国外医学数据库简介
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国内外常用数据库介绍-meiguoPubMedPubMed是互联网上最著名的免费Medline数据库,由美国国立医学图书馆的生物信息技术中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)提供,网址为:。
该系统于1997年开始使用,与以往的Medline光盘数据库相比,收录范围广、更新速度快、界面友好。
PubMed的数据主要有4个部分: Medline:与我们通常使用的Medline数据库收录的范围、年代、内容相同,但数据更新速度较快。
OLDMEDLINE:收录了1950-1965年间的美国医学索引(IM)中的题录。
In Process Citations:临时性的数据库,收录准备进行标引的题录和文摘信息,每天都在接受新的数据,进行文献的标引和加工,每周把加工好的数据加入到Medline中,同时从In Process Citations 库中删除。
InProcess Citations中的记录标有[PubMed- in process]的标记。
Record supplied by publisher:出版商将期刊文献信息电子版提供给PubMed后,每条记录都标有[PubMed- as supplied by publisher]的标记,这些记录每天都在不停地向In Process Citations 库中传送,加入到InProcess Citations后,原有的标记将改为[PubMed- in process]的标记。
由于被Medline收录的有些期刊所涉及学科范围较广,有些文献已超出了Medline的收录范围(如地壳运动、火山爆发等),从而不能进入Medline,但仍然存在于PubMed 中,其标记为[PubMed]。
10、MEDLINEMEDLINE是美国国立医学图书馆(The National Library of Medicine,NLM)开发的当今世界上最具权威性的文摘类医学文献数据库之一。
MEDICAL DATABASE(医学数据库)EBSCO医学数据库简介一.循证医学/即时治疗 (4)DynaMed (循证医学) (4)GIDEON (Global Infectious Disease and Epidemiology Network) (5)Cochrane Collection (6)二.替代医学 (6)AMED (6)Alt Healthwatch (7)Natural & Alternate Treatments (8)三.医院行政与管理 (9)Health Business Elite (9)四.康复医学 (9)SPORTDiscus with Full Text (9)Rehabilitation Reference Center(康复参考资源中心) (12)五.护理医学 (13)CINAHL Plus with Full Text (13)Nursing Reference Center (护理资源中心--含循证护理及继续教育等) (14)六.生物医学全文数据库 (16)MEDLINE with Full Text (16)七、多语言健康信息数据库 (17)八、The Scientific & Medical ART Imagebase (19)一.循证医学/即时治疗DynaMed (循证医学)DynaMed应用Cochrane Database of Systematic Reviews及其它实证医学相关文献,每日更新以提供医师最佳参考信息,进而协助进行诊疗上的判断与决策,共收录逾1,800项主题,其中包括一般及异常的疾病及症状;特定议题[如:SARS及禽流感等];正在发展的最新研究及范畴 [如: 新陈代谢症(metabolic syndrome)及D-二聚体检测(D-dimer testing)];使用DynaMed的医生及专业人士的建议等.鉴于临床的实际需要及易于使用,DynaMed的收录内容系有系统的编排包括:病况描述(涵盖 ICD-9 codes),造成原因及危险因子(Causes & Risk Factors),并发症及相关表征(Complications & Associated Conditions),病况历史(History),身体状态(physical),诊断(Diagnosis),预后(Prognosis),治疗(Treatment),防治及筛选(Prevention & Screening), 参考文献(包括评论(reviews)及指南(guidelines)), 病患数据(Patient Information)等.此外,亦收录逾400种医学期刊的实证医学及临床医疗信息,每篇文章均依据临床相关性而收录,进而由专业医师及同侪评估.GIDEON (Global Infectious Disease and Epidemiology Network)GIDEON是由四个象限共同组成的:诊断、流行病学、治疗和微生物学。
