水稻叶蝉抗性基因回交转育和CAPS 标记辅助选择
- 格式:pdf
- 大小:208.60 KB
- 文档页数:5
黑龙江农业科学2009(1):140~143Heilongjiang Agricultural Sciences综述分子标记辅助选择及其在水稻育种中应用与展望王 麒(黑龙江省农业科学院耕作栽培研究所,黑龙江哈尔滨150086)摘要:随着现代分子生物学的迅速发展,分子标记辅助选择技术给水稻育种提供了新的途径,加强分子标记辅助选择技术在水稻育种上的应用研究具有重要的实践意义。
综述了分子标记辅助选择的特点,重点介绍了分子标记辅助选择在水稻育种上的利用现状,主要包括质量性状改良、数量性状改良、回交育种、基因聚合等方面的应用进展,同时讨论了该技术存在的问题以及发展前景和展望。
关键词:分子标记辅助选择;水稻;育种中图分类号:S511 文献标识码:A 文章编号:100222767(2009)0120140204App lication and Potential P rosp ects of M olecu lar M ark er 2assistedS election in R ice B reedingW ANG Q i(Crop Tillage and Cultivation Institute of Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences ,Harbin ,Hei 2longjiang 150086)Abstract :With the rapid development of the m odern m olecular biology ,the molecular marker 2assisted selection (MAS )tech 2nology provided a new method for rice breeding.T o intensify the application of MAS was greatly significant in rice breeding.In this essay ,we summarized the characteristics of m olecular marker 2assisted selection ,focused on improving qualitative and quantitative characters ,backcross breeding and gene polymerization.At the same time ,the problems and potential prospects of m olecular marker 2assisted selection have also been discussed.K ey w ords :m olecular marker 2assisted selection ;rice ;breeding收稿日期:2008210225作者简介:王麒(19802),男,黑龙江省鸡西市人,硕士,研究实习员,从事水稻遗传育种研究。
江西农业学报㊀2021,33(03):11 16ActaAgriculturaeJiangxi㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀http://www.jxnyxb.comDOI:10.19386/j.cnki.jxnyxb.2021.03.02分子标记辅助选择改良黄华占和五山丝苗的褐飞虱抗性毛方明1,2,王红波1,3,牟同敏1∗㊀㊀收稿日期:2020-08-17基金项目:国家重点研发计划(2016YFD0101104);湖北省技术创新专项(2018ABA083)㊂作者简介:毛方明(1992─),男,江西人,硕士,主要从事水稻遗传育种研究㊂∗通信作者:牟同敏㊂(1.华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室,湖北武汉430070;2.江西省农业科学院/江西省超级水稻研究发展中心,江西南昌330200;3.湖北省农业科学院粮食作物研究所,湖北武汉430064)摘㊀要:为了提高常规籼稻品种 黄华占 和 五山丝苗 的褐飞虱抗性,采用杂交㊁回交和分子标记辅助选择技术,将褐飞虱抗性基因Bph14和Bph15分别导入到 黄华占 和 五山丝苗 的遗传背景中,选育出了具有 黄华占 和 五山丝苗 遗传背景,同时携带纯合Bph14和Bph15基因的新株系各2个㊂苗期褐飞虱抗性鉴定结果表明,选出的新株系均表现为抗褐飞虱㊂产量比较试验㊁性状考查和米质分析结果表明,新株系的产量㊁主要性状和稻米品质指标都与受体亲本相似,因此可以作为 黄华占 和 五山丝苗 的抗褐飞虱新品系进一步进行多点试验和区域试验㊂关键词:水稻;褐飞虱;抗性;分子标记辅助选择;改良中图分类号:S511.034㊀文献标志码:A㊀文章编号:1001-8581(2021)03-0011-06ImprovementofResistanceofHuanghuazhanandWushansimiaotoBrownPlanthopperbyMolecularMarker-assistedSelectionMAOFang-ming1,2,WANGHong-bo1,3,MOUTong-min1∗(1.NationalKeyLaboratoryofCropGeneticImprovement,HuazhongAgriculturalUniversity,Wuhan430070,China;2.JiangxiSuperRiceResearchandDevelopmentCenter,JiangxiAcademyofAgriculturalSciences,Nanchang330200,China;3.FoodCropsInstitute,HubeiAcademyofAgriculturalSciences,Wuhan430064,China)Abstract:InordertoimprovetheresistanceofHuanghuazhan(HHZ)andWushansimiao(WSSM)tobrownplanthopper(BPH),twoBPH-resistantgenes,Bph14andBph15,weresuccessfullypyramidedintothegeneticbackgroundofHHZandWSSMbycrossing,backcrossingandmolecularmarker-assistedselection(MAS),respectively.TwoimprovedlineswithgeneticbackgroundofeachHHZandWSSMcarriedhomozygousBph14andBph15genesweredeveloped.BPHbioassaysresultsshowedthattheimprovedlineswereallresistanttoBPHattheseedlingstage.Thefieldyieldtest,majoragronomictraitsevaluationandgrainqualityanalysisresultsshowedthattheimprovedlineswerebasicallyidenticaltothecorrespondingrecipient.TheseimprovedlinescouldbeusedasnewBPH-resistantstrainsforfurthermulti-pointandregionaltests.Keywords:Rice;Brownplanthopper;Resistance;Molecularmarker-assistedselection;Improvement㊀㊀褐飞虱是水稻上危害性最强的单食性害虫,具有极强的繁殖能力,主要危害亚洲栽培稻和野生稻㊂在2006 2015年的10年中,我国每年因稻飞虱造成的水稻产量损失可达到11.9亿kg,占水稻五大病虫害损失总量的29.51%[1]㊂褐飞虱的频繁暴发不仅对水稻的产量和品质造成了严重的影响,还因为杀虫剂的过量使用增加了水稻生产成本,破坏了自然生态系统平衡㊂多年实践证明,利用褐飞虱抗性基因培育抗褐飞虱水稻新品种,是最经济㊁环保且符合可持续发展战略的褐飞虱防治手段㊂到目前为止已至少鉴定到34个主效的褐飞虱抗性基因位点[2-3]㊂除此之外,还有约100个褐飞虱抗性相关QTLs被报道㊂Bph3㊁Bph6㊁Bph9㊁Bph14㊁BPH18㊁Bph26㊁bph29和Bph32等8个抗性基因已经被克隆[3-6]㊂位于第3号染色体长臂端的Bph14基因是首个通过图位克隆技术获得的褐飞虱抗性主效基因[4]㊂Bph14基因可以使水稻叶鞘中产生大量胼胝质,保持筛管堵塞,同时还能促进胰蛋白酶抑制剂合成来达到抑制褐飞虱取食的目的[7]㊂Bph15位于第4号染色体着丝粒临近区域的重组冷点区约580kb区间内,虽然该基因还未被克隆,但实践显示该基因具有较好的抗褐飞虱效果,已被广泛应用于水稻褐飞虱抗性育种中[8]㊂利用MAS技术可快速进行优良基因渗入及多基因聚合㊂实践证明,利用MAS聚合褐飞虱抗性基因可以有效提高水稻的褐飞虱抗性㊂Wang等利用MAS将Bph6和Bph9基因聚合于93-11背景中,成功选育出农艺性状和稻米品质与93-11相似的双基因聚合系珞扬69,其褐飞虱抗性显著高于Bph6和Bph9的单基因导入系,并且由珞扬69组配的携带Bph6和Bph9杂合基因的杂交组合也表现出较高的褐飞虱抗性[9]㊂李进波等通过9311和1826水稻品种创建了Bph14和Bph15基因的单基因和双基因导入系,褐飞虱抗性鉴定显示其双基因导入系均达到高抗水平,Bph14㊁Bph15单基因导入系分别表现出中抗以上和抗或高抗水平,说明双基因的效果强于单基因[10]㊂本研究分别以常规籼稻 黄华占 和 五山丝苗 为母本,与携带褐飞虱抗性基因Bph14和Bph15的供体材料 HB13001-14-5 (简称HB1-14-5)进行杂交和连续回交,结合分子标记检测技术和田间表型选择,最终选育出2个褐飞虱抗性明显提高㊁其他性状综合表现与轮回亲本 黄华占 相似的新株系 HB6-8 和 HB7-40 ,以及2个褐飞虱抗性明显提高㊁其他性状综合表现与 五山丝苗 相似的新株系 HB1-44 和 HB7-50 ㊂1㊀材料与方法1.1㊀供试材料和分子标记受体亲本 黄华占 和 五山丝苗 是广东省农业科学院水稻研究所选育的优质高产常规水稻新品种㊂本研究的 黄华占 和 五山丝苗 种子分别由湖北省种子集团有限公司和安徽荃银种业有限公司提供㊂供体亲本 HB1-14-5 是本实验室从 新6134/B5 后代选育的携带Bph14和Bph15基因的中间材料,抗褐飞虱㊂本研究用于检测Bph14基因的紧密连锁的Indel标记为76-2,正反序列分别为5 -CTGCT⁃GCTGCTCTCGTATTG-3 和5 -CAGGGAAGCTC⁃CAAGAACAG-3 [4]㊂用于检测Bph15基因的Indel标记为InD4,正反序列分别为5 -AGAAT⁃GCTAAAGATGACTGAA-3 和5 -AACGGTATT⁃GTTCTTGTCTAA-3 [8]㊂DNA的提取参照CTAB微量法;PCR扩增程序参考Du等的分子检测实验方法[4]㊂1.2㊀苗期褐飞虱抗性的鉴定方法本试验在华中农业大学褐飞虱鉴定网室进行㊂每个待鉴定的材料各3次重复,B5和TN1分别作为抗虫对照和感虫对照㊂具体操作方法和评价标准参考国际标准苗期集团筛选法[11]㊂1.3㊀产量、主要性状和稻米品质的测定方法于2018年夏季,在华中农业大学鄂州水稻育种基地进行产量比较试验,每个材料每个重复种植200株,行距是20cm,株距是16.7cm;每个材料3次重复,随机区组设计,四周种植保护行㊂在移栽后统一进行正常的田间管理㊂在生育期间记载生育期㊂在成熟时,每小区取样5株,进行株高㊁单株有效穗数㊁穗长㊁每穗总粒数㊁结实率和千粒重等主要性状的考查㊂分小区收获,在扬净㊁晒干(含水量13%)后,测定产量㊂稻米品质分析参照徐鹏等的方法[12]㊂2㊀结果与分析2.1㊀改良株系的创建过程于2014年夏季,在武汉种植受体亲本 黄华占 ㊁ 五山丝苗 和供体亲本 HB1-14-5 ,并分别进行杂交㊂在同年冬季,在海南种植2个杂交组合的F1各20株;在苗期,利用与Bph14㊁Bph15基因紧密连锁的分子标记对全部单株进行分子检测;在抽穗期,选择两个目标基因均杂合的单株(即真杂种),分别与对应的轮回亲本回交,分别收获BC1F1种子;从BC1F1至BC3F1,每个世代都进行分子标记检测,筛选同时携带两个抗性基因的单株,并选择表型与轮回亲本最相似的单株与对应的轮回亲本进行回交㊂于2016年5月,在武汉分别种植具有 黄华占 和 五山丝苗 遗传背景的BC3F1世代,选择其中同时携带杂合Bph14㊁Bph15基因,表型与对应轮回亲本最相似的单株,收获BC3F2种子;在BC3F2世代,从880株的 黄华占 / HB1-14-5 群体中筛选获得携带纯合Bph14和Bph15基因的单株39个,从720株 五山丝苗 / HB1-14-5 群体中筛选获得携带纯合Bph14和21江㊀西㊀农㊀业㊀学㊀报㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀33卷Bph15基因的单株28个,分别收获自交种子;从BC3F3到BC3F5世代,每个世代继续利用分子标记对目标基因进行检测,并跟踪选择,同时对中选株系的苗期褐飞虱抗性进行鉴定;对BC3F5株系进行3次重复的产量比较试验,分析主要性状及稻米品质㊂在2018年秋季,决选出2个携带纯合Bph14和Bph15基因,主要性状及稻米品质与 黄华占 