基于复杂网络的我国高等中医药院校作者影响力分析_钱爱兵_刘艳华
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卜忆群 蒋丰【摘要】目的 为提高中医医院服务能力及合理配置中医资源提供依据。
方法 采用改进的密切值法对2018年各省、市、区中医医院服务能力进行对比评价,从基础配置、服务数量、服务效率3个维度选取评价指标,并依据信息熵原理确定各指标的权重,建立样本矩阵。
结果 全国30个省、市、区的中医医院服务能力差距大且不存在按区域分布的特征。
衡量中医医院服务能力的不同评价指标的重要性不同;各省、市、区对中医医院服务能力建设重视程度存在差异。
结论 加强中医医院基础设施建设要求明确中央和地方对中医医院基础设施建设的支出责任,以适当的中医药政策激励中医人才培养,防止中医师团队西医化;增加中医医院服务量应重视公众中医药健康文化素养促进、中医药特色优势培育以及中医医联体建设;提高地方中医药事业发展积极性和均等化水平需完善中央对地方转移支付政策。
【关键词】熵权;密切值法;中医医院;服务能力评价【中图分类号】R197.4Evaluation of service capacity of traditional Chinese medicine hospitals by using the entropy-weighted osculating value method Bu Yiqun, Jiang Feng. School of Management, Nanjing University, Nanjing 210023, Jiangsu Province, China Corresponding author: Bu Yiqun, Email: buyiqun@【Abstract 】Objective To provide a basis for improving the service capacity of TCM hospitals and the rational allocation of TCM resources. Methods The modified osculating value method was used to compare and evaluate the service capacity of TCM hospitals in 30 provinces, municipalities, and autonomous regions in 2018. The evaluation parameters were selected from three dimensions including infrastructure, service quantity, and service efficiency. The weights of all parameters were determined based on the principle of information entropy to establish a sample matrix. Results The service capacity of TCM hospitals in 30 provinces, municipalities, and autonomous regions had large gaps and was not reasonably distributed by region. The importance of the evaluation parameters and the priority of the capacity-building of TCM hospitals among different provinces, municipalities, and autonomous region differed. Conclusion Strengthening the infrastructure construction in TCM hospitals requires a clearly-defined roles and responsibilities of the central and local governments, so as to develop and implement appropriate policies to promote TCM talent training and prevent the westernization of TCM physician teams. Also, increasing the service capacity of TCM hospitals requires the increase of TCM literacy among the general public, the cultivation of characteristic TCM disciplines, and the construction of TCM medical alliances. Raising the enthusiasm of local government in TCM and promoting the availability and accessibility of TCM services also requires the support from the system of central government transfer payments to local governments.【Key words 】Entropy weight; Osculating value method; Traditional Chinese medicine hospitals; Evaluation of service capacityDOI :10.3969/j.issn.2095-7432.2021.02.004 作者单位:210023 南京,南京大学政府管理学院 通信作者:卜忆群,Email: buyiqun@基于熵权密切值法的全国中医医院服务能力评价分析医疗管理科学论坛 中医医院是我国中医医疗服务网络的主体,《中医药发展战略规划纲要(2016-2030年)》明确提出要切实提高中医医疗服务能力。
中医高校古代社科文献资源建设对中医学科发展的意义初探刘爱华
【期刊名称】《陕西中医学院学报》
【年(卷),期】1999(22)5
【摘要】从中国古代哲学概念、伦理学概念与中医学基本概念具有密切关系的基础上提出了中医高校社科文献资源建设的重要意义,和从实际出发求实求精的馆藏方向。
【总页数】2页(P46-47)
【关键词】中医文献;社科文献;阴阳学说
【作者】刘爱华
【作者单位】陕西中医学院
【正文语种】中文
【中图分类】R226
【相关文献】
1.中医肺病重点学科古代文献数据库的建设 [J], 姚明;于雪峰;王祺;王凤兰;丁侃
