实验室常见大肠杆菌
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大肠杆菌培养引言大肠杆菌(Escherichia coli)是一种广泛存在于自然界中的革兰氏阴性细菌。
它是一种常见的微生物实验室模型生物,在分子生物学研究、基因工程、生物技术等领域发挥着重要作用。
本文将介绍大肠杆菌的培养方法,包括培养基的配制、接种方法、培养条件的控制等。
培养基配制大肠杆菌培养基的配制是培养大肠杆菌的重要前提,不同的菌株和研究目的需要使用不同的培养基。
下面介绍两种常用的培养基配方:Luria-Bertani(LB)培养基LB培养基是最常用的大肠杆菌培养基之一,它是一种富含营养物质的培养基,适用于一般的大肠杆菌培养。
配方:•水:800 ml•Bacto-tryptone:10 g•Yeast extract:5 g•NaCl:10 g•琼脂:15 g将上述成分加入水中,搅拌均匀,然后加热至溶解,最后将pH调节至7.0 ± 0.2。
M9盐基培养基M9盐基培养基是一种缺乏有机碳源和氮源的无营养培养基,适用于研究大肠杆菌的生理特性或用于表达外源蛋白。
配方:•水:700 ml•Na2HPO4:12.8 g•KH2PO4:3 g•NH4Cl:1 g•NaCl:0.5 g•CaCl2:0.1 g•MgSO4:0.2 g•葡萄糖:2 g•琼脂:15 g将上述成分加入水中,搅拌均匀,然后加热至溶解,最后将pH调节至7.0 ± 0.2。
接种方法大肠杆菌的接种方法有多种,常见的有无菌接种环和无菌注射器接种法。
下面分别介绍这两种接种方法:无菌接种环接种法步骤:1.用火焰将无菌接种环烧红,冷却至适宜温度。
2.打开培养基瓶盖,用无菌接种环蘸取待接种的大肠杆菌菌株。
3.快速将无菌接种环插入含有培养基的琼脂平板(或试管)中,并迅速转动接种环1-2圈,使菌体均匀分布在琼脂平板(或液体培养基)表面。
4.关闭琼脂平板(或试管)盖子,使琼脂凝固后,将琼脂平板(或试管)置于适宜的培养条件下。
无菌注射器接种法步骤:1.用火焰将无菌注射器的针头烧红,冷却至适宜温度。
纯化大肠杆菌的方法大肠杆菌(Escherichia coli)是一种常见的肠道菌,也是许多生物学实验室中最常用的微生物之一。
在进行分子生物学和遗传学研究时,纯化大肠杆菌是必不可少的步骤之一。
纯化大肠杆菌的目的是将目标菌种从其他微生物(如其他细菌、真菌)和杂质中分离出来,以便后续的实验操作。
以下是一种常用的纯化大肠杆菌的方法:1. 培养大肠杆菌首先,需要选择一株含有目标基因的大肠杆菌株,并进行培养。
将该菌株接种到含有合适营养物质的培养基中,并在适当的温度下培养。
常用的培养基包括Luria-Bertani培养基(LB培养基)等。
2. 收获大肠杆菌在培养过程中,大肠杆菌会进入对数生长期。
当细菌数量达到一定程度时,可以收获细菌。
收获大肠杆菌的方法有两种:离心收获和滤膜收获。
离心收获适用于较大规模的细菌培养,而滤膜收获适用于小规模的细菌培养。
3. 细胞破碎将收获的大肠杆菌细胞进行破碎,以释放细胞内的目标蛋白或核酸。
细胞破碎的方法有多种,包括机械破碎、超声波破碎和化学破碎等。
机械破碎是最常用的方法之一,可以使用搅拌器或高压均质器对细胞进行破碎。
4. 离心分离通过离心将细胞的残渣和细胞碎片与溶解的目标物分离。
首先,通过低速离心将细胞碎片和细胞碎片从溶解的目标物中分离出来。
然后,通过高速离心将残留的细胞碎片和杂质从溶解的目标物中完全清除。
5. 溶解目标物将离心分离的溶解物中的目标物进行溶解,得到纯净的目标蛋白或核酸。
溶解的方法根据目标物的性质不同而不同,可以使用洗脱缓冲液、盐溶液或变性剂等。
溶解后,可以通过低速离心将溶解物中的可溶性目标物与不溶性杂质分离。
