pubmed数据库使用方法
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第3章 PubMed检索PubMed是因特网上最著名的免费Medline数据库,是由美国国立医学图书馆的生物信息技术中心(National Center for Biotechnology Information ,NCBI)提供的,其网址为:/PubMed/。
该系统于1997年开始使用,与以往的Medline 光盘数据库相比,它具有收录范围广、更新速度快、界面友好等特点,并且由于NCBI与多家出版商达成协议,出版商在期刊出版之前或在期刊出版的同时,将期刊论文题录提供给PubMed, 通过部分文献的链接可到达出版商的网站,从而获取相应期刊的全文。
3.1 PubMed的收录范围PubMed的数据主要有4个部分,即Medline、OLDMEDLINE 、In Process Citations、Record Suppled by Publisher。
Medline:与我们通常使用的Medline数据库收录的范围、年代、内容相同,但数据更新速度较快。
OLDMEDLINE:收录了1950-1965年间的美国医学索引(IM)中的题录。
In Process Citations:是一个临时性的数据库,收录准备进行标引的题录和文摘信息,每天都在接受新的数据,进行文献的标引和加工,每周把加工好的数据加入到Medline中,同时从In Process Citations库中删除。
In Process Citations中的记录标有[PubMed- in process]的标记。
Record supplied by publisher:出版商将期刊文献信息电子版提供给PubMed后,每条记录都标有[PubMed- as supplied by publisher]的标记,这些记录每天都在不停地向In Process Citations库中传送,加入到In Process Citations后,原有的标记将改为[PubMed- in process]的标记。
引言概述
PubMed是一个公认的医学文献数据库,由美国国家医学图书馆(NLM)开发和维护。
这个教程指南是第二部分,旨在深入介绍如何使用PubMed数据库来检索医学文献,并提供一些高级功能和技巧。
正文内容
一、使用MeSH(医学主题词)进行高级检索
1.了解MeSH的概念和分类体系
2.使用MeSH浏览器来查找和浏览主题词
3.利用MeSH词汇筛选器进行高级检索
4.使用MeSH树进行链式搜索
5.了解MeSH组合词的使用方法
二、使用文献筛选器和高级检索器
1.使用高级检索器来限定检索结果
2.利用文献筛选器进行精确的文献检索
3.使用搜索历史和搜索详情来追踪检索过程
4.利用查询器来创建复杂的检索语句
5.使用MeSH流行趋势来了解当前研究热点
三、利用搜索工具和文献管理器
1.使用索引工具来查找文章的相关信息
2.使用MyNCBI创建和管理文献收藏夹
3.使用单击目录搜索相关文献
4.使用外部工具和来获取全文和其他资源
5.使用CitationMatcher进行文献引用的匹配
四、了解首选项和界面定制
1.个性化设置首选项和搜索界面
2.添加和删除搜索工具和菜单
3.自定义搜索结果的显示格式
4.创建个人帐户并管理订阅邮件和提醒
5.利用网站帮助和文献教育资源进行学习和培训
五、了解常见问题和解决方案
1.如何处理搜索结果过多或过少的情况
2.如何处理重复文献和非相关文献
3.如何使用布尔运算符进行复杂的检索
4.如何处理缺失的全文和报告
5.如何解决其他常见问题和疑问
总结。
pubmed检索方法与技巧Pubmed是生命科学领域最重要的文献检索工具之一、它提供了广泛的生命科学文献库,包括医学、生物学、药学和健康科学等领域的文献。
Pubmed的检索方法和技巧对于有效地和获取相关文献非常重要。
以下是一些常用的Pubmed检索方法和技巧:1. 关键词检索:使用关键词是Pubmed检索的基本方法。
关键词应该准确描述你所感兴趣的主题。
你可以使用与主题相关的单词、短语和术语进行检索。
同时注意使用同义词和近义词来扩大检索范围。
2. 语法:Pubmed支持使用逻辑运算符来组合多个词和短语。
