基于Linux集群的并行计算
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Linux系统NUMECA软件的使用和并行计算1 NUMECA软件的启动NUMECA软件安装在/Filesystem/numeca目录下,打开/filesystem/numeca/bin就能看到NUMECA系列软件启动图标,如下图所示:双击图标打开应用程序,选择Run in Terminal就可以运行相关程序。
下面主要介绍其它两种相对来说比较简单的方法:方法1:直接启动Linux命令行窗口(Terminal)或者登录到远程桌面,右键打开一个Terminal 窗口:输入命令:cd /numeca/bin 打开numeca软件所在的文件夹ls 显示文件夹下所有子目录./fine 启动软件方法2:以上设置已经加载到进程中,因此只要输入命令fine就可以启动软件Fine计算软件。
打开如下的FINE计算界面:2 并行计算设置选择Modules→Task Managers,进入到FINE计算的任务管理器:选择需要计算的RUN文件,事先通过Xftp已经上传到服务器上:勾选并行计算选项,黄色表示选上,选择Flow solver parallel settings进入到并行环境求解器设置界面,这里需要注意,由于Lincese的限制,只能选择4个CPU 并行计算,否则会报错,提示Lincense不支持等错误信息:选择自动分配,这样让4个CPU进行同样的工作量,设置完毕,关闭对话框。
3 并行计算点选Task List里面的Start按钮,就开始计算了:求解器已经启动,并开始计算,显示结果如下:计算过程中,也可以查看收敛历史:用户也可以自行添加任务,进行多任务计算,设置如下:注意:一个任务只能对应一个求解器,一个任务进行的同时,另外一个任务就挂起,只有前者进行完毕之后才进行下一个任务的计算,边界条件,收敛参数,收敛判定条件等均在FINE 里面设置好,保存然后才导入Task manager进行并行计算,这里不提供设置界面,希望大家注意。
linux parallel 用法在Linux 中,`parallel` 是一个用于并行处理任务的命令行工具,它能够将输入数据分发给多个处理单元进行并行处理。
以下是`parallel` 命令的基本用法和示例:基本用法:1. 简单的并行执行命令:```bashparallel command ::: arg1 arg2 arg3```例如,执行三次`echo` 命令:```bashparallel echo ::: A B C```2. 使用输入文件:```bashcat input.txt | parallel command```例如,对文件中的每行进行并行处理:```bashcat input.txt | parallel echo```参数和选项:- `{}` 占位符:在`parallel` 命令中,`{}` 用于表示输入中的元素。
它会被输入的实际元素替换。
```bashparallel echo {} ::: A B C```- `-j` 选项:用于指定并行执行的任务数。
```bashparallel -j 4 echo {} ::: A B C D E F G```在这个例子中,`echo` 命令将同时执行4 个任务。
- `--dry-run` 选项:仅显示要执行的命令,而不实际执行。
```bashparallel --dry-run echo {} ::: A B C```示例:1. 并行压缩多个文件:```bashls *.txt | parallel gzip```2. 计算多个数字的平方根:```bashecho "4 9 16 25" | parallel 'echo "sqrt({})" | bc'```3. 同时下载多个文件:```bashparallel wget ::: URL1 URL2 URL3````parallel` 的强大之处在于它可以轻松地并行执行一系列任务,特别适用于处理大量数据或需要执行多个相似任务的场景。
第7卷第4期中国水利水电科学研究院学报voI.7No.42009年12月JoumalofChina1nstituteofWaterResourcesandHydropowerResearchDecember,2009文章编号:1672.303l(2009)04-0302.05基于LINUX和MPICH2的高性能科学计算集群搭建及其性能评测叶茂,缪纶,王志璋,李江华(中国永利水电科学研究院信息网络中心,北京100044)摘要:在水利工程计算中,单机计算已经不能满足实际科研和生产的需要,大型工程的设计、施工、管理和科学研究都越来越依赖于高性能科学计算。
