Cre-loxP、CRISPR-Cas9技术与病毒载体在基因敲除中的联用PPT精选课件
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孵化载体先进案例孵化载体是生物技术研究中的重要工具,用于承载外源基因并将其传递给目标细胞。
随着生物技术的发展,孵化载体的设计和应用也越来越先进。
下面列举了10个符合题目要求的孵化载体先进案例。
1. 背景介绍孵化载体的设计是基因工程研究的基础,它可以通过操纵DNA序列,实现基因的克隆、表达和调控。
本文将介绍10个具有先进性的孵化载体案例。
2. pUC19载体pUC19是一种常用的质粒载体,具有小分子量、高复制数和广泛的宿主范围。
它在基因克隆和表达研究中被广泛应用。
3. BAC载体BAC(细菌人工染色体)载体是一种高容量质粒载体,可以携带大片段的外源DNA。
BAC载体在基因组学研究中起到了重要作用。
4. 病毒载体病毒载体是一种利用病毒颗粒传递外源基因的载体。
例如,腺病毒、逆转录病毒等病毒载体可以用于基因治疗和基因传递研究。
5. CRISPR-Cas9系统CRISPR-Cas9系统是一种革命性的基因编辑技术,它利用CRISPR RNA和Cas9蛋白来实现基因组的精确编辑。
CRISPR-Cas9系统已经成为孵化载体设计的重要工具。
6. TALENsTALENs(转录激活样锌指核酸酶)是一种基因编辑工具,可以实现基因组的精确编辑。
TALENs可以设计成孵化载体,用于基因组编辑研究。
7. Cre-loxP系统Cre-loxP系统是一种基因组重组技术,利用Cre重组酶和loxP位点来实现基因组的重排和删除。
Cre-loxP系统可以设计成孵化载体,用于基因组重组研究。
8. RNA干扰载体RNA干扰载体是一种利用RNA干扰技术抑制基因表达的载体。
它可以通过携带特定的RNA序列,使目标基因在转染细胞中被沉默。
9. 全基因组CRISPR筛选库全基因组CRISPR筛选库是一种利用CRISPR-Cas9技术进行基因组范围筛选的工具。
这种筛选库可以设计成孵化载体,用于发现和研究基因功能。
10. 优化的启动子和调控元件优化的启动子和调控元件是一种改良的孵化载体设计策略。
cre-loxp系统在大脑特定区域进行基因敲除的原理Cre-loxp系统是一种常用的基因敲除技术,用于特定区域的基因敲除。
该系统是通过两种转基因技术相互配合实现的,即Cre重组酶和loxp位点。
Cre重组酶是一种由细菌噬菌体产生的酶,能够识别和剪切含有loxp位点的DNA序列,从而实现特定区域的基因敲除。
Cre-loxp系统的原理如下:1. Cre重组酶的表达:首先,使用基因工程技术将Cre酶的编码基因嵌入到转基因小鼠的基因组中,使其能够在特定的组织或细胞类型中产生。
通过引入特定的启动子或组织特异性表达的促进子,可以实现Cre重组酶在目标组织或细胞中的表达。
2. 基因敲除载体:在目标基因的启动子或内含子区域,插入一对loxp位点。
loxp位点是一种特殊的DNA序列,约有34个碱基对,呈倒向重复,用于诱导Cre重组酶的作用。
3. Cre重组酶的介导:一旦Cre重组酶在目标组织或细胞中表达,它能够识别和结合含有loxp位点的DNA序列,并结合在loxp位点上。
Cre重组酶在loxp位点间发生酶活性,通过识别和切割这两个loxp位点间的DNA链,将目标基因位点裂解。
4. 基因敲除效应:一旦目标基因位点被裂解,无法继续正常转录和翻译,从而导致目标基因的敲除。
这样,就实现了在特定区域的基因敲除。
Cre-loxp系统具有以下特点和优点:1. 灵活性:Cre-loxp系统可以在不同的组织或细胞类型中实现基因敲除,由于Cre重组酶的表达是由特定启动子或组织特异性表达的促进子控制的,因此可以实现组织或细胞特定的基因敲除。
2. 高效性:Cre重组酶的催化作用很高效,能够在较短的时间内进行特定区域的基因敲除。
3. 精确性:Cre重组酶只能识别和剪切含有完整loxp位点序列的DNA链,因此能够实现精确的目标基因敲除,而不会对其他基因产生影响。
