利用SSR分析滇型杂交稻亲本籼粳分化与杂种优势的关系

云南稻核心种质籼稻SSR标记鉴定云南稻核心种质籼稻SSR标记鉴定是指通过分子标记技术对云南稻核心种质中的籼稻进行鉴定和分析，以期获得相关遗传信息，为稻种的选育和改良提供科学依据。

籼稻作为我国主要的稻米作物之一，具有重要的经济和食品价值。

在云南省，稻米是当地重要的粮食作物之一，而籼稻更是占有不可忽视的地位。

对籼稻进行SSR标记鉴定具有重要的意义。

云南稻核心种质是指在云南省具有广泛应用价值和良好遗传背景的一批稻种资源。

这些核心种质不仅在当地有着重要的地位，也有着一定的引种价值，能够为其他地区的稻米生产提供良种。

对这些籼稻核心种质进行SSR标记鉴定，能够了解其遗传特点和亲缘关系，为其在生产中的应用提供科学支撑。

SSR（Simple Sequence Repeat）标记是通过对多态性DNA序列的探测和分析，来识别和分析不同基因型之间的差异。

它是一种高效、准确、重复性好的分子标记技术，被广泛应用于植物遗传育种和种质资源鉴定中。

利用SSR标记技术，可以对稻米的遗传多样性、亲缘关系和遗传演化进行分析，对籼稻的资源调查和品种鉴定提供了有力的工具。

在云南稻核心种质中，选取代表性的籼稻材料进行SSR标记鉴定，可以得到不同基因型的分子标记信息。

通过比对分子标记数据，可以初步了解不同籼稻品种之间的遗传差异和亲缘关系。

这些信息不仅可以为籼稻的资源分类和品种鉴定提供科学依据，也可以为籼稻的遗传改良和育种提供重要参考。

除了在籼稻资源鉴定和选育中的应用外，SSR标记鉴定还可以为籼稻的种质资源保护和遗传资源调查提供科学依据。

通过对籼稻资源的SSR标记鉴定，可以筛选出具有重要遗传特征和优良性状的种质资源，进行重点保护和利用。

对籼稻的遗传资源进行调查，可以收集更多的籼稻种质资源，丰富籼稻资源库，为今后的遗传改良和新品种选育提供更多的种质基础。

利用SSR分子标记划分杂交籼稻亲本群的研究王胜军;万建民;陆作楣【期刊名称】《作物学报》【年(卷),期】2006(32)10【摘要】杂种优势群和杂种优势利用模式可以为植物的杂种优势利用提供重要信息.与玉米相比,水稻杂种优势群的研究相对薄弱.本研究利用72对SSR引物对我国47个杂交籼稻骨干亲本进行了类群划分.共检测出328个等位基因变异,每对引物检测等位基因2～13个,平均4.56个;引物的多态性信息量(PIC)范围为0.120～0.878,平均值为0.567.材料之间的遗传相似系数(GS)范围在0.633～0.928,平均为0.741.用类平均法(un-weighted pair-group method using an arithmetic average)将亲本材料划分为保持系群、温敏核雄性不育系群、恢复系群,其中保持系群和恢复系群又各分为3个亚群,分群结果基本符合系谱信息.并结合杂交水稻生产实践提出了7种杂种优势组合配组模式.分子标记是一种划分杂交籼稻亲本群的有效途径,本研究结果对杂交籼稻的亲本选配具有一定指导意义.%Heterotic groups and patterns among breeding materials provide fundamental information while utilizing heterosis in plant breeding. However, research on heterotic groups in indica rice is scarce compared with that in maize. Simple sequence repeat (SSR) analysis of the 72 loci covering the entire rice genome was carried out for 47 parental lines normally utilized in making hybrid rice in China in order to study the classification of parental lines. Seventy-two SSR primers having stable amplified profiles detected 328 alleles among the lines tested, and the number of alleles per SSR locusranged from 2 to 13, with the mean of 4.56. The polymorphism information content (PIC) per SSR locus ranged from 0.120 to 0.878 with the mean of 0.567. The genetic similarities