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《化学信息学》教学大纲【最新精选】《化学信息学》教学大纲一、课程基本信息课程编号:84110123课程中文名称:化学信息学课程英文名称:Chemical Informatics课程类型:专业必选课总学时:42学时学分:3适用专业:化学先修课程:无机化学、有机化学、物理化学开课院系:化学学院二、课程性质和任务本课程是化学—生物学实验班的专业必选课～辅助专业课应用的一门技术基础课。
本课程将全面介绍化学信息学的发展和现状～检索方法和文献情报的搜集整理。
使学生掌握一般化学化工参考工具书～化学情报～化学化工核心期刊的检索方法～了解互联网的知识。
并使学生利用专业课、完善学生的知识体系的能力得以提升～为今后实际工作打下坚实的基础。
三、课程教学目标在学完本课程之后，学生能够:1.了解化学信息学的发展和现状2.了解化学信息的出版形式和存储方法3.掌握各种信息资料的检索方法4.掌握化学信息的搜集整理5.掌握一般化学化工参考工具书，ISI数据库，美国化学文摘，化学化工核心期刊的检索方法。
6.了解互联网的一般知识。
四、理论教学环节和实践教学环节第一章绪论【教学目标】介绍化学文献的发展历史、化学情报检索系统的建立以及化学文献查阅的意义。
【教学重点】了解化学文献的发展历史。
【教学难点】情报检索系统。
【学时数】 2学时。
【考核知识点与考核要求】化学文献的发展历史、化学情报检索系统的建立以及化学文献查阅的意义。
第一节化学文献的发展本节应了解、理解、掌握的基本概念、基本理论 1、了解化学文献的发展历史。
2、理解当今化学文献总的特点。
第二节化学文献源概述本节应了解、理解、掌握的基本概念、基本理论 1、掌握化学文献源的构成:图书、期刊、科技报告、学位论文、会议资料、专利文献、技术标准、技术档案和产品样本。
2、掌握化学文献源的特点及作用。
第三节化学情报检索系统的建立和发展本节应了解、理解、掌握的基本概念、基本理论1、掌握一次文献、二次文献和三次文献的概念。
2006-2007化学信息学(计算机化学)学科发展报告随着化学信息的大量积累与计算机与网络技术的飞速发展，“化学信息学”已成为化学学科的重要分支之一。
尽管尚缺乏被广泛接受的严格定义，但其精髓可描述为“从数据到信息然后到知识”的说法已得到普遍认可，其具体研究内容包括：计算化学、分子模拟与设计、化学计量学、数据挖掘与知识发现与的利用[16-1,2]。
(一)化学信息学在社会与经济可持续发展中的地位与重要性门捷列夫可被认为是最早的化学信息学家，他通过对化学元素结构与性质的总结建立了化学元素周期表。
近年来，化学信息学在功能材料与分子设计、产品质量评价与控制、环境检测与控制、生命与健康、疾病诊断、各类“组学”的数据挖掘、复杂体系分析、智能分析仪器与新产品开发等研究领域中均发挥了重要作用，为社会与经济的可持续发展奠定了理论与技术基础[16-3,4]。
例如，虚拟筛选()和定量构效关系()等化学信息学技术的引入不仅明显缩短了新药研发周期而且大幅度降低了开发成本；“指纹图谱”的提出与应用为中草药的质量评价与控制提供了关键技术。
(二)近两年化学信息学的研究进展化学信息学在理论化学、分子模拟与设计、化学计量学、数据挖掘以与资源的利用等方面均取得了重要进展[16-5]。
分子模拟研究为药物分子的筛选建立了快速的虚拟高通量筛选()方法[16-6]、为药物的全新设计( )提供了研究方法和手段[16-7]、为蛋白质-配体之间的相互作用研究建立了新的计算方法[16-8]、为小分子化合物的与其它理化性质发展了理论预测方法[16-9]。
理论化学计算与实验科学相互结合用于合成化学和材料设计，实验结果与计算结果得到了相互印证和补充[16-10,11]。
分子动力学、模拟在化学、生物、材料等领域得到应用[16-12,13]。
基于分子力学的优化方法被广泛关注，新的优化算法不断涌现[16-14]。
为了扩展微观的分子力学与分子动力学方法的时空尺度，“粗粒化”力场的方法被重视和发展，多尺度的模拟方法被关注[16-15]。