常用的逻辑运算符包括AND(交集)、OR(并集)和NOT(排除)。
例如,使用"lung cancer AND smoking"将会检索到包含这两个关键词的文章。
3. MeSH主题词检索:MeSH(Medical Subject Headings)是Pubmed特有的主题词索引系统。
使用MeSH主题词可以更精确地检索相关文献。
你可以在Pubmed网站上找到MeSH数据库,然后主题词并将其添加到检索中。
4. 过滤结果:在Pubmed中,你可以使用多种筛选器来缩小结果范围。
例如,你可以使用年份范围、文章类型(如临床试验、回顾性研究等)、出版物类型(如期刊文章、综述等)和语言等来过滤结果。
5. 设置提醒:Pubmed提供设置提醒的功能,这样你可以根据自己的兴趣和需求定期获取最新的相关文献。
你可以创建保存结果或使用特定的词或主题来设置提醒。
6. 利用专业数据库:除了Pubmed之外,还有其他一些专业数据库也可以用于文献检索。
例如,Scopus、Embase和Web of Science等都是重要的文献检索工具,可以在组合使用它们与Pubmed一起使用以获取更全面和准确的文献信息。
8.限制范围:如果你想获取特定类型的文献,可以使用限制器来缩小范围。
例如,你可以限制文章类型为临床试验、人类研究或动物研究等来获取特定类型的文献。
pubmed文献检索方法【原创版4篇】目录(篇1)I.检索PubMed的意义II.PubMed的检索方法III.PubMed检索结果的展示和筛选IV.检索PubMed的注意事项正文(篇1)I.检索PubMed的意义PubMed是全球最大的生物医学数据库之一,提供了大量的生物医学文献资源。
对于研究人员、医学专业人士和学生来说,了解和掌握PubMed的检索方法,可以帮助他们快速找到所需的文献。
II.PubMed的检索方法1.打开PubMed网站,输入网址:https:///2.在页面左侧导航栏中选择“Search”按钮,进入检索页面。
3.在检索页面中,可以选择不同的检索方式,如关键词、作者、出版日期等。
4.输入检索词后,点击“Search”按钮,即可得到相关的检索结果。
III.PubMed检索结果的展示和筛选1.检索结果会按照相关度排序,用户可以选择不同的排序方式。
2.每个检索结果都包含标题、摘要、作者、出版日期等信息。
3.对于需要进一步阅读的文献,可以点击“Open”按钮,查看全文。
4.可以通过筛选条件,如主题、关键词、学科领域等,缩小检索范围。
IV.检索PubMed的注意事项1.避免使用过于具体的检索词,以免得到过多的无关结果。
2.对于复杂的检索需求,可以使用逻辑运算符和短语检索等方式进行组合检索。
目录(篇2)I.引言A.为什么需要pubmed文献检索方法B.pubmed简介II.pubmed文献检索方法A.如何使用pubmed1.输入关键词2.选择检索结果3.查看文献详情B.pubmed的优点1.方便快捷2.检索结果全面3.文献质量较高C.pubmed的不足1.检索结果可能不全面2.文献质量可能较低3.检索结果可能存在误导III.结论A.pubmed文献检索方法的重要性和实用性B.如何利用pubmed进行有效的文献检索正文(篇2)pubmed文献检索方法是一种非常实用的工具,可以帮助科研人员快速、准确地检索到所需的文献。
PubMed使用手册一、PubMed简介:PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的查询系统,是NCBI的Entrez系统的数据库之一。
该系统通过网络途径免费提供包括MEDLINE在内的70多外国家4800多种主要生物医学文献的书目索引文摘数据库,并提供部分免费和付费的全文链接服务。
二、页面介绍:登录/entrez/ query.fcgi后,你将进入Pubmed的主页面。
如图:主页面左侧框的介绍:1) MeSH Database你可以用它来分层流览MesH表2) Single Citation Matcher通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。