4. 可逆性:如果需要在特定的时期或特定的组织中恢复目标基因的表达,只需停止Cre重组酶的表达即可。
Creloxp重组系统介导转基因绒山羊标记基因删除的研究的开题报告一、研究背景和意义转基因绒山羊是一种非常有价值的动物模型,可以用于生物医学研究、基因功能分析等方面。
然而,随着生物医学研究的发展,越来越多的功能基因被发现,需要进行进一步的研究。
这些基因的研究需要建立相应的转基因绒山羊模型,但由于现有的转基因技术都存在一定的局限性,因此需要寻找新的方法来改进这一情况。
Cre-loxP重组系统是一种高效、原理简单的基因编辑技术,具有精准、可控、快速等特点,被广泛应用于哺乳动物基因工程技术中。
利用Cre-loxP重组技术可以实现基因敲除、替换等功能,为研究基因在细胞、组织、器官、器系等不同层次的生理和病理调节机制提供了强有力的工具。
二、研究内容和方法本研究将利用Cre-loxP重组技术对绒山羊进行基因敲除,主要包括以下内容:1. 构建ploxP -neomycin-loxP质粒首先设计、合成ploxP -neomycin-loxP质粒,并纯化得到高质量的DNA。
此质粒在Cre-loxP重组系统中起到重要的作用,是实现基因敲除的关键。
2. 优化Cre-loxP重组体系Cre-loxP重组体系是实现基因敲除的基础,需要建立一个高效、稳定、可重复的体系,才能实现对绒山羊基因的准确编辑。
优化Cre-loxP 重组体系,包括传递Cre重组酶,优化重组载体构建等方面。
3. 运用Cre-loxP重组技术敲除绒山羊标记基因选定目标基因进行敲除后,将构建好的质粒ploxP -neomycin-loxP导入到绒山羊胚胎细胞中,然后通过Cre酶介导基因重组,实现对目标基因的敲除。
随后利用PCR、Western印迹和T7E1等技术验证敲除效果。
三、预期结果本研究的预期结果包括:1. 成功构建Cre-loxP重组体系,实现对绒山羊基因的敲除。
2. 验证基因敲除效果,明确目标基因在绒山羊生长发育、健康状态等方面的影响。
3. 探究Cre-loxP重组体系的优缺点,为之后的研究提供参考。
条件性基因敲除的基本原理Cre/loxP重组系统条件性基因敲除的基本原理 Cre / loxP 重组系统条件性基因敲除主要是通过Cre/10xP或者Ftp/FRT重组系统来实现的。
这两个系统都是位点特异性重组酶系统,已发展成为在体内、外进行遗传操作的有力工具。
这两个系统的应用,可以使靶基因的表达或缺失发生在试验动物发育的某一阶段或某一特定的组织器官。
此外,若与控制Cre或Flp表达的其他诱导系统相结合,还可以对某一基因同时实现时空两方面的调控。
1.Cre/loxP系统的原理Cre/loxP系统来源于F1噬菌体,可以介导位点特异的DNA重组。
该系统含有两种成分:①一段长34bp的DNA序列,含有两个13 bp的反向重复序列和一个8 bp的核心序列。
这段34bp序列是重组酶识别的位点,被称为loxP位点(10cus of X―over in P1)。
②Cre重组酶(cyclizationrecombination),它是一种由343个氨基酸组成的单体蛋白,可以引发loxP位点的DNA重组。
任何序列的DNA,当其位于两个loxP位点之间的时候,在Cre重组酶的作用下要么被缺失(两个loxP位点的方向相同),要么方向发生倒转(两loxP位点的方向相反),如图所示。
Cre/loxP系统的作用机制2.Cre/loxP系统优点Cre/10xP系统之所以在基因敲除中获得了非常广泛的应用,是由该系统的诸多优点决定的:①Cre重组酶与具有loxP位点的DNA片断形成复合物后,可以提供足够的能量引发之后的DNA重组过程,因此该系统不需要细胞或者生物体提供其他的辅助因子;②loxP位点是一段较短的DNA序列,因此非常容易合成;③Cre重组酶是一种比较稳定的蛋白质,因此可以在生物体不同的组织、不同的生理条件下发挥作用;④Cre重组酶的编码基因可以置于任何一种启动子的调控之下,从而使这种重组酶在生物体不同的细胞、组织、器官,以及不同的发育阶段或不同的生理条件下产生,进而发挥作用,这一点也是该系统在应用过程中最为重要的一点。