2.助力重点学科发展的高校文献资源建设——以佛山科学技术学院文献资源建设为例 [J], 毕素清
3.基于中医药学科服务的高校图书馆文献资源建设——以湖北中医药大学图书馆为例 [J], 李友巍;鲁红玲;贾佳;孙玲
4.转制后的思考——从基础学科和文献资料的学科建设谈中医药学院的发展 [J], 殷平善;
5.学科服务视野下的高校图书馆文献资源流通服务管理
——以湖北中医药大学图书馆为例 [J], 贾海龙
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[基金项目]贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2020]4Y156号)。
△杨青斌,李进 贵州中医药大学2021级中西医结合临床专业在读硕士研究生△司维群,刘静 贵州中医药大学2022级中西医结合临床专业在读硕士研究生△吴佳龙 贵州中医药大学2023级中西医结合临床专业在读硕士研究生▲通讯作者利用网络药理学和分子对接技术分析“猫爪草-冬凌草”对肝癌的治疗作用机制杨青斌1△ 徐 静2▲ 李 进1△ 司维群1△ 刘 静1△ 吴佳龙1△1.贵州中医药大学,贵州贵阳 550000;2.贵州中医药大学第二附属医院肿瘤科,贵州贵阳 550000[摘要]目的 利用网络药理学和分子对接技术对猫爪草与冬凌草进行分析,探讨其治疗原发性肝癌的作用机制。
方法 基于对中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)与传统中药百科全书(ETCM)数据库的检索,掌握有关药物的有效成分与其作用靶点,借助有机小分子生物活性数据库(PubChem)以及小分子药物预测作用靶点平台(Swiss Target Prediction)的支持下,收集一系列肝癌的靶点。
参照蛋白互作数据库(STRING)进行药物与肝癌的蛋白互作(PPI)网络的构建。
在将网络系统应用于探索药物的抗癌过程和作用机理的同时,结合Cytoscope3.9.1软件成功构建“成分-靶点-通路”体系,并借助Metascape 功能实现对共同靶点和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路的富集处理。
此外,利用分子模拟软件AutoDock 展开活性成分与关键靶点间分子对接情况的探究,获取所需的系列研究成果。
结果 筛选出冬凌草与猫爪草的有效活性成分分别有23、9个;两味药的药物靶点总共1020个,共同交集靶点299个;药物和肿瘤疾病共有26个常见靶点。
KEGG 通路的富集显示,药物靶点涉及的通路主要有癌症通路、脂质与动脉粥样硬化通路、PI3K-Akt 信号通路等。
结论 猫爪草与冬凌草相须配伍,具有多成分、多靶点、多通路的作用特点,能协同发挥抗肝癌作用,为后续机制研究提供了切实可行的参考依据。
CHINA MEDICINE AND PHARMACY Vol.14 No.7 April 202477[基金项目]贵州省卫生健康委科学技术基金项目(gzwkj2022-408)。
△贵州中医药大学第二临床医学院2021级中西医结合临床专业在读硕士研究生▲通讯作者基于网络药理学及分子对接探讨二至丸治疗早发性卵巢功能不全的作用机制简万妍1△ 王艳群1 陈美玲1 曾 莉2▲1.贵州中医药大学第二临床医学院,贵州贵阳 550002;2.贵州中医药大学第二附属医院妇科,贵州贵阳 550001[摘要] 目的 基于网络药理学方法探讨二至丸治疗早发性卵巢功能不全(POI)的可能分子作用机制。
方法 使用网络药理学平台(TCMSP)采集二至丸的有效成分和相关的基因;通过基因组注释数据平台(GeneCards)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)数据库获取POI 疾病靶点;用蛋白互作网络数据库(STRING)构建蛋白质相互作用网络(PPI),通过CytoHubba 筛选核心靶点。
使用生物学信息注释数据库(DAVID)平台进行富集分析,采用Cytoscape3.10.0软件进行拓扑学分析,利用AutoDockTools 进行分子对接。
结果 二至丸内最主要的有效成分为槲皮素、木犀草素、山柰酚、刺槐素等,其中的AKT1、TP53等是关键靶点,包含的通路主要为PI3K-Akt 信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化信号通路等。
分子对接验证大部分靶点与成分能进行有效结合。
结论 揭示二至丸能够经多种成分、靶点及多条信号通路对POI 发挥协同治疗作用。
[关键词] 二至丸;早发性卵巢功能不全;网络药理学;分子对接[中图分类号] R271.9 [文献标识码] A [文章编号] 2095-0616(2024)07-0077-05DOI:10.20116/j.issn2095-0616.2024.07.18Study on the mechanism of Erzhi pills in treating premature ovarian insufficiency based on network pharmacology and molecular dockingJIAN Wanyan 1 WANG Yanqun 1 CHEN Meiling 1 ZENG Li21. The Second Clinical Medical College of Guizhou University of Traditional Chinese Medicine, Guizhou, Guiyang 550002, China;2. Department of Gynecology, the Second Affiliated Hospital of Guizhou University of Traditional Chinese Medicine, Guizhou, Guiyang 550001, China[Abstract] Objective To explore the possible molecular mechanisms of Erzhi pills in the treatment of premature ovarian insufficiency (POI) based on network pharmacology. Methods The Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform (TCMSP) was used to collect the active ingredients and related genes of Erzhi pills, POI disease targets were obtained through the genome annotation data platform (GeneCards) and the Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) database, a protein-protein interaction (PPI) network was constructed using the protein-protein interaction networks database (STRING), and core targets were screened through CytoHubba. Enrichment analysis was conducted using the bioinformatics annotation database (DAVID) platform, topology analysis was performed using Cytoscape 3.10.0 software, and molecular docking was performed using AutoDockTools. Results The main active ingredients in Erzhi pills were quercetin, luteolin, kaempferol, locust, etc. Among them, AKT1, TP53, etc. were key targets, and the pathways include PI3K-Akt signaling pathway, fluid shear stress, atherosclerosis signaling pathway, etc. Molecular docking verifies that most targets and components could effectively bind. Conclusion Erzhi pills can exert synergistic therapeutic effects on POI through multiple components, targets, and multiple signaling pathways.[Key words] Erzhi pills; Premature ovarian insufficiency; Network pharmacology; Molecular docking早发性卵巢功能不全(premature ovarian insufficiency,POI)[1]指的是女性在40周岁以前发生的一种生殖内分泌疾病,以月经稀发、频发甚至闭经,生育力下降甚至不孕或出现潮热盗汗等为主要临床症状,并伴随卵泡刺激素(follicle-stimulating hormone,FSH)水平升高(FSH>25 IU/L)、雌激素水平降低。
第11卷第7期Vol.11 No.7227“互联网+”时代下中医药文化传播面临的挑战和思考刘 笑(南通市中医院,江苏 南通 226000)摘 要:中医药文化作为中国传统文化的精髓,是我国软实力体现的重要方面。
当下,在“文化强国”战略的指导下,怎样在“互联网+”时代传承创新中医药文化成了最热门的讨论话题。
本文主要从中医药文化的意义、互联网的传播优势和中医药文化的创新几个方面,浅析中医药文化传播的途径,将中医药文化发扬传承、创新发展。
关键词:“互联网+”;中医药文化;文化传播中图分类号:G206 文献标志码:A 文章编号:1674-8883(2020)07-0227-01近些年来,“互联网+”医疗的发展势不可挡,几乎覆盖到了全部行业。
中医药文化作为中国的传统文化,无论在健康产业管理还是在传统国学中都占有举足轻重的位置。
自2015年以来,中医药行业相继迎来重大政策利好。
政府出台相关政策,制订“互联网+”在中医药产业中的实施方案,包括中医药电子商务平台的供销采购,基于互联网的中医药健康传播平台等,明确指出推动“互联网+”中医医疗的发展。
[1]一、中医药文化的地位和传承意义中医文化源远流长,中医药学更是植根于中医药文化,优秀的中医药文化起着引领中医药学发展的作用。
因此,做好中医药文化的传播更利于继承、发展中医药事业。
近几年,中医药文化受到了前所未有的关注度,国家大力倡导发扬传统中医药文化。
如何做好中医药文化传播这一命题,对于提升国家的软实力有着不可估量的作用。
面对社会老龄化问题越来越突出的现状,原有疾病在没有得到有效控制的同时,新的疾病又层出不穷,医学界面临着巨大的挑战。
中医药作为医学界重要的组成部分之一,其传播推广意义不言而喻。
国家卫计委副主任、国家中医药管理局局长王国强指出:“中医药是我国独具特色的医学科学,是中华民族对世界医学和世界文明的重要贡献。
”面对医学难题,中医所提倡的整体观、基础论、辨证治疗法和治未病等理念贡献越来越突出,其作用和地位也得到了国内外医学界的肯定和赞誉。
2021年2月第2期Vol. 42 No. 2 2021小型微 型计算 机系统Journal of Chinese Computer Systems利用网络表征学习辨识复杂网络节点影响力杨旭华,熊帅(浙江工业大学计算机科学与技术学院,杭州310023)E-mail : xhyang@ zjut. edu. cn摘要:发现复杂网络中最具影响力的节点,有助于分析和控制网络中的信息传播,具有重要的理论意义和实用价值.传统的确定节点影响力的方法大多基于网络的邻接矩阵、拓扑结构等,普遍存在数据维度高和数据稀疏的问题,基于网络表征学习,本 文提出了一种局部中心性指标来辨识网络中高影响节点(NLC),首先采用DeepWalk 算法,把高维网络中餉节点映射为一个低维空间的向量表示,并计算局部节点对之间的欧氏距离;接着根据网络的拓扑结构,计算每个节点在信息的传播过程中,对所在 局部的影响力大小,用以识别高影响力节点.在八个真实网络中,以SIR 和SI 传播模型作为评价手段,将NLC 算法和度中心性、接近中心性、介数中心性、邻居核中心性、半局部中心性做了对比,结果表明NLC 算法具有良好的识别高影响力传播节点飴 性能.