病毒RNA传统提取方法
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RNA提取一般步骤总结rna提取原理:|用变性剂破坏细胞或组织,然后用氯仿和其他有机溶剂提取RNA,沉淀、洗涤、干燥,最后溶解。
然而,RNA酶无处不在,随时都可能降解RNA,因此在实验中有很多地方需要注意,如果忽视它们,之前的努力就会白费。
RNA提取的一般步骤所有rna的提取过程中都有五个关键点,即:样品细胞或组织的有效破碎;有效地使核蛋白复合体变性;对内源rna酶的有效抑制;有效地将rna从dna和蛋白混合物中分离;对于多糖含量高的样品还牵涉到多糖杂质的有效除去。
但其中最关键的是抑制rna酶活性。
rna的提取目前阶段主要可采用两种途径:提取总核酸,再用氯化锂将rna沉淀出来;直接在酸性条件下抽提,酸性下dna与蛋白质进入有机相而rna留在水相。
第一种提取方法将导致小分子量rna的丢失,目前该方法的使用频率已很低。
实验步骤:组织破碎→ RNA分离→ RNA沉淀→ RNA洗涤→ RNA融化→ RNA保存。
1、破碎组织和灭活rna酶可以同步进行,可以用盐酸胍、硫氰酸胍、np-40、sds、蛋白酶k等破碎组织,加入β-me可以抑制rna酶活性。
2.RNA一般用苯酚、氯仿等有机溶剂和少量异戊醇分离。
经过这个步骤和离心,RNA通常分布在上层,并从蛋白质层分离。
3、沉淀rna一般用乙醇、3mnaac(ph-5.2)或异丙醇。
4.用70%乙醇清洗RNA。
有时,这一步可以省略,以避免RNA被洗掉。
洗涤后,可在空气中干燥或用乙醇干燥,但不能太干,否则不易溶解。
5.Te通常用于溶解RNA。
6、保存rna应该尽量低温。
为了防止痕量rnase的污染,从富含rnase的样品(如胰脏、肝脏)中分离到的rna需要贮存在甲醛中以保存高质量的rna,对于长期贮存更是如此。
从大鼠肝脏中提取的rna,在水中贮存一个星期就基本降解了,而从大鼠脾脏中提取的rna,在水中保存3年仍保持稳定。
另外,长度大于4kb的转录本对于痕量rnase的降解比小转录本更敏感。
病毒RNA提取方法异硫氰酸胍提取法:实验步骤:1、取200ul样品数+阴性对照+阳性对照个1.5ml灭菌eppendorf管。
2、加600ul异硫氰酸胍,然后加入对照和样品,再加200ul氯仿,颠倒混匀。
3、13000rpm离心15min。
4、在第3步离心快结束时,另取同样多eppendorf管,加入400ul -20度预冷的异丙醇。
5、取第3步离心的上清(一定不要吸取到中间白色层,第3步离心结束往外拿的时候,管子尽量不要倾斜)转移到第4步准备的管中,颠倒混匀。
6、13000rpm离心15min,轻轻倒去上清;在吸水纸上尽量沾干液体。
7、加600ul 75%乙醇,颠倒数次以洗涤残存异丙醇。
8、13000rpm离心15min,轻轻倒去上清;在吸水纸上尽量沾干液体。
9、4000rpm离心10s,将管壁残存液体甩到底部,用微量枪头吸干,室温干燥2-3min(不可过分干燥,防止下一步RNA不溶解)。
10、加入20ul DEPE水(加入depc的纯水高压后的水即为DEPE水),轻轻混匀溶解RNA。
2000rpm 离心5s,冰上保存备用(最好2小时内使用,以免RNA降解)。
TRIzol LS提取:所提取物为血清、血液、细胞培养液、鸡胚尿囊液等液体中的病毒。
提取时尽量在人少时进行,防止空气中RNA酶的污染。
所用一切物品也应是无RNA酶的。
实验步骤:1、在1.5ml的eppendorf管中加入病毒原液500ul,再加入TRIzol LS 500ul,充分混匀,室温放置10min。
