琼脂糖凝胶电泳
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DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和操作步骤DNA的琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分子生物学技术,用于分析DNA 的大小和纯度,以及进行DNA分子的分离和纯化。
凝胶电泳实验可以帮助我们确定DNA样本的大小和获得纯化的DNA片段供进一步研究使用。
下面是DNA琼脂糖凝胶电泳实验的原理和操作步骤。
【原理】DNA琼脂糖凝胶电泳是根据DNA分子在电场中的不同迁移速率来分离大小不同的DNA片段。
琼脂糖凝胶是一种凝胶状物质,其孔隙大小能够将DNA分子限制在一定范围内,较大的DNA分子迁移速率较慢,而较小的DNA分子迁移速率较快。
琼脂糖凝胶通常是在平均浓度为1%至2%之间的范围内制备,以便在不同大小的DNA分子之间提供适当的分辨率。
实验中,DNA样品通过切割酶或PCR等方法获得,样品经过核酸电泳缓冲液稀释,并在琼脂糖凝胶板上进行电泳。
凝胶板两侧连接电源,DNA 的带电粒子将在电场的作用下从负极迁移到正极,迁移过程中形成DNA的“条带”,条带的位置和长度反映了DNA的大小。
通常,DNA条带由荧光染料或核酸染料标记,以便在电泳结束后进行可视化。
【操作步骤】以下是DNA琼脂糖凝胶电泳实验的一般操作步骤:1.制备琼脂糖凝胶板:a.准备琼脂糖粉末和核酸电泳缓冲液(通常为TAE或TBE缓冲液)。
b.按照说明书将琼脂糖粉末溶解于核酸电泳缓冲液中。
c.将溶液加热至沸腾并搅拌,使琼脂糖完全溶解。
d.将溶液倒入预先准备好的电泳仓中,插入梳子或制备好的孔板,使其凝固。
2.样品制备:a.提取DNA样品并测定其浓度。
b. 将DNA样品稀释到适当浓度,通常为10-50 ng/μL。
c. 添加适当的加载缓冲液,通常是一些染料和甘胺酸(glycine)或其他添加剂。
3.DNA加载和电泳:a.打开琼脂糖凝胶仓盖,将DNA样品负载于凝胶孔内。
b.将DNA负载区域和样品标注在电泳仓中,以便在电泳结束后可以准确识别DNA带。
c.关闭盖子,将电泳仓放入电泳设备中。
琼脂糖凝胶电泳原理简介琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分离和检测生物大分子的方法。
它基于琼脂糖凝胶作为分离介质,通过电场作用使分子在凝胶中按照大小和形态的差异进行迁移,达到分离的目的。
该原理广泛应用于核酸和蛋白质的分离与分析领域。
原理琼脂糖凝胶电泳原理如下: 1. 凝胶制备:首先将琼脂糖与缓冲液混合并加热溶解,随后冷却形成凝胶。
凝胶的浓度可以根据需要调整,一般较低浓度的琼脂糖凝胶用于分离大分子,较高浓度的琼脂糖凝胶用于分离小分子。
2. 样品加载:将待分离的样品加入凝胶孔中。
琼脂糖凝胶是一种多孔的基质,具有类似于过滤器的功能。
样品中的分子会被凝胶网状结构所限制,在电场作用下沿凝胶中的微小通道向电极处迁移。
3. 电泳过程:连接正负极电源,通过电场使得带电分子根据大小和形态的差异在凝胶中迁移。
电泳时间的长短与迁移距离成正比,某些情况下可以通过控制电场强度或者时间来调节分离效果。
4. 可视化检测:根据需要,可以利用染色剂或标记物对凝胶中的分子进行可视化检测。
