显示了在Double Digestion可使用的最佳Universal Buffer条件。
在本表中,各Universal Buffer之前表示的[数字×] 是指各Universal Buffer的反应体系中的最终浓度。
TaKaRa销售产品中添附的Universal Buffer全为10倍浓度的缓冲液。
终浓度为0.5×时反应体系中的缓冲液则稀释至20倍,1×时稀释至10倍,2×时稀释至5倍进行使用。
■ 注意
◇1 μg DNA中添加10 U的限制酶,在50 μl的反应体系中,37℃下反应1小时可以完全降解DNA。
◇为防止Star活性的产生,请将反应体系中的甘油含量,尽量控制在10%以下。
◇根据DNA的种类,各DNA的立体结构的差别,或当限制酶识别位点邻接时,有时会发生Double Digestion不能顺利进行的可能。
1、同步双酶切同步双酶切是一种省时省力的常用方法。
选择能让两种酶同时作用的最佳缓冲液是非常重要的一步。
NEB每一种酶都随酶提供相应的最佳NEBuffer,以保证100%的酶活性。
NEBuffer 的组成及内切酶在不同缓冲液中的活性见《内切酶在不同缓冲液里的活性表》及每支酶的说明书。
能在最大程度上保证两种酶活性的缓冲液即可用于双酶切。
由于内切酶在非最佳缓冲液条件下的切割速率会减缓,因此使用时可根据每种酶在非最优缓冲液中的具体活性相应调整酶量和反应时间。
2、分步酶切如果找不到一种可以同时适合两种酶的缓冲液,就只能采用分步酶切。
分步酶切应从反应要求盐浓度低的酶开始,酶切完毕后再调整盐浓度直至满足第二种酶的要求,然后加入第二种酶完成双酶切反应。
3、使用配有特殊缓冲液的酶进行双酶切使用配有特殊缓冲液的酶进行双酶切也不复杂。
在大多数情况下,采用标准缓冲液的酶也能在这些特殊缓冲液中进行酶切。
这保证了对缓冲液有特殊要求的酶也能良好工作。
由于内切酶在非最佳缓冲液中进行酶切反应时,反应速度会减缓,因此需要增加酶量或延长反应时间。
通过《内切酶在不同缓冲液里的活性表》可查看第二种酶在特殊缓冲液相应盐浓度下的作用活性。
酶切技术 - 限制性内切酶PCR产物的NcoI限制性内切酶酶切鉴定限制性内切酶能特异地结合于一段被称为限制性酶识别序列的DNA序列之内或其附近的特异位点上,并切割双链DNA。
它可分为三类:Ⅰ类和Ⅲ类酶在同一蛋白质分子中兼有切割和修饰(甲基化)作用且依赖于ATP的存在。
Ⅰ类酶结合于识别位点并随机的切割识别位点不远处的DNA,而Ⅲ类酶在识别位点上切割DNA分子,然后从底物上解离。
Ⅱ类由两种酶组成:一种为限制性内切核酸酶(限制酶),它切割某一特异的核苷酸序列;另一种为独立的甲基化酶,它修饰同一识别序列。
Ⅱ类中的限制性内切酶在分子克隆中得到了广泛应用,它们是重组DNA 的基础。
绝大多数Ⅱ类限制酶识别长度为4至6个核苷酸的回文对称特异核苷酸序列(如EcoRⅠ识别六个核苷酸序列:5'-G↓AATTC-3'),有少数酶识别更长的序列或简并序列。
一、建立一个标准得酶切反应ﻫ目前大多数研究者遵循一条规则,即10个单位得内切酶可以切割1μg不同来源与纯度得DNA。
通常,一个50μl得反应体系中,1μl得酶在1X NEBuffer终浓度及相应温度条件下反应1小时即可降解1μg已纯化好得DNA。
如果加入更多得酶,则可相应缩短反应时间;如果减少酶得用量,对许多酶来说,相应延长反应时间(不超过16小时)也可完全反应。
ﻫﻫ二、选择正确得酶不言而喻,选择得酶在底物DNA上必须至少有一个相应得识别位点。
识别碱基数目少得酶比碱基数目多得酶更频繁地切割底物。
假设一个GC含量50%得DNA链,一个识别4个碱基得酶将平均在每44(256)个碱基中切割一次;而一个识别6个碱基得酶将平均在每46(4096)碱基切割一次。
内切酶得产物可以就是粘端得(3’或5’突出端),也可以就是平端得片段。
粘端产物可以与相容得其它内切酶产物连接,而所有得平端产物都可以互相连接。
