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３１２ ？ 化 学 世 界 ２００７ 年 常用化学化工互联网数据库简介 李嘉轩 ， 阎爱侠 （ 北京化工大学 ，生命科学与技术学院 北京 １０００２９） ３ 摘 ： 化合物各种常见性质的检索对化学化工工作者十分重要 。
介绍了几个重要的化学化工互 要 联网数据库 ，包括 Ｃｈｅｍｆｉｎｄｅｒ ，ＮＣＩ ，ＳＲＣ ，ＺＩＮＣ ，ＣｈｅｍＢｌｉｎｋ 五个数据库 ，并对其站点 、 内容和功能以及 使用技巧作了简要的阐述 。
关键词 ： 化学 ； 数据库 中图分类号 ： Ｚ ８９ 文献标识码 ：Ｂ 文章编号 ：０３６７２６３５８ （ ２００７） ０５２３１２２０２ Ｉｎｔｒｏｄｕｃｔｉｏｎ ｏｆ Ｓｅｖｅｒａｌ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｄａｔａｂａｓｅｓ ｏｎ Ｉｎｔｅｒｎｅｔ ＬＩ Ｊｉａ２ｘｕａｎ ， Ｙ Ａｉ２ｘｉａ ＡＮ （ Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ ｌｉｆｅ ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ， Ｂｅｉｊｉｎｇ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ， Ｂｅｉｊｉｎｇ １０００２９ ， Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ ： Ｉｔ ｉｓ ｉｍｐｏｒｔａｎｔ ｆｏｒ ｃｈｅｍｉｃａｌ ｒｅｓｅａｒｃｈｅｒｓ ｔｏ ｓｅａｒｃｈ ｖａｒｉｏｕｓ ｐｈｙｓｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ ｏｆ ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ ｉｎ ｔｈｅｉｒ ｗｏｒｋ． Ｆｉｖｅ ｉｍｐｏｒｔａｎｔ ｃｈｅｍｉｃａｌ ｄａｔａｂａｓｅｓ ｏｎ ｉｎｔｅｒｎｅｔ ａｒｅ ｉｎｔｒｏｄｕｃｅｄ ， ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ Ｃｈｅｍｆｉｎｄｅｒ ， ＮＣＩ ， ＳＲＣ ， ＺＩＮＣ ， ＣｈｅｍＢｌｉｎｋ． Ｗｅｂｓｉｔｅｓ ， ｃｏｎｔｅｎｔ ， ｆｕｎｃｔｉｏｎ ａｎｄ ｕｓｉｎｇ ｔｅｃｈｎｉｑｕｅ ｏｆ ｔｈｅｓｅ ｄａｔａｂａｓｅｓ ａｒｅ ａｌｓｏ ｅｘｐｏｕｎｄｅｄ． Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ ： ｃｈｅｍｉｃａｌ ； ｄａｔａｂａｓｅ 随着化学化工以及制药领域的发展 ， 人们对化 合物的结构和各种物化性质以及生物活性的检索也 越来越频繁 。
伴随着生物和化学信息学的出现以及 网络技术的发展 ， 一些重要的基于国际互联网服务 的化学化工数据库已经逐渐引起了人们的重视 ， 它 们在使用方面比通常的书籍检索更方便 、 快捷 。
现 对这些数据库做一个简单的介绍 。
１ Ｃｈｅｍｆｉｎｄｅｒ 数据库 Ｃｈｅｍｆｉｎｄｅｒ 是由英国 ＣａｍｂｒｉｄｇｅＳｏｆｔ 公司提供的 ， 物一般都是最为常见的 。
这个数据库的最大优点就 是查询方便 ，快捷 ， 而且部分功能免费 ， 相对价格低 廉。
Ｃｈｅｍｆｉｎｄｅｒ． ｃｏｍ 的检索途径包括 ： 化学名称 （ 或 俗名） 、 （ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ａｂｓｔｒａｃｔｓ Ｓｅｒｖｉｃｅ） 编码 、 ＣＡＳ 分子式 、 相对分子质量 。