3) Batch Citution Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。
4) Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。
5) Related Resources•Order Documents提供一种收费性质服务,可以使用户在当地得到文献的全文拷贝(费用与发送方式各不相同)。
•Consumer Health提供与MEDLINEplus的链接,MEDLINEplus是与消费者健康信息相关的国家医学图书馆的网络节点。
•Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH资助的临床研究成果的发布。
三、检索方法:1.PubMed基本检索方式(Basic PubMed Search)进入PubMed基本检索方式主页,在检索框中可以输入任意词,包括文献作者,出版杂志等:•键入一个或多个检索词(可以为任意词),如protein disulfide isomerase ,也可以输入缩略名如pdi等;输入多个词时,可自动识别成词组;但词数太多时,则以逻辑与的方式识别,如可以将protein disulfide isomerase识别成一个词,也有可能将其识别成“protein AND disulfide AND isomerase”尤其是出现数字等符号时不易识别成词组;•对PubMed不能识别检索的词组,需加引号强调,如键入:“Insight II”•以文献作者方式检索,作者名的输入格式为:姓+名。
在pubmed中获取全文的方法1. 背景介绍Pubmed是一种由美国国立卫生研究院提供的生命科学和生物医学领域的数据库,涵盖了广泛的期刊文献和临床医学资料。
在进行科研和学术研究过程中,许多研究者需要在Pubmed中获取全文来支撑自己的研究工作。
在本文中,我们将介绍在Pubmed中获取全文的方法,帮助广大科研者更加高效地获取所需文献。
2. 方法步骤2.1 进入Pubmed全球信息站我们需要打开浏览器,输入Pubmed的全球信息站(xxx),进入Pubmed全球信息站。
2.2 输入搜索关键词在全球信息站的搜索框中输入所需查找的文献关键词,点击搜索按钮进行检索。
2.3 进行筛选和排序Pubmed会返回相关的文献列表,我们可以根据年代、出版物类型、作者、语言等条件进行筛选和排序,以便更快地找到需要的文献。
2.4 确认文献信息在找到目标文献后,我们需要点击文献标题,进入文献详细信息页面。
在该页面中,我们可以查看文献的摘要、作者、期刊、出版日期等信息,并确认是否需要获取全文。
2.5 点击获取全文在确认需要获取全文后,我们可以看到页面上有“Full Text Links”或“Free Full Text”等按钮,点击该按钮即可进入全文下载页面。
2.6 下载全文在全文下载页面,我们可以选择下载格式(如PDF或HTML),点击相应的信息进行下载,即可获取全文。
3. 注意事项在使用Pubmed获取全文的过程中,需要注意一些事项,以保证获取的文献的准确性和可靠性。
3.1 确认文献来源在点击获取全文前,需要确认文献来源的可靠性,避免获取到不准确或非权威的文献。
3.2 扩大检索范围有时候我们可能无法直接在Pubmed上找到所需的文献全文,这时可以尝试在其他数据库或学术搜索引擎上进行检索,扩大检索范围。
3.3 合理使用资源在获取全文时,要合理使用自己的资源,在需要时可以通过机构订购、申请文献传递或采用其他合法途径获取全文。
pubmed的主要检索规则
PubMed是一个免费的生物医学文献数据库,主要包含了生物
医学、生命科学和相关领域的学术文章。
以下是PubMed的主
要检索规则:
1. 使用关键词检索:用户可以在PubMed的搜索框中输入与所
需信息相关的关键词,例如特定疾病、研究领域、药物名称等。
可以使用布尔运算符(AND、OR、NOT)来组合关键词,以
便更精确地进行检索。
2. 使用限制条件:用户可以使用限制条件来缩小检索结果的范围。
例如,可以通过选择特定时间范围、特定语言、特定研究类型(如临床试验、回顾性研究等)来限制检索结果。
3. 使用注册号检索:用户可以使用PubMed的搜索框来搜索特