例如,核酸可以通过乙溴化氢染色可视化,蛋白质可以通过银染法或共价标记物进行检测。
琼脂糖凝胶电泳的原理主要涉及到两个方面:凝胶基质和电场迁移。
凝胶基质琼脂糖凝胶是一种由聚糖构成的多孔基质,其主要成分是琼脂糖和缓冲液。
琼脂糖是一种天然的含羟基多糖,具有较好的凝胶性质。
琼脂糖的浓度和凝胶构建方式可以根据需要来设计,以实现对待分离分子大小和分辨率的调控。
电场迁移琼脂糖凝胶电泳是利用电场作用使带电分子在凝胶中迁移。
电泳过程中,凝胶中的聚糖构成了一套通道网络,负载着电场的分布,变为一种微电泳介质。
带电分子受到电场力的影响,在凝胶中的通道中迁移。
根据分子的大小和形态的差异,迁移速率不同,从而实现分离效果。
较小的分子会迁移得更远,而较大的分子会受到较大的凝胶阻力,迁移距离较短。
应用琼脂糖凝胶电泳在生物学领域的应用非常广泛。
主要包括以下几个方面: - 核酸分离与分析:琼脂糖凝胶电泳可以用于核酸的分离与分析。
PCR产物的琼脂糖凝胶电泳分析PCR(Polymerase Chain Reaction)是一种利用DNA复制酶扩增DNA片段的技术。
通过PCR,可以产生大量特定的DNA序列,以便后续的分析和研究。
PCR产物的琼脂糖凝胶电泳分析是一种常用的方法,用于确定扩增反应的成功与否,并得到扩增产物的大小信息。
琼脂糖凝胶电泳是一种分离和检测DNA分子的方法,基于DNA的大小和电荷的差异。
琼脂糖是一种高分子量的糖,在加热后形成凝胶状。
通过将DNA样品混合到熔化的琼脂糖溶液中,然后在电场的作用下,DNA分子会在凝胶中移动,从而分离成不同大小的带状条带。
这些条带可以被观察和测量,从而获得PCR产物的大小信息。
琼脂糖凝胶电泳分析的步骤如下:1.准备琼脂糖凝胶:将适量的琼脂糖粉末加入缓冲溶液中,加热并搅拌,使其溶解。
然后将琼脂糖溶液倒入凝胶模板中,插入梳子,待凝胶固化。
2.样品处理:将PCR产物与DNA标记物(如DNA分子量标记物)混合。
DNA标记物是一系列已知大小的DNA片段,用于标记未知PCR产物的大小。
3.载样:将样品和DNA标记物载入琼脂糖凝胶的孔中,通常使用微量移液器进行操作。
同时加入负向和正向的电源极,以形成电场。
4.电泳:使用适当的电压将琼脂糖凝胶浸入缓冲液中,然后启动电源,开始电泳。
DNA分子在电场的作用下,从孔洞区域向凝胶的另一端移动。
5.可视化:电泳结束后,可以使用紫外灯或染料(如溴化乙锭)将凝胶上的DNA分子可视化。
DNA分子会产生荧光,从而形成带状条纹。
6.分析:根据带状条纹的迁移距离和DNA标记物的大小,可以确定PCR产物的大小。
通过比较PCR产物的迁移距离和DNA标记物,并结合PCR的设计和预期产物的大小,可以确定PCR反应是否成功。
此外,可以使用图像分析软件测量和分析带状条纹的大小。
总结起来,PCR产物的琼脂糖凝胶电泳分析是一种常用的方法,用于确定PCR反应的成功与否,并获取PCR产物的大小信息。
高中生物琼脂糖凝胶电泳高中生物学是非常重要的一门学科,它涉及到人类的生命、健康和环境保护等方面。
在学习生物学过程中,琼脂糖凝胶电泳是一个重要而又基础的实验课程。
在这个实验中,我们利用琼脂糖凝胶电泳技术来分离和检测DNA 条带,以便于准确鉴定生物特征。
简单介绍琼脂糖凝胶电泳琼脂糖凝胶电泳是一种分子生物学的实验方法,它利用琼脂糖凝胶的特性将DNA 条带分离。
琼脂糖是一种胶体物质,通过加热和冷却过程,将其转变成凝胶状。