关键词:节点影响力;网络表征学习;局部节点中心性;复杂网络中图分类号:TP301文献标识码:A 文章编号:1000-1220(2021)02-0418-06Identiflcation of Node Influence Using Network Representation Learning in Complex NetworkYANG Xu-hua,XIONG Shuai(Computer Science and Technology College,Zhejiang University of Technology ,Hangzhou 310023 .China)Abstract : Finding the most influential propagation nodes in complex networks is helpful to analyze and control the propagation of in formation in the network , which is of great theoretical significance and practical value. Most of the traditional methods for determining the influence of nodes are based on the adjacency matrix and topology of the network , and the problems of high data dimension and da ta sparsity are common. Based on Network Representation Learning , this paper proposes an algorithm to identify the high influence propagation nodes of the network ( NLC). Firstly ,the deepwalk algorithm is used to map the nodes in a high-dimensional network intoa vector representation of a low-dimensional space and calculate the euclidean distance between local node pairs. Then ,according to thetopology of the network,the influence of each node on the local area during the propagation of information is calculated to identify the high-influence nodes. In eight real networks , SIR and SI propagation models are used as evaluation methods , comparing the NLC algo rithm with degree centrality , closeness centrality , betweeness centrality , neighborhood coreness , and semi-local centrality , the resultsshow that NLC algorithm has good performance in identifying high-influence propagation nodes.Key words : node influence ; network representation learning ; node local centrality ; complex network1引言真实世界中的许多系统都可以抽象为复杂网络,比如社 交网络、交通网络、电力网络、通信网络、人物关系网络、流行病传播网络等.辨识网络中有影响力的传播节点,涉及到网络 的结构和功能等属性,包括度分布,平均距离,连通性,信息传 播,鲁棒性等3〕,在实际应用中,能够控制信息在网络中的 传播⑷、做高效的新闻推广⑸、避免电网中故障的传播⑷、分 析蛋白质之间的相互作用⑺等.如何有效辨识网络中节点传播影响力的大小,研究者们 已经有了不少研究成果,这些方法总体上可以分为两种类型: 基于局部信息和基于全局信息的判断节点中心性的方法.基 于局部信息的方法,例如:度中心性⑻把节点连接的边的数量作为衡量的指标;邻居核中心性⑼把节点的一级邻居、二级邻居和三级邻居节点个数之和当做判断影响力大小的指 标;K-shell 分解方法31,是一种基于节点局部拓扑结构的方 法丄iu 等人认为许多真实网络由于局部的紧密连接而存在类核结构,导致许多节点的值不能真实的反映节点在网络中的影响力,他们通过删除冗余边的策略,提高了 K-shell 值 的准确性;郑文萍等人衡量节点在网络连通性中的作用, 通过节点所连边对局部网络连通性的影响来反映该节点在网 络连通性方面的重要性;Chen 等人口结合度中心性和全局信息,提出了一种半局部中心性方法,实验表现与紧密中心性相同,但计算复杂度较低;李维娜等人,基于网络的局部社 团结构和节点度的分布情况,提出了一种重要节点挖掘算法SG-CPMini n &基于网络全局信息的方法往往能获得比基于局部信息的算法更高的精确度,但计算复杂度比较高.例如介数中心收稿日期:2020-02-24 收修改稿日期;2020-04-14 基金项目:国家自然科学基金项目(61773348)资助;浙江省自然科学基金项目 (LY17F030016)资助.作者简介:杨旭华,男,1971年生,博士,教授,CCF 会员,研究方向为机器学习、复杂网络、智能交通;熊0巾,男,1994年生,硕士研究生,研究方向为机器学习、复杂网络.2期杨旭华等:利用网络表征学习辨识复杂网络节点影响力419性和接近中心性:冏,都是基于全局路径的方法,考虑网络中任意节点对之间的路径.谷歌公司提出的PageRank"",通过考虑邻居节点的数量和质量,再进行全局的迭代计算来确定节点的重要性.吕琳環等人提出一种类似于PageRank的算法,在网络中增加了一个背景节点与所有节点进行双向连接,使新的网络成为强连通网络,称作LeaderRank").王斌等人(切考虑网络的结构及属性信息,提出节点信任度的概念,同时将节点信任度引入到PageRank算法中,构建了一种关键节点识别算法TPR(Trust-PageRank);Lu等人画提出了一种基于信息扩散特性,将节点的局部属性与全局属性相结合的WeiboRank(WR)算法,在微博社交网络数据上表现良好.上述辨识方法,都是建立在传统的网络表示方法之上的,普遍依赖于网络的邻接矩阵和拓扑结构,具有维度高和数据稀疏的特点,计算复杂度高,在大型网络使用中计算代价比较高.随着网络表征学习技术在自然语言处理等领域的发展和广泛应用,研究者们转而探索如何将网络中的节点表示为低维且稠密的向量,提岀了诸多方法.DeepWalk是网络表征学习的先驱0),将词表示学习算法word2vec[22]应用在随机游走序列上,从而生成了节点的低维度表示向量.Lineal针对一阶相似度和二阶相似度,提出了一种边采样算法优化目标函数,进而得到节点的向量表示.N o de2vec[241通过改变随机游走序列生成的方式扩展了DeepWalk算法,将宽度优先搜索和深度优先搜索引入了随机游走序列的生成过程,综合考虑了网络的局部信息和全局信息来表示节点•CANE1251假设每个节点的表示向量由文本表示向量及结构表示向量构成,其中,文本表示向量的生成过程与边上的邻居相关,再利用卷积神经网络和注意力机制对一条边上两个节点的文本信息进行编码,得到节点的表示向量■SDNE1261使用深层神经网络对节点表示间的非线性进行建模,把模型分为两个部分:一个是由Laplace矩阵监督的建模第1级相似度的模块,另一个是由无监督的深层自编码器对第2级相似度关系进行建模,将深层自编码器的中间层输岀作为节点的向量表示.