2、加入200ul的氯仿,盖紧离心管盖,用力震荡离心管(溶液充分乳化,成乳白状,无分相现象),室温放置10min (由于氯仿沸点低、易挥发,振荡时离心管可能爆开,小心)。
3、离心4℃、13000r/min、15min,取上层液相移入另一管(切忌吸动白色中间相)。
4、加入等体积异丙醇,轻轻颠倒离心管充分混匀液体,室温放置10min。
5、离心4℃、13000r/min、15min,(这时乍一看会发现管子里好像没有东西,再仔细看看,会发现靠近管底的壁上有一星点的白色沉淀物,就是它了)用枪小心吸去所有上清。
rna提取的流程和方法RNA提取的流程和方法一、RNA 提取流程1、实验准备在RNA提取前,需要准备一些实验用品,如RNA提取试剂盒、干净的Eppendorf管、试剂管盒等。
2、组织采集从实验材料(如组织)中采集适量样品,将其添加到实验管中,并用恰当的液体(如液氮)固定。
3、细胞分离和消化将固定过的样品放置在消化槽中,并加入相应蛋白酶(常用的蛋白酶有 Protease、 DNase I 等)。
待消化完成后,细胞就可以分离出来,得到小分子和线粒体RNA。
4、细胞悬液处理细胞和消化液将放置在分离机中,以速度较快的离心来分离细胞悬液和上清液,获得纯净的细胞悬液,以及细胞内的RNA。
5、病毒筛选针对实验中可能存在的病毒,在RNA提取后期,可以采用专门的病毒筛选技术来检测病毒的存在与否,用以保证实验结果的可靠性。
6、RNA 提取利用加热或冷冻方法来预处理细胞悬液,再加入性质非常活跃的提取试剂,分离出RNA,最后经酶抑制剂处理,即可实现RNA的提取。
7、RNA 质量检测采用实时定量荧光PCR(qPCR)或定量实时荧光 PCR(qRT-PCR)技术,对提取出来的RNA进行质量检测,以确定RNA的质量是否满足后续研究的要求。
8、实验结束实验完成后,将所有的实验用品清洗干净,并完成实验报告记录和记录实验结果,结束实验。
二、RNA 提取方法1、常规方法(1)分离法利用细胞成分的不同溶解度,将细胞内的RNA和DNA分离出来,如甲醇分离法、混合洗涤法、膜过滤法等,然后将DNA除去,即可得到纯化的RNA样品。
(2)磁珠法采用特定的磁珠技术,通过磁场的作用,将RNA结合在磁珠上,然后加入洗涤液,脱除磁珠上的杂质和有害物质,最终得到纯化的RNA样品。
2、新型方法(1)多尺度细胞抗分离法利用细胞的多尺度的抗性,通过不同直径的磁珠把细胞内的RNA 分离出来,可以节约实验时间,并有效提高细胞内RNA的收量、纯度和活性。
(2)膜过滤法采用膜过滤的方法,可以快速准确的将细胞内的RNA纯化,提高RNA的收率,并保护RNA免受外界环境的破坏,为实验提供良好的保护条件。
法则:QIAamp病毒RNA试剂盒在扩增技术中提供最快捷和简便的方式来纯化病毒RNA,纯化病毒RNA可以使用非肝素抗凝的血浆,血清和其他无细胞体液。
样本可以新鲜或冻融不超过一次(多次冻融可导致病毒载量下降并应该避免该种情况)。
样本反复冻融会有冷沉淀物的聚集,当使用真空管时会导致QIAamp滤膜的堵塞。
QIAamp病毒RNA试剂盒一般可用于从许多病毒中分离出单个病毒RNA,但不能保证每种病毒均适用。
程序:QIAamp病毒RNA试剂将硅胶膜的选择结合特性和微旋转或真空技术的速度连接起来,理想地适用于多样本的同时处理。
样本首先溶解于高浓度变性液,来确保RNA 酶失活并且完整的病毒RNA分离。
然后调整缓冲液来提供RNA与膜结合的最适条件,如此样本装载到旋转柱中。
RNA结合在膜上,污染物通过使用两种不同的清洗液,两步实现特异性洗脱。
高质量RNA通过特异性无RNA酶的缓冲液洗脱下来,可直接使用或安全储存起来。
洗涤过的RNA不含蛋白,核酸酶和其他污染物或抑制剂。