注意 ，在输入化学名称时 ，如果名称 不完整 ，可以用 ３ 代替进行模糊检索 。
通过检索可 以得到包括分子式 ，ＣＡＳ 编码 ，相对分子质量 ，密度 ， 熔点 ， 沸点 ， 闪点 ， 溶解度 ， 蒸汽压 ， 蒸汽密度等化合 主要通过其网站为用户提供查询服务 ， 多数数据库 是需要收费的 ，但是对于化合物基本性质和结构的 查询是免费的 。
在首次使用这个数据库之前 ， 用户 需要进行一下简单的注册 ， 获取 ｃｈｅｍｆｉｎｄｅｒ 的用户 名和密码就可以进行检索服务了 。
该数据库的网址 物的基本性质 。
此外 ， 人们可以直接看到化合物的 二维结构图 ， 并且通过点击 ＶＩＥＷ ＣＨＥＭ３Ｄ ＭＯＤＥＬ 看到三维结构图 。
２ ＮＣＩ Ｄａｔａｂａｓｅ Ｂｒｏｗｓｅｒ 数据库检索 ＮＣＩ 数据库是一个重要的化合物及药物结构和 是 ｈｔｔｐ ：Πｃｈｅｍｆｉｎｄｅｒ ，ｃａｍｂｒｉｄｇｅｓｏｆｔ ． ｃｏｍΠ， 在这个网站 Π 上一共收集了大约 ７５ ，０００ 个化合物 ，而且这些化合 性质检索的数据库 ， 一共有 ２５０ ，２５１ 个化合物结构 可以 进 行 检 索 。
ＮＣＩ Ｄａｔａｂａｓｅ Ｂｒｏｗｓｅｒ 的 网 址 是 收稿日期 ：２００７２０１２０１ 基金项目 ： 国家自然科学基金 （２０６０５００３） ； 国家 ８６３ 计划 （２００６ＡＡ０２Ｚ３３７） ； 教育部留学回国人员基金 （２０６０５００３） ３ 联系人 ： Ｅｍａｉｌ ：ｙａｎａｘ ＠ｍａｉｌ ． ｂｕｃｔ ． ｅｄｕ． ｃｎ 第５期 化 学 世 界 ３１３ ？ 互联网进行免费检索 ， 而且整个数据库可以免费下 ［１ 、］ ２ 载 。
ＮＣＩ 数据库的检索途径包括 ： ＣＡＳ 编码 ，ＮＳＣ 编 码 ，分子式 ， 相对分子质量 ， 名称 ， 化合物的结构 ， 复 杂度 ，原子数目的范围 ，氢键接受体和给予体的数目 等选项 。
此外 ，人们可以同时规定多个检索要求 ，从 而得到所需特定化合物的信息 。
通过 ＮＣＩ 数据库检 索可以得到化合物的以下信息 ： 分子式 ，ＣＡＳ 编码 ， 相对分子质量 ，复杂度 ，抗 ＨＩＶ 活性 ， 氢键接受体和 给予体的数目 ， 可旋转键的数目 ，ｌｏｇＰ ， 有关生物活 性的预测值以及化合物结构的分子文件 （ ＳＭＩＬＥＳ ， ｓｄｆ 文件等） 。
此外 ，ＮＣＩ 数据库还可以进行化合物的子结构 检索 ，相似性检索和三维药效团检索 ，通过检索可以 得到符合检索要求的一系列相似化合物 ， 并且可以 下载它们的分子文件 ，这对药物设计有很大的帮助 。
需要指出的是 ，ＮＣＩ 数据库中给出的分子的三维结 构不是通过实验测定的 ， 而是通过 ＣＯＲＩＮＡ 软件根 ［１２２ ］ 据分子的二维结构计算而得到的 。
ＳＲＣ 物理化学性质数据库是由 Ｓｙｒａｃｕｓｅ 公司免 ３ ＳＲＣ 物理化学性质数据库 授实验室提供的一个可以直接用于进行虚拟筛选的 免费三维数据库 ， 它的网址是 ｈｔｔｐ ：Πｂｌａｓｔｅｒ． ｄｏｃｋｉｎｇ． Π ｏｒｇΠ Π ｚｉｎｃ ｃｈｏｏｓｅ． ｓｈｔｍｌ ，其中包括 ４ ，６００ ，０００ 个化合物 。
ＺＩＮＣ 数据库的检索途径是化合物的 ＳＭＩＥＬＳ 格式 ， 费提供的 ，一共包括 ２５ ，０００ 个化合物的基本物理化 学 性 质 ， 它 的 网 址 是 ｈｔｔｐ ：Πｗｗｗ． ｓｙｒｒｅｓ． ｃｏｍΠ Π Π ｅｓｃ ｐｈｙｓｄｅｍｏ． ｈｔｍ 。
这个数据库只有通过化合物的 ＣＡＳ 编码才能进行检索 。
如果检索者并不知道确切的 ＣＡＳ 编码 ，在这个数据库的检索界面提供了一个可 以在线查询 ＣＡＳ 编码的链接 。