这些算法从不同的角度,采用不同的优化方法,把高维和稀疏的网络映射到低维和稠密的向量空间,保留网络的原有结构,具有计算复杂度低和准确度高等特点.在本文中,我们基于网络表征学习提出了一种辨识网络节点影响力的方法.采用网络表征学习DeepWalk算法把高维的复杂网络映射到低维的向量空间,把网络节点映射为欧式空间中低维的向量表示,然后结合网络拓扑信息提出节点的局部中心性,作为判断节点影响力大小的指标.2基于网络表征学习的节点局部中心性节点在网络中传播信息时,与其局部的拓扑结构有很大的关系.已有研究表明:节点的K-shell值越大,周围的拓扑结构越紧密,节点向周围区域传播信息的效率越高〔勿,同时,信息传递的强度随着节点间距离的增大而迅速衰减皿),由此,提出一种基于网络表征学习和局部中心性确定任意节点i的影响力指标:NLC(i)=Z心X e-')Ti-X/2(J)其中,Ks,■表示节点i的K-shell值必”分别表示节点ij用DeepWalk网络表征方法映射到低维欧式空间的向量,比-X」表示两个向量之间的欧氏距离,r(i)表示i节点的三级邻域,即i节点的一级邻居、二级邻居以及三级邻居节点的集合j节点属于r(i)集合.网络中节点间的距离,本文没有采用网络的最短路径距离,因为会存在如下的问题,如图1所示,i节点在传播它自身的信息时,首先会影响它的一级邻居节点,比如节点k和节点j,当节点A和/被感染后,由于j节点有更多的连接到外部区域的邻居节点(图1中灰色节点),尽管同样是节点i的一级邻居节点J比k在传播i节点信息的过程中贡献更大【切,所以,信息在网络中的传播,除了距离以外,还与网络的结构密切相关,最短路径距离的长度不能准确的表示信息在传播过程中的衰减,还要根据网络的拓扑结构,对所求节点的邻域节点做进一步的划分.因为网络表征学习方法不但可以把高维网络映射到低维的向量表示,而且可以同时保持网络的结构,节点间的距离用低维向量间的欧式距离替代后,不仅考虑了最短路径距离,而且包含了图1一个有8个节戌和节点周围的拓扑结构信息,能够9务边的网络更准确的描述信息在网络传播过Fig.1Nitwork with eight程中的衰减因此在本文中,我们....选择应用DeepWalk方法,把网nodes and nine edges络节点映射到低维的向量表示,然后用节点相应的低维向量来计算节点之间的距离.具体地,基于DeepWalk方法,将网络空间映射到欧式空间,把每一个节点表示为一个低维稠密的向量,将具有N个节点的网络G转化为欧氏空间的N个r维向量,一个网络节点及其连边信息对应一个向量,其中任意节点i的向量表示为:Xi=(x.l,X.2,X.3,…,x.,),i=1,2,3,,N,在本文中,『取N/23实验和分析3.1数据集为了评估所提出的方法的性能,我们在8个真实世界的网络中进行了实验,这8个网络都是无向网络,也不考虑权重,它们分别是常见形容词和名词的邻接网络adjnoun f30]、科学家合作网络netscience、Ca-GrQc和hep-th[31H]、新西兰宽吻海豚社会网络dolphin1341、小型的facebook社交网络、爵士音乐人合作网络Jazz匈、美国政治图书网络polbooks1371,表1给出了8个真实数据集的拓扑属性参数.其中,N和E分别表示网络的节点数和边数,〈&〉表示网络的平均度,在本文中,考虑到现实世界中网络的度分布往往存在“重尾效应”,令0”=<*>/<*2>[381,表示SIR模型传播的阈值,c表示网络的平均聚类系数.3.2评价方法和指标3.2.1SIR疾病传播模型SIR属于动态传播算法,结果准确性好但计算复杂度高,420小型微型计算机系统2021年本文提出的NLC算法及其他静态指标方法计算复杂度低,我们用SIR疾病模型做为基准参照模型去评价不同的判断节点影响力静态指标方法性能的优劣(列.在SIR模型中,如果需要判定一个节点在网络中的传播影响力,则把这个节点设定为网络中唯一的感染节点(Infected),其他节点标记为易感节表1数据集Table1Data setsNetwork N E〈k〉cdolphin62159 5.130.1470.27polbooks1054418.40.0840.488Jazz198274227.700.0260.617adj n oun1124257.5890.0730.1728 netscience15892742 3.4510.1440.6378 facebook40398823443.6910.0090.6055 Ca-GrQc524214496 5.5310.05930.5296 hep-th836115751 3.7680.1150.4420点(Susceptible),在每个时间步,每个感染态节点会以概率0(0=1.50*)感染其易感邻居节点,0”表示SIR模型传播的阈值,然后以概率“(在本文中,我们设置“=1)从疾病中恢复,变成移除态(Recovered),移除态节点不会再被感染.这个过程不断迭代直到网络中没有感染节点为止,r时刻网络中移除态和感染态节点的总数量,记为F(r),F(r),作为评价r时刻该节点传播影响力大小的指标,F(r)越大,该节点影响力越大. 3.2.2SI疾病传播模型在该模型中,节点一旦被感染,状态从S变为I之后不能恢复,其他条件和SIR模型相同,在本文中,易感状态节点被感染的概率为苹".如果在相同的时间步的条件下,一个节点感染的网络节点越多,则说明该节点感染能力越强,影响力越大.3.2.3肯德尔系数不同的方法都可以按照所计算的传播能力,对网络中所有节点从高到低排序,针对不同的感染率0,我们用肯德尔系数7去评价不同的静态指标方法得到的排序列表和SIR动态传播模型生成的排序列表之间的联系I切,t是一个在[-1, 1]之间的一个数,7■越大,两个序列吻合度越高,T被定义为:2(M-NJN(N-1)(2)N c表示两个排序列表相协调元素的数量,M表示二者不协调元素的数量,N表示网络节点总数.3.3数值仿真首先,对八个真实网络的每一个节点在本网络内赋予唯一的编号,比如网络1有N个节点,则网络节点的编号应该是1,2,……,N.3.3.1比较NLC和5种知名中心性方法识别的Top-10高影响力节点的准确性在表2中,我们以SIR模型计算出来的Top-10节点为基准,在4个真实网络上,用NLC方法,度中心性(DC)、接近中心性(CC)、介数中心性(BC)、邻居核中心性(Cnc)、半局部中心性(CL)分别计算ToplO节点,比较不同方法的准确性,考虑到网络的规模和时间复杂度,本文令『=10[41].具体计算方法为:以dolphin网络为例,首先用SIR模型在t=10时刻,计算得到F(10)数值最大的Top-10节点做为基准,然后用NLC方法算出Top-10节点,如果两组节点有9个相同,则NLC算法的准确率为90%.