采用并行计算和计算机网络技术构建高性能科学计算集群,能够有效提高计算速度并降低运算成本。
本文探讨了基于Beo讯llf集群模型,利用普通Pc机和以太网,通过在uNUx操作系统下搭建基于MPIcH2的并行计算集群,实现低成本并行计算平台的技术,并介绍了利用unpack测试对并行计算集群进行性能评测的具体方法。
这一技术对于解决较大规模科学和工程计算问题具有重要的实用价值和经济意义。
关键词:科学计算集群;并行运算;性能评测中图分类号:’I鸭93.02文献标识码:A随着科学技术的不断发展,水利科学研究和大型工程的设计、施工、管理等都越来越依赖于高性能科学计算。
但由于超级计算机的价格昂贵并且运行成本高昂,普通用户难以承受其巨大投资。
因此,利用网络和普通Pc机构建集群以支持高性能科学计算,能够大幅度节约投资并有效降低运行维护成本,而倍受欢迎。
本文介绍在uNux环境下利用普通Pc机构建Be洲lf型高性能科学计算集群的搭建技术以及运用UNPACK计算性能测试评价方法。
1集群系统及并行计算原理集群(Cluster)是一组计算机,它们作为一个整体向用户提供一组网络资源。
这些单个的计算机系统就是集群的节点(N0de),从用户的角度来看集群是一个整体系统而非多台计算机,在应用中用户从来不会感觉到集群系统底层的节点;从管理员角度来看集群是由若干计算机节点组成的系统,他可以方便的进行集群系统节点的增减和重新组合。
linux parallel的用法摘要:1.Linux parallel简介2.Linux parallel的基本用法3.进阶用法与实例4.总结与建议正文:【1】Linux parallel简介Linux parallel是一款强大的命令行并行处理工具,它可以简化进程并行化,使得用户能够更高效地利用多核处理器的性能。
通过使用parallel命令,用户可以轻松地实现任务的分批处理、加速执行,从而提高系统性能。
【2】Linux parallel的基本用法parallel命令的基本语法如下:```parallel [options] command [parameters]```其中,options表示可选参数,command表示要执行的命令,parameters表示命令的参数。
例如,我们有一个多个文件的列表,想要使用ls命令查看这些文件,可以使用如下命令:```parallel ls {}```这个命令会同时查看列表中的所有文件,并将结果显示在同一个终端窗口中。
【3】进阶用法与实例parallel命令支持复杂的并行处理任务,如下所示:1.并行多个命令:```parallel --pipe -N2 command1 command2```这个命令会同时执行command1和command2,并通过管道将command2的输出传递给command1。
2.限制并行任务数量:```parallel -j 4 command```这个命令会限制同时运行的任务数量为4。
3.设置任务优先级:```parallel --eta --timeout 10 command```这个命令会将command任务的优先级提高,并在任务执行超时时设置为优先级最高。
4.添加任务描述:```parallel --eta --colsep="|" --line-buffer command```这个命令会在命令输出中添加任务描述,以便于观察。
linux并行节点计算方法(实用版3篇)目录(篇1)I.引言II.Linux 下并行计算的方法A.多核 CPU 使用时的代码B.Linux 集群中 MPI 的并行计算环境简单配置C.在 Linux 下搭建一个基于 GPU 的并行计算平台III.结论正文(篇1)I.引言在现代计算中,并行计算已经成为了提高计算速度和处理能力的重要手段。
Linux 作为一款开源的操作系统,提供了丰富的并行计算资源和工具。
本文将介绍在 Linux 下进行并行计算的几种方法。
II.Linux 下并行计算的方法A.多核 CPU 使用时的代码在 Linux 下,多核 CPU 的并行计算可以通过编写一个简单的shell 脚本来实现。
这个脚本可以通过循环读取多个文件,并将文件名作为参数传递给处理每个文件的程序,从而实现并行处理。
B.Linux 集群中 MPI 的并行计算环境简单配置MPI(Message Passing Interface)是一种在分布式内存环境下实现并行计算的接口。
在 Linux 集群中,可以通过简单配置 MPI 来实现并行计算。
配置过程主要包括安装 MPI、配置 MPI 环境变量和编写 MPI 程序。
C.在 Linux 下搭建一个基于 GPU 的并行计算平台在 Linux 下,可以通过 OpenCL、CUDA 等技术搭建一个基于 GPU 的并行计算平台。
