贝叶斯网络-代码学习
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贝叶斯⽹络python代码,贝叶斯⽹络⼯具箱-Python【实例简介】此⼯具箱只⽀持Python2版本,在Python3下可以⾃⾏修改。
允许使⽤单纯Python语⾔构建贝叶斯⽹络。
包含构建离散的贝叶斯⽹以及⾼斯贝叶斯⽹,推理算法包含消息树以及MCMC采样等。
允许搭建因⼦图模式下的BN⽹,同时包括⽹络实例。
有不清楚的地⽅欢迎⼀起交流。
【实例截图】【核⼼代码】bayesian-belief-networks-master└── bayesian-belief-networks-master├── bayesian│ ├── bbn.py│ ├── examples│ │ ├── bbns│ │ │ ├── cancer.py│ │ │ ├── earthquake.py│ │ │ ├── family_out_problem.py│ │ │ ├── huang_darwiche.py│ │ │ ├── __init__.py│ │ │ ├── monty_hall.py│ │ │ ├── pleasanton_weather.py│ │ │ ├── sprinkler.py│ │ │ └── walk.py│ │ ├── bif│ │ │ ├── alarm.bif│ │ │ ├── andes.bif│ │ │ ├── asia.bif│ │ │ ├── barley.bif│ │ │ ├── bif_inference_tester.py│ │ │ ├── bif_parser.py│ │ │ ├── cancer.bif│ │ │ ├── child.bif│ │ │ ├── diabetes.bif│ │ │ ├── earthquake.bif│ │ │ ├── hailfinder.bif│ │ │ ├── hepar2.bif│ │ │ ├── insurance.bif│ │ │ ├── link.bif│ │ │ ├── mildew.bif│ │ │ ├── munin.bif│ │ │ ├── pathfinder.bif│ │ │ ├── pigs.bif│ │ │ ├── README.txt│ │ │ ├── water.bif│ │ │ └── win95pts.bif│ │ ├── factor_graphs│ │ │ ├── cancer.py│ │ │ ├── earthquake.py│ │ │ ├── huang_darwiche.py│ │ │ ├── __init__.py│ │ │ ├── monty_hall.py│ │ │ ├── monty_hall_sampled.py │ │ │ └── walk.py│ │ ├── gaussian_bayesian_networks │ │ │ ├── __init__.py│ │ │ ├── koller.py│ │ │ └── river.py│ │ └── __init__.py│ ├── exceptions.py│ ├── factor_graph.py│ ├── gaussian_bayesian_network.py │ ├── gaussian_node.py│ ├── gaussian.py│ ├── graph.py│ ├── __init__.py│ ├── linear_algebra.py│ ├── persistance.py│ ├── stats.py│ ├── test│ │ ├── examples│ │ │ ├── bbns│ │ │ │ ├── test_cancer.py│ │ │ │ ├── test_earthquake.py│ │ │ │ ├── test_huang_darwiche.py│ │ │ │ └── test_monty_hall.py│ │ │ └── factor_graphs│ │ │ └── test_earthquake_fg.py│ │ ├── test_bbn.py│ │ ├── test_examples.py│ │ ├── test_factor_graph_verify.py│ │ ├── test_gaussian_bayesian_network.py │ │ ├── test_gaussian.py│ │ ├── test_gbn_examples.py│ │ ├── test_graph.py│ │ ├── test_linear_algebra.py│ │ ├── test_persistance.py│ │ └── test_undirected_graph.py│ └── utils.py├── docs│ └── tutorial│ ├── conf.py│ ├── index.rst│ ├── Makefile│ ├── _static│ │ ├── monty_hall_bbn.png│ │ └── monty_hall_bbn_variables.png│ ├── _themes│ │ ├── agogo_nn│ │ │ ├── layout.html│ │ │ ├── static│ │ │ │ ├── agogo.css_t│ │ │ │ ├── bgfooter.png│ │ │ │ └── bgtop.png│ │ │ └── theme.conf │ │ └── LICENSE│ └── tutorial.rst├── LICENSE.txt├── MANIFEST.in├── README.txt├── requirements.txt└── setup.py17 directories, 85 files。