表26种中心性算法和SIR模型对排名前10节点的识别结果Table2Six algorithms and SIR modelsto identify thetop-10nodes网络dolphin算法(准确率)排序DC(70%)BC(60%)cc(60%)Cnc CL(80%)(80%)NLC(90%)F(10) 1153737151515152382414638383834641383846412143438213434214155281521413746618182303046377212184151342830552952525130958523422125110258958173052网络adj n oun算法(准确率)排序DC(70%)BC(60%)CC Cnc CL(70%)(80%)(80%)NLC(80%)F(10) 11818181818181823333352334444525252352452524444444444510510281051051051056108010525512851725105105125101082828272826252592622510552655102292619325160网络polbooks算法(准确率)排序DC(80%)BC(60%)CC Cnc CL(40%)(70%)(90%)NLC(90%)F(10) 193131999921350591313131334108858531734851350473410573731073747346677777743110317744153148585831597367676774912954112745104183248741212网络netscience算法(准确率)排序DC(30%)BC(30%)CC Cnc(20%)(40%)CL(0%)NLC(80%)F(10) 134797934143034552351512823514313556337951715163143255344552827575564656335529521730291714332821336143035152914143413354714317573554143513475781432302132120214361351359631337602951437562762102172041124220143854562在表2中,比较其它5种方法,本文提出的NLC算法在4个数据集中都取得了最高的准确率.接下来,我们比较了各种2期杨旭华等:利用网络表征学习辨识复杂网络节点影响力421静态指标算法与SIR模型得到的Top-10节点排序列表的吻合程度,在小型网络polbooks和adjnoun中,6种中心性算法都有较高的准确率,CL算法和NLC算法有相同的准确率,但NLC得到的序列与SIR模型给出的序列更吻合;在dolphin 和netscience网络中,NLC算法不仅有最高的准确率,而且给出的排序序列与SIR模型给出的序列更吻合;就整体而言,NLC与SIR模型得到的序列保持良好的吻合度.其中实验结果取1000次实验的平均值,最佳准确率用黑体字标出,F(10)表示SIR模型在第10时间步的结果.3.3.2比较NLC与5种知名中心性方法在SIR模型下餉肯德尔系数分别用各种静态指标算法与SIR模型对一个网络中所有节点的影响力排序,然后比较各种静态指标算法得到的节点排序列表和SIR模型得到列表的吻合程度,我们用肯德尔系如图2所示,针对不同的感染率B,使用NLC和5种知名中心性方法计算出网络中所有节点的影响力大小排序列表,与SIR模型生成的排序列表做对比,得到肯德尔系数T.在adjnoun网络中,BC算法表现最差,CL和Cnc算法表现基本相同,NLC算法表现最好;在polbooks网络中,CC和BC 表现最差,NLC、CL、Cnc表现良好;在netscience网络中,表现最差的还是BC算法,CC和CL算法也表现不佳,当B< 0.04.NLC算法表现最好,总体表现良好;在facebook网络中,CC表现最差,当p>0.04,NLC表现最好;在hep-th网络中,当B<0.04时,NLC算法表现最好,当p>0.04,NLC算法在6种方法中排名第二;dolphin网络中,当B在0到0.04以及0.07到0.1这两个区间时,NLC算法表现最好,优于其它算法;在Jazz和Ca-Grtjc网络中,BC算法表现最差,当B >0.03时,NLC算法表现最好;综上所述,NLC在肯德尔系数表示这个吻合程度.0.80数上表现最佳.netscienceinounb0.70l0.60.650.60NLC CC BC DC CL Cnc00.020.04 0.06 0.080.100.020.040.060.080.103NLC CC BC DC CL Cnc图2NLC,8,BC,DC,CL,Cnc算法的肯德尔系数,取1000实验的平均值.横坐标表示节点被感染的概率,纵坐标表示肯德尔系数Fig.2Kendall correlation coefficient of NLC,CC,BC,DC,CL,Cnc algorithm which are taken as the average value of1000 experiments.The horizontal ordinate represents the probability of the node being infected,and the longitudinalordinate represents the Kendall correlation coefficient3.3.3比较NLC和CL、Cnc方法■所选Top-10节点的平均感染能力在8种不同的网络中.NLC算法性能均排前列;BC和CC 算法不仅计算量大,而且表现差;Cnc算法和CL算法,在不同的数据集中,表现极不稳定,在有些数据集中表现较好,在有些数据集中甚至差于BC和CC算法.为进一步比较NLC.CL以及Cnc算法的性能,我们使用SI模型检验3种算法性能.首先用一个算法选出Top-10节点,然后用Top-10节点在第r个时间步之内感染的节点总数与网络节点总数的比值的平均值I(t)诰(3)422小型微型计算机系统2021年做为该算法的性能指标•在式(3)中,n表示网络节点总数,%,表示Top-10节点中第i个节点第1到第r步感染的节点总数.在相同的时间步和感染概率的情况下,哪一种方法选出的Top-10节点感染的节点越多,可以认为该算法表现越好.具体实验结果如图3所示,可以看到,NLC算法在4个网络中都取得了最佳性能.在dolphin网络中,NLC算法表现最好,Cnc算法性能最差;在netscience网络中,当时间步大于15后,NLC算法感染的节点比另外两种算法明显增多,达到 稳定的时间也比另外两种算法早,所选Top-10节点表现最好Ca-GrQc网络中,时间步小于10时,3种算法表现相近,大于10后,NLC算法表现最好,且NLC算法在第33个时间步就达到稳定;在hep-th网络中,Cnc算法表现最差,在第42个时间步才达到稳定,NLC算法表现最好.