Gene-for-Gene_Theory解读
- 格式:ppt
- 大小:1.68 MB
- 文档页数:30
Reflections on "The Theory of the Gene"Reading "The Theory of the Gene" by Thomas Hunt Morgan was a profound experience that left me with a deeper understanding of the intricate and fascinating world of genetics. Morgan's comprehensive exploration of the principles and mechanisms of genetics provided a comprehensive and engaging overview of the subject.One of the most striking aspects of the book was Morgan's focus on the gene as the fundamental unit of heredity. His exploration of the particle theory of inheritance, chromosome-gene relationships, and the origin of mutations offered a clear and concise understanding of the complexities of genetic inheritance. The author's explanation of how genetic information is passed down from generation to generation through chromosomes was particularly enlightening.Morgan's writing style was engaging and accessible, making the complex concepts of genetics accessible to a wide range of readers. His use of examples and anecdotes throughout the book added a personal touch, making the subject matter more relatable and interesting.The book also provided a fascinating insight into the ethical and social implications of genetics. Morgan's discussion on the role of genes in gender determination and the potential for genetic engineering to impact society was particularly thought-provoking. It made me consider the ethical dilemmas that arise when we have the ability to manipulate genetic information and the potential consequences for future generations.Overall, "The Theory of the Gene" was an excellent introduction to the field of genetics. It provided a solid foundation of knowledge and understanding that will serve as a valuable resource for further exploration of this fascinating subject.I highly recommend this book to anyone interested in genetics or the science of heredity.阅读托马斯·亨特·摩尔根的《基因论》是一次深刻而富有启发性的体验,让我对遗传学这个复杂而迷人的领域有了更深入的理解。
基因概念之演变基因(gene)是遗传学家约翰逊(W.Johannsen)在1909年提出来的。
他用基因这一名词来表示遗传的独立单位,相当于孟德尔在豌豆试验中提出的遗传因子。
在遗传学发展的早期阶段,基因仅仅是1个逻辑推理的概念,而不是一种已经证实了的物质和结构。