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CRISPR/Cas9基因敲除道理及其运用CRISPR(clustered,regularlyinterspaced,shortpalindromicrep eats)是一种来自细菌降解入侵的病毒DNA或其他外源DNA的免疫机制.在细菌及古细菌中,CRISPR系总共分成3类,个中Ⅰ类和Ⅲ类须要多种CRISPR相干蛋白(Cas蛋白)配合施展感化,而Ⅱ类体系只须要一种Cas蛋白即可,这为其可以或许普遍运用供给了便当前提[1].今朝,来自Streptococcuspyogenes的CRISPR-Cas9体系运用最为普遍.Cas9蛋白(含有两个核酸酶构造域,可以分离切割DNA两条单链.Cas9起首与crRNA及tracrRNA联合成复合物,然后经由过程PAM序列结归并侵入DNA,形成RNA-DNA复合构造,进而对目标DNA双链进行切割,使DNA双链断裂.因为PAM序列构造简略(5’-NGG-3’),几乎可以在所有的基因中找到大量靶点,是以得到普遍的运用.CRISPR-Cas9体系已经成功运用于植物.细菌.酵母.鱼类及哺乳动物细胞,是今朝最高效的基因组编辑体系[1].经由过程基因工程手腕对crRNA和tracrRNA进行改革,将其衔接在一路得到sgRNA(singleguideRNA).融会的RNA具有与野生型RNA相似的活气,但因为构造得到了简化更便利研讨者运用.经由过程将表达sgRNA的原件与表达Cas9的原件相衔接,得到可以同时表达两者的质粒,将其转染细胞,便可以或许对目标基因进行操纵[2,3].今朝经常运用的CAS9研讨办法是经由过程通俗质粒,质粒构建流程如下:Cas9质粒构建设计2条单链oligo序列;退火形成双链DNA将双链DNA衔接到载体中转化G10competentcell筛选阳性克隆;测序验证序列;质粒大提;电转染靶细胞在细胞内crRNA辨认靶位点,Cas9对靶位点进行随机剪切CruiserTM酶切细胞池,盘算突变率;CruiserTM酶切初筛阳性克隆;将阳性克隆测序验证;做敲除序列比对剖析.今朝罕有的CAS9通俗质粒有(汉恒生物供给cas9质粒试剂盒):固然通俗质粒许多时刻也能达到试验后果,但是质粒转染具有用力低,感化时光短暂性等缺陷.病毒的消失解决了质粒这些问题,经常运用的病毒重要有慢病毒和腺病毒,慢病毒经常运用质粒见addgene(lentiCRISPRv2,lentiGuide-Puro,lentiCas9-Blast),慢病毒可以整合入宿主基因组中,长期稳固的表达(汉恒生物供给CRISPR/cas9慢病毒包装),但是因为慢病毒克隆才能有限而CAS9本身分子量比较大(大于4kb),且长期拔出可能导致乱切,脱靶等,同时慢病毒包装最终获得的滴度不高级原因,腺病毒更有优势,腺病毒克隆才能强,获得的病毒滴度也高.同时相对于通俗质粒来说,感化是时光也比较长,可以达到更幻想的敲除后果.(汉恒生物供给CRISPR/cas9腺病毒包装)。
《利用CRISPR-Cas9系统构建DUSP9基因敲除小鼠胚胎干细胞系》篇一一、引言在生物学研究中,基因敲除是一种重要的技术手段,能够精确地操控特定基因的表达,进而研究基因在生物体中的功能。
近年来,随着基因编辑技术的发展,尤其是CRISPR-Cas9系统的广泛应用,基因敲除技术得到了极大的推进。
本文旨在探讨利用CRISPR-Cas9系统构建DUSP9基因敲除小鼠胚胎干细胞系的方法和步骤,为进一步研究DUSP9基因的功能提供技术支持。
二、CRISPR-Cas9系统简介CRISPR-Cas9系统是一种基于细菌免疫系统的基因编辑技术,具有高效、精确的基因编辑能力。
该系统通过设计特定的RNA 引导序列与Cas9蛋白结合,形成复合物,识别并切割靶点DNA 序列,从而实现基因的敲入、敲除或替换等操作。