(d)©图3Top-10节点的感染能力和时间步的关系曲线,取1000次实验的平均值.横坐标表示时间步,纵坐标表示第t个时间步内Top-10节点在SI模型中感染的节点数的平均值与网络节点总数的比值Fig.3Relationship curve of infection ability and time step of Top-10node.The results are taken the average of1000experiments, the horizontal ordinate represents the time step,and the longitudinal ordinate represents the ratio of the average number of nodes infected by Top-10nodes in the SI model to the total number of network nodes within the t time step4总结和分析在本文中,我们基于网络表征学习方法,结合节点的拓扑结构和邻域信息,提出了一种节点局部中心性指标来识别节点影响力的方法•该方法提出网络中的节点的影响力由拓扑结构决定,同时随着距离的增加而衰减•在8个真实网络中,通过和5种知名的中心性方法相比较,在计算Top-10节点、Top-10节点的感染能力和肯德尔系数等方面,NLC算法取得了良好的辨识效果,在分析和控制复杂网络中的信息传播过程中具有广阔的应用前景.References:[1]Albert R,Barabasi A L.Statistical mechanics of complex networks[J].Review of Modem Phy s ics,2001,74(1):47-97.[2]Boccaletti S,Latora V,Moreno Y,et plex networks:structure and dynamics[J].Complex Systems and Complexity Science, 2006,424(4-5):175-308.[3]Newman M E J.The structure and function of complex networks[J].Siam Review,2003,45(2):167-256.[4]Wells C R,Galvani A P.Coupled disease-behavior dynamics oncomplex networks:a reviewf J].Physics of Life Reviews,2015,62(15):55-56.[5]Medo M,Zhang Y C,Zhou T.Adaptive model 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基于复杂网络的我国高等中医药院校作者影响力分析钱爱兵刘艳华[摘要]通过采集2004-2012年我国23所高等中医药院校在248种医药卫生类中文核心期刊所发表的合著论文数据,建立和研究了我国高等中医药院校的科研合著关系网络,对合著网络进行可视化识别,并对该网络的特征参数进行了计算,对作者影响力进行了分析,选择代表性合作网络进行解读。
研究结果表明,中医药院校整体合作情况不够理想,并且网络中具有很强影响力的作者比较少,需要从培养具有强影响力的作者和加强团队之间相互合作两方面共同努力。
[关键词]中医药院校;合著网络;中文医药科学引文索引;社会网络分析中图分类号:G250文献标识码:A文章编号:1004—3926(2016)07—0223—12基金项目:江苏省教育科学“十二五”规划2011年度课题“中国高等医药院校学术影响力研究”(C-c/2011/01/81)、国家中医药管理局中医药发展战略规划课题“中医医院影响力评价研究———以江苏省为例”(ZYYP-2015(6-2));江苏省教育厅“青蓝工程”资助(苏教师(2014)23号)阶段性成果。
作者简介:钱爱兵(1978-),男,安徽天长人,江苏中医药大学经贸管理学院副教授,博士,研究方向:医药卫生科学评价;刘艳华(1985-),女,河南漯河人,江苏中医药大学经贸管理学院讲师,博士,研究方向:社会科学评价、信息检索。
江苏南京210023引言随着大科学时代的到来,现代科学技术在不断地分化与发展,而且愈来愈趋向于交叉性、综合性的研究范式。
一些跨学科、跨地域、高难度、大规模的复杂问题,尤其需要科研合作,才能取得原创性的成果与突破性的进展。
合作研究亦越来越成为学术研究的发展趋势,单枪匹马式的研究逐渐让位于合作研究。
惟其如此才能够实现研究资源优势互补,促进知识交流和共享。
科学计量学家在研究中甚至还发现[1]:科学合作不但能够促进科学家的成果产出能力,而且能提高研究成果的质量和影响力;合著论文的著者人数与论文产生的影响因子正相关;合著论文比独著论文更易被期刊接受并能产生较大影响;合作群体越大,研究成果越具有影响力。
目前,国内关于合著现象的研究成果已经十分丰富:杨洪勇等[2]通过对2001年1月至2006年12月期间,发表在《情报科学》期刊上的科研论文进行统计,建立了一个科研人员合作网络演化模型,来分析科研人员之间的合作方式。
丁堃等[3]以我国科学学和科技管理领域10本重要期刊1994-2006年间的22459篇合著论文为载体,分析大学团队在合作网络中的地位、主要研究力量分布和重要领军者的地位,揭示我国科学学与科技管理研究合著网络的整体属性及其特征。
汤建民等[4]对1998-2007年CSSCI库收录的76007篇教育学论文的合著率和篇均作者人数进行了统计分析,并用社会网络分析方法进一步对该学科2003-2007年间的270多位高产作者之间的合作情况,以及2007年的教育学论文作者合作网进行个案研究,绘制他们的合作知识图谱。
沈建通等[5]以SCI获取的循证医学领域的9727篇文献为研究对象,构建中外高被引作者同被引矩阵和作者合作矩阵,采用整体网络分析法进行分析,利用UCINET软件实现可视化,直观地揭示和比较中外循证医学领域作者、所处位置、领域共同体及其演化。
邱均平等[6]从论文合著角度研究作者合作关系及本领域热点,基于CNKI数据库2000-2010年11年的论文数据,借助UCINET工具,通过分析合著关系网络密度、中心性及小团体,揭示国内计量学作者合作关系特征。
姚强等[7]依据中国学术文献网络出版总库(CNKI)和中国生物医学文献数据库(CBM)为数据源,将传统的文献计量学方法与社会学中的社会网络分析方法相结合,并借助可视化技术,揭示了国内外健康素养领域的机构、作者之间的合作情况。
韩芳芳等[8]以CSSCI中2006-2010年我国数字图书馆领域的相关论文为数据源,采用社会网络分析方法,构建该领域的作者合作网络并进行可视化展现。
