生物化学与分子生物学资源库

生物化学专业学习资料汇总生物化学是研究生物体内化学成分、结构和功能的科学，是生物学和化学的交叉学科。

学习生物化学需要掌握一定的理论知识和实验技能，以便更好地理解和解释生物体内的化学过程。

在这篇文章中，我们将汇总一些生物化学专业学习资料，帮助学生更好地学习和掌握这门学科。

一、教材和参考书籍1. "生物化学"（第四版）- Albert L. Lehninger、Michael M. Cox、David L. Nelson著这本教材是生物化学领域的经典教材，内容详尽全面，适合初学者入门。

它涵盖了生物化学的基本概念、分子结构、酶学、代谢途径等内容。

2. "生物化学"（第七版）- Jeremy M. Berg、John L. Tymoczko、Lubert Stryer著这本教材是另一本经典的生物化学教材，与前一本教材相比，它在内容组织和解释上有所不同，适合作为辅助教材来阅读。

3. "生物化学导论"（第八版）- William H. Elliott、Daphne C. Elliott、Carlos A. Gómez著这本教材对生物化学的基本概念和原理进行了简明扼要的介绍，适合初学者快速入门。

4. "生物化学原理"（第五版）- Horton、Robert K.、Moran、Laurence A.、Scrimgeour、K. Gray著这本教材以生物化学的基本原理为主线，介绍了生物化学的核心知识和实验技术。

二、期刊和论文1. "Journal of Biological Chemistry"这是一本专门发表生物化学领域研究成果的期刊，涵盖了生物化学的各个方面，是了解最新研究进展的重要来源。

2. "Biochemistry"这是另一本重要的生物化学期刊，发表了许多有关生物分子结构、酶学、代谢途径等方面的研究论文。

中文名: 植物生物化学与分子生物学(中文版)原名: Plant Biochemistry and Molecular Biology资源格式: PDF发行时间: 2004年地区: 大陆语言: 简体中文简介:作者：(美)B.B.布坎南(BobB.Buchanan)出版社：科学出版社出版日期：2004年2月版次：ISBN：703012013 页数：1090开本：大16开包装：价格：￥260.0本书简介本书英文版由国际杰出植物生物学家编写，美国植物生物学家学会出版，是植物生物学领域的重要著作。

