染色体核型分析系统参数要求

染色体核型分析系统参数要求一、整体要求进口品牌，主要用于我院优生遗传实验室临床染色体核型的观察和分析。

二、参数要求1、正置相差显微镜1套，三目镜，4倍、10倍、40倍和100倍物镜各1个。

具备采图相机接口。

2、采图相机1套，连接显微镜和核型分析软件，像素不小于2000万像素。

3、计算机2套，双核CPU，2G内存，500G硬盘，DVD光驱，不小于22寸液晶显示屏，可组建局域网，并未来增配新的计算机。

3、核型分析软件2套。

3.1可进行染色体核型分析，可对重合、黏连和交叉的染色体进行自动或手动的分割和重新排列，可显示染色体数目，患者信息录入，报告的发出等功能。

3.2具备染色体图像放大缩小、对比度、亮度处理功能，可随意切换、同时显示和编辑不同模块的图像，可对不同软件模块下的图像进行拼接、比较并在同一张报告上输出。

可读取处理外来标准格式图像文件，支持多种标准图像格式导出；3.3系统支持医院LIS和HIS系统的连接，可通过internet传输报告及图像，供货商负责连接费用。

具备数据存储和文件导航功能，可建立医院的病历数据库。

报告系统开放式设定，具备标准模板，并可以根据用户要求设计报告项目和检验项目。

3.4具备系统权限分配与管理功能。

3.5具备清除染色体图像背景所有杂质和污点功能。

可在排列好的核型图上直接修饰各染色单体。

能对染色体进行一键化倒转、任意角度旋转、拉直、放大、标注和彩色涂抹识别操作。

3.6具备单个或全部染色体模式图比对识别功能和二次核型自动识别功能。

3.7具备带纹增强及完善的分析后染色体单体颜色参数再调整功能。

3.8具备在原始图、核型分析图（包括单个异常染色体分析图）进行文字或符号（箭头或线条）注释的功能，文字符号颜色多种可选。

3.9可单独详细分析单个异常的染色体。

具备染色体单体自动排序、配对功能，排队正确率不低于70%。

3.10具备自动或人工干预识别着丝粒位置功能，可手动调节中线和着丝粒的位置。

实验一 染色体核型分析一、实验目的1．了解人类正常染色体核型的组成； 2．掌握人类染色体核型分析的方法；二、实验原理：各种生物染色体的形态，结构和数目都是相对稳定的。

染色体核型：指一个物种所特有的染色体数目和每一条染色体的形态特征。

如人类体细胞中共有23对染色体，22对常染色体，一对性染色体。

细胞分裂中期是染色体的形态结构最典型的时期，通过显微镜摄影，将选取伸展良好，形态清晰，有代表性的细胞分裂相进行高倍拍摄放大，得到照片，该核型可以代表该个体的一切细胞的染色体组成。

从染色体玻片标本和染色体照片的对比分析，进行染色体分组，并对组内各染色体的长度，着丝点位置，臂比和随体有无等形态特征进行观测和描述，从而阐明生物的染色体组成，确定其染色体组型，这种过程称为染色体组型分析。

染色体组型分析也称核型分析。

染色体长度测定：可在显微镜下用测微尺直接测量或在放大的照片上测量得到。

通常以微米表示。

绝对长度：不稳定，只有相对意义。

相对长度：是每条染色体的绝对长度与正常细胞全部染色体总长度的比值，通常用百分比表示。

是稳定的比较可靠的数据。

着丝粒的位置：常用Evans 提出的方法，即以染色体的长臂（L ）和短臂（S ）的比值来表示。

在常规染色的情况下，不可能全部识别每个染色体，因此根据染色体的长度和着丝点的位置，可将正常人的染色体分为7组，即A 、B 、C 、D 、E 、F 和G 组，其分布如下：这7组染色体的主要特征如下：A 组：第1，2，3染色体．在染色体中是最大的三对染色体，按长短和着丝点的位置彼此可以分开．B 组：第4、5染色体，具有亚中部着丝点的两对大型染色体，第4比第5稍长些，彼此较难于区分。