6. 纯化目标物将溶解的目标物进行纯化,以获得纯净的目标蛋白或核酸。
常用的纯化方法包括亲和层析、凝胶过滤层析、离子交换层析和透析等。
选择合适的纯化方法可以根据目标物的性质和目标物与杂质之间的亲和性进行选择。
7. 鉴定目标物对纯化后的目标物进行鉴定,确保纯化的目标物具有预期的功能和性质。
大肠杆菌培养基大肠杆菌(Escherichia coli)是一种革兰氏阴性杆菌,是一种常见的肠道细菌,也是一种重要的实验室模式生物。
大肠杆菌培养基是一种用于培养和繁殖大肠杆菌的营养培养基,它提供了大肠杆菌所需的营养物质和生长条件,使其能够在实验室中进行研究和应用。
大肠杆菌培养基的组成。
大肠杆菌培养基的组成通常包括以下成分:1. 碳源,大肠杆菌需要碳源来进行能量代谢和生长。
常见的碳源包括葡萄糖、蔗糖、乳糖等。
2. 氮源,氮源是大肠杆菌合成蛋白质和核酸的重要原料。
常见的氮源包括氨基酸、氨基酸盐、蛋白胨等。
3. 矿物盐,矿物盐是细胞生长和代谢所必需的微量元素,如钙、镁、钾、磷等。
4. 生长因子,大肠杆菌培养基中通常还添加了一些生长因子,如维生素、核酸、辅酶等,以促进大肠杆菌的生长和繁殖。
5. pH调节剂,培养基的pH值对大肠杆菌的生长有重要影响,通常需要添加pH调节剂来保持培养基的适宜pH范围。
根据不同的研究目的和实验条件,大肠杆菌培养基的配方会有所不同,可以根据实际需要进行调整和优化。
大肠杆菌培养基的制备方法。
大肠杆菌培养基的制备方法相对简单,一般包括以下步骤:1. 称取适量的葡萄糖、蛋白胨、氯化钠等成分,加入适量的蒸馏水中,搅拌均匀。
2. 调节pH值至适宜范围,通常大肠杆菌培养基的pH范围为7.0-7.4。
3. 加热蒸馏水,使培养基成分充分溶解。
4. 经过高温高压灭菌,使培养基无菌。
5. 分装培养基到适量的培养皿或试管中,待凝固后即可使用。
根据实验需求,可以添加抗生素、染色剂等成分,以实现对大肠杆菌的选择性培养。
大肠杆菌培养基的应用。
大肠杆菌培养基在科研和实验室应用中具有广泛的用途,主要包括以下几个方面:1. 细菌学研究,大肠杆菌培养基常用于大肠杆菌的分离、鉴定和培养,用于研究其生长特性、代谢途径、致病机制等。
2. 分子生物学实验,大肠杆菌是常用的重组DNA宿主细胞,大肠杆菌培养基可用于大肠杆菌的转化、表达、筛选等实验。
多亚基蛋白表达大肠杆菌大肠杆菌是一种常见的革兰氏阴性菌,广泛存在于自然环境中,同时也是一种重要的实验室模式生物。
多亚基蛋白(subunit protein)是指由多个亚基组成的蛋白质。
在大肠杆菌中,多亚基蛋白的表达是一种重要的研究手段。
多亚基蛋白的表达过程可以分为三个主要步骤:基因克隆、表达载体构建和大肠杆菌转化。
基因克隆是制备多亚基蛋白表达所必需的第一步。
研究人员首先需要从某种生物体中提取目标蛋白的基因序列,并使用聚合酶链式反应(PCR)扩增得到目标基因。
接下来,将扩增得到的基因与表达载体进行连接,通常采用限制性内切酶切割和连接酶连接的方法。
最后,将连接好的基因插入到大肠杆菌的表达载体中。
接下来,通过表达载体构建,将目标基因导入大肠杆菌中。
表达载体是一种能够在大肠杆菌中稳定复制并表达目标基因的DNA分子。
常见的表达载体包括质粒和噬菌体。
将表达载体导入大肠杆菌后,通过培养和筛选,筛选出含有目标基因的大肠杆菌。
将含有目标基因的大肠杆菌进行培养和诱导表达。
培养过程中,研究人员需要提供适宜的培养基,以提供菌体生长所需的营养物质。
同时,还需要对培养条件进行优化,如温度、pH值和氧气含量等。
在诱导表达过程中,可以通过添加诱导剂,如异丙基β-D-硫代半乳糖苷(IPTG),来激活目标基因的表达。
多亚基蛋白在大肠杆菌中的表达具有许多重要的应用。
首先,通过对目标蛋白进行表达和纯化,可以用于蛋白质结构和功能的研究。