在整合前沿知识的基础上，本书围绕细胞区室结构、细胞的繁衍、能量流、代谢与发育的整合、植物的环境与农业5个主题精心组织内容，反映了各个领域的研究历史和最新进展。

本书编排有序，图文并茂，适用于植物生物学以及分子生物学、生物技术、生物化学、细胞生物学、生理学、生态学等相关领域的研究和教学参考。

制药学、农业经济等领域的研究人员也可从中得到有价值的信息。

目录:第1篇区室结构1 膜结构和被膜细胞器导言1.1 细胞膜的共性和遗传性1.2 膜的流动镶嵌模型1.3 质膜1.4 内质网1.5 高尔基体1.6 胞吐和内吞1.7 液泡1.8 细胞核1.9 过氧化物酶体1.10 质体1.11 线粒体小结相关文献2 细胞壁导言2.1 糖：组成细胞壁的基本单位2.2 组成细胞壁的大分子2.3 细胞壁构架2.4 细胞壁的生物合成和装配2.5 生长与细胞壁2.6 细胞分化2.7 可用作食物、饲料和纤维的细胞壁小结相关文献3 膜转运导言3.1 膜运输概述3.2 植物膜上运输的组织构成3.3 泵3.4 载体蛋白3.5 离子通道的一般特性3.6 运转中的离子通道3.7 通过水通道蛋白运输水小结相关文献4 蛋白质分选和囊泡运输导言4.1 蛋白质分选的机制4.2 将蛋白质定位到质体中4.3 转运进入线粒体和过氧化物酶体4.4 细胞核的内向和外向转运4.5 内质网在蛋白质分选和组装中的作用4.6 液泡定位和分泌4.7 高尔基体中的蛋白质修饰4.8 内吞作用小结相关文献5 细胞骨架导言5.1 细胞骨架概述5.2 中间纤维5.3 肌动蛋白与微管蛋白家族5.4 肌动蛋白与微管蛋白的聚合5.5 肌动蛋白与微管蛋白的特性5.6 细胞骨架结合蛋白5.7 肌动蛋白纤维在胞内定向运动中的作用5.8 皮层微管与细胞扩展5.9 观察细胞骨架的动力学5.10 细胞骨架与信号转导5.11 细胞骨架与有丝分裂5.12 细胞骨架与胞质分裂小结相关文献第2篇细胞的繁衍6 核酸导言6.1 核酸的组成与核苷酸的合成6.2 细胞核DNA的复制6.3 DNA修复6.4 DNA重组6.5 细胞器DNA6.6 DNA转录6.7 RNA的特征和功能6.8 RNA加工小结相关文献7 基因组的组织结构与表达导言7.1 基因与染色体7.2 核基因组的组织结构7.3 转座因子7.4 基因表达7.5 染色质在染色体组织和基因表达中的作用7.6 基因调控的后生遗传机制小结相关文献8 氨基酸导言8.1 植物体内氨基酸的生物合成：研究现状与前景8.2 无机氮同化进N-转运氨基酸8.3 芳香族氨基酸的合成8.4 天冬氨酸衍生氨基酸的生物合成8.5 支链氨基酸8.6 脯氨酸代谢：耐胁迫代谢工程的靶标小结相关文献9 蛋白质的合成、装配和降解导言9.1 从RNA到蛋白质9.2 真核生物细胞质蛋白质生物合成的调控9.3 叶绿体中蛋白质的合成9.4 蛋白质的翻译后修饰9.5 蛋白质降解相关文献10 脂类导言10.1 脂类的结构与功能10.2 脂肪酸的生物合成10.3 乙酰辅酶A羧化酶10.4 脂肪酸合酶10.5 C16 和C18 脂肪酸的去饱和及其延长10.6 特殊脂肪酸的合成10.7 膜脂的合成10.8 膜脂的功能10.9 结构脂类的合成与功能10.10 贮藏性脂类的合成与分解代谢10.11 脂类的基因工程小结相关文献11 细胞分裂的调控导言11.1 动植物细胞及其细胞周期11.2 细胞周期研究的历史回顾11.3 DNA复制11.4 有丝分裂11.5 细胞周期的调控机制11.6 细胞周期的调控逻辑11.7 多细胞生物的细胞周期调控11.8 植物生长发育中的细胞周期调控小结相关文献第3篇能量流12 光合作用导言12.1 光合作用总论12.2 光吸收与能量转换12.3 反应中心复合体12.4 光系统12.5 类囊体膜的组成12.6 叶绿体膜的电子转移途径12.7 叶绿体中的A TP合成12.8 C3植物中的碳反应12.9 CO2固定机制的差异小结相关文献13 糖代谢13.1 磷酸己糖库13.2 利用磷酸己糖的生物合成途径：蔗糖和淀粉的合成13.3 产生磷酸己糖的分解代谢途径：蔗糖和淀粉的降解13.4 磷酸丙糖/磷酸戊糖代谢产物库13.5 磷酸己糖和磷酸戊糖/磷酸丙糖代谢产物库之间的相互作用13.6 淀粉与蔗糖合成：细胞对代谢总调控的范例13.7 糖类对基因表达的调控13.8 糖酵解中的贮能反应13.9 为生物合成反应提供能量和还原力小结相关文献14 呼吸与光呼吸导言14.1 呼吸概论14.2 柠檬酸(三羧酸)循环14.3 植物线粒体的电子传递14.4 植物线粒体的ATP合成14.5 线粒体呼吸作用的调节14.6 线粒体与细胞其他区域的相互关系14.7 光呼吸的生化基础14.8 光呼吸途径14.9 植物中光呼吸的规律小结相关文献第4篇代谢与发育的整合15 长距离运输导言15.1 植物体内物质的扩散与径流15.2 通道大小在确定质外体和共质体运输特征中有重要作用15.3 木质部和韧皮部物质运输的比较15.4 木质部中水分的蒸腾运动15.5 胞间连丝介导的共质体运输15.6 韧皮部运输15.7 植物内源大分子的细胞间运输小结相关文献16 氮和硫导言16.1 生物圈和植物中氮素概况16.2 固氮概论16.3 氮固定中的酶学16.4 共生固氮16.5 氨的吸收和运输16.6 硝酸盐的吸收和还原概述16.7 硝酸盐的还原16.8 亚硝酸盐的还原16.9 硝酸盐同化和碳代谢间的相互作用16.10 硫酸盐同化概述16.11 硫的化学性质及功能16.12 硫的吸收及运输16.13 还原硫的同化途径16.14 谷胱甘肽及其衍生物的合成及功能小结相关文献17 植物激素与诱激物分子的生物合成导言17.1 赤霉素17.2 脱落酸17.3 细胞分裂素17.4 吲哚-3-乙酸17.5 乙烯17.6 油菜素类固醇17.7 多胺17.8 茉莉酮酸17.9 水杨酸17.10 展望小结相关文献18 信号感受和转导导言18.1 信号转导概述18.2 受体18.3 植物受体的特殊例子18.4 G蛋白和磷脂信号系统18.5 环状核苷酸18.6 钙18.7 蛋白激酶：信号转导中的基本组分18.8 植物生长调节因子参与特殊的信号转导途径18.9 植物细胞信号转导研究的展望小结相关文献19 生殖发育导言19.1 开花诱导19.2 花的发育19.3 花发育的遗传和分子分析19.4 配子的形成19.5 影响配子体发育的突变19.6 花粉的萌发19.7 自交不亲和19.8 受精作用19.9 种子形成19.10 种子发育过程中贮藏物质的积累19.11 胚胎的成熟和脱水19.12 萌发小结相关文献20 衰老与程序性细胞死亡导言20.1 动物及植物中观察到的细胞死亡的类型20.2 植物生活周期中的PCD20.3 衰老概述20.4 衰老过程中的色素代谢20.5 衰老过程中的蛋白质代谢20.6 衰老对光合作用的影响20.7 衰老对氧化代谢的影响20.8 衰老过程中的核酸降解20.9 衰老细胞中代谢活性的调节20.10 内源植物生长调节因子与衰老20.11 环境对衰老的影响20.12 植物发育性PCD的例子：管状分子的形成和禾本科植物内胚乳的转移20.13 PCD作为植物胁迫应答的例子：通气组织的形成和超敏反应20.14 PCD研究的未来方向以及面临的更多问题小结相关文献第5篇植物的环境与农业21 植物对病原体的反应导言21.1 植物病原体的致病机理21.2 植物防御系统21.3 植物－病原体相互作用的遗传基础21.4 R基因与R基因介导的植物抗病性21.5 植物防御反应的生化原理21.6 系统性植物防御反应21.7 利用基因工程控制植物病原体小结相关文献22 植物对非生物胁迫的反应导言22.1 植物对非生物胁迫的反应22.2 与缺水相关的胁迫22.3 渗透调节及其在耐旱耐盐中的作用22.4 缺水和盐分对跨膜转运的影响22.5 水分胁迫诱导的其他基因22.6 冰冻胁迫22.7 水涝和缺氧22.8 氧化胁迫22.9 热胁迫小结相关文献23 矿质营养吸收、转运及利用的分子生理学导言23.1 必需矿质元素概论23.2 植物K+转运机制与调节23.3 磷的营养与转运23.4 微量营养吸收的分子生理学23.5 植物对矿质毒性的反应小结相关文献24 天然产物(次生代谢物)导言24.1 萜类化合物24.2 IPP的生物合成24.3 异戊烯转移酶与萜类合酶参与的反应24.4 萜类化合物骨架的修饰24.5 转基因萜类产物24.6 生物碱24.7 生物碱的生物合成24.8 生物技术在生物碱生物合成研究中的应用24.9 苯丙烷类化合物和苯丙烷类－乙酸酯途径的代谢产物24.10 苯丙烷类化合物和苯丙烷类－乙酸酯的生物合成24.11 木脂体、木质素的生物合成和栓化作用24.12 黄酮类化合物24.13 香豆素、芪、苯乙烯吡喃酮和芳基吡喃酮类化合物24.14 苯丙烷类产物的代谢工程：改善纤维、色素、药物和调味剂的可能途径小结相关文献索引。