特异性的QIAamp膜能确保在20分钟内高度回收纯净而完整的RNA,不需要使用苯酚或氯仿萃取,也不需要酒精沉淀。
所有的缓冲液或试剂都不含RNA酶。
重点:第一次准备RNA请参考附录该试剂盒所有步骤均应在室温下快速完成。
收集并离心样本后,血浆或血清可存放于2-8℃中6小时,长期储存应在-20至-80℃。
冻融别超过一次。
反复冻融可导致蛋白的失活和凝集,使病毒滴度降低并随后导致病毒RNA产量的降低。
另外,冻融形成的冷凝集可堵塞滤膜,如果冷凝集可见,可简单通过6800g离心3分钟来浓缩分离,离心后在不搅动片状沉淀物同时移走上清液。
避免细胞中DNA的干扰:1.推荐使用无细胞体液2.对含有细胞的样本(包括脑脊液、骨髓、尿液和试子),首先应过滤或者是1500g离心十分钟,留取上清液3.若RNA和DNA已经并联分离,洗出液可通过不含RNA酶的DNA酶来消化处理,随后高温处理(70℃15分钟)来使DNA酶失活该试剂盒能分离超过200个碱基的RNA分子,小的RNA分子在该条件下无法定量。
rna的提取方法
1.细胞或组织的采集:采集样品时应尽量避免RNA的降解或污染,可使用RNase-free工具和试剂,避免手套和工作表面受到RNase污染。
2. 细胞或组织的破碎:可使用机械方法、化学方法或冻融法等
方法将细胞或组织破碎,释放RNA。
3. RNA的纯化:RNA的纯化可使用酚/氯仿法、商用RNA纯化试
剂盒等方法。
其中,酚/氯仿法是最常用的RNA纯化方法。
该方法利
用酚将RNA从DNA和蛋白质中分离,然后通过氯仿的密度梯度离心分离出RNA。
4. RNA的质量检测:RNA的纯化后,需要进行质量检测,以确保RNA的完整性和纯度。
可使用紫外线吸收法、琼脂糖凝胶电泳等方法进行检测。
5. RNA的保存:RNA的保存应避免RNA降解,需使用RNase-free 的保存液,如RNAlater等,或在零下80℃的冷冻库中保存。
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rna提取方法RNA提取方法。
RNA提取是分子生物学研究中的重要步骤,它的质量和纯度直接影响后续实验结果。
本文将介绍几种常用的RNA提取方法,希望能够对您的实验工作有所帮助。
首先,我们来介绍常用的酚/氯仿法。
这是一种经典的RNA提取方法,它通过酚和氯仿的相分离作用,将RNA从细胞裂解液中提取出来。
这种方法操作简单,成本较低,适用于提取大量样品。
但是需要注意的是,操作过程中要避免RNA的降解,且提取出的RNA需要经过酶处理来去除DNA和蛋白质的污染。
其次,还有一种磁珠法。
磁珠法利用特定的磁珠载体结合RNA,再通过磁场的作用将RNA从混合物中分离出来。
这种方法具有高效、高纯度的特点,且可以自动化操作,适用于高通量的实验。
但是需要注意的是,选择合适的磁珠载体对提取效果至关重要,且操作过程中需要严格控制各种条件以确保提取的RNA质量。
另外,还有一种硅基柱法。
硅基柱法利用硅基柱将RNA从混合物中吸附出来,再通过洗脱步骤将RNA提取出来。
这种方法适用于小样本的提取,且提取的RNA质量较高。
但是需要注意的是,硅基柱的选择和使用条件对提取效果有很大影响,操作过程中需要严格控制各种条件以确保提取的RNA质量。
最后,还有一种TRIzol法。
TRIzol法是一种单步法,它通过TRIzol试剂将RNA从细胞裂解液中提取出来,再通过酒精沉淀将RNA纯化。
这种方法操作简单,适用于多种样本类型,且提取的RNA质量较高。
但是需要注意的是,操作过程中需要避免RNA的降解,且提取出的RNA需要经过酶处理来去除DNA和蛋白质的污染。
综上所述,不同的RNA提取方法各有特点,选择合适的方法需要根据实验的具体要求和样本的特点来决定。