由于科学研究水平的不断提高,从浅入深,由宏观到微观,基因的概念也在不断的修正和发展。
从遗传学史的角度看,基因概念大致分以下几个阶段:孟德尔的遗传因子阶段;摩尔根的基因阶段;顺反子阶段和现代基因阶段。
一、孟德尔的遗传因子阶段19世纪60年代初,孟德尔对具有不同形态的豌豆作杂交实验,在解释实验中每种性状的遗传行为时,用A代表红花,a代表白花,表明生物的某种性状是由遗传因子负责传递的,遗传下来的不是具体的性状,而是遗传因子。
遗传因子是颗粒性的,在体细胞内成双存在,在生殖细胞内成单存在。
孟德尔所说的“遗传因子”是代表决定某个性状遗传的抽象符号。
孟德尔在阐明遗传因子在世代中传递规律时,就已经认识到了基因的两个基本属性:基因是世代相传的,基因是决定遗传性表达的。
现在所说的“基因是生物体传递遗传信息和表达遗传信息的基本物质单位”,实际上就是孟德尔所阐明的基因观。
二、摩尔根的基因阶段1909年,丹麦遗传学家约翰逊创造了“基因”这一术语,用来表达孟德尔的遗传因子,但还只是提出了遗传因子的符号,没有提出基因的物质概念。
摩尔根对果蝇的研究结果表明,1条染色体上有很多基因,一些性状的遗传行为之所以不符合孟德尔的独立分配定律,就是因为代表这些性状的基因位于同一条染色体上,彼此连锁而不易分离。
这样,代表特定性状的特定基因与某一条特定染色体上的特定位置联系起来。
基因不再是抽象的符号,而是在染色体上占有一定空间的实体,从而赋予基因以物质的内涵。
三、顺反子阶段早期的基因概念是把基因作为决定性状的最小单位、突变的最小单位和重组的最小单位,后来,这种“三位一体”的概念不断受到新发现的挑战。
基因组学-Genomics-知识考点汇总•基因组(Genome:Gene+chromosome)细胞或生物体中一套完整的单倍体遗传物质•基因组学(Genomics)最早Thomas Roderick在1986年提出,包括基因组作图、测序和分析。
可分为结构基因组学和功能基因组学。
一、结构基因组学1.遗传图(Genetic Mapping Genomes) : Based on the calculation of recombination frequencyby linkage analysis .通过亲本的杂交,分析后代的基因间重组率,并用重组率来表示两个基因之间距离的线形连锁图谱每条染色体组成一个连锁群,所有染色体的连锁群组成的图谱即构成基因组遗传图。
重组率代表基因位点之间的相对距离。
在遗传作图中,人们把一个作图单位定义为1厘摩(cM),1cM等于1%的重组率。
提高遗传作图的分辨率:选用不同的杂交群体;增加杂交群体的数目;增加分子标记的数目;扩大分子标记的来源分子标记:绘制基因组遗传图需要的坐标点。
分子标记的主要来源是染色体上存在的大量等位基因。
在DNA水平上,两个基因间一个碱基的差异就足以形成等位基因。
2.物理图(physical map):指DNA序列上两点的实际距离,它是以DNA的限制酶片段或克隆的大片段的基因组DNA分子为基本单位,以连续的重叠群为基本框架,通过遗传标记将重叠群或基因组DNA分子有序排列于染色体上。
物理图的绘制: Based on molecular hybridization analysis and PCR techniques杂交法;指纹法;荧光原位杂交技术。
3.基因组序列测定: Sequencing methods: the chain termination procedure;Map-based clone by clone strategy;Whole genome shotgun (WGS) strategy;Sequence assembly;•传统基因组测序的方法:克隆步移法(BAC-by-BAC Strategy)和全基因组鸟抢法(Whole Genome Shotgun Strategy)。
目的基因名词解释目的基因(for gene)指真核生物体内能与另一种已知功能基因相互作用并表达产生具有某种生物学效应的蛋白质的基因。
该概念是1996年由高尔登(M.Gorton)和穆尔(A.Moore)提出的,其最初的意思是在分子生物学领域里表达外源基因的过程。
为了准确、严格地说明这个术语的涵义,必须对它做出详细的解释。
目的基因的主要功能是通过转录后修饰(如启动子)来加强特异性表达的效率或者改变基因的表达模式。
但是在很多时候,它还可以影响蛋白质的翻译。
当研究人员发现某个基因在其调控序列中编码着能够指导转录的多肽时,他们就假设该多肽将在适当的位置上发生翻译,如果正确的话,在将来的细胞分裂过程中就会进入细胞核,在细胞中表达。
为了检测这个假设,研究人员就可以在细胞的基因组中寻找这些基因,也可以测定多肽是否正确地翻译成了蛋白质。
因此,一旦目的基因被发现,那么关于这些基因的其他信息也会随之公布,所有与这个基因相关的转录和翻译的活动都会在细胞的基因组中得到记录,而且还能够追踪它们在转录后加工过程中所产生的变化。