美国国家生物技术信息中心(National Center of Biotechnology Information)唐志立它的使命包括四项任务：1. 建立关于分子生物学，生物化学，和遗传学知识的存储和分析的自动系统2. 实行关于用于分析生物学重要分子和复合物的结构和功能的基于计算机的信息处理的，先进方法的研究3. 加速生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。

山东师范大学2016年4月10日星期日30则留学生经典笑话，英语不好伤不起！凭你在国内口语练得多么娴熟，去了国外，照样有犯痴呆傻的时候！1、有次房东问我：did u eat anyting yet? 我说：no.她听后重复了一遍：so u didn’t eat anyting. 我说：yes.房东老太太犹豫了下又问：did u eat? 我说：no.她接着说：so u didn’t eat. 我说：yes. 估计她当时要崩溃了……2、刚上班不久，有个公司的A/R打电话来催支票，我循例问了一下他是哪间公司打来的，那男的很有礼貌的说：This is xxx calling from Beach Brother.听懂了很开心，不过由于对公司名字还不熟，心想先用笔记下来公司名，省得等下忘记了，正得意忘形之间，顺嘴开始拼写人家公司的名字，还说得一本正经：b.i.t.c.h.bitch, correct? 那男的终于还是没能忍住怒火，近似于怒吼似的对我喊道：NO!B.E.A.C.H.BEACH! 接下来的一年里，没再跟这间公司有过任何生意往来……3、我男朋友以前在温哥华乘skytrain 的时候，一个白人女人说：I am sorry. 他直接说：you are welcome. 对方都呆了。

4、第一次跟老外去打painball，玩的是抢旗的那种。

由于第一次玩，一直跟着个看起来很专业的队友跑，一路上躲着子弹跑到对方的base. 我们人都挂了，对方就剩一个人在看老家，就听那老外跟我说了一大堆术语，我也没听懂。