化学信息学是化学领域中近几年发展起来的一个新的分支，是建立在多学科基础上的交叉学科，利用计算机技术和计算机网络技术，对化学信息进行表示，管理，分析，模拟和传播，以实现化学信息的提取，转化与共享，揭示化学信息的实质与内在联系，促进化学学科的知识创新。
基本简介化学信息学是一门应用信息学方法来解决化学问题的学科。
20世纪中后期，伴随着计算机技术的发展，化学家开始意识到，多年来所积累的大量信息，只有通过计算机技术才能让科学界容易获得和处理，换言之，这些信息必须通过数据库的形式存在，才能为科学界所用。
这一新领域出现以后，没有一个恰当的名称。
活跃在这个领域的化学家总是说他们在“化学信息”领域工作。
然而，因为这一名称难以将处理化学文献的工作和发展计算机方法来处理化学信息的研究分别开来。
所以，一些化学家就称之为“计算机化学”，以强调采用计算机技术来处理化学信息工作的重要性。
但是，这个名称容易与理论化学计算，即“计算化学”混淆。
1973年，由NATO高级研究所夏季学校在荷兰Noordwijkerhout举办的一次研讨班，首次将在在不同化学领域工作，但都是采用计算机方法处理化学信息，或是用计算机技术从化学数据中获取知识的科学家集中在一起。
这次研讨班的名称就定为“化学信息学的计算机表征与处理”。
参加这次会议的科学家主要从事化学结构数据库，计算机辅助有机合成设计，光谱信息分析和化学计量学等方面的研究，或者开发分子模拟软件。
研讨班期间，这些化学家意识到，一个新的研究领域已经形成，而且，它隐含在化学各分支之间。
从那之后，应用于解决化学问题的计算机科学和信息学方法悄然进入了化学的各个领域。
而“化学信息学”这一名词的出现还是最近的事情。
以下是几个最早的定义：“应用信息技术和信息处理方法已成为药物发现过程中的一个很重要的部分。
化学信息学实际上是一种信息源的混合体。
它可将数据转换为信息，再由信息转换为知识，从而使我们在药物先导化合物的识别和组织过程的决策变得更有效。
化学读书笔记摘抄及感悟摘要：1.引言：化学的重要性与兴趣2.化学读书笔记：内容概述3.化学感悟：实际应用与学科交叉4.总结：化学学习的价值与启示正文：【引言】化学是一门研究物质组成、性质、变化以及能量守恒的科学。
它既是一门理论学科，也是一门实验学科。
化学在我们的生活中无处不在，从食物、药品、化妆品到能源、材料、环境等，都离不开化学知识。
正是这种无处不在的特性，使我对化学产生了浓厚的兴趣。
【化学读书笔记：内容概述】在化学的学习过程中，我阅读了大量相关书籍，积累了丰富的化学知识。
其中包括化学原理、有机化学、分析化学、物理化学等。
通过学习，我了解到化学的研究方法、基本概念和定律，掌握了一定的实验技能。
以下是一些读书笔记的摘抄：1.化学反应的本质：化学反应是物质在原子、离子或分子水平上的重新排列，形成新的物质。
2.化学键：化学键是物质中原子间的相互作用力，分为共价键、离子键和金属键等。
3.热力学定律：能量守恒定律、熵增加原理等热力学定律在化学反应中起着重要作用。
【化学感悟：实际应用与学科交叉】化学知识不仅具有理论价值，更具有实际应用价值。
例如，在新能源领域，燃料电池、太阳能电池等的研究与开发离不开化学原理；在材料科学领域，高分子材料、纳米材料的研究也离不开化学。
此外，化学在环境保护、生命科学等领域也发挥着重要作用。
同时，化学与其他学科的交叉也产生了许多新兴领域，如化学信息学、化学生物学、化学生物学等。
这些交叉学科为化学研究提供了更广阔的发展空间，也使化学知识更加丰富和实用。
【总结】学习化学，不仅让我掌握了丰富的化学知识，还使我认识到了化学在生活中的重要性。
化学知识不仅可以帮助我们更好地了解世界，还可以解决许多实际问题。
在今后的学习和工作中，我会继续深入研究化学，将所学知识运用到实际中，为人类的发展做出贡献。
化学书籍读书笔记范文化学书籍读书笔记范文当细细品完一本名著后，大家一定都收获不少，不能光会读哦，写一篇吧。
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化学书籍读书笔记1新一轮课改是从适应时代的需要出发，对化学教材大幅地进行改编，要求教师必须以一个全新的观念去审视新教材，通过学习，加深了对新教材的认识和理解，现谈几点认识和。
