实验步骤总结
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实验步骤总结
1. 人体血液中分离淋巴细胞和单核细胞
【实验目的】得到能够作为炎性反应实验材料的单核细胞和淋巴细胞
【实验原理】利用密度梯度离心的方法分离细胞,使用与淋巴细胞和单核细胞密度相同的分离液得到处于沉降平衡状态的目标细胞
【实验材料】新鲜抗凝人血、淋巴细胞分离液(密度1.077,与细胞等渗,买成品)、PBS缓冲液(无菌)、IMDM培养基、胎牛血清、红细胞裂解液;1000μL灭菌枪头、1000μL移液枪、15mL离心管(使用2M NaOH溶液浸泡灭菌过夜后使用超纯水洗净,80℃烘箱烘干)、1.5mL离心管、2mL离心管、离心机(配备水平转头)、冰盒(充满冰)
【实验步骤】
(1)将离心机温度设定为4℃,预冷至设定温度
(2)配置完全IMDM培养基,包含90%(v/v)的IMDM和10%(v/v)的胎牛血清
(3)取新鲜抗凝人血2mL,与PBS溶液等体积混合,混匀后待用
(4)向15mL离心管中加入2mL淋巴细胞分离液,向分离液上层加入(3)中得到的稀释人血,注意保持两液体的界面清晰,避免震动和晃动
(5)2000rpm离心20min
(6)吸取中间云雾带,转移至2mL离心管中,置于冰上
(7)将冰上样品加入等体积的红细胞裂解液混匀,冰上裂解5min,观察红细胞裂解情况
(8)以2000rpm离心20min,观察沉淀和上层溶液,如果两者之中有任何一个出现红色,则弃上清,保留沉淀,加入裂解液重复裂解离心,至无红色出现为止
(9)将得到的淋巴细胞和单核细胞用PBS重悬洗涤1次(若样品经多次红细胞裂解液处理,此步骤可省去),2000rpm离心10min后使用配置的IMDM完全培养基重悬
【注意事项】
(1)保持低温操作,在(3)及(5)至(8)的过程中全部在盛满冰的冰盒中操作,并保持离心机的低温状态
(2)保证后续实验的连续性,提取得到的淋巴细胞当天使用
2. 细胞中总mRNA提取
【实验目的】提取mRNA为反转录过程提供模板
【实验原理】裂解细胞后利用对mRNA不溶的有机溶剂洗去蛋白,提取mRNA结晶
【实验材料】待提取mRNA的细胞(至少106个)、DEPC水溶液(0.1%-v/v,灭菌和带菌分别准备,带菌至少1L)、DEPC 75%乙醇溶液(0.1%-v/v,提取mRNA专用,未经其他器械污染)、异丙醇(提取mRNA专用,未经其他器械污染)、氯仿(提取mRNA专用,未经其他器械污染),Trizol 溶液(购买成品);10μL枪头、200μL枪头、1000μL枪头、2.5μL移液枪、10μL移液枪、100μL移液枪、1000μL移液枪、200μL离心管、1.5mL离心管、离心机、冰盒
【实验步骤】
(1)将10μL枪头、200μL枪头、1000μL枪头、200μL离心管、1.5mL离心管浸泡在DEPC水溶液中过夜,装入铝制饭盒和枪头盒内,120℃灭菌30min待用
(2)将离心机降温至4℃,冰盒装满冰待用
(3)收集待提取mRNA的细胞,加入培养基重悬于(1)中处理过的1.5mL离心管中,离心收集细胞沉淀,弃去培养基
(4)加入100μL Trizol溶液重悬细胞,室温静置5min使细胞裂解
(5)12000rpm离心10min取上清弃沉淀
(6)加入100μL氯仿,剧烈震荡5min(不能涡旋!)后静置15min
(7)12000rpm 离心10min ,转移上清液到新的离心管中,注意不要吸取中间层的蛋白质
(8)向上清液中加入250μL 异丙醇,混匀静置10min 后12000rpm 离心5min ,得到管底部的mRNA 沉淀,沉淀应为片状,若出现白色团状或絮状沉淀则说明含有蛋白
