Omnic软件使用指南1．Omnic与系统Omnic是Nicolet公司的在PC机使用最广泛的窗口软件平台上运行的红外软件，从开始在Windows3.1上运行的版本的1.0到目前的6.1a，现行的的操作系统 Windows98/Me/NT/2000/XP都支持。
EZ-Omnic是简化的软件，一方面价格比较低，同时更加简明，容易掌握，虽然功能比较简单，仍可以满足先当部分用户的需求。
使用的仪器通讯接口有：LTP(并行口)或PCI卡，部分早一些的仪器使用ISA卡。
2．文件结构Omnic 6.0以上版本的缺省的文件分别存在于三个目录中：C:\My Documents\Omnic,在其子目录中分门别类地存放数据与参数等文件，如Spectra存光谱，Param中存设置参数,Quan t存定量方法； C:\Program Files\Omnic,存有驱动与程序文件等,系统的卸载命令在它的子目录Uninstall中；C:\MyDocument\Omnic\Lib,存放谱库，包括购买和自建的谱库。
软件安装的应用程序除了Omnic外还有Bench Diagnostics,这是一个在系统发生故障时进行判断的重要命令，能够检查从接口卡到仪器的各个重要部件。
它们与PDF文件一起置于Thermo Nicolet程序组中，3．启动Omnic软件使用下列方法之一启动Omnic 红外软件系统：1．在Windows98等的桌面上双击（或者）2．从Srart→Program→Thermo Nicolet→Omnic(或者从Srart→Program→Omnic5.0→ ) 3．其他，如Win98中的快捷方式启动。
4．Omnic显示面板：1．Omnic是一种与窗口软件充分兼容的软件，可以显示一个或多个显示窗口，当显示多个窗口时可以选择平铺（Tile）或层叠（Cascade）方式，但其中只有一个是活动窗口（被选中的）。
光谱图可以在窗口间拖动、复制与粘贴，而且可以把复制的光谱图直接粘贴到其他应用程序的文本文件中，为发表文章或书写报告带来方便。
2．在每个显示窗口中，可以显示一个到多个光谱图，最后加入的光谱是自动被选中的，缺省颜色是红色。
有些对光谱进行进一步处理时需要或可以同时处理多个光谱。
需要有多个被选中的光谱时，通过按住Ctrl或Shift键操作鼠标来增减被选中光谱。
3．标题框在光谱窗口的上面，标题内容为人工输入，或根据使用的需要，通过“选项”中所设定的方式中适当选择自动生成。
4．按“信息按钮”或双击“标题框”中的标题，打开“选中”光谱的采集和数据处理记录的窗口，在其中的注释（Comment）等若干框中，可以输入文字信息，这些信息可以随同谱图一起打印，其它的记录为非编辑内容。
5．当显示多个光谱图时，按“标题框”右边的箭头，显示出所有谱图的标题表。
用鼠标击标题表（选中）后，用键盘上的箭头键可以改变被选中的光谱，同时可以编辑被选中的光谱的标题。
按住Ctrl或Shift对标题表或窗口中的光谱点击鼠标左键，可以增加或减少一个或多个被选中的光谱。
6．图标工具是用来定义鼠标功能的：选择，范围，坐标，峰高，峰面积，标注。
7．“取景窗”中显示有完整的光谱图（被选中的），并指明光谱在窗口中的显示范围。
通过鼠标及与的联合使用，可以改变光谱在窗格中光谱的水平方向显示区间，另外Omnic软件还有几种调整显示范围的方法。
8．快捷工具图标的使用使操作更为便捷。
5．数据采集设置从Collect下选Experiment Setup，就打开了它的窗口，从中选择与采集有关的条件和参数。
也可以调用现有的参数组文件(.exp)或保存调整选择好的条件。
1.Collect选项卡中可以选择：扫描次数 Number of Scans分辨率 Resolution光谱格式 Final Format，矫正 Correction，《对H2O, CO2的矫正见附一》文件管理 File Handling背景管理 Background Handling环境干扰补偿 Automatic Atmospheric Suppresion光谱预览Preview Data Collection，在采集光谱之前需要核实或调整样品时选用，这一功能对于显微及某些附件应用时非常有效。
2.Bench选项卡，从中可以检查红外干涉信号强度并包括：增益Gain，调整红外干涉信号强度，一般将Max调到2~8V速度 Velocity，取决于检测器和应用（速度及响应）光阑 Aperture，取决于光谱分辨率、光强的调整（也可以使用衰减屏）光谱范围 Spectral Range，可根据需要变更样品位置 Sample Compartment，对于红外的系统，在指定它后，一系列其它参数均可由软件自动配套完成设置。
3.Quality选项卡，通过适当设定需要检查的各个因素及其程度等，系统在采集过程中即时指示并记录相关因素的状态，用于保证光谱质量。
使用时注意，因素及其（量化）程度选择必须适当，否则软件不能提供正确的提示。
Use Spectral Quality Checks 决定是否使用此项功能。
4.Advanced选项卡中的参数选择中：Zero Filling 用以改善谱图曲线的连续性。
Apodization 变迹(切趾)函数，在分辨率与信躁比之间权衡。