彭希羡等[9]采用社会网络分析方法构建社会计算领域作者间的合作网络,描述整体网络结构的特点,分析社会计算领域合作团体的发展过程。
综上,可以看出,目前医学领域的作者合著较多关注的是某一个具体研究领域,对机构的作者合著一般涉及数量较少。
反观人文社科领域,作者合著现象的研究则丰富很多。
关于科研合作程度的研究主要采用两个方面的指标:一是传统和常用的指标,例如:期刊论文合著率、篇均作者数。
另一方面是借用社会网络分析提出的新指标,例如:社会网络中的点度、接近度、中介度、密度和网络直径等。
两类指标各有不同的研究重点、长处和使用局限,笔者将其结合,有效解决科研合作中海量数据的复杂计算、分析和展示。
从复杂网络的角度对中医药院校的科研合著现象进行分析,一方面可以加深对整个中医药学领域科研人员合著状况的了解;另一方面,也可以通过网络的结构特点来分析实际合著网络中的优势与不足,为改进科研活动中的合作方式提出建议,对促进中医药学领域科研合作的发展具有积极的意义。
找出各个院校的发展潜力和对医学研究的参与程度,寻找到正确的发展方向。
一、数量的来源与处理(一)数据的来源1.中医药院校选择笔者选取23所高等中医药院校作为基本统计样本,不涵盖综合性大学和西医院校设立的中医学院、中药学院。
例如:河北大学中医学院、延边大学中医学院、河北北方学院中医学院、海南医学院中医学院等均不在本文的讨论范围。
2.论文采集对象与时间跨度采集所有以23所中医药院校及其直属附属医院作为第一作者单位在中文核心期刊上的发文。
第一作者若不是中医药院校或直属附院,则不予采集。
如南京中医药大学直属附院———江苏省中医院,这家医院的发文也归并到南京中医药大学,其他非直属附院则予以剔除。
鉴于引文数据加工的时滞性,而且9年的数据量已经能够很好揭示本文提出的问题,因此,论文采集的时间跨度为2004-2012。
3.数据来源科研成果,特别是合著成果的产出主要是期刊论文、会议论文和研究报告,而又以期刊论文为多,因此本文的研究对象是国内期刊论文。
笔者参照北京大学《中文核心期刊要目总览》(2011年版)所收录之248种医药卫生类来源期刊,创建《中文医药科学引文索引》(Chinese Medicine Sci-ences Citation Index,以下简称CMSCI),本文采用的分析数据均从CMSCI数据库中获取。
需要说明的是:①CMSCI数据库所收录期刊的学科分类依据《中华人民共和国学科分类与代码简表(国家标准GBT13745-2009)》,分为14个学科:基础医学、临床医学综合、内科学、外科学、妇产科学、儿科学、五官科学(口腔医学、眼科学、耳鼻咽喉科学合并为五官科学)、肿瘤学、皮肤病学与性病学、神经病学与精神病学、预防医学与公共卫生学、特种医学、药学、中医学。
②CMSCI数据库共采集248种核心期刊2004-2012年度的来源文献855669篇,参考文献8079116条,涉及作者3549674人次,其中中医药院校第一作者发文32557篇,参考文献321576条,作者141483人次。
由于数据量异常庞大,原始网页本身也存在谬误,因此在引文数据加工处理过程中极易发生错误。
(二)数据处理1.机构名称规范化(1)高校名称规范化:从1993年开始,国内高等中医药院校开始由中医学院陆续更名为中医药大学,截至目前,除河南中医学院、贵阳中医学院、云南中医学院、陕西中医学院、甘肃中医学院、山西中医学院6家以外,其余17所中医药院校全部更名为中医药大学。
笔者对所有更名数据均进行了归并。
(2)直属附院名称规范化:中医药院校直属附院的表达方式多样,全称、简称并存。
例如:北京中医药大学东直门医院,即北京中医药大学第一临床医学院。
很多论文作者标注为北京中医药大学东直门附属医院、北京中医药大学第一附属东直门医院、北京中医药大学东直门医院、北京中医药大学附属东直门医院等,实际上为同一单位。
广州中医药大学第一附属医院也是广州中医药大422《西南民族大学学报》(人文社会科学版)2016年第7期学第一临床医学院。
此类数据均进行了规范化处理。
2.同名作者处理构建作者合著网络时,同名作者易导致网络图偏差,或原本没有合著关系的作者构成密集的复杂网络。
针对可能存在的作者同名问题,笔者根据论文合作者的单位进行二次核对,若同名,则在作者名称后面加上单位,以示区别。
例如:南京中医药大学、北京中医药大学都有李伟,北京中医药大学和河南中医学院都有郑宏。
还有其他很多类似作者属于不同单位,例如:王勇、李敏、王斌、刘斌、王伟等。
笔者对所有同名作者均进行了处理。
3.作者合著数据处理为了准确挖掘出中医药院校科研合作团队,笔者选择9年发文量在45篇及以上(含非第一作者发文)的作者作为种子作者(共计175位),通过自编程序以Excel格式输出175位作者的所有合著者,再利用Pajek的一个第三方应用程序———creatpajek.exe,将Excel转化为Pajek的数据格式,绘制作者合著网络图。
二、研究结果(一)作者合著情况分析科研人员开展合作研究,并以合著的方式发表学术论文是体现学术合作的一种重要形式。
就高校而言,合著比例的统计,成为了体现院校科研合作度的一个重要指标。
笔者统计了23所中医药院校发表论文的篇数和作者数,分别得出院校间作者合著度和合著率数据,如表1、表2所示。
表12004-2012年高等中医药院校作者合著度统计年份2004200520062007200820092010201120129年平均发文数1808229827542995334836604564537657543617作者数60788169990611397127941446518677227742495414357篇均作者数 3.36 3.55 3.60 3.81 3.82 3.95 4.09 4.24 4.34 3.86由表1可以看出,9年间高等中医药院校的篇均作者数(合著度)一直保持平稳增长,说明愈来愈多的科研工作者投入到科研合作中来,合作的广度和深度在不断加强。
表22004-2012年高等中医药院校作者合著率统计人数年度独著二人三人四人五人六人七人及以上合著率200427036641330521912311285.07% 200526745549642230617817488.38% 200630551162850836721721888.93% 200727050763957343926030790.98% 200829157564968551933229791.31% 200926058074671258740137492.90% 201029865686185681057151293.47% 2011326714917969100175569493.94% 201229979794399596785489994.80%百分比7.94%15.85%19.33%18.51%16.02%11.34%11.02%分析表2数据可以看出:对比9年的数据,论文合著率逐年递增,由85.07%上升到94.80%,9年合著率平均达到了91.09%。