(9)弃上清,加入DEPC 75%乙醇溶液,温和震荡重悬mRNA 沉淀
(10)12000rpm 离心10min ,弃上清,注意不要将沉淀倒掉
(11)室温晾干或真空干燥,脱去大部分溶剂后加入30μL 灭菌DEPC 水溶解得到的mRNA 沉淀
【注意事项】
(1)DEPC 致癌且为易挥发物质,所有浸泡操作均需要在通风橱内进行
(2)mRNA 在唾液的作用下能够降解,因而在操作过程中需戴口罩并不能打喷嚏或咳嗽,更严禁大声喧哗,操作过程中勤换手套、枪头
(3)步骤中所有的离心管和枪头均指【实验步骤】(1)中处理过的枪头和离心管
(4)步骤中所使用的枪头盒、装离心管所使用的铝制饭盒需要经过DEPC 水冲洗,晾干后方可使用,玻璃器皿应在180℃干烤6h 后使用
(5)提取得到的mRNA 尽量当天使用,若要保存需保存在-80℃冰箱
3. mRNA 反转录得cDNA
【实验目的】 将提取到的mRNA 反转录得到相应的cDNA
【实验原理】 以mRNA 为模板,利用反转录酶反转录得到cDNA
【实验材料】 mRNA 模板、Oligo dT Primer 或Random Primer 或Specific Primer 、dNTP Mixture 、DEPC 水(0.1%-v/v ,无菌带菌均需要,带菌DEPC 需要约1L );10μL 枪头、200μL 枪头、2.5μL 移液枪、10μL 移液枪、100μL 移液枪、200μL 离心管,1.5mL (或2mL )离心管、冰盒
【实验步骤】
(1)将所有的待用枪头、离心管用0.1%(v/v )浸泡过夜后灭菌待用
(2)按照表1配置混合液,其中列出的浓度均为体系配置完成后的最终浓度
(2)将(1(3)从冰上取下(2)中的离心管,将液体甩到离心管底部
(4
)在(3)的离心管中按表2继续加入,直到体积为20μL
表2 反转录反应液中的配置
(5
系不需要采用),42℃(若使用PCR的下游引物作为反转录引物时,为防止引物错配的原因引起非特异性反应,需要将温度设置为50℃,这一操作不影响酶活)
(6)70℃保温15min后冰上极冷,得到的cDNA溶液可直接用于PCR扩增
4. 聚合酶链反应(PCR)
【实验目的】扩增包含特定基因的DNA片段,以进行定量分析
【实验原理】
PCR的原理与天然DNA复制过程类似,包含核酸的变性、复性、延伸三个阶段,由于是核酸的体外扩增的过程,因而反应体系应至少包括如下成分:起延伸起点作用的过量扩增用引物、起催化合成作用的DNA聚合酶、起合成原料作用的脱氧核苷三磷酸(dATP、dCTP、dGTP、dTTP)、模板DNA、反应缓冲液(含DNA聚合酶的辅助因子)。
按发生顺序,三个阶段的原理如下:
变性:通过加热使反应体系的温度达到94~95℃,破坏DNA双螺旋之间的氢键,使双链DNA变为单链DNA。
以便于引物结合,为复性和延伸做准备。
复性:将温度降低至50~60℃,在此温度下,通过碱基互补配对,反应体系中单链DNA可以与PCR 引物形成局部互补双链。
延伸:在复性阶段,引物和单链模板形成局部双链,DNA聚合酶根据碱基互补配对原则延伸引物,形成一条完整的双链,延伸温度一般为72℃。
【实验材料】
TaKaRa Taq试剂盒(应包含rTaq酶、10×PCR Buffer、dNTP,注意此处使用的dNTP与反转录使用的dNTP不能取自同一个管)、模板DNA、上游引物、下游引物、无菌水、PCR仪
【实验步骤】
(1)按照表3在冰上配置PCR反应体系(20μL)
*若模板DNA
(2)按照表5的程序在将(1)中配置的体系在PCR仪上进行扩增
表5 PCR扩增程序
(3。