凋亡与自噬
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凋亡与自噬研究进展讲座内容•凋亡与自噬的基本概念•凋亡与自噬相关信号通路•凋亡与自噬的相互转化•凋亡与自噬的检测凋亡与自噬的基本概念•程序性细胞死亡(Programmed Cell Death, PCD),是指细胞接受某种信号或受到某些因素刺激后,为了维持内环境稳定而发生的一种主动性消亡过程。
它既出现在个体正常的发育过程中,也出现在非正常生理状态或疾病中;既在体内发生,也发生在体外培养物中。
•凋亡和自噬性死亡是程序性死亡的表现形式凋亡与自噬的基本概念•细胞凋亡的概念最初是由Kerr 等于1972 年在“凋亡:一个在组织动力学方面广泛存在的基本生命现象”一文中提出的。
1980 年Wyllie 等人对细胞凋亡进行了形态学上的描述。
所以,细胞凋亡是一种形态学上的概念,描述细胞在一定生理条件下,像秋天的树叶或花瓣一样悄悄死亡的悲惨情景,借助希腊的“apoptosis”一词来表示凋亡的多重机制•Caspace依赖型细胞凋亡①死亡受体途径;②内质网压力途径;③线粒体途径•Caspase 非依赖型细胞凋亡包括Bcl 家族蛋白质Bax 诱导的细胞死亡,也涉及到其他蛋白酶,如钙蛋白酶、蛋白酶体及丝氨酸蛋白酶的细胞死亡。
Nature Review in Cell Biology, 8:741-752改变,释放细胞色素C到胞浆,核质浓缩,核膜核仁破碎,DNA降解成为约180bp-200bp片段;胞膜有小泡状形成,膜内侧磷脂酰丝氨酸外翻到膜表面,胞膜结构仍然完整,最终可将凋亡细胞遗骸分割包裹为几个凋亡小体,无内容物外溢,因此不引起周围的炎症反应,凋亡小体可迅速被周围专职或非专职吞噬细胞吞噬。
产生的不同长度的DNA片段约为180-200bp的整倍数,而这正好是缠绕组蛋白寡聚体的长度,提示染色体DNA恰好是在核小体与核小体的连接部位被切断,产生不同长度的寡聚核小体片段,实验证明,这种DNA的有控降解是一种内源性核酸内切酶作用的结果,该酶在核小体连接部位切断染色体DNA,这种降解表现在琼脂糖凝胶电泳中就呈现特异的梯状Ladder图谱,而坏死呈弥漫的连续图谱。
是在细胞凋亡时高表达一种分子,再如在糖皮质激素诱导鼠胸腺细胞凋亡过程中,加入RNA合成抑制剂或蛋白质合成抑制剂即能抑制细胞凋亡的发生。
凋亡的观察和检测•1)△ψm dissipation(线粒体跨膜电位的消失):TMRM发红色荧光,DiOC6(3)发绿色荧光。
•2)Phosphatidylserine Externalization(磷脂酰丝氨酸外翻):Annexin V-FITC(绿色)染细胞膜•3)检测线粒体产生的ROS:无荧光的HE(hydroethidine,氢化乙啶)可被ROS氧化为EthBr(ethidium bromide,溴乙啡啶),发红色荧光。
NAO(nonyl acridine orange,烷化吖啶橙,可发荧光)能与非氧化的cardiolipin(心磷脂,可被ROS氧化)反应而失去荧光。
•4)线粒体IMS蛋白的释放:AIF,细胞色素c,分别用荧光二抗染色。
•5)Capase 3a 染色:用荧光二抗染色,胞浆弥散分布。
•6)细胞膜完整性检测:DAPI(蓝色)、Hoechst 33342或PI(红色)染核。
胞膜完整的细胞(活细胞和早中期凋亡细胞)排斥,可联用annexin V。
自噬的主要过程Nature Review in Cell Biology, 8:741-752自噬的主要特征•近年来在大量的生物体中发现存在一种称为自噬性死亡的死亡方式。