一、对新教材的认识：高中化学课程改革一个非常显著的变化就是课程结构的变化。
因为课程结构的变化而带来了课程内容、教学要求以及评价等诸多方面的变化。
所有的学生都要学化学，而不同的学生可以学不同的化学。
所有的学生在科学素养方面都要有最基本的发展，但是在进入高中之后，不同的学生可以根据他们的个性、特长、潜质在科学素养发展方面获得不同的发展。
新课程的课程结构强调领域和模块，层次性和选择性。
从观念上说：新教材融进了大量的新知识，甚至有些知识对教师和学生来讲是站在同一起跑线上，像：新型无机非金属材料，合成氨前景展望等。
设置了较多的讨论和生活观察题目，从中折射出新的知识、学习观和教学观。
教师必须转变教学观念，切实承担起引导、启发、点拔、评价的`责任，激发学生的学习动机，学习兴趣和创新意识，让学生感受、理解知识产生和发展的过程，树立良好的学习观。
新课程必修共有两个模块，选修有六个模块。
必修的内容比较少，学生的心里负担较轻，对培养孩子的兴趣有好处。
除此之外，必修课内容比较简单，学生学完必修课以后对化学有了一个基本的认识，在这基础上学生就可以进行选择。
选修有六个模块，内容非常丰富，为学生进一步深入学习化学打下基础，很有好处。
二、对新理念的认识。
正确树立高中化学新理念建立有共同基础而又能适应不同学生发展需要的适应时代需要的可选择的化学课程体系；强调化学课程的应用性和实践性，培养学生从化学视角看待物质世界，能应用化学知识和化学方法参与社会决策和解决问题的能力；倡导以科学探究为主的多样的学习方式，重视化学学习方法的启迪，提高学生终身学习的能力，在现代社会的生存和竞争能力；建立有利于学生个性发展的课程评价体系；充分发掘化学课程的人文内涵，有利于学生形成正确的人生观、世界观、和价值观，有利于学生思维能力、分析解决问题能力的发展，提高科学素养和人文素养。
《化学信息学》读书笔记诺伯特·维纳对信息的著名定义：“信息就是信息，不是物质也不是能量。
不承认这一点的唯物论，在今天就不能存在下去。
”这句话深刻揭示了信息的重要地位，信息与物质、能量是客观世界的三大构成要素。
信息：事物的存在方式和运动状态的记录，它精确地描述物体或事件，并且可借助于一定的物质载体进行存储和传播。
从产生信息的客体的性质来分，可分为自然信息（声、光、热、电、天气变化、地壳运动、天体演化等）、生物信息（如遗传信息、生物体内信息交流、动物种群内的信息交流）、机器信息（自动控制系统）和（人类）社会信息。
以信息所依附的载体为依据，可分为文献信息、口头信息、电子信息、生物信息等。
信息与知识和文献之间的区别信息（Information）：通过信号带来的消息。
知识（knowledge）：人类社会实践经验的总结，是信息的一部分，需要通过信息使用归纳、演绎的方法得到。
文献（document）：是用文字、图形、符号、声频、视频等技术手段记录人类知识的一种载体，或理解为固化在一定物质载体上的知识和信息。
情报（information，intelligence）：激活了的知识。
性质有知识性、传递性及效用性。
经过传递的文献才是情报，资料是文献的通俗说法。
化学信息概论一.化学信息学的产生和发展：信息：实物的存在方式和运动状态的记录，它精确地描述物体或事件，并且可借助于一定的物质载体进行存储和传播。
化学信息学：是应用信息学方法解决化学问题的学科。
（化学信息学是信息科学与化学的交叉学科。
）二.化学信息学的研究领域：应用现代信息技术构建信息处理系统，处理长期积累的大量化学信息资源，帮助化学家组织、分析和理解已知的科学数据，正确地预测化学物质的性质，开发新化合物、材料和方法。
应用计算机科学方法或信息学解决化学问题，对化学信息进行有效的存储、操作和处理，使化学信息合理地提升为化学知识。
研究内容：化学、化工文献学；化学知识体系的计算机表示、管理与网络传输；化学图形学；化学信息的解析与处理；化学知识的计算机推演；化学教育与教学的现代技术与远程信息资源。
三.信息资源检索的意义与作用：1.启迪创新：科研工作具有继承和创新两重性，要求科研人员在探索未知进行创新之前，应该尽可能地继承和利用与之相关的信息。