生物信息学网站分子生物学数据库综合目录1. SRS序列查询系统(分子生物学数据库网络浏览器) http://www.embl-heidelberg.ed/srs5/2. 分子生物学数据库及服务器概览/people/pkarp/mimbd/rsmith.html3. BioMedNet图书馆4. DBGET数据库链接http://www.genome.ad.jp/dbget/dbget.links.html5. 哈佛基因组研究数据库与精选服务器6. 约翰. 霍普金斯大学(Johns Hopkins University) OWL网络服器/Dan/proteins/owl.html7. 生物网络服务器索引，USCS /network/science/biology/index.html8. 分子生物学数据库列表(LiMB) gopher:///11/molbio/other9. 病毒学的WWW服务器，UW-Madison /Welcome.html10. UK MRC 人类基组图谱计划研究中心/11. 生物学家和生物化学家的WWW资源http://www.yk.rim.pr.jp/~aisoai/index.html12. 其他生物网络服务器的链接/biolinks.html13. 分子模型服务器与数据库/lap/rsccom/dab/ind006links.html14. EMBO实际结构数据库http://xray.bmc.uu.se/embo/structdb/links.html15. 蛋白质科学家的网络资源/protein/ProSciDocs/WWWResources.html16. ExPASy分子生物学服务器http://expasy.hcuge.ch/cgi-bin/listdoc17. 抗体研究网页18. 生物信息网址http://biochem.kaist.ac.kr/bioinformatics.html19. 乔治.梅森大学(George Mason University)的生物信息学与计算分子生物学专业/~michaels/Bioinformatics/20. INFOBIOGEN数据库目录biogen.fr/services/dbcat/21. 国家生物技术信息研究室/data/data.html22. 人类基因组计划情报/TechResources/Human_Genome23. 生物学软件及数据库档案/Dan/software/biol-links.html24. 蛋白质组研究：功能基因组学的新前沿(著作目录) http://expasy.hcuge.ch/ch2d/LivreTOC.html序列与结构数据库一．主要的公共序列数据库1. EMBL WWW服务器http://www.EMBL-heidelberg.ed/Services/index.html2. Genbank 数据库查询形式(得到Genbank的一个记录) /genbank/query_form.html3. 蛋白质结构数据库WWW服务器(得到一PDB结构) 4. 欧洲生物信息学研究中心(EBI) /5. EBI产业支持/6. SWISS-PROT(蛋白质序列库) http://www.expasy.ch/sprot/sprot-top.html7. 大分子结构数据库/cgi-bin/membersl/shwtoc.pl?J:mms8. Molecules R Us(搜索及观察一蛋白质分子) /modeling/net_services.html9. PIR国际蛋白质序列数据库/Dan/proteins/pir.html10. SCOP(蛋白质的结构分类)，MRC /scop/data/scop.l.html11. 洛斯阿拉莫斯的HIV分子免疫数据库/immuno/index.html12. TIGR数据库/tdb/tdb.html13. NCBI WWW Entrez浏览器/Entrez/index.html14. 剑桥结构数据库(小分子有机的及有机金属的结晶结构) 15. 基因本体论坛/GO/二. 专业数据库1. ANU生物信息学超媒体服务(病毒数据库、分类及病毒的命名法) .au/2. O-GL YCBASE(O联糖基化蛋白质的修订数据库) http://www.cbs.dtu.dk/OGLYCBASE/cbsoglycbase.html3. 基因组序列数据序(GSDB)(已注释的DNA序列的关系数据序) 4. EBI蛋白质拓扑图/tops/Serverintermed.html5. 酶及新陈代谢途径数据库(EMP) /6. 大肠杆菌数据库收集(ECDC)(大肠杆菌K12的DNA序列汇编) http://susi.bio.uni-giessen.de/ecdc.html7. EcoCyc(大肠杆菌基因及其新陈代谢的百科全书) /ecocyc/ecocyc.html8. Eddy实验室的snoRNA数据库/snoRNAdb/9. GenproEc(大肠杆菌基因及蛋白质) /html/ecoli.html10. NRSub(枯草芽胞杆菌的非冗余数据库) http://pbil.univ-lyonl.fr/nrsub/nrsub.html11. YPD(酿酒酵母蛋白质) /YPDhome.html12. 酵母基因组数据库/Saccharomyces/13. LISTA、LISTA-HOP及LISTA-HON(酵母同源数据库汇编) /14. MPDB(分子探针数据库) http://www.biotech.est.unige.it/interlab/mpdb.html15. tRNA序列及tRNA基因序列汇编http://www.uni-bayreuth.de/departments/biochemie/trna/index/html16. 贝勒医学院(Baylor College of Medicine)的小RNA数据库/dbs/SRPDB/SRPDB.html17. SRPDB(信号识别粒子数据库) /dbs/SRPDB/SRPDB.html18. RDP(核糖体数据库计划) /19. 小核糖体亚蛋白RNA结构http://rrna.uia.ac.be/ssu/index.html20. 大核糖体亚蛋白RNA结构http://rrna.uia.ac.be/lsu/index.html21. RNA修饰数据库/RNAmods/22. 16SMDB及23SMDB(16S和23S核糖体RNA突变数据库)/Departments/Biology/Databases/RNA.html23. SWISS-2DPAGE(二维凝胶电泳数据库) http://expasy.hcuge.ch/ch2d/ch2d-top.html24. PRINTS /bsm/dbbrowser/PRINTS/PRINTS.html25. KabatMan(抗体结构及序列信息数据库) /abs26. ALIGN(蛋白质序列比对一览) /bsm/dbbrowser/ALIGN/ALIGN.html27. CATH(蛋白质结构分类系统) /bsm/cath28. ProDom(蛋白质域数据库) http://protein.toulouse.inra.fr/29. Blocks数据库(蛋白质分类系统) /30. HSSP(按同源性导出的蛋白质二级结构数据库) http://www.sander.embl-heidelberg.de/hssp/31. FSSP(基于结构比对的蛋白质折叠分类) /dali/fssp/fssp.html32. SBASE蛋白质域(已注释的蛋白质序列片断) http://www.icgeb.trieste.it/~sbasessrv/33. TransTerm(翻译控制信号数据库) /Transterm.html34. GRBase(参与基因调控的蛋白质的相关信息数据库) /~regulate/trevgrb.html35. REBASE(限制性内切酶和甲基化酶数据库) /rebase/36. RNaseP数据库/RNaseP/home.html37. REGULONDB(大肠杆菌转录调控数据库) http://www.cifn.unam.mx/Computational_Biology/regulondb/38. TRANSFAC(转录因子及其DNA结合位点数据库) http://transfac.gbf.de/39. MHCPEP(MHC结合肽数据库) .au/mhcpep/40. ATCC(美国菌种保藏中心) /41. 高度保守的核蛋白序列的组蛋白序列数据库/Baxevani/HISTONES42. 3Dee(蛋白质结构域定义数据库) /servers/3Dee.html43. InterPro(蛋白质域以及功能位点的完整资源) /interpro/序列相似性搜索1. EBI序列相似性研究网页/searches/searches.html2. NCBI: BLAST注释/BLAST3. EMBL的BLITZ ULTRA快速搜索/searches/blitz_input.html4. EMBL WWW服务器http://www.embl-heidelberg.de/Services/index.html#55. 蛋白质或核苷酸的模式浏览/compbio/PatScan/HTML/patscan.html6. MEME(蛋白质超二级结构模体发现与研究) /meme/website7. CoreSearch(DNA序列保守元件的识别) http://www.gsf.de/biodv/coresearch.html8. PRINTS/PROSIT浏览(搜索motif数据库) /cgi-bin/attwood/SearchprintsForm.pl9. 苏黎世ETH服务器的DARWIN系统http://cbrg.inf.ethz.ch/10. 利用动态规划找出序列相似性的Pima IIhttp://bmerc-www.bu.ede/protein-seq/pimaII-new.html11. 利用与模式库进行哈希码(hashcode)比较找到序列相似性的DashPat /protein-seq/dashPat-new.html12. PROPSEARCH(基于氨基酸组成的搜索) http://www.embl-heidelberg.de/aaa.html13. 序列搜索协议(集成模式搜索) /bsm/dbbrowser/protocol.html14. ProtoMap(SEISS-PROT中所有蛋白质的自动层次分类) http://www.protomap.cs.huji.ac.il/15. GenQuest(利用Fasta、Blast、Smith-Waterman方法在任意数据库中搜索) http://www.gdb.rog/Dan/gq/gq.form.html16. SSearch(对特定数据库的搜索) http://watson.genes.nig.ac.jp/homology/ssearch-e_help.html17. Peer Bork搜索列表(motif/模式序列谱搜索) http://www.embl-heidelberg.de/~bork/pattern.html18. PROSITE数据库搜索(搜索序列的功能位点) /searches/prosite.html19. PROWL(Skirball研究中心的蛋白质信息检索) /index.html序列和结构的两两比对1. 蛋白质两两比对(SIM) http://expasy.hcuge.ch/sprot/sim-prot.html2. LALNVIEW比对可视化观察程序ftp://expasy.hcuge.ch/pub/lalnview3. BCM搜索装置(两两序列比对) /seq-search/alignment.html4. DALI蛋白质三维结构比较/dali/5. DIALIGN(无间隙罚分的比对程序) http://www.gsf.de/biodv/dialign/html多重序列比对及系统进行树1. ClustalW(BCM的多重序列比对) /multi-align/multi-align.html2. PHYLIP(推测系统进行树的程序) /phylip.html3. 其它系统进行树程序，PHYLIP文档的汇编http://expasy.hcuge.ch/info/phylogeny.html4. 系统进行树分析程序(生命树列表) /tree/programs/programs.html5. 遗传分类学软件(Willi hennig协会提供的列表) /education.html6. 用于多重序列比对的BCM搜索装置/multi-align/multi-align.html7. AMAS(分析多重序列比对中的序列) /servers/amas_server.html8. 维也纳RNA二级结构软件包http://www.tbi.univie.ac.at/~ivo/RNA/四. 有代表性的预测服务器1. PHD蛋白质预测服务器，用于二级结构、水溶性以及跨膜片断的预测http://www.embl-heidelberg.de/predictprotein/predictprotein.html2. PhdThreader(利用逆折叠方法预测、识别折叠类) http://www.embl-heidelberg.de/predictprotein/phd_help.html3. PSIpred(蛋白质结构预测服务器) /psipred4. THREADER(戴维. 琼斯) /~jones/threader.html5. TMHMM(跨膜螺旋蛋白的预测) http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/6. 蛋白质结构分析，BMERC /protein-seq/protein-struct.html7. 蛋白质域和折叠预测的提交表http://genome.dkfz-heidelberg.de/nnga/def-query.html8. NNSSP(利用最近相邻法预测蛋白质的二级结构) /pss/pss.html9. Swiss-Model(基于知识的蛋白质自动同源建模服务器) http://www.expasy.ch/swissmod/SWISS-MODEL.html10. SSPRED(用多重序列比对进行二级结构预测) /jong/predict/sspred.html11. 法国IBCP的SOPM(自寻优化预测方法、二级结构) http://pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=/NPSA/npsa_sopm.html12. TMAP(蛋白质跨膜片断的预测服务) http://www.embl-heidelberg.de/tmap/tmap_info.html13. TMpred(跨膜区域和方向的预测) /software/TMPRED_form.html14. MultPredict(多重序列比对的序列的二级结构) /zpred.html15. BCM搜索装置(蛋白质二级结构预测) /seq-search/struc-predict.html16. COILS(蛋白质的卷曲螺旋区域预测) /software/coils/COILS_doc.html17. Coiled Coils(卷曲螺旋) /depts/biol/units/coils/coilcoil.html18. Paircoil(氨基酸序列中的卷曲螺旋定位) /bab/webcoil.html19. PREDATOR(由单序列预测蛋白质二级结构) http://www.embl-heidelberg.de/argos/predator/predator_info.html20. EV A(蛋白质结构预测服务器的自动评估) /eva/五. 其他预测服务器1. SignalP (革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和真核生物蛋白质的信号肽及剪切位点) http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/2. PEDANT(蛋白质提取、描述及分析工具) http://pedant.mips.biochem.mpg.de/六. 分子生物学软件链接1. 生物信息学可视化工具/alan/VisSupp/2. EBI分子生物学软件档案/software/software.html3. BioCatalog /biocat/e-mail_Server_ANAL YSIS.html4. 生物学软件和数据库档案/Dan/softsearch/biol-links.html5. UC Santa Cruz的序列保守性HMM的SAM软件/research/compbio/sam.html七. 网上博士课程1. 生物计算课程资源列表：课程大纲http://www.techfak.uni-bielefeld.de/bcd/Curric/syllabi.html2. 生物序列分析和蛋白质建模的Ph.D课程http://www.cbs.dtu.dk/phdcourse/programme.html3. 分子科学虚拟学校/vsms/sbdd/4. EMBnet 生物计算指南http://biobase.dk/Embnetut/Universl/embnettu.html5. 蛋白质结构的合作课程/PPS/index.html6. 自然科学GNA虚拟学校http://www.techfak.uni-bielefeld.de/bcd/Vsns/index.html7. 分子生物学算法/education/courses/590bi。

