放线菌分类2
- 格式:pptx
- 大小:94.55 KB
- 文档页数:21
放线菌是一类呈菌丝状生长,主要以孢子繁殖,革兰染色为阳性的单细胞原核微生物,是细菌中的一种特殊类型。
放线菌与人类的生产和生活关系极为密切,目前广泛应用的抗生素约70%是各种放线菌所产生。
一些种类的放线菌还能产生各种酶制剂(蛋白酶、淀粉酶、和纤维素酶等)、维生素(B12)和有机酸等。
弗兰克菌属(Frankia)为非豆科木本植物根瘤中有固氮能力的内共生菌。
此外,放线菌还可用于甾体转化、烃类发酵、石油脱蜡和污水处理等方面。
少数放线菌也会对人类构成危害,引起人和动植物病害。
因此,放线菌与人类关系密切,在医药工业上有重要意义。
放线菌在自然界分布广泛,主要以孢子或菌丝状态存在于土壤、空气和水中,尤其是含水量低、有机物丰富、呈中性或微碱性的土壤中数量最多。
土壤特有的泥腥味,主要是放线菌的代谢产物所致。
放线菌在微生物中的分类地位放线菌在形态上分化为菌丝和孢子,在培养特征上与真菌相似。
然而,用近代分子生物学手段研究的结果表明,放线菌是属于一类具有分支状菌丝体的细菌,革兰染色为阳性。
主要依据为:①同属原核微生物:细胞核无核膜、核仁和真正的染色体;细胞质中缺乏线粒体、内质网等细胞器;核糖体为70S;②细胞结构和化学组成相似:细胞具细胞壁,主要成分为肽聚糖,并含有DPA;放线菌菌丝直径与细菌直径基本相同;③最适生长PH范围与细菌基本相同,一般呈微碱性;④都对溶菌酶和抗生素敏感,对抗真菌药物不敏感;⑤繁殖方式为无性繁殖,遗传特性与细菌相似。
放线菌的形态与结构放线菌的种类很多,多数放线菌具有发育良好的分支状菌丝体,少数为杆状或原始丝状的简单形态。
这里以与人类关系最密切、分布最广、种类最多、形态最典型的链霉菌属为例。
链霉菌主要由菌丝(mycelium)和孢子(spore)两部分结构组成。
(一)菌丝</strong></p>链霉菌的细胞呈丝状分支,不同发育阶段的菌丝分化程度不同,根据菌丝的着生部位、形态和功能可分为基内菌丝、气生菌丝、和孢子丝。
目录摘要 (2)1 放线菌的分类与鉴定的研究意义与方法 (3)1.1放线菌 (3)2放线菌的分类方法的发展历程与意义 (4)2.1形态学与培养特征上的分类与鉴定 (4)2.2数值分类方法[6] (4)2.3化学分类 (4)3.放线菌的分子生物学分类的发展情况 (5)3.1.DNA碱基组成分析: (6)3.2.DNA-DNA同源性分析: (6)3.3.DNA-rRNA同源性分析: (6)3.4.核酸的一级结构的分析: (7)3.5.RNA的二级结构分析: (7)3.6.PCR-RFLP分析: (7)3.7.rep-PCR指纹分析技术: (7)3.8.RAPD分析: (7)3.9.AFLP指纹分析技术: (8)4放线菌的分类在未来发展的方向及意义 (8)参考文献 (8)致谢: (10)放线菌的分类方法摘要:放线菌是原核生物的一个类群,相关分类学经历了早期的形态学上的经典分类(主要从其形态结构来进行分类),数值分类(运用计算科学与技术对放线菌进行描述分类),化学分类(运用化学分析的方法对放线菌的细胞壁和组成成分进行分析归类),直至今天的分子分类。
通过对放线菌的分类进而建成系统进化树,更加方便了放线菌的研究与应用。
由于科学进步的发展放线菌在分子分类中又有了不同的研究方法。
从由(G+C)mol%的差别而分析的物种亲缘关系的远近形成的DNA碱基组成分析发展到在DNA 杂交中的DNA序列互补程度来推断它们的的DNA-DNA同源性分析,从核酸的一级结构上的分析到RNA 的二级结构上的分析等方法。
由于PCR技术的发展限制性酶切片段长度多态性分析和对DNA片段上的基因分析技术使放线菌的分类更加简易与精确,从而发展出了rep-PCR指纹分析技术,随机扩增的多行性DNA 分析,扩增性片段长度多态性分析等方法。
每种方法都有着不同的优缺点,科技也在不停地进步所以放线菌的分类方法的研究还在继续的发展中。
关键词:放线菌;分类方法;原核生物;系统进化树Classification of actinomycetes on the molecular levelSHANG yulong Supervisor: SONG zhaoqi(Department of Life Science, Shangqiu Normal University, Shangqiu 476000, China)Abstract: Actinomycetes is prokaryotes a groups, taxonomic experience to early morphology for the classic classification mainly from their morphological structure to classification, numerical classification by using the computational science and technology were to describe the classification, chemical classification using chemical analysis method to cell wall and components were analyzed classified for example gram negative and positive and so on, until today's molecular taxonomy. Through to the classification of the system were built and evolutionary tree, more convenient to the research and application of ray. Due to the development of the scientific advances in molecular classification and were a different research methods. From the (G + C) mol % difference and analysis of the species of genetic relationship of the formation of the near and