在操作过程中需要严格控制各种条件以确保提取的RNA质量,从而保证后续实验的准确性和可靠性。
希望本文介绍的内容对您有所帮助,祝您的实验顺利!。
rna提取方法RNA提取方法。
RNA提取是分子生物学研究中的重要步骤,它能够从细胞或组织中分离出RNA,并为后续的实验和分析提供可靠的样本。
在实验室中,有多种方法可以用来提取RNA,每种方法都有其特点和适用范围。
本文将针对常用的RNA提取方法进行介绍和比较,希望能为科研工作者提供一些参考和帮助。
一、酚/氯仿提取法。
酚/氯仿提取法是一种经典的RNA提取方法,它通过酚和氯仿的相分离特性来分离RNA。
首先,细胞或组织样本被加入到酚中,然后加入氯仿和异丙醇,最后进行离心分离。
这种方法简单易行,适用于大多数样本类型,但对RNA的纯度要求较高,且操作过程中需要注意避免RNA的降解。
二、硅基柱法。
硅基柱法是一种基于硅基质的RNA提取方法,它通过硅基柱的亲和吸附作用来富集RNA。
样本经过细胞裂解后,加入硅基柱柱子进行离心,然后通过洗脱步骤得到纯净的RNA。
这种方法操作简便,适用于高通量提取,但对样本量和纯度要求较高。
三、磁珠法。
磁珠法是一种利用磁珠颗粒来富集RNA的提取方法,它具有操作简便、高效快速的特点。
样本经过裂解后,加入磁珠颗粒进行混合,然后通过磁场分离得到RNA。
这种方法适用于多样本处理和自动化操作,但对磁珠颗粒的选择和配比要求较高。
四、酶法。
酶法是一种利用酶来选择性降解DNA而保留RNA的提取方法,它适用于需要高纯度RNA的实验。
通过加入DNA酶和蛋白酶K来去除DNA和蛋白质,最终得到纯净的RNA。
这种方法操作简便,适用于小样本和特定实验要求,但需要注意酶的活性和浓度控制。
五、TRIzol法。
TRIzol法是一种利用TRIzol试剂来提取RNA的方法,它通过酚-醇混合物和氯仿的相分离特性来富集RNA。
样本经过混合后,加入氯仿进行离心分离,最后得到RNA。
这种方法适用于多种样本类型,但需要注意操作过程中的酚和氯仿的使用安全。
综上所述,不同的RNA提取方法各有特点,科研工作者可以根据实验需求和样本特性选择合适的方法。
提取rna的步骤
提取RNA是一项基础实验,在许多分子生物学和遗传学研究中都需要用到。
以下是提取RNA的步骤:
1. 获得样本:样本可以是细胞、组织、血液或其他生物材料。
样本通常需要在提取前保持新鲜或在低温下储存。
2. 细胞破碎:将样本经过机械或化学方法破碎,以释放RNA。
机械方法可以是超声波、震荡器或高压细胞破碎机。
化学方法可以是用各种缓冲液和酶进行细胞裂解。
3. 提取RNA:使用酚-氯仿混合物或商业提取试剂盒等方法,将RNA从细胞裂解物中分离出来。
酚-氯仿混合物可以去除DNA和蛋白质等杂质,同时保留RNA。
4. 去除DNA:使用DNA酶或DNA消化酶将RNA样品中的DNA去除。
5. 纯化RNA:使用酒精沉淀或商业纯化试剂盒等方法,将RNA 分离出来并纯化。
6. 定量RNA:使用分光光度计或荧光分析仪等方法定量RNA。
7. 分析RNA:使用聚合酶链反应(PCR)、逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)、Northern blotting或RNA测序等方法分析RNA的表达和功能。
以上是提取RNA的基本步骤,每个步骤都需要严格控制条件以确保得到高质量和纯度的RNA。
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rna提取方法RNA提取方法。
RNA提取是分子生物学研究中的重要步骤,它能够从细胞或组织中提取出RNA,为后续的实验分析和研究奠定基础。
