分子生物学名词解释
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分⼦⼦物学名词解释
6DNA和RNA的结构
Polynucleotide chain:多核苷酸链。包含磷酸⼆酯⼆架与结合有碱基的核糖的单链DNA。
Nucleoside:核苷。核糖通过1位糖苷键连接到⼆个碱基上形成。核苷没有磷酸分⼆。Nucleotide:核苷酸。⼆个在1位连接碱基,5位连接⼆个或多个磷酸的核糖。Phosphodiester linkage:磷酸⼆酯键。不断重复,构成多核苷酸链的糖-磷酸⼆架。
Purine:嘌呤。Adenine:腺嘌呤。Guanine:鸟嘌呤。Pyrimidine:嘧啶。Cytosine:胞嘧啶。Thymine:胸腺嘧啶。Base flipping:
碱基翻出。单个碱基从双螺旋中突出的现象。Tautomeric:互变异构。Denature:变性。温度或pH过⼆时,DNA双链分开的
过程。
Annealing(renature):复性。变性DNA的互补链重新聚合形成双螺旋结构的过程。
Hybridization:杂交。两条单链核酸形成杂交分⼆的能⼆。
Hyperchromicity:增⼆性。DNA变性后,吸光度在260nm处明显增强的现象。Tm (melting point):熔点。DNA的吸光度增加到最⼆值⼆半时的温度。
Linking number:连环数。要使两条DNA链完全分开时⼆套链必须穿过另⼆条链的次数。Twist number:扭转数。DNA⼆条链完全缠绕另⼆条链的次数。
Writhe number:缠绕数。双螺旋DNA的长轴在三维空间⼆重复地⼆我交叉的次数。
Topoisomerase:拓扑异构酶。催化DNA产⼆瞬间的单链或双链的断裂⼆改变连环数的酶。
Ribozyme:核酶。催化⼆化反应的RNA酶。
7 染⼆体、染⼆质和核⼆体
Chromosome:染⼆体。由DNA和与其结合的蛋⼆质构成。
Chromatin:染⼆质。DNA的⼆段给定区域及其结合蛋⼆。
Histone:组蛋⼆。⼆的碱性DNA结合蛋⼆。Non-histone:⼆组蛋⼆。丰度较低的DNA结合蛋⼆。Nucleosome:核⼆体。
DNA和组蛋⼆形成的结构。
Heterochromatin:异染⼆质Euchromatin:常染⼆质Haploid:单倍体Diploid:⼆倍体polyploid:多倍体regulatory
sequences:监管序列。DNA序列外部的与⼆个给予启动⼆调节表达相关的核⼆启动⼆。Mitosis:有丝分裂。⼆代细胞维持与亲本细胞染⼆体数⼆⼆致的分裂⼆式。
Meiosis:减数分裂。⼆代细胞染⼆体数⼆为亲本细胞⼆半的分裂⼆式。Linker DNA:连接DNA。每个核⼆体之间的DNA。
Histone-fold domain:组蛋⼆折叠域。核⼆组蛋⼆中调节组蛋⼆中间体组装的保守区域。
Nucleosome remodeling complex:核⼆体重塑复合体。利⼆ATP⼆解供能,便于核⼆体改变位置或与DNA
相互作⼆的蛋⼆复合体。
Histone chaperone:组蛋⼆伴侣。核⼆体组装⼆⼆中避免组蛋⼆与DNA发送⼆效的相互作⼆的蛋⼆质。Nucleus:细胞核
Nucleolus:核仁interphase:分裂间期
Centromere:着丝粒。指导动粒形成,为DNA复制后染⼆体正确分离所必需。
Kinetochore:动粒。拉动姐妹染⼆单体互相远离并进⼆两个⼆代细胞的蛋⼆质复合体。
Telomere:端粒。⼆种线性染⼆体末端。这些序列保护染⼆体免于降解,作为复制专门的起源。
8DNA的复制 Primer-template junction:引物-模板接头。具有⼆定特定排列的双链或单链DNA。DNA polymerase:DNA聚合酶。催化DNA合成的酶。
Processivity:延伸能⼆。每次酶与引物-模板接头结合时所添加核苷酸的平均数。Semiconservative Replication:半保留复制。
Replication fork:复制叉。刚分开的模板链与未复制的双链DNA之间的连接区。Leading strand:前导链。与复制叉移动⼆向相同的新合成的DNA链。
Lagging strand:后随链。与复制叉移动⼆向相反的新合成的DNA链。
Replication eyes:复制眼。DNA复制区域两端包含⼆段很长的未复制区域的结构。Okazaki fragment:冈崎⼆段。后随链上形成的短的新链DNA⼆段。
Unidirectional replication:单向复制Bidirectional replication:双向复制
Primase:引物酶。能在单链DNA模板上制造短的RNA引物的特殊RNA聚合酶。
Cooperative binding:协同结合。⼆个SSB的结合会促进另⼆个SSB与其相邻的单链DNA结合的现象。DNA Pol III
holoenzyme: DNA聚合酶III全酶。负责⼆肠杆菌基因复制的具有⼆度延伸能⼆的蛋⼆质复合体。Polymerase switching:聚合酶的切换。真核⼆物DNA聚合酶δ或聚合酶ε取代聚合酶α的过程。
Sliding clamp loader:滑动夹装载器。催化滑动夹打开并将其安放在DNA上的特殊的蛋⼆质复合体。Replisome:复制体。复制叉上全部的作⼆蛋⼆的总和。
Origin of replication:复制起始位点。DNA解旋和复制起始发⼆的特殊位点。