定文献的注册号,如PubMed唯一的标识号(PMID)或国际
标准序列号(ISBN)等。
4. 使用高级搜索:PubMed还提供了高级搜索选项,用户可以
使用更多的搜索条件和筛选器来进行更精确的检索。
例如,用户可以在高级搜索中指定作者、期刊、出版日期等限制条件。
5. 使用Mesh词检索:PubMed还使用了医学主题词(Medical Subject Headings,简称Mesh)的术语系统来标注和分类文章。
用户可以使用Mesh词来更精确地检索文章并获得相关的研究
结果。
需要注意的是,PubMed的检索规则可能会根据平台的更新而有所变化。
因此,用户在使用PubMed检索时应根据具体的要求和搜索介面的提示进行操作。
PubMed数据库一.检索Genbacev O 等撰写的关于“胎盘氧张与胎儿生长的关系”的文章。
要求写出:①第一篇文章的原文出处,②第一篇原文后附第一篇参考文献中的第一作者的姓名。
操作步骤:1.在地址栏中输入/pubmed,进入PubMed2.在检索栏中输入 placenta growth oxygen genbacev o,点击Go3.点击题录中作者姓名如: Genbacev O,得到文摘,点击出处下方免费获取全文(free textarticle)红色按钮。
4.在原文最后找到Reference(参考文献),得到第一篇作者姓名。
二.用MeSH Database 检索肾衰竭饮食疗法的文献。
要求:第一作者Rao M的工作单位及E-mail地址。
操作步骤:1.进入PubMed主页,点击主页左侧中MeSH Database,进入MeSH Database网页2.在检索栏中输入renal failure, 点击Go3.在主题词注释页中,点击kidney failure。
4. 选副主题词(subheadings) 中的diet therapy (饮食疗法),选择send to下的Search Boxwith AND。
5.在返回结果页的检索框中"Kidney Failure/diet therapy"[MESH]后输入Rao M,点击PubMedSearch。
三.查找Challis DE作为第一作者发表于Pediatric Research 2000,47(3):309-15上的论文,并写出其他合著者。
操作步骤:1. 进入PubMed主页,在主页的左侧栏中点击Single Citation Matcher。
2. 按要求输入著者、刊名、卷、年等信息,点击search 按钮。
基因序列获取与同源性对比一.用NCBI查找人类抗癌基因(human antioncogene)的核酸序列报告,要求:写出序列号和碱基数,并拷贝原序列(Origen)。
概述:
PubMed是一个生命科学领域的文献数据库,是生物医学文献检索的重要工具。
本文对PubMed数据库的使用做一个简要介绍,以帮助读者更好地利用这个数据库进行文献检索。
1. PubMed数据库的结构和特点:
PubMed数据库是由美国国立卫生研究院(NIH)的国家医学图书馆(NLM)开发维护的。
它是一个免费的公共数据库,收录了生物医学和生命科学领域的大量学术文献,包括期刊文章、会议论文、学位论文等。
2.检索策略:
(1)关键词检索:根据文献的关键词进行检索。
关键词可以是疾病名、药物名、基因名等。
使用AND、OR、NOT等逻辑符号来组合关键词,以缩小或扩大范围。
(2)高级检索:在PubMed的高级界面中,可以通过使用多个字段、设置日期范围、对检索结果进行限定等方式,更精确地进行文献检索。
3.结果筛选和排序:
(1)限制结果:通过在界面的左侧面板中选择相关选项,可以限制结果的类型、语言、年份等。
(2)排序方式:结果默认按相关性排序,但也可以按出版日期、被引用次数等进行排序。
4.期刊和发表者信息:
5.数据库更新与同步:
(1)PubMed数据库每周更新,保持最新的文献信息。
(2)可以通过RSS订阅或设置自动更新来获取最新的文献信息。
6.其他功能和工具:。
