绝对实用chemdraw教程
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ChemDraw的使用方法【基本功能篇】ChemDraw是一款学化学的人基本都知晓的画结构式的软件,现已更名为ChemBioDraw这是一款对于我们研究化学的人来说不可缺少的软件之一,但是能够完整使用它所有动能的人,我想应该很少吧?当然,笔者也是其中之一。
所以,也为了自我学习,就写了一下这篇文章。
当然,这篇文章可能无法完全涵盖chemdraw所有的功能,这点也请大家见谅(^_^;)。
前言有了ChemDraw,我们就能准确的画出标题图这么好看的结构式。
但是chemdraw不是免费使用的,要买正规版还是需要花点钱。
虽然在中国,大家都用破解版,笔者在这里还是推荐大家尊重知识产权,能够尽量花钱买正版。
如果你只是一个大学生,为了写一下作业的话,有两款免费的软件推荐,它们是MarvinSketch和ChemSketch。
当然,如果是专门的研究人员,或者硕士博士的话,还是建议买一个完整版。
笔者现在用的是ver.13。
本文主要以这款进行说明探讨(2015年1月开始ChemDraw的最新版本是ver.14)。
如果仅仅是画一些结构式的话,版本的更新之间的差异不是特别大。
接下来在这里主要介绍一些使用频率比较高的菜单。
①FILE 菜单File菜单打开的话,除了保存等功能以外,也可以对页面进行一些设定。
Open Style Sheets :因为默认的样式表画出来的结构式并不是很漂亮,所以首先选择你想投的杂志所对应的结构式。
初学者的话一般推荐ACS格式。
具体的在后面会介绍Document Setting :可以进行包括结构式的各种样式的设定。
→Layout :在布局方面,经常在画到一半的时候,页面空余不够了。
这个时候我们就可以点击Document Size→Height・Width把操作页面扩展后,确保有足够的空间供我们作图。
→Drawing :在真正画图的时候经常需要调整的地方我想应该是化学键的长宽间距等等(Bonds), 下图给出了可以更改的具体的一些项目以及其代表的含义。
ChemDraw 教程-1Written by Anan Wu Xiamen UniversityChapter 1 Introduction1.1 启动ChemDraw在开始(Start)菜单中点击所有程序(P), 选择弹出菜单中ChemOffice2004中的ChemDraw Ultra 8.0即可启动程序1.2 ChemDraw 界面结构ChemDraw 软件的最大特点就是界面结构简单,包括文件窗口(菜单栏,工具栏,滚动栏,编辑区,状态/信息栏)和图形工具板两大结构,如图1-1所示。
图1-1 ChemDraw 软件的界面结构1.3 文件窗口ChemDraw 文件窗口的中心部分含有将用以绘制图形结构的编辑区域。
ChemDraw 文件窗口的基本组成部分如下:编辑区文件窗口图形工具板滚动栏工具栏菜单栏●标题栏:含有应用文件或操作文件的窗口标题。
●编辑区域:在ChemDraw文件窗口的中心部分,供绘制图形结构的工作区。
●菜单栏:含有为操作ChemDraw应用文件和其内容的命令设置。
●工具栏:含有常用的命令图标,当单击这些图标,其效果与选择菜单中相应的命令一样。
●最大/最小化,还原/关闭按钮:可使文件窗口最大/最小化。
●滚动栏:含有滚动框●状态/信息栏:含有表述绘制图形的简捷的信息。
1.4图形工具图标板图形工具图标板含有所有能够在文件窗口绘制结构图形的工具,选择这些工具后,光标将随之改变成相应的工具形状。
工具板间图1-2。
选择工具时,一次只能选择一个。
在图标右下角有效黑三角的工具图标中,含有进一步的子工具。
用鼠标按下含三角的图标时,子工具将显示出来。
图1-2 图形工具图标板选择工具:包括1)蓬罩工具,用于选择方框区域内的目标2)套索工具,由于选择目标。
拖动套索工具可以套住任意目标,然后进行编辑键工具:包括实键,虚键,切割键,切割楔键等,在以后章节会陆续讲解。
环工具:包括环丙烷,环丁烷等,用于快速绘制常用的环结构组成。