2.拓宽视野：21世纪信息与知识的积累日新月异，出现了大量的边缘科学和交叉科学。
面对知识频繁更新的世界，需要接受终身教育，在不断的教育中更新知识，适应环境的变化。
3.培养能力：现代教育不单纯是知识的传授，更重要是要大力进行各种能力的培养，其中包括自学能力、思维能力、研究能力、表达能力、创新能力、终生教育能力、组织管理能力和收集处理信息的能力。
4.提高素质：信息素质是信息社会中实现对知识的探索和发现的综合能力，它是进入信息社会赖以生存的通行证。
四.化学信息学的课程内容：化学信息的产生和获取：利用检索工具、通过实验方法化学信息的表达、存储和管理：化学运筹学、数据整理可视化、数据库管理技术化学信息的加工和处理：化学计量学、化学软件、目的是获取更多的信息化学信息的深化：计算机模拟设计、化学结构的可视化以图形的方式对化学信息进行描述五.电子信息和数据库（一）电子信息：指通过计算机等设备以数字信号传递的数字信息资源组成的数据库。
1.联机信息资源，如：Dialog、STN、OCLC数据库2.光盘信息资源，包括单机版、网络版、联机版3.Internet网络信息资源（二）数据库：数据库是以特定方式合理地组织相互关联的数据集合。
1.数据库的结构：（1）记录型文献数据结构常用的字段：标题、作者、地址、期刊名、学科、文件类型、语种和摘要。
2.记录的排序和索引：（1）顺排文档：按记录号顺序排列；（2）倒排文档：各个记录按照某一字段的值进行排列。
六.信息检索的方法和步骤（一）信息检索的评价1.评价指标：查全率、查准率、漏检率、误检率、响应时间、用户负担、输出形式等。
2.查全率和查准率：（1）查全率（R）：检索出的相关信息量（w）与该系统信息库中存储的相关信息量（x）的比率称为查全率，R=w/x ×100 %。
（2）查准率（P）：检出的相关信息量（w）与检出信息总量（m）的比率称为查准率，P= w/m ×100 %。
两者之间存在互逆关系，即查全率高时，查准率较低，反之亦然。
（3）漏检率（O）：O = 1 – R = 1- w/x × 100 % 。
（4）误检率（N）：N = 1 - P = 1-w/m × 100 % 。
如果一个检索系统中与某一课题相关的信息共250条。
检索操作后，实际检出了400条信息，其中相关信息为200条，此次检索效率可计算为：R = [200 /250] × 100 %=80% O = 1-80% = 20%P = [200/400] × 100%=50% N = 1-50%= 50%3.位置检索：(1)With（W、nW），表示算符两侧的检索词按此前后衔接的顺序排列，词序不可颠倒。
(2)Near（N、nN）表示算符两侧的检索词必须紧密相连，两词词序可变。
(3)Subfield （S）表示算符两侧的检索词必须同时出现在文献记录的同一字段（句子、短语）。
(4)Field（F）表示算符两侧的检索词必须同时出现在同一个字段中。
(5)Citation（C）表示算符两侧的检索词必须同时出现在一条文献的记录中。
(6)Link（L）表示算符两侧的检索词之间有一定的从属关系。
4.限词检索：基本检索字段：题名、文摘、主题词、标识词；辅助检索字段：作者、语种、出版年代、期刊名称和文献类型。
基本检索字段主要有题名（TI）、文摘（AB）、主题词（DE）和标识词（ID），适用于各种数据库。
辅助检索字段主要有作者（AU）、语种（LA）、出版年代（PY）、期刊名称（JN）和文献类型（DT）等字段。
一般说来，数据库的提供的字段越多，其检索方式就越多，可以使用多字段构建复杂的检索表达式，进行高级检索。
七.信息检索步骤1.实施检索操作，获取检索信息；评估检索结果。
为了减少滥检、漏检和缺检，可进行检索策略的调整，主要分为缩检和扩检二种。
2.缩检主要方法有：主题细化；选择更专指的检索词；运用逻辑算符AND 、NOT；运用位置算符WITH、NEAR；减少字段检索；对检索结果进行二次检索。
3.扩检主要方法有：对己确定的检索词进行其同义词、同义的相关词、缩写和全称检索；利用数据库提供的词表输入规范词；使用运算符OR 等。
4.数据库的选择：(1)数据库的类型。
例如，书目数据库、事实数据库结构数据库；文摘数据库或全文数据库。
