Real-time-PCR原理和应用
- 格式:ppt
- 大小:3.64 MB
- 文档页数:27
实时荧光pcr原理实时荧光PCR原理。
实时荧光PCR(Real-time PCR)是一种能够在PCR过程中实时监测DNA扩增情况的技术。
它通过引入荧光探针或染料,实时检测PCR反应体系中的DNA量的变化,从而实现对PCR过程的实时监测和定量分析。
实时荧光PCR的原理主要包括以下几个方面:1. 荧光探针。
在实时荧光PCR中,常用的荧光探针包括TaqMan探针、Molecular Beacon探针和SYBR Green染料。
这些荧光探针在PCR过程中与靶标DNA结合,并产生荧光信号。
通过检测荧光信号的强度,可以实时监测PCR反应的进程。
2. 荧光信号检测。
实时荧光PCR系统配备了特殊的光学检测装置,能够实时监测PCR反应体系中荧光信号的强度变化。
当靶标DNA逐渐扩增,荧光信号也会随之增加。
通过检测荧光信号的变化,可以实时获取PCR反应的动态信息。
3. 数据分析。
实时荧光PCR系统通常配备了专门的数据分析软件,能够实时处理和分析检测到的荧光信号。
通过对荧光信号的定量分析,可以计算出PCR反应体系中靶标DNA的初始量,并绘制出PCR扩增曲线。
通过PCR扩增曲线的形态和特征,可以对靶标DNA进行定量分析和检测。
4. 应用领域。
实时荧光PCR技术在生命科学领域有着广泛的应用,包括基因表达分析、病原微生物检测、基因型分析等方面。
由于其高灵敏度、高特异性和高准确性,实时荧光PCR已成为现代分子生物学研究和临床诊断中不可或缺的技术手段。
总结。
实时荧光PCR技术通过引入荧光探针和光学检测装置,实现了对PCR反应的实时监测和定量分析。
它在生命科学领域有着广泛的应用前景,为基因分析、疾病诊断和药物研发等领域提供了强大的技术支持。
随着技术的不断进步和完善,实时荧光PCR技术必将在未来发挥更加重要的作用。
实时荧光定量pcr检测核酸的原理实时荧光定量PCR(Real-Time Quantitative PCR,RT-qPCR)是一种基于聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)的技术,能够快速、准确地定量检测核酸。
RT-qPCR的原理基于PCR的扩增和荧光信号的监测。
PCR是一种通过反复复制DNA片段的方法,它由DNA模板、引物和DNA聚合酶组成。
引物是专门设计的短链DNA片段,它们能够在目标DNA序列的两端精确结合并指导DNA聚合酶的复制。
PCR的循环包括三个步骤:变性、退火和延伸。
在变性步骤中,双链DNA被加热至94-98℃,使其解离成两条单链DNA。
在退火步骤中,引物与单链DNA特异性结合。
在延伸步骤中,DNA聚合酶沿着单链DNA模板合成新的DNA链。
每一个PCR循环会使目标DNA的数量翻倍,经过多个循环,目标DNA的数量会大幅增加。
RT-qPCR通过引入荧光探针实现对PCR扩增产物的实时检测。
荧光探针也是一种短链DNA片段,其中包含一个荧光染料和一个荧光信号抑制器。
荧光信号抑制器通过与荧光染料的近距离接触,抑制了荧光信号的发射。
当荧光探针与PCR扩增产物结合时,荧光信号抑制器与荧光染料分离,荧光信号得以释放。
通过荧光信号的增加可以判断PCR扩增产物的数量。
RT-qPCR的步骤包括样品处理、反转录、PCR扩增和荧光信号检测。
首先,需要从待检测样品中提取出核酸。
然后,通过反转录酶将RNA转录成cDNA,以便后续PCR扩增。
接下来,将引物、荧光探针和PCR反应液与样品一起加入PCR扩增管中。
PCR扩增过程中,荧光探针与PCR产物结合,并释放荧光信号。
PCR扩增和荧光信号检测是在同一反应管中进行的,所以可以实现实时监测。
最后,根据荧光信号的强度,可以计算出PCR扩增产物的初始数量。
RT-qPCR具有高灵敏度、高特异性和高准确性的特点。