among 47 parental lines ranged from 0.633 to 0.928 with the mean of 0.741. The 47 parental lines were classified into three main groups (i.e. maintainer line group, TGMS line group and restorer line group) by un-weighted pair-group method using an arithmetic average (UPGMA) clustering method, which was approximately in agreement with pedigree information. Furthermore, seven patterns of heterotic combinations were recommended according to the grouping and hybrid rice production. SSR analysis is an effective way for heterotic grouping of hybrid parental lines in rice. The results of grouping can be used to choose parents in making hybrid rice.【总页数】7页(P1437-1443)【作者】王胜军;万建民;陆作楣【作者单位】南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京,210095;南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京,210095;中国农业科学院作物科学研究所,北京100081;南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京,210095【正文语种】中文【中图分类】S5【相关文献】1.利用SSR分子标记检测杂交籼稻和黄壳糯混合间栽模式下的基因流 [J], 普晓俊;李光和;瞿文林;王云月2.利用RAPD和ISSR分子标记对西瓜作图亲本的多态性分析 [J], 羊杏平;刘广;侯喜林;徐锦华;高长洲3.利用SSR分子标记划分籼型水稻杂种优势群 [J], 罗小金;贺浩华;付军如;陈小荣;孙俊立;张洪亮;李自超4.利用SSR分子标记构建Y58S及部分重要两系杂交水稻亲本的DNA指纹图谱[J], 武文;邓启云;周丽洁;朱校奇;陈春光;庄文;金德敏;王斌5.运用籼粳特异分子标记划分杂交稻亲本群及杂种优势模式初探 [J], 张小祥;李爱宏;肖宁;潘存红;余玲;李育红;黄年生;刘广青;周长海;季红娟;刘晓静;王宝和;赵步洪;谭长乐;戴正元因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

云南稻核心种质籼稻SSR标记鉴定云南省是中国的稻米产地之一，而籼稻又被誉为“南方香米”的代表作物之一。

云南省稻米产量丰富，而籼稻则是其主要种植品种之一。

在籼稻的种质改良和品种培育中，SSR标记鉴定技术发挥了重要的作用。

本文将介绍云南稻核心种质籼稻SSR标记鉴定的相关内容。

一、云南稻核心种质籼稻的特点云南省气候多样，地形复杂，拥有丰富的稻米资源。

云南籼稻种质具有抗逆性强、适应性广、品质优良等特点。

其在生长期短、生育快、产量高、抗性强等方面都有着不俗的表现。

云南省籼稻品种的育种价值极高，并且在品种改良中起到了积极作用。

二、SSR标记鉴定技术在籼稻育种中的应用SSR标记鉴定技术，即简单重复序列标记技术，是一种利用分子生物学方法对植物种质资源进行鉴定和评价的技术手段。

该技术利用微卫星序列进行PCR扩增，通过对PCR产物的电泳分析，可以对植物进行遗传解析，确定植物的亲缘关系和遗传特性。

在籼稻育种中，SSR标记鉴定技术能够帮助育种者对籼稻种质进行遗传解析，为籼稻育种和新品种选育提供科学依据。

在云南省，将SSR标记鉴定技术应用于籼稻核心种质的鉴定和评价中，取得了令人瞩目的成果。

通过对云南籼稻核心种质的SSR标记鉴定，育种者们深入了解了云南籼稻的遗传特性，为云南籼稻的选育和种质改良提供了重要的资料和素材。

云南籼稻育种中的SSR标记鉴定研究成果也为其他地区的籼稻育种提供了借鉴和参考。

云南籼稻核心种质的SSR标记鉴定研究，不仅对籼稻品种的情况有了更清晰的认识，也推动了籼稻育种的科学化和精准化。

通过SSR标记鉴定，育种者可以更加精准地选择适宜的亲本组合，加速新品种的选育进程，提高品种的遗传纯度和耐逆性，在提高稻米产量、改善品质、抗病虫害等方面发挥了重要作用。

