基因表达谱对肝细胞癌的早期诊断

肝癌的基因表达谱与生物标志物肝癌是全球范围内常见的恶性肿瘤之一，其发病率和死亡率较高，给患者和社会带来了巨大负担。

在肝癌的预防、诊断和治疗中，基因表达谱和生物标志物的研究起到了至关重要的作用。

本文将探讨肝癌的基因表达谱与生物标志物，并对其在肝癌研究中的应用进行梳理和总结。

一、基因表达谱分析在肝癌研究中的应用基因表达谱是指在特定条件下细胞内各个基因的表达水平。

通过对肝癌组织与正常组织的基因表达谱进行比较分析，可以发现与肝癌发生相关的基因变化，从而揭示肝癌的发病机制和疾病进展过程。

肝癌的基因表达谱研究主要包括以下几个方面。

1. 基因的上调与下调通过对肝癌组织与正常组织进行基因表达谱分析，可以发现大量的与肝癌相关的基因在表达水平上发生明显变化。

一些促癌基因（如c-Myc、Ras等）可能会表达升高，而一些抑癌基因（如p53、p16INK4a 等）则可能会表达降低。

这些基因的变化，既反映了肿瘤细胞的异常生长特点，同时也为肝癌的治疗提供了新的靶点。

2. 细胞信号通路的异常激活肝癌的发生发展与多个细胞信号通路的异常激活有关。

基因表达谱分析可以揭示肝癌细胞中细胞周期调控、凋亡逃逸、血管新生等信号通路的异常激活情况。

例如，Wnt/β-catenin、PI3K/AKT、Raf/MAPK 等信号通路在肝癌中的激活与肿瘤的增殖、侵袭和转移密切相关。

3. 生物学分类的建立和预后指标的发现通过对不同基因表达谱的聚类分析，可以将肝癌患者分为不同的亚型，并进一步探索每个亚型的疾病特点和预后表现。

例如，Shibuya等通过基因表达谱分析将肝细胞癌分为三个亚型，发现不同亚型在转录因子活性、癌干细胞特性以及分子靶向治疗敏感性方面存在差异。

这种分类和预后指标的研究有助于个体化治疗策略的制定。

二、生物标志物在肝癌研究中的应用生物标志物是指在生物体内可以测定的特定分子或指标，可用于诊断、疾病进展监测和预后评估等方面。

肝癌的生物标志物研究主要包括以下几个方面。

肿瘤组织中miRNA表达谱的研究及其临床意义miRNA作为一种非编码RNA，在基因表达调节、细胞生长、分化、凋亡等方面发挥了重要的作用。

与基因的突变、表达失调、病毒感染等因素相关，miRNA在肿瘤发生、发展和转移中的重要地位也在逐渐被科学家予以重视。

这篇文章将重点讨论肿瘤组织中miRNA表达谱的研究及其临床意义。

一、肿瘤组织中miRNA表达谱的特点miRNA的表达谱在正常组织和癌组织中存在显著差异，其中在肿瘤组织中miRNA表达谱的变化是非常明显的。

研究表明，在肿瘤中，有一些与肿瘤的诊断、分型、预后有关、参与肿瘤发生发展的miRNA表达谱会发生改变。

例如，miR-155、miR-21、let-7、miR-34、miR-200等miRNA的异常表达在许多肿瘤中都有报道。

除此之外，miRNA在肿瘤中表达的定位也比较独特。

他们可以表达在细胞浆、细胞核、细胞外等位置。

因此，在肿瘤组织中，miRNA可能会在多个环节上参与调控肿瘤细胞的生长和分化。

二、miRNA在肿瘤诊断中的应用miRNA在肿瘤诊断中的应用一直是一个热门的研究领域。

由于miRNA在肿瘤组织中有特异性表达和稳定性，可以通过体液（如血液、尿液、组织渗出液等）中的miRNA进行非侵入性肿瘤诊断。

但是，临床表现不明显的早期肿瘤的检测中，miRNA 诊断的灵敏度和特异性并不高，因此需要与其他诊断手段结合使用。

现在已有很多研究表明，特定miRNA的组合可以作为某些肿瘤的生物标志物，辅助肿瘤的早期筛查及诊断。

例如，在前列腺癌中，miR-141 的体液检测可以帮助早期检测并诊断患者。

在肝细胞癌的分子诊断中，miR-122、miR-21、miR-224等miRNA标志物的检测也可以帮助预测肿瘤的侵袭性和预后等。

