第一节：摇瓶与发酵之所以选择摇瓶作为第一节，主要原因是我对它有深厚的感情，本科时进行植物细胞培养时使用的是摇瓶，研究生课题设计多数时间也在使用摇瓶，进入企业种子培养，验证很多情况都是使用摇瓶。
虽然简单，但它的确是我们一个非常好用的工具，不仅研究过程要应用，生产过程也离不开，它的用途多种多样。
不仅用于种子制备，种子的测试，原料的测试，培养基的优化，发酵过程的优化，能够伴随整个发酵过程。
摇瓶虽然简单，但是要想得到有价值的结论，基本原则不能抛弃，细节也要掌握，毕竟细节决定成败。
首先我们讨论装量问题。
因为没有理论上的规定发酵时摇瓶的装量是多少，所以大家装得一定也不一样。
那么多少合适呢？我不知道有没有下限，但是肯定会有一个上限，总不能装满吧！因为装量越多，在一定转动的情况下，溶氧会越少，相对蒸发量就越低，出现异常的概率就会变大，而且单位发酵液分配的动力也可能会降低。
装量少也不行，因为放罐后要检测，体积总得要够各项检测用吧。
在这里我给一个提示：按照一般经验，发酵液和摇瓶的体积比例为10%-20%。
其实在这里强调了空气，其实也要考虑其他物质的混合，比如：摇床的作用也会使细胞分泌出来的成份快速在整个发酵液中混匀。
我们在摇瓶上进行研究的目的是为了未来能够在发酵罐上进行放大，那么摇瓶如何与发酵罐进行比较呢？现在比较流行计算流体力学，如果有人能够用计算流体力学模拟摇瓶和发酵罐空气，营养，动力等情况的分配，便可以优化摇瓶中培养基体积的多少，使摇瓶与发酵罐的参数更接近一些，为以后的放大提供更接近的数据。
提到装量，相信很多人做过试验进行过优化。
我自己也做过。
一开始没有仔细考虑，只是想优化一个最适的加量，能够使发酵单位最高。
开始的时候，由于没有考虑，挥发量的变化，所以最后得出装量越少发酵越好的结论。
显然与发酵罐是不相符合的，生产需要的是产量而不是发酵单位。
我们设计试验的目的不能够偏离实际。
做试验设计之前，我们一定要能够确定我们的试验目的是什么，我们需要的是一个稳定的菌种还是一个可能高产但是质量不稳定的菌种，我们是要筛选到发酵单位高还是产量高的工艺或培养基。