本文将介绍几种常用的RNA提取方法,希望能够为实验工作者提供一些参考和帮助。
1. Trizol法。
Trizol法是一种常用的RNA提取方法,它利用Trizol试剂将细胞或组织中的RNA溶解,然后通过酚-氯仿提取的方式分离RNA。
该方法操作简单,提取效果好,适用于各种类型的样品。
但需要注意的是,在操作过程中要避免RNA的降解,尽量减少搅拌和离心的时间,以保证提取的RNA质量。
2. 氯仿-异丙醇法。
氯仿-异丙醇法是另一种常用的RNA提取方法,它通过氯仿和异丙醇的相分离作用,将RNA从其他细胞成分中提取出来。
该方法提取的RNA纯度高,适用于大规模的样品处理。
但需要注意的是,在操作过程中要避免氯仿的挥发和异丙醇的残留,以免对后续实验造成影响。
3. 磁珠法。
磁珠法是近年来发展起来的一种RNA提取方法,它利用表面修饰的磁珠与RNA特异性结合,通过磁场的作用将RNA分离出来。
该方法操作简便,提取效果稳定,适用于高通量的样品处理。
但需要注意的是,在操作过程中要避免磁珠的污染和RNA的降解,以保证提取的RNA质量。
4. 硅胶柱法。
硅胶柱法是一种经典的RNA提取方法,它利用硅胶柱的吸附作用将RNA从细胞或组织中提取出来。
该方法提取的RNA质量好,适用于对RNA纯度要求较高的实验。
但需要注意的是,在操作过程中要避免硅胶柱的交叉污染和RNA的降解,以保证提取的RNA质量。
总结。
以上介绍了几种常用的RNA提取方法,每种方法都有其特点和适用范围。
在选择合适的RNA提取方法时,需要根据样品的特性和实验的要求进行综合考虑。
同时,在操作过程中要严格控制各项操作条件,以保证提取的RNA质量。
希望本文能够对实验工作者有所帮助,谢谢阅读!。
病毒RNA传统提取方法
一、细胞的裂解
1、单层细胞的裂解
a)吸出培养液,以7ml用冰预冷的无钙镁离子磷酸缓冲盐溶液PBS冲洗细胞培养皿内的单层细胞,重复1次,将平板置于冰上直至所有单层细胞冲洗完毕。
也可将平板放在一块铝板上,再将铝板置于冰盘上。
b)直径为90mm的培养皿需加0.5ml RNA提取缓冲液,并使之遍布整个平板的表面。
(RNA 提取缓冲注液配方:0.14mol/L NaCl,1.5mmol/L MgCl2,10mmol/L Tris.Cl(pH8.6),0.5%NP-40,1mmol/L二硫苏糖醇(DTT),100单位/ml RNA酶抑制剂或20mmol/L氧钒核糖核苷复合物。
)
c)加0.5ml蛋白酶消化缓冲液,用刮棒混匀粘稠状裂解物并将其刮到平板的边缘。
(蛋白酶消化缓冲液配方:0.2mol/L Tris.Cl(pH8.0),25mmol/L EDTA(pH8.0),0.3mol/L NaCl,2% SDS)
d)用装有21号针头的皮下注射器抽吸细胞裂解物,再将其注入聚丙烯管内。
重复3-4次,剪切DNA。
e)加蛋白酶K至终浓度为200μg/ml,充分混匀后置于37℃温育30分钟。
蛋白酶K以贮存液的形式保存,贮存液为20mg/ml蛋白K溶液。
2、悬浮培养的细胞或组织单细胞悬液的裂解
a)于4℃以2000g离心5分钟收集细胞,以10倍体积用冰预冷的无钙镁离子磷酸缓冲液悬沉淀,洗涤细胞3次,每次均用大口径的吸管轻轻吹打细胞沉淀,使其彻底分散。
b)估计细胞沉淀的体积,用10-20倍体积的RNA提取缓冲液重悬之。
c)加入与步骤b)所加RNA提取缓冲液体相同的蛋白酶消化缓冲液,用振荡器迅速混匀。
用装有21号针头的皮下注射器抽吸细胞裂解物,再将其注入聚丙烯管内。
重复3-4次,剪切DNA。
d)加蛋白酶K至终浓度为200μg/ml,充分混匀后置于37℃温育30分钟。
蛋白酶K以贮存的形式保存,贮存液为20μg/ml蛋白酶K水溶液。