虽然不能排除与这个基因无关的基因同样起着非常重要的作用,但是至少会比没有目的基因时候的情况要好。
因此目的基因往往是新发现的,而且可能只在特定的组织和器官中存在。
对于各种人类基因组计划来说,其中最令人兴奋的是发现了一些新的,具有特殊功能的基因,例如那些参与血红蛋白合成的基因等等。
同时,也有大量的文献资料表明,即使这些基因原先是存在于另一种生物的基因组中的,但是它们却在实验室条件下诱导出来了。
有些目的基因只能在特定的组织器官中被诱导表达,例如人的血小板中的促凝血因子。
然而在哺乳动物的胚胎发育过程中,这种因子的合成被认为是受基因控制的。
还有一些目的基因需要在复杂的调节机制的协调下才能表达,例如对于肝脏或肺的发育来说,一般不能识别出这两种特定组织,但是可以抑制两者中任何一种的过度增长。
我们期待着能够通过不同的方法来探测和研究这些可能成为药物的目的基因。
内部资料仅供参考基因本体论(Gene Ontology)数据库基本介绍Version No.2010.10.03西安电子科技大学计算机学院作者:孔垂亮电邮:morrain1987@导师:高琳目录目录第一部分GO是什么? (2)1.1基因本体论(gene ontology)的建立 (2)1.2本体论(The ontologies)简介 (3)1.3本体论语义之间的关系及其组织结构 (4)1.3.1语义之间关系的基本理解 (4)1.3.2关系之间的推导 (5)1.3.3调节控制关系(the regulates relation)及其推导 (6)1.3.4本体论的组织结构 (7)1.4GO的注释(Annotation) (8)第二部分GO怎么用? (10)2.1下载本体论文件和注释文件 (10)2.2GO语义及其相关注释的浏览与搜索 (17)2.2.1AmiGO的基本使用说明 (17)2.2.2语义关系的图形化描述 (20)2.2.3根据语义检索 (22)2.2.4根据基因产物检索 (25)第一部分GO是什么?GO(gene ontology)是基因本体联合会(Gene Onotology Consortium)所建立的数据库,旨在建立一个适用于各种物种的,对基因和蛋白质功能进行限定和描述的,并能随着研究不断深入而更新的语义词汇标准。
GO是多种生物本体语言中的一种,提供了三层结构的系统定义方式,用于描述基因产物的功能.ontology))的建立1.1基因本体论(gene ontology现今的生物学家们浪费了太多的时间和精力在搜寻生物信息上。
这种情况归结为生物学上定义混乱的原因,不同的生物学数据库可能会使用不同的术语,好比是一些方言一样。
不光是精确的计算机难以搜寻到这些随时间和人为多重因素而随机改变的定义,即使是完全由人手动处理也无法完成。
举个例子来说,如果需要找到一个用于制抗生素的药物靶点,你可能想找到所有的和细菌蛋白质合成相关的基因产物,特别是那些和人体中蛋白质合成组分显著不同的。
基因本体论生物过程术语的富集程度(原创实用版)目录1.基因本体论生物过程术语的富集程度概述2.基因本体论的定义与作用3.生物过程术语的富集程度分析4.富集程度的应用及意义5.总结正文【1.基因本体论生物过程术语的富集程度概述】基因本体论生物过程术语的富集程度是对基因和生物过程之间关联程度的一种度量。
在生物信息学领域,研究者们通过分析基因之间的相互作用和调控关系,试图揭示生命过程中的基因功能和调控机制。
基因本体论生物过程术语的富集程度为研究者提供了一个定量的方法,以评估基因在生物过程中的重要性和相关性。
【2.基因本体论的定义与作用】基因本体论(Gene Ontology,简称 GO)是一种用于描述基因和基因产物功能的标准词汇和分类体系。
它通过将基因和其产物与生物过程、细胞组分和分子功能等术语进行标注,从而为研究者提供了一个统一的、可比较的框架。
基因本体论在生物信息学研究中具有重要作用,包括:(1)对基因进行功能注释,揭示基因在生物过程中的角色;(2)分析基因之间的功能关联,挖掘基因组中的功能模块;(3)为基因表达数据分析提供生物学背景,辅助研究者理解实验现象。
【3.生物过程术语的富集程度分析】生物过程术语的富集程度分析是基于基因本体论的一项研究方法,通过对基因进行功能注释,统计不同生物过程术语在基因中的分布情况,计算各术语的富集程度。
富集程度的计算方法通常采用基因本体论中的“基因 - 术语”映射关系,通过比较不同生物过程术语在基因中的出现次数与预期次数,得到各术语的富集程度。
【4.富集程度的应用及意义】富集程度分析在生物信息学研究中有广泛应用,包括:(1)鉴定生物过程相关基因:通过富集程度分析,可以找到与特定生物过程密切相关的基因,为功能基因组学研究提供线索;(2)研究基因功能和调控关系:通过比较不同生物过程术语的富集程度,可以揭示基因在生物过程中的功能和调控关系;(3)辅助实验设计:富集程度分析可以为实验研究提供参考,帮助研究者确定实验重点和研究方向。