Replicon:复制⼆。基因复制开始的特定起始位点。
Replicator:复制器。⼆够指导DNA复制起始的整套顺式作⼆的DNA序列。
Initiator protein:起始⼆蛋⼆。特异性识别复制器中的⼆个DNA元件并激活复制起始的蛋⼆质。
Origin recognition complex(ORC):起始位点识别复合体。真核细胞的起始⼆,是⼆种与复制⼆结合并将其他复制蛋⼆召集到复制器上的六蛋⼆复合体。
End replication problem:末端复制问题。后随链的合成不能复制线性染⼆体的最末端的现象。Sliding DNA clamp:滑动DNA夹。Licensing factor:执照因⼆。
9DNA的可突变性和修复
Transition:转换。嘌呤到嘌呤或嘧啶到嘧啶的替换。Transversion:颠换。嘌呤到嘧啶或嘧啶到嘌呤的替换。Point
mutation:点突变。改变单个核苷酸的突变。
DNA microsatellites:微卫星DNA。易突变序列,是2、3或4核苷酸序列的重复。Mismatch repair system:错配修复系统。检验碱基配对并进⼆修复的系统。Dam methylase:dam甲基化酶。使DNA两条链上5’-GTAC-3’的A都甲基化的酶。
Mutagen:诱变剂。Alkylation:烷基化oxidation:氧化radiation:辐射Base analog:碱基类似物。能替换正常碱基的化合物。
Intercalating agent:嵌⼆剂。能插⼆碱基间的化合物。
Excision repair system:剪切修复系统。指导受损的核苷酸从DNA上被除去⼆未被修复的系统。
Base excision repair:碱基切除修复。Nucleotide excision repair:核苷酸切除修复。Recombinational repair:重组修复。当两条DNA链都受损时采⼆的修复⼆式。
Photoreactivation:光活化作⼆。直接逆转紫外辐射造成的嘧啶⼆聚体结构。 Glycosylate:糖基化酶。识别并通过⼆解糖苷键除去受损碱基的酶。
Transcription-coupled repair:转录耦联修复。当RNA聚合酶转录过程中被模板链的损伤终⼆时,核苷酸切除修复可拯救RNA聚合酶的现象。
Translesion synthesis:移损合成。绕过受损部位继续复制的⼆式。
10 分⼆⼆平上的同源重组
homologous recombination:同源重组。指两个有相似或者相同序列的DNA分⼆交换遗传信息的过程。Double-strand break
(DSB) repair model:双链断裂修复模型。
Strand invasion:链侵⼆。两条重组DNA分⼆间形成碱基互补的短⼆段起始区的过程。
Holliday junction:Holliday联结体。链侵⼆使两个DNA分⼆被相互交叉的DNA联系在⼆起的结构。Branch migration:分⼆移位。Holliday联结体通过碱基配对连续地解链和配对⼆沿DNA移动的过程。Resolution:拆分。在Holliday联结体处切断
DNA重新⼆成两个分开的双螺旋DNA,从⼆完成遗传物质的交换的过程。
Heteroduplex DNA:异源双螺旋DNA。
Meiotic recombination:减数分裂重组。在减数分裂过程中发⼆的同源重组。Silence cassettes:沉默盒。额外的沉默拷贝所在的基因座。
Synthesis-dependent strand annealing(SDSA):依赖合成的链退⼆模型。⼆于分析交配型转换的同源重组机制。
11位点特异性重组和DNA转座
Conservation site-specific recombination(CSSR):保守性位点特异性重组。发⼆于两段特定序列之间。Transpositional
recombination:转座重组。发⼆于特定序列和⼆特定DNA位点之间。
Crossover region:交换区。重组位点上重组酶识别序列中间所包含的⼆个短的不对称序列。Inverted repeat:反向重复。单个DNA分⼆上的两个位点的⼆向为反向的重复。
Direct repeat:同向重复。单个DNA分⼆上的两个位点的⼆向为同向的重复。Architectural protein:构筑蛋⼆。重组反应中结合特定DNA序列并使之弯曲的辅助蛋⼆。Lysogenic state:溶原状态。Lytic growth:裂解性⼆长。
Integration host factor(IHF):整合宿主因⼆。⼆种序列依赖性的DNA结合蛋⼆。Transposable element:转座因⼆。可以移动的遗传因⼆。
Target site duplication:靶位点重复。紧邻在DNA转座⼆两端的短的正向重复序列。
Autonomous transposon:⼆主转座因⼆。带有⼆对终端反向重复序列和⼆个转座酶基因的DNA转座⼆。Nonautonomous
transposon:⼆⼆主转座因⼆。只有终端反向重复序列的可移位DNA⼆段。
Long terminal repeat:长末端重复序列。嵌⼆在较长重复序列中正向排列在类病毒反转录转座⼆两端的终端反向重复序列。Synaptic complex(transpososome):联合复合体/转座体。由转座酶、转座⼆两端反向重复序列形成的蛋⼆