三、云南籼稻核心种质SSR标记鉴定技术研究的局限性与挑战尽管云南籼稻核心种质的SSR标记鉴定技术在籼稻育种领域取得了显著的成果，但也面临一些局限性与挑战。

SSR标记鉴定技术需要耗费较多的经费和人力物力，需要耐心和精确的实验操作。

SSR鉴定水稻两系杂交种纯度的运用与探讨I.亲本和杂交种分别筛选引物的适用性摘要：分别采用亲本和杂交种为材料，从４４对引物中筛选出适合于鉴定两系杂交水稻品种两优１７、苯两优６３９、天两优６１６的引物。

结果表明，对同一品种用两种方法筛选出的ＳＳＲ引物相同。

在没有亲本的情况下，仅用杂交种筛选得到的引物可用于室内纯度鉴定。

关键词：两系杂交稻；ＳＳＲ；纯度鉴定；引物筛选运用ＳＳＲ检测水稻种子纯度，以往的研究与应用一般都是用亲本种子来筛选引物［１－８］。

通常情况下，种子经销商没有掌握亲本种子，生产商由于某种原因又不愿意提供亲本种子用于种子检验。

在这种情况下，如能直接利用商品两系杂交种子筛选ＳＳＲ引物，则可为两系杂交种子质量监督带来方便。

刘卫今等［９］曾在无亲本种子的条件下，用三系杂交水稻Ｆ１种子筛选引物进行纯度鉴定。

但两系杂交种子这方面的问题前人研究甚少［１０－１２］，尤其是采用室内与室外大群体比对的研究尚未见诸报道。

研究的目的在于比较用亲本种子筛选的引物与用杂交种筛选的引物是否具有一致性，用这些引物鉴别亲本杂株是否具有可靠性，从而进一步判断用杂交种筛选出的ＳＳＲ引物能否替代用亲本种子筛选出的ＳＳＲ引物，以提高引物筛选效率，降低检测难度与成本。

１材料与方法１．１材料试验所用品种天两优６１６、两优１７、苯两优６３９及其亲本均由湖北省种子管理局提供。

所用引物及试剂均由北京鼎国生物有限公司提供。

１．２方法１．２．１田间鉴定以上所有品种都设置田间正季鉴定，每品种一个小区，每小区５０行，编号为１~５０；每行１０株，编号为１~１０，共５００株，每株代号为４位数，前两位表示行序号，后两位数表示同一行的株序号，例如２９０８表示第２９行第８株。

株距１７ｃｍ，行距２７ｃｍ。

在各小区前端种植该样品的不育系和恢复系各两行（２０株），作为ＳＳＲ和田间杂株比对标样。

鉴定方法根据ＧＢ／Ｔ３５４３．５—１９９５执行。

１．２．２ＰＣＲ反应体系ＰＣＲ扩增反应总体积１０μL：１０×ｂｕｆｆｅｒ１μL，１０ｍmol/L ｄＮＴＰ０．２μL，５０ｎｇ／μL ｐｒｉｍｅｒ０．２μL＋０．２μL，２U／μL Ｔａｑ酶０．６μL，２５ｎｇ／μL ＤＮＡ１μL，ｄｄＨ２Ｏ６．８μL。

云南稻核心种质籼稻SSR标记鉴定云南省是中国稻米的主要产地之一，而籼稻则是云南省的主要稻米种类之一。

为了改良籼稻的品质和产量，云南省稻米研究所进行了大量的籼稻种质资源的筛选和鉴定工作。

利用SSR标记技术进行籼稻种质资源的鉴定是一项重要的工作。

本文将介绍云南稻核心种质籼稻SSR标记鉴定的相关内容。

一、SSR标记技术SSR标记（Simple Sequence Repeat）是一种基因组DNA序列中的重复序列，由于其在种群中的高变异性和多态性，成为了分子遗传学研究和种质资源鉴定中的重要工具。