三、miRNA在肿瘤治疗中的应用除了作为肿瘤诊断的生物标志物，miRNA在肿瘤治疗中的应用逐渐得到了重视。

miRNA的特异性与细胞增殖、转移、细胞凋亡、血管生成等肿瘤病理生理过程的密切关联，使其成为肿瘤治疗的潜在靶点。

肝脏纤维化相关基因的表达变化肝脏纤维化是一种慢性肝病，其主要特征是肝细胞的死亡与替代性增生，伴随着结缔组织增生和沉积，最终导致肝功能衰竭，甚至肝癌等疾病的发生。

许多研究表明，肝脏纤维化的发生与基因的表达变化密切相关。

本文将探讨与肝脏纤维化相关的基因表达变化，并对其进行分析。

1. 肝脏纤维化的基因表达变化肝脏纤维化的发生与多种生物学过程有关，其中包括肝细胞凋亡、炎症反应、细胞外基质沉积和肝细胞再生等方面。

随着技术的升级和基因组学的发展，大规模基因表达谱分析已经成为了研究肝脏纤维化的重要手段之一。

研究证明，许多基因在肝脏纤维化中的表达出现了改变。

首先，研究发现，纤维化过程中的细胞外基质沉积和炎症反应是由多种细胞因子和生长因子介导的。

TGF-β、IL-6、TNF-α、PDGF和CTGF等生长因子在肝脏纤维化中扮演重要角色，它们影响了肝细胞的生长和分化。

在肝脏纤维化中，TGF-β的表达增加，而肝细胞本身也开始表达TGF-β。

这些因子与肝细胞的信号传导路径有关，包括Smad信号通路、MAPK信号通路和JNK信号通路等。

通过肝脏基因表达数据的分析，人们发现这些信号途径的成员基因在肝脏纤维化中的表达出现了明显变化。

其次，研究表明，肝细胞凋亡在肝脏纤维化的发生中起着重要作用。

肝细胞凋亡的过程中可能引发DNA的损伤和基因突变，从而导致肝细胞功能的丧失和肝脏纤维化的发生。

与此同时，许多研究还发现，肝脏纤维化中还涉及许多基因的表达变化。

例如，研究人员通过对肝脏基因表达数据的分析，发现将近300个基因在肝脏纤维化中发生了显著变化，其中包括与细胞凋亡有关的基因和与细胞分裂有关的基因。

2. 基因表达谱分析在研究肝脏纤维化中的应用基因表达谱分析是研究肝脏纤维化中基因表达变化的重要手段之一。

将肝脏组织中的mRNA转录为cDNA，并通过高通量测序技术进行测序，可以得到一个由许多基因表达值组成的基因表达谱。

通过分析基因表达谱中的特征基因，研究人员不仅可以找到在肝脏纤维化中发生了变化的基因，还可以从中发现新的调控通路或进行生物学系统分析。

肝癌早期检测的生物标志物筛选与实验研究肝癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一，其高度侵袭性和易转移性使之成为难治性疾病。

据统计，全球每年约有75万人死于肝癌，我国更是肝癌的高发地区之一。

与许多其他癌症一样，肝癌早期发现和治疗是预防和控制该疾病的关键。

因此，研究肝癌早期检测的生物标志物是当前的热点和难点问题之一。

生物标志物是指能够说明生物体内某种生理或病理状态的物质或指标。

在肝癌的早期检测中，生物标志物可以作为一个重要的参考。

目前，临床上用于肝癌早期筛查的生物标志物有AFP、PIVKA-II、ALT、AST、GGT、TB、ALB等。

然而，这些检测指标的特异性和敏感性都存在较大的局限，存在误诊和漏诊的风险。

在分子生物学技术不断更新的今天，通过对患者血液样本、组织样本和体液样本中生物标志物的高通量筛选，以发现能够早期和准确诊断肝癌的生物标志物，已成为研究的重点和热点。

以下将介绍目前常用的一些生物标志物筛选技术和肝癌生物标志物的研究情况。

一、基因芯片技术基因芯片技术是一种高通量筛选生物标志物的方法，其通过分析组织或细胞中的RNA或DNA来获取分子水平的信息。

通过将数以万计的基因序列固定在一个晶片上，检测样本中的RNA或DNA与芯片上的基因序列的杂交程度，可以快速地得到许多生物标志物的表达情况，为寻找肝癌早期生物标志物提供了重要的依据。