MICROMEDEX数据库简介MICROMEDEX数据库是由美国Thomson Healthcare (汤姆生卫生保健信息集团) 制作的事实型医药知识数据库。
其内容是由医药学专家针对全世界2000余种医药学期刊文献进行分类、收集、筛选后,按照临床应用的需求,编写为基于实证的综述文献,直接提供给专业人士使用。
MICROMEDEX的Healthcare数据库有:一、Drug InformationDosing & Therapeutic Tools提供图表,药物剂量换算程序,诊断和治疗的经典法则等工具。
DRUGDEX® System提供药物剂量,药物动力学,使用药物的注意事项,药物交互作用,药效分析比较等信息,并提供正在进行临床试验的新药信息。
涵盖的药品包括有美国食品药物管理局认证的药物,非美国地区的药物,医师处方用药和非处方用药。
DrugPoints® System以条列方式简述药物的分类,剂量,给药方式,交互作用,可能引起的副作用和后遗症。
DRUG-REAX®System包括药物和药物的交互作用,药物和食物的交互作用,药物和疾病,药物和酒精的交互作用,以及药物对检验结果的影响和是否引起病人的过敏反应。
IDENTIDEX® System提供处方用药和非处方用药的商品名和药品名,以及其药品成份,和化学物理性质等信息。
Index Nominumfrom the Swiss Pharmaceutical Society提供七千多种全球使用的药品和衍生物的信息,包括药物的分子式,治疗等级等。
IV INDEX TM with Trissel’s Tables报导145种常用药物的兼容性.资料来源有Trissel’s Tables以及Gold Standard Multimedia IV compatibility module。
KINETIDEX® 2.0 System由药物动力学的参数,提供给药量之建议,并以图表方式呈现,让医疗人员可用来报告和贮存成为病人记录档案。
五大医学文献数据库:只知道PubMed你就out了循证医学时代,写文章无论是背景、讨论、引用研究,一定要参考文献。
作为医学文献老大的Pubmed,基本无人没用过,而下面介绍的这些文献数据库,你可不能错过了。
1. 中国生物医学文献数据库(CBM)一个集检索、免费获取、个性化定题服务、全文传递服务于一体的生物医学中外文整合文献服务系统。
由中国医学科学院医学信息研究所开发研制。
收录1978 年以来1600 多种中国生物医学期刊,以及汇编、会议论文的文献题录,年增长量约40 余万篇,数据总量达350 余万篇。
学科范围涉及基础、临床、预防学等生物医学的各个领域。
CBM 注重数据的规范化处理和知识管理,全部题录均根据美国国立医学图书馆最新版《医学主题词表》、中国中医研究院中医药信息研究所《中国中医药学主题词表》等进行主题标引和分类标引。
此外,检索系统与PUBMED 具有良好兼容性:CBM 检索系统(CBMWEB) 具有检索入口多,检索方式灵活,以及主题、分类、期刊、作者等多种词表辅助查询功能,可满足简单检索和复杂检索的需求,与 PUBMED 具有良好兼容性。
可获得良好的查全率和查准率。
2. Embase主要特点:近 2000 种 Medline 以外的特有期刊,11 00 万条记录,覆盖更多疾病和药物的信息,无可匹敌的欧洲、亚洲文献汇总,使用 EMTREE 主题词表(包含了所有 MeSH 词)。
检索内容除了文章外,还支持药物和疾病检索。
embase 数据库(Excerpt Medica Database)是由荷兰 Elsevier Science 出版公司建立的 EM 的书目型数据库,收录 70 多个国家出版的 4550 种左右期刊的医药文献,每年约 50 多万条文献记录,累积约994 万条,80% 的文献带有文摘。
EMBASE 医学外文文献数据库中收录药物方面的文献量大,占 40% 左右,并设置了与药物有关的副主题词(连接词)17 个,与疾病有关的副主题词(连接词)14 个,2000 年又新增与给药途径的副主题词(连接词)47 个,设了许多与药物有关的字段,如药物主题词字段(DR),药物分类名称字段(EL),药物商品名字段(TN)等。
生命科学中最常用的5个数据库介绍生命科学是一个庞大而复杂的学科,其中包含了关于生命现象的各种研究。
对于生命科学的研究,特别是在分子水平上进行的研究,需要大量的数据支持。