SSR 标记技术具有高度特异性、高度多态性、易扩增等特点，可以用于鉴定不同籼稻品种的遗传背景、亲缘关系和地理分布等信息。

二、云南稻核心种质籼稻资源云南省是我国籼稻资源丰富的地区，拥有着丰富的籼稻遗传资源。

在云南省稻米研究所的种质资源库中，收集、整理和保存了大量来自不同地区和不同生态环境的籼稻种质资源。

这些籼稻种质资源具有丰富的抗逆性、优良的品质和高产性，是云南省籼稻育种工作的重要基础。

为了更好地利用和保护云南省的籼稻种质资源，云南省稻米研究所进行了籼稻种质资源的SSR标记鉴定工作。

通过对籼稻种质资源进行SSR标记分析，可以了解不同籼稻种质的遗传特征、亲缘关系和遗传多样性，为籼稻育种提供重要的参考信息。

云南稻核心种质籼稻SSR标记鉴定工作是云南省稻米研究所的重要工作之一。

通过对籼稻种质资源的SSR标记鉴定，可以为籼稻育种提供重要的数据支持，促进籼稻生产的发展和籼稻品质的提高。

这项工作也为籼稻种质资源的保存和利用提供了科学依据，对于云南省稻米产业的发展具有重要的意义。

希望通过不断的努力和研究，云南省的籼稻生产能够进一步提高，为人民生活水平的提高和农业的可持续发展做出更大的贡献。

云南稻核心种质籼稻SSR标记鉴定【摘要】本文主要研究云南稻核心种质籼稻的SSR标记鉴定。

通过对云南稻核心种质的收集和籼稻特性分析，筛选并鉴定出合适的SSR标记，进行遗传多样性分析，最终得出种质鉴定结果。

研究结果表明云南稻核心种质中存在丰富的遗传多样性，SSR标记鉴定具有重要意义。

未来的研究可以进一步探讨这些核心种质的遗传特性，为稻种改良和遗传资源保护提供参考。

本研究对于云南稻核心种质籼稻的遗传研究具有重要意义，为稻米产业的发展提供了科学依据和技术支持。

【关键词】云南稻、核心种质、籼稻、SSR标记、遗传多样性、种质鉴定、意义、未来研究、鉴定分析1. 引言1.1 研究背景云南稻核心种质籼稻SSR标记鉴定是当前稻种遗传资源研究中的一个重要课题。

稻作为我国重要的粮食作物之一，对我国农业生产和粮食安全具有重要意义。

随着人口的增加和城市化进程的加快，我国的粮食需求也在不断增加，因此研究和保护稻种遗传资源显得尤为重要。

在云南省，地处南亚热带，气候温暖湿润，适宜稻作生长，是我国重要的稻作区之一。

云南省拥有丰富的稻种资源，具有潜在的遗传优势，是我国稻种资源的重要保护区之一。

由于人为因素和自然环境的影响，云南稻种资源的遗传多样性逐渐丧失，亟需进行种质资源的鉴定和保护工作。

对云南稻核心种质籼稻进行SSR标记鉴定研究，不仅可以为我国稻种资源的保护和利用提供重要的科学依据，还可以为稻种的品质改良和抗逆性提升提供重要参考。

本研究旨在通过对云南稻核心种质籼稻的SSR标记鉴定，揭示其遗传特性和多样性，为我国稻作产业的可持续发展提供科学支持。

1.2 研究目的研究目的：通过对云南稻核心种质籼稻的SSR标记鉴定，旨在探究其遗传多样性和种质鉴定结果，为籼稻的遗传改良和种质资源利用提供科学依据。

具体目的包括：1. 确定云南稻核心种质籼稻的遗传背景和遗传多样性水平，揭示其品种间遗传差异和亲缘关系，为选育优质、高产、抗逆籼稻品种提供遗传资源支持。

云南稻核心种质籼稻SSR标记鉴定云南是中国重要的稻米生产区之一，稻米是云南人民的主要粮食作物之一。

为了提高云南稻米的品质和产量，农业科学家们不断努力，开展了大量的研究工作。

其中一项重要的研究是通过SSR标记鉴定云南稻核心种质的遗传多样性。

SSR标记，全称为简单重复序列标记（Simple Sequence Repeat Marker），是一种常用的分子标记方法，可以用来研究物种的遗传多样性和亲缘关系。