目前，该技术已被广泛应用于肝癌的研究，如对比肝癌与正常肝组织的基因表达谱、对比不同肝癌患者的基因表达谱、对比肝癌早期与晚期患者的基因表达谱等。

例如，研究表明，在肝癌组织中，FAM19A4、TMEM106B、AP1S2、IGHG1等基因的表达显著下调，而DSC2、SLC25A13、KRT6C等基因的表达显著上调，这些基因可以作为评估肝癌预后和治疗效果的生物标志物。

二、蛋白质芯片技术蛋白质芯片技术是一种用于分析大量蛋白质表达水平的高通量生物芯片技术。

该技术通过将数千个蛋白质固定在晶片上，将样本中的蛋白质与晶片上的蛋白质发生特异性的相互作用，以确定不同生物样本中的蛋白质表达量和表达模式，可以为肝癌早期诊断和治疗提供重要的生物标志物。

全局基因表达谱的转录组学分析及其在疾病诊断中的应用研究随着基因测序技术的不断发展，尤其是基因芯片技术的广泛应用，全局基因表达谱转录组学分析已成为研究基因功能及其与疾病关系的重要手段。

本文旨在探讨全局基因表达谱分析在疾病诊断中的应用研究。

一、全局基因表达谱的转录组学分析是什么全局基因表达谱是指在给定条件下，在特定组织或细胞类型中所有基因的表达水平。

转录组是指特定组织或细胞类型中所有RNA分子的总和。

因此，全局基因表达谱转录组学分析是基因和RNA分子在特定条件下表达的总体分析。

这种分析可以为研究基因功能和疾病诊断提供有价值的信息。

二、全局基因表达谱分析在疾病诊断中的应用1. 疾病分类和分级利用全局基因表达谱分析可以确定对不同疾病分析的独特转录组变化。

这种方法可以进一步鉴别疾病类型和分级。

例如，在肺癌分析中，全局基因表达谱分析可以区分肺腺癌和鳞状细胞癌。

2. 预后分析和治疗反应预测全局基因表达谱分析还可以用于预测疾病预后和治疗反应。

例如，在肝癌患者中，全局基因表达谱分析可以用于预测肝癌再发风险和预测化学药物疗效。

3. 诊断和治疗全局基因表达谱的分析可以直接用于疾病诊断和治疗。

例如，在乳腺癌分析中，全局基因表达谱分析可以用于区分好发和难于治疗的肿瘤类型。

三、全局基因表达谱分析技术的优势全局基因表达谱转录组学分析具有许多重要的优势。

它可以为研究疾病机制和疾病标志物提供更加全面的知识。

此外，全局基因表达谱分析可以在很短的时间内分析大量样本，减少测试时间和成本。

最后，这种分析可以建立起疾病预测模型，从而为疾病治疗提供准确和高效的方法。

四、全局基因表达谱分析在疾病诊断中的挑战全局基因表达谱的转录组学分析在实际应用中仍然存在挑战。

一个主要的挑战是解释大量与疾病有关的信号，因为大量信号有时可能受到模型复杂性和实验噪声的影响。

另一个挑战是如何在大量信号中发现真正的生物学意义。

解决这些挑战需要不断改进分析算法和开发更加精准的法定试剂盒。

肝癌的转录组学和单细胞测序技术肝癌是全球范围内最常见的癌症之一，也是导致癌症相关死亡的主要原因之一。

肝癌的早期诊断和个体化治疗一直是医学研究的焦点。

近年来，转录组学和单细胞测序技术的发展为肝癌的研究提供了重要工具。

本文将就肝癌的转录组学和单细胞测序技术的应用进行探讨。

一、转录组学在肝癌研究中的应用转录组学研究通过分析基因转录水平的变化，揭示了肝癌中的关键基因和信号通路。

该技术可以帮助我们深入了解肝癌的致病机制，并为肝癌的早期诊断和治疗提供新的思路。

1. 转录组学揭示的潜在靶点通过对肝癌组织和非肿瘤组织的基因表达进行比较分析，转录组学研究已经发现了多个与肝癌发生密切相关的基因。

例如，长链非编码RNA（lncRNA）HOTAIR在肝癌细胞中被高表达，其通过调控染色质结构和表观遗传修饰，影响了多个肝癌相关基因的表达。

另外，通过转录组学的研究，发现肝癌细胞中表达上调的miR-21可通过干扰抗凋亡蛋白PDCD4的表达而促进肝癌细胞的增殖和转移。

2. 信号通路的调控网络转录组学的研究还揭示了肝癌中的多个调控网络，这些网络与肝癌的发生和发展密切相关。

例如，转录组学的研究发现，Wnt/β-catenin 信号通路在肝癌中的异常激活与肿瘤细胞的增殖和转移密切相关。

