遗传图构建原理资料
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深⼊探究遗传图谱的奥秘上⼀期⼩美给⼤家介绍了构建遗传图谱的各种作图群体,⼤家纷纷表⽰以后⾯对纷繁复杂的作图群体就再也不怕了!曾经也是⼀名科研狗的⼩美,现在能为⼤家科研道路上提供⼀点点⼩⼩的帮助,甚感欣慰呀!本期⼩美给⼤家介绍的是构建遗传图谱的基本原理!图谱构建的遗传学原理⾸先不得不提的就是遗传学三⼤定律了,下⾯⼩美就和⼤家⼀起来回忆⼀下。
分离定律在杂合⼦细胞中,位于⼀对同源染⾊体上的等位基因,具有⼀定的独⽴性;当细胞进⾏减数分裂,等位基因会随着同源染⾊体的分开⽽分离,分别进⼊两个配⼦当中,独⽴地随配⼦遗传给后代(图1)。
图1 分离定律⾃由组合定律位于⾮同源染⾊体上的⾮等位基因的分离或组合是互不⼲扰的。
在减数分裂形成配⼦的过程中,同源染⾊体上的等位基因彼此分离,⾮同源染⾊体上的⾮等位基因⾃由组合(图2,表1)。
图2 表1 ⾃由组合定律基因的连锁和交换定律在进⾏减数分裂形成配⼦时,位于同⼀条染⾊体上的不同基因,常常连在⼀起进⼊配⼦;在减数分裂形成四分体时,位于同源染⾊体上的等位基因有时会随着⾮姐妹染⾊单体的交换⽽发⽣交换,因⽽产⽣了基因的重组(图3)。
应当说明的是,基因的连锁和交换定律与基因的⾃由组合定律并不⽭盾,它们是在不同情况下发⽣的遗传规律:位于⾮同源染⾊体上的两对(或多对)基因,是按照⾃由组合定律向后代传递的,⽽位于同源染⾊体上的两对(或多对)基因,则是按照连锁和交换定律向后代传递的。
图3 连锁和交换定律重组型配⼦所占的⽐例取决于减数分裂过程中发⽣的交换频率。
交换频率越⾼,则重组型配⼦的⽐例越⼤。
重组型配⼦最⼤可能的⽐例是50%,代表两对基因的连锁区段均发⽣了交换,相当于两对基因间⽆连锁。
重组型配⼦占总配⼦的⽐例称为重组率,⽤r表⽰。
重组率的⾼低取决于交换的频率,⽽两对基因的交换频率取决于它们之间的物理距离,因此,重组率⽤来表⽰基因间的图距,图距单位⽤厘摩(centi-Morgan,cM)表⽰,1cM表⽰1%的重组率。
2.3 遗传作图的方法染色体作图:确定相互连锁的基因在染色体上的相对位置以及它们之间的遗传距离的过程,又称为基因定位(gene mapping)。
连锁图:根据基因在染色体上直线排列的定律,构建的基因位置以及相互交换值的图谱称为连锁图(linkage map)或遗传学图(genetic map)2.3.1 构建遗传图谱的基本原理假设交换是随机发生的,一对并列的染色单体上任何两点发生交换的机会是均等的;两个彼此靠近的基因之间因交换而分离的的几率要比互相远离的2个基因之间发生分离的几率要小。
随机的染色体上两个任意基因座越远,它们越容易被染色体断裂所分离。
因此重组率可以成为测量两个基因之间相对距离的尺度。
计算出不同基因间的重组率,就可以构建出显示基因在染色体上相对位置的图。
真核生物遗传过程中会发生减数分裂,此过程中染色体要进行重组和交换,这种重组和交换的概率会随着染色体上任意两点间相对距离的远近而发生相应的变化。
根据概率大小,就可以推断出同一条染色体上两点间的相对距离和位置关系。
正因为如此,得到的这张图谱也就只能显示标记之间的相对距离。
我们称这一距离(概率)为遗传距离(cM),由此构建的图谱也称为遗传图谱。
重组率:是指重组型配子占总配子数的百分比,用Rf表示。
Rf =(重组型配子数/总配子数) ×100%交换值:重组率通常又称为交换值。
但严格地讲,交换值不能等同于重组率。
因为非等位基因之间可能发生多重交换,但不一定形成重组型配子,导致用重组率代表交换值会造成偏低估计。
基因间距离与交换值、遗传距离、连锁强度遗传图的偏离与造成遗传图偏离的原因重组热点(r e c o m b i n a t i o n h o t s p o t):染色体上某些比其他位点有更高交换频率的位点。
近端粒区和远着丝粒区有较高重组率。
性别之间也表现重组率的差异。
双交换的出现,产生距离减少的假象。
遗传学图的绘制1)测定基因所属连锁群2)确定基因在染色体上的顺序连锁群(linkage map):位于同一染色体上的所有基因构成一个连锁群。