凝胶的孔隙大小和密度是可调的,可以根据需要进行操作。
琼脂糖凝胶电泳是利用电场的力学作用,将DNA 条带分离为不同的迁移带,大小和迁移速度的差异可以对不同的DNA 条带进行鉴定和分析。
实验步骤琼脂糖凝胶电泳是一项基础性的实验,下面我们来简单介绍一下实验步骤。
准备琼脂糖凝胶首先,我们需要准备琼脂糖凝胶。
将琼脂糖粉末加入缓冲溶液中,在加热的过程中充分混合,然后冷却成凝胶状态。
准备DNA 样本接下来,我们需要提取DNA 样本。
可以通过DNA 提取试剂盒快速提取DNA 样本,或者手动分离DNA 样本。
电泳操作将准备好的琼脂糖凝胶放置于电泳槽中,加入适量缓冲溶液。
然后在琼脂糖凝胶中插入电极片,加入电泳缓冲液。
在电泳桥的一侧加入DNA 样本,另一侧加入DNA 分子量标准品。
运行电泳在电泳过程中,DNA 样本会在电场力的作用下迁移至阳极端,较小的分子将更远地迁移。
DNA 分离后,通过染色技术来识别各段片段。
注意事项在实验过程中,需要注意电压和时间的控制,以保证良好的分离效果。
同时,对琼脂糖凝胶的制备和保存也需要注意。
结语总结一下,琼脂糖凝胶电泳是一项基础性的实验操作,需要掌握一定的实验技能和知识。
通过这项实验,我们能够更加深入地了解生命的分子基础,并加深对遗传学、基因工程等方面的理解。
琼脂糖电泳是一种常用的核酸和蛋白质分离和纯化方法。
通过利用琼脂糖的凝胶特性,将待测样品分子按照大小和电荷进行分离。
在琼脂糖电泳实验中,电压和电流的设置对实验结果有着重要的影响。
下面我将详细介绍琼脂糖电泳电压和电流的设置方法和注意事项。
一、电压的设置1. 琼脂糖电泳实验中,电压的设置应根据待测分子的大小来确定。
较小的DNA片段通常需要较高的电压,而较大的DNA片段则需要较低的电压。
2. 选择合适的电压可以提高分离速度和分辨率。
但是过高的电压会导致琼脂糖凝胶发热、溶胶蒸发和样品失去活性等问题,因此需要谨慎设置。
3. 一般情况下,琼脂糖电泳实验的电压范围为50-150V。
如果待测分子较小,可以选择较高的电压,最大不超过150V。
大片段DNA则应选择较低的电压,最小不低于50V。
二、电流的设置1. 电流是根据电压和电阻来计算得到的,它与琼脂糖凝胶中的离子浓度和凝胶孔隙大小有关。
凝胶浓度越高,孔隙越小,电流就越小。
2. 电流的设置应根据实验室所使用的琼脂糖凝胶和电泳槽的尺寸来确定。
一般情况下,电流范围为10-30mA。
3. 在设置电流时,需要根据具体实验条件进行调整。
如果电流过高,可能会导致凝胶加热、样品失活等问题;而电流过低,则可能导致分离速度缓慢、分辨率下降等。
三、注意事项1. 在进行琼脂糖电泳实验前,要仔细检查电泳槽、电极和电源等设备是否正常工作,以确保实验的顺利进行。
2. 在设置电压和电流之前,需要根据待测样品的大小、琼脂糖凝胶的浓度和孔隙大小等因素进行综合考虑,并进行初步的试验和优化。
3. 在实验过程中,要定期检查电泳槽内的温度和电压情况,确保实验的稳定性和可靠性。
4. 对于不同的琼脂糖电泳实验,根据实际需要可以进行不同的电压和电流设置,以获得最佳的分离效果。
总结起来,琼脂糖电泳电压和电流的设置应根据待测分子的大小、琼脂糖凝胶的浓度和孔隙大小等因素进行综合考虑。
合理的电压和电流设置可以提高实验的分离速度和分辨率,同时还需要注意避免电泳槽发热、溶胶蒸发和样品失活等问题。