chemdraw教程(29)第二章Chemdraw的使用及技巧第一节绪论1.1安装ChemDraw基本操作步骤同其它软件类似,但是由于ChemDraw是一款商务软件,且价格在上千美元,大多数使用者往往是使用下载的版本而不是购买正版的商务套装。
双击ChemDraw 后,会弹出一个对话框,要求输入其注册用户名和密码进行软件的激活。
可以通过两种方法进行处理。
示,最好把line width放宽一点(画分子的时候也许Tolerances 也要大点,并且所有的键、原子都可以选成不同的颜色,这样贴到powerpoint里面比较pp一些。
图2-3 Preference对话框Color Palette(调色板)可以添加,移动或变化默认的前景或背景的颜色。
1.5 ChemDraw文件操作ChemDraw文件本身的格式是*.cdx。
在File /Apply Document Settings from…中集成了国际很多通用的格式,经常用的会是ACM 格式。
下面是ACS(美国化学会)所有杂志包括JACS对ChemDraw画分子结构的要求:1) As drawing settings select:chain angle 120°bond spacing 18% of widthfixed length 14.4pt(0.508cm,0.2in.)bold width 2.0pt(0.071,0.0278in.)line width 0.6pt(0.021cm,0.0084in.)margin width 1.6pt(0.056cm,0.0222in.)hash spacing 2.5pt(0.088cm,0.0347in.)2) As text sttings select:Font HelveticaSize 10pt3) Under the preferences choose:Units PointsTolerances 3Pixels4) Set the page setup to 100%5) Label the drawings:"Reduce to 75% of current size for publication."每次打开一个文件就会出现一个新的文件窗口,如果打开多个文件,文件窗口只显示最后打开的文件,通过Ctrl+Tab可以进行窗口的变换。
ChemDraw软件是Cambridgesoft公司出品的Chemoffice系列的最新版本Chemoffice2002的重要组成部分。
一、ChemDraw软件简介1、启动:在Windows下,有两种打开方式:在桌面上,双击ChemDraw图标;或者在“开始菜单”里选择ChemDraw选项。
2、界面简介:下图为ChemDraw的图形化用户界面(GUI)。
关于画图的主要工具——工具栏,其主要功能如下图所示:ChemDraw为绘制化学结构,提供了以下工具。
化学键工具, 环工具, 脂肪链工具, 自动错误矫正, 在ChemDraw Ultra中还新增了从化学名称到结构的功能。
⑴、化学键的绘制:绘制化学键有以下几种工具,利用这些工具,可以直接在文档中单击或者拖拉来绘制化学键。
默认的键长和键角用Object菜单中Fixed Lengths和Fixed Angles选项固定。
⑵、环的绘制:环的绘制,可以使用右边的工具:环的绘制可以用以下的方法,注意以下的细节:如果选择环工具之后,在一个原子上单击,则会在该原子上添加一个环,如果在一条键上单击,则会在键上添加环,具体的演示如下:如果想要绘制共轭环结构,可以按下CTRL键的同时,在文档中单击放置环。
这样,会在环中出现一个圆圈。
当然,这种情况下,环已烷的椅式结构除外。
⑶、脂肪链键的绘制:选择脂肪链工具,在文档上拖动鼠标即可画出长链。
也可以在文档空白区域或者一个原子上单击,在出现的对话框输入想要链长的原子数。
⑷、键的编辑:改变键的类型:选择键工具,指向已经存在的键,单击,则会出现新的类型的键。
改变楔形键和虚格键的方向:选择楔形键和虚格键工具,点击适当的位置,则方向被自动调整。
⑸、移动原子:选择键的工具,指向一个原子,然后按下Shift键的同时,拖动这个原子,就可以改变键的方向。
⑹、自动绘制结构从化合物的名字:从ChemDraw Ultra 的Structure菜单中选择Convert Name to Structure命令,在出现的对话框中输入2-bromobenzoic acid,点击OK后,就可以在文档中看见结构了。