相似的新株系,分别命名为HB6-8和HB7-40;同时决选出2个携带纯合Bph14和Bph15基因,主要性状及稻米品质与 五山丝苗 相似的新株系,分别命名为HB1-44和HB7-50㊂改良株系的创建过程以及新株系抗性基因的分子检测结果分别见图1和图2㊂图1㊀具有 黄华占 和 五山丝苗 遗传背景的改良株系的创建过程阴性对照为 黄华占 和 五山丝苗 ;阳性对照为HB1-14-5;每个株系含5个泳道,76-2和InD4分别检测Bph14和Bph15基因㊂图2㊀改良株系的抗性基因Bph14㊁Bph15的PCR检测结果31㊀3期㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀毛方明等:分子标记辅助选择改良黄华占和五山丝苗的褐飞虱抗性2.2㊀改良株系的遗传背景回复率分析将4个决选株系的种子进行催芽,从中随机选取30粒种子的幼芽进行混合取样㊂样品送至中国种子集团公司生命科学中心,使用水稻育种芯片RICE6K进行遗传背景分析㊂RICE6K芯片共包含5102个均匀覆盖水稻12条染色体的SNP和InDel标记,其中SNP的分布密度为每1Mb12个SNPs[13]㊂亲本间差异分析结果表明:在 黄华占 与 HB1-14-5 之间有678个SNP标记表现出多态性;而在 五山丝苗 与 HB1-14-5 之间有689个SNP标记表现出多态性㊂在改良株系中,来源于供体 HB1-14-5 的染色体片段主要集中在抗性基因Bph14和Bph15的上下游区段(图3);除此之外,在其余染色体上也有少量供体来源的片段分布;株系HB6-8㊁HB7-40㊁HB1-44和HB7-50的遗传背景回复率分别为94.52%㊁90.91%㊁94.57%和92.69%㊂BB表示来源于供体亲本的染色体片段;AB表示杂合的染色体片段;AA表示来源于受体亲本的染色体片段㊂图3㊀改良株系的RICE6K芯片分析结果2.3㊀改良株系在苗期的褐飞虱抗性表现于2018年7月,在武汉对改良株系的苗期褐飞虱抗性进行了鉴定㊂以TN1作为感虫对照,以携带Bph14和Bph15基因的B5作为抗虫对照,每份材料3次重复㊂抗性鉴定结果表明:受体亲本黄华占 和 五山丝苗 以及感虫对照TN1的平均受害等级分别为7.0㊁8.3和8.3级,表现为感或高感褐飞虱;供体亲本 HB1-14-5 和抗虫对照B5的平均受害等级分别为3.0和1.7级,分别表现为抗和高抗褐飞虱;4个改良株系的平均受害等级为1.0 2.3级,表现为抗或高抗褐飞虱,其中具有 黄华占 背景的两个改良株系HB6-8和HB7-40的平均受害等级均为2.3级,表现为抗褐飞虱;具有 五山丝苗 背景的两个改良株系HB1-44和HB7-50的平均受害等级分别为1.7和1.0级,均表现为高抗褐飞虱(图4a和图4b)㊂2.4㊀改良株系的产量、主要性状及稻米品质表现改良株系的产量比较试验和主要性状考察结果(表1)表明:株系HB6-8和HB7-40的株高㊁单株有效穗数㊁穗长㊁每穗总粒数㊁产量与受体亲本 黄华占 没有显著差异,但是播始历期比 黄华占 缩短了2 3d,在高温条件下结实率和千粒重比黄华占提高;HB1-44的播始历期㊁单株有效穗数㊁穗长㊁结实率和产量都与受体亲本 五山丝苗 没有显著差异,但是株高和千粒重显著提高,每穗总粒数极显著降低;株系HB7-50除播始历期和每穗总粒数极显著低于 五山丝苗 外,产量㊁其他性状与五山丝苗无显著性差异㊂㊀㊀稻米品质分析结果(表2)表明,在分析的10项理化指标中,改良株系HB6-8和HB7-40与 黄华占 基本相似,而HB1-44和HB7-50与 五山丝苗 基本相似㊂3㊀讨论3.1㊀分子标记辅助选择技术有助于快速改良水稻的抗性分子标记辅助选择(MAS)技术结合常规育种是目前进行作物育种改良的有效途径,其准确率41江㊀西㊀农㊀业㊀学㊀报㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀33卷和选择效率高,育种周期短㊂本研究采用该方法将Bph14和Bph15基因渗入优良常规稻 黄华占 和 五山丝苗 背景中,分别获得了2个褐飞虱抗性显著提高,且产量㊁主要性状和稻米品质与受体亲本相似的新株系,可以作为黄华占和五山丝苗的抗褐飞虱替代品系进一步进行多点试验和区域试验㊂㊀㊀a:褐飞虱取食后幼苗的表现㊂b:幼苗的抗性分数及抗性水平㊂B5:抗虫对照㊂TN1:感虫对照㊂S㊁HS㊁R和HR分别表示感㊁高感㊁抗和高抗褐飞虱㊂图4㊀改良株系的苗期褐飞虱抗性鉴定结果表1㊀改良株系2018年在鄂州的产量和主要性状表现材料播始历期/d株高/cm单株有效穗数穗长/cm每穗总粒数结实率/%千粒重/g产量/(kg/667m2)黄华占82.0116.110.424.216663.5820.0613.7HB6-879.7∗∗116.010.625.316076.19∗21.8∗∗632.8HB7-4079.0∗∗113.910.224.616278.28∗22.1∗∗636.4五山丝苗83.3123.79.626.226873.4319.3715.0HB1-4482.7127.6∗10.724.9187∗∗72.4821.1∗702.1HB7-5081.3∗∗122.910.925.8188∗∗71.8120.4699.0㊀注:方差分析采用Duncan s新复极差法; ∗ 和 ∗∗ 分别表示与受体亲本的差异达到了0.05和0.01显著水平㊂表2㊀改良株系2018年在鄂州的稻米品质分析结果材料出糙率/%精米率/%整精米率/%粒长/mm长宽比垩白粒率/%垩白度/%直链淀粉含量/%胶稠度/mm碱消值/级黄华占78.7868.5465.615.93.34.21.015.588.36.6HB6-879.0970.8758.926.03.32.60.714.683.76.5HB7-4079.6470.1664.435.93.24.51.316.786.35.6五山丝苗79.1370.7167.565.73.11.80.414.874.06.7HB1-4478.4469.8365.655.73.01.90.514.977.06.9HB7-5078.8570.6664.425.83.23.81.113.878.36.8㊀㊀作物的抗虫㊁抗病等抗性基因主要受主效基因的控制,受外界环境因素的影响较小㊂通过分子标记辅助选择技术将这些抗性基因导入目标品种,以改良其抗性是一种十分有效的途径㊂例如,任西明等利用Bph14和Bph15基因,通过MAS成功改良了两系不育系C815S的褐飞虱抗性[14];徐鹏等通过MAS将Pi9㊁Xa23㊁Bph14和Bph15基因聚合于水稻恢复系R1813中,获得了稻瘟病㊁白叶枯病和褐飞虱抗性均明显提高的新株系[12]㊂利用MAS技术除了可以进行前景(目标基因)选择外,还可以对遗传背景进行选择㊂随着分子标记的普及和不断开发,SSR㊁RFLP㊁AFLP㊁SNP等分子标记技术被广泛应用于生物学科研的各个领域㊂前期利用分子标记进行遗传背景选择时,可以快速淘汰一些不符合育种要求的单株;对于背景回复率高的单株,则需要继续在未恢复为轮回亲本的位点附近继续增加标记进行回交选择,以此缩小与轮回亲本间的差异㊂MAS虽然能够给作物育种和改良提供便利,但在应用过程中也暴露出一些缺点,比如MAS只能从构成表型的所有变异中捕获主效基因带来的变异,而非主效基因累加的变异被忽视㊂为了达到更加精确的育种目标,可以利用全基因组选择方法,在基因组水平上对与目标性状相关的所有QTL进行检测,从而捕51㊀3期㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀毛方明等:分子标记辅助选择改良黄华占和五山丝苗的褐飞虱抗性获主效和非主效基因带来的变异㊂3.2㊀褐飞虱抗性基因Bph14和Bph15的利用价值及策略Bph14和Bph15基因是目前褐飞虱抗性基因研究中使用较为广泛的两个主效基因,前人研究均表明其具有良好的褐飞虱抗性㊂本研究利用MAS将Bph14和Bph15基因分别聚合在常规稻 