检索者只需要知道 化合物的名称或分子式就可以检索到相关化合物的 ＣＡＳ 编码 ，然后就可以进一步检索化合物的物理化 学性质了 。
通过检索可以得到化合物的名称 ， 分子 式 ，相对分子质量 ，熔点 ，沸点 ，ｌｏｇＰ ， 水溶解度 ， 蒸汽 压 ，Ｐｋａ （ ａｃｉｄ ｄｉｓｓｏｃｉａｏｎ ｃｏｎｓｔａｎｔ） ，Ｈｅｎｒｙ 常数等 。
这个 数据库的优点就是方便 ，快捷 ，对于有些没有实验值 的性质提供了估计值作为参考 。
ＺＩＮＣ 是由美国加州大学旧金山分校 Ｓｈｏｉｃｈｅｔ 教 ４ ＺＩＮＣ 数据库 同时还可以规定其它性质的范围 ，比如 ： 静电荷的范 ｈｔｔｐ ：Π１２９． ４３． ２７． １４０Π Π ｎｃｉｄｂ２Π，ＮＣＩ 数据库可以通过 围 ，ｘｌｏｇＰ 的范围 ，可旋转键数目的范围 ，相对分子质 量的范围 ，氢键接受体和给予体的数目范围 ，极性表 面积的范围等等 。
而且 ＺＩＮＣ 数据库还可以进行官 能团检索 。
ＺＩＮＣ 数据库的检索结果是与输入结构相类似 的一系列化合物 ， 这对于药物的虚拟筛选及药物设 计很有帮助 。
此外 ，ＺＩＮＣ 数据库的检索结果还给出 了一些化合物的重要性质 ，包括 ｘｌｏｇＰ ，溶解度 ，氢键 ［３ ］ 接受体数目 ， 氢键给予体数目 ， 电荷等 。
通过检 索 ，人们可以看到化合物的二维结构和三维结构 ，而 且可 以 下 载 所 有 化 合 物 结 构 的 分 子 文 件 ， 包 括 ＳＭＩＬＥＳ ，ＳＤＦ ，ＭＯＬ２ 和 Ｆ１ｅｘｉｂａｓｅ 四种格式 。
此外 ，在 检索到所需化合物相关信息后 ， 还可以以表格的形 式下载化合物的相关信息 ， 下载格式为 Ｅｘｃｅｌ 文件 ， 以方便检索者的使用 。
５ ＣｈｅｍＢｌｉｎｋ 数据库 ｉｎｄｅｘ． ｈｔｍ ，它最大的优点就是提供了中英文两个界 ＣｈｅｍＢｌｉｎｋ 的网址是 ｈｔｔｐ ：Πｗｗｗ． ｃｈｅｍｂｌｉｎｋ． ｃｏｍΠ Π ２００５ ，４５ （１） ：１７７２１８２． Ｃｏｍｐｕｔ Ｓｃｉ ［Ｊ ］ ， ２００２ ，４１ （１） ：４６２５７． Ｓｃｉ ［Ｊ ］ ， ２００１ ，４１ （３） ：７０２２７１２． 面供查询者使用 ， 检索界面下提供了中英文切换的 链接 。
人们可以通过 ＣＡＳ 编码 ， 分子式 ， 化合物名 称 ，供应商等进行检索 ， 以得到相关的化合物的信 息。
通过检索人们可以看到化合物的结构 ， 中英文 名称 ， 相对分子质量 ， 熔点 ， 沸点 ， 闪点 ， 溶解度等性 质 。
此外 ，该数据库还提供了该化合物供应商的信 息 ，方便人们购买 。
总之 ， 通过利用以上互联网资源进行数据库的 检索 ，人们可以方便的得到所需化合物的结构 、 性质 以及购买信息 。
参考文献 ： ［１ ］ Ｖｏｉｇｔ Ｊ Ｈ ， Ｂｉｅｎｆａｉｔ Ｂ ， Ｗａｎｇ Ｓ ， ｅｔ ａｌ ． Ｊ Ｃｈｅｍ Ｉｎｆ Ｃｏｍｐｕｔ ［２ ］ Ｉｈｌｅｎｆｅｌｄｔ Ｗ Ｄ ， Ｖｏｉｇｔ Ｊ Ｈ ， Ｂｉｅｎｆａｉｔ Ｂ ， ｅｔ ａｌ ． Ｊ Ｃｈｅｍ Ｉｎｆ ［３ ］ Ｊｏｈｎ Ｊ ， Ｉｒｗｉｎ ， Ｂｒｉａｎ Ｋ， Ｓｈｏｉｃｈｅｔ． Ｊ Ｃｈｅｍ Ｉｎｆ Ｍｏｄｅｌ ［Ｊ ］ ， ［４ ］ ： Πｃｈｅｍｆｉｎｄｅｒ． ｃａｍｂｒｉｄｇｅｓｏｆｔ． ｃｏｍ ｈｔｔｐ Π Π ［５ ］ ： Π１２９． ４３． ２７． １４０Π ｈｔｔｐ Π ｎｃｉｄｂ２Π ［６ ］ ： Πｗｗｗ． ｓｙｒｒｅｓ． ｃｏｍΠ Π ｈｔｔｐ Π ｅｓｃ ｐｈｙｓｄｅｍｏ． ｈｔｍ ［８ ］ ： Πｗｗｗ． ｃｈｅｍｂｌｉｎｋ． ｃｏｍΠ ｈｔｔｐ Π ｉｎｄｅｘ． ｈｔｍ ［７ ］ ： Πｂｌａｓｔｅｒ． ｄｏｋｉｎｇ． ｏｒｇΠ Π ｈｔｔｐ Π ｚｉｎｃ ｃｈｏｏｓｅ． ｓｈｔｍｌ１。