这些数据包括分子序列、蛋白质结构、代谢途径等等。
为了有效地管理这些数据,生命科学中广泛应用了各种数据库。
本文将介绍生命科学中最常用的5个数据库。
1. GenBankGenBank是全球最大的分子生物学数据库,包含了全球各地实验室提交的DNA和RNA序列。
它由美国国家生物技术信息中心(NCBI)维护。
GenBank包含了数十亿条序列记录,其中包括了不同物种的基因组、蛋白质序列、DNA和RNA序列等。
与DNA和RNA序列相关的信息包括序列长度、基序、带电的特殊域、结构域、转录因子结合位点以及其他数据。
GenBank还包含了元数据,如物种和菌株的信息、文献引用以及序列的提交日期。
2. PubMedPubMed是美国国家医学图书馆(NLM)维护的一个生命科学文献数据库,包括了生命科学、医学和健康相关的数百万篇论文。
PubMed提供了对文献的全文搜索和存储,使科学家在查找特定话题时更加方便。
除了搜索全文的功能,PubMed还提供了很多额外的服务,如翻译摘要、相关文章推荐、绘制图表等。
3. EnsemblEnsembl是一种数据库、搜索引擎和分析平台,专门用于处理各种生命科学的数据。
Ensembl已经成为了全球最大的基因组数据库之一,包含了人类、其他哺乳动物、鸟类、篮球、双子蝎、无脊椎动物等近700个物种的基因组信息。
Ensembl提供的数据包括生物序列、调控区域、基因家族、基因结构、基因组的变异和基因表达信息等。
4. Protein Data Bank (PDB)蛋白质数据银行(PDB)是一个三维蛋白结构数据库,由改华大学、美国罗格斯大学和欧洲生物信息研究所等机构共同维护。
PDB存储了全球各地实验室提交的蛋白质晶体结构和生化分析,包括了大多数已知的蛋白质家族和酶。
医学研究证据常用的检索数据库
- 中国生物医学文献数据库(CBM):收录了国内医学期刊种类较多,与 Pubmed 有良好的兼容性。
- Medline:是美国国立医学图书馆生产的国际性综合生物医学信息书目数据库,是当前国际上最权威的生物医学文献数据库。
- ScienceDirect 数据库:收录了爱思唯尔出版集团的同行评议期刊、系列丛书、手册和参考书等。
- Cochrane library:是循证医学数据库,提供有关最新医疗的客观信息。
- SpringerLink:是德国施普林格出版集团提供的电子图书数据库,包括各种类型的Springer 图书产品。
- OALib:可以免费获取各类文献,包括经过同行评议过的期刊文章、参考文献、技术报告、学位论文等全文信息。
- Free Medical Journals:是因特网上免费提供生物医学全文最多的期刊集合网站,收录了1460余种生物医学全文期刊。
- 科学公共科学图书馆(PLOS):旨在推广世界各地的科学和医学领域的最新研究成果,使其成为一种公众资源。
PLOS 出版了8种生命科学与医学领域的期刊,可以免费获取全文。
不同的数据库有不同的特点和优势,建议根据研究需求和学科领域选择合适的数据库进行检索。
国外医学数据库简介
一、EMBASE数据库
EMBASE是将EMBASE—荷兰医学文摘(1974年推出)中1100多万条生物医学记录与700多万条独特的MDELINE记录(1966年推出)相结合,经过去重,形成全球最大最具权威性的生物医学与药理学文献数据库。
EMBASE囊括了70多个国家/地区出版的7,000多种刊物,覆盖各种疾病和药物信息,尤其是它所涵盖的大量欧洲和亚洲医学刊物。
是医学研究和科技查新不可或缺的工具。
最新版本的EMBASE提供如下功能:
1、同步检索超过1800万条EMBASE+MEDLINE记录,且结果无重复;
2、每天新增2000多条记录,每年新增记录达到600000万条;
3、EMBASE记录在收到原始刊物后10个工作日内即会出现;
4、涵盖70多个国家/地区出版的7,000多种刊物;
5、80%的记录都包含摘要;
6、EMTREE包含超过50,000条药物与医学术语、10,000条代码和大约200,000条同义词(完全集成了MeSH术语)。
二、MD Consult数据库
MD Consult是全球最大的STM (科技、医学信息) 出版公司Elsevier的核心全文医学资讯平台,MD Consult把当今世界上领先的医学信息资源整合到一个网上服务系统之中,拥有50多套权威的医学参考书籍,80多种各专业临床医学权威期刊,22,000多种药物资讯,1,000种临床实践指南,10,000种病患须知及手册,同时以上各项内容均在不断地增加。
十大版块介绍如下:
1、First Consult—在线专家诊疗系统,为医生及医学生提供患者评估、诊断、治疗、管理和预防等方面持续更新的循证医学指导。
包括三大版块:医学主题、鉴别诊断、操作程序。