生物化学与分子生物学综合测试试卷一、选择题（每题2分，共20分）1、下列哪个物质不是生物分子？A.蛋白质B. DNAC.脂肪D.维生素2、生物化学主要研究的是？A.生物大分子的结构与功能B.生物小分子的结构与功能C.生物大分子和生物小分子的结构与功能D.以上都不是3、以下哪种反应是生物化学中常见的氧化还原反应？A.蛋白质合成B. DNA复制C.糖酵解D.以上都是4、下列哪项描述不准确？A.酶是生物催化剂B.大多数酶是蛋白质C.酶的反应特性是高效性和专一性D.酶只能催化热力学允许的反应5、下列哪个分子不是构成生物膜的成分？A.磷脂B.蛋白质C.多糖D. DNA二、填空题（每空2分，共30分）1、生物化学主要研究生物体在__和__条件下，体内__变化规律的科学。

2、构成蛋白质的基本单位是__，构成核酸的基本单位是__。

3、酶的特性包括__、__、__。

4、生物膜主要由__、__和__组成。

生物膜的功能包括__和__。

5、DNA复制需要__作为模板，需要__催化合成。

新合成的DNA分子是__链。

三、简答题（每题10分，共30分）1、请简述DNA复制的过程。

2、请说明酶在生物体内的催化作用以及其重要性。

3、请简述生物膜的结构以及其主要功能。

复习题生物化学与分子生物学复习题：生物化学与分子生物学一、选择题1、在生物化学中，ATP的中文名称是什么？A.腺嘌呤核糖核苷酸B.腺苷三磷酸C.腺苷二磷酸D.腺苷一磷酸2、下列哪种物质不是蛋白质？A.肌红蛋白B.血红蛋白C.细胞膜上的载体蛋白D.细胞内的氧化酶3、生物氧化过程中，下列哪种物质不是必需的？A.氧气B.水C.电子传递链D.葡萄糖4、下列哪种酶参与糖酵解过程？A.磷酸果糖激酶-1B.丙酮酸激酶C.异柠檬酸脱氢酶D.柠檬酸合酶5、下列哪种物质是DNA，而不是RNA？A.胸腺嘧啶B.尿嘧啶C.胞嘧啶D.鸟嘌呤二、简答题1、请简述生物化学与分子生物学之间的关系。

2、请详细说明糖酵解的过程及其意义。

生物化学与分子生物学在医学教育中的重要性及教学探索作者：韩阳阳王天晓来源：《中国校外教育·综合(上旬)》2015年第13期摘要：现今临床医学水平逐渐提升，其涉及的知识与学科愈加广泛。