通过SSR标记鉴定云南稻核心种质，可以为云南稻米的选育和优化提供科学依据。

在进行SSR标记鉴定之前，研究人员首先需要收集云南不同稻米品种的种子样本。

这些种子样本来自不同的地理区域，包括不同的山区、平原和丘陵地带。

然后，研究人员将提取这些种子样本的DNA，并利用PCR技术扩增特定的SSR序列片段。

在扩增之后，研究人员将扩增产物进行电泳分析。

通过将扩增产物与DNA分子量标记物一起进行电泳，研究人员可以确定扩增产物的大小。

根据扩增产物的大小，在不同的稻米品种中可以识别出不同的SSR位点。

通过对云南不同稻米品种的SSR位点进行鉴定，研究人员可以得到每个品种的遗传特征。

这些遗传特征包括遗传多样性指数、遗传相似系数和遗传距离等。

遗传多样性指数可以反映云南稻米品种内部的遗传多样性，遗传相似系数可以反映不同云南稻米品种之间的遗传相似程度，遗传距离可以帮助人们判断云南稻米品种之间的亲缘关系。

通过SSR标记鉴定云南稻核心种质的遗传多样性，可以为云南稻米的选育和优化提供重要的科学依据。

通过了解不同品种之间的遗传相似程度和亲缘关系，研究人员可以更好地选择适合云南地区种植的稻米品种，从而提高云南稻米的产量和品质。

SS R 分子标记与水稻杂种优势的相关性研究倪先林1,张涛2,蒋开锋2,杨莉2,杨乾华2,曹应江2,游书梅2,郑家奎1,2*(1.重庆大学生物工程学院,重庆400044;2.四川省农业科学院水稻高粱研究所,四川德阳618000)摘要 [目的]探讨SSR 标记遗传距离与水稻杂种优势的相关性。

[方法]以5个不育系和4个恢复系为材料按5 4NC 方法配制20个杂交组合,选取36对与水稻产量相关的特异性SS R 标记(与QTL 连锁的标记)和124对非特异性SS R 标记(一般标记)对9个供试亲本进行多态性分析,研究SS R 标记遗传距离与水稻杂种优势的关系。

[结果]特异性SS R 标记遗传距离与水稻F 1代各性状优势之间的相关性均不显著,而非特异性SSR 标记遗传距离与株高、千粒重优势呈显著和极显著正相关,与结实率优势呈显著负相关,特异性SS R 标记遗传距离与水稻单株产量优势相关更密切。