二、提取步骤
1、用等体积酚:氯仿抽提1次,以去除蛋白质。
2、用吊桶式转头于室温以5000g离心10分钟使水相与有机相分相,将水相吸至一个新的离心管内,加2.5倍体积用冰乙醇,充分混匀,于0℃放置1小时。
3、于4℃以5000g离心10分钟沉淀RNA,弃上清,用含0.1mol/L乙酸钠(pH5.2)的70%乙酸洗涤沉淀,用自动微量移液器尽可能将乙醇吸尽,随后于室温放置几分钟,晾干沉淀。
切勿抽干沉淀,因为干的核酸沉淀很难溶解。
4、每个直径为90mm的培养皿或每107细胞加200μl 50mmol/L Tris.Cl(pH7.8)1mmol/L EDTA(pH8.0)溶液重溶沉淀。
5、分别按10mmol/L和0.1mmol/L的深度加MgCl2和二硫苏糖醇(DTT),然后分别按1000单位/或10mmol/L 的终深度加台盘RNA酶抑制剂或氧钒核苷复合物。
6、加入无RNA酶的胰DNA酶I至终浓度为2μg/ml,混匀,于37℃温育60分钟。
7、分别按10mmol/L和0.2%的终浓度加EDTA和SDS。
8、用等体积酚:氯仿抽提1次。
9、于室温以5000g离心10分钟使水相与有机相分相,将水相吸至另一个离心管内,加
3mol/L乙酸钠(pH5.2)至终浓度为0.3mol/L,加2.5倍体积用冰预次的乙醇,充分混匀,冰浴放置2小时。
10、用微量离心机于4℃以12 000g离心5分钟沉淀RNA。
11、吸出所有的乙醇,将打开管盖的离心管在实验台放置几分钟,让最后残存的痕量乙醇挥发干净。
12、用200μl TE(pH7.6)重溶沉淀,加500μl乙醇,于-70 ℃贮存备用。
回收DNA 时,只须取出1小份贮存液,加入3mol/L乙酸钠(pH5.2 )至终浓度为0.3mol/L,充分混匀,用微量离心机于4℃以12 000g离心5分钟即可。
三、注意事项
1、测定最终所得溶液的OD260值可以确定RNA的浓度。
取10μl乙醇/TE混合液离心沉淀RNA,以400水重溶,测定OD260值,OD260=1的RNA溶液每毫升约含40μg RNA。
2、如果需要,可用oligo(dT)-纤维素层析法从所制备的细胞总RNA中纯化无寡脱氧核糖核苷酸污染的mRNA或购买试剂盒进行mRNA的纯化。
3、某些情况下(例如从感染了DNA病毒或用DNA转染的细胞中制备RNA时),必须从细胞总RNA中去除寡脱氧核核苷酸。
否则,当用这种RNA构建cDNA库或进行引物延伸反应时应会出问题,反转录过程中法染的模板DNA片段可能会与RNA杂交而充当引物,从而导致物定mRNA5'末端定位的错误或产生截短的cDNA克隆。
a)步骤12后,加200μl 3mol/L乙酸钠(pH5.2),用自动微量移液器反复吹吸,以重悬核酸沉淀,将悬浮液移至另一个灭菌的微量离心管内。
b)用微量离心机于室温以12,000g离心10分钟,RNA沉于管底,而绝大部分寡脱氧核糖核苷酸仍在上清中。
c)弃上清液,用200μl TE(pH7.6)重溶沉淀。
加入20μl 3mol/L乙酸钠(pH5.2),分混匀,加入550μl用冰预冷的乙醇。
混匀溶液,在冰上骤冷30分钟。
用微量离心机于4℃以12,000g离心10分钟,以回收RNA。
小心吸出上清。
d)弃上清液,用300μl TE(pH7.6)重溶沉淀,加1ml乙醇,-70℃贮存备用。
回收RNA时,只需取出1小份贮存液,加3mol乙酸钠(pH5.2)至终浓度为0.3mol/L充分混匀,用微量离心机于4℃以12 000g离心5分钟即可。
如需去除氧钒核糖核苷复合物,用含0.1%羟喹啉的苯酚[用0.01mol/L Tris.Cl(pH7.8)平衡]将RNA终溶液抽提数次即可。