研究发现，通过抑制GSK-3β的活性、降解β-catenin以及调控β-catenin的下游基因表达，可以有效抑制肝癌细胞的生长和转移。

二、单细胞测序技术在肝癌研究中的应用单细胞测序技术是一种能够对细胞进行高通量测序的技术。

相比于传统的测序方法，单细胞测序技术在细胞层面的分析上具有更高的分辨率和准确性。

1. 单细胞测序技术的突破传统的肝癌研究往往只能给出肿瘤整体的基因表达情况，对于不同细胞类型之间的差异和细胞内的异质性缺乏细致的认识。

而单细胞测序技术的出现，使得我们可以对肿瘤组织中单个细胞进行全面的测序，从而揭示出不同细胞类型之间的差异以及细胞内的异质性。

肝癌的分子诊断技术研究——让诊断更准确、治疗更有效肝癌是世界范围内常见的恶性肿瘤之一，其高度恶性、快速扩散、缺乏有效治疗方法等特点，使得肝癌的治疗成为医学研究领域的一大难题。

目前，随着基因检测技术不断的发展和进步，分子诊断技术成为肝癌基础研究和临床治疗的重要手段，有望在诊断、预测、治疗和预后评估等方面发挥重要作用。

一、分子诊断技术的基本原理分子诊断技术是基于生物分子的物理、化学和生物学特性，通过检测和分析患者体内蛋白质、DNA、RNA等分子物质，发现肿瘤的特异性标志物，实现对肿瘤的早期检测、分类诊断和预后评估。

该技术主要包括遗传学检测技术、蛋白质质谱技术、核酸芯片技术、荧光定量PCR技术等。

二、进展（1）基因检测技术近年来，基因检测技术在肝癌研究中得到广泛应用，其研究内容主要包括基因表达谱、突变检测、CNV分析、启动子甲基化等。

基因表达谱研究表明，在肝癌的发生和发展过程中，多个基因表达异常，如TP53、Rb、p16、NF-κB等。

突变检测和CNV分析发现在肝癌组织中常伴随着多种基因突变和拷贝数变化，在特异性表达的突变点和蛋白质异常改变等方面具有很高的参考价值。

启动子甲基化可以影响基因的表达，并被证实与肝癌的发生和发展密切相关。

（2）蛋白质质谱技术蛋白质毒性和转录后调控的突出地位已经引起了科学家们的广泛关注，蛋白质质谱技术已经成为了分子生物学研究中的重要实验技术。

近年来，蛋白质质谱技术的应用在肝癌诊断研究中得到了广泛应用。

例如，用蛋白质质谱技术对肝细胞癌相关蛋白进行鉴定，筛选出31个肝癌独有蛋白，这些蛋白可作为肝癌的新的诊断标志物。

同时，通过比较肝癌转移组织和原发肝癌组织的蛋白质谱，研究发现细胞复杂度和AKT信号通路在肝癌转移过程中起着关键作用。

（3）核酸芯片技术肝癌核酸芯片技术是一种新的高通量检测技术，可以同时检测数百万个基因的表达情况，是分子诊断技术中的一种新兴技术，其技术主要通过在芯片上固定上数百万个核酸探针，来检测患者样本中的核酸序列，从而确定不同基因的表达情况。

发掘新的生物标志物可能为恶性肿瘤诊治提供新的思路，从而改善疾病预后。

癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas，TCGA)计划是迄今为止世界上最大的癌症基因信息数据库，为肿瘤基础医学和转化医学研究者提供海量的基因组数据和与其关联的临床数据，为寻找恶性肿瘤生物标志物，甚至为药物靶标的筛选，提供重要线索[4]。

UALCAN数据库是由哈佛大学医学院附属丹娜法伯肿瘤研究院开发和维护更新，使用TCGA的3级RNA-seq数据，对30余种不同肿瘤类型中约20500个蛋白质编码基因进行基因表达和生存分析的数据库网站[5]。

近年研究表明，BRCA1相关蛋白1(BRCA1associ-ated protein1，BAP1)与肿瘤的发生发展有一定的关系。

BAP1是一种泛素羧基末端水解酶(ubiquitin carbox-yl-terminal hydrolase，UCH)[6]，其与许多肿瘤的发生发展关系密切。

BAP1通过去泛素化作用，参与基因转录调控、表观遗传调控、DNA损伤修复等过程[7]，发挥抑癌作用[8]。

临床实践工作中NGS检测发现肝癌患者存在BAP1基因突变的病例，但病例数量十分有限。

查阅文献，有学者曾分析TCGA中364例HCC患者有效数据，与正常组织相比，BAP1在HCC样本中突变差异显著，男性高于女性，BAP1高表达提示生存预后差[9]。