PubMed使用教程指南PubMed使用教程指南1:简介1.1 PubMed概述1.2 文档目的和范围1.3 文档结构2:注册和登录2.1 注册过程2.2 登录步骤2.3 用户账户管理3:检索和筛选文献3.1 关键字检索3.2 高级检索3.3 检索结果筛选和排序3.4 收藏和导出文献4:文献详细信息和摘要4.1 文献详细信息页4.2 文献摘要和关键词4.3 相关文献推荐5:全文获取途径5.1 免费全文获取5.2 付费全文获取5.3 图书馆访问6:文献浏览和阅读工具6.1 在线阅读器6.2 PDF和打印6.3 标注和笔记7:数据库交互和导出选项7.1 搜索历史和搜索警报设置7.2 保存和导出搜索结果7.3 数据库交互和集成8: PubMed Central (PMC) 8.1 PMC概述8.2 PMC文献访问和8.3 PMC作者和机构信息9:其他功能和资源9.1 科学计量指数和引用分析9.2 转录本数据库和序列检索9.3 生物医学主题词(MeSH)搜索附录:附件1: PubMed常见问题解答 (FAQs)附件2: PubMed搜索示例附件3: PubMed用户指南(官方文档)法律名词及注释:1:版权(Copyright):著作权法所规定的权利,授予创作者对其所创作作品的独占权利。
2:公共领域(Public Domn):指作品的版权保护期已经过去,不再受版权法保护,可以自由使用。
3:开放获取(Open Access):指文献免费并可自由获取的出版模式,通常由作者或资助机构支付出版费用,以使文献对全球范围内的读者免费开放。
4:数据共享(Data Sharing):研究数据的共享原则,将研究数据公开存档并向其他研究人员开放,促进科学研究的可重复性和透明度。
5:版权许可(Copyright License):版权持有者授权他人使用、复制或再分发作品的许可证。
6:存取策略(Access Policy):指特定出版物的访问规则和限制,如开放获取、订阅制度等。
pubmed数据库的使用方法
本文以 pubmed中的一篇文章 Inhibition of Notch pathway attenuates the progression of human immunodeficiency virus-associated nephropathy. 为例来说明pubmed数据库的使用方法。
在pubmed中检索到该篇文章后,网址是 /pubmed/23389453
在页面左侧稍微靠上的地方,显示有该文章所属的期刊名字,如下图所示:
上图中棕色横线标注处显示的就是收录该文章的期刊的名字(是缩写),鼠标移动到该缩写的期刊名字上后,会弹出提示框显示该期刊的全名。
棕色横线标注处同行的后边是这篇文章在该期刊中是哪一年的哪一期以及该文章的doi编号等信息。
双击棕色横线标注处的链接,将可以查看该期刊的更多详细信息。
页面的右上角有时候会显示出该篇文章的全文获取链接,如下图所示:
在上图的棕色横线标注处,有时可以看到一个矩形的图标,那就是该篇文献的全文下载链接。
点击该链接将来到收录该文章全文的期刊或者数据库的该篇文章的网络下载页面,例如该篇文献的网络下载页面如下图所示:
上图红色链接标注处出现了一个登陆框,要求进行登陆,这表明你没有下载该篇文献的权限。
上图中绿色横线标注处是当你有此篇文献下载权限时,点击下载文献全文的位置。
没有该篇文献全文下载权限的话,是无法下载到此文献的,如果您是通过seek68数字图书馆提供的pubmed入口来到此页面,则有很大机会直接就具有该篇文献的下载权限,如下图所示:
上图是通过seek68提供的pubmed入口下载文献有该篇文献下载权限时出现的页面,大家可以比较与上一图的不同之处,即没有出现登陆框,并且绿色横线标注处也有所不同,提示您点击绿色横线标注处的链接即可以下载到此文章。
不过pubmed并不是对所有文章都给出全文下载链接,此时就需要根据pubmed所揭示的该文章被收录于什么期刊或者什么数据库等信息,来到相应的期刊或数据库网址中下载文章。
当这种比较疑难的情况出现时,解决办法请参看以下几篇文章:
文章一:外文文献怎么下载?疑难外文文献下载方
法! /swdzsw/item/c6f845ef02bc923b87d9de7b
文章二:一次疑难外文文献下载过程 /html/help/17.Html
文章三:从本站客服案例看如何下载国外期刊文
章 /html/kefu/47.html
这几篇文献下载经验文章在本站客户端软件菜单上也有,可以显著改善大家的文献下载体验,希望大家认真阅读。