黄华占 及 五山丝苗 中,获得的4个新株系的褐飞虱抗性均达抗级水平以上,表明纯合Bph14和Bph15基因聚合能够达到抗褐飞虱的效果㊂Hu等的研究表明,Bph14和Bph15在 明恢63 背景中表现出较高的褐飞虱抗性,在其所配的杂交组合中,Bph14和Bph15在单基因杂合㊁单基因纯合㊁双基因杂合㊁双基因纯合状态下均表现出一定的褐飞虱抗性,且抗性逐渐增强[16]㊂Wang等的研究结果表明,携带纯合Bph14和Bph15的亲本或杂交组合在苗期均具有优良的褐飞虱抗性,而携带杂合Bph14和Bph15基因的杂交组合在苗期均表现为感褐飞虱[17]㊂上述研究结果表明纯合Bph14和Bph15基因在不同遗传背景中均能表现出优良的抗性,而杂合Bph14和Bph15基因在不同遗传背景下其抗性可能有差异,表明Bph14和Bph15基因具有剂量效应,是不完全显性表达的㊂因此,若利用Bph14和Bph15基因进行抗虫杂交稻选育,最好选择携带相同褐飞虱抗性基因的不育系和恢复系进行配组,使杂交稻携带纯合的褐飞虱抗性基因,从而达到最佳的抗褐飞虱效果㊂参考文献:[1]刘万才,刘振东,黄冲,等.近10年农作物主要病虫害发生危害情况的统计和分析[J].植物保护,2016,42(5):1-9,46.[2]FujitaD,KohliA,HorganFG.Riceresistancetoplan⁃thoppersandleafhoppers[J].CritRevPlantSci,2013,32(3):162-191.[3]RenJS,GaoFY,WuXT,etal.Bph32,anovelgeneencodinganunknownSCRdomain-containingprotein,confersresistanceagainstthebrownplanthopperinrice[J].SciRep,2016,6(1):441-444.[4]DuB,ZhangWL,LiuBF,etal.IdentificationandcharacterizationofBph14,ageneconferringresistancetobrownplanthopperinrice[J].ProcNatlAcadSciUSA,2009,106(52):22163-22168.[5]WangY,CaoLM,ZhangYX,etal.Map-basedcloningandcharacterizationofBPH29,aB3domain-containingrecessivegeneconferringbrownplanthopperresistanceinrice[J].JExpBot,2015,66(19):6035-6045.[6]HuJ,XiaoC,HeYQ.Recentprogressonthegeneticsandmolecularbreedingofbrownplanthopperresistanceinrice[J].Rice(NewYork),2016,9(1):30-42.[7]HuL,WuY,WuD,etal.Thecoiled-coilandnucleotidebindingdomainsofbrownplanthopperresistance14functioninsignalingandresistanceagainstplanthopperinrice[J].PlantCell,2017,29(12):3157-3185.[8]LvWT,DuB,ShuangGX,etal.BACandRNAse⁃quencingrevealthebrownplanthopperresistancegeneBPH15inarecombinationcoldspotthatmediatesauniquedefensemechanism[J].BMCGenomics,2014,15:674-690.[9]WangY,JiangWH,LiuHM,etal.MarkerassistedpyramidingofBph6andBph9intoeliterestorerline93-11anddevelopmentoffunctionalmarkerforBph9[J].Rice,2017,10(1):51.[10]李进波,夏明元,戚华雄,等.水稻抗褐飞虱基因Bph14和Bph15的分子标记辅助选择[J].中国农业科学,2006(10):2132-2137.[11]VelusamyR,HeinrichsEA,MedranoFG.Greenhousetechniquestoidentifyfieldresistancetothebrownplan⁃thopper,Nilaparvatalugens(Stål)(Homoptera:Del⁃phacidae),inricecultivars[J].Elsevier,1986,5(5):328-333.[12]徐鹏,叶胜拓,牟同敏.分子标记辅助选择改良水稻恢复系R1813稻瘟病㊁白叶枯病和褐飞虱抗性研究[J].杂交水稻,2019,34(1):62-69.[13]YuHH,XieWB,LiJ,etal.Awhole-genomeSNParray(RICE6K)forgenomicbreedinginrice[J].PlantBiotechnologyJournal,2014,12(1):28-37.[14]任西明,向聪,雷定强,等.利用分子标记辅助选择改良水稻两系不育系C815S的褐飞虱抗性研究[J].杂交水稻,2018,33(3):54-58,87.[15]田大刚,杨小双,陈子强,等.利用分子标记辅助选择改良闽恢3301稻瘟病抗性[J].南方农业学报,2019,50(8):1665-1670.[16]HuJ,LiX,WuCJ,etal.PyramidingandevaluationofthebrownplanthopperresistancegenesBph14andBph15inhybridrice[J].MolecularBreeding,2012,29(1):61-69.[17]WangHB,YeST,MouTM.Molecularbreedingofricerestorerlinesandhybridsforbrownplanthopper(BPH)resistanceusingtheBph14andBph15genes[J].Rice,2016,9(1):1-9.(责任编辑:黄荣华)61江㊀西㊀农㊀业㊀学㊀报㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀33卷。