检索方式:字母顺序、关键词搜索
2、Books—参考书,提供50部各主要医学领域最新版本的经典参考书在线阅读,例如:西氏内科学、克氏外科学、坎贝尔手术骨科学、Campbell-Walsh泌尿学、尼尔森儿科学、Braunwald’s 心脏病、米勒麻醉学、Williams内分泌学、Kelley’s风湿病学、Hoffman血液学、Abeloff’s临床肿瘤学、Sleisenger & Fordtran’s胃肠和肝脏病等。
另有450多部参考书可选。
检索方式:作者姓名顺序、专科分类、关键词搜索
3、Journals—期刊,提供53种各医学领域期刊,可浏览下载现刊及过刊全文,检索范围涵盖Medline。
例如:美国心脏杂志,美国心脏病杂志,美国胃肠病杂志,Chest,重症护理杂志,临床内分泌杂志,Neurology,柳叶刀传染病分刊、肿瘤分刊、神经病学分刊等。
检索方式:刊名字母顺序、关键词搜索
4、The Clinics—北美临床系列医学期刊,共35种,可浏览下载现刊及过刊全文。
检索方式:刊名字母顺序、关键词搜索
5、Patient Education—患者教育,超过12,500篇患者教育手册,并可按需修订。
检索方式:疾病与治疗字母顺序、药物字母顺序、专科分类、关键词搜索
6、Drugs—药物信息,大量的、综合的药物信息及FDA提供的信息,包括药物核准通
告和药物安全通告。
检索方式:药物名称、适应症、禁忌症、不良反应、关键词搜索
7、Guidelines—诊疗指南,超过1,000份经过同行评议的诊疗指南。
检索方式:字母顺序、专科分类、发布机构、关键词搜索
8、Images—参考图片,超过50,000幅出自参考书的高质量图片和图表,提供对比功能。
检索方式:关键词搜索
9、News—医学新闻,摘自所有重要期刊、政府机构和医学会议的简明临床进展概要,可定制本学科医学新闻。
检索方式:时间顺序、专科分类、原始报道、关键词搜索
10、CME—继续医学教育,提供15个专业的200个CME在线教育单元,由两家机构提供教育学分,为Cleveland Clinic和Albert Einstein College of Medicine。
三、PubMed数据库
PubMed系统是由NLM的国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)开发的用于检索MEDLINE、PreMEDLINE数据库的网上检索系统。
从1997年6月起,PubMed在网上免费向用户开放。
它具有收录范围广泛、更新速度快、检索系统完备、链接广泛的特点。
PubMed系统包含三个数据库:MEDLINE、PreMEDLINE和Record supplied by Publisher。
基本检索功能
1、自动词语匹配功能(Automatic Term Mapping)可以实现词语的自动转换和匹配,主要通过4个表来进行:MeSH转换表(MeSH Translation Table)、刊名转换表(Journal Translation Table)、短语表(Phrase List)、著者索引表(Author Index)。
在检索提问栏内输入一个或若干个检索词,系统将依次到以上4个表中进行词语匹配,直到找到相匹配的词为止。
2、截词功能(Truncation) 可以使用"*"作为通配符进行截词检索。
系统只检索前150个词形变化。
3、词组检索功能(Phrase Searching)也叫强制检索功能。
许多短语可以通过自动词语匹配功能检索,但是当所键入的短语没有所对应的匹配词组时,如single cell,系统将会分别检索single和cell,然后用AND将其组配起来。
可以使用""强制系统把single cell当成一个不可分割的词组进行检索。
4、布尔检索PubMed支持布尔逻辑检索,运算符号必须大写,分别是:逻辑与AND,逻辑或OR,逻辑非NOT。
运算顺序是从左到右执行,可以通过()改变运算次序。
5、限定检索有字段限定检索;日期和日期范围的限定检索;其它限定检索。
辅助检索功能
1、Limits 限定的主要功能是进行限定检索。
2、Preview/Index 可实现在显示检索结果前显示检索结果的数量;加词检索;特定字段加词检索;从索引表中选择检索词。
3、History 主要用于查看检索策略和检索结果的数量。
结果处理
1、检索结果显示在检索结果界面,可以对检索结果的显示格式和条目数设定。
2、检索结果的保存打开Send to键后面的下拉菜单选择file然后点击Send to键存储所有命中记录,一次最多可存储10 000条记录。
3、检索结果的打印使用浏览器的打印功能,只能打印网页上显示的记录。
4、使用剪贴板(Clipboard)集中保存和打印检索结果。