本文进一步扩大研究广度和深度，利用TCGA、UALCAN等数据库，采用生物信息学分析方法，旨在探讨BAP1在LIHC中的表达及其与预后的关系，并初步分析BAP1在泛肿瘤和正常组织的表达与预后情况，为寻找新的LIHC生物标志物及有效的靶向精准治疗提供研究基础。

1资料与方法1.1数据资料下载及处理从UALCA获得TC-GA数据库中LIHC(即TCGA-LIHC)的BAP1mRNA 表达水平及临床数据。

包含癌组织样本371例，正常组织样本50例。

BAP1的mRNA表达数据均进行log2(TPM+1)或log2(FPKM+1)的形式转换。

肝癌的转录组和表观遗传学研究肝癌是一种高度复杂且致命的肿瘤类型，其发病机制至今尚不完全清楚。

然而，随着转录组学和表观遗传学的快速发展，我们对于肝癌发生和发展的研究取得了突破性进展。

本文将对肝癌的转录组和表观遗传学研究进行探讨，以期增加对这一疾病的认识。

一、转录组学研究转录组学是研究细胞内所有转录本的产物，即mRNA的全集。

通过转录组学研究，我们可以全面了解肝癌中基因表达的变化情况，从而揭示其发生机制。

研究表明，与正常细胞相比，肝癌细胞中存在大量基因的异常表达。

这些异常表达的基因涉及到细胞生长、凋亡、血管生成等重要生物学过程，从而导致了肝癌的发展。

1. 转录组变异与肝癌研究发现，肝癌细胞中存在大量的基因变异。

这些变异可能是由致癌基因的点突变、染色体结构异常或基因拷贝数的改变所导致。

通过对这些变异基因的分析，我们可以发现一些与肝癌进展相关的重要驱动基因。

例如，肝癌中常见的TP53基因突变在细胞凋亡的调控中起着关键作用。

2. 转录组学的亚型分类基于转录组学的研究，肝癌可以被进一步分为不同的亚型。

这些亚型在基因表达模式、临床症状和预后上存在差异。

通过对肝癌亚型的研究，我们可以更好地了解肝癌的异质性，并为个体化治疗提供依据。

3. 转录组学在预后评估中的应用转录组学研究不仅可以帮助我们理解肝癌的发生机制，还可以用于预测肝癌患者的预后。

通过分析肝癌组织中的基因表达谱，我们可以得到与预后相关的基因指标，为临床预后评估提供参考。

二、表观遗传学研究表观遗传学是研究影响基因表达的可逆性调控机制。

在肝癌中，表观遗传学调控的异常常常导致基因的错配表达，从而促进肿瘤的发展。

1. DNA甲基化DNA甲基化是表观遗传学中最为重要的调控方式之一。

研究发现，在肝癌中存在大量基因的异常DNA甲基化。

这些异常的DNA甲基化可能导致基因的沉默或过度表达，从而促进肝癌的发生。

2. 组蛋白修饰组蛋白修饰是另一种常见的表观遗传学调控方式。

研究表明，在肝癌中存在组蛋白修饰的异常，如乙酰化、甲基化和泛素化等。

·临床论著·Clinical Article·[作者简介]帕成周,云南盈江人,硕士研究生,研究方向:肝胆外科基础与临床研究。

E-mail:**************.com [通讯作者]邬善敏,博士,教授,主任医师,研究方向:肝胆外科基础与临床。

E-mail:153****************肝细胞癌组织中CYP27A1的表达及其临床意义帕成周邬善敏武汉大学人民医院肝胆外科（湖北武汉430060）272原发性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)是最常见的恶性肿瘤之一,在我国发病率居恶性肿瘤第四位,病死率居恶性肿瘤第三位[1]。

HCC 主要危险因素为慢性丙型肝炎病毒(HCV)和(或)乙型肝炎病毒(HBV)感染、重度饮酒、糖尿病,以及非酒精性脂肪性肝病。

HCC早期诊断困难、术后高复发率使其总体预后仍不理想。

胆固醇27-羟化酶(CYP27A1)由CYP27A1基因编码,为细胞色素P450氧化酶家族成员之一。

近年研究发现CYP27A1与多种肿瘤的发生、发展密切相关,在前列腺癌、膀胱癌、乳腺癌中低表达[2-5],但在HCC中的作用机制尚不明确。

本研究通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库,比较CYP27A1在HCC组织和正常肝组织中的表达,分析CYP27A1与HCC临床病理因素和预后的关系,探讨CYP27A1在HCC发生发展中的作用。

