长江中上游圆筒吻鮈群体线粒体Cytb遗传多样性分析

长江中上游圆筒吻鮈群体线粒体Cyt b遗传多样性分析蒲艳;田辉伍;陈大庆;段辛斌;刘绍平;汪登强【摘要】为探明大坝建设及过度捕捞等可能会对圆筒吻鮈资源造成的影响,采用线粒体DNA Cyt b基因序列对长江中上游宜宾、泸州、合江、江津、巴南、涪陵和黄冈7个圆筒吻鮈(Rhinogobio cylindricus)群体进行研究,分析其遗传多样性及遗传结构.结果表明:在获得的998 bp序列长度中检测到14个变异位点,140尾样本定义15个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)和平均核苷酸多样性(Pi)分别为0.625、0.00077,说明圆筒吻鮈种群遗传多样性较贫乏.分子变异方差分析(AMOVA)表明圆筒吻鮈地理群体间未出现显著遗传分化.单倍型Network网络分析呈星型结构,邻接系统发育(NJ)树显示单倍型没有出现高支持率的分支,表明群体内部没有发生遗传分化.中性检验、错配分布及BSP分析均表明圆筒吻鮈发生历史种群扩张事件,种群扩张发生在0.06 Ma(百万年前).综上表明,圆筒吻鮈的群体遗传多样性较低,群体间遗传分化不显著,建议将圆筒吻鮈群体作为一个整体就地保护,并在今后应加强长期监测.【期刊名称】《淡水渔业》【年(卷),期】2019(049)001【总页数】6页(P14-19)【关键词】圆筒吻鮈(Rhinogobio cylindricus);线粒体Cytb;遗传多样性;长江中上游【作者】蒲艳;田辉伍;陈大庆;段辛斌;刘绍平;汪登强【作者单位】西南大学生命科学学院, 重庆400715;中国水产科学研究院长江水产研究所, 农业部长江中上游渔业资源环境科学观测实验站, 武汉430223;中国水产科学研究院长江水产研究所, 农业部长江中上游渔业资源环境科学观测实验站, 武汉430223;中国水产科学研究院长江水产研究所, 农业部长江中上游渔业资源环境科学观测实验站, 武汉430223;中国水产科学研究院长江水产研究所, 农业部长江中上游渔业资源环境科学观测实验站, 武汉430223;中国水产科学研究院长江水产研究所, 农业部长江中上游渔业资源环境科学观测实验站, 武汉430223;中国水产科学研究院长江水产研究所, 农业部长江中上游渔业资源环境科学观测实验站, 武汉430223【正文语种】中文【中图分类】S917.4圆筒吻鮈(Rhinogobio cylindricus)，隶属于鲤形目(Cypriniformes)鲤科(Cyprinidae)鮈亚科(Gobioninae)吻鮈属(Rhinogobio)，主要分布在长江上游干流及其支流(如岷江、金沙江、嘉陵江等)[1-2]，近年有研究表明在长江中游也有分布[3]，是长江主要经济鱼类 [4]。

长江、高邮湖、太湖日本沼虾遗传多样性的RAPD分析朱银安;单红;王庆;周国勤【期刊名称】《水产养殖》【年(卷),期】2008(29)1【摘要】采用随机扩增多态性DNA (RAPD)技术对取自长江、高邮湖、太湖3个野生群体的日本沼虾共51个个体的遗传多样性进行分析.10个随机引物共检测出54个位点(200-2500bp),长江、高邮湖、太湖各群体的多态位点比例分别为72.22%、53.70%、62.96%,基因多样性指数分别为0.2878、0.2380、0.2635.群体遗传多样性的Shannon信息指数分析表明,日本沼虾3个野生群体种质资源状况良好,遗传多样性水平较高.【总页数】3页(P5-7)【作者】朱银安;单红;王庆;周国勤【作者单位】南京市水产科学研究所,江苏,南京,210036;南京市水产科学研究所,江苏,南京,210036;南京市水产科学研究所,江苏,南京,210036;南京市水产科学研究所,江苏,南京,210036【正文语种】中文【中图分类】S917【相关文献】1.RAPD分析野生和养殖太湖秀丽白虾的遗传多样性 [J], 张敏莹;刘焕章;徐东坡;刘凯;段金荣;施炜纲2.基于线粒体Cytb基因和D-loop区序列的高邮湖湖鲚(Coilia nasus)遗传多样性分析 [J], 李大命;张彤晴;关浩勇;唐晟凯;刘燕山;刘小维;潘建林3.日本沼虾太湖群体和鄱阳湖群体杂交F1生长性能比较研究 [J], 李瀚声;冯建彬;谢楠;冯晓宇;李应森;李家乐4.洪泽湖日本沼虾9个野生群体遗传多样性微卫星分析 [J], 冯建彬;吴春林;丁怀宇;华雪铭;李应森;李家乐5.太湖日本沼虾的遗传多样性分析 [J], 吴滟;傅洪拓;李家乐;龚永生;李明爽因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