贝叶斯优化的bpnn模型python代码-概述说明以及解释1.引言1.1 概述在这个部分,你可以描述贝叶斯优化和BP神经网络模型的基本概念和背景。
可以简要介绍贝叶斯优化是一种基于概率和贝叶斯理论的优化方法,用于在给定的限制条件下寻找最优解。
同时也可以介绍BP神经网络是一种常用的人工神经网络模型,用于解决分类和回归等问题。
你可以讨论贝叶斯优化和BP神经网络在不同领域的应用,以及它们之间结合起来的潜在优势。
可以指出这种结合可以帮助优化神经网络的超参数,提高训练效率和准确性。
最后,可以强调本文旨在探讨如何使用贝叶斯优化优化BP神经网络的参数,以提高其性能和应用范围。
1.2文章结构1.2 文章结构本文主要分为引言、正文和结论三部分。
具体结构安排如下:引言部分将会首先概述贝叶斯优化和BP神经网络,并介绍本文的研究目的。
正文部分主要分为三个小节。
首先是贝叶斯优化简介,介绍这一优化方法的原理和应用场景;接着是BP神经网络模型概述,解释BP神经网络的基本原理和结构;最后是结合贝叶斯优化和BP神经网络的优势,探讨将两者结合应用的好处和可行性。
结论部分将总结贝叶斯优化在BP神经网络中的应用情况,展望未来研究方向,并对整个文章进行总结概括。
1.3 目的:本文旨在探讨贝叶斯优化在BP神经网络中的应用,并分析结合两者的优势。
通过对贝叶斯优化和BP神经网络的简介,以及它们各自的优势进行论述,旨在为读者提供一个全面的了解和认识。
同时,本文也将总结贝叶斯优化在BP神经网络中的实际应用和未来研究方向,为相关领域的研究者和从业者提供参考和启发。
通过本文的阐述,希望能够为贝叶斯优化和BP神经网络的进一步研究和应用提供一定的指导和帮助。
2.正文2.1 贝叶斯优化简介:贝叶斯优化是一种通过在可能的目标函数空间中建立高斯过程来优化目标函数的方法。
其主要思想是在探索和利用之间进行权衡,通过不断地试验目标函数来找到最优解。
贝叶斯优化通常用于处理黑箱函数,即目标函数的具体形式未知,只能通过输入输出的对应关系进行观测。
贝叶斯分类器代码1. 介绍贝叶斯分类器是一种基于贝叶斯定理的概率分类器。
它通过学习一组训练数据,构建一个由特征和类别之间的条件概率组成的模型,然后用该模型对新的未知样本进行分类。
贝叶斯分类器在文本分类、垃圾邮件过滤、情感分析等任务中都得到了广泛应用。
本文将详细探讨贝叶斯分类器的代码实现,在Python中使用scikit-learn库进行演示。
2. 贝叶斯分类器原理贝叶斯分类器基于贝叶斯定理,根据条件概率计算样本的后验概率。
具体来说,给定一个样本x和一组类别y_1, y_2, …, y_n,贝叶斯分类器的任务是预测样本x 属于每个类别的概率,然后选择具有最高概率的类别作为预测结果。
贝叶斯分类器通过以下公式计算后验概率:P(y|x) = (P(x|y) * P(y)) / P(x)其中,P(y|x)是给定样本x的条件下样本属于类别y的概率,P(x|y)是属于类别y 的样本中具有特征x的概率,P(y)是类别y发生的先验概率,P(x)是样本具有特征x的概率。
3. 数据准备在编写贝叶斯分类器代码之前,首先需要准备用于训练和测试的数据。
这里以一个文本分类任务为例,使用20类新闻文本数据集(20 Newsgroups)作为示范数据。
首先,从库中加载新闻数据集:from sklearn.datasets import fetch_20newsgroupscategories = ['alt.atheism', 'sci.med', 'comp.graphics', 'sci.space'] # 选择四个类别作为示例data_train = fetch_20newsgroups(subset='train', categories=categories, shuffle =True, random_state=42)data_test = fetch_20newsgroups(subset='test', categories=categories, shuffle=T rue, random_state=42)加载数据后,我们得到两个对象data_train和data_test,它们分别表示训练集和测试集。
3.5 贝叶斯网络贝叶斯网络是一系列变量的联合概率分布的图形表示。
一般包含两个部分,一个就是贝叶斯网络结构图,这是一个有向无环图(DAG),其中图中的每个节点代表相应的变量,节点之间的连接关系代表了贝叶斯网络的条件独立语义。
另一部分,就是节点和节点之间的条件概率表(CPT),也就是一系列的概率值。
如果一个贝叶斯网络提供了足够的条件概率值,足以计算任何给定的联合概率,我们就称,它是可计算的,即可推理的。
3.5.1 贝叶斯网络基础首先从一个具体的实例(医疗诊断的例子)来说明贝叶斯网络的构造。
假设:命题S(moker):该患者是一个吸烟者命题C(oal Miner):该患者是一个煤矿矿井工人命题L(ung Cancer):他患了肺癌命题E(mphysema):他患了肺气肿命题S对命题L和命题E有因果影响,而C对E也有因果影响.命题之间的关系可以描绘成如右图所示的因果关系网.因此,贝叶斯网有时也叫因果网,因为可以将连接结点的弧认为是表达了直接的因果关系。
图3-5 贝叶斯网络的实例图中表达了贝叶斯网的两个要素:其一为贝叶斯网的结构,也就是各节点的继承关系,其二就是条件概率表CPT。
