核酸分子杂交
一、概念:
1、分子杂交(hybridizat子浓度等条件下,通过碱基 互补退火形成稳定的双链分子的过程 。
2、 印迹(bloting):将DNA、RNA或蛋白质固定到固体 支持物上的过程。
3、探针(probe):核酸探针是指用放射性核素、生物 素或其他活性物质标记的,能与特定的核酸序列发生特 异性互补的已知DNA或RNA片段。
(2) Northern杂交:RNA片段经电泳后,从凝胶中 转移到硝酸纤维素滤膜上或尼龙膜,然后用探针杂交。 被检对象为RNA,探针为DNA或RNA。
二、Southern杂交
1、步骤:
Southern杂交可用来检测经限制性内切酶切割后 的DNA片段中是否存在与探针同源的序列,它包括下 列步骤:
(1) 酶切DNA, 凝胶电泳分离各酶切片段,然后使 DNA原位变性。
进行克隆筛选时,可采用本方法。将这些菌落归并到 一个琼脂主平板以及已置于第二个琼脂平板表面的一 张尼龙膜上。经培养一段时间后,对菌落进行原位裂 解。主平板应贮存于4℃直至得到筛选结果。
五、斑点杂交
(2)254nm波长的紫外线照射尼龙膜带RNA的一面。
后一种方法较为繁琐,但却优先使用,因为某些批号的带正 电荷的尼龙膜经此处理后,杂交信号可以增强。然而为获 得最佳效果,务必确保尼龙膜不被过度照射,适度照射可 促进DNA上小部分碱基与尼龙膜表面带正电荷的胺基形 成交联结构,而过度照射却使DNA上一部分胸腺嘧啶共价 结合于尼龙膜表面,导致杂交信号减弱。
三、Northern杂交
Northern杂交与Southern杂交很相似。主要区别 是被检测对象为RNA,其电泳在变性条件下进行,以去 除RNA中的二级结构,保证RNA完全按分子大小分离。 变性电泳主要有2种:乙二醛变性电泳、甲醛变性电泳。 电泳后的琼脂糖凝胶用与Southern转移相同的方法将 RNA转移到硝酸纤维素滤膜上,然后与探针杂交。