far DNA base composition analysis to DNA in the DNA from the development of the hybrid DNA sequence complementary degree to infer the their homology of DNA-DNA homology analysis, from the structure of nucleic acid on the primary structure of the analysis, the secondary structure of RNA analysis, etc. Due to the development of the PCR technology limited enzymatic cut fragment length polymorphism analysis of DNA fragments and the gene analysis technology makes the classification more simple and were accurate and developed the rep-PCR fingerprint analysis technology, and the random amplified line sexual DNA analysis, amplification sex fragment length polymorphism analysis, etc. Each method with different advantages and disadvantages, and science and technology are constantly in progress so actinomyces classification method research is continuing development.Key words:Actinomycetes; sorting technique; Prokaryotes; Phylogenetic tree随着科技的发展放线菌分类学已从形态学与生化层面发展到了分子水平,在人们的研究中起着重要的作用。
一、酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)1 酸微菌目(Acidimicrobiales)酸微菌亚目(Acidimicrobineae)酸微菌科(Acidimicrobiaceae)酸微菌属(Acidimicrobium)典型种:氧化亚铁微酸菌(Acdimicrobium ferrooxidans)二、红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae)1 红色杆菌目(Rubrobacterales)红色杆菌亚目(Rubrobacterineae)红色杆菌科(Rubrobacteraceae)红色杆菌属(Rubrobacter)2 土壤红杆菌目(Solirubrobacterales)土壤红杆菌科(Solirubrobacteraceae)扩展杆菌科(Patulibacteraceae)康奈斯氏杆菌科(Conexibacteraceae)康奈斯氏杆菌属(Conexibacter)3 嗜热油菌目(Thermoleophilales)嗜热油菌科(Thermoleophilacceae)嗜热油菌属(Thermoleophilum)三、红蝽杆菌亚纲(Coriobacteride)1 红蝽杆菌目(Coriobacteriales)红蝽杆菌科(Coriobacteriaceae)红蝽杆菌属(Coriobacterium)阿托波菌属(Atopobium)扣林氏菌属(Collinsella)神秘杆菌属(Cryptobacterium)反硝化杆菌属(Denitrobacterium)伊格尔兹氏菌属(Eggerthella)欧陆森氏菌属(Olsenella)斯莱克氏菌属(Slackia)非消化糖杆菌属(Asccharobacter)肠杆菌属(Enterorhabdus)戈登氏杆菌属(Gordonibacter)类伊格尔兹氏菌属(Paraeggerthella)四、腈基降解菌亚纲(Nitriliruptoride)1 腈基降解菌目(Nitriliruptorales)腈基降解菌科(Nitriliruptoraceae)腈基降解菌属(Nitriliruptor)2尤泽比氏菌目(Euzebyales)尤泽比氏菌科(Euzebyaceae)尤泽比氏菌属(Euzebya)五、放线菌亚纲(Actinobacteridae)1 放线菌目(Actinobacterales)放线菌亚目(Actinomycineae)放线菌科(Actinomycetaceae)放线菌属(Actinomyces)放线杆菌属(Actinobaculum)隐秘杆菌属(Arcanobacterium)动弯杆菌属(Mobiluncus)弯曲短杆菌属(Varibaculum)链霉菌亚目(Streptomycineae)链霉菌科(Sterptomycetaceae)链霉菌属(Streptomyces)北里孢菌属(Kitasatospora)链嗜酸菌属(Streptacidiphilus)链孢囊菌亚目(Streptosporangineae)链孢囊菌科(Streptosporangiaceae)链孢囊菌属(Streptosporangium)小双孢菌属(Microbispora)小四孢菌属(Microtetraspora)野野村氏菌属(Nonomuraea)游动单孢菌属(Planomonospora)游动双孢菌属(Planobispora)草孢菌属(Herbidospora)游动四孢菌属(Planotetraspora)高温多孢菌属(Thermopolyspora)果实包囊菌属(Acrocarpospora)球状包囊菌属(Sphaerisporangium)拟诺卡氏菌科(Nocardiopsaceae)拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)高温双岐菌属(Thermobifida)链单孢菌属(Streptomonospora)盐放线孢菌属(Haloactinospora)海洋放线孢菌属