琼脂糖凝胶电泳实验报告琼脂糖凝胶电泳实验报告引言:琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分离和分析生物大分子的方法。
它基于琼脂糖凝胶的孔隙大小,通过电场作用下分离样品中的不同分子。
本实验旨在通过琼脂糖凝胶电泳技术,分离并分析DNA样品中的不同片段。
实验材料与方法:1. 实验材料:-琼脂糖凝胶:用于制备凝胶基质,提供分离分子的孔隙。
-缓冲液:用于维持凝胶的pH值和离子浓度稳定。
-DNA样品:包含待分离的DNA片段,可通过PCR扩增获得。
2. 实验步骤:(1)制备琼脂糖凝胶:将适量琼脂糖加入缓冲液中,加热搅拌至溶解,待冷却至大约60℃时,倒入凝胶模具中,插入梳子,待凝胶完全固化后,取出梳子。
(2)样品处理:将待分离的DNA样品与DNA加载缓冲液混合,加热至95℃,使DNA变性,然后迅速冷却至室温。
(3)电泳分离:将凝胶模具放入电泳槽中,加入足够的缓冲液,将DNA样品加入凝胶孔中,连接电源,施加适当电压,进行电泳分离。
结果与讨论:经过电泳分离后,我们观察到琼脂糖凝胶上出现了一系列DNA条带。
这些条带的迁移距离与DNA片段的大小成反比,即较小的片段迁移距离较远,较大的片段迁移距离较短。
实验结果的解释可以通过琼脂糖凝胶电泳的原理来理解。
琼脂糖凝胶的孔隙大小决定了不同大小的DNA片段在凝胶中的迁移速度。
较小的DNA片段能够更容易通过凝胶孔隙,因此迁移距离较远;而较大的DNA片段则受到凝胶孔隙的限制,迁移距离较短。
通过对DNA条带的大小和形状进行分析,我们可以获得关于DNA样品的重要信息。
例如,我们可以确定样品中是否存在特定的DNA片段,或者在PCR扩增中是否成功地放大了目标片段。
总结:琼脂糖凝胶电泳是一种简单而有效的生物大分子分离和分析方法。
通过电泳分离DNA样品,我们可以快速获得关于样品中DNA片段的信息。
这种技术在分子生物学、遗传学等领域有着广泛的应用,对于研究和诊断基因相关的疾病具有重要意义。
在今后的研究中,我们可以进一步探索琼脂糖凝胶电泳的应用,并结合其他分析技术,提高实验的准确性和灵敏度。
琼脂糖凝胶电泳的原理
琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生物分子分离技术。
其基本原理是利用琼脂糖形成的凝胶作为分离介质,通过电场的作用将带电的生物分子(如DNA、RNA和蛋白质等)在凝胶中进行分离。
琼脂糖是一种多糖,它具有黏性和凝胶性。
在琼脂糖凝胶电泳中,首先将琼脂糖加入缓冲液中,使其溶解并形成适当的凝胶浓度。
然后将凝胶溶液倒入电泳槽中,待其凝固后形成凝胶。
凝胶中的空隙可以根据琼脂糖凝胶的浓度调整得到不同的大小,从而实现对生物分子的分离。
较低浓度的琼脂糖凝胶可以形成较大的孔隙,适用于大分子的分离,如DNA片段或蛋白质。
较高浓度的琼脂糖凝胶形成较小的孔隙,适用于小分子的分离,如RNA。
在电泳过程中,凝胶中的分子受到电场的作用,在电场的推动下向电极迁移。
分子的迁移速度取决于它们的电荷、大小和凝胶孔隙的尺寸。
较大的分子受到凝胶孔隙的限制,迁移速度较慢,而较小的分子能够较快地通过凝胶孔隙。
为了可视化分离结果,可以在凝胶中加入染料或标记物,使得分离的分子能够显示出明显的带状图案。
电泳结束后,可以通过紫外线照射或染色来观察和分析分离的带状图案,从而获得目标生物分子的相对大小和迁移距离。
总而言之,琼脂糖凝胶电泳利用琼脂糖凝胶作为分离介质,通