C 组：第6、7、8、9、10、11和12染色体。

具亚中部首丝点的中型染色体。

第6、7、8和11染色体的着丝点比第9、10、12染色体的着丝点更近于中央。

组内各染色体的大小也略有不同。

该组内的各染色体较难于配对和确定。

染色体核型自动分析系统操作规程染色体核型自动分析系统（1）打开显微镜及调整显微镜光路明暗电源。

OLYMPUS TL4下按钮，顺时针扭动，光路光线变亮；逆时针扭动，光路光线变暗。

扭动载片台上的大按钮，使载玻片在载片台上前后移动；扭动载片台上的小按钮，使载玻片在载片台上左右移动（2）染色体核型制片完成后，放置在物镜下。

先用低倍物镜观测选准视野；然后用高倍物镜，调焦选准视野中有待分析的区域（3）开显示器及电脑主机，双击桌面“植物染色体图像分析”软件。

无需输入密码，直接点击“确定”进入软件界面（4）点击“报告编辑”图标，建立样品档案，手动输入样品的基本信息，例如物种名称、核型类型、实验者、如期和时间等信息（5）手动填写完成，点击“保存报告”图标，报告名称显示为：实验编号+物种中文名+物种拉丁名称（6）点击“图像处理”图标，出现图像处理界面。

界面左上方出现“片1”，则不用点击“增加涂片”图标。

若界面左上方未出现“片1”，点击“增加涂片”图标增加涂片（7）点击“显示/隐藏视频”图标，激活相机，调整焦距，在目镜观测下图像较为清晰时，点击“视频定格”图标，开始图像采集。

界面右下方出现采集的图像（8）对已拍摄好的现有图像进行染色体核型分析。

点击右上方“Ⅰ图像”，在下拉菜单中选择“A导入”，找到图像路径，选中图像，点击“打开”，在界面右下方出现有待分析的图像（9）点击“选中任意区域”图标，在图像上画出有待分析的区域（10）点击“剪裁”图标，图像仅显示剪裁区域（11）如果图像显示不佳，点击“P图像处理”中的“R曲线调节”。

调节的原则是“亮度、对比度和清晰度达到最佳状态（12）调节完毕，在“曲线”对话框中先点击“保存”再点击“确定”，最后点击“Ⅰ图像”中的“C保存”，即可保存图像（13）点击“核型分析”，在“C染色体识别”中选中“A轮廓识别”，出现背景阀值对话框。

背景阈值调节的原则:将所有的染色体圈起来，背景干扰最小（非染色体被圈的区域最小）（14）删除染色体（其实不是染色体），删除杂质背景。

干货染色体核型分析技术染色体核型分析技术在遗传学研究特别是在人类染色体疾病的临床诊断方面有着十分广泛的应用，也是用于探明生物遗传与变异，染色体组演化和种属将亲缘关系的基本方法。