生物化学与分子生物学仍旧是其中较为重要的基础医学课程内容。

在不断地完善与发展下，生物化学与分子生物学已经成为了生命学科的共同探索对象。

该学科具有较强的系统性，但内容比较抽象，缺少直观性，在教学方面往往不能够起到良好的教学效果，学生水平不能够得到有效提升。

针对生物化学与分子生物学在医学教育和教学中的重要性进行了探索，主要从教学手段、教学内容、网络教学和能力培养四个方面，对其进行了深入研究。

关键词：生物化学分子生物学教学探索现今，生物化学与分子生物学的相关知识内容已经在医学中的各个领域均有所涉及，内容十分深奥，具有一定难度。

在目前医学快速发展，生物化学与分子生物学相关理论与技术逐渐拓展和丰富的情况下，其在各类疾病的诊断、预防以及治疗中均已经被广泛的应用。

同时，亦是新时代医学教学中的重要教学内容之一。

但是，我国医学教学中，学生对生物化学与分子生物学课程的开展并不具有较高的兴趣。

因而现今需要对生物化学与分子生物学在医学教育中的重要性和教学方案等进行探索，以便提高学生的学习兴趣和该学科的学习效果。

一、生物化学与分子生物学特点下的教学手段新时代医学教学手段需要对生物化学与分子生物学的特点进行更加细致的分析，进而具有针对性地激发学生学习兴趣，提高该学科的学习效率。

兴趣是最好的老师，通过兴趣的提升，将能够有效提升学生的创造思维能力。

生物化学与分子生物学学科具有一定活力，并且对生物学科具有较强的影响力。

在教学中，仅凭借教师采用口头叙述的方式进行教学，将比较难以为学生留下深刻的印象。

但是，若在恰当分析该学科特点后，充分利用现代的多媒体等教学手段，将书本中较为枯燥的知识转化为图文并茂、直观且形象的课件进行战象，更加能够吸引学生，激发其学习的主动性，提高教学水平和效率。

生物化学及分子生物学第九版笔记1. 引言生物化学及分子生物学是现代生物学的重要分支，它研究生命活动的基本原理及相关分子机制。

第九版笔记是这一领域的经典教材，涵盖了生物化学和分子生物学的最新发展，对于理解细胞的生物化学过程、基因调控和蛋白质功能等方面有着重要意义。

2. 基本概念生物化学及分子生物学的基本概念包括生物大分子（蛋白质、核酸、多糖和脂类）的结构和功能、细胞代谢途径及信号传导等。

通过深入学习这些基本概念，我们可以更好地理解生命的本质及其调控机制。

3. 蛋白质的结构和功能蛋白质是细胞中最重要的大分子，它们承担着多种生物学功能，如酶催化、结构支持、信息传递等。

了解蛋白质的结构与功能对于深入理解细胞活动至关重要。

第九版笔记中对蛋白质结构的描述非常详细，包括了一级结构、二级结构、三级结构和四级结构等方面的内容，为我们提供了深入理解蛋白质结构与功能的基础知识。

4. 基因调控基因调控是细胞命运决定和分化的重要过程，也是许多疾病发生的基础。

第九版笔记中对基因调控的机制进行了系统的介绍，包括DNA的复制、转录和翻译等过程，以及转录调控和表观遗传调控。

通过学习这些内容，我们可以深入了解基因调控在细胞内部是如何进行的，为后续的疾病研究和治疗提供理论基础。

5. 分子生物学技术分子生物学技术是生物化学及分子生物学领域的重要工具，它们包括了PCR、基因克隆、蛋白质纯化等技术手段。

第九版笔记中对这些技术的原理及应用进行了系统的介绍，为我们理解和运用这些技术提供了重要的参考资料。

总结与展望生物化学及分子生物学第九版笔记涵盖了生物化学和分子生物学领域的最新进展，对于我们深入理解细胞的生物化学过程、基因调控和蛋白质功能等方面起着重要作用。

在今后的学习和研究中，我们应该注重对这些知识的深入理解和灵活运用，不断拓展自己的学术视野，为生命科学领域的发展做出更大的贡献。

个人观点生物化学及分子生物学是一门既有理论深度又具有广泛应用价值的学科，它为我们揭示了细胞的奥秘和生命的本质。

生物专业同学常去的国内外几大网站
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基因组数据库(GDB)
http://www.gdb/org/
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蛋白质结构数据库(PDB)
/。