三、DUSP9基因敲除小鼠胚胎干细胞系的构建1. 靶点设计:首先需要确定DUSP9基因的敲除靶点,设计相应的sgRNA和Cas9蛋白序列。
通过分析DUSP9基因的序列,找到合适的位置作为靶点。
2. 胚胎干细胞系的获取:选取适合的小鼠胚胎干细胞系,确保其处于稳定的生长状态。
3. CRISPR-Cas9系统介导的基因编辑:将设计好的sgRNA和Cas9蛋白通过特定的方式(如质粒转染、病毒载体等)引入小鼠胚胎干细胞中。
在细胞内,sgRNA和Cas9蛋白形成复合物,识别并切割DUSP9基因的靶点。
4. 克隆筛选和鉴定:经过一段时间的培养和筛选,挑选出发生基因突变的小鼠胚胎干细胞克隆。
通过PCR、测序等分子生物学手段,鉴定克隆中DUSP9基因的敲除情况。
5. 细胞系建立:将鉴定成功的DUSP9基因敲除小鼠胚胎干细胞进行传代培养,建立稳定的细胞系。
四、实验结果与讨论通过上述步骤,我们成功构建了DUSP9基因敲除小鼠胚胎干细胞系。
在实验过程中,我们观察到CRISPR-Cas9系统对DUSP9基因的切割效率较高,成功获得了多株基因敲除克隆。
Cre-loxp重组酶系统是一种常用的基因编辑技术,它可以在特定的DNA序列上实现特异性的编辑和改变。
本文将从原理、应用和发展趋势等方面对Cre-loxp重组酶系统进行介绍。
一、Cre-loxp重组酶系统的原理1. Cre重组酶Cre重组酶是一种来源于大肠杆菌的酶,它能够识别和结合特定的DNA序列loxp,并在该序列上引发DNA的重组事件。
Cre酶最初是在嗜盐古细菌(Archaeoglobus fulgidus)中发现的,后来被用于基因编辑和遗传工程领域。
2. loxp序列loxp序列是Cre-loxp重组酶系统中的关键部分,它是一种DNA序列,长度为34个碱基对,其中包含了两个逆向定向重组位点。
这样的结构使得Cre酶可以选择性地将该序列分为两部分,并引发DNA片段的剪接和重组。
3. Cre-loxp重组酶系统的原理当Cre重组酶与loxp序列结合后,它将在该序列上诱导DNA的重组,使得该序列内的基因组成发生改变。
这种改变可以是插入、缺失、逆向或转向等,具体取决于Cre酶与loxp序列的相对定向。
Cre-loxp重组酶系统可以实现对特定DNA序列的编辑和改变。
二、Cre-loxp重组酶系统的应用1. 基因敲除通过Cre-loxp重组酶系统,可以实现对特定基因的敲除。
具体而言,首先需要在目标细胞中导入一个含有loxp序列的质粒,然后再导入Cre重组酶。
Cre酶与loxp序列结合后,将引发目标基因的敲除,从而实现对该基因的功能破坏或消除。
2. 基因激活除了基因敲除外,Cre-loxp重组酶系统还可以实现对特定基因的激活。
这种激活方式通常是通过插入或逆向调控目标基因的转录和翻译,从而增加目标基因产物的表达水平。
3. 细胞命运的调控在细胞生物学领域,Cre-loxp重组酶系统也被广泛应用于调控细胞的命运和功能。
通过敲除或激活特定基因,可以实现对细胞增殖、分化、凋亡等过程的调控,从而揭示细胞内部的生物学机制。
cre名词解释微生物CRE(的全称为Cre/loxP重组酶系统)是一种常用的遗传工程技术,被广泛应用于微生物学研究中。
本文将对CRE进行详细解释和探讨。
1. CRE的定义与原理CRE是一种重组酶系统,由Cre重组酶和loxP位点组成。
Cre重组酶是一种遗传物质(蛋白质),其功能是调控目标DNA分子上的重组反应。
loxP位点则是一种特定的DNA序列,它是CRE酶作用的靶标。
通过CRE和loxP的相互作用,可实现DNA分子的重组、插入或剪切等操作。
2. CRE的应用领域微生物学中,CRE被广泛用于基因组工程、基因表达调控、病毒病理研究等方面。
具体应用包括:- 基因敲除和基因突变:利用CRE的重组功能,可以靶向敲除或突变目标基因,从而实现研究该基因功能或解析其对生物体的作用。
- 基因表达调控:通过在目标基因上插入loxP位点,再利用CRE酶的活性,可以实现基因的激活或抑制,从而调控基因表达水平。