若一个贝叶斯网可计算,则这两个条件缺一不可。
贝叶斯网由一个有向无环图(DAG)及描述顶点之间的概率表组成.其中每个顶点对应一个随机变量。
这个图表达了分布的一系列有条件独立属性:在给定了父亲节点的状态后,每个变量与它在图中的非继承节点在概率上是独立的。
该图抓住了概率分布的定性结构,并被开发来做高效推理和决策。
贝叶斯网络能表示任意概率分布的同时,它们为这些能用简单结构表示的分布提供了可计算优势.假设对于顶点xi,其双亲节点集为Pai,每个变量xi的条件概率P(xi|Pai)。
则顶点集合X={x1,x2,…,xn}的联合概率分布可如下计算:。
双亲结点。
该结点得上一代结点。
该等式暗示了早先给定的图结构有条件独立语义。
它说明贝叶斯网络所表示的联合分布作为一些单独的局部交互作用模型的结果具有因式分解的表示形式。
机器学习--朴素贝叶斯算法原理、⽅法及代码实现⼀、朴素的贝叶斯算法原理 贝叶斯分类算法以样本可能属于某类的概率来作为分类依据,朴素贝叶斯分类算法是贝叶斯分类算法中最简单的⼀种,朴素的意思是条件概率独⽴性。
条件概率的三个重要公式: (1)概率乘法公式: P(AB)= P(B) P(A|B) = P(A) P(B|A) =P(BA) (2)全概率公式: (3)贝叶斯公式: 如果⼀个事物在⼀些属性条件发⽣的情况下,事物属于A的概率>属于B的概率,则判定事物属于A,这就是朴素贝叶斯的基本思想。
⼆、算法实现⼀般步骤 (1)分解各类先验样本数据中的特征。
(2)计算各类数据中,各特征的条件概率(⽐如:特征1出现的情况下,属于A类的概率p(A|特征1),属于B类的概率p(B|特征1),属于C类的概率p(C|特征1)......)。
(3)分解待分类数据中的特征(特征1、特征2、特征3、特征4......)。
(4)计算各特征的各条件概率的乘积,如下所⽰: 判断为A类的概率:p(A|特征1)*p(A|特征2)*p(A|特征3)*p(A|特征4)..... 判断为B类的概率:p(B|特征1)*p(B|特征2)*p(B|特征3)*p(B|特征4)..... 判断为C类的概率:p(C|特征1)*p(C|特征2)*p(C|特征3)*p(C|特征4)..... ...... (5)结果中的最⼤值就是该样本所属的类别。
三、应⽤举例 ⼆分类问题:⼤众点评、淘宝等电商上都会有⼤量的⽤户评论,有差评(1),有好评(0),现需要使⽤朴素贝叶斯分类算法来⾃动分类⽤户评论。
四、实际问题代码实现from numpy import *#贝叶斯算法def loadDataSet():trainData=[['my', 'dog', 'has', 'flea', 'problems', 'help', 'please'],['maybe', 'not', 'take', 'him', 'to', 'dog', 'park', 'stupid'],['my', 'dalmation', 'is', 'so', 'cute', 'I', 'love', 'him'],['stop', 'posting', 'stupid', 'worthless', 'garbage'],['mr', 'licks', 'ate', 'my', 'steak', 'how', 'to', 'stop', 'him'],['quit', 'buying', 'worthless', 'dog', 'food', 'stupid']]labels=[0, 1, 0, 1, 0, 1] #1表⽰侮辱性⾔论,0表⽰正常⾔论return trainData, labels#⽣成词汇表def createVocabList(trainData):VocabList = set([])for item in trainData:VocabList = VocabList|set(item) #取两个集合的并集return sorted(list(VocabList)) #对结果排序后返回#对训练数据⽣成只包含0和1的向量集def createWordSet(VocabList, trainData):VocabList_len = len(VocabList) #词汇集的长度trainData_len = len(trainData) #训练数据的长度WordSet = zeros((trainData_len,VocabList_len)) #⽣成⾏长度为训练数据的长度列长度为词汇集的长度的列表for index in range(0,trainData_len):for word in trainData[index]:if word in VocabList: #其实也就是,训练数据包含的单词对应的位置为1其他为0WordSet[index][VocabList.index(word)] = 1return WordSet#计算向量集每个的概率def opreationProbability(WordSet, labels):WordSet_col = len(WordSet[0])labels_len = len(labels)WordSet_labels_0 = zeros(WordSet_col)WordSet_labels_1 = zeros(WordSet_col)num_labels_0 = 0num_labels_1 = 0for index in range(0,labels_len):if labels[index] == 0:WordSet_labels_0 += WordSet[index] #向量相加num_labels_0 += 1 #计数else:WordSet_labels_1 += WordSet[index] #向量相加num_labels_1 += 1 #计数p0 = WordSet_labels_0 * num_labels_0 / labels_lenp1 = WordSet_labels_1 * num_labels_1 / labels_lenreturn p0, p1trainData, labels = loadDataSet()VocabList = createVocabList(trainData)train_WordSet = createWordSet(VocabList,trainData)p0, p1 = opreationProbability(train_WordSet, labels)#到此就算是训练完成#开始测试testData = [['not', 'take', 'ate', 'my', 'stupid']] #测试数据test_WordSet = createWordSet(VocabList, testData) #测试数据的向量集res_test_0 = []res_test_1 = []for index in range(0,len(p0)):print(p0[index])if test_WordSet[0][index] == 0:res_test_0.append((1-p0[index]) * test_WordSet[0][index])res_test_1.append((1-p1[index]) * test_WordSet[0][index])else:res_test_0.append(p0[index] * test_WordSet[0][index])res_test_1.append(p1[index] * test_WordSet[0][index])if sum(res_test_0) > sum(res_test_1):print("属于0类别")else:print("属于1类别")运⾏结果:。
朴素贝叶斯的python源码实现朴素贝叶斯是一种简单但非常强大的分类算法,它基于贝叶斯定理和特征条件独立假设,被广泛应用于文本分类、垃圾邮件过滤、情感分析等领域。
在本文中,我们将通过Python源码实现朴素贝叶斯分类器,并详细解释其原理和实现步骤。
朴素贝叶斯算法的核心思想是利用已知类别的训练样本,通过计算每个特征在每个类别下的条件概率,来预测新样本的类别。
在实现朴素贝叶斯分类器之前,我们需要了解一些基本概念。
我们需要定义文档和类别。
文档是由词汇组成的集合,类别是文档所属的类别。
在文本分类中,文档即为文本,类别可以是正面评价和负面评价。
我们需要训练样本集,其中包含了已知类别的文档。
接下来,我们需要计算每个类别的先验概率,即P(c),表示一个文档属于某一类别的概率。
这可以通过统计训练样本中每个类别的文档数量来计算。
然后,我们需要计算每个词汇在每个类别下的条件概率,即P(w|c),表示在已知文档属于某一类别的情况下,该文档包含某个词汇的概率。
这可以通过统计训练样本中每个类别下每个词汇出现的次数来计算。
在实现朴素贝叶斯分类器时,我们首先需要进行训练。
我们将训练样本分为正面评价和负面评价两类,并统计每个类别的先验概率。
然后,我们统计每个类别下每个词汇出现的次数,并计算每个词汇在每个类别下的条件概率。
接着,我们需要对新样本进行分类。
给定一个新的文档,我们需要计算该文档属于每个类别的概率,并选择概率最大的类别作为分类结果。
计算文档属于某个类别的概率可以通过将文档中每个词汇在该类别下的条件概率相乘,并乘以该类别的先验概率得到。
下面是使用Python实现朴素贝叶斯分类器的源码:```pythonimport numpy as npclass NaiveBayesClassifier:def __init__(self):self.classes = Noneself.class_priors = Noneself.word_counts = Noneself.word_probs = Nonedef fit(self, X, y):self.classes = np.unique(y)self.class_priors = self.calculate_class_priors(y) self.word_counts = self.calculate_word_counts(X, y) self.word_probs = self.calculate_word_probs()def calculate_class_priors(self, y):class_priors = {}total_samples = len(y)for cls in self.classes:class_count = np.sum(y == cls)class_priors[cls] = class_count / total_samples return class_priorsdef calculate_word_counts(self, X, y):word_counts = {}for cls in self.classes:class_indices = np.where(y == cls)class_word_counts = np.sum(X[class_indices], axis=0)word_counts[cls] = class_word_countsreturn