1资料与方法1.1数据来源自TCGA数据库官网(https://por⁃/)下载HCC和正常肝组织数据,包括经校正后的RNA-Seq基因表达谱及相对应的临床资料。

1.2方法1.2.1数据集筛选下载的TCGA数据集包含HCC组织病例样本374例,正常肝组织50例,均包含详实的临床病理参数和预后资料,进行生存分析时筛除1例缺失随访信息的资料,进行Cox 回归分析仅保留具有完整临床资料的235例HCC 数据。

《基于生物信息学发现肝细胞癌标志性miRNA及作用与机制研究》篇一一、引言肝细胞癌（Hepatocellular Carcinoma, HCC）是全球范围内最常见的致死性恶性肿瘤之一，早期诊断与治疗的挑战一直阻碍了患者康复与预后。

随着生物信息学与高通量测序技术的发展，多种疾病特异性微小RNA（microRNAs, miRNAs）作为非编码小分子RNA成为了诊断、预后和靶向治疗的热点研究对象。

本研究将重点讨论通过生物信息学分析所发现的肝细胞癌标志性miRNAs，及其在HCC的病理机制与治疗作用。

二、方法本研究采用生物信息学方法，结合高通量测序技术，对肝细胞癌患者与健康人群的miRNA表达谱进行对比分析。

通过数据挖掘、差异表达分析、功能富集分析等手段，找出肝细胞癌的标志性miRNAs，并进一步对其功能及作用机制进行研究。

三、结果（一）肝细胞癌标志性miRNAs的发现通过高通量测序与生物信息学分析，我们成功筛选出若干在肝细胞癌中显著差异表达的miRNAs。

其中，特定miRNAs在肝细胞癌患者中的表达明显高于或低于健康人群，显示出显著的差异表达模式。

这些miRNAs可能是肝细胞癌发生、发展的关键调控因子。

（二）miRNAs的功能与作用机制研究1. 靶基因预测与功能富集分析：通过生物信息学软件预测这些miRNAs的靶基因，并进行功能富集分析。

我们发现这些miRNAs主要参与细胞增殖、凋亡、侵袭和转移等生物过程，与肝细胞癌的发生、发展密切相关。

2. 信号通路分析：通过分析miRNAs调控的信号通路，我们发现这些miRNAs在肝细胞癌中主要参与Wnt、TGF-β、MAPK 等重要信号通路，对肿瘤细胞的生长、迁移和侵袭具有重要影响。