它可以在短时间内检测到低浓度的核酸,并且能够区分不同的核酸序列。
简述实时荧光定量PCR技术的原理
实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR, qPCR)是一种用于检测和定量DNA或RNA的方法。
它结合了传统的PCR技术和荧光探针技术,可以实时监测PCR反应的进程,并根据荧光信号的强度来确定目标物质的数量。
实时荧光定量PCR的原理如下:
1. PCR反应体系:反应体系中包含目标DNA或RNA模板、引物(一对用于扩增目标序列的寡核苷酸片段)、荧光探针和酶。
荧光探针通常由一个与目标序列互补的序列和一个带有荧光物质和荧光物质猝灭物质的序列构成。
2. 扩增过程:PCR反应通过一系列的温度循环来进行。
首先是变性步骤,将DNA 或RNA模板变性为单链。
然后是退火步骤,引物与目标序列互补结合。
最后是延伸步骤,酶在合适的温度下合成新的DNA链。
3. 荧光信号检测:在PCR反应过程中,荧光探针与目标序列的结合会导致荧光信号的释放。
荧光信号的强度与目标序列的数量成正比。
实时荧光定量PCR系统可以实时监测荧光信号的强度,并记录下来。
4. 分析和定量:通过实时荧光定量PCR系统记录的荧光信号强度曲线,可以确定PCR反应的阈值周期数(CT值)。
CT值表示在达到阈值信号强度时,PCR 反应的循环数。
根据CT值,可以计算出目标序列在初始反应体系中的起始数量。
实时荧光定量PCR技术具有高灵敏度、高特异性和高准确性的特点,广泛应用于基因表达分析、病原体检测、突变分析等领域。
实时PCR技术的原理实时PCR(Real-time PCR)是一种用于检测和定量DNA或RNA的技术。
它在PCR反应的过程中,通过测量PCR产物的数量的变化来实时监测DNA或RNA的扩增情况。
实时PCR技术具有高度敏感性、快速性、精准性和广泛的应用范围,成为了分子生物学研究和临床诊断中不可或缺的重要工具。
一、PCR(聚合酶链反应)的基本原理PCR是一种体外扩增DNA序列的技术,通过反复的循环扩增,能够从少量DNA样本中产生大量DNA。
PCR反应由三个步骤组成:变性(Denaturation)、退火(Annealing)和延伸(Extension)。
其中,变性步骤是将DNA双链解开,使其成为单链;退火步骤是将DNA引物与目标序列的互补区域结合;延伸步骤是利用DNA聚合酶酶活性进行新链的合成。
这些步骤的循环扩增使得DNA的复制指数级增加。
二、实时PCR的优势相较于传统PCR技术,实时PCR具有以下几个优势:1.实时监测:实时PCR可以在PCR过程中实时监测PCR产物的变化,通过检测荧光信号的强度来确定PCR产物的数量。
这种实时监测的方式省去了传统PCR后续检测步骤的时间,提高了实验效率。
2.高度灵敏:实时PCR技术可以检测非常低浓度的DNA或RNA,甚至能够检测单个拷贝的目标序列。
这使得实时PCR在分子诊断和病原体检测中具有非常重要的应用价值。
3.高度精准:实时PCR具有较低的误差率,可以精确定量目标序列的拷贝数。
这对于研究基因表达调控、检测基因突变等方面非常重要。
4.高通量性:实时PCR技术可以通过多重荧光探针或染料的设计,同时检测多个靶标序列。
这样可以大大提高实验的通量和效率。
三、实时PCR的基本原理实时PCR可以使用不同的荧光信号来实现PCR产物的实时监测,其中最常用的有SYBR Green和探针法。
1.SYBR Green法:SYBR Green是一种荧光染料,与DNA结合后发出荧光信号。
在实时PCR过程中,SYBR Green会结合到PCR产物上,发出荧光信号,从而实现PCR产物的检测。
总RNA的提取与RT、Realtime-PCR一、实验原理RNA是基因表达的中间产物,存在于细胞质与核中。