其次,多亚基蛋白的表达还可用于制备抗原,用于疫苗研究和诊断试剂的开发。
此外,通过对多亚基蛋白表达的调控研究,可以深入了解蛋白质合成和调控机制。
总结起来,多亚基蛋白在大肠杆菌中的表达是一种常用的研究手段。
通过基因克隆、表达载体构建和大肠杆菌转化等步骤,可以将目标基因导入大肠杆菌中,并通过培养和诱导表达得到目标蛋白。
多亚基蛋白的表达在生物学研究中具有广泛的应用价值,可以用于蛋白质结构和功能的研究,以及抗原制备和蛋白质调控机制的研究。
大肠杆菌的代谢途径及调控机制大肠杆菌(Escherichia coli)是一种广泛存在于自然环境中的革兰氏阴性杆菌。
它是常见的消化道菌群成员之一,也是重要的实验室模式生物。
大肠杆菌代谢途径的理解对于理解生命现象的各个层面具有重要意义。
在本文中,将介绍大肠杆菌的代谢途径及调控机制。
总体代谢途径大肠杆菌的代谢途径可以分为两个部分:有氧代谢和厌氧代谢。
有氧代谢是指在有足够含氧量的情况下,细胞利用氧气氧化代谢底物,产生更多的ATP。
厌氧代谢是指在缺氧的情况下,细胞不利用氧气氧化代谢底物,在发酵作用下产生更少的能量。
这两种代谢途径为大肠杆菌提供了在不同环境下生存的能力。
有氧代谢途径大肠杆菌的有氧代谢主要包括三种途径:糖酵解途径、三羧酸循环及呼吸链。
糖酵解途径:大肠杆菌中最为重要的代谢途径是糖酵解途径。
它包括十个步骤,将葡萄糖分解为两个分子的丙酮酸,同时产生两个分子的ATP。
在乳酸菌等其他微生物中,糖酵解途径可直接生成乳酸。
但大肠杆菌的糖酵解途径最终生成的是丙酮酸、乳酸、乳酸酸或无氧乙酸。
这些化合物可以被呼吸链进一步代谢,在细胞内持续产生能量。
三羧酸循环:大肠杆菌的三羧酸循环是一种周期性的反应,在细胞内循环进行。
三羧酸循环也被称为卡布酸循环或柠檬酸循环。
它涉及到多个底物的代谢,包括葡萄糖、脂肪酸和蛋白质分解生成的氨基酸。
三羧酸循环的反应产生NADH和FADH2,这些被转移到呼吸链中,进一步产生ATP。
呼吸链:呼吸链是由一系列氧化还原反应组成的过程。
在有氧条件下,细胞通过呼吸链转移电子,并最终将它们转移到氧分子上,形成水分子。
这些反应产生电荷,这些电荷最终用来产生ATP。
同时,呼吸链用于维持细胞的内部环境,防止过多的还原中间产物在细胞中积累。
厌氧代谢途径在缺氧环境下,大肠杆菌通过发酵作用代谢底物,并产生少量的ATP。
大肠杆菌的厌氧代谢途径包括糖酵解途径、无氧乙酸发酵途径等。
糖酵解途径:当大肠杆菌在缺氧的环境下,无法将氧转化为ATP,因此它使用糖酵解途径在缺氧条件下生成少量的ATP。
大肠杆菌的特点与前景研究大肠杆菌(Escherichia coli)是一种常见的革兰阴性杆菌,存在于人类和许多动物的肠道内,是肠道菌群中的主要成员之一、大肠杆菌具有以下特点:1.易培养和高繁殖率:大肠杆菌生长速度快,培养方法简单,因此成为实验室中最常用的微生物模型之一、大肠杆菌短繁殖周期(约为20分钟),易于进行遗传变异和基因工程研究。
2.遗传工具齐全:大肠杆菌具有完整的遗传工具箱,包括质粒转化、噬菌体介导的转导、细菌共轭等。
这些工具使得大肠杆菌成为基因工程研究的理想对象,可以用于表达外源蛋白、产生重组蛋白、合成有益物质等。
3.代谢多样性:大肠杆菌具有多样的代谢途径,能够利用多种碳源和能源,包括葡萄糖、乳糖、葡萄糖醇等。
这使得大肠杆菌成为工业上重要的生物生产平台,可用于生产谷氨酰胺、异戊二烯、丙酮、生物柴油等。
4.耐受高温和高盐浓度:大肠杆菌具有一定的耐受高温和高盐浓度的能力,适应广泛的环境条件。
这使得大肠杆菌成为广泛应用于微生物酶的表达和产业化生产的重要菌株。
5.引起人类肠道感染:虽然大肠杆菌是肠道菌群的一部分,然而一些菌株可以引起人类肠道感染,导致腹泻和胃肠道炎症。