自(体吞)噬是胞质溶胶和细胞器被隔离到双层膜的小泡中,由此运送到溶酶体/空泡中降解,并使因此形成的大分子进行再循环的一个过程。
自噬出现在许多真核细胞,但自噬性细胞死亡不是多细胞生物体唯一的特征。
•通过超微结构特征而鉴定的自噬的形态学特征表现在如下几个方面:①高尔基体和内质网等细胞器膨胀;②胞质无定形,核碎断、固缩;③形成大量吞噬泡(由粗面内质网包围将要被吞噬的底物,随后与初级溶酶体结合形成);④细胞质膜失去特化,可能发生细胞膜出泡现象。
自噬的主要特征•1)自噬是细胞消化掉自身的一部分,即self-eating,初一看似乎对细胞不利。
事实上,细胞正常情况下很少发生自噬,除非有诱发因素的存在。
这些诱发因素很多,也是研究的热门。
既有来自于细胞外的(如外界中的营养成分、缺血缺氧、生长因子的浓度等),也有细胞内的(代谢压力、衰老或破损的细胞器、折叠错误或聚集的蛋白质等)。
由于这些因素的经常性存在,因此,细胞保持了一种很低的、基础的自噬活性以维持自稳。
•2)自噬过程很快,被诱导后8min即可观察到自噬体(autophagosome)形成,2h后自噬溶酶体(autolysosome)基本降解消失。
这有利于细胞快速适应恶劣环境。
•3)自噬的可诱导特性:表现在2个方面,第一是自噬相关蛋白的快速合成,这是准备阶段。
第二是自噬体的快速大量形成,这是执行阶段。
自噬的主要特征•4)批量降解:这是与蛋白酶体降解途径的显著区别•5)“捕获”胞浆成分的非特异性:由于自噬的速度要快、量要大,因此特异性不是首先考虑的,这与自噬的应急特性是相适应的。
•6) 自噬的保守性:由于自噬有利于细胞的存活,因此无论是物种间、还是各细胞类型之间(包括肿瘤细胞),自噬都普遍被保留下来自噬的功能•自噬有以下功能:①细胞营养缺乏时营养的动员;②细胞间分化;③细胞死亡及老化;④阻止癌症的发生。
自噬与凋亡的区别与鉴定•很多试剂在肿瘤细胞系中能引起细胞死亡,通过使用caspase 抑制剂和自噬抑制剂能鉴定其为何种死亡方式,如内抑制素诱导的细胞死亡方式没有被caspase 抑制剂阻止,但是却被自噬抑制剂3-甲基腺嘌呤所抑制。
As2O3 诱导的细胞死亡也只被自噬抑制剂巴弗洛霉素A1 抑制而不被普通的caspase 抑制剂阻断。
自噬与凋亡的区别与鉴定(a)Normal,(b)Autophagy(c)Apoptosis(d)Necrosis自噬与凋亡的区别与鉴定自噬与凋亡的区别与鉴定Trends in Molecular Medicine Vol.15 No.3自噬的研究方法正常培养的细胞自噬活性很低,不适于观察,因此,必须对自噬进行人工干预和调节,经报道的工具药有:(一)自噬诱导剂1)Bredeldin A / Thapsigargin / Tunicamycin :模拟内质网应激2)Carbamazepine/ L-690,330/ Lithium Chloride(氯化锂):IMPase 抑制剂(即Inositol monophosphatase,肌醇单磷酸酶)3)Earle's平衡盐溶液:制造饥饿4)N-Acetyl-D-sphingosine(C2-ceramide):Class I PI3K Pathway抑制剂5)Rapamycin:mTOR抑制剂6)Xestospongin B/C:IP3R阻滞剂自噬的研究方法(二)自噬抑制剂•1)3-Methyladenine(3-MA):(Class III PI3K)hVps34 抑制剂•2)Bafilomycin A1:质子泵抑制剂•3)Hydroxychloroquine(羟氯喹):Lysosomal lumen alkalizer(溶酶体腔碱化剂)•除了选用上述工具药外,一般还需结合遗传学技术对自噬相关基因进行干预:包括反义RNA干扰技术(Knockdown)、突变株筛选、外源基因导入等。