相关信息参见目录得patible Cohesive Ends And Recleava ble Blunt Ends一文。
ﻫ三、酶ﻫ内切酶一旦拿出冰箱后应当立即置于冰上。
酶应当就是最后一个被加入到反应体系中(在加入酶之前所有得其它反应物都应当已经加好并已预混合)。
酶得用量视在底物上得切割频率而定。
例如,超螺旋与包埋法切割得DNA通常需要超过1U/μg得酶才能被完全切割。
参见目录第244与264之"切割质粒DNA"与"包埋法切割DNA"。
ﻫ四、DNA待切割得DNA应当已去除酚、氯仿、乙醇、EDTA、去污剂或过多盐离子得污染,以免干扰酶得活性。
DNA得甲基化也应该就是酶切要考虑到得因素。
关于甲基化得内容,参见第252页至253页之甲基化相关内容。
五、缓冲液对于每一种酶NEB都提供相应得最佳缓冲液,可保证几乎100%得酶活性。
使用时得缓冲液浓度应为1X。
有得酶要求100μg/ml得BSA以实现最佳活性。
双酶切连接反应全攻略
一、实验材料和试剂准备
1.DNA片段:需要连接的两个DNA片段,通常分别由PCR法或酶切法
获得。
2. 双酶切酶:选择两种具有互补端切位点的酶,如常用的 EcoRI 和HindIII。
3.T4DNA连接酶或其他适用的连接酶。
4.DNA连接试剂盒:如T4DNA连接试剂盒等。
5.反应缓冲液:根据连接酶选择合适的反应缓冲液。
二、双酶切连接反应步骤
1.酶切:将两个DNA片段用各自的切割酶酶切,生成互补的粘性末端。
注意,切割反应需要在适当的反应缓冲液和温度下进行,在所选择的酶切
位点附近不得有其他酶切位点。
2.酶活化:将酶切后的DNA片段进行热变性处理,加入适当的酶活化
缓冲液,在65-80℃下进行5-10分钟的热处理,以去除酶切过程产生的
内切酶的限制性影响。
3.连接反应:将酶活化处理后的DNA片段加入连接反应体系中,加入
适量的连接酶和缓冲液,并在适当的温度下进行连接反应。
连接反应温度
一般为16-20℃,反应时间根据试剂的不同而有所差异,一般为2-4小时
至过夜。
4.构建:将连接反应后的DNA取出,可根据需要进行进一步的DNA构建,如转化到宿主细胞中进行复制或进行其他分子生物学操作。
三、实验条件和注意事项
1.酶切反应:根据所选择的切割酶的活性要求选择合适的反应缓冲液
和酶切温度。
2.热变性处理:确保将酶切后的DNA片段充分变性,去除酶切产生的
限制性影响,但同时避免过度变性导致DNA不可恢复的损伤。
3.连接反应:根据所选择的连接酶和试剂盒的要求进行适当的缓冲液
和温度选择。
4.连接效率:连接效率可能受到多种因素的影响,如DNA片段的完整性、浓度、连接酶的活性和反应条件等。
在实验过程中,可以调节影响连
接效率的参数来优化实验结果。
5.阳性对照:在连接试验中可以设计阳性对照样品,即将两个DNA片
段直接连接,并通过测序确认连接效果。
四、技巧和优化
1.控制DNA片段的完整性:在连接前,确保DNA片段经过正确的PCR
扩增或酶切,以获得理想的DNA片段完整性。
2. 合理选择连接酶:根据连接酶的特性和反应条件,选择适合的连
接酶,如 T4 DNA 连接酶适合于连接互补的粘性末端,而 T4 RNA-Ligase 适合于连接两个非互补的 DNA 分子。
3.合适的反应条件:根据连接酶的要求,选择合适的温度和反应时间。
一般而言,连接反应可以在16-20℃下进行2-4小时至过夜。
4.对PCR扩增的片段进行A尾化:一些连接酶仅适用于DNA片段带有A尾,对于PCR扩增片段,可以通过使用适当的DNA多聚核苷酸转移酶,在PCR扩增末端添加A尾化处理。
5.高浓度DNA片段的连接:高浓度的DNA片段可能会导致连接效率下降,可以通过稀释DNA片段来优化反应结果。
6.使用阳性对照:设计一个已知效果的阳性对照样品,以确认连接反应的成功,并对连接效果进行评估。
总结起来,双酶切连接反应是一种常用的DNA结合方法,步骤简单可靠。
在实验过程中,根据实验材料和试剂的要求,并结合一些实验技巧和优化策略,可以获得高效的连接效果。