分子标记辅助选择培育抗稻瘟病和白叶枯病水稻光温敏核不育系两系法杂交水稻是我国发明的水稻杂种优势利用方法,与三系法杂交稻相比,两系法杂交水稻育种环节减少、细胞质多样化、配组自由,易于选育优质高产的组合,已经成为我国杂交水稻的主要栽培类型,但是目前其抗病性并没有明显提高。
在水稻光温敏核不育系的选育中,育种家主要注重育性稳定性、稻米品质、配合力等方面的改良,使得目前许多两系杂交水稻的稻瘟病和白叶枯病抗性较差,已严重影响我国的水稻生产。
分子标记辅助选择技术的发展和应用,为有效改良水稻光温敏核不育系的抗稻瘟病和抗白叶枯病提供了技术支持。
本研究利用分子标记辅助选择和基因聚合技术,通过杂交、回交和复交,将抗稻瘟病基因Pi2和抗白叶枯病基因Xa7、Xa21和Xa23渗入到3个优良的水稻光温敏核不育系C815S、广占63-4S和华328S背景中,创建了一系列稻瘟病和白叶枯病抗性得到明显改良的光温敏核不育系新材料,并通过冷水处理、人工气候箱筛选、育性稳定性鉴定、主要农艺性状和开花习性考察、稻米品质分析、组合测配和产量比较试验,获得了以下研究结果:1.选育出性状基本稳定的光温敏核不育系14个。
其中携带Pi2基因抗稻瘟病的光温敏核不育系5个,分别命名为华1032S、华1033S、华1034S、华1037S和华1035S;抗白叶枯病的不育系8个,分别是携带Xa7基因的华1017S,携带Xa23基因的华1006S和华1009S,同时携带Xa7和Xa21基因的华1002S、华1005S、华1010S和华1012S,同时携带Xa7和Xa23基因的华1001S;携带Pi2和Xa23基因同时抗稻瘟病和白叶枯病的不育系1个,华1015S。
2.连续两年在稻瘟病常发区的远安和恩施自然诱发鉴定结果表明,5个携带Pi2基因的光温敏核不育系,华1032S、华1033S、华1034S、华1037S和华1035S,稻瘟病抗性为中抗至高抗,同时携带Pi2和Xa23基因的华1015S,稻瘟病表现中感至抗,受体亲本C815S和广占63-4S均表现高感。
作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2012, 38(11): 1960-1968 /zwxb/ ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9 E-mail: xbzw@ This work was supported by the National High Technology Research and Development Program of China (Grant No. 2011AA10A101 and 2012AA101102) and the Ministry of Finance, China (Grant No. 2012RG002-4).* Correspondence author: WU Jian-Li, E-mail: beishangd@, Tel: +86-571-63370326**These authors contributed equally to this work. Received(收稿日期): 2012-04-17; Accepted(接受日期): 2012-07-05; Published online(网络出版日期): 2012-09-10.URL: /kcms/detail/11.1809.S.20120910.1404.023.html DOI: 10.3724/SP.J.1006.2012.01960Development and Validation of CAPS Markers for Marker-Assisted Selection of Rice Blast Resistance Gene Pi25WANG Hui-Mei 1,**, CHEN Jie 1,**, SHI Yong-Feng 1, PAN Gang 2, SHEN Hai-Chao 1, and WU Jian-Li 1,* 1 State Key Laboratory of Rice Biology / China National Rice Research Institute, Hangzhou 310006, China; 2 College of Agriculture and Biotechno- logy, Zhejiang University, Hangzhou 310058, ChinaAbstract: To promote the application of rice blast resistance gene Pi25 in rice breeding programs, we developed four sets of gene-specific CAPS markers (CAP1/Hinc II, CAP3/Bgl II, CAP3/Nde I, and CAP3/Hpy 99I) based on the coding sequences of the locus. One hundred and sixty-nine rice accessions, 98 recombinant inbred lines (RILs) and 217 transgenic plants were used for the validation of the markers. The results showed that all the four sets of markers were able to accurately and efficiently detect the Pi25/pi25 locus, CAP1/Hinc II and CAP3/Hpy 99I could digest specifically the dominant allele Pi25 while CAP3/Bgl II and CAP3/Nde I were able to digest specifically the recessive allele pi25. RILs and transgenic lines carrying Pi25 allele were resistant