物化生专业的教学资源与教材推荐物化生专业是指物理化学与生物学相结合的学科领域，包括物理化学、有机化学、生物化学、分子生物学等内容。

在物化生专业的教学中，选择合适的教学资源和教材对学生的学习效果至关重要。

本文将介绍一些优质的物化生专业教学资源和教材推荐。

一、教学资源推荐1. 实验教学资源实验是物化生专业的重要组成部分，通过实验能够帮助学生巩固理论知识、培养实验操作能力。

优质的实验教学资源可以提供给学生更多的实验案例和实验教学视频，帮助学生深入理解实验原理和操作技巧。

国家级实验教学示范中心、高校实验平台和相关学术网站都是寻找实验教学资源的好渠道。

2. 网络课程资源网络课程能够提供灵活的学习方式和丰富的学习资源，对于物化生专业的学习尤为重要。

一些知名的在线教育平台如Coursera、edX、学堂在线等提供了许多优质的物化生相关课程，学生可以根据自己的学习进度和需求选择适合的课程进行学习。

3. 学术期刊与论文资源物化生专业的学习离不开学术期刊和论文的阅读和参考。

订阅一些权威的学术期刊，如Nature、Science、Cell等，可以让学生及时了解前沿的科学研究成果。

此外，一些学术数据库如Web of Science、PubMed等也是寻找相关论文的好工具。

二、教材推荐1. 《物理化学》《物理化学》是物化生专业必修的教材之一，适合初学者入门。

该教材系统地介绍了物理化学的基本概念和原理，并结合实例进行解析，能够帮助学生理解和掌握物理化学的基础知识。

2. 《有机化学》《有机化学》是物化生专业重要的教材之一，着重介绍有机化学的基本理论和方法。

该教材内容丰富，例题和习题较多，能够帮助学生深入理解有机化学的知识和技巧。

3. 《分子生物学》《分子生物学》是生物化学、分子生物学等课程的主要教材，适合物化生专业的学习。

该教材全面介绍了分子生物学的基本概念、技术和应用，有助于学生理解生物分子的结构和功能。

4. 《生物化学》《生物化学》是物化生专业必备的生物学教材，介绍了生物体内生物分子的结构、功能和代谢过程。

化学生物学小分子筛选及资源数据库ChemBank简介赵仲麟;李瑞歌;吕东灿;张淑利;袁超【摘要】ChemBank是一个公共的化学生物学数据平台,其中储存了多种小分子信息及其处理细胞或其他生物系统的数据结果.同时.网站还提供相关的分析工具用于小分子间或小分子与细胞的处理分析.ChemBank数据库为生命科学领域的研究人员提供生物医药方面的相关数据和工具,指导化学生物学家合成新的小分子化合物或文库,帮助研究者找到可以干扰特殊生物途径的小分子或是影响一些催化过程的新型药物,同时也可作为化学信息学分析的数据资源库.【期刊名称】《农业网络信息》【年(卷),期】2016(000)010【总页数】5页(P136-140)【关键词】ChemBank;化学生物学;数据库;小分子筛选;元数据【作者】赵仲麟;李瑞歌;吕东灿;张淑利;袁超【作者单位】河南农业大学理学院,河南郑州 450002;河南农业大学理学院,河南郑州 450002;河南农业大学理学院,河南郑州 450002;河南农业大学理学院,河南郑州 450002;河南农业大学理学院,河南郑州 450002【正文语种】中文【中图分类】G642化学生物学是近十多年以来的新兴研究领域，由哈佛大学的Schreiber博士和Scripps研究所的Schultz博士分别在美国东西海岸引领这个领域。

化学生物学是研究生命过程中化学基础的科学，其中心任务采用化学手段，通过小分子实现对生命过程的调控。

疾病的发生发展是致病因子对生命过程的干扰和破坏，而药物的防治是对病理过程的干预。

化学生物学通过用化学的理论和方法来研究生命现象、生命过程的化学基础，通过探索干预和调整疾病发生发展的途径和机理，为新药发现提供必不可少的理论依据。

化学生物中一个的重要内容是组合化学和多样性导向合成，而组合化学通过平行、系统的反复共价连接不同的结构单元得到海量的化合物，并进行高通量筛选的一类策略和方法。

高通量筛选大量的化合物就需要研究小分子及其生物学效应的公共数据资源来辅助研究。

中国科学院微生物研究所(G /. 中国科学院生物物理研究所(G /. 中国科学院西北高原生物研究所(G /. 中国科学院水生生物研究所(G /hydrob/index_ihb.htm. 中国科学院上海生物化学研究所(G . 中国科学院上海细胞生物学研究所(G . 中国科学院上海微生物研究所(G /. 上海生物工程研究中心(G /. 上海国家基因研究中心(G /. 上海生命科学研究中心(G /. 中国微生物菌种保藏中心(G /im/lab1.html. 中国生物多样性信息中心微生物分部(G /cbic.html. 中国微生物信息网络系统(G /chinese/chinese.html. 中国医学细菌保藏管理中心(G . 分子生物学专业信息网(G /. 分子生物学与免疫学之家(G . 中国生物多样性信息系统内陆水体生物学分部(G . 华中理工大学生物物理与生物化学研究所(G /IBB/hust-gb.html . 生命科学BBS论坛(G /users/cat/catboard/catboard.htm. 分子生物学专业信息网(G /. 分子生物学专业信息(G /. 中国生态系统研究网络(G /. 蛋白质工程及植物基因工程国家重点实验室(G / . 上海人类基因组研究中心(G . 北京大学蛋白数据库(G /htm/med/peking.htm . 北京电子显微镜实验室(G /. 奇幻的恐龙世界(BIG5) /. 生物信息空间探索发射台/launch.html. 生命之树/tree/phylogeny.html. 生物学Web虚拟图书馆/biopages.html/biopages/journals.html. 生物学资源链接/. 生物科学资源/. 生物学资源服务http://pillo.unipv.it/em/surf.htm. 生物信息学资源/bioinfo.html. 生物学数据库/. 生物学教学信息资源服务/biopages/edures.html . 生物学会议预告/zrdocs/confs/confs.htm. 美国地质调查所生物资源部/. 美国国家生物信息基础设施NBII /nbii/index.html. 美国生物资源中心联网服务/nbs/nbshp2_2.htm. 国际生命科学研究所ILSI /. 美国国家生物技术信息中心. 美国生物技术高级研究中心/. 德国Wyraburg大学生物中心http://www.biozentrum.uni-wuerzburg.de/. 物种2000 /default.html. 英国Aberdeen大学生化学图象实验室/. 美国哈佛大学生物学实验室/. 百慕大生物研究站/. 分子生物工程研究中心/. 欧洲分子实验室http://www.embl-heidelberg.de/. 美国加州大学圣地亚哥分校生化遗传学/. 英国Sanger中心/. 欧洲分子生物学网络http://beta.ebmnet.unibas.ch/ebmnet/info.html. G Protein-Coupled Receptor数据库/GCRDBHOME.html. 细胞生物学/~cellab/. 细胞图片和电影/quill/. 细胞生物学词典/~julian/Dict.html. 细胞生物学实验室手册/~cellab/. 分子模型/modeling/. 生物化学信息服务/Heme-lron/. 人工生命研究信息系统. 蛋白/hopkins.html. 蛋白质http://expasy.hcuge.ch/sprot/sprot-top.html. 蛋白质数据库PDB //npdb/index.html(北京大学镜像网站). 蛋白质数据库信息服务QUEST . 生物流体力学BioFluids /. 微生物学和滤过性微生物学信息索引/WHSCL/medweb.microbiology.html . 微生物学电子公告板/microbbs/. 世界菌种保藏联合会世界微生物数据中心WDCM http://wdcm.nig.ac.jp/. 人类基因组组织HUGO /. 美国国家基因资源计划/. 基因组网络http://www.genome.ad.jp/. 人类基因组研究项目/. 美国斯坦福大学Motif Biolnformatics服务器/. 核酸数据库NDB /. 日本DNA数据库http://www.ddbj.nig.ac.jp/. Santa Fe研究所/. Jackson实验室/. 美国Brookhaven国家实验室/. 日本国家遗传学研究所/. 日本信息生物学中心/. 日本动物基因组数据库服务http://ws4.niai.affrc.go.jp/jgbase.html. 人类基因组差异研究常识问答/research/diversity.html. 用于遗传研究的计算机软件/. 网站GenLink /. 美国约翰.霍普金斯大学基因组数据库/. 澳大利亚国家基因组信息服务ANGIS .au/. LLNL人类基因组中心/bbrp/genome/genome.html . 英国人类基因组映射研究/. 虚拟基因组信息中心/VGC.html. 生命科学文摘/core/. 结构生物学杂志/. 生物技术杂志/. 遗传学杂志/. 生物化学杂志/. 生物世界今天/. 古生物学学会/orgs/paleo/homepage.html. 古植物学国际组织/palaeo/. 古生物学博物馆/. 恐龙展览厅/diapsids/dinosaur.html。

