第2章 蛋白质分子设计
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《蛋白质的分子结构》教学设计一、教材分析本节课是生物化学第二章第二节蛋白质分子结构的内容。
它是在学生学完氨基酸、肽、稳定蛋白质分子的作用力的知识后,转入难度较大的蛋白质分子结构的学习。
蛋白质是学生接触到的第一个生物大分子,部分学过生物的同学对蛋白质的了解也只是基础知识。
学生没有建立起蛋白质分子结构的概念。
因此本堂课蛋白质的分子结构是本章节的重点内容。
它与前面所学的氨基酸、肽等内容联系紧密:也为今后学习酶、理解其它生物大分子的结构奠定基础。
二、教学目标【知识目标】①掌握蛋白质的一级、二级、三级、四级结构的概念及其作用力②掌握蛋白质二级结构的基本类型和结构特点。
③理解蛋白质结构与功能的关系。
【能力目标】通过观察、总结、推理等手段,培养学生的观察思考、归纳总结和创造思维能力。
【情感目标】通过发现问題、解決问题的过程,培养学生的探素精神。
使学生完成由感性认识到理性认识的过程,促进学生形成正确的世界观。
三、教学重点与难点蛋白质的分子结构属于微观世界,是看不见、摸不着的,通过展示图片,动画讲解来帮助学生理解,仍要学生发主观能动性,所以本节课的重点是蛋白的一级结构、二级结构,难点是白质的空间结构。
四、教学方法根据本节课的内容及学生的实际水平,我采取启发式学法。
作为理解蛋白质功能的重要理论,蛋白质的结构是一个极其抽象的知识。
对于学生米说,蛋白质的创设一种氛国,引导学生进入积极思考的学习状态就很重要了。
而启发式教学就重在教师的启发,创设问题情景,以此调动学生内在的认知需求,激发学生的探究蛋白质结构的兴趣。
五、教学手段充分发挥电脑多媒体的辅助教学作用。
多媒体以图片、动画等多种形式强化对学生感观的刺激,加强教学的直观性,増强学生的感性认识,提高学习兴趣,使学生在主动获取知识的过程中完成重点、难点的学习,从面完成教学日标。
六、教学过程五、板书设计第二节蛋白质的分子结构一、蛋白质的分子结构(一)蛋白质的一级结构(二)蛋白质的空间结构1、蛋白质的二级结构(1)α-螺旋(2)β-折叠(3)β-转角(4)无规则卷曲2、蛋白质的三级结构3、蛋白质的四级结构二、蛋白质结构与功能的关系(一)蛋白质一级结构与功能的关系(二)蛋白质空间结构与功能的关系。
蛋白质分子设计[引言]蛋白质是一类非常有用的物质,在生物体的进化过程中起着非常重要的作用。
与其它化学试剂比较:(1)分子量非常大;(2)在机体内稳定;(3)专一性的优劣。
分子生物学的发展弥补了上述缺点,如定位突变、PCR使蛋白质可能工程化生产。
蛋白质设计(蛋白质的结构、功能预测)涉及多学科的交叉领域,包括材料学、化学、生物学、物理及计算机学科。
其应用范围涵盖了药物、食品工业中的酶、污水处理、疫苗、化学传感器等,设计的蛋白质也不仅仅限于20种天然氨基酸,也包括非天然氨基酸、有机/无机模块。
蛋白质设计的目的:(1)为蛋白质工程提供指导性信息;(2)探索蛋白质的折叠机理。
蛋白质设计分类:(1)基于天然蛋白质结构的分子设计;(2)蛋白质从头设计。
存在问题:与天然蛋白质比较:(1)缺乏结构独特性;(2)缺乏明显的功能优越性。
第一节基于天然蛋白质结构的分子设计一、概述蛋白质结构与功能的认识对蛋白质设计至关重要,需要多学科的配合。
蛋白质设计循环如下:1.对要求的活性进行筛选。
2.对蛋白质进行表征,如测定序列、三维结构、稳定性及催化活性。
3.专一型突变产物。
4.计算机模拟。
5.蛋白质的三维结构。
在PDB中搜索,无纪录即进行X射线、NMR方法或预测并构建三维结构模型。
6.蛋白质结构与功能的关系。
蛋白质突变体设计的三个主要步骤:1.突变位点和替换氨基酸的确定。
(1)确定对蛋白质折叠敏感的区域。
(2)功能上的重要位置。
(3)其它位置对蛋白质突变体的影响。
(4)替换或加减残基对结构特征的影响。
2.能量优化和蛋白质动力学方法预测修饰后蛋白质的结构。
3.预测结构与原始蛋白质结构比较,预测新蛋白质性质。
上述设计工作完成后,再进行蛋白质合成或突变实验,分离、纯化并对新蛋白质定性。
二、蛋白质设计原理1.内核假设。
假设蛋白质独特的折叠形式主要由蛋白质内核中的残基相互作用决定。
所谓内核指蛋白质在进化过程中的保守区域,由氢键连接的二级结构单元组成。