(Marinactinospora)高温单孢菌科(Thermomonosporaceae)高温单孢菌属(Thermomonospora)马杜拉放线菌属(Actinomadura)螺孢菌属(Spirillospora)珊瑚放线菌属(Actinocorallia)高温双孢菌属(Thermobispora)小单孢菌亚目(Micromonosporineae)小单孢菌科(Micromonosporaceae)小单孢菌属(Micromonospora)游动放线菌属(Actinoplanes)指孢囊菌属(Dactylosporangium)发仙菌属(Pilimelia)短链孢菌属(Catellatospora)短链游动菌属(Catenuloplanes)库奇游动菌属(Couchiolanes)螺旋游动菌属(Spirilliplanes)疣孢菌属(Verrucosispora)杆状孢囊菌属(Virgisporangium)长孢菌属(Longispora)阿森诺氏菌属(Asanoa)盐孢菌属(Salinispora)放线短链孢菌属(Actinocatenispora)多形态孢菌属(Polymorphospora)克拉西利尼科夫菌属(Krasilnikovia)卢得曼氏菌属(Luedemannella)假孢囊菌属(Pseudosporangium)游动孢囊菌属(Planosporangium)短链球孢囊菌(Catelliglobosispora)滨田氏菌属(Hamadaea)植物放线孢囊菌(Plantactinospora)皱纹单孢菌属(Rugosimonospora)植物栖居菌属(Phytohabitans)放线橘橙孢菌属(Actinaurispora)异短链球孢菌属(Allocatelliglobosispora)糖霉菌亚目(Glycomycineae)糖霉菌科(Glycomycetaceae)糖霉菌属(Glycomyces)斯塔堪布瑞德氏菌属(Stackebrandtia)盐糖霉菌属(Haloglycomyces)细链孢菌亚目(Catenulisporineae)细链孢菌科(Catenulisporaceae)细链孢菌属(Catenulispora)丛生放线菌科(Actinospicaceae)丛生放线菌属(Actinospica)放线多孢菌亚目(Actinopolysporineae)放线多孢菌科(Actinopolysporaceae)放线多孢菌属(Actinopolyspora)动球菌亚目(KIneococcineae)动球菌科(KIneococcaceae)动球菌属(KIneococcus)动孢菌属(Kineosporia)四折叠球菌属(Quadrisphaera)假诺卡氏亚目(Pseudonocardineae)假诺卡氏菌科(Pseudonocardiaceae)假诺卡氏菌属(Pseudonocardia)异壁放线菌菌属(Actinoalloteichus)拟无枝酸菌属(Amycolatopsis)克洛斯氏菌属(Crossiella)拟孢囊菌属(Kibdelosporangium)库兹涅尔氏菌属(Kutzneria)古德飞罗氏菌属(Goodfellowia)普劳斯氏菌属(Prauserella)糖单孢菌属(Saccharomonospora)糖多孢菌属(Saccharopolyspora)异壁链霉菌属(Streptoalloteichus)放线孢菌属(Actinomycetospora)异库兹涅尔氏菌属(Allokutzneria)南海海洋所菌属(Sciscionella)束丝放线菌科(Actinosynnemataceae)束丝放线菌属(Actinosynnema)列舍瓦列氏菌属(Lechevalier)伦兹氏菌属(Lentzea)糖丝菌属(Saccharothrix)动孢放线菌属(Actinokineospora)梅泽宾夫氏菌属(Umezawaea)弗兰克氏菌亚目(Frankineae)弗兰克氏菌科(Frankiaceae)弗兰克氏菌属(Frankia)热酸菌属(Acidothermus)隐孢囊菌科(Cryptosporangiaceae)隐孢囊菌属(Cryptosporangium)矿生菌属(Fodinicola)地嗜皮菌科(Geodermatophilaceae)地嗜皮菌(Geodermatophilus)芽生球菌属(Blastococcus)贫养杆菌属(Modestobacter)中村氏菌科(Nakamurellaceae)潮湿球菌属(Humicoccus)鱼孢菌科(Sporichthyaceae)鱼孢菌属(Sporichthya)棒杆菌亚目(Corynebacterineae)棒杆菌科(Corynebacteriaceae)棒杆菌属(Corynebacterium)苏黎世菌属(Turicella)迪茨氏菌科(Dietziaceae)分枝杆菌科(Mycobacteriaceae)分枝杆菌属(Mycobacterium)诺卡氏菌科(Nocardiaceae)诺卡氏菌属(Nocardia)戈登氏菌属(Gordonia)红球菌属(Rhodococcus)斯科曼氏菌属(Skermania)威廉姆斯氏菌属(Williamsia)米利斯氏菌属(Millisia)慢反应脂肪酸菌科(Segniliparaceae)慢反应脂肪酸菌属(Segniliparus)冢村氏菌科(Tsukamurellaceae)冢村氏菌属(Tsukamurella)微球菌亚目(Micrococcineae)微球菌科(Micrococcaceae)微球菌属(Micrococcus)螨共生菌属(Acaricomes)节杆菌属(Arthrobacter)柠檬球菌属Citricoccus)考克氏菌属(Kocuria)涅斯捷连科氏(Nesterenkonia)肾杆菌属(Renibacterium)罗氏菌属(Rothia)志恒刘菌属(zhihengliuella)中国单孢菌属(Sinomonas)口腔球菌属(Stomatococcus)布登堡菌属(Beutenbergia)乔治菌属(Georgenia)萨勒河菌属(Salana)博戈里亚湖菌科(Bogoriellaceae)博戈里亚湖菌属(Bogoriella)短杆菌科(Brevibacteriaceae)短杆菌属(Brevibacterium)纤维单孢菌科(Cellulomonadaceae)纤维单孢菌属(Cellulomonas)光柱菌属(Actinotalea)去甲基醌菌属(Demequina)厄氏菌属(Oerskovia)吸收不良菌属(Tropheryma)皮杆菌科(Dermabacteraceae)皮杆菌属(Dermabacter)短状杆菌属(Brachybacterium)皮生球菌科(Dermacoccaceae)皮生球菌属(Dermacoccus)肥沃菌属(Demetria)皮革球菌属(Kytococus)嗜皮菌科(Dermatophilaceae)嗜皮菌属(Dermatophilus)动球菌属(Kineosphaera)间孢囊菌科(Intrasporangiaceae)间孢囊菌属(Intrasporangium)砒酸球菌属(Arsenicicoccus)两面神菌属(Janibacter)诺尔士菌属(Knoellia)鸟氨酸球菌属(Ornithinicoccus)鸟氨酸微球菌(Ornithinimicrobium)稻田土壤菌属(Oryzihumus)丝氨酸球菌属(Serinicoccus)地杆菌属(Terrabacter)土壤球菌属(Terracoccus)四球菌属(Tetrasphaera)潮湿芽孢杆菌属(Humibacillus)韩国生工所菌属(Kribbia)矿杆菌属(Fordinibacter)小石球菌属(Lapillicoccus)海藻球菌属(Phycicoccus)海居菌属(Marihabitans)潮湿居菌属(Humihabitans)琼斯菌科(Jonesiaceae)琼斯菌属(Jonesia)微杆菌科(Microbacteriaceae)微杆菌属(Microbacterium)阿格雷氏菌属(Agreia)壤球菌属(Agrococcus)壤霉菌属(Agromyces)棍状杆菌属(Clavibacter)喜冷杆菌属(Cryobaterium)短小杆菌属(Curtobacterium)冷杆菌属(Frigoribacterium)叶居菌属(Frondihabitans)喜珍品杆菌属(Gulosibacter)拉贝达氏菌属(Labedella)利夫森氏菌属(Leifsonia)无色杆菌属(Leucobacter)微孢菌属(Microcella)小土居菌属(Microterricola)栖霉菌属(Mycetocola)奥卡河杆菌属(Okibacterium)盐水杆菌属(Salinibacterium)栖地下菌属(Subtercola)假棍状杆菌属(Pseudoclavibactet)植物杆菌属(Plantibacter)拉氏杆菌属(Rathayibacter)赤球菌属(Rhodoglobus)朴勇河氏菌属(Yonghaparkia)舒曼氏菌属(Schumannella)海藻菌属(Phycicola)克鲁格氏菌属(Klugiella)潮湿杆菌属(Humibacter)冰伽杆菌属(Glaciibacter)齐默曼氏菌属(Zimmermannella)原小单孢菌科(Promicromonospore)原小单孢菌属(Promicromonospora)纤维微菌属(Cellulosimicrobium)栖白蚁菌属(Isoptericola)产丝菌属(Myceligenerans)解木聚糖杆菌属(Xylanibacterium)解木聚糖微菌属(Xylanimicrobium)解木聚糖单孢菌属(Xylanimonas)稀有杆菌科(Rarobacteraceae)稀有杆菌属(Rarobacter)血杆菌科(Sanguibacteraceae)血杆菌属(Sanguibacter)阎氏菌科(Yaniellaceae)阎氏菌属(Yaniella)阮氏菌科(Ruaniaceae)阮氏菌属(Ruania)嗜盐放线杆菌属(Haloactinobacterium)丙酸杆菌亚目(Propionibacterineae)丙酸杆菌科(Propionibacteriaceae)丙酸杆菌属(Propionibacterium)黄球菌属(Luteococcus)小月菌属(Microlunatus)产丙酸菌属(Propioniferax)产丙酸微球菌(Propionimicrobium)四圆形菌属(Tessaracoccus)弗莱德门氏菌属(Friedmanniella)微白霜菌属(Micropruina)产丙酸单孢菌属(Propionicimonas)潮汐滩菌属(Aestuariimicrobium)布克劳氏菌属(Brooklawnia)颗粒球菌属(Granulicoccus)产丙酸细胞菌属(Propionicicella)类诺卡氏菌科(Nocardioidaceae)类诺卡氏菌属(Nocardioides)多形态放线菌属(Actinopolymorpha)气微菌属(Aeromicrobium)姜氏菌属(Jiangella)韩国生工菌属(Kribbella)大理石雕菌属(Marmoricola)2 双栖杆菌目(Bifidobacteriales)双栖杆菌科(Bifidobacteriaceae)双栖杆菌属(Bifidobacterium)加德纳氏菌属(Gardnerella)斯卡多维亚氏菌属(Scardovia)类斯卡多维亚氏菌属(Parascardovia)卡多维亚氏菌属(Aeriscardovia)异斯卡多维亚菌属(Alloscardovia)另类斯卡多维亚氏菌属(Metascardovia)高温放线菌高温放线菌科(Thermoactinomycetaceae)高温放线菌属(Thermoactinomyces)来斯氏菌属(Laceyella)高温黄色微菌属(Thermoflavimicrobium)清野氏菌属(Seinonella)直丝菌属(Planifilum)皂硫-洛克菌属(Mechercharimyces)岛津氏菌属(Schimazuella)最新文件仅供参考已改成word文本。
放线菌(网址/view/35926.ht ml?wtp=tt#sub35926)放线菌(Actinomycete)是原核生物的一个类群。
大多数有发达的分枝菌丝。
菌丝纤细,宽度近于杆状细菌,约0.5~1微米。
可分为:营养菌丝,又称基质菌丝,主要功能是吸收营养物质,有的可产生不同的色素,是菌种鉴定的重要依据;气生菌丝,叠生于营养菌丝上,又称二级菌丝。
目录编辑本段径与细菌直径基本相同;③最适生长PH范围与细菌基本相同,一般呈微碱性;④都对溶菌酶和抗生素敏感,对抗真菌药物不敏感;⑤繁殖方式为无性繁殖,遗传特性与细菌相似。