也可以先用文本工具在文档中输入一些化合物的名字,然后选择这个名字,在选择Structure菜单Convert Name to Structure即可得到结构。
3、在ChemDraw中,可以在状态栏和信息区域显示使用信息。
4、用户自定义ChemDraw的一些功能。
Preferences允许用户改变应用于每个打开文档默认的选项。
Document Settings 可以允许你改变仅仅作用于激活文档的默认属性。
Preferences 影响ChemDraw 应用程序的工作方式。
从 File 菜单中选择Preferences.选项,点击Use Defaults选项可以载入默认的工作方式。
Document and object settings用来定义正在使用的文档格式. 包括:在layout框可以设置文档成格式海报或者页面.在footer框可以设置页眉、页角和一些注解。
在Drawing框中可以定义所绘结构的默认的键长,键角等参数。
在Captions框中定义所输入的文字的字体和大小。
在Atom Labels可以设置所输入原子符号的字体和大小。
在colors框中可以改变文档的背景、前景与其它颜色。
绘图设置是影响绘图中使用的化学键和其他单位的文档设置。
使用者可以为整个文档或者文档的特殊对象配置绘图设置:对于整个文档,在文档设置窗口中进行配置。
对于一个对象,在对象设置窗口中进行配置。
在绘制设置中的改变只影响当前激活文档,这些设置可以在StyleSheets/Stationery Pads保存。
为了为整个文档设置绘图设置:从 File中选择Document Settings,在出现的对话框中选择Drawing标签,出现如下:完成设置后,OK保存,该设置应用于整个文档。
为所选对象进行绘图设置:先选择你要定义的对象,然后从Object打开Object Settings对话框:在其中进行完设置后,OK保存,该设置只用于该对象的属性。
5、添加说明与原子标志ChemDraw 可以帮助你创建以下类型的文本。
说明文本:-创建注解,化学名称,化学式,页标题和表中信息。
原子标识文本-用化学符号标识原子和子结构使用者可以利用文本工具创建和编辑说明和原子标识,同时,可以在文档设定对话框和对象设定对话框编辑文本。
只需打开File菜单中的 Document Settings对话框,在其中选择Captions或Atom Labels来调整说明文本和原子标识。
创建文本说明:你新创建的文本的格式被在Document Settings对话框中的Captions标签中设定。
在你创建文本前修改成你想要的格式。
为了创建一个文本说明,首先单击文本工具,然后指向文档窗口的一个空白区域,单击插入文本框,然后输入文本。
利用回车键可以换行输入。
鼠标点击文档的空白地方即可文本输入框。
利用文本框旁边的把手可以改变文本框的大小。
只需拖动到希望的宽度即可。
如果想要改变已经存在的文本,只需选择文本工具,然后在文本上单击,即可修改文本。
在该版本的ChemDraw中,还可以利用Structure菜单中的 Convert Structure to Name命令直接把已绘出的结构加上名字。
利用文本工具添加原子标识:你新创建的文本的原子标识被在Document Settings对话框中的Atom Labels标签中设定。
在你创建文本前修改成你想要的格式。
为了在一个原子上添加原子标识,首先选取文本工具,然后指向一个原子(当鼠标指向一个原子上的时候,指示器就变形状了。
点击,然后输入原子标识即可。
如果是想要在一个环上添加原子标识,只需指向一个原子双击,然后输入文本即可。
6、绘制轨道,标记,箭头,化学符号和其它形状ChemDraw 提供了如下工具让使用者可以添加化学符号和标记到你的文档中。
Orbital tool-绘制轨道Chemical Symbols tool-绘制电荷、激发集团和其它符号。
Arrow tool-绘制各种箭头Drawing Elements tool-绘制各种方框,圆圈和线。
Brackets tool-绘制方括弧,圆括弧等Arc tool-绘制符号Pen tool-手绘各种形状二、ChemDraw基本操作1、设计反应式打开ChemDraw,然后用File/Save As命令将文档以文件名保存。