(2)数据库所收集的数据内容所涵盖的学科领域和收录范围。
(3)数据库的现状，包括数据库收录的文件类型、据量、存储年限、更新周期、语种、媒体介质和辅助工具。
(4)数据库的检索质量、权威性和检索速度。
(5)数据库提供的系统功能和检索方式。
(6)数据库的使用权和检索费用。
印刷类化学文献信息一.图书分类法简介（一）图书馆的重要地位和作用图书馆在网络环境下受到了相当大的冲击和挑战，但还能发挥其独特而无以替代的作用。
图书馆可推动和促进知识传播、教育普及、学术研究与交流等活动，它也要与信息产业中的其他机构协同合作，以求得更加长远的发展前景。
（二）图书馆图书的分类系统国际十进制分类法和中国图书馆图书分类法介绍几种国内外各大图书馆广泛应用的图书分类系统：（1）杜威十进位分类法；（2）国际十进位分类法；（3）美国国会图书分类法；（4）中国科学院图书分类法；（5）中国图书馆图书分类法。
1、中国科学院图书分类法根据我国的具体情况和科技发展的需要而制定的分类法，1958年开始使用，并几经修订形成目前的分类体系。
分类表分为五大部分，即马列主义、毛泽东思想；10哲学；20社会科学；50 -89自然科学90综合性图书。
2、中国图书馆图书分类法1973年北京图书馆联合全国有关图书馆共同编制了《中国图书馆图书分类法》（简称《中图法》），1999年第四版，目前已为我国许多图书馆和情报单位采用。
《中图法》是以科学分类为基础，结合图书文献的特点进行分类的。
将人类知识分为五大部分，22大类。
图书馆索书号：0622.2……中图号00----排架号可通过计算机索引查到索书号3、文献标识码：是用于标示文献正文内容类型的代码。
为便于文献的统计和期刊评价，确定文献的检索范围，提高检索结果的适用性，每一论文作者在撰写公开发表的论文或投稿时，都应根据“规范”所设的5种内容分类文献标识码，确定自己论文的分类项，并在中图分类号项后标注文献标识码。
这5种文献标识码所指代的文献内容的基本类型如下：A—理论与应用研究学术论文(包括综述报告)B—实用性技术成果报告(科技)、理论学习与社会实践总结(社科)C—业务指导与技术管理性文章(包括领导讲话、特约评论等)D—一般动态性信息(通讯、报道、会议活动、专访等)E—文件、资料(历史资料、统计资料、机构、人物、书刊、知识介绍等)二.化学文摘（Chemical Abstracts)名称（CA，Chemical Abstract）内容：以化学化工为主，涉及生物、医学、轻工、冶金、物理等领域，最常用的检索工具。
出版情况：周刊，两卷/每年，26期/卷特点：（1）摘录广泛，收录136个国家56种文字出版的14,000多种期刊，包括期刊、图书、学位论文、科技报告、会议论文、专利等，占总文献98%。
（2）出版迅速（3）索引完备组成：CA文摘和CA索引CA文摘的内容：以报道性为主，其内容包括研究的目的和范围、新的化学反应、化合物、材料、工艺、操作、设备、性质机器理论，新知识的应用，以及研究结果和作者的判断、结论等。
CA索引介绍：（一）主题索引（Subject Index ）（1）1907~1915年初级阶段；（2）1916~1966年发展阶段；（3）1967~1971年成熟阶段；（4）1972~至今分成化学物质索引和普通主题索引，出现索引指南作为辅助工具。
（二）分子式索引（Formula Index）按分子式符号的英文字顺序排列，相同分子式下又按化学物质名称的字顺序排列。
分子式按Hill 系统排列，含碳化合物碳在前、氢在后，其他按字序；普通主题索引的主题词按学科内容分58各大类，排列成等级表，用点数表示主题级别，其格式为：54.TECHNOLOGICAL PROCESSES AND（三）登记号索引（Registery Number Index）化学文摘中化学成分、结构及化学键性质确定的每一种化学物质都编一个登记号。
1969年起出版登记号索引（71、72-73、74-75卷）1974年起改出登记号手册（CAS Registry Handbook Number Section）登记号由三部分组成，用短线联接，第一部分最多六位数，第二部分两位数，第三部分为一位数。