word_countsdef calculate_word_probs(self):word_probs = {}for cls in self.classes:total_words = np.sum(self.word_counts[cls])word_probs[cls] = (self.word_counts[cls] + 1) / (total_words + len(self.word_counts[cls]))return word_probsdef predict(self, X):predictions = []for x in X:class_probs = {}for cls in self.classes:class_prob = np.log(self.class_priors[cls]) for i, word in enumerate(x):if word > 0:class_prob += np.log(self.word_probs[cls][i]) * wordclass_probs[cls] = class_probpredicted_class = max(class_probs, key=class_probs.get)predictions.append(predicted_class)return predictions```在上述代码中,我们首先定义了一个NaiveBayesClassifier类,并初始化了一些成员变量。
Matlab中的机器学习和贝叶斯网络技巧机器学习是一门涵盖统计学、人工智能和计算机科学等多学科知识的领域,它通过让计算机从数据中学习并逐步改进性能,来完成特定任务。
而贝叶斯网络是机器学习中一种常用的概率图模型,它能够建模和推断变量之间的依赖关系。
本文将介绍在Matlab中应用机器学习和贝叶斯网络的技巧和方法。
一、机器学习基础机器学习的基本任务是通过对已有数据的学习来构建一个预测模型,并用该模型对新的数据进行预测。
在Matlab中,我们可以使用一些常用的机器学习工具箱,如Statistics and Machine Learning Toolbox和Neural Network Toolbox等,来实现各种机器学习算法。
1. 数据准备在进行机器学习之前,我们首先需要准备好适合建模的数据。
这包括数据的采集、预处理和特征提取等步骤。
Matlab提供了丰富的数据处理和可视化函数,如readtable、preprocess和feature_extraction等,来帮助我们完成这些任务。
2. 特征选择在建模之前,我们需要从原始数据中选择出对预测结果有重要影响的特征。
Matlab中提供了一些特征选择工具函数,如sequentialfs、relieff和lasso等,可以帮助我们进行特征选择。
3. 模型训练在数据准备和特征选择之后,我们就可以使用机器学习算法进行模型训练了。
根据不同的问题和数据类型,我们可以选择适合的算法,如支持向量机、决策树、随机森林等。
Matlab提供了这些算法的实现函数,如svmtrain、treefit和randomForest等,可以方便地进行模型训练。
4. 模型评估模型训练完成后,我们需要对模型进行评估,以了解其性能和泛化能力。
在Matlab中,我们可以使用一些评估指标,如准确率、精确率、召回率和F1值等,来评估模型的效果。
此外,还可以使用交叉验证、学习曲线和混淆矩阵等方法来进行模型评估。
Matlab贝叶斯网络建模1 FullBNT简介基于Matlab的贝叶斯网络工具箱BNT是kevin p.murphy基于matlab语言开发的关于贝叶斯网络学习的开源软件包,提供了许多贝叶斯网络学习的底层基础函数库,支持多种类型的节点(概率分布)、精确推理和近似推理、参数学习及结构学习、静态模型和动态模型。
1.1贝叶斯网络表示BNT中使用矩阵方式表示贝叶斯网络,即若节点i到j有一条弧,则对应矩阵中值为1,否则为0。
1.2结构学习算法函数BNT中提供了较为丰富的结构学习函数,都有:1. 学习树扩展贝叶斯网络结构的算法.2. 数据完整条件下学习一般贝叶斯网络结构学习算法表1-1 数据完整条件下贝叶斯结构算法算法名称调用函数K2算法learn_struct_k2()贪婪搜索GS(greedy search)算法earn_struct_gs()3. 缺失数据条件下学习一般贝叶斯网络结构学习算法表1-2 缺失数据条件下贝叶斯结构算法1.3参数学习算法函数1. BNT中也提供了丰富的参数学习函数,都有:2. 完整数据时,学习参数的方法主要有两种:最大似然估计learn_params()和贝叶斯方法bayes_update_params();3. 数据缺失时,如果已知网络拓扑结构,用EM算法来计算参数,learn_params_em ()。
1.4推理机制及推理引擎为了提高运算速度,使各种推理算法能够有效应用,BNT工具箱采用了引擎机制,不同的引擎根据不同的算法来完成模型转换、细化和求解。
这个推理过程如下:BNT中提供了多种推理引擎,都有:表1-3 BNT推理引擎算法名称调用函数联合树推理引擎jtree_inf_engine()全局联合树推理引擎global_joint_inf_engine()信念传播推理引擎belprop_inf_engine()变量消元推理引擎var_elim_inf_engine()采样传播引擎gibbs_sampling_inf_engine2 参数学习在BNT中,参数评估程序可以分为4类。