编辑本段形态与结构放线菌种类很多,多数放线菌具有发育良好的分支状菌丝体,少数为杆状或原始丝状的简单形态。
菌丝大多无隔膜,其粗细与杆状细菌相似,直径为1微米左右。
细胞中具核质而无真正的细胞核,细胞壁含有胞壁酸与二氨基庚二酸,而不含几丁质和纤维素。
以与人类关系最密切、分布最广、种类最多、形态最典型的链霉菌属为例。
链霉菌主要由菌丝和孢子两部分结构组成。
菌丝(mycelium)根据菌丝的着生部位、形态和功能的不同,放线菌菌丝可分为基内菌丝、气生菌丝和孢子丝三种。
1.基内菌丝(substrate mycelium) 链霉菌的孢子落在适宜的固体基质表面,在适宜条件下吸收水分,孢子肿胀,萌发出芽,进一步向基质的四周表面和内部伸展,形成基内菌丝,又称初级菌丝(primary mycelium)或者营养菌丝(vegetative mycelium),直径在0.2~0.8微米之间,色淡,主要功能是吸收营养物质和排泄代谢产物。
可产生黄、蓝、红、绿、褐和紫等水溶色素和脂溶性色素,色素在放线菌的分类和鉴定上有重要的参考价值。
放线菌中多数种类的基内菌丝无隔膜,不断裂,如链霉菌属和小单孢菌属等;但有一类放线菌,如诺卡氏菌型放线菌的基内菌丝生长一定时间后形成横隔膜,继而断裂成球状或杆状小体。
2.气生菌丝(aerial mycelium)是基内菌丝长出培养基外并伸向空间的菌丝,又称二级菌丝(secondary mycelium)。
什么是放线菌引言放线菌(Actinobacteria)是一类广泛存在于自然环境中的细菌,也是一类非常重要的微生物资源。
它们具有丰富的代谢能力和生物活性产物,对于农业、药物开发、环境保护等领域具有重要的应用价值。
放线菌的研究和应用已经成为微生物学和生物技术领域的热点之一。
本文将从分类特征、生物特性、应用领域等方面对放线菌进行详细介绍。
一、分类特征1. 形态特征放线菌是革兰氏阳性细菌,其细胞多为直杆状,长为0.2-2.0μm,直径为0.5-1.0μm。
有的放线菌细胞会形成分枝或丝状结构,使得其菌落呈现放射状生长。
2. 细胞壁特征放线菌的细胞壁主要由多肽聚糖组成,其中N-乙酰葡萄醣胺和N-乙酰半乳葡萄糖胺是其特征性成分。
这些特殊的细胞壁结构使得放线菌对抗生物膜、抗药物和耐酸碱有一定的能力。
3. 分类系统放线菌属于细菌界放线菌纲(Actinobacteria),目前已知的放线菌约有50个属。
根据形态特征、生理和生态习性等分类指标,放线菌可以进一步分为不同的科、属和种。
二、生物特性1. 生长环境放线菌广泛存在于土壤、水体和植物表面等自然环境中。
它们对土壤质地、pH值、湿度和养分含量等因素有一定的适应性,因此在地球生态系统中分布十分广泛。
2. 代谢能力放线菌具有丰富的代谢能力,可以利用多种有机物和无机物作为碳源、氮源和能源。
许多放线菌具有优良的降解能力,能够降解有机污染物和农药,对环境保护具有重要的意义。
3. 生物活性产物放线菌是许多重要天然产物的产生者,其中包括抗生素、抗肿瘤活性物质、抗氧化物质等。
这些生物活性产物对细菌、真菌和肿瘤细胞等具有显著的抑制或杀灭作用,对人类的健康和医疗具有重要意义。
三、应用领域1. 农业应用放线菌具有优良的土壤分解和降解能力,可以降解农药残留、处理农业废弃物等。
此外,放线菌还能够产生一些具有生物肥料作用的物质,可以促进植物的生长和发育。
2. 药物开发放线菌是抗生素的重要来源之一,许多著名的抗生素如链霉素、土霉素等都是由放线菌产生的。
一、酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)1 酸微菌目(Acidimicrobiales)酸微菌亚目(Acidimicrobineae)酸微菌科(Acidimicrobiaceae)酸微菌属(Acidimicrobium)典型种:氧化亚铁微酸菌(Acdimicrobium ferrooxidans)二、红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae)1 红色杆菌目(Rubrobacterales)红色杆菌亚目(Rubrobacterineae)红色杆菌科(Rubrobacteraceae)红色杆菌属(Rubrobacter)2 土壤红杆菌目(Solirubrobacterales)土壤红杆菌科(Solirubrobacteraceae)扩展杆菌科(Patulibacteraceae)康奈斯氏杆菌科(Conexibacteraceae)康奈斯氏杆菌属(Conexibacter)3 嗜热油菌目(Thermoleophilales)嗜热油菌科(Thermoleophilacceae)嗜热油菌属(Thermoleophilum)三、红蝽杆菌亚纲(Coriobacteride)1 红蝽杆菌目(Coriobacteriales)红蝽杆菌科(Coriobacteriaceae)红蝽杆菌属(Coriobacterium)阿托波菌属(Atopobium)扣林氏菌属(Collinsella)神秘杆菌属(Cryptobacterium)反硝化杆菌属(Denitrobacterium)伊格尔兹氏菌属(Eggerthella)欧陆森氏菌属(Olsenella)斯莱克氏菌属(Slackia)非消化糖杆菌属(Asccharobacter)肠杆菌属(Enterorhabdus)戈登氏杆菌属(Gordonibacter)类伊格尔兹氏菌属(Paraeggerthella)四、腈基降解菌亚纲(Nitriliruptoride)1 腈基降解菌目(Nitriliruptorales)腈基降解菌科(Nitriliruptoraceae)腈基降解菌属(Nitriliruptor)2尤泽比氏菌目(Euzebyales)尤泽比氏菌科(Euzebyaceae)尤泽比氏菌属(Euzebya)五、放线菌亚纲(Actinobacteridae)1 