自噬诱导药物Nature Reviews Drug Discovery 2007,6, 304-312自噬的观察和检测•常用的策略和技术有:•1)观察自噬体的形成•由于自噬体属于亚细胞结构,普通光镜下看不到,因此,直接观察自噬体需在透射电镜下。
Phagophore的特征为:新月状或杯状,双层或多层膜,有包绕胞浆成分的趋势。
自噬体(AV1)的特征为:双层或多层膜的液泡状结构,内含胞浆成分,如线粒体、内质网、核糖体等。
自噬溶酶体(AV2)的特征为:单层膜,胞浆成分已降解。
(autophagic vacuole,AV)•2)在荧光显微镜下采用GFP-LC3融合蛋白来示踪自噬形成:•由于电镜耗时长,不利于监测(Monitoring)自噬形成,人们利用LC3在自噬形成过程中发生聚集的现象开发出了此技术。
无自噬时,GFP-LC3融合蛋白弥散在胞浆中;自噬形成时,GFP-LC3融合蛋白转位至自噬体膜,在荧光显微镜下形成多个明亮的绿色荧光斑点,一个斑点相当于一个自噬体,可以通过计数来评价自噬活性的高低。
自噬的观察和检测•3)利用Western Blot检测LC3-II/I比值的变化以评价自噬形成:•自噬形成时,胞浆型LC3(即LC3-I)会酶解掉一小段多肽,转变为(自噬体)膜型(即LC3-II),因此,LC3-II/I比值的大小可估计自噬水平的高低。
•(Note:LC3抗体对LC3-II有更高的亲和力,会造成假阳性。
方法2和3需结合使用,同时需考虑溶酶体活性的影响。
)•在研究自噬相关蛋白时,需对其进行定位。
由于自噬体与溶酶体、线粒体、内质网、高尔基体关系密切,为了区别,常用到一些示踪蛋白在荧光显微镜下来共定位:•Lamp-2:溶酶体膜蛋白,可用于监测自噬体与溶酶体融合。
•LysoTrackerTM 探针:有红或蓝色可选,显示所有酸性液泡。
•pDsRed2-mito:载体,转染后表达一个融合蛋白(红色荧光蛋白+线粒体基质定位信号),可用来检测线粒体被自噬掉的程度(Mitophagy)。
MitoTraker探针:特异性显示活的线粒体,荧光在经过固定后还能保留。
•Hsp60:定位与线粒体基质,细胞死亡时不会被释放。
•Calreticulin(钙网织蛋白):内质网腔凋亡与自噬相关信号通路凋亡相关信号通路DNA损伤与凋亡Oxidative metabolismDNA replicationEnvironmental–UV and γ-radiation–carcinogens–anti-neoplastic RxM.Ljungman / Mutation Research 577 (2005) 203–216DNA 损伤与凋亡/nrc/journal/v9/n12/images/nrc2745-f1.jpg/nri/journal/v5/n3/images/nri1568-f5.jpgFOXO与凋亡/cgi/content-nw/full/120/15/2479/FIG3FOXO与凋亡Oncogene27, 2276-2288 (7 April 2008)凋亡与蛋白乙酰化自噬相关信号通路诱导自噬的各种信号通路Molecular Cell, Volume 40, Issue 2, 22 October 2010Beclin-1的调节网络Cell Death Differ. 2011 Apr;18(4):571-80.自噬与肿瘤的关系•与凋亡(在肿瘤细胞中一般都存在缺限)不同,自噬是被优先保留的。