过电场的作用将带电的生物分子在凝胶中进行分离。
分子根据大小和电荷的不同在凝胶中迁移的速度也不同,从而实现了生物分子的分离和分析。
一、简介琼脂糖凝胶电泳是以琼脂糖凝胶作为支持介质、利用核酸分子在电场中时的电荷效应和琼脂凝胶的分子筛效应,达到分离核酸混合物的一种电泳技术。
1、琼脂糖的分子筛效应1)琼脂糖(Agarose)来源于海洋红藻细胞壁,是一种大分子线性聚合物,基本结构是由D-半乳糖和3,6-anhydro-α-L-半乳糖通过β-1,4糖苷键结合而成的双糖单位在α-1,3糖苷键的连接下形成的一个长链。
琼脂糖具有亲水性,并几乎完全不存在带电基团,对敏感的大分子极少引起变性和吸附,是理想的惰性载体。
常用作电泳、层析等技术中的半固体支持物,用于生物大分子或小分子物质的分离和分析。
琼脂糖在水中一般加热到90℃以上溶解,温度下降到40℃左右形成良好的半固体状凝胶。
琼脂糖加热溶解后分子呈随机线团状分布,当温度降低时链间糖分子上的羟基通过氢键作用相连接,形成直径从50nm-200nm不等的孔径结构,孔径的大小由凝胶浓度控制。
琼脂糖凝胶中孔径的大小,影响了通过的核酸分子的大小以及通过的速度。
通常来说,琼脂糖凝胶的浓度越高,孔径越小,能够通过的核酸分子越小,迁移速度也越慢。
DNA片段越小,所需的胶浓度越大;而DNA 片段越长,所需的胶浓度则越小。
选择合适的胶浓度才能更好的分离片段。
2)琼脂的质量评价琼脂糖通常通过其凝胶强度和电内渗情况判断质量好坏。
强度越高,凝胶性能越好。
质量较好的琼脂糖强度通常在1200g/cm2以上,硫酸根含量在0.2%以下,电内渗在0.13以下。
琼脂糖是从琼脂中分离而来的。
琼脂由琼脂糖和琼脂果胶组成的,琼脂果胶是由许多更小的分子组成的异质混合物,和琼脂糖结构相似,但带硫酸根和羧基组分,凝胶能力差。
在琼脂糖制备过程中需要把琼脂果胶尽量去除,否则琼脂糖有可能存在极微量硫酸根和丙酮酸取代电离基团,附着到琼脂糖的多糖基质上,造成电内渗(EEO)。
电内渗会导致缓冲液中产生正电荷反向离子,它们向负极移动,从而造成与DNA反方向迁移的液流,使DNA的分离效果变差。
DNA琼脂糖凝胶电泳实验原理及超详细步骤实验原理:琼脂糖凝胶电泳是利用DNA分子的电荷和大小差异来分离DNA分子的一种方法。
DNA分子在电场作用下,会向阳极移动,移动速度与DNA分子的大小呈反比。
琼脂糖凝胶是一种聚合物,可以形成一种网络结构,在凝胶中进行电泳分离。
DNA分子在凝胶孔隙中相互碰撞,分子大小不同的DNA分子会在不同的速度下向阳极移动,从而实现了DNA分子的分离。
实验步骤:1.实验前的准备:a.制备琼脂糖凝胶:取一定量的琼脂糖粉末加入缓冲液中,加热溶解后冷却至大约50℃左右,倒入琼脂糖凝胶板中,插入梳子,待凝固。
b.缓冲液的制备:根据需要准备TAE缓冲液或TBE缓冲液。
2.DNA样品制备:a.将待测DNA样品加入试管中,用适当的缓冲液稀释样品。
b.使用嵌入剂将DNA样品加入琼脂糖凝胶中,通常将样品加入凝胶中的槽道。
3.凝胶电泳操作:a.将琼脂糖凝胶板放入电泳槽中,加入足够的缓冲液,使凝胶完全浸泡在缓冲液中。
b.将阴极和阳极电极连接到电泳槽中。
c.将样品和一些DNA分子大小标准物质分别加入凝胶中,用以测量DNA的大小。
d.打开电源,设定电流和电压,并进行电泳分离。
4.凝胶染色和成像:a.完成电泳分离后,关闭电源,取出琼脂糖凝胶板。