[结论]SSR 标记遗传距离与水稻杂种优势有一定的相关性,但相关系数较小,不足以预测水稻的杂种优势。

关键词 特异性标记;非特异性标记;水稻;杂种优势;相关性中图分类号 S511 文献标识码 A 文章编号 0517-6611(2009)23-10913-04Study on the Correlation bet ween SSR M olecu l ar M arkers and R ice Heterosis NI X i an li n et al (Coll ege of B i o l ogical Eng i neer i ng ,Chongqi ng U ni versity ,Chongqi ng 400044)Abstract [Objecti ve]The a m i was to di scuss the corre l ati on bet ween genetic distance o f SS R markers and rice heterosi s .[M et hod]W it h 5m ale sterile li nes and 4restorer lines as testedm ater i a l s ,20hybri dized co mb i nati ons were compounded on the basis o f 5 4NC m et hod .Thirt y si x pa irs of spec i fic SS R m arkers (markers li nked t o QTL)re l ated t o rice y iel d and 124pairs of non s pec ific SS R m arkers (genera l m arkers)w ere selected f o r perfor m i ng pol ymorph i s m ana l ysis on 9tested parents so as to st udy the corre l ati on bet ween gene tic di st ance of SSR m arkers and rice heterosis .[Result]The corre l ati ons bet w een genetic distance of specifi c SSR markers and traits heterosis o f ri ce genera ti on F 1were not si gn ifican.t But t he geneti c d i st ance o f non specifi c SS R markers showed si gnificant and ex tre m ely signifi cant positi ve correl a ti ons w it h t he heterosi s i n p l ant hei ght and 1000 grai n we i gh,t res p .and showed si gnifi cantly negative correlation w it h seed setti ng rate .t he genetic di stance of specifi c SSR makers re l ated to t he he t erosis of rice y iel d per pal ntmo re cl ose l y .[Concl usi on]There was a cert a i n correlati on be t ween t he geneti c di st ance of SSR markers and rice heterosis ,but t heir corre l ati on coe fficientw as too s ma ll t o pred i ct rice heterosis .K ey words Specifi c SS R markers ;N on specifi c SSR markers ;R i ce ;H eterosi s ;Corre l ati on基金项目 农业部跨越计划项目;四川省!十一五∀水稻育种攻关项目;四川天府英才创新团队建设计划资助项目。

SSR标记遗传距离与粳稻杂种优势的相关性分析赵庆勇;朱镇;张亚东;赵凌;陈涛;张巧凤;王才林【期刊名称】《中国水稻科学》【年(卷),期】2009(023)002【摘要】利用SSR分子标记对30个粳稻品种进行遗传多样性分析,继而研究分子标记遗传距离与按照NCⅡ设计获得的200个杂交组合主要产量性状杂种优势的相关性,探讨分子标记遗传距离预测杂种优势的可行性.结果表明,64对SSR引物共检测到185条多态性片段,平均每对引物2.9条,每个SSR位点的多态性信息含量指数(PIC值)变化范围为0.064～0.844,平均为0.380.以SSR标记遗传相似系数为原始数据,按UPGMA聚类方法将30个亲本材料划分为7大类群,分类结果与系谱关系基本相符.分子标记遗传距离与杂种性状平均值的相关除每穗总粒数外均达到显著或极显著水平,与杂种优势的相关均达到极显著水平,相关系数介于-0.361～0.359,说明分子标记可用于水稻杂种优势群的划分和遗传多样性分析,但相关程度还不足以预测产量杂种优势.【总页数】7页(P141-147)【作者】赵庆勇;朱镇;张亚东;赵凌;陈涛;张巧凤;王才林【作者单位】江苏省农业科学院,粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心,江苏,南京210014;南京农业大学,农学院,江苏,南京210095;江苏省农业科学院,粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心,江苏,南京210014;江苏省农业科学院,粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心,江苏,南京210014;江苏省农业科学院,粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心,江苏,南京210014;江苏省农业科学院,粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心,江苏,南京210014;江苏省农业科学院,粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心,江苏,南京210014;江苏省农业科学院,粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心,江苏,南京210014【正文语种】中文【中图分类】Q943;S511.035.1【相关文献】1.SSR分子标记遗传距离预测大豆亲本杂种优势的研究 [J], 杨祥波;刘晓丹;刘广娜2.SSR 标记遗传距离与辣椒杂种优势的关系 [J], 何建文;姜虹;杨红;苏丹;刘永翔3.SSR标记遗传距离与水稻籼粳衍生系杂种优势的相关性分析 [J], 杨旺兴;卓伟;马彬林;邹文广;韦新宇;张受刚;祁建民;许旭明4.SSR标记遗传距离与辣椒杂种优势的关系 [J], 何建文;姜虹;杨红;苏丹;刘永翔5.7个粳稻SSR和SRAP分子标记遗传距离比较及其与产量性状杂种优势的关系[J], 徐美兰;金正勋;李晓光;张忠臣;刘海英;张丰转;赵书宇;张海彬因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。