这些病原菌产生毒素和相关的致病因子,其致病性与它们的遗传背景密切相关。
基于大肠杆菌的特点,它在很多领域都有重要的研究前景:1.生物制药:大肠杆菌作为重要的表达系统,可以用于生产蛋白药物,如胰岛素、人干扰素、单克隆抗体等。
此外,大肠杆菌还可以通过基因工程改造,产生重组酶、抗生素等药物。
2.基因工程与合成生物学:大肠杆菌是进行基因工程和合成生物学研究的理想模型。
通过改造大肠杆菌的基因组,可以实现蛋白质功能的调控,构建人工代谢途径,甚至实现对环境污染物的生物降解等。
3.新材料生产:通过基因工程改造大肠杆菌,可以合成新型材料和生物可降解材料,如生物塑料、生物燃料、生物胶体等。
4.环境保护:大肠杆菌具有高度适应环境的能力,对环境中污染物的降解具有较高的潜力。
大肠杆菌自动诱导培养基配方及操作方法大肠杆菌(Escherichia coli)是一种常见的肠道细菌,也是实验室中常用的菌种之一、下面是大肠杆菌自动诱导培养基的配方及操作方法。
一、自动诱导培养基配方:1.碳源:-葡萄糖(10g/L):作为主要的碳源供给菌体能量。
-乳糖(5g/L):用于诱导乳糖酶的表达。
2.氮源:-酵母粉(5g/L):提供菌体生长所需的氮源。
3.盐类:-氯化钠(5g/L):维持培养基的渗透压和离子平衡。
4.调节剂:-草酸二钠(1.36g/L):调节培养基的pH值,保持适宜的生长环境。
5.其他添加剂:-磷酸二氢钾(5g/L):提供磷酸盐的源,促进菌体生长。
-氯化钾(0.25g/L):提供钾盐的源,满足菌体对钾的需求。
-氯化镁(0.5g/L):提供镁盐的源,满足菌体对镁的需求。
配方中的所有化学品都可以在实验室常见试剂供应商处购买得到。
二、自动诱导培养基操作方法:1.准备培养基:a.根据配方将所需的化学品称量并溶解在适量的去离子水中。
b.用自动滤器(pH7.0)滤过溶液以去除可能存在的微生物污染。
c.调节培养基的pH至7.0,再用去离子水补足总体积至所需浓度。
2.灭菌:a.将调好pH的培养基倒入适量的培养瓶中。
b.放入高压灭菌锅中,进行高压灭菌。
3.菌种接种:a.选取一株适宜的大肠杆菌菌株,用无菌技术将其接种至培养基中。
b. 将接种好的培养基培养瓶放入恒温摇床中,以28°C恒温、200 rpm的条件下培养。
4.观察生长:a.在培养过程中,定期取一部分培养基进行测量分析。
b.测量菌液的光密度(OD值),以评估菌体生长情况。
5.收获细胞:a.在菌液达到一定浓度后,用无菌操作将菌液转移到离心管中。
c.将沉淀用缓冲液重悬。
6.文库构建:a.从收获的菌体中提取DNA,并使用合适的方法构建文库。
以上即为大肠杆菌自动诱导培养基的配方及操作方法。
在实验过程中,要注意使用无菌技术,尽量避免微生物污染。
大肠杆菌诱导蛋白的温度引言大肠杆菌(Escherichia coli)是一种常见的革兰氏阴性杆菌,广泛存在于人和动物的肠道中。
大肠杆菌是一种重要的实验室模式生物,被广泛用于基因工程和蛋白表达研究中。
在这些研究中,诱导蛋白的表达是一个关键步骤,而温度是影响蛋白表达的重要因素之一。
温度对大肠杆菌生长的影响大肠杆菌是一种嗜温菌,其最适生长温度在37摄氏度左右。
在这个温度下,大肠杆菌的生长速度最快,代谢活性最高。
当温度低于最适生长温度时,大肠杆菌的生长速度会减慢,而当温度过高时,细胞会受到热应激,生长受到抑制甚至死亡。
温度对大肠杆菌诱导蛋白表达的影响大肠杆菌的诱导蛋白表达通常是通过外源添加诱导剂来实现的,其中最常用的诱导剂是异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)。
IPTG可以诱导大肠杆菌中的Lac operon启动子,使其启动子上的诱导子结合位点与RNA聚合酶结合,从而启动目标基因的转录和翻译。