基于线粒体Cytb基因的江淮下游6个湖泊翘嘴鲌群体遗传多样性分析李大命;杨子萍;刘燕山;唐晟凯;谷先坤;殷稼雯【期刊名称】《江苏农业科学》【年(卷),期】2024(52)3【摘要】以线粒体Cytb基因作为分子标记对长江、淮河下游6个湖泊翘嘴鲌群体共262尾个体的遗传多样性、遗传分化及历史动态进行分析。

结果显示,翘嘴鲌Cytb基因序列全长为1141 bp,碱基A+T的含量(55.9%)高于G+C含量(44.1%)。

262条Cytb基因序列检出42个变异位点,定义46个单倍型,总群体单倍型和核苷酸多样性分别为0.916±0.010和0.00256±0.00008;6个群体的单倍型多样性为(0.798±0.059)~(0.927±0.019),核苷酸多样性为(0.00204±0.00027)~(0.00285±0.00018),表明翘嘴鲌遗传多样性属于高Hd和低Pi模式。

基于单倍型构建的系统发育树和进化网络图显示,6个群体的单倍型未形成明显的地理格局。

分子方差分析(AMOVA)显示,遗传变异主要来自于群体内部(91.64%),群体间遗传分化系数(F_(st))为0.08362(P<0.01);6个群体间的F_(st)为-0.00427~0.15529,其中,长江群体和淮河群体间均具有显著中度或高度遗传分化(P<0.05)。

中性检验结果显示,Tajima’s D和Fu’s F_(s)均为负值(P<0.05),核苷酸不配对分布曲线呈现单峰型,表明翘嘴鲌群体在历史上经历过显著的种群扩张。

整体来看,江淮下游湖泊的翘嘴鲌野生种质资源遗传多样性较低,长江水系群体和淮河水系群体间有显著的遗传分化,应采取措施恢复翘嘴鲌资源量及提高其遗传多样性,并将长江流域和淮河流域湖泊群体划分为不同的管理单元进行保护。

【总页数】8页(P213-220)【作者】李大命;杨子萍;刘燕山;唐晟凯;谷先坤;殷稼雯【作者单位】江苏省淡水水产研究所/江苏省内陆水域渔业资源重点实验室;南京师范大学海洋科学与工程学院【正文语种】中文【中图分类】S917【相关文献】1.基于线粒体D-loop基因的珠江翘嘴鲌遗传多样性与遗传分化研究2.基于COI 基因分析长江下游典型水域翘嘴鲌的遗传多样性3.基于线粒体COⅡ基因序列的长江下游翘嘴鲌群体遗传多样性分析4.基于线粒体COI序列的江淮下游湖泊鲢群体遗传多样性和遗传结构分析5.基于线粒体Cyt b基因的洪泽湖翘嘴鲌群体遗传多样性分析因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

8种鲤养殖品种线粒体Cyt b基因的遗传多样性和系统进化分析肖同乾;鲁翠云;李超;张明昭;顾颖;孙效文【摘要】对8种鲤养殖品种的线粒体Cyt b基因部分序列进行测定,并比较分析其遗传多样性和系统进化关系,结果获得425 bp的Cyt b序列,其中T、C、A、G的平均含量分别为26.8％、29.0％、29.7％、14.5％,A+T含量(56.5％)高于G+C 含量(43.5％),翻译为141个氨基酸,其中突变多数存在于缬氨酸和异亮氨酸之间(两个氨基酸都为不带电荷的疏水性氨基酸),其变异不影响Cyt b的功能,说明该蛋白是一个进化缓慢的蛋白,适合用于遗传进化分析.140个个体中共检测到4个单倍型,其中75.5％的个体属于单倍型Hap 2,而单倍型Hap1主要分布在3种表现型为镜鲤的品种.AMOVA分析结果和利用Kimura 2-parameter模型分析的系统发育关系结果表明,德国镜鲤、散磷镜鲤和松浦红镜鲤亲缘关系较近,而蓝鳞鲤、荷包红鲤抗寒品系和高寒鲤亲缘关系较近.【期刊名称】《水产学报》【年(卷),期】2013(037)003【总页数】7页(P344-350)【关键词】鲤;遗传多样性;细胞色素b【作者】肖同乾;鲁翠云;李超;张明昭;顾颖;孙效文【作者单位】中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江哈尔滨150070;大连海洋大学水产与生命学院,辽宁大连 116023;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江哈尔滨150070;上海海洋大学水产与生命学院,上海201306;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江哈尔滨150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江哈尔滨150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江哈尔滨150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江哈尔滨150070【正文语种】中文【中图分类】Q343.3+5;S917.4鲤(Cyprinus carpio)，隶属于硬骨鱼纲(Osteichthyes)，鲤形目(Cypriniformes)，鲤科(Cyprinidae)，鲤属(Cyprinus)，养殖历史悠久，是我国养殖范围最广泛的淡水经济鱼类之一［1－2］。