b.将琼脂糖凝胶板放入DNA染色剂中,染色一段时间后,取出凝胶板。
c.在紫外灯下观察琼脂糖凝胶板,可以看到DNA分子的条带。
5.数据分析:a.使用图像分析软件或标尺对琼脂糖凝胶板上的DNA条带进行测量,得到DNA分子的大小。
b.根据标准物质的条带大小,将待测DNA分子的大小与标准物质进行对比,计算DNA分子的大小。
c.根据DNA条带的强度和大小,可以估算DNA的浓度。
需要注意的是,具体的实验步骤可能因实验设备和试剂的不同而有所差异,所以在进行实验之前最好仔细阅读实验操作手册,并参考实验室老师或资深研究人员的指导。
琼脂糖凝胶电泳失败的三大原因及解决方法琼脂糖凝胶电泳是常用分离DNA或RNA等生物大分子的方法之一。
但是,在进行琼脂糖凝胶电泳时,经常会出现失败的情况,影响实验
结果。
下面介绍三种常见的琼脂糖凝胶电泳失败原因及解决方法。
一、凝胶制备不当
凝胶制备不当是琼脂糖凝胶电泳失败的常见原因之一。
凝胶的浓
度和 pH 值的不准确,会导致样品在凝胶上的迁移速度不同,分离效
果差。
解决方法:
1、准确称量琼脂糖的用量,按标准比例配制凝胶;
2、保持 pH 值适当,通常为 7.5-8.0;
3、使用新鲜的试剂,防止污染。
二、电泳条件不正确
电泳条件对于琼脂糖凝胶电泳的成功与否有很大的影响,如果电
泳时间不够或者电场强度不够,样品可能没有分离开来。
解决方法:
1、选择正确的电泳缓冲液;
2、根据样品的大小和特性来制定合适的电泳时间和电场强度;
3、定期更换电泳缓冲液,防止污染。
三、样品制备不当
样品制备不良,也是琼脂糖凝胶电泳失败的原因之一。
不同的组织、细胞、DNA或RNA等样品,对样品的制备条件有不同的要求。
解决方法:
1、严格按照标准或常规操作制备样品;
2、根据样品的大小和性质,选择合适的溶解方法;
3、尽可能地去除污染物或者其他干扰物。
综上所述,准备好琼脂糖凝胶,选择合适的电泳条件,以及正确地制备样品,是避免琼脂糖凝胶电泳失败的关键。
琼脂糖凝胶电泳
一、琼脂糖凝胶的特点
天然琼脂是一种多糖,主要由琼脂糖(约80%)和琼脂凝集素组成。
琼脂糖是一种中性物质,由半乳糖及其衍生物组成,不带电荷,而琼脂凝胶是一种含有硫酸盐和羧基的强酸性多糖。
因为这些基团是带电的,所以它们在电场的作用下能产生强烈的电渗作用。
此外,硫酸盐能与一些蛋清物质相互作用,影响电泳速度和分离效果。
因此,目前平板电泳常用琼脂糖作为电泳载体,其优点如下。
1.琼脂糖凝胶电泳操作简单,电泳速度快,样品无需预先处理即可电泳。
2.琼脂糖凝胶结构均匀,含水量大(约占98%~99%),近似自由电泳,样品扩散较自由电流,对样品吸附极微,因此电泳图谱清晰,分辨率高,重复性好。
3.琼脂糖透明,无紫外线吸收。
电泳过程和结果可直接用紫外灯检测和定量测定。
4.电泳后区带易染色,样品极易洗脱,便于定量测定。
制成干膜可长期保存。
目前,琼脂糖常用作分离蛋白质和同工酶的电泳载体。
琼脂糖电泳和免疫化学的结合已经发展成为免疫电泳技术,它可以识别其他方法无法识别的复杂系统。
由于超微技术的建立,可以检测到0.1ug蛋白质。
琼脂糖凝胶电泳也常用于分离、鉴定核酸,如dna鉴定,dna限制性内切核酸酶图谱制作等。
由于这种方法操作方便,设备简单,需样品量少,分辨能力高,已成为基因工程研究中常用实验方法之一。
二、dna的琼脂糖凝胶电泳
琼脂糖凝胶电泳分离核酸主要基于它们的相对分子质量和分子构型,并且与凝胶浓度密切相关。