在蛋白表达过程中,温度是一个重要的调控因素。
通常情况下,大肠杆菌的诱导蛋白表达是在较低温度下进行的,如20摄氏度或25摄氏度。
这是因为在较低温度下,蛋白的折叠速度较慢,有利于蛋白的正确折叠和功能的形成。
温度对蛋白折叠的影响蛋白的折叠是一个复杂的过程,温度是其中一个重要的影响因素。
在低温下,蛋白的折叠速度较慢,容易形成部分折叠态或不稳定的结构。
这使得蛋白更容易发生错误的折叠,导致蛋白失去功能或形成聚集体。
而在较高温度下,蛋白的折叠速度加快,容易形成过度折叠态或聚集体,同样也会导致蛋白失去功能。
温度对大肠杆菌诱导蛋白表达的优化为了获得高效的蛋白表达,研究人员通常需要对温度进行优化。
以下是一些常用的优化策略:1. 温度梯度诱导表达温度梯度诱导表达是一种常用的优化策略。
通过在不同温度下进行蛋白表达,可以找到最适合目标蛋白表达的温度。
通常情况下,可以在25摄氏度、30摄氏度和37摄氏度等不同温度下进行表达,然后通过分析蛋白的表达水平和折叠状态来确定最适温度。
大肠杆菌国家标准
大肠杆菌(Escherichia coli)是一种常见的革兰氏阴性杆菌,属于肠道菌群中
的一种重要成员。
它在人和动物的肠道中普遍存在,是一种常见的肠道微生物。
大肠杆菌在生物学、医学和食品工业中具有重要的意义,因此各国都对大肠杆菌制定了相应的国家标准,以保障公共卫生和食品安全。
国家标准对大肠杆菌的监测和检测进行了详细规定,主要包括采样方法、检测
方法、限量标准等内容。
在食品工业中,大肠杆菌是一种重要的指标菌,其数量的多少直接反映了食品的卫生状况。
因此,国家标准对食品中大肠杆菌的限量标准进行了严格规定,以保障食品的安全卫生。
在医学领域,大肠杆菌也是一种重要的病原菌。
它能够引起多种感染性疾病,
如泌尿系统感染、肠道感染等。
因此,国家标准对医疗机构和实验室中的大肠杆菌的监测和检测也进行了详细规定,以防止病原菌的传播和感染。
除了食品和医学领域,大肠杆菌在生物学研究中也具有重要意义。
它是一种常
用的实验室模式菌种,被广泛应用于分子生物学、遗传学和生物工程等领域。
因此,国家标准对实验室中的大肠杆菌的保存、传递和使用也进行了规范,以保证实验室操作的安全和准确性。
总的来说,大肠杆菌国家标准的制定和执行,对于保障公共卫生和食品安全具
有重要意义。
通过对大肠杆菌的监测和检测,可以及时发现和控制病原菌的传播,保障人民群众的健康。
同时,国家标准的执行也可以规范实验室操作,保证科研工作的准确性和安全性。
因此,各界应严格遵守大肠杆菌国家标准,共同维护公共卫生和食品安全。
大肠杆菌检验方法
大肠杆菌(Escherichia coli)是一种革兰氏阴性的厌氧菌,常常被用作指示性微生物来评估食品和水源的卫生质量。
以下是常见的大肠杆菌检验方法:
1. 培养基方法:将样品接种在包含大肠杆菌生长所需营养物质的培养基上,如大肠杆菌选择性琼脂培养基(MacConkey琼脂培养基)和EC培养基等。
大肠杆菌能够利用琼脂中的乳糖发酵产生酸,导致培养基呈现红色或粉红色。
此外,EC 培养基还包含了可以检测大肠杆菌β-葡萄糖苷酶的亚甲基红试剂,如果大肠杆菌存在,则培养基呈现金属光泽。
2. 确认方法:对落有培养基上的鲜艳深色菌落进行进一步确认。
典型的确认方法包括革兰染色、目测观察形态特征、氧化发酵试验和测试产气杆菌酶试验。
3. PCR检测方法:利用聚合酶链反应(PCR)技术,从样品中扩增大肠杆菌特异性基因片段(如16S rRNA基因),然后通过凝胶电泳检测扩增产物。
4. 快速方法:如免疫层析试纸法和光学组织测定法。
免疫层析试纸法利用抗大肠杆菌抗体与大肠杆菌特异性抗原结合生成可视化结果。
光学组织测定法利用大肠杆菌的β-葡萄糖苷酶水解比色底物产生颜色变化。
这些方法都可用于检测大肠杆菌在食品和水源中的存在及其数量。