3. 临床意义：通过对肝细胞癌患者临床样本的检测，我们发现这些标志性miRNAs的表达水平与患者的预后、复发和转移密切相关。

这为肝细胞癌的早期诊断、预后评估和个体化治疗提供了新的可能。

Midkine(MDK)在肝细胞癌(HCC)中的表达及其临床意义朱文伟;张巨波;郭磊;张博;叶青海【摘要】Objective To investigate the expression level of Midkine (MDK) in hepatocellular carcinoma ( HCC) and evaluate the clinical diagnostic value of serum MDK for HCC. Methods MDK expression was separately assessed by immunohistochemistry and Western blot in 50 tissue samples (30 from HCC tissues, 10 from cirrhotic tissues and 10 from normal liver tissues) and 7 different cell lines. Serum MDK levels were detected by Enzyme-linked immunosorbent assay in 120 participants including HCCs and controls. Its diagnostic value of HCC was further analyzed. Results MDK level was significantly elevated in HCC tissues compared with cirrhotic tissues (77% vs. 30%; P<0. 01) and normal liver tissues (77% to. 0%; P<0. 001). In addition, MDK was widely up-regulated in HCC cell lines. Moreover, serum MDK was significantly elevated in HCC patients (1. 195 ng/mL,0. 84 — 1.71) compared with healthy donors (0. 102 ng/mL,0. 02-0. 53;P<0. 01),HBV related cirrhosis (0. 57 ng/mL,0. 26 - 0. 67;P<0. 05)and HCV related cirrhosis (0. 34 ng/mL,0. 09 - 0. 56;P<0. 01). Conclusions MDK is significantly elevated in HCC patients. Serum MDK may serve as a novel diagnostic tumor marker for HCC.%目的探讨Midkine (MDK)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)组织中的表达以及检测血清MDK对于肝癌诊断的初步临床意义.方法通过免疫组织化学染色和Western blot法检测50例临床样本(包含肝癌,肝硬化及正常肝组织)及7种不同肝癌细胞系中MDK表达情况；进一步通过酶联免疫吸附反应定量检测120例不同受试人群的血清样本,分析血清MDK在诊断肝癌中的初步临床意义.结果肝癌组织中MDK表达阳性率显著高于肝硬化(77％ vs.30％,P＜0.01)及正常肝组织(77％ vs.0％,P＜0.001)；Western blot检测结果显示,MDK在多株肝癌细胞系中表达上调；此外,HCC患者血清MDK的中位数水平(1.195 ng/mL,0.84～1.71)较正常人(0.102 ng/mL,0.02～0.53;P＜0.01)、HBV相关肝硬化(0.57 ng/mL,0.26～0.67;P＜0.05)和HCV相关肝硬化(0.34 ng/mL,0.09～0.56;P＜0.01)患者显著升高.结论 MDK在HCC患者中的表达显著上调,血清检测MDK可作为临床诊断肝癌的重要方法.【期刊名称】《复旦学报（医学版）》【年(卷),期】2013(040)001【总页数】5页(P55-59)【关键词】肝细胞癌(HCC);Midkine (MDK);肿瘤标记物【作者】朱文伟;张巨波;郭磊;张博;叶青海【作者单位】复旦大学附属肿瘤医院胰腺肝胆外科上海200032;复旦大学附属中山医院肝癌研究所肝外科上海200032;复旦大学附属中山医院肝癌研究所肝外科上海200032;复旦大学附属中山医院肝癌研究所肝外科上海200032;复旦大学附属中山医院肝癌研究所肝外科上海200032【正文语种】中文【中图分类】R730.23肝细胞癌(hepatocellular carcinoma，HCC)是我国常见的恶性肿瘤之一，预后很差，5年生存率不到5%，排在我国癌症死因第2位［1］。

肝癌的组织病理学诊断肝癌是一种常见且致命的恶性肿瘤，通过组织病理学的诊断可以明确肿瘤的类型、分级和分期，为个体化治疗提供重要依据。

本文将探讨肝癌组织病理学诊断的方法与应用。

一、肝癌的组织病理学特征肝癌主要分为原发性肝癌和继发性肝癌两类。

原发性肝癌包括肝细胞癌和胆管细胞癌，而继发性肝癌则来自于其他器官的转移。

肝癌在显微镜下呈现出一些典型的组织病理学特征，如细胞排列方式、细胞形态和细胞核特征等。

肝细胞癌一般呈现出巢状、索状或腺管样排列。

肿瘤细胞的形态多样，包括多核细胞、巨细胞和浸润性生长的细胞。

肝细胞癌的细胞核通常呈椭圆形，核分裂像较少，核染色质分散。

而胆管细胞癌则表现为呈肿块状的、导管样结构的肿瘤。

二、肝癌的分级与分期肝癌的分级和分期对于治疗方案的选择和预后评估至关重要。

组织学分级是根据肿瘤细胞的形态及组织结构进行评估的，而病理分期则是通过观察肿瘤的深度浸润、淋巴结转移和远处转移来判断。

肝癌的分级主要采用Edmondson-Steiner分级法，将肝细胞癌分为四个不同等级，即Ⅰ级、Ⅱ级、Ⅲ级和Ⅳ级，分别代表肿瘤细胞的分化程度和增殖指数。

分期则使用国际抗癌联盟（UICC）的TNM分期系统，根据肿瘤的大小、深度浸润、淋巴结转移和远处转移来判断肿瘤的分期。

三、肝癌的免疫组织化学检测免疫组织化学检测是一种重要的诊断工具，可以通过检测肿瘤标记物的表达情况来帮助确定肝癌的类型和分级。

常用的免疫组织化学标记物包括肝特异性糖蛋白（Hepatocyte Specific Antigen，HSA）、甲胎蛋白（Alpha Fetoprotein，AFP）和细胞角蛋白19（Cytokeratin 19，CK19）等。