通过View 菜单选择 Show General Toolbar 和Show Info Window以显示一般工具栏和信息栏。
点开Object 菜单确定Fixed Lengths 和Fixed Angles是选定的。
注意:应用 fixed lengths 和 fixed angles可以使你在创建结构时使用固定的键长和键角。
The fixed length 长度可以在Drawing Settings 对话框中设定。
创建一条单键:(1)、选定实心单键工具,把指示器(+)定位到文档窗口的任何位置,然后点击。
单键以固定角度—30度,固定长度显示。
添加第二条键:(2)、将指示器指向右边的原子,点击原子以加一条键。
这条键和第一条键之间夹角120度。
注意:添加键的角度可以在Drawing Settings 对话框利用Chain Angle setting 设置。
添加第三条键:(3)、按照以上方法添加第三条键,完成后如右图所示:改单键为双键:点击中间的原子,按下鼠标,按照下图方向拖动鼠标,然后松开鼠标。
向结构中添加标签:用指示器(+)指向双键上方的原子,双击该原子,在出现的文本框中输入大写字母“O”,然后可以通过点击别的区域和选择别的工具关闭输入文本框。
接下来,利用复制这个结构,并利用复制品创建一个新的结构。
复制结构:选择套锁工具,所绘结构会被自动选取。
指向选择框,按下Ctrl键,向右侧拖动选取框。
就会复制出一个结构。
修改复制结构:选择实心单键工具,指向复制结构右下方的原子,单击。
并在同一个原子上多次单击以添加多条键。
完成图如右:注意:多次单击不可过快,否则,会出现文本框。
应在单击之间稍做停留。
选择要添加的标签的原子,在上面输入“O H”。
排列结构:选择两个结构,在Object菜单下,指向 Align,并选择 T/B centers,将两个结构对齐。
结果如下:接下来,使用不用的方式选择结构,并将两个结构分开一定的距离以添加箭头:选择选取框工具,最后一个绘制结构会被选择。
按下Shift 键以保持结构的整齐,并拖动选取框至右边。
向反应式中添加箭头:点击箭头工具以显示箭头模板。
选择箭头后,松开鼠标。
指向第一个结构的后方,并按下鼠标,拖动箭头至你想要的长度,然后松开鼠标。
注意:在箭头工具右下方的三角形说明该图表包含有模板内容。
如果你想改变箭头的长度和箭头与X轴的夹角,可以这样:1.按下 Shift键并指向箭头,这时,一个高亮的框将会出现,如果你选择正确的对话。
2. 拖动箭头至你所想要的长度和角度。
利用文本工具在添加反应条件与催化剂:选择文本工具,指向箭头上方,单击插入文本框,在出现的文本框中输入OH,完成如下图:注意:如果你想重新放置文档,可以利用选择工具然后拖动该说明。
利用在化学符号工具模板中可用的特殊符号加一个电荷符号:选择化学符号工具,选择环型负电荷符号,指向“OH”的中间,并单击放置电荷工具。
注意:如果你在放置符号之后,按着鼠标,就可以沿着符号通过拖拉将其旋转到固定位置。
从化学符号模板中添加的符号自动和离他们最近的结构相结合。
一些诸如箭头之类的符号不能自动结合,使用者可以使用群组命令手工合并这些符号。
为了组合符号:点击选择工具—套锁或者选取框。
按下Shift键的同时,点击箭头,OH 标签和电荷符号。
在Object菜单中选择Group就可以组合这些目标。
注意:如果你按着“Shift”点击一个已被选择的目标,则该目标可以取消选择。
你可以通过在一个群中点击单个的物体来选择他们。
利用文本工具可以创建包括反应物的名字和数量的说明:选择文本工具,指向第一结构的下方,单击创造一个文本框,在“Text”菜单中选择“Centered”命令,鼠标会移到文本框的中间,然后输入文本“2-propanone”,点击“Enter or Return”按钮可以输入新的一行。
然后输入“2 moles”,为另一个结构创建一个平行的说明:先放置一个文本框,然后输入4-hydroxy-4-methyl-2-pentanone, 和1 mole。
最后,为了完成方程式,我们给方程式一个阴影框:选择“绘制元素”工具,从模板中选择阴影框,如下图所示圈出阴影范围。