获得高纯度和完整的RNA是很多分子生物学实验所必需的,如Northern杂交、cDNA合成及体外翻译等实验的成败,在很大程度上取决于RNA的质量。
由于细胞内的大部分RNA是以核蛋白复合体的形式存在,所以在提取RNA时要利用高浓度的蛋白质变性剂,迅速破坏细胞结构,使核蛋白与RNA分离,释放出RNA。
再通过酚、氯仿等有机溶剂处理、离心,使RNA与其他细胞组分分离,得到纯化的总RNA。
1.RNA提取的最大影响因素-RNA酶但是由于RNA酶(RNase)广泛存在且稳定,可耐受多种处理而不被灭活,如煮沸、高压等。
RNase催化的反应一般不需要辅助因子,因而RNA制剂中只要存在少量的RNase就会引起RNA在制备与分析过程中的降解,所以RNA的制备过程中要抑制内源和外源的RNase活性,保护RNA分子不被降解。
外源性的RNase存在于操作人员的手汗、唾液等,也可存在于灰尘中。
在其它分子生物学实验中使用的RNase也会造成污染。
这些外源性的RNase可污染器械、玻璃制品、塑料制品、电泳槽、研究人员的手及各种试剂。
而各种组织和细胞中则含有大量内源性的RNase。
2.常用的RNA酶抑制剂*焦碳酸二乙酯(DEPC):是一种强烈但不彻底的RNase抑制剂。
它通过和RNase的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而抑制酶的活性。
*异硫氰酸胍:目前被认为是最有效的RNase抑制剂,它在裂解组织的同时也使RNase失活。
它既可破坏细胞结构使核酸从核蛋白中解离出来,又对RNase有强烈的变性作用。
*氧钒核糖核苷复合物:由氧化钒离子和核苷形成的复合物,它和RNase结合形成过渡态类物质,几乎能完全抑制RNase的活性。
*RNA酶的蛋白抑制剂(RNasin):从大鼠肝或人胎盘中提取得来的酸性糖蛋白。
RNasin是RNase的一种非竞争性抑制剂,可以和多种RNase结合,使其失活。
实时荧光定量pcr原理实时荧光定量PCR(Real-Time Quantitative PCR,rt-qPCR)是一种常用于新生儿筛查和诊断病原体检测的分子定量方法。
它利用荧光标记的分子生物学技术,可以快速直接对特异的核酸序列进行检测,使检测过程更加精确快速,具有更高的特异性,可以测量微量样品。
实时PCR是基于PCR(聚合酶链反应)技术,它可以连续调整DNA或RNA片段的分子复制,目的是使目标DNA或RNA片段的量变得更多。
实时荧光定量PCR与其他实时PCR技术类似,但具有独特的优势,即在各个PCR周期中,它不仅可以检测和计数特定的DNA或RNA片段,而且可以定量检测,其特异性高强烈。
实时荧光定量PCR的工作原理是将一种可燃的标记的荧光物质(如恩替卡韦)收集到一起,成为荧光标记物或标记基因。
在性能上,它是一种热力学分子生物学技术,可以直接对特异的核酸序列进行检测。
当溶液中的特定核酸序列(如基因型)与检测溶液中的匹配(比如,使用收集器)时,荧光探针的特定的荧光单片将被激活,以及一系列的共同发光反应,从而产生荧光终级产物(FIP)。
最终,FIP的强度可以确定检测溶液中特定的基因的数量,用于定量。
实时荧光定量PCR的优势有:(1)高灵敏度。
它可以检测出非常小的核酸序列,即使它们微乎其微,甚至只有几个DNA底片;(2)快速。
可以在几个小时内完成;(3)高选择性。
它只是仅仅检测和计数特定的基因序列;(4)高特异性。
实时荧光定量PCR可以检测出比单次PCR更多的核酸片段,因此更加精确可靠;(5)高绝对量数据。
它可以提供准确的检测结果,并可以用于直接比较不同标本的数量差异;(6)同时测量多个基因。
可以特异性地检测不同家族的基因,即使这些基因的序列和尺寸都存在很大的差异,也可以很容易的检测到它们。
实时荧光定量PCR的主要应用是在基因组学及病毒学研究中,如检测HIV抗原、癌症基因组遗传学分析、突变定位以及新生儿疾病筛查等。