to the blast isolate JS001-20 while the lines carrying pi25 allele were susceptible, indicating a perfect detection of the target locus by the CAPS markers. In addition, a low frequency (1.2%) of the dominant allele was detected in the germplasm collections, in-dicating this gene has not been fully utilized in rice breeding programs in China. Markers CAP1/Hinc II and CAP3/Hpy 99I are recommended and will be useful for the improvement of blast resistance, especially for the early-season indica rice.Keywords: Oryza sativa ; Blast resistance; Cleaved amplified polymorphic sequence (CAPS); Marker-assisted selection (MAS); Single nucleotide polymorphism (SNP)稻瘟病抗性基因Pi25特异性CAPS 标记的开发与验证王惠梅1,** 陈 洁1,** 施勇烽1 潘 刚2 沈海超1 吴建利1,*1中国水稻研究所 / 水稻生物学国家重点实验室, 浙江杭州 310006; 2浙江大学农业与生物技术学院, 浙江杭州 310058摘 要: 为在水稻育种中快速与高效利用稻瘟病抗性基因Pi25, 本文利用该基因不同等位基因编码区序列差异开发了4套CAPS 标记(CAP1/Hinc II 、CAP3/Bgl II 、CAP3/Nde I 和CAP3/Hpy 99I), 并利用169份稻种资源、98个重组自交系(RIL)以及217个水稻转基因后代, 对4套标记的准确性和选择效果进行了验证。
分子标记辅助选择在水稻抗病育种研究进展官华忠摘要:随着水稻高密度分子遗传图谱的构建和重要农艺性状的基因或QTL的定位,分子标记辅助选择逐渐用于质量和数量性状的遗传改良。
本文综述了分子标记辅助选择在水稻抗稻瘟病、抗白叶枯病和抗细菌性条斑病的育种应用的研究进展,存在的问题和展望。
关键词:分子标记辅助选择,水稻育种,稻瘟病,白叶枯病,细菌性条斑病水稻是全球重要的粮食作物之一,全世界有25亿以上的人口主食大米,其中中国是世界上最大的水稻生产和消费国,60%人口以稻米为主要食粮。
自从实现杂交水稻三系配套以来,我国杂交水稻年种植面积1533.33万hm2左右,约占水稻总面积的50%,而产量则占水稻总产的近60%[1],为我国粮食生产做出了巨大贡献。
然而,水稻病害的危害一直严重地影响着水稻生产。
水稻病害种类很多,全世界有近百种,我国正式记载的达70余种,其中具有经济重要性的有20余种[2]。
稻瘟病、白叶枯病发生面积大,流行性强,危害严重,两者均为水稻“三大病害”之一;同时由于近年来随着感病杂交水稻的大面积推广,细菌性条斑病发生日趋广泛和严重,也已成为我国南方稻区最重要的水稻病害之一。
因此,筛选出具有持久抗瘟能力的种质资源做供体亲本,采用相宜的杂交配组方式,从而培育具有持久抗瘟能力的不育(保持)系和恢复系,并推广和种植抗病品种,是防治水稻稻瘟病病害的最经济有效的措施。
目前国内多数育种单位还基本上是靠传统的方法进行抗病育种,依赖于抗性鉴定和植株表型的选择,常常受到没有合适的致病菌株和病菌发病条件的限制,鉴定结果不准确,育种效率低[3]。
此外,用传统方法构建基因累加系(即基因聚合)是很困难的,难于选育出聚合多个抗病基因的持久抗病品种。
利用生物技术培育持久抗病性品种是现代开辟的新途径。
例如分子标记辅助选择(Maker assisted selection, MAS),这种技术是通过分析与抗病基因紧密连锁的分子标记的基因型来对目标基因进行选择。
水稻稻瘟病抗性基因研究进展及其在育种上的应用康美花;曹丰生;陈红萍;刘建华;杨水莲;杨素芬;裴冬莲【摘要】综述了迄今已定位和克隆的稻瘟病抗性基因的研究进展,并结合国内对这些抗性基因的应用情况,展望了稻瘟病抗性基因在育种中的应用前景.【期刊名称】《江西农业学报》【年(卷),期】2010(022)002【总页数】4页(P95-98)【关键词】稻瘟病;抗性基因;定位;克隆;抗性育种【作者】康美花;曹丰生;陈红萍;刘建华;杨水莲;杨素芬;裴冬莲【作者单位】江西省农业科学院,水稻研究所,江西,南昌,330200;江西省农业科学院,水稻研究所,江西,南昌,330200;江西省农业科学院,水稻研究所,江西,南昌,330200;江西省农业科学院,水稻研究所,江西,南昌,330200;江西省农业科学院,水稻研究所,江西,南昌,330200;江西省农业科学院,水稻研究所,江西,南昌,330200;江西省农业科学院,水稻研究所,江西,南昌,330200【正文语种】中文【中图分类】S511水稻(Oryza sativa L.)是世界上 1/3以上人口的主要粮食之一,也是我国 65%以上人口的主食。
而由病原菌 Magnaporthe grisea引起的稻瘟病是水稻最严重的病害之一,在世界各个水稻生产国家或地区均有发生。
据统计,在1975~1990年,因稻瘟病引起的全球水稻产量损失高达1.57亿 t[1]。
在流行年份,稻瘟病造成的产量损失一般为 10%~20%,严重的可达 50%以上,局部田块甚至颗粒无收,而且还会导致稻米品质下降[2]。
实践证明,培育与种植抗病品种是最经济、最有效的防治稻瘟病的措施。
然而,大多数抗病品种在推广数年后,其抗病性会逐步丧失,其主要原因是大面积种植的品种的抗病基因相对单一,使得稻瘟病菌群体中的毒性小种逐渐成为优势小种,进而造成病害的流行[3]。
因此,抗稻瘟病基因的发掘和合理利用是当今抗病育种的关键。
利用分子标记辅助选择改良闽恢3301稻瘟病抗性作者:田大刚杨小双陈子强陈在杰林艳王锋来源:《南方农业学报》2019年第08期摘要:【目的】改良三系杂交籼稻强势恢复系闽恢3301的稻瘟病抗性,以提高其在生产中的应用价值。
【方法】以75-1-127和C101A51为稻瘟病主效基因Pi9和Pi2的供体亲本,以闽恢3301为受体亲本,通过杂交、多代回交和自交,结合分子标记辅助选择和田间选择的方法,将供体亲本的Pi9和Pi2基因导入闽恢3301中,改良其稻瘟病抗性。
利用21个福建近年流行的稻瘟菌菌株及其混合菌液对闽恢3301改良系进行人工接种抗性鉴定,并连续两年在上杭茶地病圃进行田间自然诱发抗性鉴定。