其中Boxcar应用于高分辨率，Blackman-Harris应用于高信躁比，而Happ-Genzel最常用，它兼顾了信躁比和分辨率。
Sample Spacing 采样间隔，1自15798CM-1始，2自7899CM-1始，4从3949 CM-1始记录光谱数据。
Phase Correction 相位矫正。
Low (High) Pass Filter 低(高)通滤波器转折频率。
……5.Diagnostic选项卡：电源, 氦氖激光器, 红外光源, 电子部件, 分束片与检测器。
上面五个是诊断图标，被点击时显示出相应信息，但没有Bench Diagnostic中给出的充分，其中的“√”和“╳”分别指示正常和不正常。
a)当View reference detector 被选时，窗口中的红外干涉图就被参考检测器的干涉信号取代，其强度一般在1~2V以上。
此信号用于干涉图峰位控制、Nexus中的湿度检查和IR检测器的故障判断。
b)Align, 对干涉仪进行自动准直，将仪器调整并保持运行在最佳状态。
需人工调整干涉仪的系统，如G系列和大部分I mpact，没有此项功能。
c)Reset Bench, 光学台重置（复位）。
d)Verify Smart Accessory, 有E.S.P.功能的系统中，对智能附件进行确认（识别）。
e)Configure Bench, 光学台系统设置，输入光源、分束器、检测器和与计算机通讯的地址参数等。
对有E.S.P.功能的系统软件会自动设置，一般不需要人为调整，除非有特殊用户元件。
f)Check Desiccant, 干燥状态检查 (Nexus 系列) 。
根据结果，决定干燥剂需要更换与否。
在Omnic软件中（不含EZ），使用Match Spectrum Setting，按选定光谱图的实验条件设置有关数据采集的所有参数，确保光谱的可比性。
Spectral Quality Reference用来评价仪器状态。
6．背景与样品数据文件的采集根据上面的顺序，用Collect Background和Collect Sample的指令进行数据采集。
在背景管理Background Handling中选择前两项之一时，背景要按照所提示的顺序采集。
选择第三项时，后面输入的数值就是设定的背景有效使用分钟数，到时候软件会提示需要重新采集背景。
七．显示、打印与存盘1．选择光谱：采集好的光谱可以以重叠(Overlay)或分层(Stack)的方式显示到指定的窗格中。
最后加入或被点击的光谱图是红色，即“选中的”。
2．显示范围（坐标）：其大小可以通过a) Display Limits输入数值，b) 拖动鼠标，c) 取景窗(X轴)，d)View 菜单中 Full, Common, Match，Offset-Scale(Y轴)，e) Roll/Zoom Window 工具等等来调整。
3．使用Find Peaks 或标峰位置，用“图标工具”进行峰高、峰面积测量与标注等等操作。
4．通过打开(Open)、剪切(Cut)、删除(Clear)、拷贝(Copy)、粘贴(Paste)、保存光谱图(Save, Save As)和保存光谱图组(Save Group)进行文件管理。
5．显示设置 (Display Setup)：a) 显示项目，b)注释方式及项目，c) X轴格式，是否对低波数范围扩展或者以波长为单位，d)分层(Stack)显示光谱的个数，e) 所要显示有关采样信息的选项。
6．打印： a) 按照显示直接打印，b) 按照报告模板(Report Template)打印。
显示与打印的有关系统设置在Edit→Option中选择。
八．数据的分析处理1．转换：透过(Transmittance)与吸收(Absorbance)之间的转换。
Other Conversions 其它转换，包括漫反射、光声光谱、反射率的对数和X轴的波数/波长转换。
2．数据处理Reprocess再处理，须存有干涉图、单光束光谱图。
Baseline Correct/Automatic ~基线校正/自动基线校正：基线校正须对吸收图操作，自动基线校正对于基线不是简单倾斜的图的校正结果较差。
Other Corrections其它校正，包括：K-K、ATR.、H2O和CO2校正。
Blank/Straight Line使空白/直线生成Subtract 差谱Fourier Self-Deconvolution自去卷积，以改善峰重叠Smooth/Automatic ~平滑/自动平滑，以压缩噪声，但分辨率会有不同程度下降Change Data Spacing改变数据点的间隔，用以不同分辨率间的比较和处理Derivative导数光谱Spectral Math数学运算Multiply乘(某一系数)Add相加(两个光谱)Normalize Frequency频率标准化Normalize Scale Y坐标标准化3．Analyze 分析Find Peaks峰查找，点击鼠标设定阈值，灵敏度则与标峰多少有关。
Noise噪声水平测量Average平均值测量Statistical Spectra统计光谱，取得多个光谱的平均值与偏差Library Setup谱库设置，选择谱库路径/谱库，建立谱库组，选择检索类型、内容、定义光谱检索范围、结果保留及显示的个数。