HSA是肝细胞和肝癌细胞的特异性标记物，免疫组织化学检测HSA的表达情况可以帮助区分原发性肝癌和继发性肝癌。

AFP是很多肝癌患者血清中常见的肿瘤标记物，同时也是免疫组织化学诊断肝癌的重要指标。

四、肝癌的分子病理学检测肝癌的分子病理学检测可以帮助进一步了解肿瘤的发生机制和预后。

基因表达谱的分析与差异基因筛选研究随着早期癌症的基因诊断技术不断发展，基因表达谱已经成为了癌症筛选和预测的重要指标。

本文将从基本概念入手，介绍基因表达谱的分析方法以及如何通过分析得到差异表达的基因，为癌症的早期诊断和治疗提供帮助。

一、基因表达谱的基本概念基因表达谱是指针对一个生物、一个组织、一个细胞或特定情境下的基因表达状况的描述，通常使用基因芯片、RNA-seq等高通量测序技术获取。

基因表达谱可以反映生物在不同时期、不同环境中基因的表达状态，同时也可以揭示疾病发生的分子机制，成为了分子诊断和治疗的基础研究工具。

基因表达谱主要分为两种类型，即绝对表达水平和相对表达水平。

前者是指基因在细胞中的转录水平或蛋白质表达水平的具体值，后者则是相对于其他同样测量的基因的表达水平（一般是在同一组织或同一时期测得的基因表达数据为基础）二、基因表达谱的分析方法1.标准化处理基因表达谱分析中，由于实验条件和仪器的限制，不同样本的基因表达水平数值间有着很大的悬殊，因此需要进行标准化处理以消除偏差。

常见的标准化方法有Quantile、RMA和Loess等。

2.差异基因筛选差异基因指在两个或两个以上组间（如对照组和实验组）中表达水平有显著差异的基因。

差异基因筛选的方法包括t检验、方差分析、Wilcoxon秩和检验、FDR 等。

3.聚类分析聚类分析是对基因表达谱数据进行分级标记的一种方法。

通过对样本间的相似性进行计算，将高一致性的数据点进行聚类，以便比较和分析。

4.生物信息学分析生物信息学分析是将大量的基因表达谱数据梳理出来，并将其与已有的数据库和文献进行比较、分类、分类和注释的一种方法，从而找到潜在的分子机制。

三、差异基因筛选方法及其优缺点1.基于t检验的差异基因筛选t检验是基于均值、方差和样本大小的统计方法，一般用于比较两个样本的均值是否存在显著性差异。

在差异基因筛选中，t检验可以直接根据两组的均值、方差和大小来计算基因表达谱的差异程度。

肝癌的体外诊断和分子检测技术肝癌是一种常见的消化系统恶性肿瘤，其早期诊断对患者的治疗和预后具有重要意义。

随着医学科技的不断进步，肝癌的体外诊断和分子检测技术也不断发展和完善。

本文将就肝癌的体外诊断和基因检测技术进行探讨。

一、肝癌的体外诊断技术目前，肝癌的体外诊断主要包括血液学检查、影像学检查和肿瘤标志物检测。

血液学检查可以通过血常规、肝功能检查、AFP（甲胎蛋白）等指标来评估肿瘤的发生和发展情况。

影像学检查包括超声检查、CT （计算机断层扫描）和MRI（核磁共振成像）等，可以帮助医生判断肿瘤的大小、位置和侵袭范围。

肿瘤标志物检测是通过检测血液中的特定蛋白质、酶或基因等来辅助肝癌的诊断，如AFP、CA19-9、CA125等。

二、肝癌的分子检测技术1. DNA测序技术DNA测序技术是目前肝癌分子检测的重要手段之一。

通过对肝癌患者肿瘤组织或血液中的DNA进行测序，可以发现与肝癌相关的基因突变、基因重排等。

这些基因变异的信息可以提供给医生，帮助他们进行更准确的诊断和治疗选择。

同时，DNA测序技术还可以用于监测肝癌治疗过程中的基因变异，评估疗效和预测患者的预后。

2. RNA表达谱分析技术RNA表达谱分析技术是通过检测肝癌患者肿瘤组织中的RNA，确定其表达水平和模式。

通过与正常组织进行比较，可以发现与肝癌相关的RNA分子，揭示肝癌发生和发展的分子机制。

这种技术可以为肝癌的早期诊断和治疗提供重要的参考依据。

3. 微小RNA检测技术微小RNA是一类长度为18-25个核苷酸的非编码RNA分子，它在调控基因表达和蛋白质合成中起着重要的作用。

研究表明，某些微小RNA的表达与肝癌的发生和预后有关。

因此，通过检测肝癌患者血液中的微小RNA，可以辅助肝癌的早期诊断和预后评估。

4. 肿瘤DNA甲基化检测技术肿瘤DNA甲基化是一种常见的表观遗传学改变，与肝癌的发生和发展密切相关。

通过检测肝癌患者肿瘤组织或血液中的DNA甲基化水平，可以发现与肝癌相关的甲基化位点，为肝癌的早期诊断和治疗提供参考。