1.核酸分子大小与琼脂糖浓度的关系
①dna分子的大小在凝胶中,dna片段迁移距离(迁移率)与碱基对的对数成反比,因此通过已知大小的标准物移动的距离与未知片段的移动距离时行比较,便可测出未知片段的大小。
但是当dna分子大小超过20kb时,普通琼脂糖凝胶就很难将它们分开。
此时电泳的迁移率不再依赖于分子大小,因此,就用琼脂糖凝胶电泳分离dna时,分子大小不宜超过此值。
2.琼脂糖浓度如下表所示。
不同大小的DNA需要用不同浓度的琼脂糖凝胶分离。
表琼脂糖浓度和DNA分离范围
琼脂糖浓度/%线状dna大小/kb
60-5
10
7-
20-1-
0.50.40.2
0.8
6-
4-
3-0.1
0.3
零点六
0.7
0.91.21.52.0
2、核酸构型与琼脂糖凝胶电泳分离的关系
不同构型DNA的运动速度顺序为:价闭环DNA(cccDNA)>线性DNA>开环双链环状DNA。
当琼脂糖浓度过高时,圆形DNA(通常为球形)不能进入胶中,相对迁移率为0(rm=0),而相同大小的线性双链DNA(刚性杆)可以在长轴上前进(rm>0)。
可以看出,三种构型
的相对迁移率取决于凝胶浓度,但同时也受电流强度的影响。
缓冲溶液的离子强度。
3.电
泳方法:凝胶型
用于分离核酸的琼脂糖凝胶电泳可分为垂直型及水平型(平板型)。
水平型电泳时,
凝胶板完全浸泡在电极缓冲液下1-2mm,故又称为潜水式。
目前更多用的是后者,因为它
制胶和加样比较方便,电泳槽简单,易于制作,又可以根据需要制备不同规格的凝胶板,
节约凝胶,因而较受欢迎。
② 缓冲系统
缺少离子时,电流太小,dna迁移慢;相反,高离子强度的缓冲液由于电流太大会大
量产热,严重时,会造成胶熔化和dna的变性。
常用的电泳缓冲液有edta(ph8.0)和
tris-乙酸(tea),tris-硼酸(tbe)或tris-磷酸(tpe)等,浓度约为
50mmol/l(ph7.5~7.8)。
电泳缓冲液一般都配制成浓的贮备液,临用时稀释到所需倍数。
tae缓冲能力较低,后两者有足够高的缓冲能力,因此更常用。
tbe浓溶液长期贮存会出
现沉淀,为避免此缺点,室温下贮存5×溶液,用时稀释10倍0.5×工作溶液即能提供足
够缓冲能力。
③凝胶的制备
以稀释后的电极缓冲液为溶剂,用沸水浴或微波炉制备一定浓度的溶胶,倒入水平胶
框或垂直胶膜中,插入梳子中自然冷却。
④ 样品制备和添加
dna样品用适量tris-edta缓冲液溶解,缓冲液内含有0.25%溴酚蓝或其他指示染料,含有10%-15%蔗糖或5%~10%甘油,以增加其比重,使样品集中。
为避免蔗糖或甘油可
能使电泳结果产生u形条带,可改用2.5%ficoll(聚蔗糖)代替蔗糖或甘油。
⑤电泳
琼脂糖凝胶分离大分子DNA的实验条件表明,在低浓度、低电压下分离效果良好。
在
低电压条件下,线性DNA分子的电泳迁移率与电压成正比。
然而,当电场强度增加时,较
大DNA片段的迁移率增加相对较小。
因此,随着电压的增加,电泳分辨率降低。
为了获得DNA片段电泳分离的最大分辨率,电场强度不应高于5V/cm。
电泳系统的温度对DNA在琼
脂糖凝胶中的电泳行为没有显著影响。
电泳通常在室温下进行。
只有当凝胶浓度小于0.5%时,凝胶才能在4℃下电泳,以增加凝胶的硬度。
⑥ 染色和摄影
常用荧光染料溴乙锭(eb)染色,在紫外光下观察dna条带,用紫外分析仪拍照,或
用凝胶成像系统输出照片,并进行有关的数据分析。