将闽恢3301改良系和闽恢3301分别与三系不育系荟丰A和广8A及两系不育系GRD-7S进行测配,考察其农艺性状,以闽恢3301为父本的杂交组合为对照。
【结果】通过利用Pi2/9分子标记对抗病基因进行跟踪选择,最终获得含Pi9和Pi2的闽恢3301改良系(闽恢3301-Pi9和闽恢3301-Pi2)各20份。
除闽恢3301-Pi9对SH17004菌株表现为中感外,闽恢3301-Pi9对其他20个稻瘟病菌株及于2016和2017年在田间自然诱发鉴定中均表现出抗病,且闽恢3301-Pi2对21个稻瘟病菌株及于2016和2017年在田间自然诱发鉴定中均表现出抗病或高抗,二者抗性达到甚至超过两供体亲本75-1-127和C101A51的抗性水平,但闽恢3301对7个稻瘟病菌株表现感病,对1个菌株表现中感,对其他菌株则表现中抗或抗病,且田间自然诱发鉴定中均表现高感,说明闽恢3301-Pi9和闽恢3301-Pi2抗性水平得到有效提高。
除RGD-7S×闽恢3301-Pi9和RGD-7S×闽恢3301-Pi2组合的单株产量分别极显著(P<0.01)高于相应的对照组合外,其他以闽恢3301改良株系为父本的杂交组合在株高、穗长、分蘖数、千粒重、单株产量和结实率上无显著差异(P>0.05),表明闽恢3301-Pi2和闽恢3301-Pi9在培育稻瘟病抗性杂交水稻组合上具有广阔的应用前景。
作物育种新技术:DNA标记辅助选择蒲晓斌;蒋梁材;张锦芳;李浩杰;张启行【摘要】农业生产的关键是选用优良品种。
一个理想的优良品种不仅产量高、品质好,而且抗病虫、抗逆性强。
将不同品种各自具有的优良性状通过杂交集中到一个品种中,一直是作物育种家们的主要工作目标。
在传统的育种工作中,育种家们首先进行品种或品系间的杂交,然后从分离后代中通过表型观察选择理想的重组基因型。
但一些重要性状如抗性、品质等的表型观测十分困难,多数是数量性状,易受环境影响,这就注定传统育种工作是一个周期长、难度大、耗费多、结果难预料的过程。
长期以来,育种家们试图利用遗传标记辅助育种,但早期的遗传标记各自具有一些弱点,新近发展的DNA标记才成为最有成效的手段。
【期刊名称】《种子》【年(卷),期】2006(025)005【总页数】2页(P54-55)【关键词】育种新技术;DNA标记;作物育种;标记辅助选择;优良品种;标记辅助育种;育种工作;遗传标记;农业生产;抗逆性强【作者】蒲晓斌;蒋梁材;张锦芳;李浩杰;张启行【作者单位】四川省农业科学院作物研究所,成都,610066;四川大学生命科学学院,成都,610064;四川省农业科学院作物研究所,成都,610066;四川省农业科学院作物研究所,成都,610066;四川省农业科学院作物研究所,成都,610066;四川省农业科学院作物研究所,成都,610066【正文语种】中文【中图分类】S33农业生产的关键是选用优良品种。
一个理想的优良品种不仅产量高、品质好,而且抗病虫、抗逆性强。
将不同品种各自具有的优良性状通过杂交集中到一个品种中,一直是作物育种家们的主要工作目标。
在传统的育种工作中,育种家们首先进行品种或品系间的杂交,然后从分离后代中通过表型观察选择理想的重组基因型。
但一些重要性状如抗性、品质等的表型观测十分困难,多数是数量性状,易受环境影响,这就注定传统育种工作是一个周期长、难度大、耗费多、结果难预料的过程。
水稻叶蝉抗性基因回交转育和CAPS 标记辅助选择王春明1,安井秀2,吉村醇2,苏昌潮1,翟虎渠1,万建民1(1南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/江苏省植物基因工程研究中心,南京210095;2日本国立九州大学农学部,福冈812-8581)摘要:以综合性状好但对黑尾叶蝉(Ne p hotettix cinctice p s Uhler )敏感的品种台中65作为轮回亲本,与抗性品种DV85连续回交,得到回交高代BC 6F 2群体,进行抗叶蝉性状的回交转育。
将抗黑尾叶蝉基因Grh2两侧的RFLP 标记C189和G1465成功地转换为在亲本间具有多态的CAPS 标记。
在进行表型选择的同时,利用CAPS 标记对BC 6F 2进行了标记辅助选择,分析了CAPS 标记与Grh2间的遗传距离和标记辅助选择的效果。
所选出的个体具有台中65的遗传背景且携带纯合Grh2基因,可作为聚合抗叶蝉基因培育新品种的重要中间材料。
关键词:水稻;黑尾叶蝉;抗虫性;CAPS ;标记辅助选择Green Rice Leafho pp er Resistance Gene Transferrin g Throu g h Backcrossin g and CAPS Marker Assisted SeIectionWANG Chun-min g 1,Hideshi Yasui 2,Atsushi Yoshimura 2,SU Chan g -chao 1,ZHAI Hu-q u 1,WAN Jian-min 1(1State Ke y Laborator y o f Cro p Genetics and Germ p lasm Enhancement ,Nan j in g A g ricultural Universit y /Research Center o f Plant Gene En g ineerin g ,Nan j in g 210095;2Facult y o f A g riculture ,K y ushu Universit y ,Fukuoka 812-8581,Ja p an )Abstract :In order to transfer the resistance to g reen rice leafho pp er (Ne p hotettix cinctice p s Uhler )into Taichun g 65,a j a p onica cultivar with elite characters ,the resisitant indica cultivar DV85was backcrossed with Taichun g 65as the recurrent p arent.Grh2,one of resistance g enes was located on chromosome 11of resistant variet y DV85.C189and G1465,two RFLP markers flankin g Grh2g ene ,were transformed into CAPS mark-ers.Both p henot yp ic selection and CAPS marker assistant selection were conducted in the BC 6F 2p o p ulation de-rived from the cross of Taichun g 65and DV85to p ick out the im p