这些技术可以使 GPU 作为协处理器,与 CPU 协同工作,提高计算性能。
搭建过程主要包括安装相关库、编译和运行示例程序等。
III.结论综上所述,Linux 下并行计算的方法有多种,包括多核 CPU 使用时的代码、Linux 集群中 MPI 的并行计算环境简单配置和在 Linux 下搭建一个基于 GPU 的并行计算平台等。
目录(篇2)I.引言II.Linux 下并行计算的方法A.多核 CPU 使用时的代码B.Linux 集群中 MPI 的并行计算环境简单配置C.在 Linux 下搭建一个基于 GPU 的并行计算平台III.结论正文(篇2)I.引言在现代计算中,并行计算已成为提高计算性能的重要手段。
linux的parallel参数================概述--在Linux系统中,parallel是一个非常有用的工具,它能够并行地执行一系列的任务,从而提高任务的执行效率。
parallel参数是parallel命令的一些选项和参数,它们可以用来控制parallel的行为和性能。
本篇文档将详细介绍parallel参数的基本概念和使用方法。
基本用法----要使用parallel命令,你需要先安装它。
在大多数Linux发行版中,你可以使用包管理器来安装parallel。
一旦安装完毕,你就可以使用parallel命令来并行地执行任务了。
基本语法:```shellparallel[options][command]```parallel命令接受一系列的选项和参数,用于控制命令的执行方式。
常用的选项包括:*`-j`或`--jobs`:指定同时执行的进程数。
*`-k`或`--keep`:保留输出结果,并将其返回给原始命令。
*`-P`或`--pipe`:指定管道中的管道数。
*`-v`或`--verbose`:显示详细的输出信息。
*`-h`或`--help`:显示帮助信息。
例如,要并行地执行3个任务,并保留输出结果,你可以使用以下命令:```shellparallel-j3-kcommand```参数详解----下面是一些常用的parallel参数及其含义:*`-j`或`--jobs`:指定同时执行的进程数。
这是parallel最常用的参数之一,用于控制并行执行的进程数量。
你可以根据系统的可用资源和工作负载来调整这个值。
*`-P`或`--pipe`:指定管道中的管道数。
这个参数用于指定并行执行的进程之间通过管道传递数据的数量。
通常与`-j`参数一起使用,控制数据在管道中的流动速度。
*`-s`或`--stdin`:从标准输入中读取命令列表。
当你需要从文件或其他来源中读取命令列表时,可以使用这个参数。
*`-d`或`--delay`:控制管道中数据传递的延迟时间。
高性能计算集群的配置与使用教程高性能计算(High Performance Computing,HPC)集群是一种强大的计算工具,能够处理大规模的数据和执行复杂的计算任务。
本文将介绍高性能计算集群的配置和使用方法,并为您提供详细的教程。
1. 配置高性能计算集群配置高性能计算集群需要以下几个步骤:1.1 硬件要求选择适合的硬件设备是配置高性能计算集群的第一步。
您需要选择性能强大的服务器,并确保服务器之间能够互相通信。
此外,还需要大容量的存储设备来存储数据和计算结果。
1.2 操作系统安装选择合适的操作系统安装在每个服务器上。
常用的操作系统有Linux和Windows Server,其中Linux被广泛使用于高性能计算集群。
安装操作系统后,您还需要配置网络设置、安装必要的软件和驱动程序。
1.3 服务器网络连接为了保证高性能计算集群的正常工作,需要配置服务器之间的网络连接。
您可以选择以太网、光纤等网络连接方式,并确保每个服务器都能够互相访问。
1.4 集群管理软件安装为了方便管理和控制高性能计算集群,您需要安装相应的集群管理软件。
常用的集群管理软件有Hadoop、Slurm和PBS等。
这些软件可以帮助您管理任务队列、分配资源和监控集群的运行状态。
2. 使用高性能计算集群配置完高性能计算集群后,您可以开始使用它进行计算任务。
以下是使用高性能计算集群的一般步骤:2.1 编写并提交任务首先,您需要编写计算任务的代码。
根据您的需求,可以选择编写Shell脚本、Python脚本或其他编程语言的代码。
编写完毕后,您需要将任务提交到集群管理软件中。
2.2 监控任务状态一旦任务提交成功,您可以使用集群管理软件提供的监控功能来跟踪任务的状态。
您可以查看任务的进度、资源使用情况和错误信息等。
2.3 调整任务与资源如果您发现任务需要更多的计算资源或运行时间,您可以根据需要调整任务的资源配置。
集群管理软件通常提供了资源调整的功能,您可以根据任务的实际情况进行调整。