- 基因标记和追踪:结合荧光基因和CRE/loxP系统,可以标记特定细胞或组织,以追踪其在生物体内的分布和命运。
- 病原体研究:利用CRE/loxP系统,可以构建感染模型,研究病原体的致病机制、感染途径等,并探索相应的防治策略。
3. CRE的优势和局限性CRE/loxP系统在微生物学研究中具有以下优势:- 高度特异性:CRE酶对loxP位点的识别和结合具有高度特异性,因此可以实现准确的基因重组和操控。
- 灵活性:CRE/loxP系统可以在不同细胞类型和生物体中应用,且操作相对灵活,可以根据需要进行精细调整。
- 低毒性:CRE酶的表达对细胞或生物体的毒性较低,因此对被操作的生物体影响较小。
然而,CRE/loxP系统也存在一些局限性:- 依赖loxP位点:CRE/loxP系统必须在目标DNA上存在loxP位点才能发挥作用,因此需要在目标基因中进行插入或改造。
- 重组效率有限:CRE/loxP系统的重组效率受到多种因素的影响,包括CRE酶的表达水平、loxP位点的位置等,可能存在一定的不可控性。
髓系特异性Spi1基因敲除小鼠的构建和基因鉴定吴旭铭;王卉卉;朱向玲;周园园;王安琪;张慧茹;刘崇;涂佳杰【期刊名称】《安徽医科大学学报》【年(卷),期】2024(59)3【摘要】目的构建髓系特异性Spi1基因敲除小鼠并分析其基因型,为疾病病理机制及药物靶点研究提供动物模型基础。
方法根据CRISPR/Cas9技术原理和Cre/LoxP系统,设计并构建sgRNA和Donor载体,以第2号外显子(Exon 2)所在的转录本为敲除区域,在Exon 2两侧各放置同向Loxp元件;将Cas9蛋白、sgRNA和Donor载体混合显微注射到C57BL/6J小鼠的受精卵中,移植受精卵到假孕的C57BL/6J母鼠的子宫中,19~20 d后获得F0代。
将阳性F0代小鼠与C57BL/6J小鼠交配,得到稳定的F1代Spi1^(flox/+)小鼠。
F1代Spi1^(flox/+)小鼠雌雄自交得到Spi1^(flox/flox)小鼠。
Spi1^(flox/flox)与Lyz2-Cre^(+)小鼠交配得到Spi1^(flox/+)/Lyz2-Cre^(+)小鼠,再将其与Spi1^(flox/flox)交配,得到的Spi1^(flox/flox)/Lyz2-Cre^(+)小鼠为髓系特异性Spi1基因敲除(KO)小鼠;Spi1^(flox/flox)/Lyz2-Cre^(-)小鼠作为野生型(WT)小鼠。
提取WT和KO小鼠DNA,PCR扩增后琼脂糖凝胶电泳鉴定基因型;Western blot检测WT和KO小鼠免疫细胞中脾病灶形成病毒前病毒整合癌基因-1/富含嘌呤盒1(PU.1)表达。
结果PCR鉴定结果显示,采用flox引物鉴定时仅扩增出220 bp条带的小鼠,即基因型为Spi1^(flox/flox)纯合子,采用Lyz2-Cre引物鉴定时扩增出700 bp的小鼠,基因型为Lyz2-Cre^(+);Western blot结果显示,与WT组比较,KO组小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)和腹腔原位巨噬细胞(PM)中的PU.1不表达(P<0.01);T细胞中KO小鼠PU.1表达水平与WT小鼠差异无统计学意义;PCR和Western blot结果均表明髓系特异性Spi1 KO小鼠构建成功。
利用CRISPR-Cas9和Cv^HoxP系统删除34个非必需基因构建L-苏氨酸生产菌丁志祥12,胡晓清12,柳亚迪12,王小元*123(1.食品科学与技术国家重点实验室,江南大学,江苏无锡214122;2,江南大学生物工程学院,江苏无锡214122;3.江南大学国际食品安全联合实验室,江苏无锡214122)摘要:L-苏氨酸是一种被广泛应用于食品、饲料及医药等领域的必需氨基酸$大肠杆菌以葡萄糖为碳源合成L-苏氨酸的过程中,一些非必需基因的转录和翻译会消耗碳源$利用CRISPR-Cas9和位点特异性重组系统Cre/loxP,敲除了大肠杆菌MG1655基因组中puuE和ynal区间的34个非必需基因(共30.372kb),获得了突变菌MG003,然后通过高表达L-苏氨酸合成途径中关键基因thrA*"thrB和thrC以及L-苏氨酸转运酶编码基因rhtA和rhtC提高L-苏氨酸产量。
