6第六章 蛋白质的翻译
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Chapter VI Protein‐Protein InteractionNetworks of ProteinNetworks of Protein--Protein Interaction蛋白质‐蛋白质相互作用(PPI)形式与方式•形式上四级结构,如血红蛋白4个亚基的装配;形成多亚基蛋白质的如血红蛋白个亚基的装配形成蛋白质复合体,如病毒外壳,核孔复合体等;瞬时的蛋白质蛋白质相互作用,如蛋白质的翻译后修饰、磷酸化、乙‐酰化等。
几乎参与细胞基本生命活动的全部过程。
•方式上结构域‐结构域相互作用。
如蛋白质‐蛋白质复合体,抗原‐抗体等均属于该类型;结构域‐肽相互作用。
如某些病毒衣壳组装的相互作用,主要组织相容性复合体‐抗原复合体相互作用;分子内蛋白质‐蛋白质相互作用,即多结构域蛋白质分子内部头尾端不同结构域之间的相互作用。
如FERM蛋白质家族以及Tyr激酶Src等受这种首尾作用调控。
种首尾作用调控蛋白质‐蛋白质互作的研究方法•离体(In vitro)‐将待研究的蛋白质分离后,在细胞外进行相互作用分析的方法作用分析的方法。
蛋白质亲和层析(Affinity chromatography);核磁共振谱分析(Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy, NMR );g p py,表面等离子共振(Surface plasmon resonance, SPR);亲和印记(Far western);蛋白质芯片(Protein microarray);‐‐‐‐‐‐•在体(In vivo)‐在细胞内进行蛋白质互作分析的方法。
在细胞内进行蛋白质互作分析的方法异种系统检测‐将待研究的蛋白质在异种细胞中表达后加以分析的方法。
~细菌双杂交、酵母双杂交、哺乳动物细胞双杂交等。
基于活细胞的蛋白质‐蛋白质相互作用研究方法。
~基于荧光共振能量转移显微技术、共聚焦显微技术、流式细胞分析等。
•亲和层析是一种利用待分离分子与固定相配体的特异亲和结合特性来分离分子的色谱方法,蛋白质亲和层析,即利用发生相互作用的蛋白质分子之间存在这种特异的亲和力,从而达到分离鉴定互作蛋白质的目的。
第一章蛋白质的结构与功能1、蛋白质protein蛋白质(protein) 是由许多氨基酸(amino acid) 通过肽键(peptide bond)相连形成的高分子含氮化合物2、氨基酸 amino acid氨基酸(amino acid)是蛋白质的基本组成单位。
3、肽键 peptide bond蛋白质分子是氨基酸通过肽键连接形成的多肽链。
一份子氨基酸的α-羧基与另一分子氨基酸的α-氨基脱水缩合形成的酰胺键(—CO—NH—)称为肽键。
4、一级结构 primary structure蛋白质分子中,从N端至C端的氨基酸排列顺序称为蛋白质的一级结构。
5、二级结构secondary structure是指蛋白质分子中某一肽链的局部空间结构,即多肽链中主链原子的相对空间排列分布,而不涉及氨基酸残基侧链的空间排布。
6、α-螺旋α-helix多肽链中的主链围绕中心轴有规律的螺旋式上升,螺旋的走向为顺时针方向,称右手螺旋。
氢键是维持α-螺旋结构稳定的主要化学键。
7、β-折叠β-pleated sheetβ-折叠呈折纸状多肽链充分伸展,各个肽单元以Cα为旋转点,依次折叠成锯齿状结构,氨基酸残基侧链交替地位于锯齿状结构的上下方。
8、三级结构 tertiary structure是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间排布,即整条肽链所有原子在三维空间的排布位置。
主要靠次级键,包括氢键、离子键(盐键)、疏水作用、范德华力、二硫键等。
9、四级结构quaternary structure每一条具有完整三级结构的多肽链,称为亚基(subunit)。
各亚基之间以非共价键相互连接形成特定的三维空间构象,称为蛋白质的四级结构。
维持四级结构的作用力主要是疏水作用,也包括氢键、离子键及范德华力等。
10、变性 denaturation蛋白质在某些理化因素的作用下,空间构象受到破坏,改变理化性质,并失去其生物活性,称为蛋白质的变性。
变性涉及空间结构的改变。
细胞生物学-6(总分100,考试时间90分钟)一、判断题1. 放线菌酮抑制线粒体蛋白质的合成,氯霉素抑制细胞质蛋白质的合成。
A. 正确B. 错误2. 肽如何正确折叠,以及是否进一步加工或组装成寡聚体的信号都存在于蛋白质的一级结构中,或者说这些信息仅存在于编码该蛋白质的基因本身。
A. 正确B. 错误3. M6P是溶酶体酶的分选标志,该标志是在内质网中合成的。
A. 正确B. 错误二、填空题1. 逃离的内质网驻留蛋白通过______进行回收,驻留信号序列的受体位于______上。
2. 分泌性蛋白首先在细胞质基质______核糖体上起始合成,当多肽链延伸至80个氨基酸左右后,N端的信号序列与______结合使多肽链延伸暂时停止。
直至______与内质网膜上的停泊蛋白结合,核糖体与内质网膜的结合,此后,肽链又开始延伸。
3. Caspase的活化需在两个亚基的连接处的天冬氨酸位点进行切割,结果产生了______,此即具有活性的酶。
4. 某些特殊的氨基酸序列可以作为分选标记影响蛋白质的定位,C端具有序列的蛋白质通常驻留在内质网腔,而带有______序列的蛋白质则会被输送到______。
5. 在高尔基体修饰蛋白质的过程中,糖基化修饰发生在其______面,分泌泡在______面。
6. Caspase的活化需要在两个亚基的连接区的______位点进行切割,结果产生由两个亚基组成的异二聚体。
7. CpG岛常位于转录调控区,其中的______常常被甲基化,DNA甲基化与基因表达的______有关。
8. 进来研究发现依据膜蛋白的不同,膜泡运输可分为3种不同类型的有被小泡,它们有不同的运输途径。
______泡,运输的方向是______到______;______泡,运输的方向是______到______;______泡,运输的方向既可以是______到______,又可以是______到______。
9. 母鼠抗体从血液通过上皮细胞进入母乳,再经乳鼠的肠上皮细胞被摄入体内,这种将内吞作用和外排作用相结合的跨膜转运方式称为______运输。