放线菌目(Actinobacterales)放线菌亚目(Actinomycineae)放线菌科(Actinomycetaceae)放线菌属(Actinomyces)放线杆菌属(Actinobaculum)隐秘杆菌属(Arcanobacterium)动弯杆菌属(Mobiluncus)弯曲短杆菌属(Varibaculum)链霉菌亚目(Streptomycineae)链霉菌科(Sterptomycetaceae)链霉菌属(Streptomyces)北里孢菌属(Kitasatospora)链嗜酸菌属(Streptacidiphilus)链孢囊菌亚目(Streptosporangineae)链孢囊菌科(Streptosporangiaceae)链孢囊菌属(Streptosporangium)小双孢菌属(Microbispora)小四孢菌属(Microtetraspora)野野村氏菌属(Nonomuraea)游动单孢菌属(Planomonospora)游动双孢菌属(Planobispora)草孢菌属(Herbidospora)游动四孢菌属(Planotetraspora)高温多孢菌属(Thermopolyspora)果实包囊菌属(Acrocarpospora)球状包囊菌属(Sphaerisporangium)拟诺卡氏菌科(Nocardiopsaceae)拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)高温双岐菌属(Thermobifida)链单孢菌属(Streptomonospora)盐放线孢菌属(Haloactinospora)海洋放线孢菌属(Marinactinospora)高温单孢菌科(Thermomonosporaceae)高温单孢菌属(Thermomonospora)马杜拉放线菌属(Actinomadura)螺孢菌属(Spirillospora)珊瑚放线菌属(Actinocorallia)高温双孢菌属(Thermobispora)小单孢菌亚目(Micromonosporineae)小单孢菌科(Micromonosporaceae)小单孢菌属(Micromonospora)游动放线菌属(Actinoplanes)指孢囊菌属(Dactylosporangium)发仙菌属(Pilimelia)短链孢菌属(Catellatospora)短链游动菌属(Catenuloplanes)库奇游动菌属(Couchiolanes)螺旋游动菌属(Spirilliplanes)疣孢菌属(Verrucosispora)杆状孢囊菌属(Virgisporangium)长孢菌属(Longispora)阿森诺氏菌属(Asanoa)盐孢菌属(Salinispora)放线短链孢菌属(Actinocatenispora)多形态孢菌属(Polymorphospora)克拉西利尼科夫菌属(Krasilnikovia)卢得曼氏菌属(Luedemannella)假孢囊菌属(Pseudosporangium)游动孢囊菌属(Planosporangium)短链球孢囊菌(Catelliglobosispora)滨田氏菌属(Hamadaea)植物放线孢囊菌(Plantactinospora)皱纹单孢菌属(Rugosimonospora)植物栖居菌属(Phytohabitans)放线橘橙孢菌属(Actinaurispora)异短链球孢菌属(Allocatelliglobosispora)糖霉菌亚目(Glycomycineae)糖霉菌科(Glycomycetaceae)糖霉菌属(Glycomyces)斯塔堪布瑞德氏菌属(Stackebrandtia)盐糖霉菌属(Haloglycomyces)细链孢菌亚目(Catenulisporineae)细链孢菌科(Catenulisporaceae)细链孢菌属(Catenulispora)丛生放线菌科(Actinospicaceae)丛生放线菌属(Actinospica)放线多孢菌亚目(Actinopolysporineae)放线多孢菌科(Actinopolysporaceae)放线多孢菌属(Actinopolyspora)动球菌亚目(KIneococcineae)动球菌科(KIneococcaceae)动球菌属(KIneococcus)动孢菌属(Kineosporia)四折叠球菌属(Quadrisphaera)假诺卡氏亚目(Pseudonocardineae)假诺卡氏菌科(Pseudonocardiaceae)假诺卡氏菌属(Pseudonocardia)异壁放线菌菌属(Actinoalloteichus)拟无枝酸菌属(Amycolatopsis)克洛斯氏菌属(Crossiella)拟孢囊菌属(Kibdelosporangium)库兹涅尔氏菌属(Kutzneria)古德飞罗氏菌属(Goodfellowia)普劳斯氏菌属(Prauserella)糖单孢菌属(Saccharomonospora)糖多孢菌属(Saccharopolyspora)异壁链霉菌属(Streptoalloteichus)放线孢菌属(Actinomycetospora)异库兹涅尔氏菌属(Allokutzneria)南海海洋所菌属(Sciscionella)束丝放线菌科(Actinosynnemataceae)束丝放线菌属(Actinosynnema)列舍瓦列氏菌属(Lechevalier)伦兹氏菌属(Lentzea)糖丝菌属(Saccharothrix)动孢放线菌属(Actinokineospora)梅泽宾夫氏菌属(Umezawaea)弗兰克氏菌亚目(Frankineae)弗兰克氏菌科(Frankiaceae)弗兰克氏菌属(Frankia)热酸菌属(Acidothermus)隐孢囊菌科(Cryptosporangiaceae)隐孢囊菌属(Cryptosporangium)矿生菌属(Fodinicola)地嗜皮菌科(Geodermatophilaceae)地嗜皮菌(Geodermatophilus)芽生球菌属(Blastococcus)贫养杆菌属(Modestobacter)中村氏菌科(Nakamurellaceae)潮湿球菌属(Humicoccus)鱼孢菌科(Sporichthyaceae)鱼孢菌属(Sporichthya)棒杆菌亚目(Corynebacterineae)棒杆菌科(Corynebacteriaceae)棒杆菌属(Corynebacterium)苏黎世菌属(Turicella)迪茨氏菌科(Dietziaceae)分枝杆菌科(Mycobacteriaceae)分枝杆菌属(Mycobacterium)诺卡氏菌科(Nocardiaceae)诺卡氏菌属(Nocardia)戈登氏菌属(Gordonia)红球菌属(Rhodococcus)斯科曼氏菌属(Skermania)威廉姆斯氏菌属(Williamsia)米利斯氏菌属(Millisia)慢反应脂肪酸菌科(Segniliparaceae)慢反应脂肪酸菌属(Segniliparus)冢村氏菌科(Tsukamurellaceae)冢村氏菌属(Tsukamurella)微球菌亚目(Micrococcineae)微球菌科(Micrococcaceae)微球菌属(Micrococcus)螨共生菌属(Acaricomes)节杆菌属(Arthrobacter)柠檬球菌属Citricoccus)考克氏菌属(Kocuria)涅斯捷连科氏(Nesterenkonia)肾杆菌属(Renibacterium)罗氏菌属(Rothia)志恒刘菌属(zhihengliuella)中国单孢菌属(Sinomonas)口腔球菌属(Stomatococcus)布登堡菌属(Beutenbergia)乔治菌属(Georgenia)萨勒河菌属(Salana)博戈里亚湖菌科(Bogoriellaceae)博戈里亚湖菌属(Bogoriella)短杆菌科(Brevibacteriaceae)短杆菌属(Brevibacterium)纤维单孢菌科(Cellulomonadaceae)纤维单孢菌属(Cellulomonas)光柱菌属(Actinotalea)去甲基醌菌属(Demequina)厄氏菌属(Oerskovia)吸收不良菌属(Tropheryma)皮杆菌科(Dermabacteraceae)皮杆菌属(Dermabacter)短状杆菌属(Brachybacterium)皮生球菌科(Dermacoccaceae)皮生球菌属(Dermacoccus)肥沃菌属(Demetria)皮革球菌属(Kytococus)嗜皮菌科(Dermatophilaceae)嗜皮菌属(Dermatophilus)动球菌属(Kineosphaera)间孢囊菌科(Intrasporangiaceae)间孢囊菌属(Intrasporangium)砒酸球菌属(Arsenicicoccus)两面神菌属(Janibacter)诺尔士菌属(Knoellia)鸟氨酸球菌属(Ornithinicoccus)鸟氨酸微球菌(Ornithinimicrobium)稻田土壤菌属(Oryzihumus)丝氨酸球菌属(Serinicoccus)地杆菌属(Terrabacter)土壤球菌属(Terracoccus)四球菌属(Tetrasphaera)潮湿芽孢杆菌属(Humibacillus)韩国生工所菌属(Kribbia)矿杆菌属(Fordinibacter)小石球菌属(Lapillicoccus)海藻球菌属(Phycicoccus)海居菌属(Marihabitans)潮湿居菌属(Humihabitans)琼斯菌科(Jonesiaceae)琼斯菌属(Jonesia)微杆菌科(Microbacteriaceae)微杆菌属(Microbacterium)阿格雷氏菌属(Agreia)壤球菌属(Agrococcus)壤霉菌属(Agromyces)棍状杆菌属(Clavibacter)喜冷杆菌属(Cryobaterium)短小杆菌属(Curtobacterium)冷杆菌属(Frigoribacterium)叶居菌属(Frondihabitans)喜珍品杆菌属(Gulosibacter)拉贝达氏菌属(Labedella)利夫森氏菌属(Leifsonia)无色杆菌属(Leucobacter)微孢菌属(Microcella)小土居菌属(Microterricola)栖霉菌属(Mycetocola)奥卡河杆菌属(Okibacterium)盐水杆菌属(Salinibacterium)栖地下菌属(Subtercola)假棍状杆菌属(Pseudoclavibactet)植物杆菌属(Plantibacter)拉氏杆菌属(Rathayibacter)赤球菌属(Rhodoglobus)朴勇河氏菌属(Yonghaparkia)舒曼氏菌属(Schumannella)海藻菌属(Phycicola)克鲁格氏菌属(Klugiella)潮湿杆菌属(Humibacter)冰伽杆菌属(Glaciibacter)齐默曼氏菌属(Zimmermannella)原小单孢菌科(Promicromonospore)原小单孢菌属(Promicromonospora)纤维微菌属(Cellulosimicrobium)栖白蚁菌属(Isoptericola)产丝菌属(Myceligenerans)解木聚糖杆菌属(Xylanibacterium)解木聚糖微菌属(Xylanimicrobium)解木聚糖单孢菌属(Xylanimonas)稀有杆菌科(Rarobacteraceae)稀有杆菌属(Rarobacter)血杆菌科(Sanguibacteraceae)血杆菌属(Sanguibacter)阎氏菌科(Yaniellaceae)阎氏菌属(Yaniella)阮氏菌科(Ruaniaceae)阮氏菌属(Ruania)嗜盐放线杆菌属(Haloactinobacterium)丙酸杆菌亚目(Propionibacterineae)丙酸杆菌科(Propionibacteriaceae)丙酸杆菌属(Propionibacterium)黄球菌属(Luteococcus)小月菌属(Microlunatus)产丙酸菌属(Propioniferax)产丙酸微球菌(Propionimicrobium)四圆形菌属(Tessaracoccus)弗莱德门氏菌属(Friedmanniella)微白霜菌属(Micropruina)产丙酸单孢菌属(Propionicimonas)潮汐滩菌属(Aestuariimicrobium)布克劳氏菌属(Brooklawnia)颗粒球菌属(Granulicoccus)产丙酸细胞菌属(Propionicicella)类诺卡氏菌科(Nocardioidaceae)类诺卡氏菌属(Nocardioides)多形态放线菌属(Actinopolymorpha)气微菌属(Aeromicrobium)姜氏菌属(Jiangella)韩国生工菌属(Kribbella)大理石雕菌属(Marmoricola)2 双栖杆菌目(Bifidobacteriales)双栖杆菌科(Bifidobacteriaceae)双栖杆菌属(Bifidobacterium)加德纳氏菌属(Gardnerella)斯卡多维亚氏菌属(Scardovia)类斯卡多维亚氏菌属(Parascardovia)卡多维亚氏菌属(Aeriscardovia)异斯卡多维亚菌属(Alloscardovia)另类斯卡多维亚氏菌属(Metascardovia)高温放线菌高温放线菌科(Thermoactinomycetaceae)高温放线菌属(Thermoactinomyces)来斯氏菌属(Laceyella)高温黄色微菌属(Thermoflavimicrobium)清野氏菌属(Seinonella)直丝菌属(Planifilum)皂硫-洛克菌属(Mechercharimyces)岛津氏菌属(Schimazuella)。