在进行检验时,应严格遵守相关的操作规程和实验室操作规范,以确保结果的准确性和可靠性。
1:DH5a菌株
DH5a是一种常用于质粒克隆的菌株。
E.coli DH5a在使用pUC系列质粒载体转化时,可与载体编码的β-半乳糖苷酶氨基端实现α-互补。
可用于蓝白斑筛选鉴别重组菌株。
基因型:F-,φ80dlacZΔM15,Δ(lacZYA-argF)U169,deoR,recA1,endA1,hsdR17(rk-,mk ),phoA,supE44,λ-,thi-1,gyrA96,relA1
2:BL21(DE3) 菌株
该菌株用于高效表达克隆于含有噬菌体T7启动子的表达载体(如pET系列)的基因。
T7噬菌体RNA聚合酶位于λ 噬菌体DE3区,该区整合于BL21的染色体上。
该菌适合表达非毒性蛋白。
基因型:F-,ompT, hsdS(rBB-mB-),gal, dcm(DE3)
3:BL21(DE3) pLysS菌株
该菌株含有质粒pLysS,因此具有氯霉素抗性。
PLysS含有表达T7溶菌酶的基因,能够降低目的基因的背景表达水平,但不干扰目的蛋白的表达。
该菌适合表达毒性蛋白和非毒性蛋白。
基因型:F-,ompT hsdS(rBB-mB-),gal, dcm(DE3,pLysS ,Camr
4:JM109菌株
该菌株在使用pUC系列质粒载体进行DNA转化或用M13 phage载体进行转染时,由于载体DNA产生的LacZa多肽和JM09编码的LacZΔM15进行α-互补,从而显示β-半乳糖苷酶活性,由此很容易鉴别重组体菌株
基因型:recA1,endA1,gyrA96,thi-1,hsdR17,supE44,relA1,Δ(lac-proAB)/F’[traD36,proAB ,lacIq,lacZΔM15]
5:TOP10菌株
该菌株适用于高效的DNA克隆和质粒扩增,能保证高拷贝质粒的稳定遗传。
基因型:F- ,mcrAΔ(mrr-hsd RMS-mcrBC), φ80 ,lacZΔM15,
△lacⅩ74, recA1 ,araΔ139Δ(ara-leu)7697, galU ,galK ,rps,(Strr) endA1, nupG
6:HB101菌株
该菌株遗传性能稳定,使用方便,适用于各种基因重组实验
基因型:supE44,hsdS20(rB-mB-),recA13,ara-14,proA2,lacY1,galK2,rpsL20,xyl-5,mtl-1,leuB6,thi-1
7:M110 及 SCS110
大多数大肠杆菌菌株中含有Dam甲基化酶和Dcm甲基化酶,前者可以在GATC序列中腺嘌呤N-6位上引入甲基,后者在CCA/TGC序列的第一个胞嘧啶 C-5位置上引入甲基。
常用的菌株都会产生dam,dcm,从而受到甲基化的影响.
部分限制性内切酶对甲基化的DNA不能切割,如FbaI和MboI等,一般生物公司提供的内切酶说明中均有说明。
大多数酶切位点的甲基化不影响切割,而有些会影响,如XbaI, BclI 等。
而且甲基化只发生在特定序列,以XbaI为例,只有在位点序列旁出现GA或TC,该XbaI位才会被甲基化。
而要解除这种限制修饰作用通常有两种方法:
(1)选用上述酶的同功酶,如Sau3AI,DNA识别切割位点与MboI相同;但不受甲基化影响;
(2)利用甲基化酶缺失的受体细胞进行DNA的制备,如E.coli JM110和
链霉菌等,前者Dam和Dcm甲基化酶已敲出,而后者细胞内本就没有甲基化酶,从这些细胞中抽提的 DNA就能被上述酶切割。
E.coli JM110
要排除dam,dcm甲基化的影响,需要用特定的dam-,dcm-的菌株,如JM110
如果由JM110或 SCS110等甲基化缺失的菌株产生的质粒,则不会被甲基化.。