与对照菌MG1655/pFW01-thrA*B C比,MG003/pFW01-thrA*B C生长加快,L-苏氨酸产量提高25.5%:MG003/pFW01-thrA*B C-rhtA的L-苏氨酸产量提高了43.3%;MG003/pFW01-thrA*B C-rhtC的L-苏氨酸产量提高了74.5%。
研究结果表明,大肠杆菌基因组中34个非必需基因的删除有利于其提高L-苏氨酸合成能力。
关键词:大肠杆菌;L-苏氨酸;CRISPR-Cas9;Cre/loxP;puuE;ynal中图分类号:Q933文章编号:1673-1689(2020)11-0071-10DOI:10.3969/j.issn.1673-1689.2020.11.010Construction of L-Threonine-Producing Escherichia coli by Deleting34NonEssential Genes Using CRISPR-Cas9and CrelloxP System*1,2,3DING Zhixiang1,2,HU Xiaoqing1,2,LIU Yadi1,2,WANG Xiaoyuan(1.State Key Laboratory of Food Science and Technology,Jiangnan University,Wuxi214122,China;2.Schoolof Biotechnology,Jiangnan University,Wuxi214122,China; 3.International Joint Laboratory on Food Safety,Jiangnan University,Wuxi214122,China)Abstract:L-threonine is an essential amino acid widely used in food,feed and medicine.In theprocess of L-threonine synthesis from glucose,transcription and translation of some non-essentialgenes consume carbon source.In this study,CRISPR-Cas9and site-specific recombination systemCrel loxP were used to delete34non-essential genes(30.372kb)between puuE and ynal genes in thegenome of E.coli MG1655,resulting the mutant strain MG003.The genes thrA thrB and thrC,thekey genes in the L-threonine biosynthetic pathway,and the genes rhtA and rhtC encoding theL-threonine transporters,were then overexpressed in MG003to increase the L-threonine production.Compared to the control strain MG1655lpFW01-thrA*B C,MG003lpFW01-thrA%BC grew faster and收稿日期:2019-04-01基金项目:国家轻工技术与工程一流学科自主课题项目(LITE201P-10)(*通信作者:王小元(1965—),男,博士,教授,博士研究生导师,主要从事微生物代谢工程方面的研究。