放线菌(Actinomyces)放线菌是1877年合兹首先在牛体内发现的。
在形态上具有分枝状菌丝、菌落形态与霉菌相似,以孢子进行繁殖。
“介于细菌与丝状真菌之间又接近细菌的一类丝状原核生物”放线菌实际上是属于细菌范畴内的原核微生物,只不过其细胞形态为分枝状菌丝。
放线菌:是一类主要呈菌丝状生长和以孢子繁殖的陆生性较强的原核生物。
也可将之定义为一类主要呈丝状生长和以孢子繁殖的G+细菌。
一、放线菌的分布放线菌广泛分布在含水量较低、有机物较丰富和呈微碱性的土壤中。
1克土壤中可存在数万~数百万个孢子。
一般,肥沃土>贫瘠土农田>森林中性偏碱土壤>酸性土壤含水低土>含水高土二、放线菌与人类的关系1.多数属于有益菌(1)腐生型放线菌在自然界物质循环中起很重要的作用。
(2)生产抗生素的主要微生物据估计,全世界近万种抗生素约70%是放线菌的次生代谢产物。
(3)筛选到许多新的生化药物Eg.抗癌剂、酶抑制剂、抗寄生虫剂、免疫抑制剂和农用杀虫(杀菌)剂等。
(4)是许多酶、维生素等的产生菌(5)Frankia(弗兰克氏菌属)对非豆科植物的共生固氮具有重大作用。
(6)在甾体转化、石油脱蜡、烃类发酵、污水处理等方面也有应用(7)具有极强的分解纤维素、石蜡、角蛋白、琼脂和橡胶等的能力,故它们在环境保护、提高土壤肥力和自然界物质循环中起着重大作用。
2.危害(1)寄生型的放线菌可引起人、动物和植物的许多疾病,eg.肺部感染、皮肤病、脑膜炎(1)具有特殊的土腥味(土霉素的味道),主要由放线菌产生的土腥味素所引起的。
可使水、食品变味,也能破环棉毛织品、纸张等。
三、放线菌在微生物中的分类地位放线菌在形态上分化为菌丝和孢子,在培养特征上与霉菌相似,故在早期曾被列入真菌类。
后来随着对微生物分类学的不断认识,特别是分类手段的改进,发现放线菌有很多生物特性与细菌相似,在一段时间内被认为是“介于细菌与真菌之间的一类微生物”。
然而,用近代分子生物学手段进行分析的结果表明:放线菌实际上是属于细菌范畴的原核细胞型微生物,革兰染色结果为阳性,与普通细菌不同的是细胞形态呈分枝状菌丝体。
放线菌纲(Actinobacteria)一、酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)1 酸微菌目(Acidimicrobiales)酸微菌亚目(Acidimicrobineae)酸微菌科(Acidimicrobiaceae)酸微菌属(Acidimicrobium)典型种:氧化亚铁微酸菌(Acdimicrobium ferrooxidans )二、红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae)1 红色杆菌目(Rubrobacterales)红色杆菌亚目(Rubrobacterineae)红色杆菌科(Rubrobacteraceae)红色杆菌属(Rubrobacter )2 土壤红杆菌目(Solirubrobacterales )土壤红杆菌科(Solirubrobacteraceae )扩展杆菌科(Patulibacteraceae )康奈斯氏杆菌科(Conexibacteraceae )康奈斯氏杆菌属(Conexibacter )3 嗜热油菌目(Thermoleophilales )嗜热油菌科(Thermoleophilacceae )嗜热油菌属(Thermoleophilum )三、红蝽杆菌亚纲(Coriobacteride )1 红蝽杆菌目(Coriobacteriales )红蝽杆菌科(Coriobacteriaceae )红蝽杆菌属(Coriobacterium )阿托波菌属(Atopobium )扣林氏菌属 (Collinsella )神秘杆菌属(Cryptobacterium )1酸微菌亚纲(Acidimicrobidae) 2红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae) 3红蝽杆菌亚纲(Coriobacteride ) 4 腈基降解菌亚纲(Nitriliruptoride )5放线菌亚纲(Actinobacteridae)反硝化杆菌属(Denitrobacterium)伊格尔兹氏菌属(Eggerthella)欧陆森氏菌属(Olsenella)斯莱克氏菌属(Slackia)非消化糖杆菌属(Asccharobacter)肠杆菌属(Enterorhabdus)戈登氏杆菌属(Gordonibacter)类伊格尔兹氏菌属(Paraeggerthella)四、腈基降解菌亚纲(Nitriliruptoride)1 腈基降解菌目(Nitriliruptorales)腈基降解菌科(Nitriliruptoraceae)腈基降解菌属(Nitriliruptor)2尤泽比氏菌目(Euzebyales)尤泽比氏菌科(Euzebyaceae)尤泽比氏菌属(Euzebya)五、放线菌亚纲(Actinobacteridae)1 放线菌目(Actinobacterales)放线菌亚目(Actinomycineae)放线菌科(Actinomycetaceae)放线菌属(Actinomyces)放线杆菌属(Actinobaculum)隐秘杆菌属(Arcanobacterium)动弯杆菌属(Mobiluncus)弯曲短杆菌属(Varibaculum)链霉菌亚目(Streptomycineae)链霉菌科(Sterptomycetaceae)链霉菌属(Streptomyces)北里孢菌属(Kitasatospora)链嗜酸菌属(Streptacidiphilus)链孢囊菌亚目(Streptosporangineae)链孢囊菌科(Streptosporangiaceae)链孢囊菌属(Streptosporangium)小双孢菌属(Microbispora)小四孢菌属(Microtetraspora)野野村氏菌属(Nonomuraea)游动单孢菌属(Planomonospora)。