掌握染色体核型分析技术在促进正确解读生物的遗传多样性方面发挥着十分重要的作用。

今天，小编就带领大家深度解读一下染色体核型分析技术及如何来制作一张漂亮的染色体核型分析图。

背景知识核型（Karyotype）：亦称染色体组型，是指生物体细胞有丝分裂中期染色体组的表型，是染色体数目、大小、形态特征的总和。

体细胞具有两组同样的染色体，成为常染色体(2n)表示，与性别直接相关的染色体，称为性染色体。

每个配置带有一组染色体，叫做单倍体，用n表示，两性配子结合后，形成二倍体细胞。

核型分析：是按照染色体的数目、大小和着丝粒位置、臂比、次缢痕、随体等形态特征，对生物核内的染色体进行配对、分组、归类、编号等分析的过程。

核型图：为一个物种的核型模式，将染色体组全部染色体逐条按其长短、形态、类型特征规律性排列。

染色体形态分类：着丝点两侧部分称为染色体臂。

如两臂相等，则称为等臂染色体。

如两臂不相等，则分别称为长臂和短臂。

根据染色体着丝粒位置不同，可将染色体分为中部着丝粒（m）、亚中部着丝粒（sm）、亚端部着丝粒（st）和端部着丝粒（t）等不同形态，部分染色体具有随体和次缢痕。

辨别各对染色体时的常用形态指标是：测量染色体的长度、确定着丝点的位置、副缢痕及随体的有无。

染色体的长度较不固定，受遗传、环境因素的影响较大，但一般认为在一个细胞内的各条染色体的伸长和缩短是同比的。

因此，目前一般用相对长度来表示每条染色体的长度。

细胞分裂中期为染色体形态结构最典型的时期，通过选取伸展良好，形态清晰，有代表性细胞分裂相进行高倍拍摄，用于核型分析图片。

实验原理染色体标本制备为核心分析的关键，通常情况下，利用外周血淋巴细胞进行核型分析。

正常情况下，人体外周血淋巴细胞不再分裂，但植物血凝素（PHA）可刺激血中的淋巴细胞转化成淋巴母细胞，使其恢复增殖能力。

实验九染色体核型分析【实验目的】1. 观察测量照片上每条染色体，进行配对排列和剪贴成核型分析图；2. 掌握染色体组型分析的各种数据指标，学习和掌握核型分析的方法；3. 正确理解生物的遗传多样性——染色体多样性。

【实验原理】核型(Karyotype)亦称染色体组型，是指体细胞有丝分裂中期细胞核(或染色体组)的表型，是染色体数目、大小、形态特征的总和。

每一个体细胞含有两组同样的染色体，用2n表示。

其中与性别直接有关的染色体，即性染色体，可以不成对。

每一个配子带有一组染色体，叫做单倍体，用n表示。

两性配子结合后，具有两组染色体，成为二倍体的体细胞。

在对染色体进行测量计算的基础上，进行分组、排队、配对，并进行形态分析的过程叫核型分析(如图1所示)。

将一个染色体组的全部染色体逐条按其长短、形态、类型等特征排列起来的图称为核型图，它代表一个物种的核型模式。

核型分析通常包括两方面的内容：⑴ 确定一物种的染色体数目；⑵ 辨析每条染色体的特征。

→图1 人类中期细胞染色体核型分析(2n=46)染色体在复制以后，纵向并列的两个染色单体，通过着丝粒联结在一起。

着丝粒在染色体上的位置是固定的。

由于着丝粒位置的不同，染色体可分成相等或不相等的两臂，造成中部着丝粒(m)，亚中部着丝粒(sm)、亚端部着丝粒(st)和端部着丝粒(t)等形态不同的染色体(如图2所示)。

此外，有的染色体还含有随体或次级缢痕，所有这些染色体的特异性构成一个物种的核型。

细胞分裂中期是染色体的形态结构最典型的时期，通过显微镜摄影，将选取伸展良好，形态清晰，有代表性的细胞分裂相进行高倍拍摄放大，得到用于核型分析的照片。

图2 中期染色体形态及结构1. 分析标准：⑴ 臂比值r(长臂长/短臂长)；⑵ 着丝粒指数i[(短臂长/染色体长)×100%](表1)；⑶ 相对长度：某条染色体长度占一套单倍体染色体长度总和的百分比：相对长度(%)＝(某染色体长度/单套染色体组总长)×100％(植物)；或：相对长度(%)＝[某染色体长度/(单套常染色体+X染色体)的总长]×100％(动物)；⑷ 臂比指数(N.F.值)：把具中部和近中部着丝粒的“V”形染色体计为2个臂，而把具近端和端部着丝粒的“J”或“I”染色体计为1个臂，以此统计核型中总臂数；⑸ 染色体长度比：根据染色体长度比[(最长染色体长/最短染色体长)×100%]。

染色体分析系统使用说明书上海欣谕仪器有限公司一、系统文件安装1.系统文件安装，将光盘插入，执行安装程序Setup.exe;2 配置文件和加密锁驱动文件安装执行光盘上的INSTALL.EXE 文件，系统自动安装其它配制文件，包括加密锁的设备驱动文件。