ortant breedin g materials with Taichun g 65back g round and resistance to g reen rice leafho pp er.The linka g e distance was calculated with the molecular and p henot yp ic data ,meanwhile the effect of the selection method was anal y zed.Ke y words :Or y za sativa ;Ne p hotettix cinctice p s Uhler ;Insect resistance ;CAPS ;Marker assisted selection 收稿日期:2002-01-18基金项目:教育部优秀骨干教师基金资助项目和农业部“948”资助项目(201002A )作者简介:王春明(1967-),男,江苏江都人,讲师,博士,主要从事水稻遗传育种研究。
万建民为本文通讯作者,Tel /Fax :025-*******;E-mail :wan j m@n j 水稻品种DV85抗黑尾叶蝉(Ne p hotettix cinc-tice p s Uhler )基因Grh2和Grh4分别位于第11和第3染色体上,C189和G1465为Grh2两侧的RFLP 标记,Grh4位于RFLP 标记R44和Y3870R之间[1,3]。
仅有1对抗性基因的家系,即基因型为Grh2/Grh2g rh4/g rh4或g rh2/g rh2Grh4/Grh4,对黑尾叶蝉表现不抗,而同时具有2对抗性基因的家系,即基因型为Grh2/Grh2Grh4/Grh4,则表现高抗[2]。
利用分子标记辅助选择的方法向综合性状好的品种转育这2个抗黑尾叶蝉的基因,可以加速水稻抗叶蝉基因的聚合育种进程。
可用于水稻标记辅助育种的分子标记技术很多:基于DNA-DNA 杂交的DNA 标记如RFLP ,基于PCR 技术的DNA 标记如RAPD 、SSR 、SCAR 和中国农业科学2003,36(3):237-241Scientia A g ricultura SinicaSTS等。
RFLP分析需要高质量的DNA、繁琐的转膜技术、同位素标记或昂贵的ECL试剂盒,特别是DNA的提取需要采集较多叶片而不适合在生长早期进行性状的选择。
CAPS标记(cleaved am p lified p ol y mor p hic se q uences,酶解扩增多态性序列)是将特异引物PCR与限制性酶切相结合而产生的一种DNA标记技术,它实际上是一些特异引物PCR标记(如SCAR和STS)的延伸。
当SCAR或STS的特异扩增产物的电泳谱带不表现多态性时,补救方法是用限制性内切酶处理扩增产物,然后通过琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶电泳检测其多态性[4]。
从RFLP标记设计出与有用性状连锁的且具有多态的CAPS标记是对性状的标记辅助选择极具意义的关键步骤。
另一方面,在回交高代进行标记辅助选择时,有助于快速导入有利基因,使栽培品种的性状得到改良[5]。
笔者以综合性状好但对黑尾叶蝉敏感的品种台中65作为轮回亲本,与抗性品种DV85连续回交得到回交高代BC6F2群体,探索不影响植株正常生长、适合于早期选择重要农艺性状的CAPS分析配套方法,将抗黑尾叶蝉基因Grh2两侧的RFLP标记C189和G1465转换为在亲本间具有多态的CAPS标记,在进行表型选择的同时,利用CAPS标记对BC6F2进行标记辅助选择,将抗叶蝉基因Grh2快速导入台中65品种,分析CAPS标记与Grh2间的遗传距离和标记辅助选择的效果,以期选出具有台中65的遗传背景且携带纯合Grh2基因的个体,作为聚合抗叶蝉基因培育新品种的重要中间材料。
1材料与方法1.1分离群体的构建台中65是综合性状好而对黑尾叶蝉敏感的粳稻品种(基因型为g rh2/g rh2g rh4/g rh4),以之与抗叶蝉品种DV85(基因型为Grh2/Grh2Grh4/ Grh4)杂交,从杂交后代中选择抗性个体与轮回亲本台中65连续回交,在BC6F2群体中经RFLP分析选择基因型为Grh2/g rh2Grh4/Grh4的BC6F2个体,自交后,产生由120个个体组成的基因型为Grh2/g rh2的BC6F3分离群体供CAPS分析。
1.2DNA的简易提取将BC6F3分离群体播于温室中,DNA的简易提取方法是:从播种1~2周后的幼苗上取1~3cm长的叶片放入备有适量0.4mol・L-1NaOH的离心管中,用塑料棒碾磨至液体呈绿色,加160µl100mmol ・L-1Tris(p H7.5)充分混匀,以稀释60倍后的上清液(浓度约5n g・µl-1)作为模板DNA(可置-20℃保存),取2µl至PCR板中进行CAPS分析(反应体系为20µl)。
同时作接种鉴定,进行表型选择。
1.3供试虫群在25℃、相对湿度60%的恒温室中,16h人工照明和8h黑暗的光周期条件下繁殖饲养黑尾叶蝉群体,饲料为对叶蝉敏感的水稻品种日本晴。
水稻抗性测定方法:每棵幼苗接种7~10头2、3龄若虫,3d后观察,以若虫死亡率作为抗性指标[6]。
1.4CAPS标记设计CAPS引物设计方法:从日本水稻基因组(RGP)网页检索到位于Grh2两侧的RFLP标记C189和G1465的核苷酸序列,引物设计在htt p:// w w w-g /c g i-bin/p rimer/p rimer3-w w w.c g i网页进行。
引物合成和PCR产物测序工作由日本Takara公司完成。
扩增后测序发现台中65在C189区域存在缺失,DV85正常,2个亲本的PCR扩增产物经2%琼脂糖凝胶电泳检测出多态性;台中65的G1465区域无缺失变异,但存在点突变。
因此,从G1465设计PCR引物,这2个亲本的PCR扩增产物电泳谱带未表现多态,故分别用7种限制性内切酶BamHⅠ、B g lⅡ、DraⅠ、EcoRⅠ、EcoRV、HindⅢ和EcoT22Ⅰ进行酶切、电泳和筛选,发现EcoT22Ⅰ酶能够识别该突变位点,酶切电泳后检测出多态(图1)。
1.5CAPS分析PCR反应中DNA的变性、退火、延伸条件设定为:94℃1min、55℃1min、72℃2min,循环45次。
酶切在37℃下进行2h。
结合CAPS标记的分子数据和抗性数据用Ma p maker软件计算2个CAPS标记与Grh2基因的交换值,用Kosambi函数转换成遗传距离[7]。
2结果与分析2.1CAPS分析2个亲本C189片段处的PCR扩增产物经琼脂糖凝胶电泳,检测出多态性;而G1465处PCR扩增产物电泳谱带不表现多态性,经内切酶的筛选发现,用EcoT22Ⅰ酶切电泳后检测有多态性。
图2为2个CAPS标记在亲本间的多态。
图3为部分群体G1465处的PCR扩增产物经EcoT22Ⅰ酶切后出现的CAPS多态。