生物学习中的实用资源推荐
在生物学习中，获取和利用有效的资源至关重要。

作为学生的伙伴，我将为你推荐一些极具实用性的资源，帮助你在这个学科中取得更大的成功。

首先，让我们从书籍说起。

像《分子生物学导论》和《生物化学基础》这样的经典教材就像是你的导师，深入浅出地解释复杂的生物学概念。

它们不仅提供理论知识，还能帮助你理解生物学原理的核心。

除了传统的纸质书籍，电子资源也是不可或缺的。

例如，生物学领域的数据库和在线期刊能够提供最新的研究进展和数据分析工具，让你能够接触到前沿科技和研究成果。

别忘了，视频资源也是学习的重要组成部分。

生物学相关的教育视频可以通过生动的动画和实验展示，帮助你更直观地理解抽象的概念，比如细胞分裂或基因组学。

此外，交互式的学习平台和应用程序为你提供了个性化的学习体验。

通过这些平台，你可以进行自测、实验模拟和在线辅导，加强你的理论知识并提高解决问题的能力。

最后，社区和论坛是与其他生物学爱好者交流和学习的好地方。

在这些平台上，你可以分享经验、讨论问题、找到答案，甚至结识志同道合的伙伴。

总之，生物学学习中的资源多种多样，每一个都有助于你深入理解这门学科的奥秘。

选择适合你学习风格的资源，并结合多种途径，将有助于你在生物学领域取得更大的进步和成功。

中国生物医学文献数据库1. 简介中国生物医学文献数据库（Chinese Biomedical Literature Database，以下简称CBM）是一个重要的国内生物医学领域的文献资源。

CBM由中国科学院生物医学信息研究所（Institute of Biomedical Information, Chinese Academy of Sciences）与国家自然科学基金委员会（National Natural Science Foundation of China）共同开发和维护。

CBM是基于国内临床和基础生物医学研究领域相应的论文选集，覆盖了大量关于生物医学领域的科学文献。

CBM致力于收集和整理中国境内发表的生物医学文献，并提供简便易用的检索和浏览工具。

作为一个全面、丰富的生物医学文献数据库，CBM为科研人员、医务人员和学生提供了一个查找国内相关生物医学研究文献的重要平台。

2. 数据内容CBM数据库文献内容涵盖了多个生物医学领域，包括但不限于临床医学、基础医学、药学、生物工程、遗传学、生物信息学等。

数据库中收录了大量与这些领域相关的期刊文章、会议论文以及学位论文等。

CBM数据库的内容来源主要包括以下几个方面：2.1 期刊论文CBM收录了众多国内生物医学领域的期刊论文。

这些期刊覆盖了临床医学、诊断学、药理学、生理学、生物化学、分子生物学等多个学科领域。

大部分期刊都是中国的学术期刊，但也包括了一些国际生物医学领域的重要期刊。

2.2 会议论文CBM还收录了国内各类生物医学领域的学术会议论文。

学术会议是学界交流和分享最新研究成果的重要场合，CBM收录了这些会议上发表的与生物医学相关的优秀论文，为研究人员提供了更多的资源。

2.3 学位论文CBM还收录了中国各大高校的生物医学相关专业的硕博学位论文。

这些学位论文是培养研究生时的重要产出，包括了很多研究生在生物医学领域的优秀研究成果。

3. 检索与浏览CBM提供了强大的检索和浏览功能，使用户能够方便地查找到所需要的文献资源。

转载)分子生物学相关数据库综合数据库：Entrez由NCBI开发的一个数据库检索系统，它综合了下述各大数据库的信息，包括核酸、蛋白以及Medline文摘数据库，在这三个数据库中建立了非常完善的联系。

因此，可以从一个序列查询到蛋白产物以及相关的结构、功能和文献信息，详见NCBI(美国国立生物技术信息中心) 简介。

EBI欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatics Institute,EBI)是EMBL的分部，位于英国Hinxton的Wellcome Trust Genome Campus。

EBI维护和发布的数据库：üEMBL核酸数据库、欧洲原始核酸数据资源库üSwissProt蛋白质序列数据库[与瑞士生物信息学协会(Swiss Institute for Bioinformatics,SIB)的Amos Bairroch合作]üTrEMBL(SwissProt的附属数据库，由EMBL数据库编码序列翻译而来的蛋白质序列数据库)ü分子结构数据库(Molecular Structure Database,MSD)[与Brookhaven 国家实验室(纽约)的蛋白质三维结构数据库(Protein Data Bank,PDB)合作]ü放射杂交数据库(Radiation Hybrid database,RHdb)ü其他组织合作产生的分子生物学数据库：EBI还提供网络服务，通过互联网、其WEB界面和FTP服务器可以访问最新收集到的数据，同时也提供数据库和序列相似性的搜索工具。

核酸数据库：GenBankGenBank是NIH的基因序列数据库，由美国国立卫生研究院全国生物技术信息中心（NCBI）建立并维护，是所有公开的DNA序列的集合( Nucleic Acids Research 1998 Jan 1;26(1):1-7)，GenBank包含所有已知的核苷酸及蛋白质序列、以及与之相关的生物学信息和参考文献，是世界上的权威序列数据库。