执行该文件后，在D：盘产生4个子目录，它们分别是：D:\CHR_IMG;D:\CHR_DAT;D:\CHR_KAR, D:\CHR_BMP。

D:\CHR_IMG 存放获取的原始核型图D:\CHR_DAT;存放处理的中间结果D:\CHR_KAR,存放分析后的核型图D:\CHR_BMP;存放以BMP方式保存的核型图3.加密锁当程序安装完成后，将加密锁插入计算机的USB槽中，系统自动检测发现Senselock_v1.5 的提示信息，按提示，一直按Next>，直至完成。

当程序安装完成后，将加密锁插入计算机的USB槽中。

执行Kar_Lock_Test.exe测试程序，显示：加密锁检验成功！OK！4 图像采集卡安装与测试2.4.1图像采集卡硬件安装关闭计算机电源，打开机箱将图像采集卡插入计算机的任意一个PIC 槽中，保证到位，并用螺丝固定紧。

盖上机箱将数据线一弊端与图像采集卡相连，另一端与显微镜上的摄像机相连。

2.4.1图像采集卡软件安装打开计算机电源开关，启动计算机，当Windows加载完成后，系统将会出现下面的信息提示：出现上图后，点击“下一步(N)>”,立即弹出下一窗口，将查找范围定于：光盘的\V3a_Drv目录下，点击“Saa7146.inf”文件，按打开，即可。

对后面所出现的提示，一律按“下一步(N)>”，直到安装完成。

重新取动计算机，至此，采集卡的驱动安装完成。

安装完成后执行：GRap_test.exe，如果能显示图像，即正确。

二、XY-RS-A B染色体核型自动分系统使用说明（硬件安装部分）本系统针对细胞染色体的G带核型分析，研制了染色体核型自动分析系统。

核酸序列检测系统技术参数1*≤50um内径新型24道全自动毛细管电泳系统。

2*采用505nm固态长寿激光光源激发装置，无需散热。

3*检测系统采用低温CCD装置，无机械位移，同时采集所有通道信号4*光栅同步分光装置，更换染料不必更换硬件设备5*可同时进行≥6色荧光实时检测,以满足高通量片段分析应用；6*24小时测序量达984个样品以上,碱基数>492,000，DNA序列分析精度98.5％或以上，测序长度最长可达1000bp以上.7测序试剂可常规做≥8倍稀释，8*电泳操作温度：18℃-70℃，适合进行变性胶电泳的SSCP突变分析。

9数据分析所用软件: 基本的测序及片段分析软件。

10仪器操作和数据分析所用计算机工作站，保证结果质量。

11*一块板可同时进行测序和片段分析。

12可96孔和384孔板，96孔快速反应板，八连标准或者快速管兼容，一种管子一种胶可同时进行测序和片段分析，样品可直接从96或者384微孔反应板自动吸取并且上样。

13*可进行大规模STR研究，24小时可分析6万个以上STR基因型。

14*可进行大规模SNP的系列研究，24小时可进行9万个SNP分析。

15*可利用片段分析功能检测大于100bp以上的插入缺失。

可做微卫星不稳定检测（MSI）。

16有适用于全基因组连锁分析和疾病基因定位研究的配套试剂盒。

17*有适用于亲子鉴定和个体识别的法医配套软件和试剂盒。

18测序软件要求：每一碱基判读均有国际公认的质量评分系统（Phred Q20），精确度达98.5%；真实反映峰高比例，能精确自动辨认杂合子位置，不漏检采用Oracle数据库，满足高通量分析，24小时测序分析达84,000碱基数。

19序列比对、拼接软件：适合于不同生物种类基因组快速检测变异位置、全自动、高通量，无序列数量限制。

自动批处理，可后期编辑，直接兼容Genebank文件格式。

20片段分析软件要求：高速、高通量，每小时可处理5万以上的基因型、可自动剔除干扰峰，不需要人工修正，输出表格简单易懂、采用Oracle数据库，可以大规模搜索和管理数据、有现成六色荧光片段分析参数设置，可方便进行亲子鉴定，连锁分析，SNP分析。